3LHUA

Crystal structure of the mutant i199f of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with inhibitor bmp
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
VMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAFIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Conformational changes in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase: "remote" residues that stabilize the active conformation.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 80
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2010-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3lhuA00
3S8HA 5F4SA 1KTBA 4H3DA 1QFEA 1GPWA 3W1LA 5AB3A 3EX2A 4WXZA 5LSMA 3LCXA 4P2VA 3GYEA 3CIXA 1VH7A 1GYNA 4WQ6A 4UTUA 4LUJA 1GG1A 4UFIA 2QCMA 2VEMA 1RD5A 3QW4B 1W5MA 1JULA 5D32A 1GVOA 4DF2A 2LLEA 1LLZA 3NQ7A 4ICNA 3QMTA 1QPRA 4ZQNA 2GUUA 1GVQA 2E1DA 4UMCA 5MHBA 5CSSA 4IMCA 1EUNA 3TJLA 4NNAA 4IXHA 3P61A 3SIZA 3L0KA 1PHWA 3TMLA 3MP3A 2V82A 3O1NA 1OX5A 5BRBA 1QPOA 1SW3A 3BG9A 5F2GA 4WY0F 1F6PA 1KLZA 4JYEA 1AL7A 4AHPA 3TMQA 5FF7A 1XL9A 2NX1A 1WAUA 3BGGA 3EXTA 4UFHA 3LHVA 4K8EA 1LZOA 1W37A 4EIVA 4JTLA 3TROA 3GR7A 3PBWA 1VGAA 1K8ZA 3KOFA 4JTUA 1SO6A 1QWGA 3SSJA 4ORIA 4IMDA 3P80A 2ZRYA 1JUKA 3MI3A 3HG4A 4Z1BA 4O14A 2Z1BA 1JCNA 2Y70A 1J5TA 1D9EA 1ZALA 3QW3A 3TK7A 1H7NA 5K9XA 4YLWA 1M5WA 3TR2A 4FXRA 1LP6A 3LHUA 4N9CA 3G0UA 4WOZA 3NZ1A 3T7VA 5FEZA 3NQAA 4RCXA 4GNJA 5F4WA 3MHUA 5I3JA 4IOTA 4LOCA 3NQFA 2FJKA 4NU7A 3M1ZA 4CNPA 5LHFA 2YW3A 4MFEA 1GTHA 3W73A 4M6QA 3W83A 5HR7A 5EA9A 3TSBA 5BMXA 3HBLA 3RK8A 2TPSA 2WV8A 1K8XA 5G2WA 1H5YA 1L2UA 5LKYA 2CZDA 3LRLA 3MHFA 2ZA2A 1VPXA 4MIMA 2J9ZA 5HWJA 5CSRA 1X1ZA 4NT0A 3SFKA 3GLCA 2G5WA 2ZRVA 1TPUA 3BO9A 1B4EA 1AG1O 2Y63A 3HGJA 1PCKA 3W72A 3S6DA 3CU2A 5E0KA 2PCQA 4GBUA 4JTKA 4OV4A 2RDWA 3STFA 1H51A 3O16A 1QAPA 3L65A 3LRKA 3C4UA 1TB3A 3ABOA 2V5BA 1NF7A 3BV4A 1WOAA 4IPIA 1KFBA 4UTWA 4EWND 1GZGA 1IIGA 3N73A 1NFBA 3SGZA 3DFNA 2NUXA 4QM1A 4X3ZA 2VC6A 4O17A 1HG3A 1Q6OA 5CGQA 1FUYA 1OHLA 1LBFA 4PEKA 3W87A 1R2RA 4MZ1A 2GVGA 3DZ1A 4RX0A 5DELA 3HPSA 2B0MA 4RZ6A 5DCEA 4K38A 1AW2A 1VLWA 4JIQA 2CLFA 3NPVA 1ZAHA 3WK3A 1K7XA 2BX7A 1LROA 2JGQA 4I7VA 2AGKA 4DPPA 1RZMA 5D38A 3UWVA 1JCLA 2X1TA 4JX6A 3TAKA 5HMSA 1TJRA 1H62A 1TQJA 5AHIA 3B03A 3FOKA 4AF0A 3W7RA 2CLKA 1RR2A 3D0CA 3LCFA 3T55A 3GR8A 4QAIA 1OYCA 1WYIA 4LC8A 1NF0A 3W7IA 4K8HA 3A5VA 5CZSA 3RFAA 4DQWA 1K03A 4JY8A 1THFD 1P0NA 1MSSA 1T96A 2GJNA 1PVNA 2HMCA 2FLIA 4OE7A 3QYQA 3W22A 1FDJA 1IIHA 4TO8A 4JTIA 3N19B 3RMJA 3TQ0A 1QOQA 4FX7A 3TFCA 1LTDA 4UCGA 4E0CA 5A8GA 5CPOA 3GB6A 3N2XA 3OEXA 5FESA 5BOOA 4CQ9A 5G1YA 4R33A 3KXQA 2A4AA 2WSRA 4UTKA 1TJPA 2A85A 4NJJA 1W5NA 2ZA1A 2J9XA 4DF0A 1AMKA 4YMZA 2R91A 5K4XA 4O1AA 3TA6A 1KA9F 1TREA 3M6YA 3W7PA 2QCDB 1LRNA 4NX0A 1QPNA 3INPA 1U5JA 4FHAA 1XXXA 2CU0A 2V2HA 4CQAA 2WSYA 1WOBA 2FPVA 4WXYA 3PUOA 5EYWA 5FEPA 3C2EA 4DELA 3G1VA 2AAMA 3QPZA 4JTSA 4NJKA 1J2WA 1VRDA 3EWUA 1B9BA 3S1XA 2QAFA 3W71A 1F05A 8TIMA 1TPDA 2YZRA 4RZ4A 1YTDA 1IXPA 1PHQA 1P0KA 1V7YA 3JS3A 1HO4A 3N34A 4M6PA 3TE9A 3G18A 1N7KA 3LCLA 4UTIA 2G96A 3B0VC 1TTJA 2X16A 1Q6QA 4GFSA 3G22A 5T26A 3STGA 4O4WA 2PURA 3LHTA 3M47A 4R53A 4O1DA 2IQTA 3SGUA 3NA8A 3W1UA 1C8VA 1O94A 2E77A 1K8YA 3IVTA 4P61A 5CPLA 4DO4A 3VE7A 5D2YA 3LBMA 4LUIA 4UTTC 3I7SA 3NL2A 4IPJA 3UZJA 2PRLA 1SZEA 3FYPA 5HJLA 2E09A 3DHFA 1H7XA 1F5ZA 1LCOA 1YPFA 2HTMA 3M5ZA 3KFTA 1KFCA 3M16A 5CKSA 2H6RA 2ABBA 4NZJA 1WBHA 3B05A 2P10A 2C1HA 1TV5A 3L5LA 1UJPA 5CZJA 1TTIA 5K9CA 4QNWA 3DKLA 1OFEA 3L67A 3H55A 5D2WA 3EX1A 4XKYB 5HNRA 3NQEA 2C15A 5K9DA 2A7NA 5EKYA 3SZ8A 1XBZA 3ELFA 4GC4A 1T0OA 3P7YA 4KFPA 1AL8A 4LV9A 1FWSA 1X8FA 2DZVA 1EB3A 1Q6LA 4IMFA 1UUOA 4J9JA 3M44A 4JYDA 3TU9A 3V75A 3G24A 3NZRA 5K2ZA 1VLIA 3WJYA 3NQDA 1IXOA 1R46A 3G1XA 4LTSA 3O6YX 3HJZA 3QM3A 3UPBA 3HIJA 2H3BA 4XUGA 1EWDA 3PB0A 1TRDA 4I7UA 1H50A 2YFOA 5D03A 1SU5A 4JTGA 1R47A 3A24A 2A7RA 4UR8A 1LOSA 2ISWA 4K7YA 4MYAA 2CLIA 2W79A 1W0MA 1NSJA 3W9ZA 1O5XA 4FNPA 2CZFA 4S2CA 4RXGA 3GK0A 5DCDA 1K7EA 3EWXA 3LTPA 2C3ZA 2NUYA 3BVJA 2QUVA 5AHFA 4MOZA 4LVFA 1OYAA 1VJIA 3A5FA 3P8IA 5K4ZA 5K3VA 4HNTA 3E9AA 5DLCA 5EL1A 3PAJA 4PTNA 1KFEA 1LLWA 3BLIA 3JRKA 1YDOA 3L9CA 2RH9A 2YX0A 4JEQA 4O18A 3FYOA 4CCDA 1DL3A 2QKFA 3C6CA 5F1UA 3BLEA 3HGOA 3QSTA 3M9YA 3IEBA 3EWBX 4IX2A 4WY0B 5AOUA 4A3UA 3NQMA 1SFJA 2QJIA 4DO5A 2V5LA 3GAKA 2H90A 4PH6A 2PE4A 3CT7A 4LY8A 3SJ3A 2E5CA 1SW0A 3E0IA 1S5VA 4JR5A 3ANYA 2FQIA 3W1NA 3IGUA 5AC7A 1XBYA 3W70A 4M19A 2DZPA 4A2SA 1B3OA 1FCUA 4JX4A 2C13A 4CNOA 3SY5A 4FNSA 1WQ5A 3FKKA 3WFAA 2A0NA 3R2GA 2OX1A 3IIZA 3MBDA 4KWWA 1D3HA 3NNTA 4UTMA 4O0ZA 1BWLA 3G0SA 3ZFHA 2Z2UA 2X30A 4R7JA 1U83A 3CEPA 2DZTA 2OMAA 2J24A 3DBPA 3LI1A 4Q32A 3EWWA 1OVDA 4O12A 3TH6A 3W7CA 5K7JA 1UASA 4ZZ9A 5E1QA 5DY2A 4JDBA 1NAL1 1RPXA 2V81A 5G4EA 1XC4A 2DJLA 2Y7DA 2A5HA 4DEFA 1HFBA 1FWWA 5LNWA 2RFGA 4IJBA 4PA8A 1I2RA 4YCOA 3YPIA 4LU0A 4EOUA 3QZEA 3TV8A 3NQCA 1QR7A 2CLLA 1D3GA 2AQWA 4XZ9A 6TIMA 2G97A 2QCGA 3A22A 5F2MA 3W86A 1OFAA 4O4VA 3NOEA 5CZ0A 3QC3A 4QITA 2FB3A 4FXSA 2Y61A 3B04A 5LNRA 1TTQA 2ZZ7A 1G4PA 3M0ZA 4OWGA 2I1OA 3PWAA 2VEPA 3MYPA 1OF6A 1QPQA 1TIMA 3EWZA 3TKFA 2FFCA 4BI5A 1DORA 1VZWA 1RQBA 3H53A 5EY5A 4N9EA 1X7FA 4O54A 1BTMA 3N3MA 4E2DA 2CFFA 3H54A 2CZEA 1LOLA 2RKXA 2WOQA 1H1YA 1I2PA 1SZFA 3L0NA 3KHJA 1HUVA 3CLMA 4R34A 3HB9A 2ZZ2A 1I2OA 3F1QA 2QR6A 3QFEA 1GJPA 2FIQA 1O60A 2QJGA 2ZA3A 4Z1DA 4AEOA 3S5NA 4UUIA 4Q33A 1MEHA 4ZL1A 2EHHA 4UTHA 2CLOA 5HULA 5AC6A 5KMYA 3GVGA 2R94A 2W0UA 1SUXA 3FJLA 2DJXA 2HS6A 1XKYA 1F74A 4ZVJA 4AH7A 3MI2A 1KM0A 2ZRWA 3E96A 2NWSA 2V9DA 2FB2A 4JTJA 2Y89A 4LVDA 2Q3OA 4JDYA 5KZDA 1FWRA 1FY6A 2C6QA 4JXCA 1GVSA 2J88A 4ALDA 5IBXA 3W75A 4JN6A 1GQNA 2JKPA 3W76A 3W1TA 4FF7A 3W07A 5G4WA 4QSHA 4UMAA 4LS0A 2HS8A 1FQ0A 3N9SA 4QIUA 2B7NA 1JUBA 3P74A 4M7SA 2WPBA 3O06A 3B4UA 3OIXA 4ZQCA 1JJKA 3SR7A 4UTWC 2BWGA 1IXNA 2CZ5A 2ZYFA 4DO6A 3BW3A 1OFPA 3W7LA 1W3IA 1LOQA 2F7FA 3WJZA 2DZXA 2EAWA 1H63A 2C16A 3PUDA 3W3OA 3ABRA 3TXZA 2RDTA 4WJEA 2ZFAA 3UY7A 1ME9A 5AC8A 4YCPA 1JCJA 1OFBA 1SQ7A 1VCGA 1B4KA 1MXSA 3DFSA 3HGSA 3NL3A 1XDMA 4DF1A 1DHPA 3IVUA 3LLDA 1JCYA 3NO5A 2QDGA 3PR2A 1TPWA 3M43A 4MYXA 3O63A 1L9WA 2WNQA 1SZGA 3DAQA 1TPFA 3CM4A 4FEZA 5G2HA 2NV1A 1GVFA 3HG5A 3PSWA 5D2VA 5C6MA 3F4NA 1W31A 3BW2A 3L5MA 4PCFA 2C19A 3WK1A 1KBJA 3EKLA 2E6YA 3LBCA 1KV8A 4NZFA 4OBTA 1KM6A 5J5RA 3GXNA 4TIMA 5FEXA 4Y96A 1VCVA 1S3HA 1QOPA 3IV3A 3AO0A 4O1CA 3B0PA 1NVMA 1VQTA 2GVJA 3UD6A 3NQ8A 2RHGA 3FIGA 3W6YA 2ALDA 1OF8A 4JX5A 4UNKA 2DU2A 4YWIA 3R5EA 1H60A 2QUTA 2NXGA 2A6LA 2ATMA 1JQXA 4A2RA 4HNVA 4C1KA 3G1HA 3W2LA 3GZ3A 2JKAA 5AHLA 4O50A 1G4SA 5LNVA 1ZJIA 2QJHA 3FS2A 1N8FA 3FFSA 1PIIA 4UIOA 3W7DA 3W23A 3PB2A 2WKJA 3MUXA 3NQ6A 4YL2A 3GDKA 5HQEA 5CZTA 4JTFA 3EEGA 4OT7A 3PF3A 3LHYA 1OFRA 4HKPA 2XN0A 2ZZ1A 4O16A 4LW7A 2Y7GA 2ZZ4A 5KITA 4ONVA 3PC0A 1H1ZA 5I3FA 3P84A 3PM6A 3IVSA 1F76A 4C1LA 1GVRA 4O13A 3HF3A 2RDUA 1ZAIA 2Q8ZA 2NUWA 3IRDA 4UNLA 3P67A 1EX5A 4EF8A 1KM5A 5ABTA 3G1FA 5C55A 1VYRA 1KFKA 4FIRA 1OK4A 1UBSA 3TIMA 4FX6M 3R89A 1VCFA 3VCRA 4NUWA 3UYCA 4A29A 4A21A 1EWEA 1I8JA 4N4PA 5AYXA 1JRBA 3W2NA 1Q45A 1TTPA 5D05A 3EX4A 4O1BA 2EKCA 4WOQA 3RLUA 2VOMA 4RV8A 2YSWA 1YDVA 3W1XA 3V1PA 1UCWA 3W7QA 3BW4A 4TU1A 1VYPX 2H8XA 3LXCA 1JQVA 4LVAA 3MMTA 4GUIA 2BZNA 3RNDA 1H61A 6ALDA 1H7WA 2VXNA 3G1YA 4JTTA 3T40A 1TV8A 4LS2A 5HINA 1TPC1 3UZ5A 4GUGA 2A7PA 3B0UX 4K7VA 1DQXA 2JGYA 2O7QA 2DZUA 5CPMA 5KTLA 5F1VA 3BGJA 1I2QA 1XUZA 3W2MA 3TX9A 3OVRA 3QPYA 3IGSA 5C2XA 3DFTA 4ADTA 2QCCA 1QMLA 1TRIA 3M5YA 2E5DA 1Q3NA 3LCGA 2QF7A 2X2GA 4TMBA 4S2BA 1SO5A 4ZQPA 1TV7A 2X1RA 3LLFA 3P81A 1H7PA 1BKSA 5H2ZA 1SO4A 3PBUA 3TC7A 4ZQOA 3OG3A 3W7KA 4AVFA 1LRQA 3FJ6A 4AB4A 4MLJA 4JNMA 4M6VA 3W85A 3M5XA 4FNRA 3IIVA 1W3TA 4JGDA 4FO4A 3RLVA 3E49A 3G8EA 1I45A 1ZNNA 4OHQA 3E02A 1VR6A 5LGZA 3MJYA 3NQ2A 4JICA 4IX0A 4Y6GA 4JYFA 5I3HA 7TIMA 5HWNA 3S0CA 3TC6A 1MEIA 3HGRA 3MYOA 4LS1A 3IIXA 3ZWTA 5U7SA 3C3NA 4O0KA 4Y8FA 3GNDA 3WJSA 3QEZA 2GQ9A 3GDLA 2QCHA 3OA3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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