3TXVA

Crystal structure of a probable tagatose 6 phosphate kinase from sinorhizobium meliloti 1021
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
406
structure length
387
Chain Sequence
RGIPSICSAHPLVIEAAMLRAHREKAPVLIEATCNQVNQDGGYTGMTPEDFTRFVGAIADRIEFPREKILLGGDHLGPNPWKHLPADEAMAKAEAMITAYAKAGFTKLHLDTSMGCAGEPTALPDATTAARAARLAAVAEDAVLPVYIIGTELEVTAPEAAIETVRVHRAAFEEAGAAGAFSRVVGAVVQPGVEFGNENVIAYDRARAEKLSATLGQLHGMVFEAHSTDYQTPDALRELVADGFAILKVGPGLTFALREALYGLDQIAAFLFPAARERTLAEVTEAVMREEPANWAKYYHGSAEEQRLQRHFSYSDRIRYYWPHPKAAAAVDELMSLLDGVAIPETLISQFLAGSYARVRNGEVAPQAKPLALAAVDAVLQDYFAAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Probable tagatose 6-phosphate kinase
publication title Crystal structure of a probable tagatose 6 phosphate kinase from Sinorhizobium meliloti 1021
rcsb
source organism Sinorhizobium meliloti
total genus 138
structure length 387
sequence length 406
ec nomenclature ec 2.7.1.144: Tagatose-6-phosphate kinase.
pdb deposition date 2011-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08013 Tagatose_6_P_K Tagatose 6 phosphate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.400.20 Mainly Alpha Orthogonal Bundle GI Alpha 1, domain 2-like putative tagatose 6-phosphate kinase domain like 3txvA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3txvA01
3P60A 1TPDA 2WSRA 3FKRA 1WA3A 2NV1A 3IIVA 4O4WA 4EIVA 3F4WA 4LS0A 3UPBA 1I2OA 3EXRA 3HG4A 4FEZA 4H6KA 1D9EA 2E77A 2YDAA 2QF7A 3G18A 4DXVA 2V30A 3LHUA 3C2VA 3LRLA 1OFBA 4UTHA 1R2SA 4ZQOA 1H50A 1GG0A 4ADSA 1TPVA 3BW3A 2EPHA 1TPEA 2A21A 1O95A 3PG8A 1W37A 2B7QA 3TUUA 2QCHA 4GWEA 4HN4A 1X7FA 3PVFA 2G95A 4TU1A 3QRHA 1WBJA 3CT7A 4WOZA 1KM6A 1MEWA 2OX1A 1UJPA 4M6PA 1W5PA 1I4NA 4OWGA 3C61A 4H4IA 3VKJA 2WKJA 4QM1A 4GUJA 3E0IA 4O53A 4CCEA 4DO5A 4NNAA 3B0PA 1XDMA 2H8XA 4AF0B 3PULA 1XUUA 3USBA 3R2GA 3LI0A 4AWSA 1I2NA 1OFAA 1FWRA 1ME7A 2B4GA 4AVFA 1LOSA 4ZQCA 2TMDA 3BV4A 4OHQA 5D2YA 4TMCA 5D33A 5LHFA 2ZRXA 3CQ0A 1O5KA 4NT0A 4O4VA 1YDOA 4MZYA 2FPYA 3B05A 5AHIA 1M5WA 1ZNNA 4HSOA 1NF7A 3TMQA 3TSMA 5G5IA 3HPXA 3HB9A 2PRHA 1QO2A 3GXTA 5T26A 1TJRA 3G8EA 3QW3A 3U6WA 3G1FA 4UTWA 3W9ZA 3FA5A 1Q3NA 5FF3A 3CC1A 4JDYA 3O06A 2ABBA 4CQ8A 1SPQA 1QPOA 3GNNA 1LDCA 4EF8A 1C9DA 3G0SA 1PVNA 1AW1A 3DXIA 3FOKA 1NFBA 2DZWA 4YMZA 1VGAA 3PUDA 4ZQMA 3VI2A 5AHFA 3TNOA 1BWKA 3DGRA 1I45A 4KWWA 3QZEA 4RR4A 2VOMA 4OU1A 1SW0A 4X22A 1W3NA 4TIMA 1DL3A 1SUXA 4BI7A 3QJAA 3WJXA 1P0NA 3GR8A 3M0ZA 2GQAA 3ZR4A 3IIOA 2ZZ1A 3W2JA 1TPFA 1X1ZA 4Y9AA 3KVMA 3RFAA 3I68A 4FXSA 3S1UA 2FLIA 3MI3A 4NQ1A 1EP1A 4YL2A 1TRDA 1XKYA 5LKYA 2ZCGA 4DF0A 2OCZA 3LBCA 1MO0A 5F4WA 2YFOA 3G3DA 1LBMA 2C3ZA 1Z41A 4WQ6A 4WY0B 2CLHA 3LHYA 4OQVA 2NUXA 1OF6A 1WDWA 4IMFA 1GOXA 3W84A 2DORA 3V75A 3L66A 1XC4A 1G6CA 3W7MA 3TC7A 4UFHA 3OVPA 3Q58A 5LNSA 4XUGA 4IOTA 4MLJA 1UASA 4N4PA 3NVTA 4BI6A 1YXCA 3GDRA 1WQ5A 4KFNA 4A3UA 2J88A 3GR7A 1WV2A 1TPUA 3LCIA 5FI8A 4OBTA 1XDLA 2RH9A 5CGQA 2UV8G 1J5TA 2OT0A 1VCGA 1KM0A 1LCOA 1QPRA 1VYSX 1Y0EA 5DBUA 2NUWA 3Q2DA 1FDJA 1TPH1 1YPFA 2P10A 4R7JA 1P0KA 1JJKA 3GAYA 1PHWA 1IGSA 3CLMA 1GWJA 2ZFAA 2Y7GA 2NX3A 1H7WA 4TX9A 2YFNA 3QQ0A 3LRMA 4E0CA 4MVAA 1AW5A 3C56A 3YPIA 2ZA1A 1U5JA 3ABQA 4PH6A 3LRKA 1Z42A 4AMAA 5D2VA 4O1BA 4YXGA 4POCA 4MY9A 1HTIA 5AC7A 2DZTA 3STCA 2A5HA 2HMCA 3THQA 5BMXA 3F1QA 2X30A 3PBUA 1OX6A 3DI1A 4XZ9A 3IIZA 3ZS4A 3C4UA 4UIOA 1JCLA 1JULA 4IX0A 4KFOA 2B7NA 2A7NA 3RMJA 1W3TA 4LRSA 4O54A 4O8RA 1MXSA 1SFJA 3CWNA 2XN2A 4LVFA 3LLDA 1HO1A 3EX6A 2NUYA 3SIZA 2ZRVA 4D2JA 1KFCA 2CLMA 3JRKA 4IMCA 1YDNA 1CI1A 2QUTA 4BFAA 1TRIA 3S5YA 4GXMA 3VE7A 5J5RA 2X1UA 5HR7A 5D2XA 3HG5A 4UNKA 4IWWA 1EIXA 3GDTA 3HGRA 2V0TA 1TO3A 4N6FA 3W70A 1SO5A 4N6EA 4PODA 4LV9A 2Q3RA 4O11A 1TV7A 4NZFA 3ABRA 2H8ZA 4AWUA 1EWEA 3L5AA 3TR2A 1SZNA 2VENA 3S8HA 4NJKA 3DKJA 4E2BA 3DU0A 1B57A 1VHCA 4FXRA 3QEZA 1G4TA 1GQNA 2LLEA 3S6DA 4MJZA 4ZQPA 2A6NA 4I9AA 3PSWA 4JIQA 1SW3A 4UTKA 1LTDA 1LLWA 2I14A 3OA3A 3W1UA 3FYPA 3A5FA 4LVGA 5EL1A 4MYAA 5LNRA 1P1XA 2RFGA 3S9YA 3P80A 3HG3A 4Z1CA 2J24A 1ME8A 3SW6A 2G96A 3L0NA 3W2UA 2W0UA 2Y85A 2ZZ4A 4RXFA 4G1KA 1RZMA 2QCGA 1YADA 4JGDA 3A23A 1K7EA 3R5EA 2QDGA 3P82A 3CIWA 1KM1A 4NZJA 1FDYA 4R34A 3W7RA 3BK0A 4N02A 4JS3A 1F6PA 5IM51 3FS2A 5KINA 4TO8A 4MJMA 1OFOA 1HO4A 1W5QA 1QFEA 1JCMP 2R8WA 2V2DA 3W72A 4C1KA 3HOJA 3QSRA 2E6YA 3OVQA 1TQXA 1VLIA 3W2KA 5DCBA 3DI0A 1BKSA 3MP4A 4RJEA 4JTLA 3C2FA 3EB2A 1AW2A 5CSRA 3C8FA 1F5ZA 4GNJA 4LUJA 2OJPA 2ZDRA 1XBYA 1KM2A 3L5MA 3EX2A 3W7PA 4HNVA 1TIMA 3TKFA 3L21A 4HHPA 3ZWTA 3R89A 3T4CA 2YZRA 3W07A 1AMKA 1HG3A 1O5XA 4UTLA 3UWQA 4MY8A 3DZ1A 3M5VA 1ZAIA 1H7XA 2TSYA 5IBXA 1T0OA 1BWLA 3N3MA 3G24A 3I7SA 4WZHA 3QC3A 3MW7A 4WXYA 3TC6A 1WX0A 3UZ5A 6TIMA 2GVGA 1LOQA 3W75A 3H54A 3LI1A 4WX2A 1ICSA 1VCFA 2V9DA 5GVJA 5K3VA 1ZFJA 1KM4A 1KTNA 1H61A 4M7SA 3H55A 4JN6A 2HS6A 3PUEA 4BR1A 4DPQA 1IIGA 3BLIA 3W7KA 3ABSA 3B04A 4GUIA 2NX1A 2ZZ5A 1H1ZA 1H5YA 5AYXA 4FNQA 3LGEA 4LWWA 1VZWA 3MMTA 1ZHAA 2FB3A 4RCXA 4LS1A 3GZ3A 1VYPX 3TIMA 1DJNA 1FDZA 2QCNA 5HNRA 3UD6A 3DFOA 3W73A 4NXSA 4NNCA 1PV8A 3CHVA 5K7JA 3W2MA 2VFHA 4RXGA 3A24A 4NNBA 1A5AA 2ZRUA 4MPQA 1QWGA 3W1XA 1YTKA 3B0UX 2GVLA 2NZLA 2QJHA 3RF9A 3UWVA 3U8GA 3TSDA 4A21A 4O52A 1KBIA 3E49A 1EEPA 6ALDA 1PCWA 3BVJA 1IXQA 3BLEA 2X1RA 3LHZA 1TV5A 2JGQA 3T55A 1OABA 2QCDA 3T40A 4FIRA 4BWLA 2JKAA 3L0GA 2VFDA 3LBMA 4K37A 3UY8A 3QF0A 4LNYA 1IXPA 2CWNA 1WOAA 3LOTA 2OT1A 8TIMA 5D04C 1XM3A 1WXJA 3W7EA 2C6QA 3M7WA 1QR7A 2V81A 5C2XA 4RKAA 5D38A 1GVRA 3HO8A 3PB0A 1FCVA 2A0NA 3KVJA 1QOQA 1LYXA 3NQCA 2R94A 3TXVA 2Y7EA 1YPIA 3VNDA 2WOQA 1JCNA 1EP3A 1FWNA 1JQXA 1Q6RA 3TAKA 2BWGA 5DBTA 4NX5A 2ZBTA 1KBJA 1V5XA 1P4CA 3W7LA 1LBFA 1FCBA 4RLIA 3PF3A 1QNVA 5C5YA 1ONRA 3GAKA 5BW6A 1I2RA 3CU2A 3LTPA 4M6VA 2DZUA 2YW4A 5D2WA 3EX3A 2AAMA 4PEKA 3NM1A 4ZZ9A 1A50A 2R14A 3NQ2A 1LLZA 3QMSA 3E12A 3MHGA 2BXVA 1FY6A 1W5NA 1TQJA 1SZFA 4XBKA 4AHQA 4S1FA 5G4WA 3TQKA 1M7OA 5F1UA 4IGHA 3KVLA 1W3IA 3S1XA 1ALDA 3G1XA 3GKAA 5LNVA 5LZLA 2E5BA 3GB6A 3BARA 1C8VA 1KFKA 1TTPA 3TJLA 2ZA2A 3V1PA 1FWTA 1EB3A 3ATZA 3EKZA 3UWYA 3DFNA 4UTMA 1IF2A 3L5LA 4UTWC 1N55A 2X1TA 3W2LA 4GFSA 1BEUA 1GT8A 2VKZG 4JYDA 1K8YA 3NQAA 4UFKA 3M1ZA 3M9YA 3EXTA 4PL1A 4A22A 2BZNA 3G8RA 3KAOA 3LHTA 2H3DA 3RNDA 4P2VA 3LERA 1RPXA 5CZ0A 3LCHA 4UFLA 1FCUA 2PCQA 1DHPA 3UY7A 4M7TA 3TROA 1XI3A 5FF2A 2I9EA 2TYSA 3TH6A 1OFPA 4AAJA 4IJBA 1OX4B 3O8AA 2H3BA 3L68A 4O0KA 1UBSA 4RZ4A 2Z0IA 5L6UA 3W71A 5AOUA 4XWUA 3NZRA 2IQTA 3S1VA 3SJ3A 1R2RA 3LTSA 1J4EA 4KWVA 4O1CA 1ZCOA 2HTMA 4KKXA 1F73A 5K2ZA 1OF8A 3S5OA 5DLCA 1LZOA 5CPNA 4FF7A 2ZTKA 3CEPA 3IVUA 3NQFA 3TAOA 1D3HA 1H63A 1H7NA 3W76A 4FNUA 1VQTA 4Y8FA 2VFFA 2E6AA 3FJ6A 1KFLA 5CKSA 4UTTA 2YW3A 1CX9A 3B06A 3HPSA 5E1QA 5U7SA 2WJZA 2XN1A 4JR5A 2QCLA 1G69A 4NUWA 2YCEA 2QAFA 4TR9A 3UZJA 3WFAA 1TCDA 1GYNA 1A5BA 1S3HA 2PC4A 5D2TA 3DBPA 4OGZA 4JXCA 4BK9A 3E9AA 2E5DA 3THAA 3QMRA 4MYXA 3IVSA 3GLCA 4S2BA 4QITA 2RDTA 4JTHA 3G3MA 4JEQA 3S5ZA 3NL6A 4OT7A 4XTDA 4NX0A 1X1OA 2B7OA 1JVNA 1K8ZA 1L6YA 2CLLA 1QDSA 4B5NA 3HGOA 2BTMA 3FIGA 2DZXA 3ZFHA 2WNZA 3LCFA 5KTLA 3NQEA 2NXIA 3TV8A 3W88A 1O60A 1EPXA 1IXNA 3R13A 4OV4A 5KITA 2DU2A 3CB8A 3ATYA 1F7BA 5D09A 3HGJA 4WJEA 3LXBA 3M44A 1UUOA 2XFWA 4UMAA 4HNUA 4J9JA 4I7WA 3IEBA 4L4LA 2E1DA 1TJPA 4WY0F 4MIMA 4X2RA 4AHPA 4PTNA 2GJLA 3NNTA 5FF0A 2E09A 2A2IA 4QSHA 2EF9A 4ICNA 3N73A 5DXYA 3EEGA 5EY5A 1F76A 2QUVA 3SSJA 4NJJA 3IRDA 4EVZA 3EX1A 5HINA 5CPMA 3S42A 4FX6M 3MHUA 3KRSA 5K9DA 4CCDA 1W8SA 4K6AA 4MFDA 1TYGA 1EP2A 4O16A 2TRSA 5HJLA 1VPXA 2J27A 4FO4A 5SWUA 3BGGA 3W1AA 5CZSA 5EYWA 2C13A 3GYEA 1FX6A 4XKYA 5A5WA 1JCJA 4LOCA 2V5LA 3LCXA 2WV8A 3N2XA 1X6UA 1KM5A 1JUKA 4ZL1A 2QCFA 2CLKA 3NL5A 2WNNA 5LHEA 1LRTA 4LU0A 3P8IA 3G1DA 5CZTA 4FB7A 1VYRA 2RHGA 1K02A 2YPIA 3WK3A 3M5XA 4NJHA 3T7VA 3O16A 2NX9A 4TMBA 1TTIA 2DJXA 3HMJG 1OK6A 2H90A 2EAWA 2QKFA 2WO5A 3W1PA 3UWWA 4Y90A 5G1TA 3PY2A 4JX4A 2F7FA 2ISVA 3MP3A 2PE4A 3GDMA 3OHIA 4ZQRA 1VLWA 4NJIA 3EWXA 4UFIA 1WAUA 2W79A 4RV8A 4CNNA 4EOUA 1D3GA 3MHFA 3K30A 2CLOA 1SO6A 3EWYA 3DFQA 3PM6A 4N9CA 5BRBA 5HWNA 3S0CA 1SW7A 3BG9A 4Y6GA 3W7CA 1FCQA 3FYOA 2G5WA 2CU0A 3NQGA 2QR6A 4O57A 1FXPA 2W6RA 3IIPA 3KRZA 5ABTA 4O14A 1BTMA 3INPA 1EA0A 1I8JA 3UWZA 5LSMA 2OMAA 4MKNA 2GPTA 2FPVA 3C52A 4ZQNA 1FWSA 3O63A 4Z0JA 1NF0A 2A6LA 3NA8A 2C1HA 1SSGA 3E96A 4PC8A 1JRBA 3LXCA 1ML1A 5E0KA 2B7PA 4AB4A 5EKYA 3B03A 2QEZA 3O6YX 3C2RA 3G22A 1TV8A 2Y61A 2OZ0A 4ADTA 3IV3A 4JD4A 5G2WA 2AGKA 3P61A 4HIBA 5DCDA 4DEFA 3PWAA 5F2GA 4LUIA 2GQ8A 3O1NA 1ZAHA 1G7VA 3HPZA 3NPWA 2E5CA 4YLWA 3DFTA 4K36A 3GXNA 3TFXA 4QJ1A 4JTJA 3EWUA 1THFD 3PR2A 3QPYA 1NVMA 3RU6A 2FTPA 4RZ6A 4DF1A 3I65A 1EWDA 2ZZ6A 1F05A 1QCWA 4QAIA 5FEXA 2ISWA 3LHVA 5I3HA 3WK2A 3DHFA 1H7OA 3A5VA 4O1DA 2Z1BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1AQ0 A;  1C7T A;  1TPD A;  2G41 A;  3GUW A;  3FJ4 A;  4O4W A;  3W26 A;  3F4D A;  1CTN A;  3QPE A;  5FAC A;  4LS0 A;  3M6D A;  3K4D A;  1I2O A;  3MZN A;  3S2N A;  1BAG A;  1W3H A;  3B9N A;  4DXV A;  3QN3 A;  2V30 A;  3GG1 A;  3LRL A;  1AMY A;  2VZO A;  4D6F A;  4YYC A;  1GG0 A;  1TPV A;  1JD9 A;  4QXI A;  1GIA A;  3GVW A;  2CWX A;  4B2D A;  1R9Z A;  1TPE A;  1E1C A;  2AL2 B;  4GVF A;  4DRS A;  4B4H A;  1J8V A;  2B7Q A;  3TUU A;  2QCH A;  3AXH A;  4GO9 A;  3E5P A;  5EMM A;  2XNS A;  3TA9 A;  1WBJ A;  3CT7 A;  1KM6 A;  3HUR A;  2QGH A;  4KGL A;  3CO4 A;  1KR0 A;  3QV9 A;  1NDY A;  1UPP A;  4OWG A;  4FK9 A;  5M03 A;  4H4I A;  4C6K A;  4LY4 A;  3PTQ A;  1S1P A;  3E0I A;  3T8L A;  4X63 A;  3DEQ A;  4O53 A;  3GHS A;  3GY1 A;  4BZY A;  4PFH A;  2H8X A;  4A8N A;  3USB A;  4BKN A;  4PCP A;  1I2N A;  1E4I A;  4AU0 A;  1XX1 A;  5HMD A;  4TVC A;  3ARR A;  1EGV A;  3SAZ A;  1V02 A;  1BD0 A;  1O5K A;  2OZ8 A;  2NSO A;  1B3Z A;  3BL3 A;  1M5W A;  3TSM A;  5G5I A;  3MZ2 A;  3GXT A;  5TNV A;  4W8L A;  1TJR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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