2CLLA

Tryptophan synthase (external aldimine state) in complex with n-(4'- trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f9)
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
266
structure length
257
Chain Sequence
ERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords TRYPTOPHAN SYNTHASE ALPHA CHAIN
publication title Allosteric Regulation of Substrate Channeling in Tryptophan Synthase: Modulation of the L-Serine Reaction in Stage I of the Beta-Reaction by Alpha-Site Ligands.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella typhimurium
total genus 98
structure length 257
sequence length 266
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2006-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2cllA00
1OVDA 3TCEA 3UY8A 1WYIA 4TMBA 5KSWA 2VEKA 1UUOA 1DJQA 1F6KA 5F2GA 4DBEA 3ABQA 1VRDA 1YYAA 3PSWA 3W76A 4JIQA 1KA9F 3ATZA 1B57A 1H63A 1VYPX 1OFEA 3MW7A 3A23A 1I2NA 1C29A 3N2MA 3F4WA 2P1FA 3E49A 5BNKA 4HN4A 5H2ZA 3SGZA 5CPOA 4JD4A 5FEZA 3TKFA 3H54A 1PV8A 4UTLA 3HG4A 4M7TA 3HGRA 4K8EA 4PH6A 3HB9A 1S5WA 1KLZA 5HQEA 3S6DA 3UXAA 3O06A 3PBVA 2FB3A 1KM1A 4MOZA 2EPHA 3HGSA 4ADUA 2CLFA 3EX3A 1O94A 1SSDA 2ISWA 1YDOA 2C15A 1QDSA 3F03K 1KFLA 1SFJA 3QW4B 1LTDA 1FXQA 5CZ0A 2ZRZA 1VGAA 4M6QA 5F2IA 4U4MA 2QCDA 1UASA 5C2XA 1ME7A 4X3ZA 4NZJA 3GDTA 3W23A 5SWUA 2PRMA 2NUYA 3O6YX 1KM2A 2X16A 4GXMA 4M5PA 1RQEA 3P67A 3QMTA 4P2VA 5G1TA 3NQ2A 3LTPA 3SSJA 3DBPA 3VE7A 3R13A 1HG3A 3SZ8A 5IBXA 1JCYA 1YXDA 1L2UA 4Z08A 3NVTA 4K37A 5CGQA 2AGKA 1A5AA 4AF0A 2FQIA 3BG5A 1SFLA 3HG5A 1FWRA 3PM6A 3NG3A 3NPUA 3FKRA 1KFCA 4KFNA 3GKAA 4NJJA 3GNNA 5CPMA 1G6CA 4PCFA 2J27A 4JYEA 2NUWA 4O53A 4I7UA 5FEPA 4JNMA 4JTTA 2A7RA 3DHFA 2YGYA 3LV6A 3QC3A 3W2NA 2A21A 4O0ZA 5LNWA 2ABBA 1THFD 3TJXA 4HPXA 3VE9A 4UXDA 4BI7A 2DZVA 3N9RA 4QM1A 1L6YA 4QNEA 2XFWA 1J4EA 1K8ZA 1SUXA 1Q6RA 2DZWA 1R2RA 2E5BA 1VPXA 4O10A 2YYUA 2DZSA 1JJKA 2J24A 1ME8A 1WBJA 3WK0A 5KZEA 3TW6A 1RVGA 3E12A 1W1ZA 4UMCA 4ZQPA 3TV8A 3W7KA 2A4AA 2VXNA 5AFDA 3VFLA 2FPYA 3IIZA 2RHGA 3W1PA 1QCWA 3EX6A 4OHQA 1EWDA 4HKPA 2E77A 3TW7A 2BSLA 1R46A 4JDBA 3P81A 4O8RA 1F74A 3BARA 3TA6A 3WJXA 5A5WA 3R8RA 4XKYB 5IBXC 4GWEA 2IQTA 4K7YA 1KBIA 4GFSA 1XBVA 1GJPA 4LOCA 3GAKA 1E51A 4HNUA 3MUXA 1F73A 3MHFA 1LM1A 3LCGA 3C8FA 1GYLA 3PG8A 1ZENA 3M9YA 4IPIA 3G22A 1QNVA 1I2PA 3BO9A 4A2SA 2WKJA 2NX3A 3QMRA 4Y96A 3GXTA 1DVJA 1KFKA 3QH2A 2J9ZA 3UYCA 1KM5A 3M47A 4FIQA 3W6YA 2FTPA 4LTSA 1JCJA 5HINA 3M5XA 1A50A 3SI9A 4KWVA 2DU2A 3PSVA 3PWAA 2WSRA 3M43A 4LVBA 4MLJA 1W54A 3IIOA 3OA3A 1GVOA 2JK2A 4IQLA 4PODA 1F5ZA 2D73A 3OHIA 1R30A 3G24A 3TIMA 2NXHA 4YMZA 2P0OA 3PUDA 5T26A 1Q6OA 4ZZ9A 3SY5A 4HNNA 3LLFA 1OABA 4Z0JA 2R8WA 4EF8A 5DELA 5D38A 3PF3A 5K4XA 3MBDA 1TIMA 1S3HA 1VJIA 4ADSA 2X1UA 4IUOA 1NEYA 1LLZA 4RCXA 3Q94A 1D3HA 2ZDRA 3W2MA 1CX9A 1OF8A 5D2VA 4LVAA 4S2BA 4UTJA 2J9XA 1ZFJA 3CU2A 4N9CA 2CLIA 2FPTA 3ELFA 3HOJA 5AOUA 2EKCA 3C52A 3EKZA 2C19A 3IVSA 1OX5A 3RFAA 3MWAA 3R2GA 1G4SA 1K8YA 4WQ6A 4LRSA 4A3UA 1RQHA 4JXCA 5EL1A 5G4EA 3W2UA 2BTMA 5E1QA 4L4LA 2E6DA 3NL3A 2H3BA 1OFAA 1PCWA 1FDJA 2V2HA 5GVJA 4PC8A 4BR1A 4KKXA 4NJKA 3W7GA 3EX4A 1XM3A 1H7RA 1RZMA 5K9CA 1PHWA 1XXXA 4JYDA 1EIXA 5G2WA 3S5ZA 3W1MA 3G0UA 2UV8G 4LT9A 2J88A 4N2YA 4YL2A 1BWKA 4BFAA 1H7XA 1OX6A 3GDLA 3OIXA 3T55A 4JTUA 2A2IA 5AC6A 3BG3A 1YLVA 3QF0A 3EWUA 3L5AA 4NZFA 1ZAHA 1DBTA 1TPUA 3NDOA 3P80A 1EB3A 1QR7A 3N9SA 4ZQRA 5AHFA 2GQ8A 1TV5A 3IEBA 3PS7A 1DL3A 3BW4A 1EPXA 1FWTA 4I7WA 4NNCA 2H6RA 3PG9A 3L9CA 3NM1A 5KZDA 1X1OA 5TBOA 4LVDA 4JY8A 3E96A 4EOUA 2V82A 4ML9A 3NZRA 2TMDA 3MI3A 4FXSA 2HS8A 3W83A 3Q2DA 4UTKA 1ICSA 3QYQA 1W3IA 4O4WA 3DFQA 3C4UA 3TK7A 2QDGA 1VLIA 4B5NA 4EF9A 1VCFA 4GC4A 1W5NA 1O5KA 3UWWA 2ISVA 2Y70A 3DXIA 5D30A 5I3HA 5U7SA 1PHQA 1YTEA 1FCUA 4E2DA 1LOQA 1IGSA 3UWQA 4EVZA 3NL2A 4JDYA 4P61A 3YPIA 1S5VA 2RDUA 2QF7A 2Z0IA 5FI8A 1LRNA 1AG1O 2PCQA 3UD6A 1MEHA 4NXKA 2QR6A 5K7JA 3LBMA 2ZRVA 4MUZA 4MYXA 5KZMA 2WSYA 3NQDA 3M5ZA 2B7PA 3I68A 3WK2A 5HNRA 4DELA 3QSRA 1G69A 1KTNA 3G0XA 1YDVA 3LBCA 1SZNA 3HO8A 3CB8A 3ZWTA 3P5YA 1TPH1 1ZAIA 4O0KA 3NM3A 3R12A 2GJLA 4RZ5A 3C2FA 1K7XA 1IXPA 1OK4A 1ZALA 4WZHA 4IJBA 2VENA 3H53A 5LNVA 2QCFA 3W1AA 3GB6A 2WNQA 3KAOA 1W5PA 3PBWA 3TUUA 2I1OA 1U5JA 4GNJA 1VYRA 4K8HA 3HGJA 5C55A 4ZVJA 4MZ1A 5AN7A 4OV4A 4KWWA 3W1LA 2RH9A 4QJ1A 4NNAA 1XFBA 2YW4A 1A5CA 3NO5A 1I2QA 2PRHA 1TPVA 3A21A 1I45A 5LNUA 1DV7A 1O95A 3LOTA 1Z44A 1Z48A 1AW2A 3BLFA 2NWSA 2W6RA 3F4NA 2VFHA 1LRTA 3R5EA 3D0CA 2QUVA 3W71A 3W1NA 1H50A 2GVGA 2CU0A 4FHAA 1G4PA 1YTDA 3LHYA 1TTQA 4WX2A 3OVQA 4HHPA 5K9XA 4DPQA 2CWNA 3LRKA 4E38A 3SW6A 3L2IA 3NYZA 3N3MA 3N34A 4CCEA 2A1YA 3CPRA 2RDTA 1VQTA 3FYOA 1VH7A 1X7FA 2NX9A 2Q3OA 3RU6A 5AHIA 3LCWA 1TREA 1RD5A 2VKZG 1GTEA 1SU5A 3BVJA 1I2OA 3KVLA 1LCOA 4IX0A 3L66A 1A5BA 3UPBA 2WPBA 4NX0A 5BMXA 2PC4A 4X2RA 1F2JA 1OX4B 2VFFA 1C9DA 1RPXA 3L5LA 3LB0A 2ZCGA 4Z1AA 3UZJA 5G4WA 3ABOA 4UFLA 1KM4A 1NFBA 4QIUA 1G67A 2NLIA 5AHNA 3MI2A 1B3OA 4LV4A 3W7EA 3TDFA 5HR6A 3T44A 3W3OA 3PB0A 4K7VA 3B05A 4N9EA 4IMCA 3BW3A 1G4EA 2FJKA 4IX2A 2Y7FA 2LLEA 2Q8LA 5DCBA 1K3UA 1EP3A 3O16A 3NPVA 3A5FA 3KX6A 1OYCA 3W7HA 2GOUA 1TO3A 2X1TA 3NQMA 1YADA 1GOXA 2Q3RA 2FDSA 1TRIA 2CLEA 3C2VA 2QCCA 1KM6A 3B03A 1H7WA 1SZFA 1ML1A 3W7PA 1PS9A 3WK3A 2BX7A 4Z1CA 3TSDA 2ZRUA 2OMAA 4GBUA 3WJYA 2HMCA 3G8EA 4POCA 2JKEA 1OYBA 3NQGA 5HULA 5KMYA 1O5XA 3RLUA 5DCDA 1SZEA 3W7NA 4AWSA 4QSHA 1TV8A 3GDKA 4UTWA 3W85A 1X6UA 3M41A 2DZPA 2VEMA 3A22A 3E0IA 4A21A 4NXSA 1A5SA 2VFIA 1WA3A 1YXCA 4NJHA 4UFIA 2QEZA 1QWGA 1TQJA 3TJLA 1ICPA 1BTMA 3GDRA 4IMEA 1W3NA 1WAUA 4NQ1A 3VKJA 3DENA 2V5BA 1JUBA 3G1HA 2CLKA 2RFGA 2Y62A 4JGDA 5C54A 5AHEA 3G8RA 2GJNA 5AYYA 4N4QA 4RLIA 3B0PA 1L9WA 5EPDA 1GPWA 2ZBTA 4MJMA 4UR8A 4Q32A 2FPVA 2TPSA 2HSAA 2Z1BA 3OVRA 1KV8A 2BLEA 4BF9A 1TJRA 3PB2A 2ZFAA 3CIXA 3FIGA 3QPYA 1GVQA 5I3GA 2I14A 4RX0A 3W74A 3G3DA 1PE1A 1LDCA 3NQAA 3TQKA 4AVFA 4RV8A 4WY0A 5H91A 1S5TA 4RZ4A 2B4GA 5LSMA 4BI6A 1O4UA 5TIMA 4I7VA 1IXQA 2YX0A 5CSRA 3FA5A 4JTJA 1NSJA 4KFPA 2P10A 1GVRA 2CZEA 4QITA 2QCNA 2OCZA 2GPTA 1KTBA 4M19A 4FNSA 3S1XA 2C16A 2OX1A 4UTTA 3ANYA 5I3JA 3TSBA 4N6FA 1OYAA 1FCQA 3GAYA 1EX5A 4DPPA 5D09A 4UTWC 4RK8A 3M5VA 3EKLA 4R34A 4OE7A 1PVNA 3STFA 4MJZA 5E0KA 1FX6A 1HO4A 4GJ1A 3N2XA 2VOMA 4MIMA 2ZA3A 3KOFA 3QZEA 5AYZA 3JRKA 1P5BA 2V0TA 4FX6M 1MZHA 2PURA 3LERA 4RZ6A 4UIOA 3MHUA 2WV8A 2QAPA 2HS6A 4UCGA 3UWYA 3IGSA 1OFPA 2A6NA 3LGEA 1IXNA 3TC7A 3NR0A 2OT0A 1DQWA 1ME9A 4DBDA 3M7WA 3UPWA 4LW7A 3CWOX 1P0KA 3IVTA 1YDNA 5LGZA 2ATMA 4MY8A 2PE4A 4RXGA 4QAIA 2XN0A 3DI1A 3W1UA 1K7EA 4A29A 4TX9A 3NXFA 2QCMA 1ZHAA 3W75A 1WOBA 2GUUA 4RR4A 1DQXA 3TC6A 1VYSX 5ABTA 1D3GA 3O6CA 5DLCA 1GEQA 4GUGA 1F7BA 4NJGA 4O16A 4RKAA 4MY9A 1KFBA 3P7YA 1TMHA 1AK5A 4AWTA 4JEQA 3S5YA 4BK9A 3A24A 4JX6A 5C6MA 4ZMGA 1OFBA 2ATSA 2JKPA 1TPWA 2B7OA 1SW7A 3OVPA 2Y88A 5I3FA 1LOLA 3LHVA 1VCGA 2QUTA 1LORA 2BWGA 1M6JA 4UTTC 5HMSA 1WQ5A 5K3VA 1I8JA 2ZZ4A 4OT7A 4UFKA 1M7PA 2YPIA 4OGZA 1QO2A 1CI1A 3BGJA 4XKYA 2NXGA 3G1XA 3LCHA 1I4NA 2QDHA 5CZSA 1YXYA 4IGHA 1RR2A 1H1ZA 3C0JA 2W79A 2DZUA 1KBJA 3DHDA 4LUJA 3MYOA 2ZTJA 4ZQNA 2R91A 1VC4A 1LYXA 3NQEA 5F2LA 4XZ9A 3DZ1A 2YW3A 2ZZ3A 4Z1DA 3N19B 1JVNA 5LHFA 4CNOA 3FOKA 1IIHA 4N9BA 2G95A 4GUIA 3P61A 3WJSA 5F4XA 2GVLA 3KHJA 2ZRWA 2CZFA 5HR7A 3G1AA 3LHTA 2V9DA 4E2BA 3P82A 3CWNA 3LRLA 4TU1A 2A6LA 1HTIA 4O1BA 3LHZA 5TQLA 3Q58A 4TR9A 1P0NA 2ZZ6A 3CT7A 4DO6A 5F2MA 2HTMA 2Y7GA 4TMCA 3TE9A 2QJGA 3QEZA 4FNUA 3O6DA 1D9EA 1OFOA 2AAMA 4Z1BA 4NJIA 4JTIA 3S1UA 1X8FA 1W56A 2H8XA 2CZDA 1TPB1 1TPC1 5D2YA 1LZOA 1JUEA 1OHLA 3HF3A 1H7OA 3MP3A 3P5ZA 4Q33A 3AJXA 2ZZ1A 4UTUA 3L21A 3RNDA 2Y89A 1H5YA 4IXXA 3S5OA 3KVKA 4CCCA 3BLEA 4AHPA 1J2WA 5L9FA 2DZXA 3ATYA 3LCIA 5LKYA 2ZA1A 1QPQA 4JIPA 1QPNA 3GKFA 5CZJA 1JCLA 3KFTA 1MO0A 4IMFA 4QNWA 3MMTA 4PL1A 3BPWA 1KV5A 1F76A 5K4ZA 3TH6A 1JULA 4ZL1A 1VHCA 2B7QA 3MJYA 1Z41A 5CSSA 1AMKA 1SSGA 2QCGA 3LCFA 3RF9A 3USBA 2CFFA 3QW3A 4ZQMA 3L68A 4K6AA 3HJZA 4LU0A 2WO5A 1DORA 2J6XA 2EF9A 1JCMP 1LLWA 3PY2A 3C2OA 4IWWA 3W2KA 4FEZA 2ZZ2A 2OT1A 5K9DA 4WY0F 3LM7A 4CNNA 3EWBX 3C6CA 2DJXA 3ABRA 2C14A 4NT0A 3G1SA 3NEVA 1TYGA 3MO7A 4D2JA 2DZTA 2R14A 1FCVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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