4HZ7A

Crystal structure of bglb with glucose
Total Genus 173
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
173
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
KKFPEGFLWGAATSSYQIEGAWNEDGKGESIWDRFTRIPGKIKNGDSGDVACDHYHRYEQDLDLMRQLGLKTYRFSIAWARIQPDSSRQINQRGLDFYRRLVEGLHKRDILPMATLYHWDLPQWVEDEGGWLSRESASRFAEYTHALVAALGDQIPLWVTHNEPMVTVWAGYHMGLFAPGLKDPTLGGRVAHHLLLSHGQALQAFRALSPAGSQMGITLNFNTIYPVSAEPADVEAARRMHSFQNELFLEPLIRGQYNQATLMAYPNLPEFIAPEDMQTISAPIDFLGVNYYNPMRVKSSPQPPGIEVVQVESPVTAMGWEIAPEGLYDLLMGITRTYGKLPIYITENGAAFDDQPDQSGQVNDPQRVGYFQGHIGAARRALADGVDLRGYYAWSLLDNFEWAEGYSKRFGIIYVDFETQQRTLKQSAQWYRDVIANNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords beta-glucosidase
publication title Structural insights into the substrate recognition properties of beta-glucosidase.
pubmed doi rcsb
source organism Uncultured bacterium
total genus 173
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4hz7A00
1EHNA 4OZOA 5CZKA 4MNMA 5AYBA 1H1NA 4BQ3A 4GI9A 1XSKA 1WP6A 2AOSA 4PMOA 3ARSA 2ZXBA 3PZOA 2CPUA 2GDVA 2W92A 2ZICA 1TVNA 3CZGA 4H7VA 3II1A 1Q4NX 1UR1A 1V02A 3VMNA 1W9BM 1VFOA 2WLYA 4AIOA 1E6SM 5GQBA 1E6QM 2AAAA 2QV4A 1UKQA 2J7DA 4HZ6A 2F2HA 5A8OA 4BQ4A 1BQCA 2YLLA 1FFQA 5I23A 3ZR5A 1PAMA 1KWKA 5I77A 4PMYA 1PJ9A 3UCQA 4E4PA 1HP5A 3AROA 2Y8VA 5ECUA 2V5CA 1G0CA 1UZ1A 2CBIA 1H4PA 4OUEA 3AFBA 4D6FA 4CN6A 5CSYA 5A8MA 2G41A 4J27A 3WF0A 1C91A 4CD4A 3O6AA 1OD8A 1JGIA 3N9KA 2WVSA 3AXXA 4MAZA 5A6SA 1CGUA 4PMUA 2VMFA 4N42A 1GQKA 1EGZA 4W87A 4JCMA 3GZAA 2XIBA 4BZYA 1W91A 1PX8A 3KZSA 4U2YA 4GI8A 1JDDA 4PMVA 4UOJA 3F5KA 3CH9A 4PYSA 6A3HA 1EDQA 1WCGA 2X0HA 2WMFA 4ML4A 3VDAA 1GOMA 3AIVA 1CXFA 2DPEA 1PEZA 1JZ7A 2QMKA 4YN5A 3FAXA 4GZJA 4UQCA 2XPKA 1ESWA 1HJWA 4D71A 5A2CA 4AD1A 5JIWA 3WNNA 1J0IA 1DTUA 3UR8A 3AMCA 1UA7A 4TX6A 4X9YA 3OIHA 2BNJA 3WY1A 4M82A 1C93A 1KGWA 1KXTA 5A8PA 4PCSA 4ACZB 3NSMA 1UD6A 1V03A 3F4VA 2VZOA 3T09A 1C7SA 2D22A 1CEOA 1V08A 2VZTA 3T0BA 3FW6A 2CKSA 4AD2A 3KWXA 3BXWA 5I2UA 2XM2A 1GVYA 1QHOA 3L4XA 1H11A 1FP9A 4TUFA 4GQRA 4JZ5A 3EDEA 3CUIA 1UR9A 5FCZA 3WDQA 2X09A 4Z2KA 4UQAA 4EK7A 1GOQA 1KXQA 4UFIA 1MXGA 2EQDA 4HZ7A 2QLYA 1E6ZA 3VD5A 3EMQA 1UR8A 5ABHA 1CGXA 2DT2A 1CXHA 1W1VA 3GBDA 3NDYA 1VFFA 3L4WA 4FF5A 1LG1A 4Z2GA 1L0PA 5E6YA 3U7BA 1VFUA 1HJXA 1MFVA 1HKIA 1EO5A 3GXIA 3LPOA 1XD0A 4ACZA 2BHZA 4B3LA 4WSJA 3VVGA 1QOXA 2JIWA 2O9OA 1W9UA 1KFWA 1V0LA 3WH8A 1PBGA 1E56A 1MXDA 5JBEA 1J0JA 1ZB5A 5DT7A 1M03A 1Q6EA 1NOUA 2EJ1A 4NF7A 2WVVB 2XM1A 2WC3A 2J7FA 2D23A 2QPSA 4A3HA 5FD0A 1VEMA 4QAWA 6TAAA 1HJSA 2NT1A 2Y2WA 1BGGA 1WDQA 3GH4A 4BA0A 2EPKX 2Y8KA 3OA5A 5F7UA 1UOKA 5D9MA 1US2A 4EAMA 2V38A 3N17A 5ABFA 4X0NA 2BY1A 4DWSC 1QHPA 2HVMA 4AZ6A 5KZ6A 2FHBA 1FH7A 4UFLA 3AHXA 5IHRA 3PZ9A 1KGUA 3W38A 3DHUA 5LA0A 1JL8A 1BVZA 2A3AA 1PIGA 3VIIA 2WVVA 4QLLA 2CITA 3PTKA 1D7FA 2WZEA 1U33A 3LPPA 3WD3A 3MO4A 1GQJA 3S6TA 3VGEA 2W4XA 3BAWA 1V3LA 2GJXB 2D3LA 4PRWA 2O92A 4F9DA 1Q6CA 2WSPA 3VX0A 4MB4A 1E0WA 3CZLA 3K4DA 2ESCA 3HMCA 1HKKA 1XYZA 1C8QA 3MMDA 2IXUA 4MJ2A 3MV11 4E8CA 2W61A 2WMKA 2W5FA 4IISA 3K46A 3W6MA 2ZWYA 3QHNA 1CGVA 3WNMA 2BY0A 3IJ7A 1HN1A 1A47A 3OB8A 1QI2A 1KQYA 3BAXA 4M80A 1B30A 2OYLA 4UR9A 4GIAA 3ARTA 1B3VA 4AZCA 3FHQA 1EQCA 1DP0A 2AMGA 4W7WA 3WELA 4FK9A 2WZIA 3AZSA 3G6LA 3W24A 1V3JA 2GJXA 4J7RA 2WC7A 4IPNB 1UKSA 3VD7A 1HF6A 2J62A 5A2BA 3AIEA 3AMGA 2CNCA 3PZVA 1E43A 3IK2A 1Y7VA 3BH4A 3WF3A 4LX4A 2O9PA 4TTGA 4AZBA 4KWUA 2DT3A 2A3BA 2C0HA 3RMEA 1IT0A 1JXJA 3SCPA 2X05A 2W62A 3PZMA 1WKYA 1UQZA 4HOXA 2VQTA 3WBAA 1E4IA 4AYSA 3DECA 2VURA 4JCLA 4DWSB 4FMVA 3RO8A 3AMLA 4H2CA 4LXFA 3PBGA 2XVGA 1X6NA 3VM5A 1GZJA 3BGAA 1W1TA 3VIHA 1KCLA 3WDHA 1PPIA 2FGLA 4LYQA 7CGTA 3W27A 2DT1A 3UG4A 1EHAA 2XG9A 3WNPA 3VDHA 4B9ZA 2ZXDA 3BAIA 3WFLA 3A6OA 1DWGM 5A8QA 4GO8A 2WVTA 1B2YA 3CUJA 2YIHA 2VVSA 5HNNA 2ZX7A 5BRPA 1IZKA 1MWOA 3POCA 3CTTA 4DWSD 2A3HA 3CHDA 3ZQ9A 2YDRA 3VGBA 4AD5A 3O9NA 1TMQA 1D3CA 3AQUA 3OZPA 3NSXA 1I1WA 1EIBA 3ALFA 3MU7A 1GW1A 4H04A 1GHRA 2CETA 2BY2A 3CBWA 3QOMA 3N1AA 1R87A 2NT0A 1NP2A 3WMBA 1UR2A 4MDOA 4PBGA 2QPUA 4YHEA 1JAEA 4OIFA 2YA2A 1X6LA 2YJQA 5CXPA 4UQDA 2ZUUA 4NSBA 3VO0A 4HU8A 3PZTA 2WMGA 2V3EA 1KB3A 5ABGA 1CTNA 4UQ9A 2ZIDA 1HVQA 2F8QA 2WK2A 3MMWA 1JYXA 4MB1A 1ITCA 5DF0A 4FLQA 1O6IA 2CYGA 5A2AA 3WEZA 1KR1A 3SUSA 3THCA 4OBRA 2XJ7A 4GKLA 4U31A 3B9EA 4P7QA 1E1EA 1EDTA 1DWAM 2JF6A 5IXEA 4UNIA 3WH7A 3TA9A 3EDDA 2EPNA 3BMWA 1ODZA 5A6BD 1QW8A 1GONA 3WF1A 4NI3A 2OSXA 3WNOA 1TCMA 1UD5A 2GFTA 5A69A 4KH2A 5ABEA 3VDCA 1UWTA 1B3ZA 3BLPX 3WIJA 1BTCA 1JYVA 4U33A 1J0YA 1UHVA 3SUWA 4AY1A 3WH5A 2YDSA 1B3XA 2WHKA 4BQ5A 1DEDA 1XRVA 1JG9A 3S2CA 3AYRA 1DWIM 1E6PA 3VIOA 1O7AA 2WZHA 4FLOA 1ISXA 2FHCA 4JKLA 1JFXA 5HPCA 1HJQA 4AEEA 1CPUA 3AMDA 1TA3B 3KL0A 1OB0A 2OSYA 1W9VA 2DSUA 3WQ4A 2W91A 1E55A 1JXKA 3AMKA 1QI4A 2ZX8A 1ZL1A 1UD4A 2MANA 4PEEA 1JNDA 3I3BA 1WDSA 3AXIA 2ZX9A 5E6ZA 3GXFA 5CJ5A 2E8ZA 1V6YA 2WCAA 3WDJA 2B31A 1J18A 1P6WA 4R27A 1LL7A 3MANA 1ZBVA 1E6NA 1UD8A 3LPGA 4HA1A 4QCFA 5E09A 3WUFA 3GBEA 4DM1A 2WSKA 1ZJBA 2WAGA 4Z2JA 5HPOA 3WEOA 1B31A 2V3GA 4WSKA 4ATWA 1TZ7A 4KGLA 5DT5A 3AYSA 3WQ8A 3WH9A 2ZWZA 4CD6A 1JDAA 2D0HA 1OWQA 1XH2A 3NDZA 2VR4A 1BF2A 1DWFM 1E9LA 1TA3A 1H5VA 3N04A 3FY1A 2V5DA 4MADA 1ISWA 4WF7A 1HL8A 3VTRA 3GDBA 4S3JA 1DWJM 1HP4A 3PN8A 1VENA 2WANA 3WQVA 1J12A 5IFTA 2JEPA 2DDXA 1QHZA 1H2JA 2XYLA 1WAWA 3L2MA 1VEPA 1ZS2A 3AHYA 1E72M 1UH3A 2WW5A 1ZJAA 2Y5EA 2BS9A 2YL8A 4P8VA 3IJ9A 1SMAA 1UH2A 5C8BB 2XVNA 2J77A 2WKLA 1W32A 1N82A 4MJ4A 1G1YA 3HN3A 1SMDA 3EMZA 1CWYA 3RM8A 2Z1KA 4M24A 3DYMA 1IZJA 2PB1A 3QOKA 1NOWA 3FAWA 3VMPA 1J10A 2DSVA 1WZAA 4WJXA 3CHCA 1H49A 2PI6A 2WBGA 5FOOA 4R5EA 3UR7A 3WH6A 3AIWA 2WB5A 4D6CA 2VL4A 3MKKA 1E4LA 3ARQA 1XCXA 1PZ3A 3MUAA 1M7XA 4M1RA 5CPTA 3RM4A 4L4OA 1E3ZA 2CHNA 3U57A 4PMDA 3WENA 3UG3A 2HISA 2G3IA 4CN4A 4C7FA 5CQ1A 3KE0A 5M17A 4QLJA 2PBOA 3WQ6A 1EA9C 1B90A 2UY5A 3WBEA 4UFMA 4M29A 3AS3A 1UQYA 5D9PA 1DWHM 1E40A 2G3JA 5A1AA 5GNYA 2Y4SA 2QMJA 4PMXA 7TAAA 2O9RA 5CLWA 4PTMA 1BYDA 1HIZA 2BVYA 2QF8A 2GK1B 3VIFA 4J3VA 3SCTA 2DH2A 1UKTA 1A3HA 1CENA 2EPMX 4NRSA 3WUGA 5EFDA 2VVNA 4XV0A 1U30A 5LYRA 4GXPA 2J25A 3VKKA 1V3KA 1ZBKA 1UWSA 1NWRA 2OYMA 4XZBA 1XHGA 3GXDA 5JBDA 1W9XA 4P8XA 1XV8A 5CPQA 1K9DA 3SCUA 3W4RA 4K68A 4TXEA 1BAGA 5E9AA 1V0NA 4HA3A 3T2PA 5BROA 3SURA 4D1JA 3WNKA 1LF1A 1AQHA 3QR3A 1RP8A 4J3TA 2F61A 5ABFB 2BVDA 1V6VA 2OWXA 4Q7NA 2DGAA 4OOZA 1H3GA 3RIKA 1QBAA 2PWFA 1QVBA 3TTQA 4JFSA 2EBNA 1LG2A 5C70A 2XVLA 2GK1A 2VZUA 2XSAA 1JNEA 1XCWA 4UQBA 5EB8A 1UD3A 2VR5A 2BY3A 1OM0A 3TONA 5JUVA 2PBGA 1LWJA 1UD2A 3AIRA 3BC9A 1VEOA 2XHYA 4S3KA 1AVAA 1R8LA 4HMDA 3PZUA 1YHTA 2J78A 4UFJA 2YL6A 1J9YA 1RP9A 1OT2A 8A3HA 1NP0A 2VO5A 4QDMA 3APGA 3TOPA 4B3KA 1ZU8A 1E4MM 1G94A 1JDCA 4CCDA 1WB0A 3PZNA 2VQUA 2A3EA 1CZ1A 5IDIA 4ZXOA 1EXPA 3L2LA 3WDPP 3MV01 5HXMA 4ZENA 3L4ZA 2X8RA 2CESA 1AQMA 3T2QA 4W89A 3ZT7A 4W84A 2O9TA 3OGVA 1MW2A 4LQ1A 1VBUA 4D6JA 1QNOA 4WKAA 1UH4A 1GOIA 1J01A 3L4UA 4D72A 1U2YA 3AHZA 1VJSA 2CXGA 3AICA 3OG2A 3VGDA 5M3WA 1JYNA 3CIVA 3BAJA 4AZGA 5E0FA 3KL5A 3RPMA 1GHSA 2YA1A 1Z32X 1OT1A 4PUDA 4AZCB 1CIUA 4KRTA 1JYWA 2OLHA 3M6DA 4XX6A 4CU8A 2PWEA 3FN9A 2GUYA 4UZSA 1E73M 1WDPA 3ZJKA 3WSUA 5I3DA 1K9TA 2NSXA 1CYGA 4HPGA 1UR0A 2E9BA 2XFYA 2CBJA 1BGAA 3PTQA 1JZ6A 1ISYA 2CBUA 1OGSA 4JHOA 2WNWA 2G8ZA 4W93A 1J11A 3TTYA 4PUEA 1R86A 4P8WA 2OYKA 3OLGA 4RL3A 1Q6FA 3A4WA 3PTMA 2CEQA 2NW0A 1VFMA 1PX4A 1K9FA 4WKFA 4C7GA 3N15A 2WM0A 1E6XM 4U5KA 4XZWA 1MYRA 1BYBA 1CLXA 2XFFA 4Z2LA 4HMEA 1FH8A 3AS1A 1UKPA 3BCFA 3QHMA 3CZJA 4LPCA 2VZVA 3ZSSA 3CO4A 1E0VA 2WMIB 3WUBA 3VM7A 1VRXA 1JIBA 3ZOAA 4M81A 1BYCA 4GI6A 2OSWA 1R7AA 1NM9A 1OGGA 1OGBA 3UEQA 1XC6A 2CERA 1BG4A 2J75A 2UY4A 3U7VA 4E8DA 1V6XA 1LL4A 3M46A 2WWDA 4U3AA 1C8YA 5BYWA 3T2OA 3A4XA 1JI2A 4ZE4A 3A3HA 1H09A 1WNOA 4JL1A 3WEMA 4N0RA 3VNZA 2JIEA 1FH9A 4CN1A 4UQEA 6CGTA 4OBSA 2WWCA 1GVIA 3BAYA 4UOQA 5HBFA 1UKOA 1QNSA 3IJ8A 3TP4A 2JFEX 2XSBA 3W53A 4GZEA 1E70M 3B8SA 1CXLA 3L4VA 1W3KA 4AIEA 2EPLX 2J74A 4ZFMA 3ARWA 1SYTA 4U3CA 1BHGA 5LA2A 2WMIA 1NWSA 3WF2A 2GVYA 3WQWA 4D6GA 1UZ4A 2XVPA 5AC4A 4AWEA 1MFUA 4W88A 2D2OA 4TTUA 3UESA 4WIWA 1CGYA 3T0AA 1BYAA 1GOKA 3K8KA 5CGTA 3SUVA 1UUQA 4QCEA 1GNXA 2C8NA 2VX4A 1BSIA 2XFRA 1AMYA 4UZUA 1B9ZA 4MAVA 1QI3A 4W8BA 1SR0A 3EYPA 4PTWA 2YKKA 2ZX5A 3CZEA 3KEHA 1G9HA 1LQ0A 3VMOA 1NWTA 4J3SA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EHN A;  4OZO A;  5CZK A;  4MNM A;  5AYB A;  1H1N A;  4BQ3 A;  4GI9 A;  1XSK A;  1WP6 A;  2AOS A;  4PMO A;  3ARS A;  2ZXB A;  3PZO A;  2CPU A;  2GDV A;  2W92 A;  2ZIC A;  1TVN A;  3CZG A;  4H7V A;  3II1 A;  1Q4N X;  1UR1 A;  1V02 A;  3VMN A;  1W9B M;  1VFO A;  2WLY A;  4AIO A;  1E6S M;  5GQB A;  1E6Q M;  2AAA A;  2QV4 A;  1UKQ A;  2J7D A;  4HZ6 A;  2F2H A;  5A8O A;  4BQ4 A;  1BQC A;  2YLL A;  1FFQ A;  5I23 A;  3ZR5 A;  1PAM A;  1KWK A;  5I77 A;  4PMY A;  1PJ9 A;  3UCQ A;  4E4P A;  1HP5 A;  3ARO A;  2Y8V A;  5ECU A;  2V5C A;  1G0C A;  1UZ1 A;  2CBI A;  1H4P A;  4OUE A;  3AFB A;  4D6F A;  4CN6 A;  5CSY A;  5A8M A;  2G41 A;  4J27 A;  3WF0 A;  1C91 A;  4CD4 A;  3O6A A;  1OD8 A;  1JGI A;  3N9K A;  2WVS A;  3AXX A;  4MAZ A;  5A6S A;  1CGU A;  4PMU A;  2VMF A;  4N42 A;  1GQK A;  1EGZ A;  4W87 A;  4JCM A;  3GZA A;  2XIB A;  4BZY A;  1W91 A;  1PX8 A;  3KZS A;  4U2Y A;  4GI8 A;  1JDD A;  4PMV A;  4UOJ A;  3F5K A;  3CH9 A;  4PYS A;  6A3H A;  1EDQ A;  1WCG A;  2X0H A;  2WMF A;  4ML4 A;  3VDA A;  1GOM A;  3AIV A;  1CXF A;  2DPE A;  1PEZ A;  1JZ7 A;  2QMK A;  4YN5 A;  3FAX A;  4GZJ A;  4UQC A;  2XPK A;  1ESW A;  1HJW A;  4D71 A;  5A2C A;  4AD1 A;  5JIW A;  3WNN A;  1J0I A;  1DTU A;  3UR8 A;  3AMC A;  1UA7 A;  4TX6 A;  4X9Y A;  3OIH A;  2BNJ A;  3WY1 A;  4M82 A;  1C93 A;  1KGW A;  1KXT A;  5A8P A;  4PCS A;  4ACZ B;  3NSM A;  1UD6 A;  1V03 A;  3F4V A;  2VZO A;  3T09 A;  1C7S A;  2D22 A;  1CEO A;  1V08 A;  2VZT A;  3T0B A;  3FW6 A;  2CKS A;  4AD2 A;  3KWX A;  3BXW A;  5I2U A;  2XM2 A;  1GVY A;  1QHO A;  3L4X A;  1H11 A;  1FP9 A;  4TUF A;  4GQR A;  4JZ5 A;  3EDE A;  3CUI A;  1UR9 A;  5FCZ A;  3WDQ A;  2X09 A;  4Z2K A;  4UQA A;  4EK7 A;  1GOQ A;  1KXQ A;  4UFI A;  1MXG A;  2EQD A;  4HZ7 A;  2QLY A;  1E6Z A;  3VD5 A;  3EMQ A;  1UR8 A;  5ABH A;  1CGX A;  2DT2 A;  1CXH A;  1W1V A;  3GBD A;  3NDY A;  1VFF A;  3L4W A;  4FF5 A;  1LG1 A;  4Z2G A;  1L0P A;  5E6Y A;  3U7B A;  1VFU A;  1HJX A;  1MFV A;  1HKI A;  1EO5 A;  3GXI A;  3LPO A;  1XD0 A;  4ACZ A;  2BHZ A;  4B3L A;  4WSJ A;  3VVG A;  1QOX A;  2JIW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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