4EK7 | Genus

Total Genus 187

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	187
sequence length	501
structure length	470
Chain Sequence	DATRISRSDFPADFIMGTGSSAYQIEGGARDGGRGPSIWDTFTHRRPDMIRGGTNGDVAVDSYHLYKEDVNILKNLGLDAYRFSISWSRVLPGGRLSGGVNKEGINYYNNLIDGLLANGIKPFVTLFHWDVPQALEDEYGGFLSPRIVDDFCEYAELCFWEFGDRVKHWMTLNQPWTFSVHGYATGLYAPGRGRSTGNPGTEPYWVTHHLLLAHAAAVELYKNKFQRGQEGQIGISHATQWMEPWDENSASDVEAAARALDFMLGWFMEPITSGDYPKSMKKFVGSRLPKFSPEQSKMLKGSYDFVGLNYYTASYVTNASNFSYNTDIHVTYETDRNGVPIGPQSGSDWLLIYPEGIRKILVYTKKTYNVPLIYVTENGVDDVKNTNLTLSEARKDSMRLKYLQDHIFNVRQAMNDGVNVKGYFAWSLLDNFEWGEGYGVRFGIIHIDYNDNFARYPKDSAVWLMNSFHK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Raucaffricine-O-beta-D-glucosidase
publication title	High speed X-ray analysis of plant enzymes at room temperature. pubmed doi rcsb
source organism	Rauvolfia serpentina
total genus	187
structure length	470
sequence length	501
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.1.219: Vomilenine glucosyltransferase.
pdb deposition date	2012-04-09

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4ek7A00

5D9MA 3UG3A 4WK9A 1BYBA 3VGFA 3ZJ6A 1OGSA 1UKPA 2J75A 8A3HA 1UD4A 3TTOA 1KXHA 2W5FA 2A3AA 4RE2A 3PBGA 3WF1A 2CHNA 2ESCA 3I3BA 3VX0A 1HJUA 1HP4A 3ZJ8A 3A4WA 3HMCA 5CPSA 4RL3A 3MV11 4L4OA 2D1ZA 2DIEA 1GJWA 3CBWA 3WQWA 2XVNA 4AZCA 4DWSB 3WD4A 3AICA 2DSWA 1EO5A 4J3WA 4PTXA 4UQAA 4DWSA 1C3FA 4PMDA 1SMDA 2XM2A 1FA2A 1HN1A 3FY1A 1XCWA 1M04A 3EMZA 3W4RA 4CVUA 4TVUA 4GZIA 3LPPA 4UFMA 4MAVA 1GUVA 2WXDM 4AWEA 2X0HA 4HU8A 2JE8A 3M7SA 1B30A 3WD3A 1WO2A 4JFVA 4Z2LA 4BQ2A 3S2CA 1LG2A 1UR9A 2V38A 4Y7EA 3N11A 4TUFA 3BLPX 2OWWA 2W63A 3MMUA 1QNPA 1W1PA 2YA0A 1JZ2A 4DUWA 3T0DA 2D0GA 2BVDA 3MSGA 4MJ2A 3L4TA 1E4IA 1X6NA 2B31A 1GQLA 1W9DM 1R87A 3OB8A 3KZSA 2OYMA 1MW2A 1TUXA 1OT1A 5A6JA 5FCZA 1LJYA 1WNOA 3OLDA 4AD4A 5CGTA 1GORA 5DF0A 1IT0A 1C8YA 2JF6A 1XH1A 1HP5A 1UD8A 3SUVA 4AZHA 3NCOA 3TP4A 1MFUA 1Q4NX 1BVZA 1KXTA 1W3HA 3NDYA 2J47A 1VRXA 3VMOA 3L4YA 3RCNA 2WCSA 5BYWA 3FN9A 3TTYA 2WVVB 3BAXA 4W5ZA 1MW3A 4W8BA 4V2XA 2EPMX 1KBBA 3CZ8A 3A6OA 2WVVA 1P6WA 1Q6GA 2J4GA 4LYQA 1J18A 1B31A 2Z1SA 2CBIA 4CCCA 1BG9A 1D3CA 4JKLA 3CPUA 3QHMA 3PTMA 4W86A 1VEOA 2ZE0A 4MDPA 3CIVA 2WM0A 4JHOA 1R85A 4CCEA 2XJ7A 2WMJA 4UQDA 1CIUA 4PUDA 1H1NA 1J01A 3A4AA 2E4TA 1X6LA 1E4NA 1R8LA 5ABHA 3WL1A 2J7GA 1UD5A 2WW5A 4PSRA 3ZSTA 2E8YA 3B8SA 1HKMA 4ZEPA 2NT0A 3WH7A 1I75A 7TAAA 1I1WA 1KB3A 1QPKA 3WNOA 4PMQA 3UG5A 3WFZA 1O7AA 5E0FA 4TX6A 1E6ZA 4LX4A 1KFWA 2V3FA 4M56A 1UYQA 3LMYA 1JDDA 1QNSA 1BVNP 4D6JA 2D3LA 1ISWA 5ABGA 5M17A 4Z2IA 2PC8A 3EDJA 3AIWA 2YDQA 3PZTA 1B0IA 1B3XA 3SCRA 3W25A 1UR1A 5CZKA 3VX1A 1KQYA 4MB3A 3AZRA 4UQCA 4OOZA 1Q6FA 9CGTA 1TG7A 4P8UA 1FFRA 4GINA 2VJXA 4HMEA 2JALA 3WY1A 1MXDA 2BVTA 3VKKA 2IXVA 2QPSA 3OGVA 1ITXA 4OZOA 1DHKA 4HZ8A 4HZ6A 3PZGA 4J28A 4M81A 2WB5A 1C93A 1K9EA 5HOSA 1KCLA 1UA3A 1KXVA 3QOMA 1E0XA 2ZXQA 1V0NA 2J77A 1UKQA 2YOCA 3PZIA 1PEZA 4M29A 4X0VA 4UFHA 2WK2A 1LL7A 4GIAA 3POHA 2VZUA 2GJXB 2QHAA 3EYPA 3SUTA 2VX5A 4M82A 1AQ0A 3VGGA 1V03A 1QI3A 2PWDA 2GJXA 5BXSA 4WSJA 4XB3A 4LPCA 3TTQA 1V6YA 1UR4A 4FLOA 2YLAA 3KEHA 1WZKA 1GOQA 2EBNA 2VNCA 1V02E 3NSXA 2ZWZA 1E0VA 3ZT5A 3WF0A 1MQRA 3AS3A 2QPUA 3ZR6A 1XYFA 4CD5A 3L4WA 4NRSA 5A6SA 1SFSA 2HVMA 3WQ4A 4ZE4A 5E70A 4GQQA 3AHTA 5AYBA 1JYNA 4R5EA 3WEOA 1V02A 2MANA 1NQ6A 1J11A 1KR1A 1U33A 2FGZA 5AC5A 1C90A 1GCYA 4GQRA 3WDPP 1PX4A 1TA3B 5CGMA 4BQ5A 2WANA 3T0BA 2CETA 3F4VA 2D2OA 1TA3A 1B90A 1ZBVA 2FHFA 2WWDA 3ARVA 2VC9A 1M03A 5GQBA 1CLXA 2WNWA 2WZEA 3K8MA 3GH4A 5GNXA 1JNEA 2BY2A 1Z32X 2ZUMA 3AMLA 1KGUA 1E71M 4P8WA 5DEZA 4PMVA 3WNLA 4MB5A 1UR2A 2J25A 3CUFA 5I5RA 2DDXA 1OGGA 4P7QA 4JHZA 1W3JA 1E5JA 1ISVA 2WVUA 1ITCA 2EPKX 2WMGA 1JZ4A 1FOBA 2BXZA 2IXUA 3SIMA 4W84A 4AIOA 2FHCA 4URIA 3AJ7A 3GM8A 1NOWA 2J78A 4MB4A 3WIJA 3ZM8A 2GJPA 3VDHA 2Y2WA 3N9KA 2Y5EA 1H0IA 3HU7A 1BPLB 3OGRA 4D71A 3WNNA 2OLHA 3SURA 3W24A 4FLQA 1M7XA 1GVYA 3IANA 1UWIA 1VB9A 1UKSA 4LYPA 3FXYA 3WH6A 4KRUA 4GZEA 3CGTA 5JIPA 1CPUA 2CKRA 4WSKA 1WCGA 3I3DA 3WUEA 4TTUA 3CHFA 1KGWA 2YA1A 1DWHM 1ECEA 4QFUA 1CTNA 5IDIA 1IZKA 1PX3A 4F79A 4EK7A 1RP8A 1DEDA 2WWCA 2CKSA 4CKQA 2WHKA 5D8ZA 4PMRA 1K9DA 1G5AA 3MU7A 1PBGA 4PTVA 1QI0A 1WZAA 3NDZA 3QOKA 3ALGA 4CGTA 7CGTA 4KGJA 2WLZA 4AW7A 4XX6A 1QBBA 1AMYA 5JBEA 2VCCA 1JFXA 1FP8A 2DSUA 2YL8A 3BCDA 3DHUA 2NT1A 4AC1X 4C7FA 1ISYA 1J9YA 3VGHA 1LWJA 3ZSSA 3QR3A 3IJ9A 4TOQA 3N13A 4AY1A 2WLYA 3ARZA 2G3IA 2Q8XA 2XVGA 3T0AA 3AHYA 2J74A 1JYWA 1U30A 1Q6EA 2DSVA 5ABEA 5CPTA 4CU7A 4P8VA 1M01A 5M5DA 1SR0A 2VURA 5FL1A 3EMQA 3W6MA 3WBAA 4KGLA 5HBFA 3AXXA 4E8DA 4CD6A 3T2QA 2V5DA 4LQ1A 3OLGA 2DT3A 2D20A 3TTSA 4HZ7A 3UR8A 3BCFA 1WP6A 2YIHA 3GNOA 4XZWA 1GOMA 2F61A 4FLRA 2G8ZA 3A3HA 2VO5A 1OIMA 1W3KA 4PN2A 1E9LA 3UR7A 4JL2A 1BHGA 2G4FA 4JCMA 2J7EA 3AOFA 1H3GA 4DM1A 2D24A 2C7FA 4LGXA 4J7RA 5A1AA 3WSUA 3QHOA 3ZQ9A 4HMCA 3ARYA 3SCPA 4A3YA 5DFAA 4MTVA 2XYLA 3W6LA 4J3XA 3GDBA 4Q22A 3EDFA 3UERA 1W1VA 4CU6A 3AS1A 1CXIA 4D6DA 2PI6A 5F7UA 2E9MA 3CLWA 1CECA 4D6HA 1KBKA 4M1RA 2WCGA 1PAMA 4E8CA 2WBGA 4EANA 1NARA 1V0MA 1TVPA 3ARPA 2WMFA 2BHUA 1JDCA 5I0DA 4UFKA 3WF3A 2BV9A 3NUKA 1JDAA 2EXOA 4ZENA 2VZSA 4U5IA 5I77A 2XFRA 1GQJA 4ACZB 2VL4A 3CMJA 1YHTA 5D9NA 3M46A 5A6KA 5EMYA 1NOFA 4ACZA 1E15A 1ZBWA 1G01A 1PZ2A 2WCAA 3UETA 3ZMRA 1K6AA 3TOPA 1JNDA 4WKAA 3SUUA 1WDPA 2WYSA 4W88A 1MW1A 2WC7A 4UNIA 1JAKA 1JIBA 2GFTA 3VD9A 5BXTA 3OZPA 3VIMA 1FH7A 3NJ3A 4M80A 1UZ1A 2VZOA 3W29A 4AZBA 4D1JA 5A3HA 1QNQA 1MWOA 5JBDA 5EFFA 4QLLA 2O9PA 4Q7NA 4AZ7A 1FHLA 1WZLA 1JI2A 2D23A 4AZCB 2Y8KA 1EH9A 3EDDA 3NSNA 3L4ZA 1ISXA 4V27A 5IFPA 3II1A 1BG4A 4W7UA 4DWSC 1W9XA 4A3HA 4W89A 3AXIA 3SCWA 2CITA 4UZUA 4RE4A 1CYGA 3AISA 1W9UA 4CU8A 1E6NA 4IISA 3GNRA 4UQ9A 2XFFA 1HKJA 4JFWA 3T2PA 4JFUA 3CHCA 2X2YA 1CGXA 3VVGA 3WUFA 5I6SA 3CHEA 3L2MA 2BY3A 4P8XA 3MMDA 1EDQA 3M07A 3N04A 5D9PA 1VENA 1CGYA 4U33A 4AIUA 1PIFA 2XWEA 3F5LA 3BSHA 2VI0A 3WUBA 3BAKA 4AZ5A 3B9AA 3GNPA 3LPGA 1JF6A 3WDHA 3VPLA 5CSUA 1EIBA 3VIIA 1QHOA 1CXEA 4JFSA 5A6AA 1LL4A 1JG9A 5FIPA 3W53A 4PMZA 3PZNA 3IJ8A 4BCEA 1GOIA 1CXKA 5BXRA 2XM1A 3CZKA 4TXEA 3EMCA 4HP5A 1XH2A 1JZ6A 1H2JA 4OKDA 1VJZA 2VX6A 3POCA 2WAGA 4P7OA 1R86A 1KGXA 4CD7A 4WKHA 4IPNB 1US3A 4YHGA 4AEEA 3MUIA 8CGTA 1DTUA 1F4HA 3BAWA 1UA7A 1J0HA 4UZSA 3AQUA 1EQCA 6TAAA 5A2CA 3F5KA 2G41A 2ZXAA 4AZGA 3WNMA 2Y24A 2ZUWA 1GQKA 2J62A 3MANA 3RM8A 2WVSA 2VVSA 4MPKA 4D72A 1B9ZA 2WPGA 1BQCA 1DWGM 1TFVA 2VRKA 3ZO9A 5I79A 2JIEA 4A4AA 2A3HA 1GJUA 4HOZA 1XD0A 1E3ZA 1JZ3A 2G3JA 1H49A 1W2PA 4XZBA 1CGVA 1CXFA 2YL5A 2VOTA 3W28A 1F4AA 1Q6DA 2Z1KA 4JZ5A 1OT2A 3VDBA 5FD0A 3GTNA 2YBUA 1GHSA 3ARTA 3GBDA 1K9FA 1BYCA 4H8HA 4JKKA 1UUQA 1VFMA 5A94A 2BY1A 3VMPA 3EDEA 2JEQA 1DWJM 2BXYA 3AHXA 5A2BA 2ZXDA 3GXFA 4BF7A 3CO4A 3OG2A 1OD8A 2CHOA 3SEPA 1QNRA 1H0GA 5FOOA 2OWXA 1FHDA 4GKLA 1W91A 4Z2JA 2OYKA 4MNJA 1UQZA 2ZUNA 2DT2A 1E3XA 1EDTA 4W93A 1CEOA 4X0NA 5JBFA 1E6XM 1H11A 4FMVA 4EE9A 4HOXA 1KWGA 3WEZA 1GQIA 1EHNA 2VT0A 3TONA 2V3GA 3VD5A 5GPRA 1HKIA 1XYZA 2E40A 1OINA 2WC4A 1NWSA 2YLLA 2GDUA 3VDCA 3PTQA 4D1IA 3NIYA 4YN5A 3AMCA 4ZXLA 5A6LA 2VRQA 4M24A 3G6LA 1XD1A 1G0CA 1G1YA 1EA9C 1JI1A 3ZJ7A 2VX4A 1UWRA 3VIOA 3ARRA 2X0YA 3AFBA 1EQPA 1W9VA 1UH2A 4KWUA 2WVTA 5DT7A 4FF5A 3WDJA 1CWYA 4U3CA 1PPIA 1V3KA 4J3SA 1LG1A 3PZQA 2XIBA 1LL6A 3SUSA 4JCLA 1C8QA 1UQYA 3CZEA 3VIKA 5ABFB 4AEFA 1XSKA 3AZSA 2PWGA 1EO7A 1LLOA 1WPCA 1XSIA 2XUCA 5ABFA 1J10A 3BC9A 4MAZA 4UFLA 5M3WA 3OIHA 5E9AA 1H5VA 3DC0A 4HPHA 2XSAA 3W26A 1JD7A 3MUZ1 1BGAA 2X09A 3HJEA 3LPFA 2X8RA 1OIFA 1UWQA 4JIEA 1PJ9A 5JIWA 1VEPA 5HNNA 1GZJA 5A95A 2WZIA 3AIRA 2XFYA 4W8AA 3J7HA 2PB1A 2WMHA 1B3ZA 2ZUVA 3KL0A 5HDRA 3PZ9A 4PEEA 4OBRA 3WQVA 2UWFA 2OSXA 1PX8A 3VDAA 5M03A 1TR1A 5D9OA 3ALFA 3K8KA 2VQTA 4QCEA 3VD7A 3FAXA 3APGA 2DIJA 5D4YA 2QMKA 3VTRA 4MNMA 1C91A 2DT1A 2YDSA 4DUVA 6CGTA 3ZJKA 1E6PA 3SCVA 1VFUA 3WF2A 2DGAA 3WD2A 3D5HA 5E0CA 2C0HA 1HKKA 4FLSA 3U7VA 5CJ5A 1QI2A 1TE1A 1E4LA 2CXGA 1HIZA 5EB8A 2V5CA 1MW0A 2VMFA 3MS8A 3ECQA 6A3HA 1ZBCA 1FFQA 2CIPA 4TX8A 1GHRA 1W32A 3O9NA 4LXFA 2G3NA 1QNOA 3EDKA 3RILA 1HVQA 3OA5A 4CUCA 5IHRA 2XPKA 3MV01 3SCTA 3WDRA 4PMXA 1JZ5A 1G9HA 1V3HA 1GPFA 3ZOAA 2ZIDA 3DYPA 1KCKA 2WBKA 3MKKA 2BHZA 2XGIA 1B1YA 3M6DA 1ZU8A 1R7AA 4ZFMA 4UQBA 1OD0A 2PBGA 5C70A 3PZVA 1XCXA 4OUEA 3FHQA 3AMDA 1QBAA 1E55A 4B9ZA 3AIUA 2W62A 1KR0A 2W92A 3U5UA 1UD6A 1BTCA 1CENA 4GO9A 1LQ0A 2X1IA 1BGGA 2VQUA 3RMEA 1B3WA 2A3CA 2JF7A 1VBRA 3MUY1 5LA0A 3SCUA 3S6TA 3K8LA 2YDRA 3E1F1 3CZLA 1FH8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EK7A

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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