1OG6A

Ydhf, an aldo-keto reductase from e.coli complexed with nadph
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
297
structure length
297
Chain Sequence
LVQRITIAPQGPEFSRFVMGYWRLMDWNMSARQLVSFIEEHLDLGVTTVDHADIYGGYQCEAAFGEALKLAPHLRERMEIVSKCGIATTAREENVIGHYITDRDHIIKSAEQSLINLATDHLDLLLIHRPDPLMDADEVADAFKHLHQSGKVRHFGVSNFTPAQFALLQSRLPFTLATNQVEISPVHQPLLLDGTLDQLQQLRVRPMAWSCLGGGRLFNDDYFQPLRDELAVVAEELNAGSIEQVVNAWVLRLPSQPLPIIGSGKIERVRAAVEAETLKMTRQQWFRIRKAALGYDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords HYPOTHETICAL OXIDOREDUCTASE YDHF
publication title Crystal Structure of Ydhf, an Aldo-Keto Reductase from Escherichia Coli
rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 95
structure length 297
sequence length 297
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00248 Aldo_ket_red Aldo/keto reductase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.100 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel NADP-dependent oxidoreductase domain 1og6A00
2IPFA 3UG8A 3P2VA 2PDPA 1ZUAX 2IQ0A 2R9RA 2PDXA 3GHUA 4PMJA 4WDWA 3C3UA 3R43A 2HE5A 3EAUA 1QRQA 1LWIA 2PEVA 3UFYA 1ADSA 4GABA 2HDJA 2CLPA 2INEA 3COTA 3CAQA 1GVEA 2PDWA 4WGHA 1PZ0A 4FA3A 1EKOA 2IKJA 2FZ9A 1EL3A 2PDGA 1ZGDA 1Z8AA 4YU1A 2ACRA 5HA7A 3F7JA 1PYFA 2FGBA 3LNMA 2QXWA 3G1RA 2IS7A 4DZ5A 5C7HA 4YVVA 5JH1A 2INZA 2IPJA 2DUZA 1EXBA 1OG6A 2PDYA 4ASTA 5LIWX 1HW6A 4JQ1A 1PWMA 3GHSA 1XF0A 4DBUA 4LBSA 3O0KA 4QBXA 3N2TA 3T42A 4QX4A 4JQ3A 4PUWA 3GHRA 2BGQA 3H4GA 3QKZA 4PRRA 1MRQA 1QWKA 3V36A 3CV7A 2PDKA 2P5NA 1IEIA 1LQAA 2WZTA 4F40A 2PD5A 1J96A 1S1PA 3MB9A 3M0IA 2HEJA 2I17A 3R8HA 2DV0A 3UWEA 3UYIA 4Q7BA 4IJCA 3M64A 5LIYX 1C9WA 4RPQA 3CAVA 4YS1A 5HNTA 3O3RA 4IJRA 2R24A 4HBKA 4JIHA 2PDHA 4WRHA 4AUBA 1ZSXA 3FX4A 3LZ3A 4ICCX 4FZIA 4JQ4A 3R6IA 3KRBA 1Q13A 3MC5A 1UR3M 1MI3A 2PDCA 3BV7A 2PDNA 2J8TA 4R9OA 4XVEA 2HE8A 4IGSA 1FRBA 4QXIA 2I16A 3R8GA 4HMNA 4WEVX 1AH4A 3BCJA 1X98A 2PDMA 3FJNA 4EXBA 3H7RA 4LB4A 5HNUA 3NTYA 3GUGA 3UZWA 5M2FX 3RX3A 1PWLA 3DN5A 3S3GA 3R58A 3R94A 4JQ2A 5LIXX 1EF3A 3EB3A 2C91A 2FZ8A 3BURA 4FALA 3Q67A 1X96A 2HVNA 4JTQA 1Z3NA 3BUVA 3G5EA 2FZDA 3LZ5A 1K8CA 4QR6A 2PZNA 2IQDA 4JTRA 5AZ1A 2F38A 1RALA 3UP8A 4JTAA 4OTKA 2NVDA 2HV5A 3ONCA 4DBWA 1M9HA 1XJBA 1RY8A 1VP5A 1HQTA 3M4HA 3LQGA 3H7UA 2HVOA 4YVPA 4XO7A 2PDQA 2IPWA 3UZYA 4WDXA 3UZXA 1YE6A 2PDBA 1ZQ5A 2IKIA 4JQAA 1AFSA 3V0SA 4LB3A 3VXGA 2ISFA 1RY0A 2BGSA 4H7CA 3ERPA 4G5DA 5JH2A 4XO6A 1Z89A 4EXAA 3CASA 3D3FA 4MHBA 4XZMX 1T40A 4H8NA 5LIUX 2IKHA 4XZLX 3Q65A 3R7MA 3N6QA 4GQGA 1YNQA 1YNPA 2VDGA 3RX4A 2PDJA 3WCZA 1T41A 3B3DA 5DANA 3WBXA 1AZ1A 3DOPA 1SM9A 3LQLA 5LIKX 4GCAA 4GIEA 2AGTA 4LBRA 1JEZA 1S1RA 4GACA 1A80A 4XZIA 1Q5MA 2PDFA 4PR4A 4JIIX 4XVDA 4NKCA 3ONBA 4LAZA 2ACUA 4I5XA 3V0TA 2FVLA 1R38A 3RX2A 4L1WA 3UGRA 2IPGA 1AZ2A 1X97A 2FZBA 3WBYA 2A79A 3LN3A 1US0A 4PUUA 4L1XA 2BP1A 2ACQA 4GQ0A 4Q3MA 2NVCA 3CMFA 3GHTA 4JTDA 3UZZA 4JIRA 3WG6A 4WDTA 4ZFCA 4XK2A 4XAPA 3LUTA 3LEPA 4YVXA 4LAUA 1Z9AA 2ALRA 5AZ0A 2PF8A 3V0UA 2PFHA 2WZMA 1S2AA 4DBSA 2IKGA 1MZRA 3WBWA 2PDIA 5KETA 2F2KA 4WDUA 3U2CA 2PDLA 4FAMA 1VBJA 4JTCA 3LBOA 4XZNX 1AH0A 3LD5A 2DUXA 1XGDA 3CV6A 3V35A 4XZHA 1S2CA 4PRTA 3EB4A 2ACSA 2PD9A 1PZ1A 1AH3A 3LENA 4GA8A 2PDUA 1IHIA 1YE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XW8A 4KETA 5K9DA 3EWDA 4UOZA 2YA1A 1FXQA 2J9XA 2HE5A 3LCGA 1EJUC 3QMSA 2WOQA 4AQLA 3W75A 4ATWA 3STFA 1WQ5A 5JIPA 2VD8A 4Q8WA 3C0JA 1TFVA 1NSJA 2X1UA 1WDSA 3RK8A 4QE5A 2IKJA 1RVGA 4KWVA 5DELA 3WLRA 4DJFA 2F2HA 1VENA 3B0YA 3RR4A 1VHCA 1EP1A 3B8WA 1VS1A 3BW2A 1G9HA 3QYQA 4MMWA 4ZE5A 1OIMA 3VOJA 4XQ6A 3TX9A 3CZGA 1PTAA 1FH7A 2EQDA 1BVZA 2VX7A 4HB7A 3O7UA 4C6FA 2D2JA 3WLSA 3DC8A 4F0SA 4KIRA 2O7SA 4FI4A 3IAPA 1XLGA 2DUAA 3CV7A 1IEIA 2ZTKA 4DZHA 1U83A 2E68A 2G3MA 3GR7A 4B3LA 1S1PA 3MB9A 1OT1A 3WQFA 2XVLA 5DMYA 1I8JA 4ZXLA 4GZIA 1TKKA 5C55A 4QGCA 3KXQA 2QAPA 3AUJA 4PUDA 1RQHA 5CSYA 1CGTA 2R1KA 5HNTA 2GVGA 3SY5A 2CW6A 2ZRZA 4EIVA 1UQYA 4O50A 4WRHA 2H3DA 4HP5A 4C1NA 3UGVA 2P0IA 4FNTA 4RK8A 5CGQA 3I3BA 3RF9A 1V0MA 1HKIA 2JKAA 5CBJA 4EKJA 4DYKA 2ZXBA 2NLIA 3F5JA 4L4LA 1DJXA 2BSLA 2Y6ZA 4BZYA 4UTMA 4QXIA 2WHJA 5BU9A 3NO1A 2QF8A 3LCWA 1FKWA 4WJXA 1H41A 3NDOA 3IACA 1JL8A 1ZAJA 3ARPA 3WF3A 3CQ0A 4PGLA 5CSSA 4EXBA 3N9RA 4Q4MA 1GEHA 3K8LA 5I3IA 1GVIA 1VJSA 4PTMA 3PUEA 2C71A 2V69A 3AIBA 5M2FX 5FAJA 3UR7A 1Q6DA 1WDDA 2V3FA 1GJWA 2YDRA 3CK5A 3OJGA 3I3DA 3QPEA 5LHEA 2W91A 1OB0A 3NM3A 1J0HA 1ZBKA 2VMFA 5K9CA 1GG1A 2Y7EA 5C9ZA 1SW0A 2FFCA 4UOJA 1GW9A 5ECVA 1NWUA 4Q6XA 1CI1A 3FSUA 4BQ5A 2VEFA 3GG8A 2NVAA 3NEVA 3OVRA 1XLHA 1YEYA 4O11A 3L2MA 4GVIA 5C70A 3N18A 4RR4A 3A6OA 2XINA 1J2WA 1R9ZA 3DKLA 4G6CA 5M1TA 4DAIA 4GNJA 1W91A 1OHLA 1P0BA 5IFTA 1TRDA 2HTMA 2PMQA 2VX4A 1H11A 1XXXA 1A5NC 3MMWA 2XFRA 3FV9A 4HJWA 3UZYA 4HYRA 4PSPA 3FEMA 2NQZA 1AQMA 4A2SA 2OO0A 3J7HA 4KGJA 2CCRA 3V0SA 2FPYA 2ZRWA 5CZ0A 4TO8A 3D47A 2VDHA 1O5RA 1AW5A 2QEZA 2X1TA 4MZYA 4ZE4A 3E02A 2NT0A 5CC7A 4IT1A 4ACYA 4I5RA 5FEPA 3R7MA 4U5IA 1PSCA 1UOKA 4FNPA 4KWSA 2C6QA 3RX4A 2XDFA 1T41A 2RDTA 3OTRA 4DLFA 3S1XA 5HUOA 1U33A 2QJMA 3A21A 3WBXA 3MUXA 5E1QA 1DBTA 1SM9A 3QW3A 4L61A 3IJ6A 2A1YA 3BOFA 3GTHA 3CZJA 2XGBA 1LDCA 1Z32X 4J2PA 3CUHA 3UNTA 1P6WA 1SR9A 2WHLA 3VD3A 3TN4A 4QLJA 3S6OA 4JEJA 1SU5A 3MCMA 3EMCA 1EIBA 4JIIX 5GJPA 4ROQA 2C1HA 3W2NA 1VGAA 3AXIA 4I5XA 4PBGA 3W6MA 3ZT7A 3H2OA 4AIUA 1RLDA 4BHYA 1LRTA 5LZLA 3LU2A 1B3ZA 3VIIA 3IEBA 2CITA 3BCDA 4Q8QA 3EMZA 4WXZA 1VFMA 4DWSC 2PUZA 3GC4A 3LV6A 1GK8A 3ABOA 3B05A 4JDYA 5AFDA 3EKLA 3AICA 1CT5A 3VA8A 1OZMA 3ZO9A 1UH3A 2PSNA 5FAGA 1P0NA 1ZAIA 4X2PA 5DY2A 3CO8A 4DWSA 5L9FA 1M01A 2XFWA 3OLGA 3UVAA 1QDSA 4IL0A 4LX4A 2WZMA 2J25A 3P62A 4LAKA 3VGFA 3NL6A 5DXYA 3AHXA 4AAJA 1BWLA 1H62A 3HFYA 4PMDA 2Y5JA 2PDLA 4OECA 3TAOA 4KF1A 3ZXWA 4LEQA 4ZB5A 3ITXA 5GJMA 1RR2A 1T0OA 4AMAA 3E2SA 3TQKA 4LNYA 3OGSA 1W3HA 3R11A 1F5ZA 4ES4A 3LTSA 3KTSA 3RPMA 3PJXA 3W23A 4TVDA 1RJPA 1KNWA 3ZMRA 2J66A 4DN1A 3ATYA 3SO7A 1M03A 2VXNA 3RU6A 1XRSA 5FF2A 1IGSA 4XTDA 3DI0A 4NX5A 3Q2DA 2NUWA 2FQIA 2QULA 1H5VA 1LWIA 2E6AA 1FWEC 3GTXA 3ARZA 4K7VA 3TOYA 1PCWA 1BYBA 1TV3A 4OV4A 1PBGA 3VDAA 1Z7AA 3VYLA 7REQB 4OVXA 3N4EA 1Y5WA 3G22A 1W3NA 2FGBA 4IL2A 1RBOB 1QPKA 1XBXA 1F74A 1DJQA 4K6AA 4LEFA 4XG1A 3IS4A 4YVVA 3GC2A 2IMRA 3N11A 4GG9A 2R14A 1QO5A 1UWRA 3C5QA 5CLTA 5EL1A 4MTVA 2PBGA 3WQGA 5TF0A 3VNJA 1UZ1A 1U5JA 2CZFA 4WY0F 2ZKMX 1Q63A 3OOQA 2VEIA 2YJQA 3TH6A 3PG9A 2ZZ6A 2PODA 3RLVA 1TTQA 4AFYA 4UTWA 3AWNA 1F61A 3II1A 2UV8G 2E25A 2I56A 4GVHA 3BARA 4LVFA 3KS6A 1XYZA 3IARA 2PTZA 1QNVA 1J96A 3AHVA 1F9CA 1TPUA 2HEJA 2YSWA 1UKTA 1XRFA 5ABTA 1QCWA 3B8TA 3MBFA 4X61A 5EYWA 2VRJA 4DAFA 1E5JA 5M17A 3CAVA 1DPMA 1X6LA 3R25A 4X63A 2QMJA 5IBXC 3M0JA 3EWXA 3MDWA 4JYEA 4DUOA 4TTGA 1JDEA 3NSXA 4UTUA 1GZGA 3KBJA 4ICCX 2EXOA 1WB0A 3FJ4A 1RCXB 2WCSA 3M5VA 3BANA 1YHTA 5CBIA 3B9EA 1R2RA 1HL9A 1TJRA 1F3TA 1FHVA 3MZNA 1AVAA 2ZIDA 2Z1BA 1FX6A 1GQLA 2WZEA 4NNCA 1PIGA 2NV1A 2W3ZA 4YTTA 1JRBA 4UTLA 1ISXA 2DVUA 4QJ4B 1O5QA 2NX3A 2VJXA 3CO4A 2NW0A 2P88A 4LALA 1EJXC 1EA9C 1NP2A 5A6BD 3B0UX 5HNUA 2NWSA 3N29A 2WC4A 1DV7A 9XIMA 1K7EA 4GOAA 2B7NA 1X8FA 2BG5A 2C15A 2O9TA 4PTXA 3TFCA 2VELA 2VP8A 1KGWA 3TW6A 3T0BA 3QOMA 3W7GA 3B4YA 4C6DA 1OX6A 3UWQA 3DG3A 1OK4A 5CJMA 2WNNA 4US6A 4HK5A 3C2FA 2HS6A 1O1ZA 2JIEA 3F4CA 2I9EA 3Q94A 4UTTA 4W84A 2PWGA 1DXEA 4KFNA 7TIMA 1CTNA 5HJLA 3RU8X 4NSBA 1RY8A 2A3BA 3W85A 1QJWA 4HU4A 3K1DA 1IR1A 4DJDA 1YBQA 3V5FA 1UCWA 3H7UA 4UCGA 3QY8A 2GWGA 1FWFC 1WDPA 3RN6A 4P7OA 3E0IA 4PUNA 3GXDA 4HPJA 1O5XA 2O9RA 3FA3A 3LRKA 1POJA 1RCOB 2XSAA 1VRDA 4QAWA 3QPZA 2PWVA 1KB3A 4LS2A 4AMCA 1X6NA 1ZJHA 4JAWA 5I3HA 1ALDA 2WWDA 5DY3A 3CQJA 4ZA0A 2A2IA 1SMDA 5LXEA 4CN4A 4AG0A 2I14A 3W74A 6TIMA 2ZWYA 4GI4A 4EXAA 5HR6A 1K6AA 1E73M 2ZWZA 1Q4NX 3QSTA 1GTEA 4DO4A 3GG0A 5EBUA 4ZO9A 3G3MA 1ZRQA 3TTOA 1V51A 4N7QA 1PKYA 5BMWA 4B4FA 3WX7A 1NFPA 1LLWA 2FB2A 3EEZA 1Q65A 1TRIA 4NNAA 5LIKX 3WQ8A 5AYBA 3T4WA 1T7LA 5BXRA 3ATZA 2BXYA 3EPOA 1S1RA 4M56A 4LANA 4RNFA 4K8GA 1VPXA 2P1FA 5G1MA 5FJOA 1TTPA 4YHGA 4RDYA 3VAVA 1AODA 1UZHA 1RBLA 2H9AB 2B7PA 1MFUA 2Y7GA 3QJAA 1XLEA 4HGXA 4W5UA 4N9DA 1V6YA 1HKJA 1POKA 3VNMA 2R8WA 4CQDA 3B0VC 3HGOA 2EO7A 2CPUA 1Q7QA 2FZBA 5HOSA 3BSGA 3S2JA 3T0DA 4RPPA 3C8FA 2VOTA 1QPRA 4X9SA 2ZXQA 4Q3MA 4MSSA 1EP2A 3MI2A 3IGUA 1ICPA 5CG7A 5E6ZA 2VT0A 1V03A 5IXEA 4DO7A 3V0UA 2P3EA 3ALGA 1XLAA 2PFHA 1KFBA 4MY8A 3WUEA 2J7DA 4IPNB 1MZRA 2G3FA 3GFYA 1HNYA 5AKQA 1I2NA 1E3XA 1O4UA 3U2CA 3QPYA 4HHLA 5ABHA 4LY4A 1T99A 2UBPC 3LD5A 4HOZA 2Y63A 1XFBA 4MY9A 1SMAA 1IYXA 3W1TA 3OLEA 2XVGA 5I23A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XW8 A;  4KET A;  5K9D A;  3EWD A;  4UOZ A;  2YA1 A;  1FXQ A;  2J9X A;  2HE5 A;  3LCG A;  1EJU C;  3QMS A;  2WOQ A;  4AQL A;  3W75 A;  4ATW A;  3STF A;  1WQ5 A;  5JIP A;  2VD8 A;  4Q8W A;  3C0J A;  1TFV A;  1NSJ A;  2X1U A;  1WDS A;  3RK8 A;  4QE5 A;  2IKJ A;  1RVG A;  4KWV A;  5DEL A;  3WLR A;  4DJF A;  2F2H A;  1VEN A;  3B0Y A;  3RR4 A;  1VHC A;  1EP1 A;  3B8W A;  1VS1 A;  3BW2 A;  1G9H A;  3QYQ A;  4MMW A;  4ZE5 A;  1OIM A;  3VOJ A;  4XQ6 A;  3TX9 A;  3CZG A;  1PTA A;  1FH7 A;  2EQD A;  1BVZ A;  2VX7 A;  4HB7 A;  3O7U A;  4C6F A;  2D2J A;  3WLS A;  3DC8 A;  4F0S A;  4KIR A;  2O7S A;  4FI4 A;  3IAP A;  1XLG A;  2DUA A;  3CV7 A;  1IEI A;  2ZTK A;  4DZH A;  1U83 A;  2E68 A;  2G3M A;  3GR7 A;  4B3L A;  1S1P A;  3MB9 A;  1OT1 A;  3WQF A;  2XVL A;  5DMY A;  1I8J A;  4ZXL A;  4GZI A;  1TKK A;  5C55 A;  4QGC A;  3KXQ A;  2QAP A;  3AUJ A;  4PUD A;  1RQH A;  5CSY A;  1CGT A;  2R1K A;  5HNT A;  2GVG A;  3SY5 A;  2CW6 A;  2ZRZ A;  4EIV A;  1UQY A;  4O50 A;  4WRH A;  2H3D A;  4HP5 A;  4C1N A;  3UGV A; 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