3PUEA

Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
291
structure length
291
Chain Sequence
TIQGSIVAIVTPMLKDGGVDWKSLEKLVEWHIEQGTNSIVAVGTTGEASTLSMEEHTQVIKEIIRVANKRIPIIAGTGANSTREAIELTKAAKDLGADAALLVTPYYNKPTQEGLYQHYKAIAEAVELPLILYNVPGRTGVDLSNDTAVRLAEIPNIVGIKDATGDVPRGKALIDALNGKMAVYSGDDETAWELMLLGADGNISVTANIAPKAMSEVCAVAIAKDEQQAKTLNNKIANLHNILFCESNPIPVKWALHEMGLIDTGIRLPLTPLAEQYREPLRNALKDAGII
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title Crystal structure of the complex of Dhydrodipicolinate synthase from Acinetobacter baumannii with lysine at 2.6A resolution
rcsb
source organism Acinetobacter baumannii
total genus 110
structure length 291
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2010-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3pueA00
2JKEA 3W84A 4TX9A 3NA8A 1Q45A 2ZCGA 4XTDA 1B57A 1U5JA 1FDZA 3A9IA 3N19B 3QEZA 3RK8A 2ABBA 3PSVA 4A2RA 3QFEA 1KM2A 5TQLA 4IX0A 5TBOA 1TV5A 1OK6A 1ZAHA 2CZDA 3TMQA 1QOPA 4AB4A 1SU5A 4LOCA 1Q6LA 2VKZG 2ZTKA 3A23A 3QQ0A 5TIMA 1K7EA 3S6DA 4O14A 1KM6A 1G4EA 3G8RA 3LI0A 3W1PA 1Z42A 4AEOA 2A4AA 2AAMA 3W85A 4IJBA 5D03A 4M7TA 1EWEA 5HWJA 2QCEA 2CWNA 2V0TA 6TIMA 5DY3A 5KZEA 3TSDA 4DO6A 1XUZA 4O1CA 3TUUA 3UXAA 2V5LA 8TIMA 3UXDA 2CLOA 3CWOX 1GT8A 4X22A 1NEYA 1OFDA 2ZA3A 5AHNA 3ABRA 4BI6A 3O16A 1ZY9A 3LB0A 1R30A 3C0JA 3TXZA 3GYEA 1N55A 3M6YA 5G1YA 2RHGA 1RQHA 1TCDA 3L66A 1HO1A 2RDTA 4IMEA 2CLLA 1T96A 3PS7A 4CCEA 3BARA 2W0UA 5BW6A 4O18A 3VE9A 2BSLA 1K8ZA 3STCA 3W76A 4MJZA 3P74A 1DOSA 3G1SA 2QDGA 4O11A 1FY6A 1KV8A 2FJKA 4UC5A 4WXYA 3WJSA 2VFFA 1SFLA 1TTPA 3W1XA 4PC8A 1SR9A 2CU0A 1PVNA 1PE1A 3GR8A 1FQ0A 3ZWTA 3G1FA 3W07A 4K8HA 5HJLA 3GX9A 4I7UA 3STGA 3H54A 1IGSA 4ZQCA 2C13A 4DPQA 3EWBX 1H60A 4RZ5A 3PBVA 3QJAA 3NQMA 3C52A 3W7OA 3M47A 3DHDA 1F74A 3NAVA 3VKJA 4JTIA 3W1UA 3DGRA 4UTMA 1S3HA 2ZRUA 2E6AA 1XBYA 3CWNA 4FF7A 3TKFA 2X1SA 4FXRA 3O6CA 1VPXA 3PM6A 1FWSA 5CGQA 3TROA 1PL9A 1TJRA 1Z48A 2V5BA 4IMCA 3BLFA 3SFKA 4NJJA 3STFA 5D37A 2C1HA 4OGZA 2CLHA 1L6YA 4UNKA 1ZHAA 2B0MA 3DXIA 4GUJA 3DFOA 4UR7A 3PUDA 2V8ZA 1O5XA 4LTSA 4AF0B 1QMLA 5F2MA 4CQAA 5HQEA 3TK7A 5EY5A 2BZNA 5F4WA 4Y90A 3L0NA 3CPRA 3W2UA 3OHIA 5BRBA 1J4EA 2QCDB 3LGEA 5G2HA 2Z1BA 4M19A 3OVPA 1H7OA 7TIMA 1OFAA 3R8RA 1QAPA 2GQ9A 1JUKA 1W3NA 3TH6A 3GLCA 3M43A 3M5YA 2ZFAA 4JICA 1PHWA 4FNUA 3SIZA 4HHPA 2JGYA 2EGZA 2FPTA 3DFSA 4M5PA 1F76A 3NM1A 4MZYA 4MYAA 3R12A 1EUAA 3NPUA 3H55A 4LC8A 4UFJA 1VRDA 4JDYA 4K38A 1ICQA 1W5NA 3HMJG 1LLWA 2HSAA 4BR1A 1TB3A 2WKJA 4QAIA 4JTHA 1L2UA 1Q6QA 1DJNA 1UBSA 4O10A 3NZ1A 2NWSA 4AH7A 5AC8A 1YDVA 5G1TA 3S0CA 1A5AA 4WY0B 4AXKA 1VR6A 3PY2A 4N4QA 1VLIA 2ABAA 4Z1AA 1MSSA 1A5SA 1YTDA 3RF9A 4ALDA 2VFEA 3WK0A 3WK1A 1JCLA 1VLWA 3LXAA 3V75A 2PRHA 3STEA 3L67A 1LROA 5CKSA 1N8FA 1QFEA 1K7FA 4L4LA 1PCKA 2ZZ2A 5CPMA 2I9EA 1LRNA 5KITA 2H3BA 4GXMA 2CZEA 4JN6A 3QMSA 3LCLA 4GJ1A 1CW2A 1MEIA 3NL5A 3EKLA 5LNRA 1TMHA 4LRSA 3HPZA 3H53A 1GZGA 1SSGA 4GNJA 3W88A 3S5YA 3P84A 1EPXA 3NQ2A 3GVGA 3SY5A 2P0OA 3PF3A 3W6YA 4QIUA 2VFIA 5CPLA 4CCDA 5A8GA 3G0XA 1I2PA 1Z41A 1DJQA 4GUFA 1IXNA 2VEMA 2Q3OA 5DCDA 2X1RA 4FB7A 3HIJA 4YMZA 4NJKA 1DORA 1L6WA 1LBLA 2LLEA 2BTMA 4AMAA 1A5BA 3NNTA 3HG5A 3W1TA 3NL2A 1NF0A 3NO5A 3E9AA 1XDLA 4PFMA 3W1QA 1HFBA 3AJXA 1X8FA 4OHQA 1X7FA 2NX3A 3HGSA 1M6JA 3W7CA 3CIWA 1BEUA 3PBWA 3W75A 1VC4A 1KV5A 3LHUA 1JCMP 4PA8A 2B7NA 1H7XA 1TQXA 3L9CA 4JX6A 1AW1A 3NGJA 3UWQA 2CLMA 1NFBA 2VOMA 1ADOA 1O4UA 3O6DA 4BI5A 1M7OA 3QC3A 1JRCA 2TMDA 1YYAA 3MBFA 4X9SA 4BFAA 3HG2A 4LNYA 2EKCA 4LV4A 1FUYA 1R2RA 2E6YA 3TXVA 1O5KA 5D38A 3TV8A 5D09A 2WNNA 1RQEA 2C15A 2YFOA 2DU2A 1CI1A 4MY1A 1C8VA 1L6SA 2A6NA 4PEKA 1C29A 1K7XA 4JTLA 5EL1A 2A0NA 5I3IA 1O94A 3PG8A 5FEXA 2XFWA 1M5WA 1OG0A 2CZFA 1LCOA 3FKKA 3FOKA 4RV8A 3L21A 3NQ8A 4IOTA 4A29A 3UY7A 3G1AA 2I1OA 2VELA 3PC0A 1WBJA 5GVJA 2G97A 3UY8A 4MFEA 1H5YA 3FLUA 3QW3A 3ZS4A 1VJIA 1I4NA 5F2LA 4QISA 3W7LA 3ATYA 4HIBA 3AO0A 1ZAJA 2YX0A 3R5EA 1W31A 3QMTA 1F7BA 4RXFA 4HNVA 4IPIA 1XC4A 4K7YA 1KM5A 3LHYA 4JYEA 5H2ZA 1ICSA 3TJLA 4JDBA 3LV6A 4DELA 1QWGA 1MO0A 3C8FA 3FEMA 3A24A 3QMRA 1QPOA 3SZ8A 5J5DA 5I3GA 4JS3A 2O7SA 1GTEA 4P61A 5FESA 1KFLA 4KWVA 2R8WA 3G0UA 4NJHA 2PRLA 2D73A 3P81A 3LCXA 5LNSA 5D02A 2O7QA 4QSHA 5F2GA 1OABA 2XN1A 1H63A 4O52A 3MYOA 1XXXA 1RR2A 3NPVA 1JVNA 3TSBA 1YXDA 1XFBA 4Y9AA 3LTPA 3L68A 3B05A 2A7RA 2G95A 4FIQA 1F5ZA 3IGUA 3W73A 4RKAA 5LNVA 3TW6A 1TREA 3G3MA 4UXDA 5DN1A 5I3JA 4AHQA 5AYXA 2Z6JA 2ZRZA 1ME7A 1OX4A 1FWRA 1G4TA 3G1XA 4Q4KA 3NQAA 4O0KA 1K8YA 4NX0A 1TJPA 2P10A 5DCBA 3MHUA 5D2XA 3W7HA 2WSQA 4O8RA 1YTEA 3TE9A 3W7EA 5AHEA 3GR7A 1G7UA 3NQDA 2NXGA 4FHAA 3UPBA 3C3NA 4BI7A 5H91A 3THAA 3BGGA 1QDSA 5FI8A 3Q37A 3P7YA 3TX9A 1S5WA 3C2RA 4RLIA 5IM51 4OT7A 3Q94A 1KBIA 2PURA 3NXFA 1DV7A 2E5CA 4FNTA 1ZCOA 2E5DA 1JUBA 3W70A 4BF9A 1EP1A 3LOTA 1KM4A 4X2RA 4L4MA 1LOLA 2ZZ1A 3EXRA 2YGYA 1BTMA 4RX0A 4NNAA 1B3OA 3FJLA 4FNRA 3UWZA 1T8XA 2VEKA 2Y7EA 1ZENA 2ALDA 5LNWA 1U83A 1NF7A 4WY0F 4XTIA 1VYPX 3FJ6A 3GXNA 4PH6A 4EF9A 4AHPA 4A21A 3S1UA 3NR0A 3WFAA 1OF8A 2YXGA 2QCNA 3PVFA 4MLJA 3DBPA 1VZWA 3GDRA 4J9JA 2YW4A 1TPUA 2Y7GA 5HWNA 5C54A 3N3MA 4HPXA 3U8GA 3HG3A 4NX5A 3VFLA 5CZTA 4FIRA 5EYWA 4AWTA 2FPVA 1SZNA 1H61A 4UCGA 1XBZA 4ZZ9A 3E0IA 3GAYA 1AG1O 1G69A 1QOQA 4TMCA 4O4WA 3PG9A 4WJEA 3W86A 1OFQA 3EX1A 1N7KA 2BX7A 4ML9A 4UFMA 4GC4A 4YCOA 4N4PA 5KTLA 4EVZA 4OQVA 3W7KA 3O8AA 4LVGA 5EKYA 4Z0JA 1IXPA 4LVAA 4BWLC 3IV3A 2J88A 3P62A 3SR7A 4K8EA 5IBXC 3IIZA 3UZ5A 3USBA 4M7SA 2NXHA 1SW0A 2H3DA 3GB6A 1LP6A 3W7DA 2UV8G 5LHFA 2QAFA 2WOQA 4LVFA 5K9DA 5I3FA 1YDNA 5CZJA 3FS2A 3TJXA 1F6PA 1OHLA 1J2WA 2PCQA 3EX3A 1G4SA 4O1AA 3WJWA 4E2BA 3NOEA 2DZSA 1BKSA 3DFQA 2DZWA 1MEWA 1HUVA 3TC7A 1BWLA 3O05A 1FWWA 3PBUA 4UMBA 1YLVA 3O63A 3DENA 2WSRA 5DXYA 4O1DA 3ELFA 3UWUA 4UTTC 3PR2A 1KM3A 1UB3A 3HQ1A 1FXQA 1LTDA 2QJGA 3OVRA 3KVJA 4ZL1A 2Z2UA 3P60A 1FX6A 3E02A 1VCFA 1SZGA 3BPWA 3S1XA 3B03A 1F05A 3IIXA 3RFAA 3L0KA 1LDCA 1KFCA 4NU7A 3EX4A 4LWWA 1TQJA 2E68A 3EWZA 1Y0EA 2QJHA 4RJEA 2ATMA 3BG5A 4HN4A 1H7PA 4A2SA 3W87A 4ZMGA 3CEUA 4JTFA 4HKPA 5F1VA 1DL3A 3LBCA 4HT3A 1TPVA 3W71A 2G96A 1KFBA 1OFBA 1OK4A 3GDKA 1ICPA 3A22A 1GQNA 3B0UX 4ICNA 3I65A 1HO4A 4RZ4A 3LRKA 1GG1A 2C18A 1AL7A 4HNNA 3DI1A 1PS9A 3JR2A 1P0NA 3NQ6A 1LOSA 4M6QA 5E0KA 3QW4B 5D2WA 3LXCA 3O6YX 1SW3A 3TMLA 3P8IA 3L5AA 3MWAA 5K4XA 1QPQA 2QF7A 2B7QA 3R13A 1VYSX 2X1TA 6ALDA 3HGRA 5HNRA 3KRSA 4H4IA 2GQ8A 1LOQA 3T7VA 4EWND 2QJIA 1TPWA 4O54A 4UTIA 2X30A 1W5PA 1SO5A 1DQWA 4JTEA 1KA9F 5G2IA 3VE7A 3GDLA 4LVBA 2PC4A 3KRZA 4WQ6A 5D04C 4Z0SA 4U4MA 3MYPA 2NWRA 4FX6M 5AHFA 3M1ZA 3DKLA 3GKAA 5HINA 3B06A 4ZQPA 1W0MA 4HNUA 1RPXA 4R34A 1KFKA 4Q33A 1ONRA 4JY9A 3EEGA 5CZSA 3RLUA 1W5MA 1EP2A 4LT9A 1KTNA 4TIMA 4WOZA 2FLIA 3NQVA 4BWLA 1A50A 2CLEA 2OT0A 5IBXA 5LHEA 4UNLA 2C6QA 5K9CA 1I2NA 3GAKA 3IVTA 4FXSA 1W37A 3RNDA 4Y96A 3DFPA 1W54A 4FX7A 2FB2A 5C2XA 2RDUA 4LUIA 1IIHA 4MPQA 3E12A 5AC6A 2C3ZA 3LTYA 4CCCA 3UD6A 2NX9A 2FFCA 2GVGA 2ZRYA 4MJMA 2XN0A 4S2CA 5K3VA 5EA9A 1GYLA 2WSYA 3G0SA 4IX2A 1UUMA 3IRDA 1FWNA 2Q3RA 1A53A 5HWMA 1SZEA 3P5ZA 3QH2A 1FBAA 1K3UA 2DZPA 2Y89A 3ABSA 3T78A 2V81A 2NV2A 2QCMA 1GYNA 1Q6RA 2OT1A 3IGXA 1FCUA 5FEZA 3W7QA 3TNOA 1JQXA 5DELA 1LM1A 2QR6A 4ONVA 4E38A 1G4PA 3A5VA 4R7JA 5C5YA 1M7PA 1WOAA 2A7PA 2CW6A 2VFGA 3UQNA 4UIOA 5HULA 4IMDA 4QM1A 3W1MA 2QCGA 3DZ1A 4DBEA 3W7IA 1QPRA 2TRSA 4ZQMA 3LRMA 3FYPA 3LM7A 3QYQA 4XZ9A 2DZVA 3IVSA 3NQFA 1GOXA 1ME9A 1OX4B 5AYYA 3FFSA 3MMTA 1KTCA 4KFPA 3TAOA 1RD5A 4EOUA 1I8JA 4FNSA 3LCWA 3LLDA 4N6FA 1H51A 3N9SA 1V7YA 1SUXA 3BO9A 3QSTA 4WOQA 1YXCA 5C6MA 5K4ZA 3QF0A 3KXQA 2DP3A 4JTJA 4ADUA 3LERA 3MI2A 3MHGA 4H3DA 2Q8LA 4NJGA 3TFXA 4JIQA 2ISWA 4CQ9A 3LCHA 4GRSA 4DXVA 3IIVA 1TTJA 1F6KA 3NL3A 2G5WA 2W6RA 2ZZ6A 3LHTA 3NQ7A 4NNCA 3MW7A 3W1RA 3M9YA 4MFDA 1TTIA 3EKZA 2ZRXA 3SSJA 1P4CA 1FDYA 2Y85A 5FF3A 2DZXA 4CQ8A 3UPWA 1JR1A 3MP5A 3NPWA 5FEPA 1JCYA 3UZJA 4WUIA 4B5NA 3MI6A 1SO3A 2DJXA 3ABOA 3S9YA 1W3IA 1H7WA 2A5HA 5G5IA 4HSOA 2VEIA 1WOBA 1ZJIA 3ZWSA 4LS0A 1I2RA 4FNQA 4QJ1A 4XQ6A 2A1YA 1WBHA 4O16A 5F2IA 3WJXA 3B0VC 5LSMA 3GDTA 4O4VA 3UNDA 3QPZA 3EWXA 3CQ0A 2J9XA 3W7MA 2ZZ3A 5LZLA 4DO5A 4MIMA 4JTSA 4O50A 1JQVA 5HR6A 5BMWA 4UFIA 3SW6A 3P5YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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