3WD0A

Serratia marcescens chitinase b, tetragonal form
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
498
structure length
498
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 498
sequence length 498
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd0A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd0A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd0A01
5D8WA 4J3XA 1Q6GA 4JIEA 1JYNA 2DT1A 3UEQA 2WSKA 5A6BA 2EEXA 1EOKA 2WCAA 1GOKA 3QR3A 3BAKA 1UD2A 1CECA 1W9XA 2YL8A 2W62A 2DDXA 2PWFA 1ITCA 3W4RA 3VGGA 3APGA 3T0DA 1HKIA 4KGLA 2XUCA 3F4VA 1XH0A 2J74A 1XH2A 5A6KA 4M24A 2G3MA 4V27A 1E56A 1C3FA 1UKTA 4AD5A 3AROA 1DWJM 3CZLA 3OBAA 1KB3A 3CUJA 1W3KA 1Y7VA 3U7BA 4CVUA 1UH2A 4AWEA 3T2PA 5BCAA 1DHKA 4MAZA 1CPUA 4NI3A 5DFAA 1GONA 3ARZA 4TTUA 1JDAA 1UHVA 1CXHA 4NSBA 4W5ZA 1H2JA 2ZXBA 3NJ3A 2XWEA 1G5AA 5D9OA 3WF0A 2BNJA 4AZ6A 2VJXA 1LF1A 5BXPA 1C92A 1JDDA 4UQEA 4J3SA 2YLLA 1W1YA 1MFUA 3MSDA 1QHPA 2EPKX 2RGMA 3W6LA 4PMZA 4TOQA 4WF7A 3AYRA 3AMKA 2CIPA 1NWTA 4UFKA 2NT1A 4KH2A 2WBKA 1GOMA 4BA0A 5E6YA 2X0YA 1ISXA 4AZ5A 2WMKA 2W66A 1TE1A 1M7XA 3FAWA 4X0VA 4A3YA 3ZSSA 2GK1B 1E6XM 4P7LA 3L4XA 3ZOAA 5IFTA 2G4FA 3W6MA 1V0LA 3I3BA 2Y8VA 2BY1A 3A6OA 4AZ7A 1WO2A 1TZ7A 3VGEA 2YA0A 3BCDA 4ZE4A 5JBEA 4PMUA 1GW1A 1JNDA 4AY1A 4BQ5A 1UQYA 2NW0A 4QLLA 2RTSA 4UZSA 4JL1A 4HZ7A 4QLKA 2XGIA 3WD0A 3NYDA 1E15A 3VVGA 4W8AA 5C70A 1UD4A 2VUYA 1UWIA 1QBBA 5A8QA 4Z2LA 3DYMA 5CGMA 2B31A 2ZUTA 1XD0A 4TVCA 5DO8A 3TA9A 2XIIA 4D6IA 4FLQA 1W3LA 4AMCA 3VGDA 3MU7A 2J78A 5I23A 3IJ9A 5ABGA 2BHZA 1V3KA 1XCXA 4RL3A 4UQDA 2O9TA 1U30A 4ACZB 1CENA 5A6LA 1XH1A 1XRVA 3KZSA 1VAHA 2YLAA 2CPUA 3W26A 3ZR6A 4Z2HA 2PI6A 4AD2A 1HKJA 4XUYA 5LYRA 4R5EA 1Q4NX 1CEOA 4WKHA 3W53A 2D0GA 3M7SA 3ZQ9A 5FD0A 4ACZA 2WNWA 1US3A 4B3KA 2NT0A 1G01A 1UWSA 3VDHA 4JFSA 3LPFA 1EHAA 4C7DA 3ARYA 2BHUA 3A4XA 3VGFA 1W1PA 5KEZA 4PCSA 1EOMA 4BS0A 1C7TA 5GNXA 1B3ZA 1XD1A 3SIMA 1EA9C 1FHDA 1MQRA 2VZVA 3QOKA 1US2A 2WVVB 5E0CA 1QOXA 2XJ7A 3WNMA 3DC0A 2BVDA 1JXKA 3HMCA 4ATLA 3BH4A 2PWGA 2BY2A 1BSIA 1QPKA 3WH9A 3CGTA 2XFYA 4JFVA 2OSWA 1Q6EA 3B9DA 3AMGA 3ZMRA 5JIWA 1UD8A 2EJ1A 4AD3A 3AJ7A 3AHYA 2BVTA 1EGZA 3SCQA 2OWWA 2G3IA 1CXIA 3SUWA 3MV01 2ZIDA 1M53A 2VX4A 2WHKA 2WMJA 1Q6FA 2E9MA 1ZS2A 9CGTA 2J7EA 1JF5A 1UYQA 4CCEA 3NIYA 4PEEA 4U2YA 2BFGA 4D6CA 1PEZA 1UD5A 4DM1A 3BC9A 1NWUA 1KQYA 2E40A 3K46A 3M07A 2XPKA 3AFBA 5JBDA 3OZOA 4CKQA 1BGGA 2ZOXA 4PUEA 1PZ3A 5A2BA 1VRXA 1WZMA 1OGSA 3WH6A 4XV0A 2E3ZA 1ED7A 3AXIA 4A4AA 1J01A 5EB8A 4CUCA 3LMYA 1CBGA 2F8QA 3EMQA 3NSMA 3THDA 3B9AA 2DH2A 1KCLA 4AIEA 3IAPA 1QNOA 2JE8A 3VX0A 1U33A 4HA3A 4MNMA 1HJSA 1E43A 2UY2A 5A6AA 1EH9A 1BTCA 2ZWYA 3SCPA 4P7OA 2DGAA 3L2LA 4NRRA 2CBVA 1MXDA 1GQKA 2V3GA 3WD1A 1ZJBA 1KFWA 2ZUNA 4URIA 1QNSA 3IAQA 3WMSA 5IHRA 5FL1A 2UY3A 3KWXA 4P8XA 1MXGA 1C8YA 5ECUA 7A3HA 2CYGA 2D3NA 3KL5A 1K9FA 5I0DA 1FP8A 3A3HA 2EPLX 3VD7A 5I6SA 4JHZA 4D72A 3J7HA 2XFFA 5D8ZA 4WLCA 4ZENA 3BAWA 2CESA 3TONA 1XC6A 2X8RA 1JZ5A 3PZIA 1KBBA 1JYWA 4BZYA 1YQ2A 1W1VA 5I77A 2PBOA 3VDBA 3WEOA 5A1AA 4N42A 3EDJA 4AIOA 5HBFA 3WDIA 5JUVA 1PX4A 1E6QM 1CTNA 4PTMA 3UETA 1HJXA 4MB1A 1GQIA 2DIEA 3AS1A 2WC4A 2CITA 3EBVA 5D9NA 4RE2A 3RM9A 1MW3A 3VIGA 4AC1X 3ZR5A 5DEZA 3ALFA 1HKKA 4CU8A 1DWFM 5M03A 3BSGA 2W4XA 3ZJ7A 1UKPA 1MW1A 3MUAA 4GIAA 1IZKA 2V3FA 1W32A 4LPCA 4CD7A 3WNPA 4GO8A 1W1TA 1QNPA 1V3JA 1V0NA 3BLKA 3CZKA 1NH6A 1TCMA 1UR2A 1LWHA 4HA4A 2PBGA 1UA7A 1ISVA 6TAAA 1X6NA 1UWUA 2XVNA 1DEDA 1MYRA 2G8ZA 1VFUA 4B9YA 1JL8A 4IISA 1CWYA 4U2ZA 3WKZA 1E5JA 3W24A 5GPRA 3CHDA 3WUEA 4GQQA 4EKJA 4E8CA 5E09A 2A3AA 1J0HA 4UFJA 2WLYA 4ATWA 3TOPA 1C8XA 3OLIA 1AMYA 4QCEA 4UQCA 3WNKA 5ABFB 4HMCA 3IJ8A 5CLTA 2VRQA 4AZCB 3VTRA 2D23A 3THCA 3L4WA 3AIQA 3L4ZA 2J77A 4W8LA 1VFMA 4AXNA 1GHRA 4TUFA 4W85A 4J3TA 3BAYA 4IUGA 1CXKA 4PMYA 3UG5A 1UR8A 3WD4A 1UG6A 4H8UA 5A95A 5ABFA 2WMIB 3CHFA 1EIBA 1MVYA 7CGTA 1WCGA 2CKSA 1GOWA 3OB8A 3MUY1 2ZX5A 2WLZA 1QW9A 2E0PA 1J11A 4PBGA 1G94A 4PTVA 4P8WA 4J28A 2OLHA 2G3NA 1B90A 1UD6A 5CG0A 1BGAA 1UWQA 2WMIA 2QMJA 4F66A 3II1A 1DTUA 1HN1A 3FHAA 2QLYA 4PMNA 4C7FA 2YKKA 1R87A 2E8YA 1M04A 3MSGA 3AS3A 1EHNA 1HJWA 2VCAA 4W5UA 4JL2A 1WNOA 2VMFA 3N04A 2GFTA 1FH8A 3AS0A 2ZUWA 2J7BA 4WKAA 2BY3A 3T0BA 1V6YA 4W7VA 2PF0A 3PTMA 1NWSA 1P6WA 1J10A 1BLIA 1MW0A 3EMCA 5BXTA 3ARTA 3HJEA 3T09A 1EQPA 2WANA 1RP9A 3W27A 2A3CA 2YIHA 2VVSA 2O9OA 1HJVA 2GJXB 1HNYA 1BG4A 2CXGA 2WMHA 2VCCA 3BGAA 3VM7A 1ZBKA 3CBWA 1WB0A 3O9NA 4F9JA 3WF3A 2WVSA 3AHTA 3K4AA 2ZICA 2X0HA 4ZFMA 1I1XA 2NSXA 1UOKA 1E1FA 3WDJA 2GJXA 1XSKA 4OZOA 1A47A 3N9KA 4GKLA 3WQ5A 1ISWA 1JXJA 1MW2A 2Y24A 2FHCA 5D9PA 4OKDA 4JFWA 4TVDA 1IZJA 1AQ0A 1QBAA 4MB4A 1J0KA 3AYSA 3L2MA 2J8FA 2Q8XA 3VU2A 3VIPA 1NOUA 3N13A 1JAKA 3WF2A 1GNXA 1UKQA 2WPGA 4MNKA 1WDRA 1HT6A 1BVZA 3ZT5A 2FHBA 1UR1A 2WHLA 1UZ4A 1DWAM 3IK2A 3K4DA 4QLJA 4UOJA 3WH5A 3SEPA 4QFUA 1NP2A 4LYPA 1PZ2A 4Q22A 2A3EA 2XWDA 3GXIA 3WQ6A 2GVYA 1E4LA 4Z2IA 4Q7NA 1V0MA 2W91A 4QP0A 4X0NA 5HDRA 2VR4A 1UD3A 1F4HA 3BLPX 2IUZA 3AIWA 2MANA 3SUUA 1W91A 3A4AA 4AIUA 2EXOA 1PX3A 3CUIA 4IM4A 1FFRA 2RGLA 1BFNA 4MJ2A 2GDUA 2O9RA 2D2OA 1X6LA 1OIMA 4V28A 4L4PA 2CCRA 5AY7A 1JD9A 3PZTA 2JFEX 2YOCA 1H1NA 1EXPA 2XGBA 3BMWA 1BQCA 4J3WA 2QPUA 2WZIA 1JNEA 5C71A 2E4TA 4D6FA 1E71M 3QHMA 2UWFA 2BV9A 4WSJA 5M5DA 3GNPA 3SCWA 1L0PA 3A4WA 2WW5A 1HJUA 5CZKA 5A8OA 1XSJA 1KXHA 4KRTA 3FAXA 1KR0A 4XX6A 1CXFA 2Z1SA 4M8UA 2YBTA 4AEFA 4LX4A 4RE4A 2A3BA 4WIWA 3CUGA 4JCLA 3WMBA 2YL5A 1LL7A 3ARWA 1QW8A 3SCTA 5CJ5A 4UZUA 5CSYA 5C8BB 3AZSA 4C7GA 1GPFA 2GJPA 3T08A 2JF6A 2OSXA 3PTQA 1VFOA 2GK1A 4P8VA 3AHXA 2EBNA 3OGRA 3VNYA 4MB3A 3GH5A 3BAXA 1E1EA 2BY0A 1UR4A 1QI5A 4M29A 3CLWA 3HN3A 5A8PA 1E4MM 3UG3A 1W2PA 1TVPA 4IPNB 1HX0A 3WNOA 2JIWA 2Z1KA 3UR8A 4YHEA 2ZUMA 1RPKA 4P7NA 3WQ8A 3ZSTA 1MQPA 3WUFA 1QNQA 2JF7A 1E72M 4GI9A 4M82A 4FF5A 3QOMA 1E6ZA 1UUQA 3RJXA 5EBAA 3HU7A 2BS9A 1WZKA 1TG7A 3WQWA 2BHYA 4N0RA 4WKFA 1ISZA 3DHPA 5M3WA 4YHGA 1ESWA 2QV4A 2XYLA 1WKYA 4DM2A 2ZX7A 2W61A 3WDPP 2CHNA 3W0KA 4EANA 1R85A 3POHA 3CUHA 3G6LA 1W3JA 1E6NA 4H41A 3UG4A 1SFSA 4P7RA 4AEEA 1C8QA 1FH9A 3CHCA 4JHOA 4U31A 3ARRA 3L4VA 2PB1A 4OOUA 1JZ8A 4PYSA 2BXZA 3O6AA 3G6MA 4MNJA 4MDOA 3K8KA 5CQ1A 3SUVA 3WEMA 1CDGA 3BXWA 3S2CA 2WVVA 1PX8A 1BAGA 2XG9A 4ML4A 4FK9A 3VM5A 4D6HA 1AQHA 1TUXA 4KWUA 4F9DA 1CXEA 1LWJA 5E9AA 2WKGA 2WHMA 1W3HA 3VIKA 4E4PA 4W87A 1B1YA 4UFLA 1OSEA 3I3EA 3W28A 2Y4SA 4KMQA 1W9UA 4JKMA 3GXFA 1E3XA 1VEOA 1V3LA 5HPOA 1CGVA 4Z2GA 3QHOA 3W82A 2WHJA 1ITXA 4BCEA 3GZAA 3RJYA 3CPUA 4HZ8A 1O6IA 3AIVA 1B2YA 2DSKA 1NARA 2VVNA 4NZCA 3NSNA 2W92A 2DSUA 3CTTA 2VNCA 2ZX6A 2D0FA 2XM2A 1CYGA 3IJ7A 5FOOA 3VKKA 4PN2A 3U7VA 3WL0A 1LLOA 2W5FA 3OGSA 1VJSA 3WFLA 3ZT6A 1GVYA 2EO7A 1H09A 2WKLA 3ARQA 2JALA 5AYBA 2DSVA 3MV11 2E9LA 4GI8A 4XZBA 4MB5A 4MDPA 4HTYA 1J0IA 3FN9A 1B30A 5FKYA 3WBAA 1LJYA 5M17A 3OGVA 2ZXDA 4J3UA 3ZM8A 4OBRA 1R8LA 3VILA 2OYLA 4EK7A 5A8NA 3GNRA 1TVNA 1CGYA 2J8GA 5DMYA 2J7FA 2EPNA 3WDRA 1FH7A 2XVPA 1UZ1A 4GI6A 2W63A 5HNNA 4BQ3A 1JGIA 1V08A 2D24A 3AMLA 3UR7A 1RH9A 1GQLA 4TXEA 1EDGA 4CVWA 1V02A 5BRPA 4P7QA 1OCQA 1H4PA 1NP0A 2DEPA 3DECA 4HMDA 3OIHA 1KR1A 3RIKA 1K9DA 1OGGA 4S3JA 1FP9A 2F61A 3N11A 3VMPA 3QHNA 3IANA 1JYXA 2E9BA 4GXPA 1NM9A 2J47A 1IT0A 1GOIA 3WH8A 1E4IA 1J9YA 3ARPA 1QI3A 5BROA 1H0IA 3PZUA 5CLWA 2VZUA 1C7SA 1R86A 2YA1A 3WQ4A 1J18A 2ZXAA 4H7VA 3T0AA 3OA5A 2OWXA 1C90A 3TTQA 3MS8A 5D9MA 3RCNA 3BAJA 1AQMA 2J7CA 4MAVA 2WC7A 4ZXLA 1Q6DA 4UQ9A 4PTWA 5AYIA 5DT7A 5A6BD 1V02E 2OYMA 4Z2JA 1ZB5A 1HIZA 2VI0A 3PN8A 1E6PA 4ZEPA 3OZPA 2PWHA 2YDSA 1J0JA 5CPTA 3OLEA 4GPNA 1U2YA 3LPGA 1B31A 3FW6A 3SURA 3SUTA 3F5LA 2BXYA 1WZLA 3GXMA 1GZJA 1W9PA 1UWRA 4RE3A 3WBEA 3I3DA 4A3HA 1EO5A 3F5JA 1EDTA 3SCUA 4S3KA 3NDZA 1MFVA 3VD9A 2WWDA 2D22A 2XVGA 2E8ZA 1DP0A 2FGLA 5BXRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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