3G0X | Genus

Total Genus 141

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	141
sequence length	363
structure length	360
Chain Sequence	DERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
publication title	Structure-based design, synthesis, and characterization of inhibitors of human and Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenases pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	141
structure length	360
sequence length	363
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2009-01-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3g0xA00

1GG0A 2OCZA 3QYQA 1BTMA 1RQBA 1FDYA 4Y96A 1LM1A 3H55A 3W1XA 3S5YA 4U4MA 3NA8A 1LP6A 4TO8A 1Q6QA 2YYTA 3CIXA 4O0ZA 3R8RA 5HMSA 3BG3A 4KFOA 4NNBA 4JX4A 1C29A 2GJNA 2Y70A 4R34A 5CKSA 1DOSA 5FEZA 8TIMA 3GNNA 4R53A 2ATSA 3R12A 3W7QA 3I68A 1LBLA 2VFFA 4OQVA 1IXOA 4FEZA 5I3GA 4Q4KA 1MZHA 3FFSA 4RX0A 3RU6A 4JXCA 3QQ1A 1T99A 3M7WA 2NX9A 3DFPA 4OHQA 2QEZA 3GDMA 3G1DA 4OBTA 3IIXA 1X7FA 1Z41A 3G18A 5D2TA 3HPZA 2Y62A 3P82A 2A7PA 3OVQA 3RLVA 1QNVA 5HWNA 2B7PA 3P62A 3HG5A 4MVAA 3BK0A 3GDRA 1H62A 2I9EA 4QM1A 3CB8A 3TROA 4UR8A 4XQ6A 4Q33A 4CCCA 3W6YA 4PA8A 4JICA 3KFTA 1KFEA 1IIHA 3ABRA 3W7GA 4DELA 3STGA 2X30A 3QH2A 3O07A 2CW6A 2ZRUA 1R2TA 3LOTA 4MZ8A 1KM1A 4PCFA 3G1YA 2A1YA 3EX4A 4JTTA 1RV8A 3UWVA 3DFNA 1G69A 3QPZA 2J9YA 1QO2A 2FQIA 2A0NA 3PG9A 2CLLA 3E12A 2FIQA 4A21A 2D73A 1I4NA 4N4QA 2DU2A 1KFJA 3O63A 4BI7A 2HTMA 2ZZ3A 3N2XA 4KWVA 2CLIA 3QPYA 2TSYA 4POCA 3STCA 4LVFA 1KFCA 1VJIA 4WY0F 4UNLA 2GOUA 2QCNA 2ZZ1A 4DPPA 3P74A 2ZCGA 1A5AA 3B8DA 4AMAA 2E6DA 2YDAA 3CHVA 3T7VA 2A5HA 2FLIA 4WQ6A 4JTJA 4MIMA 3CWNA 4UTWA 4I7VA 1GVRA 3QZEA 4FO4A 2DJXA 4LVGA 1UB3A 4M5PA 1FWRA 3W87A 1Q45A 3W1MA 1GT8A 1FX6A 3PVFA 3TJXA 3RFAA 4RLIA 4ZZ9A 4N02A 3TK7A 5F2MA 1GTEA 4S2BA 5AHMA 4LVBA 4LNYA 1WOAA 2JGYA 1KW1A 3JS3A 1EB3A 2I1OA 3L65A 4OGZA 2FB2A 5G4WA 4PTNA 2WNNA 3CLMA 1RQEA 2A4AA 1J4EA 1XKYA 4N9EA 3WJWA 3TV8A 2V8ZA 4LC6A 4IMDA 2QCMA 4LVDA 4GJ1A 4DF0A 5G4EA 3MWAA 1FUYA 1LLWA 4LS1A 3N3MA 1THFD 4FX7A 3STFA 5C2XA 2AQWA 4R7JA 2VOMA 3IVTA 3QEZA 1T8XA 4FNPA 4XTIA 3CIWA 1G4EA 1WDWA 3LB0A 4ICNA 5BMWA 4MLRA 1H1ZA 3HGOA 1FCVA 3EX3A 1SZGA 2DZTA 5L9FA 3Q2DA 1NAL1 3W7CA 1A5BA 1JULA 2R14A 2VEKA 5AHNA 3GR8A 1M6JA 4UR7A 3W74A 1OFBA 2NV2A 2A85A 2XN0A 3FA5A 1R46A 3MBFA 5AYZA 4Z1BA 3TW7A 5GVJA 3R2GA 2Y7EA 1M5WA 2R8WA 4O13A 1VRDA 4WXYA 2H8XA 2GVJA 4YXGA 3HGRA 4IXHA 4UFJA 2YCEA 3TXVA 2QR6A 3NVTA 3LERA 1XDMA 2C1HA 3C6CA 4Z1DA 2QCDB 3VI2A 1F73A 5HQEA 4Z1AA 3ZWSA 3W7DA 3LHUA 3P61A 3MMTA 2CLMA 3SECA 1FBAA 4O15A 5F1VA 4O12A 1QO5A 4I9AA 4NNCA 4UTTA 2CLHA 1S3HA 4KKXA 1Q6RA 4IUOA 1H1YA 1QCWA 3O1NA 1KM6A 3LTSA 1TMHA 2Z6IA 1TJPA 5HUPA 1PVNA 1OFPA 4HT3A 3W76A 1X1OA 1AW2A 4MFDA 3FOKA 1UCWA 4LC8A 3CT7A 2FJKA 3W7IA 5K3VA 5H91A 1F05A 3W7PA 5KZDA 3W1TA 2NXGA 1VLWA 3NG3A 4N9CA 3I7SA 2CWNA 4GE8A 3SFKA 4ADUA 3B05A 3DKJA 2RKXA 1LZOA 2Z2UA 2CZ5A 4FB7A 3T40A 1EWDA 1H60A 1KM3A 5U7SA 1L9WA 5EPDA 3KRZA 4UMCA 1ICQA 4LT9A 1I2QA 1SUXA 3WK0A 1JUKA 1OFOA 3ELFA 3T44A 4NJJA 2ZBTA 3SW6A 4AHPA 1EEPA 1VCFA 2FPVA 2WSRA 4CNOA 5KTLA 4IPIA 1JCYA 4A29A 1OK4A 3I7QA 1ZAJA 3GAKA 4TIMA 2WNQA 1JCNA 2J88A 4RZ6A 1MEWA 3C2EA 5HINA 3E9AA 3M6YA 3KRSA 4OT7A 2QCGA 4ONVA 4MYAA 2BX7A 3LRMA 1XBYA 2NXHA 3OHIA 2E6AA 3MI6A 5K4ZA 1H7OA 4WUIA 5DBUA 3P5YA 4UTLA 3VKJA 2WKJA 3MHFA 3NAVA 4O50A 5C5YA 1OX4B 3UPWA 1KFKA 1PHQA 2ALDA 3IGSA 2CLKA 4NU7A 3QMTA 2GVLA 3L68A 2E68A 3M5ZA 5FI8A 5F4WA 5F1UA 4JYFA 4HKPA 2EAWA 4C1KA 5J5DA 4NXKA 3S1WA 2XN2A 1AW5A 3W7MA 1GWJA 1VYSX 1XBVA 3LI1A 3ANYA 1HO4A 3A9IA 3W73A 1S5TA 1KM4A 3I6RA 3TQ0A 1C9DA 3QQ0A 3HBLA 3WJZA 4D2JA 4NT0A 1A5SA 2GQAA 3PB2A 5G5IA 2WQPA 3SR7A 4NJHA 1TPFA 3I7RA 3TA6A 1JJKA 1L6SA 2B0MA 1FXPA 2EHHA 3TC6A 2RDWA 4DF2A 4K38A 4K8HA 3YPIA 3G0SA 2CLEA 1LOLA 3PY2A 1DQWA 3U6WA 5FF0A 5F2IA 2ZRVA 3LCWA 3EB2A 5G2IA 3CEPA 4XZ9A 3LHTA 1W5MA 3LCLA 3PSWA 3TKFA 1YDNA 3W85A 3LHZA 2ISVA 2PRLA 3IVSA 4O18A 2DZUA 4Q32A 1F6KA 2OT0A 2ZRXA 1F5ZA 3UPBA 3CWOX 5HULA 1P5BA 2GVGA 3NPUA 3LHYA 1MEHA 3KVJA 1N55A 4JIQA 4MY1A 4A2RA 4E2BA 3O05A 3QSTA 3E96A 3HB9A 2VENA 3L0NA 4LW7A 5E93A 1V7YA 1JR1A 3L0GA 1K03A 3NO5A 1OFEA 4NZFA 3BV4A 3NOEA 2C15A 4O28A 3O6CA 2ZZ7A 1VYPX 3VFLA 3L67A 5EMUA 1JQVA 2TMDA 2RDUA 3MP4A 3S6DA 1W5PA 3QSRA 1W1ZA 3KVLA 3KX6A 2CLFA 2PC4A 4O1CA 1TTIA 1VCVA 1GYLA 2YXGA 4LS2A 1LCOA 4CQAA 3L9CA 2CZFA 3UWWA 4YMZA 3LBCA 2ZRZA 2A7RA 3C4UA 4BWLA 4KWWA 4UFIA 2Q8LA 3NYZA 4JDYA 4Y90A 1SO3A 2BLEA 3A23A 1GVQA 2HSAA 3BW2A 3G24A 4FNRA 1TV7A 2DORA 4JTSA 1KFBA 2ZZ2A 5DXXA 3NPVA 4M7SA 3W2MA 1TRDA 4X2RA 5K9XA 4K37A 4O53A 4UFLA 5FEXA 3LBMA 1X1ZA 4ADTA 1W5NA 4JY8A 2Q8ZA 3DENA 3FLUA 3W7HA 3NQ7A 3GK0A 1QFEA 2QAPA 4WX2A 5LNRA 3T78A 4WY0B 4RZ4A 3W1QA 1IIGA 3L5MA 4E2DA 4LV4A 1TJRA 3WJXA 1GOXA 3PR2A 3MHGA 1UASA 2FFCA 4R33A 3ATYA 2VKZG 4OV4A 5I3HA 3NQCA 1MO0A 1XI3A 3SI9A 3NL3A 4O10A 3W86A 5DCBA 1O4UA 3NZRA 3EWYA 1O94A 1RPXA 3UY7A 3HGJA 2EPHA 3TCEA 3UWUA 3EX2A 1AK5A 1G7VA 1G4SA 1QPOA 2WOQA 5IBXC 4IX0A 3GX9A 4RCXA 3V1PA 4H6KA 2FDSA 1TV5A 3PBYA 3C52A 4CQ8A 1SZEA 4XKYB 2Y61A 1DKWA 1OFQA 3LLFA 3RLUA 3NQ8A 2J24A 3P5ZA 1LORA 4CQ9A 4L4MA 1KBJA 3W1RA 2VXNA 2WNZA 4JN6A 3L66A 2OX1A 1GEQA 2G97A 3AJXA 4QNWA 3HG2A 4LOCA 2ZTJA 1PL9A 3P67A 3ZR4A 1TTPA 1R47A 3DBPA 1D3HA 3W2LA 1N8FA 3A5VA 4HNUA 5C6MA 1JUEA 2VFGA 4DQWA 3W75A 3NQGA 4YL2A 4XBSA 3B04A 4LVAA 3RF9A 1H7RA 1ZCOA 1FDZA 3LTPA 4LRSA 1LBFA 3CTLA 4Z0JA 1LRQA 2G96A 5FEPA 1QOPA 4UXDA 2ZYFA 5D03A 3NPXA 4JD4A 1FWSA 1ICPA 3W7EA 1KBIA 2HS8A 3LCXA 1X8FA 3O06A 3P80A 3GNDA 2H3BA 1JCLA 1DORA 2VFIA 1DBTA 3TIMA 3PBVA 3L0KA 3BLIA 3DKLA 3FYPA 1XBZA 3IEBA 2FB3A 4H3DA 4PH6A 5L6UA 1FY6A 2PRHA 1EPXA 1Q6LA 2W79A 1S5VA 1YPIA 2RH9A 2RFGA 1ADOA 4O16A 1NEYA 5CGQA 5DLCA 3CC1A 4MKNA 2C0AA 3T55A 2QDHA 5LKYA 5I3IA 1I2NA 4ZL1A 3G8RA 1K8XA 3KXQA 1WX0A 2Y7DA 5D37A 1SFJA 1H7XA 3LLDA 4ADSA 2E1DA 3GKAA 4J9JA 4EIVA 4JTHA 5DBTA 5KMYA 4GWEA 1H51A 3EKZA 4UTJA 4AHQA 3SIZA 3WJSA 4GNJA 3MW7A 2HMCA 1R2RA 2ZZ4A 4JX5A 1F2JA 1AW1A 2QKFA 5A5WA 4JY9A 1IXQA 4JTEA 4O19A 3S8HA 4HNVA 1XXXA 3CU2A 1XM3A 2JKPA 4MLJA 4HNTA 4OWGA 1P0NA 2X1TA 1L6WA 1R2SA 2JGQA 1W8SA 3TSDA 1G4TA 4IJBA 4ML9A 4TMCA 2YYUA 1EA0A 5CPNA 1TREA 3EWZA 3GIYA 3QMSA 1S5WA 2C16A 4DEFA 2B7NA 5KINA 5HWMA 3UWYA 3INPA 4E38A 1W5OA 5LHFA 2C13A 2ZFAA 1H50A 4LY8A 1ZHAA 1K7XA 2B7OA 1Q3NA 4DBEA 3P60A 5AHIA 5AHFA 1F74A 4ZMGA 5LGXA 4UNKA 1PV8A 5HJLA 2QCLA 3PUEA 3M44A 1V5XA 3A24A 4IMGA 4E0CA 1KM5A 3KHJA 1JCXA 4HSOA 3LGEA 4I7WA 1TPVA 4JYDA 4BI5A 2O7SA 3CQ0A 3BPWA 1CW2A 1GVOA 2V2DA 1XCFA 3QW4B 1LDCA 1ZNNA 3W1LA 2PURA 4WOZA 3P8JA 3C2OA 3NM3A 4MZYA 2A7NA 3LCGA 3W1UA 1ONRA 4OE7A 3NQ6A 4IPJA 1Z42A 2QCDA 2IQTA 4GRSA 4UFHA 3E02A 3G3MA 5CZJA 1A50A 2WPBA 1Z44A 1XBXA 4CLMA 4IX2A 2QAFA 2OMAA 5CZ0A 3ZS4A 5CPOA 3MP3A 4I7UA 3ZWTA 4UTIA 3GXNA 3UZJA 4JTLA 1H5YA 4NVTA 4Z1CA 1SO6A 5D02A 2X2GA 3G0XA 2FPYA 3QMRA 4O1DA 4PODA 2DZXA 3S5NA 3DFSA 3W2KA 4FX8A 3HGSA 5SWUA 3THQA 2O7QA 2ZDRA 1LTDA 4UMAA 4AWSA 4ZQRA 3NQMA 3TAOA 3W71A 3LI0A 1ICSA 3C56A 4WJEA 5D05A 4FXSA 4O11A 2JKEA 1PCWA 2A6NA 3DZ1A 3TUUA 1SW3A 4QIUA 1SO4A 3KRUA 3VNDA 4PL1A 3EXTA 1VGAA 5AC7A 2J27A 4H4IA 1QPNA 2NV1A 1NF7A 4FHAA 1YXDA 3IRDA 1GYNA 4YCPA 4GFSA 3GVGA 3A22A 5LZLA 3SJ3A 6TIMA 1LLZA 5J5RA 4MJMA 2VEIA 5H2ZA 4IQLA 4JTGA 4AH7A 3C0JA 4FNUA 5D38A 2QJHA 2BTMA 4N9DA 4BI6A 4O17A 1SQ7A 4K36A 3NNTA 3QC3A 3OIXA 1XFBA 3ABSA 5AC6A 1VHCA 2NWRA 3GR7A 2NZLA 2ABBA 4AEOA 4O4VA 3EXSA 3N19B 3BLEA 1B4EA 3IIVA 2Y63A 3MI2A 1GPWA 3O6YX 4RJEA 1OX4A 1JCMP 2B7QA 5G2WA 5HWJA 5CG7A 3W2NA 1U5JA 5MHBA 3TFXA 2Y89A 1KV8A 1K3UA 1OABA 3G8EA 4X3ZA 1QR7A 4IOTA 3Q37A 1JUBA 1LOSA 5AC8A 4CCEA 5AFDA 2OZ0A 4P2VA 1FWTA 5CSSA 2GUUA 4QSHA 4JNMA 4DBDA 2YZRA 3O16A 1KM2A 1JRCA 5FF7A 5DCEA 1OYCA 3JRKA 4M6QA 4A22A 1UBSA 4QITA 1ML1A 3W3OA 1TO3A 4N6FA 3TE9A 3GKFA 5EL1A 1ZFJA 3NL6A 3N2MA 2GPTA 3Q58A 4NJIA 3NR0A 4LU0A 3BG5A 1OHLA 1TPEA 1DQXA 4EVZA 2V2HA 1B4KA 1SR9A 5CPMA 2V81A 5HR6A 3MO7A 3TR2A 4O54A 3F03K 4LTSA 3EWWA 3SGZA 1PE1A 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5K9DA 3W88A 4P61A 3MHUA 2HS6A 2QCFA 4N6EA 4WY0A 3W70A 1W3TA 2EGZA 1EUAA 3GXPA 1OJXA 5DY3A 4IMFA 3HG3A 4AB4A 1GJPA 3F4NA 4Y8FA 2NUWA 3GAYA 3OG3A 1K7EA 3IVUA 5D04C 2P10A 1HTIA 2CU0A 3UXDA 3F1QA 2X1SA 2J9ZA 2VFHA 2QF7A 4RXGA 2F7FA 1LOQA 3W1PA 4UCGA 3TXZA 4LRTA 2XN1A 2X16A 3M47A 1TIMA 1QOQA 3DH7A 1TSIA 4U28A 2ZTKA 3HPSA 4JTKA 3TFCA 4UC5A 1C8VA 4XKYA 1U83A 4M6PA 1LYXA 1ZAIA 1IXNA 3GDTA 2WSQA 3M5YA 3G1AA 4JS3A 4KFNA 2DP3A 2QUUA 5D2YA 3L2IA 3NL5A 3G22A 3W9ZA 5LNWA 1DJQA 1YXCA 3SZ8A 1W54A 1YTEA 3KVKA 4WD0A 4MYXA 3ATZA 4S1FA 4BF9A 1L6YA 3M5VA 5F2GA 2VFEA 1O5KA 3ABQA 3W84A 2PE4A 4AF0B 1TQXA 5FF2A 4NX5A 3O6DA 5IBXA 2ABAA 4TU1A 5G2HA 3UD6A 3UYCA 3UWQA 3FKRA 4GUJA 3HPXA 1WQ5A 2FTPA 2QCCA 4GUIA 4DPQA 2CLOA 4FX6M 1EX5A 2Z6JA 3E49A 3EX6A 3SSJA 1BKSA 5DCDA 2C6QA 1SFLA 3W7JA 3EWUA 2Y7GA 1KLZA 3TMLA 1VCGA 5LSMA 5HR7A 5HNRA 1I2RA 3W7RA 2G5WA 3LHWA 4AVFA 3PULA 1TB3A 3GLCA 3SY5A 3NQFA 1OFRA 1CI1A 5LNUA 1FQ0A 2QCEA 2ZA1A 3BGJA 1HL2A 3NQ2A 2V2CA 4QAIA 2VC6A 1SU5A 3FEMA 1NVMA 3BLFA 2BZNA 5I3FA 3G1VA 2WSYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3G0XA

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