4ZQMA

Crystal structure of the catalytic domain of the inosine monophosphate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis in the complex with xmp and nad
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
357
structure length
333
Chain Sequence
DPVPTGGDDPHKVAMLGLTFDDVLLLPAASDVVPATADTSSQLTKKIRLKVPLVSSAMDTVTESRMAIAMARAGGMGVLHRNLPVAEQAGQVEMVKRSGGLLVGAAVGVGGDAWVRAMMLVDAGVDVLVVDTAHAHNRLVLDMVGKLKSEVGDRVEVVGGNVATRSAAAALVDAGADAVKVGVGPGSICTTRVVAGVGAPQITAILEAVAACRPAGVPVIADGGLQYSGDIAKALAAGASTAMLGSLLAGTAEAPGELIFVNGKQYKSYRGMGSLGAMLVPEGIEGRVPFRGPLSSVIHQLTGGLRAAMGYTGSPTIEVLQQAQFVRITPAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase,Inosine-5'-monophosph
publication title Mycobacterium tuberculosis IMPDH in Complexes with Substrates, Products and Antitubercular Compounds.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis (strain atcc 25618 / h37rv)
total genus 101
structure length 333
sequence length 357
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2015-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4zqmA00
5LGZA 4AEOA 1UUMA 4KFOA 2PCQA 4LVBA 4N4QA 3IVTA 4JNMA 5CG7A 2VENA 1QPNA 1J4EA 4OE7A 2NX9A 3G1VA 2AQWA 1KBJA 1WOAA 1UUOA 1KW1A 4WY0A 2E77A 2HS6A 3A5FA 3P7YA 4O50A 5D2XA 1OX4B 2H8XA 3PWAA 1O4UA 1OK6A 3N9RA 5AC8A 4K8HA 1TTJA 3KVJA 3BARA 5DY2A 1SO5A 4AWUA 1SO3A 3MI6A 5K9DA 1HFBA 2VKZG 2OJPA 2YXGA 5F4WA 1VH7A 4MFEA 5FF7A 1TO3A 3ATYA 4N6FA 4GWEA 3SW6A 1B57A 5K9CA 4NJIA 2V82A 3S5ZA 2DZTA 5AN7A 3O15A 1NVMA 3KVMA 1GVSA 1QDSA 5AHFA 2NX1A 4YXGA 3MHGA 1OG0A 5BMWA 5E0KA 5D2YA 4B5NA 4Z08A 4DQWA 3SY5A 4FB7A 4GNJA 4QNEA 3QMSA 3CC1A 3GAKA 3WK2A 1RVGA 4H4IA 3NQFA 1VHNA 2VFIA 3NQAA 1VCVA 4O10A 2I14A 4TMBA 1K7EA 5DLCA 1FUYA 1SR9A 4LTSA 2B4GA 3JRKA 4ADTA 4KKXA 1Q6QA 3CEPA 3CM4A 2ZA1A 3WJZA 1XXXA 3G1SA 3N73A 5AHNA 3W7HA 3D0CA 3NR0A 4JTEA 2FIQA 1EEPA 1FY6A 3LXAA 4AWSA 1Q3NA 4FXRA 4EF8A 1VHCA 2R8WA 1U83A 1GTHA 1PVNA 4YLWA 1R30A 2ZFAA 1G69A 4Y90A 3UWWA 1ZCOA 4R33A 3M5ZA 3BW2A 1O5KA 3M5VA 3M47A 3C56A 4XQ6A 4IMGA 3RK8A 4BI7A 3TW7A 3W7PA 2NWRA 4LOCA 3W70A 3NQEA 1JJKA 1LLZA 5C2XA 5HULA 4O57A 3NQVA 3UPBA 4X2RA 2ZCGA 1FQ0A 3B8DA 1QNVA 5F1UA 4BF9A 2OCZA 3W7LA 5G4WA 3IVUA 5CPMA 2HTMA 1Q45A 1RQHA 3FS2A 3IVSA 3P5YA 3FKRA 4BK9A 4QAIA 3UD6A 1F6PA 4O0ZA 3KFTA 1F05A 3Q94A 4GE8A 1KFCA 2QF7A 5LSMA 3STEA 3TK7A 4RXGA 1TV7A 3RMJA 1XM3A 1MO0A 3W7NA 4K8EA 3LX9A 4N9CA 4UCGA 3HOJA 3OEXA 4GXMA 4PODA 2RDUA 3EXRA 5F2LA 2VEKA 4X22A 5LGXA 4XWUA 3LRLA 3LXBA 1I2OA 1RPXA 2W79A 1IXPA 1ICSA 4RKAA 1SSGA 4JEQA 4N02A 2Q3OA 2DU2A 1XBXA 3QSTA 3DKLA 3KX6A 6TIMA 1GG1A 5E1QA 3QYQA 1VLWA 1O94A 3L0NA 1W5OA 1R2RA 1KBIA 1X6UA 1GG0A 5KITA 5EY5A 2VOMA 1I2QA 1GTEA 3W1AA 1OFPA 2O7QA 3G18A 2QCMA 3ZS4A 2YYUA 3LCHA 3M9YA 3LHUA 1WXJA 4U28A 1KFJA 4JTFA 3P5ZA 3BPWA 1UJPA 5D37A 3LGEA 2WV8A 3C61A 5AC6A 1GVQA 4R7JA 4DPPA 2Y85A 1FCBA 1PCKA 2ZA3A 2OMAA 3DAQA 5FESA 1TTQA 2X1RA 3TKFA 3O1NA 5DY3A 4N9EA 3W2LA 2OZ0A 5AYZA 2B0MA 3GLCA 3IIVA 2Y61A 3PG9A 1I2PA 2EGZA 4MY1A 4E2DA 1VC4A 5DXYA 1KFEA 2BX7A 1J2WA 3QZEA 4XTIA 3STCA 5FF2A 1B4KA 4XTDA 3S5YA 3MBDA 4CQ8A 3MWAA 1OF8A 1Z41A 3L5MA 3AJXA 1WYIA 2QCHA 1WA3A 1WOBA 3KVKA 5DCBA 3PBVA 4LW7A 3TAOA 3HGOA 2TPSA 4PC8A 4RXFA 4MYAA 1VS1A 5EL1A 2QDHA 1VRDA 3W7IA 4RLIA 5D2VA 1MSSA 3RNDA 3PC0A 1M5WA 1LM1A 1B3OA 3WJSA 1QPRA 5LNVA 4IMFA 5I3IA 4FNQA 1YDOA 2E5DA 5K2ZA 1IGSA 4K7VA 3GX9A 3OHIA 4WQ6A 2W0UA 4K7YA 1VCFA 1D3GA 4FNTA 3W1PA 4FX6M 3DGRA 4AF0B 4IPIA 1XUUA 4POCA 4JYFA 3SJ3A 2QUVA 1G7VA 1KTNA 3T44A 2Y89A 4JDBA 1LDCA 3FJ6A 3LHZA 3JR2A 1GYNA 1TJRA 2YPIA 5DCDA 1LZOA 1LRQA 4GC4A 4MIMA 3EKLA 1YPIA 1K8XA 3C52A 4O28A 3NPWA 4MLRA 2FJKA 4KWWA 5CPOA 4DF0A 4WXZA 4R53A 5CZTA 3RU6A 3TR2A 1KV8A 2VC6A 5HUPA 3PBYA 3NQ7A 4C1KA 3BO9A 2NUWA 4NNCA 4O1AA 1L6YA 3W7OA 2GOUA 2Z6JA 4Y6GA 1HO1A 3L5LA 1GYLA 4PEKA 4JY8A 1OFAA 4AMAA 3E96A 3PAJA 1OYCA 1XC4A 3TIMA 1YLVA 2QCFA 4UTUA 1R2TA 4GJ1A 4BR1A 1RZMA 1SW0A 1FDZA 1XDLA 3G0UA 3CU2A 1I2RA 1HG3A 3W83A 3TQ0A 1B4EA 5F2IA 2J6XA 3LHTA 4HNVA 1IF2A 3I7SA 4Y96A 1MEHA 1JCXA 3C3NA 2A0NA 1SPQA 1A53A 1G7UA 2C14A 3LCWA 3EWWA 2J9XA 2QCNA 3GDRA 4NZFA 4QJ1A 4P61A 4HKPA 1CI1A 2DZVA 3NM3A 4GRSA 4AHQA 4PCFA 2V81A 4LC6A 3GVGA 3UQNA 2NV1A 2QKFA 2WO5A 4NUWA 3W84A 3TX9A 1FDYA 5FEPA 2ZZ3A 4JX5A 5KZEA 2V9DA 5D33A 2RKXA 1FBAA 3T40A 3MBFA 3SR7A 2C6QA 3WK1A 1ONRA 1ICPA 1JVNA 2C1HA 1H50A 4AF0A 3EWZA 4LRSA 2GQ9A 2PE4A 1NFBA 5DBUA 4PH6A 4NQ1A 1J5TA 1SZNA 4LWWA 1FWSA 2G96A 3PUDA 3P82A 1ZY9A 1GJPA 4JTGA 1EPXA 4LRTA 2EAWA 1XL9A 1AK5A 5HMSA 3TCEA 4JR5A 1HTIA 3BW3A 4M6VA 4DXVA 2Y7GA 5G1YA 1AW5A 1D9EA 2CZDA 3EWXA 3QW4B 4M7TA 3L21A 3FIGA 3LHYA 3EX4A 3U8GA 1ZAIA 3HG3A 4HNUA 4JX4A 4LC8A 1AW2A 3E9AA 1F74A 4UNLA 2GVLA 2BTMA 1FXPA 5HUOA 1K7XA 4IX2A 1DQXA 2NWSA 2JKAA 2XN1A 1CX9A 2ZA2A 4PL1A 4BI6A 1X7FA 2V2CA 1H61A 3W1TA 3CPRA 3KRUA 4HNNA 3DKJA 5CZJA 3TUUA 4X9SA 1TV8A 3IEBA 5BMXA 1K02A 3KOFA 3TSBA 2QCCA 1EA0A 3DHFA 4RK8A 1W54A 3LI1A 1AL8A 1YTKA 3OBKA 3M0ZA 1JUBA 3NA8A 3T7VA 4A29A 3W2JA 3P61A 1H7RA 1THFD 5FI8A 2Y88A 3S1UA 1F6KA 1SSDA 3W7RA 4Q32A 3C0JA 1KA9F 2LLEA 3O6YX 5DELA 1NEYA 2DJLA 1G67A 4NX5A 1XBYA 3QM3A 3O6DA 5TBOA 3BLFA 3W7GA 4YMZA 4O11A 2OX1A 1TTIA 1YXDA 2J24A 2TMDA 1YDVA 5ABTA 5U7SA 1W3IA 3G0XA 3I7RA 3A21A 4N4PA 4K38A 3GR7A 2CZFA 2ZYFA 3W1LA 1X1OA 1Z44A 3HBLA 3W3OA 3BG5A 3QPZA 8TIMA 2FTPA 1T99A 3BG9A 4CNNA 4EWND 1QFEA 4BWLA 3NPXA 3IIOA 1Z48A 1W0MA 3SFKA 1TSIA 2W6RA 3N14A 2WSYA 1TPH1 1O5XA 3WFAA 5HNRA 3WK0A 5K3VA 1R47A 3TC7A 5KZMA 2V0TA 3LB0A 3Q2DA 1KM1A 5E93A 1XUZA 3SGUA 1OX6A 2B7NA 4M7SA 5D04C 1JCJA 1U5JA 1EWDA 3P74A 4XKYB 4UMAA 1XBVA 2ISWA 4O0KA 1MZHA 1M7PA 3KVLA 4UTWC 2R91A 2CLEA 3W7CA 3PULA 3MUXA 3A24A 1B9BA 4HT3A 4ORMA 3E0IA 1P0KA 1QO5A 4M19A 1SW3A 1G4SA 3UZJA 1H7WA 3O6CA 1QO2A 3S1XA 3VI2A 3O8AA 4UMBA 4O52A 3MP3A 1TPFA 3MP4A 3EX3A 1SW7A 3V1PA 3W22A 3GXPA 1LRTA 3QH2A 5CZSA 3B0PA 1RV8A 3O07A 2QEZA 1VYPX 2JBMA 2QCEA 6ALDA 4UR7A 2NZLA 4MJMA 1OF6A 1S5TA 4N2YA 3DENA 5G2HA 3GK0A 3MW7A 3M6YA 2CFFA 3S5OA 4UTKA 5FF4A 4GUJA 4G1KA 3MI2A 3DZ1A 2DZXA 4AHPA 3S1VA 1C9DA 3C2OA 2X30A 4PFMA 1ALDA 2GVGA 2H90A 4U4MA 1NSJA 3GDTA 2JK2A 4CNPA 3W2UA 5KZDA 3NQ8A 1JCLA 3DFSA 3L9CA 2TYSA 2Y7EA 2RH9A 4RZ5A 5BW6A 2I1OA 4JTTA 3TXVA 1GPWA 1LBMA 1TV5A 1G4TA 1GVOA 5AYXA 5TIMA 3W1NA 1ICQA 2DJXA 1N8FA 3MYOA 5J5RA 3EB2A 3W07A 1F76A 2UV8G 1LCOA 2A1YA 3HF3A 3OVRA 4O12A 3G1DA 4JIQA 4EIVA 3O06A 3S8HA 1ME7A 4RJEA 1T8XA 2ATMA 1XFBA 3LERA 3NVTA 1ME9A 3NL3A 1BKSA 1DVJA 3NQDA 4GUHA 5I3GA 4HPXA 3NZ1A 2WNNA 3H54A 1C8VA 3MHFA 2QJHA 5L6UA 3W72A 4CQ9A 3CB8A 3W2KA 4E38A 3R89A 3W7DA 4O17A 3N19B 1IXOA 3OVPA 4S2CA 4UNKA 1TRIA 5D30A 4BI5A 1EP2A 1OX4A 1FWRA 2Z0IA 5G4EA 4UC5A 1I45A 3PM6A 5EA9A 2ZDRA 2ZTJA 4Z1BA 4UTTA 4ONVA 1HUVA 3PUOA 3HQ1A 2GQ8A 2QR6A 3IGXA 3G3MA 1X1ZA 2YSWA 4JN6A 4UTHA 3TXZA 3THQA 2H3DA 5HJLA 1DBTA 2ZRYA 1A5BA 3GDLA 4OQVA 4QISA 3W1QA 3HGJA 5CKSA 1A50A 1KFKA 1W5PA 1D3HA 1OHLA 4IPJA 1L6WA 1JQVA 1MEIA 2G97A 1L9WA 2DP3A 5KINA 3LRKA 3HGSA 4O54A 4Z1CA 1KV5A 1O60A 4NU7A 5HINA 4ZQOA 2C3ZA 1UASA 3S42A 1JCYA 3SGZA 4RR4A 1Q6OA 4GUIA 4HNTA 3CLMA 1FWNA 3C2VA 2WSQA 4O1CA 1TPWA 1TIMA 3W85A 3SZ8A 3S1WA 1WAUA 3GNNA 3VKJA 3W7JA 4FNPA 3HGRA 2V2HA 4LVFA 3SIZA 4S1FA 3U6WA 4ICNA 1BWLA 3NQ6A 2V5BA 3P81A 1I8JA 1T96A 3GYEA 1VR6A 1ZHAA 1HO4A 3VE7A 1ZFJA 1DJQA 2FPTA 5I3JA 2G5WA 2RFGA 1ZAJA 5EYWA 3NXFA 1PHWA 3MYPA 4WOQA 4GBUA 1XBZA 2V5LA 2XN0A 1L2UA 3WK3A 3M1ZA 2QAPA 1EWEA 5FF3A 1EB3A 1QOPA 4MZYA 5FEWA 4QQ3A 2YCEA 3UPWA 2XFWA 1AMKA 1KM3A 4IXHA 1NF7A 4GUGA 2E5BA 3LV6A 3UWQA 3BGJA 3LBCA 3LLDA 4OV9A 3FFSA 3W7QA 4UFMA 3DH7A 3GKFA 1I4NA 2FFCA 4NNAA 4IOTA 3UYCA 2G95A 2Q3RA 3M7WA 3QF0A 3VE9A 1X8FA 5D09A 3HPXA 4NZJA 5SWUA 3C8FA 4JDYA 3W2NA 4TIMA 1SFLA 2NV2A 1FX6A 1SZGA 2JKPA 2QJGA 3ABQA 3W76A 1MEWA 3CHVA 4UXDA 2H3BA 3C2FA 3PVFA 1QR7A 1OYBA 4MPQA 4MVAA 2D73A 4O53A 3TC6A 3N2XA 1H5YA 1W5QA 3EXSA 3F4WA 3R13A 4WX2A 1PV8A 2E09A 3TFXA 4O4WA 1TPDA 3PSWA 1T0OA 3THAA 4IQLA 4QIUA 1RR2A 2FB3A 3JS3A 5I3KA 3MMTA 4KWVA 2EKCA 3L66A 5CGQA 1OFQA 2E1DA 3UWVA 3HJZA 2VXNA 5J5DA 2A21A 4UFHA 4O15A 5LHFA 5KMYA 3K30A 1OFEA 3NQ2A 3NNTA 5IM51 4FIQA 3I6RA 2CLOA 4JX6A 1YXCA 3FYPA 1SO4A 5F1VA 4CLMA 4LNYA 3B03A 3L2IA 3GDKA 3LOTA 3RFAA 1G4PA 3LM7A 1S5VA 4FF7A 5FF0A 1BTMA 1GQNA 4I9AA 2Q8LA 3QRHA 3G3DA 3HPZA 3GXNA 2HSAA 4MY8A 2WNZA 1SU5A 3VCRA 4N9BA 2ZRZA 3UY8A 4LV9A 4AH7A 2QCLA 2ABBA 4ZQCA 4YWIA 5I3FA 1A5CA 4OU1A 2C19A 1EUNA 3TROA 2VFEA 1N7KA 1Z42A 3FJLA 1BEUA 1DORA 4A2RA 1ZALA 4E2BA 4YL2A 5AOUA 5LNSA 3UXDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HZ3 A;  1E6R A;  2BDQ A;  4DO7 A;  1W6T A;  3USZ A;  4LVB A;  1OBA A;  3W00 A;  2XWD A;  4JNM A;  2VEN A;  4OE7 A;  2NX9 A;  2AQW A;  1KBJ A;  1E72 M;  1CXL A;  1UUO A;  1KW1 A;  2HS6 A;  1UBP C;  1OX4 B;  4PYS A;  5FSD C;  2HJP A;  2H8X A;  1VD6 A;  1O4U A;  1OK6 A;  2XVN A;  5AC8 A;  4B5U A;  4GG9 A;  2DIK A;  2A3B A;  2CYG A;  3MDW A;  3PAO A;  4AWU A;  1SO3 A;  4AQL A;  5K9D A;  2VKZ G;  2QDE A;  5F4W A;  3WD3 A;  3SRK A;  4UWM A;  2ZX6 A;  4HYW A;  4N6F A;  3ATY A;  3SW6 A;  4DXX A;  3UCQ A;  4RNI A;  5HMD A;  1B57 A;  3ABZ A;  3AYS A;  3P6L A;  1W91 A;  5I6S A;  5AN7 A;  3EMC A;  3MV0 1;  4AWE A;  3M0L A;  5AHF A;  2NX1 A;  1K9T A;  3RG6 A;  3FGC B;  1C8Y A;  1L6G A;  3AML A;  4XV0 A;  2PD5 A;  3OLG A;  3H70 A;  3QMS A;  3CC1 A;  3GAK A;  2MUC A;  4W5Z A;  3WLM A;  1TUF A;  1P1M A;  2WJD A;  4MM1 A;  3WCZ A;  4O10 A;  3CO8 A;  3N11 A;  4FR6 A;  1SR9 A;  4ADT A;  3JRK A;  4KRU A;  5TNV A;  1AH4 A;  1S1R A;  2CXE A;  4GIR A;  2ZA1 A;  1QI2 A;  4S3J A;  3G1S A;  2VM8 A;  4NAF A;  3BTN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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