4S3JA

Crystal structure of the bacillus cereus spore cortex-lytic enzyme slel
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
431
structure length
429
Chain Sequence
FAIQIVTVRSGDSVYSLASKYGSTPDEIVKDNGLNPAETLVVGQALIVNTKGNNYYVQPGDSLYRISQTYNVPLASLAKVNNLSLKSILHVGQQLYVPKGTKRSVESIAYLQPSTIPIKESLVNATRAINPFLTYLAYFSFEAKRDGTLKEPTETAKIANIATQGQTIPMLVITNIENGNFSADLTSVILRDATIQNKFITNILQTAEKYGMRDIHFDFESVAPEDREAYNRFLRNVKIRLPSGYTLSTTLVPKTSSNQKFFEAHDYKAQGQIVDFVVIMTYDWGWQGGPPMAISPIGPVKEVLQYAKSQMPPQKIMMGQNLYGFDWKLPFKQGNPPAKAVSSVAAVALARKYNVPIRYDFTAQAPHFNYFDENGVQHEVWFEDARSIQSKFNLMKEQGIGGISYWKIGLPFPQNWRLLVENFTITKKG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cortical-lytic enzyme
publication title Structural and functional analysis of SleL, a peptidoglycan lysin involved in germination of Bacillus spores.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus cereus
total genus 148
structure length 429
sequence length 431
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4s3jA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4s3jA02
3VINA 2GDUA 1RPKA 9CGTA 3W82A 2E8ZA 3KZSA 4F9JA 1VFUA 2VVSA 4RE3A 3AIEA 5HPOA 2WCAA 2XFRA 4AZ7A 1LL4A 4UOQA 2W92A 2XGIA 3VIMA 3POCA 3N11A 4AWEA 1B90A 1TVPA 4FLSA 1CLVA 5BRQA 5M5DA 4KRTA 3N04A 2ZUSA 3AHVA 4MDPA 1OCQA 1H3GA 1QOXA 1LL7A 2CBJA 2YLAA 1J0KA 3N1AA 3WMCA 3W6MA 4AXNA 3WF3A 3AXIA 1HVXA 1DWJM 3WH7A 4HTYA 1ISWA 1HN1A 4H8VA 2WHKA 5A8OA 4M80A 1E0VA 1MW0A 4WK9A 1JXJA 3CZ8A 2WMJA 2G3IA 1WAWA 2VZOA 5HBFA 3VIFA 1M03A 2BFGA 1UWRA 4PTMA 4D6HA 2ZXAA 1NWSA 4URIA 1VIWA 4BA0A 2VVNA 3W81A 1W9XA 2BY2A 1O7AA 3ZR5A 4GXPA 2NW0A 3ZR6A 1WZLA 4NRSA 5A6AA 1CXKA 4EE9A 1C8YA 4QFUA 1JZ4A 3WEMA 3ZIZA 3KL3A 1UHVA 1HT6A 4PCTA 2YA0A 1IZKA 2E0PA 2D22A 1ISZA 2E9LA 4IISA 5E09A 1VB9A 1EGZA 4U2YA 3S2CA 3WMBA 4DWSD 4CD5A 2Z1KA 3W6LA 1JZ8A 4OZOA 1V6XA 2CBUA 4QP0A 1JYNA 3UEQA 2A3AA 2DSWA 3B9EA 4F8XA 1OGGA 2DSVA 1JZ3A 2O92A 3BAJA 1H11A 4CD4A 3UESA 3D3AA 2GK1A 2VR5A 4QCFA 1U2YA 1BF2A 3CUJA 5ECUA 1JIBA 4UZUA 1OWQA 2WMIB 5A8PA 1RP8A 4KRUA 2OLHA 1J9YA 1ISXA 2ZXQA 1R7AA 4PUDA 3SCVA 1J12A 1V3HA 1Q6DA 1Q6GA 2X1IA 3AMLA 1VAHA 4DUXA 3GXIA 1HJWA 4WIWA 7CGTA 1H2JA 1QHZA 1V6VA 4PTXA 2WK2A 3CZGA 5A6SA 4P7NA 2WPGA 3WD2A 2XWEA 4E2OA 1KQZA 2V5DA 3VGFA 3PZTA 2V3GA 4AZHA 1C92A 1W3KA 3VM7A 1ZJAA 3MKKA 1VEPA 1WP6A 4CU7A 3LPGA 3J7HA 2WC4A 3A3HA 2ZUTA 1ZBKA 3WD0A 1EH9A 4KGJA 3VNZA 1GOOA 2WMKA 3SCWA 1C7SA 4FLRA 2Q8XA 1HJUA 1MFUA 2VI0A 1V0NA 1Q6CA 1OSEA 3SEPA 1I1WA 4KGLA 3AMKA 2F8QA 2WVSA 4QAWA 4MNJA 1ZS2A 4ACYA 5CG0A 1VJZA 5E0FA 7TAAA 1Q6EA 2CETA 1ITXA 1E1FA 2GUYA 2XIIA 4PTWA 1E55A 1GJWA 5CGMA 3AOFA 1ZBVA 1RH9A 1A47A 1QPKA 3FHAA 3QR3A 1W1PA 1E6NA 3BCDA 4D72A 4EK7A 3N18A 3CBWA 1NOUA 3VMNA 2OSYA 4P8WA 1GQLA 4Z2HA 3NSXA 1BTCA 3ZJ7A 4MAVA 1IT0A 3TTOA 2YL6A 5ABHA 1XGZA 1E6ZA 4HOXA 1K9EA 4H2CA 3W38A 2WNWA 4MNMA 3VIOA 1ZB5A 1CGYA 1E4IA 1UG6A 6CGTA 1H0IA 1SYTA 3AROA 4XX6A 2W62A 4NRRA 4M29A 1UYQA 2BVYA 4GI8A 1M04A 3W0KA 3ZT6A 3GXMA 4FF5A 3FHQA 2YDSA 3SCOA 4W8AA 5HOSA 2O9RA 3PBGA 3RMEA 3MV11 5JBEA 1FOBA 2GVYA 2VZTA 2V3FA 1Q4NX 2Y4SA 3B9AA 1KGUA 2W91A 3QGVA 1EDQA 1JI1A 1US3A 2BHUA 1BPLB 1C8XA 3T2OA 2A3CA 2ZUNA 1XRVA 3SUUA 5E6ZA 1EIBA 1LG2A 2EBNA 3T2QA 1RP9A 1NWTA 4UQEA 4AZ5A 1JD7A 1V3JA 3PN8A 4BQ5A 1HKIA 1V0KA 3MU7A 3JUGA 2AAAA 5BRPA 4RL3A 1W2VA 3ZQ9A 2EO7A 4CVWA 4P7LA 3T08A 4PMUA 1CZ1A 3GDBA 2ZX5A 4E8CA 4CU8A 2F2HA 4Y7EA 2BXYA 4GO8A 4OBRA 5BXRA 3VIIA 4UFHA 4PSPA 3T2PA 4F9DA 1J0JA 1EO7A 3VDCA 5FIPA 4JKKA 1V3MA 4GQRA 1JYWA 1MXDA 4B15A 1PX8A 1QNSA 3WBAA 1UA7A 3O6AA 1UR8A 2YKKA 3LPFA 1UWTA 4S3KA 4BQ2A 4GI6A 5IFTA 2XWDA 4H41A 3SCNA 5EMYA 1OD0A 4H8UA 5DEZA 3L4ZA 2VURA 3OB8A 1HNYA 4ZXLA 5HXMA 1JI2A 2A3EA 2XTKA 1OD8A 4PYSA 1GVIA 2VNCA 2HISA 3WEOA 4PMVA 2FHFA 1KXTA 3MMWA 4AIUA 1ISYA 3VIHA 1KR1A 1MW2A 3OLIA 1UKTA 1VFOA 4UQDA 4W7UA 5I77A 3GNPA 1DHKA 3VTRA 3ZSSA 2VRJA 3ARTA 4J7RA 2PWFA 3CZKA 5A95A 1HL8A 1ZL1A 1DWFM 1XH0A 2E4TA 2OWWA 1GONA 4ZXOA 5AY7A 3QHNA 5I6SA 2OSWA 3VDAA 1B3VA 2XUCA 5ABEA 2WVVB 4MPKA 1J0IA 3AYSA 2JALA 1QI5A 5BCAA 4PN2A 4AW7A 4PEEA 3B8SA 3ARZA 2VOTA 4P8XA 3VPLA 4D6FA 1E6PA 1MXGA 2CHOA 4IPLA 1JDCA 2UWFA 1EOMA 1E4MM 5CZKA 2YDRA 4W88A 5I78A 3WMSA 3KL0A 4W5UA 2DT1A 3EDEA 4AD0A 1B0IA 4UQCA 2E8YA 2DH3A 1V3IA 3WDPP 1GQJA 1G94A 1KBBA 3EDJA 5D9PA 1W2PA 4H7VA 3WKZA 1E40A 3AHTA 4W8BA 1EO5A 1GOWA 1B3WA 2WMGA 3L4WA 3PTKA 1LJYA 2VX6A 3IJ8A 2BS9A 2J75A 3QOKA 1MFVA 3M6DA 4A3YA 3I3EA 3N17A 4PMYA 2PWHA 3UG4A 4ATLA 1DTUA 4B9ZA 1FH9A 1AMYA 4BZYA 8CGTA 3M07A 2J62A 4HZ7A 1UH3A 2GJXB 2WC3A 3MMUA 4HA3A 2VX5A 4MB3A 3NSNA 4C7FA 3OA5A 5LA1A 4JFWA 3VD3A 3BH4A 3ARUA 2WSPA 3DYOA 3WDHA 4PRWA 4IUGA 2XFFA 1E0WA 5GPRA 3AS2A 3NSMA 6TAAA 5M17A 1JNEA 1CNVA 4ML4A 3MS8A 5DMYA 1GORA 4MDOA 3AJ7A 1PX3A 3UR8A 3A6OA 3U57A 1HP5A 1KXQA 2CBVA 2JFEX 2XSAA 4W5ZA 2BY0A 2XVKA 3EYPA 1UQYA 4J27A 4BQ4A 3WSUA 4CD6A 2UY4A 1PIFA 2ZX9A 1UH4A 5DO8A 1QI2A 3BAWA 3BCFA 3O9NA 5I24A 1VBUA 2WMHA 1W32A 3TA9A 4W8LA 5GQBA 8A3HA 4N42A 4A3HA 3UR7A 1D3CA 1CGXA 1J18A 3VD9A 3G6LA 3I3BA 5C71A 2DT3A 2Y24A 4Z2IA 3U5YA 3WF2A 5JH8A 1GNXA 1O6IA 5CPTA 1BAGA 2QF8A 4UZSA 1WB0A 2B31A 3IAPA 1RD6A 3W4RA 1NQ6A 2FHBA 3WN6A 1EDGA 4AD4A 3SUTA 3L4TA 4W93A 2WYSA 3VIPA 5CGTA 3AIBA 1WDRA 1VFMA 1G01A 1FH7A 1Z32X 2G41A 3PZGA 1JGIA 4TX8A 3BGAA 1QW9A 4DWSB 2QPUA 3DC0A 3SCTA 4ZE4A 2WZIA 4QLJA 1QI4A 1UKPA 1QNQA 3MV01 3FAWA 4UQAA 1G0CA 2WWCA 4PMXA 1WDPA 2GDVA 2J77A 3CHEA 4V2XA 1FP8A 3AZRA 4W7VA 4WLCA 4UFJA 3BLKA 1UWUA 4MB4A 1KCKA 1BVZA 1EQPA 3RILA 4Z2KA 1E4NA 3WEZA 4AZCB 3W26A 1U33A 4PMOA 1GOQA 3AMGA 1NWUA 1FHLA 5IHSA 1NOWA 5CLTA 3U7BA 1PZ2A 3OIHA 1UZ4A 4F79A 3AIWA 3SUVA 4FLQA 4PSRA 4WSKA 3FAXA 3NCOA 3BSHA 4UFLA 2PB1A 1QBBA 1ZJBA 1W91A 1DP0A 2WVTA 3AMCA 1ITCA 3PZNA 1GPFA 3L4UA 3OBAA 3I3DA 4U2ZA 2X8RA 2ZX6A 4YN5A 1XSIA 1J0YA 3W27A 1IZJA 2ZICA 1XSJA 3A4WA 3NIYA 3OZOA 2DPEA 3HJEA 4E8DA 4U31A 1XD0A 3WDIA 4E4PA 3AS3A 1Q6FA 3ARWA 2JF7A 3VM5A 5JIWA 4CD7A 4HMEA 1TR1A 3WNPA 2X0YA 4P8VA 4P8UA 4TVCA 2VC9A 3PZOA 4U5IA 2WLYA 2W61A 3APGA 3D5HA 3WF1A 1VENA 1V02E 5DFAA 4HZ6A 4GQQA 4WKHA 5I79A 1GOIA 3S6TA 4HMCA 1V3LA 2MANA 1HKMA 1KB3A 4LYQA 2WLZA 3K46A 1HKJA 2EXOA 2IXUA 1V03A 1JNDA 1JF5A 2G3NA 3BAYA 2E9BA 3VILA 4WSJA 3VDBA 1WZAA 1Y7VA 1H41A 3CUGA 3WNLA 4JFSA 1OINA 4D6EA 3RDKA 2D3NA 2XFYA 3WH5A 2CNCA 3DHPA 2XVPA 1E6QM 3ARYA 3AISA 2GSJA 5CXPA 2ZWYA 1LF1A 5LA2A 1HF6A 2NT1A 1C93A 1OIFA 3SUWA 4GI9A 2CEQA 5BXPA 3UCQA 1E71M 1AQ0A 4J3VA 1UQZA 3RM8A 4PMQA 3VIGA 1WNOA 4L4OA 1XYFA 3QHOA 4TUFA 4CN1A 4XV0A 1HX0A 5CPQA 1KCLA 2DIJA 4CN6A 4P7QA 3L4YA 3WQ8A 2QMJA 3WELA 4HP5A 5A6JA 1LL6A 1CBGA 5F7UA 3AZTA 4CU6A 4AYSA 3THDA 3PZMA 1EHNA 2E3ZA 5A8QA 1GJUA 2J8FA 1XHGA 2YA2A 2A3BA 1EA9C 3ZT5A 2J7DA 3ZSTA 1VRXA 2OWCA 1KFWA 1FHDA 4HU8A 1TFVA 1UD4A 3VGEA 4H04A 2V3EA 4B3LA 1QHOA 3A47A 3SCUA 1TVNA 2W4XA 4AIEA 4PMNA 3WQ5A 5DF0A 2JIEA 1PIGA 1V0MA 1EDTA 5A3HA 1VEMA 4JFUA 1W9VA 2JEPA 1GCYA 2XM2A 3GBEA 4TXEA 2QLYA 1UR1A 2GK1B 1CGWA 3WDRA 4OBSA 5A2AA 1W3JA 4Q22A 4M56A 4X0NA 4W87A 2XJ7A 2VQTA 1GOMA 3T0BA 1OT1A 4LYRA 3GH7A 1QBAA 1ZBWA 4CN4A 2ZUUA 1TA3A 3OGSA 1BQCA 1QVBA 3IANA 2C8NA 1JAEA 1BVNP 1GHRA 2WVUA 1GVYA 5IFPA 5A69A 2VTFA 3SCPA 1E3XA 2ZXBA 1B3YA 3WDQA 3KEHA 3WUEA 3VIJA 4DUVA 3UETA 1TG7A 2G3JA 3AI0A 1H1NA 3L2LA 5CPSA 4HPHA 4FLOA 2YJQA 2ZUMA 3RO8A 4BS0A 4R5EA 1BLIA 1B3XA 2W5FA 1UWIA 1F4AA 3AFBA 1ZU8A 3AMDA 4UOZA 3CZEA 3PZUA 2VRKA 3CUIA 4D71A 1JAKA 1E56A 1MYRA 3PZVA 5IHRA 1UZ1A 4MNLA 2D3LA 2UY2A 4ZENA 1PEZA 2X2YA 5CSYA 4JL2A 1BG9A 3VGHA 2DSZA 1KXVA 1JXKA 4CCCA 3ARPA 2WVVA 1NM9A 3FW6A 3BAKA 1W1TA 5JBDA 1B9ZA 2WM0A 3RM9A 5D8ZA 4PCSA 2WB5A 4UNIA 2D1ZA 5GNXA 1V6YA 1JG9A 4B3KA 4D6JA 5JBFA 5EFDA 5HNNA 1H4PA 3E1F1 1GQIA 4Q7NA 1YQ2A 4RE2A 3PZ9A 3K8LA 1IV8A 3AXXA 1PZ3A 1B3ZA 2Z1SA 2JF6A 3NDZA 1UUQA 4JFVA 4CKQA 3K8MA 1WDQA 3FY1A 4S3JA 2ZUWA 4J3XA 4MAZA 1OBAA 2GFTA 3SCRA 4JHOA 3TTYA 2FHCA 2GJXA 1NP0A 4W84A 3ZOAA 3WQ4A 1BYBA 2C7FA 2W63A 3FN9A 2CYGA 1DEDA 4NI3A 2VR4A 2YBTA 4M24A 1QNRA 3THCA 3ZJ8A 3VNYA 2XYLA 5E70A 1W9UA 7A3HA 2G8ZA 1M01A 1BYAA 1CXHA 1QI3A 3BAIA 3IJ9A 4LGXA 4CCEA 3VO0A 1CXIA 2DSUA 2FGLA 2JEQA 3HMCA 1MWOA 3B9DA 1HJXA 1UKSA 5C8BB 1W3HA 1KR0A 1ODUA 3WL0A 1JYXA 1E1EA 3CIVA 4W7WA 5ABFB 1L0PA 1VFFA 1NOFA 1WKYA 3BXWA 1TE1A 1UR9A 1MQRA 5CQ1A 3WF4A 3L4VA 2WKGA 5FCZA 3M7SA 5DT7A 2VUYA 3K8KA 5A6BA 4WF7A 1CGUA 4GINA 3WENA 2XIBA 4WJXA 2O9TA 2D24A 5AC5A 3BMVA 4AEFA 3DHUA 3DECA 3L4XA 4UFMA 1WPCA 5FL1A 5AC4A 1E43A 3AHXA 2QHAA 3NUKA 1TUXA 2XSBA 1JL8A 3WUBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1LLW A;  2CZF A;  4EIV A;  5KEZ A;  2E40 A;  3ARX A;  2NV1 A;  2QZR A;  1G9H A;  4LF1 A;  4O4V A;  3C2F A;  3AIV A;  4DEF A;  3TN6 A;  4UFK A;  1W3L A;  4PBG A;  4GQG A;  4UTW C;  3ZXW A;  4GVF A;  4OTK A;  5D9O A;  1SSG A;  4JIE A;  2PTD A;  1GG0 A;  4XZB A;  4H3D A;  4GCX A;  1Z7A A;  4GYP C;  3WLP A;  2HXT A;  3T44 A;  1ONE A;  3TWA A;  3DYP A;  2VT0 A;  3W70 A;  1QOQ A;  1QPO A;  4HQV A;  1RCO B;  1CXF A;  4YPJ A;  2XM1 A;  1YDO A;  4HB7 A;  1PTD A;  4QDM A;  3LHW A;  3V1H A;  4HCD A;  2DW7 A;  3EWW A;  4LAV A;  4AZC A;  4PRT A;  3QV7 A;  3N3M A;  4I5R A;  3UZ5 A;  2C1I A;  4HZ8 A;  1TPF A;  3EPM A;  3M4H A;  3F5L A;  2QPS A;  2QCH A;  5CZT A;  3T0D A;  3GR7 A;  2Y6Z A;  2AMG A;  3RLV A;  3CLW A;  3PY2 A;  2LJ4 A;  4NZJ A;  4YCP A;  1E6S M;  1KGX A;  3EDK A;  1M41 A;  3TC6 A;  3HMJ G;  1JZ6 A;  3P93 A;  4BR1 A;  4IP7 A;  5D2X A;  4D1I A;  2P4V A;  4QLK A;  1HL9 A;  2IKI A;  4IP5 A;  4F66 A;  1P6C A;  1F73 A;  3N15 A;  1DHP A;  3AIQ A;  2C13 A;  2C15 A;  2RAG A;  4HGX A;  4JFJ A;  4AVO A;  4XAF A;  3VZZ A;  3NEV A;  1UBP C;  1JCH B;  2QV5 A;  3VKK A;  3WQE A;  3KAO A;  4E6M A;  3M5V A;  4OJY A;  2F6U A;  3HJZ A;  4KFN A;  1P0D A;  4RR4 A;  1OF6 A;  4RUB A;  3DES A;  1XLF A;  2ZE0 A;  2RUC A;  4AC1 X;  4F4R A;  1POJ A;  1EJS C;  1S46 A;  1VFH A;  2FH8 A;  5F4W A;  2ZTK A;  1EF3 A;  3A4A A;  1FWS A;  3R79 A;  1OZM A;  3CHF A;  4RKA A;  1TTQ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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