1E6ZA

Chitinase b from serratia marcescens wildtype in complex with catalytic intermediate
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPASRAKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTITDGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKVTNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPSTDYWLVGCEECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords CHITINASE B
publication title Structural Insights Into the Catalytic Mechanism of a Family 18 Exo-Chitinase
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 1e6zA03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1e6zA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e6zA01
3LMYA 3FHAA 1QI4A 3EYPA 4UR9A 1XRVA 1E5JA 3GNOA 5A8PA 1SMDA 3VX0A 4BQ5A 5BRQA 3SUVA 1XD0A 1JXKA 1K6AA 5DT5A 4BS0A 3BGAA 1BG4A 2E40A 2WMHA 4JL2A 3SCRA 1ODUA 1V3MA 4ZXLA 2YL6A 4JFWA 3M6DA 1JDAA 3CLWA 4DUVA 1TR1A 4MB4A 2QHAA 3POHA 4GI8A 1PX8A 4MPKA 1JDCA 2EEXA 1SFSA 2JALA 2XTKA 3U7VA 3AIVA 5A6BA 1B0IA 1ZB5A 4UQDA 2CITA 2UY4A 4M81A 4QLKA 1L8NA 1EDGA 2NT0A 1HKJA 1QNOA 3AXHA 5A6SA 1LL4A 1XV8A 2FH6A 5BROA 3FHQA 2C0HA 2J7FA 2OYKA 4GZIA 1HN1A 4Z2IA 2YL5A 4AD3A 4UFIA 1WDQA 2XVLA 3WNPA 3B9DA 3BCDA 3THCA 2DSVA 1TCMA 3GBDA 3W6MA 4AZCB 3VOCA 3CUHA 4MAZA 2JF7A 1H0GA 1UWQA 2ZUTA 3ZSSA 3WDPP 3ZJKA 1CXEA 1V02A 4DM2A 5E0FA 3VGDA 3WF4A 4CD7A 3O9NA 1FFQA 2O9OA 2ZWZA 3UESA 4MDOA 5FL1A 1O6IA 2CBIA 1HNYA 1XSIA 2YA0A 4AD4A 3HMCA 1XD1A 3BCFA 5D4YA 1E6XM 1ODZA 2WCGA 1PJ9A 1WAWA 2WHKA 3HU7A 4Q22A 2VO5A 4B3KA 1U30A 3BAJA 1GNXA 1DWAM 4PUDA 1V03A 1PX3A 3CZKA 2A3BA 4UFJA 1GHRA 1R87A 5LA1A 2PWFA 4F66A 1R8LA 2DPEA 2JEPA 1ISVA 3PN8A 3OGRA 2Z1KA 2EQDA 1UD2A 4UFKA 4MNKA 2XFRA 4KGJA 1GOIA 4GO9A 1DWJM 2WNWA 2CBUA 2D3NA 2XWDA 2BY3A 4HA1A 3I3BA 1B90A 2W61A 1QNPA 3GXDA 3MUAA 1Q4NX 3L4VA 2WMKA 1E72M 5I2UA 3M46A 4L4OA 3OA5A 5M3WA 1BGAA 4OZOA 3OB8A 2YOCA 2GVYA 4YHGA 1JAEA 4OBSA 1E43A 1H0IA 5I6SA 3VIOA 4HOXA 3VDCA 2ZX7A 2MANA 1UA3A 2VVSA 2CETA 2PC8A 1QI0A 4DWSA 4GI6A 1OD0A 2J8FA 2XIIA 2GJPA 1QI2A 1JNEA 3CGTA 4P7QA 2WVUA 1JZ4A 4EK7A 2CBJA 3WF2A 1ED7A 5E0CA 2W63A 1AQMA 3OZOA 2BY2A 5EFDA 4ZFMA 3OLIA 3SUUA 3KL5A 8A3HA 4PMXA 4CKQA 4HMCA 2IXVA 1GOQA 3UEQA 1OWQA 1F4AA 4RE2A 3WEZA 3AXIA 1J0KA 1J10A 3VD3A 2UY2A 1Q6EA 3VIKA 3W29A 4GQRA 1C7SA 4AWEA 1ZJBA 1OM0A 3RIKA 2YBTA 2W92A 1H11A 3WUGA 2BY0A 1QW8A 3PHAA 3VMPA 1EO5A 5GPRA 3NDZA 3WIJA 2J7EA 4PBGA 5C8BB 2XM2A 2WANA 1ZBVA 2C7FA 4GQQA 1SR0A 1SYTA 5CQ1A 2PB1A 1LLOA 4D6JA 4WKFA 1MWOA 3K4DA 1AQ0A 2O9PA 4IPNB 3VDAA 1E70M 1M04A 3VDBA 5HDRA 1W3KA 1ESWA 3WDHA 1JF5A 3AYSA 2J79A 1H5VA 1LWJA 2WHJA 3OLEA 3ZSTA 3IAPA 3AMDA 1JZ6A 2V38A 1KGXA 5I79A 1MXGA 4BQ4A 1DEDA 1OGSA 1XSJA 1E0XA 4CVUA 1M7XA 2J7CA 2B31A 5BYWA 1RD6A 3VD7A 3EDDA 4C7GA 2AMGA 4JHZA 4ZE5A 5IXEA 4GO8A 3N18A 1W1PA 1BSIA 2JIEA 1OINA 2A3EA 4H7VA 1V0KA 2CCRA 3W37A 1H4PA 3OBAA 3NSMA 2QF8A 2E9BA 1JD7A 4URIA 1CYGA 3WD1A 1XH0A 3IJ8A 2V3DA 2NSXA 1E6PA 2HVMA 1LWHA 1NOUA 3AS1A 2CKRA 1W3HA 2BHZA 1JI2A 3QHMA 1HXJA 1EDQA 3WNMA 3AXXA 4B9YA 1W1YA 3WNNA 4JKLA 1KWGA 1WE5A 1E71M 3VM7A 3EDKA 4EKJA 3CH9A 5M03A 4AZ7A 1IV8A 1V08A 2VJXA 3WQWA 1B2YA 2GDVA 2DSKA 1E6SM 2WKGA 3W38A 3N17A 4AIEA 3OG2A 4Y7EA 4NRRA 1C91A 5F7UA 1JXJA 1CXLA 2F2HA 1W1VA 4MNLA 4Z2HA 2G8ZA 3M7SA 4CN4A 3LPGA 3GXFA 4U33A 1V0NA 1U2YA 4J3UA 3ARPA 3AHYA 3CUIA 4HZ7A 4BF7A 1MYRA 5EMYA 1W2VA 3AMKA 5D8WA 2UWFA 1WZMA 5FCZA 2WWDA 3ALGA 1EHAA 2ZXAA 2FHCA 5BXPA 5A6JA 3GDBA 1G5AA 2WVTA 1KXVA 1HJXA 5HBFA 1JZ7A 3WL1A 3CZGA 1XH1A 4LPCA 2WK2A 1HVQA 2VQTA 1W9UA 2XWEA 3PBGA 3RMEA 1QW9A 1JZ2A 2J77A 1PIFA 4U3CA 4EAMA 2E4TA 1VFOA 2JF6A 3MANA 1H2JA 3VIJA 3WMBA 1GONA 4QCFA 4QCEA 4PTMA 3QR3A 1TUXA 4DUXA 3M07A 3L4XA 4HU8A 3W6LA 2CXGA 3GH7A 1OBAA 4UCFA 2ZUMA 4MJ4A 1PZ2A 3DYPA 5AYBA 4U2YA 1GJWA 1M01A 2CEQA 1U33A 4ACYA 3ZJ6A 2XJ7A 3VIGA 5FL0A 4PEEA 1JD9A 5I24A 1ZJAA 2JE8A 3LPPA 3VTRA 3ZOAA 3BC9A 1VBUA 1QI5A 3WDQA 2XPKA 1VEPA 4P7OA 2ZXQA 3WQ4A 1KXTA 5CG0A 5I3DA 1OB0A 4FLRA 5AC5A 4XX6A 3CZEA 1YQ2A 5C71A 3ZJ7A 3FXYA 3W0KA 3ZT5A 2G3JA 3WEMA 1UQYA 3PZUA 2TAAA 4CCCA 1OCQA 3AMGA 2YL8A 1G94A 3ARYA 4C7DA 4OOZA 2X1IA 4CU7A 3ARQA 1UWRA 2WMFA 3F5JA 4TUFA 3AS0A 1NWUA 2DIJA 1TMQA 2WZIA 4IUGA 3WF1A 4HMEA 2BVDA 3NCOA 3SUTA 3AIQA 1WZKA 3AIBA 5E70A 1BAGA 3ARRA 2XM1A 2W91A 2WMJA 2V5CA 3WUFA 4UQBA 2XFFA 3GNPA 3HJEA 4UQ9A 5HPCA 3BLKA 1WKYA 4A4AA 2NT1A 5IFTA 1J01A 2WAGA 3L4ZA 2ZUWA 4JFSA 1WZLA 1FH8A 3BSGA 2Y8VA 3SCVA 3VKKA 2EO7A 4XZWA 3AIRA 5CGMA 1CXIA 4A3HA 5FKYA 2WZHA 1E6NA 3CMGA 4LX4A 3W24A 2DT2A 2NW0A 1FHLA 3PZ9A 3WUBA 3B8SA 2ZIDA 1XYFA 3WBEA 4TTGA 1EXPA 1IZKA 1W9PA 1AIWA 1CEOA 4GXPA 4HOZA 1HL8A 4R27A 4CN1A 3NSNA 4FLSA 2W67A 3SCPA 3WNKA 4HOWA 2A3AA 1LJYA 3LPFA 4W7WA 1AMYA 1E6ZA 3T2QA 4WK9A 3OLDA 3TONA 4B16A 5A6KA 1HJSA 3AOFA 3ZIZA 4J28A 1J11A 4K68A 1NWRA 5TD4A 4AZHA 2VX6A 2X2YA 2XVPA 3ZT7A 2RTSA 4U31A 3VO0A 3WKZA 4JCMA 4F9JA 5CGTA 4KH2A 1OGBA 3MUY1 2VRJA 1UWIA 3GXIA 4WSJA 3MMWA 3S2CA 1UKOA 5HPOA 4AC1X 5HOSA 3MMDA 2ESCA 4UZUA 3WFLA 1MVYA 5A6LA 1PBGA 4W8AA 3KE0A 3K8MA 5EBAA 2RGLA 1HKMA 2PWEA 1ISZA 3AZSA 1NWSA 2Y8KA 1GQLA 3MU7A 2DH3A 3AZTA 2J7HA 5A69A 3WSUA 1QI3A 3WF3A 4PTXA 2WHMA 1W9DM 1C93A 1JFXA 4P7NA 5JBEA 4CCEA 2D0FA 2E3ZA 4W89A 3MUZ1 1HJQA 1GQJA 1EH9A 4IISA 2VX5A 3A4AA 1UD4A 1H49A 5FIPA 1LQ0A 2YIHA 5DF0A 3T0AA 3SEPA 1BVNP 4TX6A 4LGXA 4XZBA 2J8GA 1UD3A 3A3HA 2RGMA 4KMQA 4WIWA 3B9AA 1WZAA 3RCNA 3ZO9A 1V6YA 1JDDA 3W81A 4MNMA 2E8ZA 5DMYA 1K9DA 1XH2A 4B15A 1H41A 5JH8A 3WQ5A 3PZIA 1OSEA 2QV4A 2J7BA 3BAXA 1VENA 1OIFA 5CPSA 1WDRA 1SMAA 5E6ZA 1E6QM 5JBFA 1BYBA 2DDXA 2V3EA 2WMGA 3J7HA 7TAAA 2FGZA 1UH3A 1UD5A 3APGA 4AW7A 3VGFA 2WLYA 3NSXA 3WUEA 1EGZA 2WHLA 3A47A 4HPHA 1BQCA 2CIPA 5FD0A 3VU2A 3JUGA 3VGEA 4UNIA 3WD0A 1E9LA 2GFTA 2XVKA 2O9RA 1B3VA 2Z1SA 1D3CA 4ZXOA 3WD3A 3GBEA 3AHXA 4E8DA 9CGTA 2FH8A 2ZXDA 3ARZA 3VGHA 4AZGA 1CXFA 4UFLA 1GORA 4XB3A 1JGIA 2X8RA 3RO8A 1E1EA 1GOWA 3PZTA 4MB3A 1B30A 2WBKA 4MDPA 3T0DA 1JF6A 4LYRA 4HP5A 2YA1A 2BVYA 1VFUA 1UR9A 4BA0A 2DQXA 1A47A 4XUYA 1KXHA 4H8UA 1CLXA 2J7DA 4PMDA 1VFMA 4HTYA 5CLTA 1JNDA 1EO7A 4M24A 4YPJA 2EJ1A 3CZLA 2J62A 4J3XA 1CWYA 1W9BM 5D9NA 1HL9A 1QNQA 4TOQA 5A6MA 1UR8A 1MFUA 2WCSA 1HJUA 2VUYA 3T09A 3MS8A 1K9EA 1XSKA 3VILA 3CIVA 2QMKA 4CCDA 2XYLA 1N82A 4Z2GA 1UQZA 2Q8XA 2D24A 2ZE0A 2XVNA 5ECUA 1V0LA 1CPUA 1EDTA 2CHOA 5JIPA 4MTVA 2DIEA 2X09A 2BS9A 1S46A 3VIIA 2F61A 1TZ7A 2G3MA 3KEHA 4Q7NA 3PTQA 4D6FA 3SIMA 2WM0A 6A3HA 1BPLB 2VZTA 1MXDA 2X0YA 5JBDA 3W53A 1CENA 1MW2A 3CUGA 3F4VA 1PZ3A 2VZUA 1FHDA 3O2LA 1V3HA 2YJQA 1DHKA 3QOKA 4YHEA 2BNJA 1VEMA 1W2PA 2YKKA 1GUVA 1PPIA 2E9MA 3QHOA 2DSUA 1C8YA 1JL8A 1NARA 1QHZA 4AEEA 3CHEA 2Y4SA 1UHVA 4KGLA 4CVWA 1B3WA 2XSBA 4P8VA 3FNDA 2BXYA 1JZ5A 6TAAA 4PMRA 4UQEA 2CESA 5BXRA 1XHGA 1ITXA 3FAXA 7CGTA 5IHSA 3ARVA 1H1NA 3AS2A 4TVUA 3CHDA 4JCLA 3SCQA 3AIEA 3SCSA 4L4PA 4PN2A 4NSBA 5FOOA 3VMNA 1UWSA 2ZX6A 3SCUA 4W7UA 1MW3A 4M8UA 1B1YA 2IXUA 4M56A 2XVGA 3WL0A 4V28A 2VMFA 3UG5A 4X0NA 2QMJA 3EDEA 3KL0A 3PZOA 1KGWA 1PAMA 2X0HA 1EQPA 4PMVA 1QBBA 1WNOA 4AZ5A 4M29A 4MAVA 3VMOA 1V3KA 4PCTA 1J9YA 1ZBCA 3VGBA 2OWXA 3WELA 2ZOXA 1WB0A 5A1AA 1OT2A 3POCA 4AISA 4CD8A 3B9EA 2DGAA 2W4XA 4KRUA 1MW1A 4X9YA 3WDRA 2OWCA 2A3CA 2YDRA 4KRTA 1JZ3A 4AZ6A 2ZWYA 1CXHA 1TE1A 8CGTA 4NZCA 1US3A 5A95A 3BMVA 4TTUA 1Q6DA 5I23A 3VINA 1E73M 3TOPA 3MV01 4N0RA 3WFZA 4D6EA 3RM9A 5A2AA 4HA3A 1GQIA 3VGGA 5M5DA 3NYDA 1DTUA 1TFVA 3AJ7A 5CPQA 1WDSA 3UERA 4UTFA 5BXTA 3VD9A 4CD4A 2CBVA 2VR4A 3GTNA 4RE3A 4CU8A 1UD6A 2ZX8A 2Y24A 2D3LA 3CHCA 1UWTA 1HF6A 4QDMA 6CGTA 3AICA 1GVIA 1VIWA 2VZOA 3AHVA 3VIMA 2QPSA 3T2PA 3WF0A 1XGZA 1XCXA 1Q6CA 4UQCA 1EOMA 4V2XA 4AY1A 4D1IA 5GQBA 2YBUA 1UWUA 2YLLA 4PMNA 2ZUSA 1Z32X 4H41A 1GJUA 2XIBA 1CTNA 5CLWA 3ARSA 1B31A 4GPNA 1UUQA 5GNYA 4JKMA 3UETA 3K8LA 1UR4A 4W85A 4IM4A 2VX4A 3RILA 1CGYA 2W5FA 1E55A 1UZ1A 4UQAA 3FAWA 3VNYA 2X05A 5A6AA 2WC4A 4DWSB 1WP6A 4M1RA 4AXNA 2J74A 1B9ZA 1VBRA 3N1AA 5CJ5A 1E4LA 2EXOA 2PWHA 3AZRA 1M03A 3O6AA 4W86A 1ECEA 5KZ6A 4M80A 4GIAA 2VZVA 1EIBA 2CHNA 3AHTA 2D23A 2XFYA 1US2A 4H2CA 1E4NA 1CDGA 5CSUA 3EBVA 1G0CA 4D1JA 2WXDM 3MV11 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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