1QNVA

Yeast 5-aminolaevulinic acid dehydratase lead (pb) complex
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
342
structure length
328
Chain Sequence
MHTAEFLETEPTEISSVLAGGYNHPLLRQWQSERQLTKNMLIFPLFISDNPDDFTEIDSLPNINRIGVNRLKDYLKPLVAKGLRSVILFGVPLIPGTKDPVGTAADDPAGPVIQGIKFIREYFPELYIICDVCLCEYTSHGHCGVLYDDGTINRERSVSRLAAVAVNYAKAGAHCVAPSDMIDGRIRDIKRGLINANLAHKTFVLSYAAKFSGNLYGPFCYQLPPAGRGLARRALERDMSEGADGIIVKPSTFYLDIMRDASEICKDLPICAYHVSGEYAMLHAAAEKGVVDLKTIAFESHQGFLRAGARLIITYLAPEFLDWLDEEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Dehydratase
molecule keywords 5-AMINOLAEVULINIC ACID DEHYDRATASE
publication title MAD Analyses of Yeast 5-Aminolaevulinic Acid Dehydratase. Their Use in Structure Determination and in Defining the Metal Binding Sites
pubmed doi rcsb
total genus 90
structure length 328
sequence length 342
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 1999-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qnvA00
5CPOA 1UASA 1WBJA 4OWGA 2X1RA 2QAPA 4X22A 5KMYA 4ZVJA 3STEA 3TUUA 2HS8A 2V8ZA 4OU1A 4OV9A 3W7QA 2DORA 3W7JA 2TPSA 2PC4A 3EB2A 5LKYA 3PBUA 1W5MA 2CLOA 4O1BA 4R53A 3L5AA 3W83A 2E68A 1H7RA 2QUUA 3W6YA 1FWTA 3QMSA 5HWNA 4E2BA 4KFOA 3ATYA 3DHDA 3EX4A 4CQ9A 4IXHA 1TPEA 3G3MA 3H54A 4JTGA 3HIJA 1Q45A 3EWUA 4RZ4A 3C8FA 3MP3A 3BVJA 1GYNA 3M9YA 4L4MA 5K3VA 1LLWA 4QIUA 3G3DA 5E0KA 3NAVA 3NQ8A 3ANYA 1WA3A 4LTSA 1JCNA 1FCUA 3GX9A 2CU0A 2XFWA 2E6DA 1G6CA 4X9SA 1ME7A 2YGYA 3A23A 3PVFA 2X1SA 1FWWA 3LCGA 3CLMA 1YDOA 1DOSA 1FY6A 2X2GA 3W2JA 3THAA 4CLMA 2JKAA 3L0GA 4IX0A 1F76A 1Z48A 4O19A 5DCEA 4EOUA 3CEUA 4O54A 2BTMA 3NA8A 1FX6A 2HSAA 3BW3A 1KTNA 3P61A 3GDTA 4J9JA 4S1FA 4Y8FA 3GR7A 3LLDA 2R8WA 3QW4B 1K7EA 4IUOA 1THFD 3JS3A 2PRMA 4IGHA 5AYYA 1VCVA 3LXAA 4JS3A 4MLJA 1O95A 1KLYA 3HO8A 3PG9A 1LORA 5AHIA 1M7PA 1B57A 3W7EA 3OA3A 1EIXA 3CWNA 1W3NA 2HMCA 3OBKA 1OFOA 1TPFA 3NDOA 1R30A 5AHEA 2VFHA 4BR1A 2GQ9A 5D32A 1LTDA 4NJJA 1T96A 4NZJA 3DKLA 1MEHA 1NFBA 3TQ0A 4O0ZA 1EPXA 1K03A 4UUIA 3HGRA 3U2OA 4P2VA 2QKFA 3MWAA 3A24A 3CU2A 1EP3A 2GJLA 4TIMA 3QSRA 2ISWA 1VRDA 2C1HA 3NNTA 3R12A 4LS2A 2RH9A 1P0NA 4NJKA 1L6SA 5F2MA 2A7PA 5FF7A 5CKSA 1UB3A 1SW3A 4XKYB 1JCYA 1ZNNA 3CHVA 3WJSA 3GDRA 1UUMA 4Z0SA 3GXTA 3OIXA 3PF3A 1P5BA 3L5MA 3NZRA 5I3IA 4QQ3A 3P60A 2NUWA 5FF2A 3TCEA 3EWBX 1ZALA 2CLFA 3EEGA 3VE7A 4O57A 2YW4A 3W23A 4IOTA 3L66A 4CNOA 4E0CA 1QAPA 1XBXA 1K3UA 3TV8A 3W1UA 1OFEA 3PS7A 4Y90A 1C8VA 5FEPA 2ZBTA 4LVBA 4JYEA 3N73A 2J9YA 4GUHA 1GWJA 1LROA 3QW3A 3MUXA 4AHPA 3HBLA 3GB6A 2R91A 4EF8A 3C2OA 4G1KA 2B7NA 4GUGA 2QUVA 1MEIA 4DXVA 2A0NA 1YTKA 1X1OA 2BWGA 3IRDA 3G1XA 4A22A 4FNTA 1KFLA 4K37A 2DZPA 4A2RA 3WK1A 4UFHA 4IJBA 1PV8A 1B3OA 5FI8A 3LCIA 4K36A 1ONRA 3B06A 4NX0A 1KFJA 4U28A 3KRZA 1DV7A 4TMBA 1JCMP 1W31A 2VFGA 4O50A 5D2TA 3F4WA 2E6YA 3WJXA 2XN2A 1QR7A 1VYSX 1TO3A 4N4PA 4ZL1A 1SSDA 4ORMA 1SPQA 1F2JA 3M0ZA 3WK3A 3GK0A 1SW7A 3NQDA 1P0KA 3FYPA 1DVJA 3BV4A 4FXRA 3TR2A 3LHYA 1MSSA 5F4SA 1XBYA 4IXXA 2C0AA 1N8FA 4TO8A 4N02A 1FXQA 2VEPA 3Q2DA 3LDVA 1ML1A 2C6QA 3FS2A 5D09A 1VZWA 3LHUA 3T55A 4RV8A 1JVNA 1VYPX 4XKYA 3G0UA 1SQ7A 3E96A 3LM7A 2A7NA 4LC6A 4POCA 3G8RA 1I4NA 1FQ0A 2XN0A 3L67A 3NGJA 3NYZA 4HPXA 5DLCA 3P7YA 1AW2A 5HWMA 4Z08A 4K8HA 3W1PA 3Q58A 3KFTA 5HINA 2WOQA 5HJLA 3W7LA 1KM6A 4JTEA 5AHFA 1R47A 4LRTA 5AHMA 1KFBA 1VHNA 2CZEA 4DO4A 2WNNA 3HMJG 1ZCOA 3S42A 5SWUA 5EA9A 3TX9A 4JGDA 4HNTA 5AC7A 4QISA 3GDKA 3QQ0A 2VEIA 4GE8A 3LV5A 1TMHA 3PBWA 4NXKA 4IPJA 1ME8A 2V2HA 3PM6A 4TU1A 4R34A 4Q4KA 1SZGA 4XQ6A 1WDWA 5BNKA 4FB7A 1O94A 4UTMA 4H4IA 5LNSA 4O4WA 4RKAA 2A2IA 5FF0A 2O7SA 4DBDA 5BMWA 3W7KA 1OF6A 3L2IA 4Z0JA 4AF0B 3CTLA 3I7RA 3B0UX 1IF2A 3STFA 4K7YA 4PODA 3TFCA 3VCRA 1QPRA 5E93A 3QJAA 4PL2A 2QCEA 2VC6A 1VGAA 3UY8A 3YPIA 3NPWA 4GUFA 1TPC1 2W79A 1O60A 2A7RA 3BG3A 3E02A 3TK7A 4EF9A 4QSHA 3OEXA 3NQCA 5FEWA 3UWQA 2V2CA 3C2FA 4O13A 2P10A 2YYUA 4GXMA 5CZSA 3MI6A 3NPVA 4A2SA 2WSQA 5IBXC 1OX6A 4RZ6A 1JUKA 3DZ1A 4ZQNA 3TXZA 1PVNA 1Q3NA 5HNRA 4EIVA 3NL3A 1Q6OA 1WXJA 3N14A 1XC4A 3QRHA 4UTJA 1NF0A 1W5QA 5AYZA 5AC8A 3S1VA 5F2IA 3PSWA 3T40A 2CLIA 5AHNA 1KFCA 1VC4A 4M19A 2OT0A 1YPFA 3T4CA 4LOCA 2J9XA 4H3DA 1QWGA 2EKCA 4M7TA 2NWSA 1QPOA 3KX6A 4RZ5A 3LGEA 3F03K 2QCHA 3M1ZA 4OGZA 3RNDA 4AWUA 3LCHA 4ZQOA 4NNBA 2TSYA 4YXGA 1FDYA 2VOMA 4HSOA 1QOQA 4FXSA 1YYAA 2CWNA 1Q6LA 3W75A 4YCPA 4GFSA 3W7HA 4FX6M 2FFCA 4MZYA 4X3ZA 1TQJA 1VH7A 1J4EA 1I8JA 5LNVA 1H7XA 2B7OA 4LVAA 2OZ0A 5TBOA 3FLUA 3G1VA 2AQWA 2QJIA 5CG7A 2W6RA 2RKXA 1IXQA 3IVSA 3LB0A 4UMCA 1H61A 3NL5A 1WBHA 1QPQA 1EB3A 1TTJA 3NQ6A 4JYDA 4UFJA 7TIMA 2EHHA 1YADA 1QO5A 1FCQA 1TCDA 3HPSA 3L21A 2DJLA 2FPVA 1HG3A 4MLRA 1VLWA 5DBTA 3NM1A 4PTNA 3DKJA 4RCXA 3OVPA 4M6PA 1VLIA 3B0VC 2GVGA 1YTDA 5FEZA 1ZAHA 4MY9A 3DHFA 3EWXA 4GNJA 4CCCA 3W22A 4RK8A 4BI6A 3UWZA 3V1PA 1KM1A 3C0JA 1NF7A 3RF9A 5LHEA 1W5NA 1U5JA 1OK6A 4JXCA 1GEQA 2C15A 2ZRXA 4Y9AA 1OYBA 3EXTA 1TTIA 1XXXA 4O12A 4HNVA 1EWEA 2QCCA 1KM3A 3W07A 3W2MA 5J5DA 2C16A 3DBPA 4WXYA 1ICSA 2HS6A 5G4WA 1KFKA 2QCDB 5AFDA 1ZAIA 4MY8A 3W85A 1NSJA 2ZRVA 1W54A 3TSMA 2I1OA 3P80A 2VELA 3R5EA 1N55A 1CW2A 1WOBA 3LTPA 1H7PA 4MFDA 5KINA 5DBUA 3PWAA 3VKJA 2JK2A 4O15A 2OT1A 3NQEA 1MO0A 1TV5A 2A4AA 3MHUA 3EWZA 4NZFA 5D2XA 5G2IA 4FNSA 5LZLA 3W7OA 2ABAA 2QCLA 1K8YA 4OV4A 4NQ1A 5I3JA 2A1YA 5DCBA 3IVTA 4XZ9A 5E1QA 1F6PA 3PG8A 4Z1DA 1NVMA 3SZ8A 2PE4A 5MHBA 3O1NA 2VFFA 3O15A 1SFLA 4UFKA 4HSNA 3STCA 3TU9A 2GQAA 4RXFA 4W9TA 5AN7A 2KZHA 3LXBA 4UC5A 1D3HA 3NG3A 2Y7EA 4O4VA 4KKXA 4O18A 4ZQPA 1GVOA 3STGA 1TRIA 1IXNA 4XBSA 5D04C 5I3HA 1VQTA 3THQA 4M6VA 4RJEA 1FXPA 4DF0A 2ZZ5A 5IM51 4YWIA 3P82A 2I9EA 4DO5A 1K7FA 3W7RA 3E49A 4C1KA 3P74A 3M16A 3UWYA 1GTHA 2ZCGA 1M6JA 3BO9A 4UNKA 2RDTA 2WKJA 1LOQA 1B4EA 3LOTA 1BWKA 1F74A 3GNDA 1OFRA 3GDMA 3KRSA 2E1DA 4GUJA 2PRLA 5IBXA 3LI1A 1W37A 3UWWA 2NX9A 3G1DA 3TA6A 4AWSA 1S3HA 3GYEA 3FOKA 3QF0A 1N7KA 4BWLC 2ZA1A 4MVAA 4ICNA 4BI5A 1XBVA 4MZ8A 1M7OA 1LBMA 3E12A 4JTIA 2A85A 1AW1A 2Y61A 1OHLA 2QCDA 5C5YA 5LHFA 4DEFA 3WFAA 3IIPA 2NXHA 3S0CA 3NQVA 3W1AA 4D2JA 1OK4A 1RQBA 3O06A 4L4LA 3LCWA 4E38A 3MO7A 4FEZA 4KFPA 3W7MA 1EEPA 3HJZA 3TAOA 3NEVA 1Z41A 1FBAA 4JTLA 4DO6A 4LC8A 4O16A 3W88A 1EUNA 4N9BA 3I6RA 5G2HA 1LLZA 1L6WA 1H1ZA 3RLVA 2Y7DA 3IVUA 3W7IA 5D2WA 3EWWA 3BARA 1K8XA 2E5CA 5FESA 4YMZA 3FEMA 3F1QA 4PH6A 4MZ1A 4ONVA 1A50A 1I2NA 3W7NA 2ISSA 4DF1A 3PB0A 3TIMA 4HT3A 3C6CA 1KBJA 3UPBA 1SO6A 2R14A 1OFQA 1L6YA 2QAFA 3SJ3A 5CZ0A 5F2GA 1F5ZA 2JBMA 5K4XA 3HPZA 1OABA 3LV6A 4JTJA 4UTWC 5A8GA 3C56A 4O1AA 2CZFA 1H63A 2A21A 4LU0A 3N9SA 2B0MA 4MPQA 4GJ1A 2Y7GA 2VFDA 4M6QA 1W56A 2V2DA 3CQ0A 3SI9A 1EP2A 2GJNA 1VCFA 2TRSA 1CX9A 3GAKA 4NVTA 4LRSA 4WY0A 1QMLA 3A22A 3KVJA 5GVJA 3O07A 1TTPA 2R94A 3QSTA 3MMTA 4PCFA 3FA5A 2E5BA 3DU0A 3EKZA 1Q6QA 1ZAJA 2OMAA 4IMDA 1K7XA 4BFAA 2Q8ZA 3L0KA 1I2QA 1H50A 2ZZ3A 1LRTA 3UXDA 4UTTA 1QDSA 4JY9A 2YZRA 1JCLA 3PY2A 2C18A 1EX5A 3PAJA 2WQPA 1W3TA 3ABQA 1HFBA 1ZFJA 4NJHA 3L68A 4JTSA 3ATZA 1P4CA 4LVFA 1FWRA 3T78A 1I2RA 5C2XA 1JRCA 4ZQCA 1GVSA 4M5PA 1TTQA 4N2YA 3RK8A 2TYSA 2EGZA 2V30A 4MUZA 2Q8LA 1TPH1 5A5WA 3W1XA 3TMLA 3S1XA 1Y0EA 1PIIA 2WNQA 1BTMA 4NXSA 3UNDA 1IGSA 4ZZ9A 8TIMA 2NUYA 5EL1A 3S8HA 1W5PA 4EWND 4UMAA 3TKFA 3O16A 3N34A 1AG1O 5EPDA 5FEXA 3U8GA 3PUOA 2FB2A 3QFEA 1C29A 3BG5A 2O7QA 3PBVA 1I2OA 3HF3A 3LTSA 1XDLA 3LXCA 3FFSA 3S1UA 5AC6A 1PL9A 1EP1A 5AB3A 4CQ8A 3HPXA 1GG0A 3PC0A 4N9DA 2BSLA 1T8XA 2YXGA 4WOZA 3PULA 2B4GA 1X7FA 5C54A 4DBEA 1YXCA 2WO5A 5LGXA 3DI0A 3L0NA 4PL1A 2Q3OA 1EUAA 1OG0A 1Z44A 3MBFA 5F4XA 1SO4A 1O4UA 3B03A 3FKKA 3W1RA 3VNDA 1EA0A 3OG3A 4MOZA 3BK0A 3N9RA 2ZFAA 3KOFA 4ZQMA 3EX2A 3PR2A 2Y6ZA 1RV8A 2QJHA 4QNEA 3LI0A 4MYAA 2X16A 5AOUA 1X8FA 4AH7A 1GJPA 1H7NA 2C13A 2FPTA 4OE7A 4GWEA 1GQNA 3HQ1A 1J5TA 1O5KA 1KFEA 1V7YA 1LCOA 3LLFA 3GKAA 4O11A 2QCMA 4YCOA 1A5SA 1KM5A 4WD0A 5CPMA 3DGRA 3LX9A 4MFEA 3P5YA 4UR8A 2ZQ0A 3CWOX 4Z1CA 3UYCA 4QJ1A 4OBTA 3E9AA 5H91A 3QZEA 2BZNA 3M6YA 1FWNA 3HG5A 1F7BA 4ZMGA 1H5YA 2ZDRA 4WJEA 1SUXA 3BGJA 3OVQA 1HO1A 3P5ZA 3CIWA 5KTLA 1B4KA 3KAOA 2J27A 1LYXA 2GVLA 3TJXA 1QCWA 1T99A 1IIGA 3SGZA 3W71A 4IMGA 3TSDA 2E5DA 1VPXA 1YDVA 5DXXA 4K39A 1VR6A 2G95A 5C55A 3L5LA 2WPBA 2G97A 2ZRYA 2ZRZA 1OJXA 3PB2A 2YYTA 4AHOA 2VFIA 1F73A 3UY7A 4XTIA 1KM2A 3G8EA 1VS1A 2FDSA 3ELFA 3JRKA 1OX4B 3WK0A 5D05A 1YXYA 2DZUA 1AK5A 2CLMA 3P62A 3P8IA 5D03A 1MZHA 4K7VA 2Y70A 4B5NA 2FB3A 2V5BA 4Y6GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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