1W9UA

Specificity and affnity of natural product cyclopentapeptide inhibitor argadin against aspergillus fumigatus chitinase
Total Genus 145
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
145
sequence length
395
structure length
395
Chain Sequence
ASSGYRSVVYFVNWAIYGRNHNPQDLPVERLTHVLYAFANVRPETGEVYMTDSWADIEKHYPGDSWSDTGNNVYGCIKQLYLLKKQNRNLKVLLSIGGWTYSPNFAPAASTDAGRKNFAKTAVKLLQDLGFDGLDIDWEYPENDQQANDFVLLLKEVRTALDSYSAANAGGQHFLLTVASPAGPDKIKVLHLKDMDQQLDFWNLMAYDYAGSFSSLSGHQANVYNDTSNPLSTPFNTQTALDLYRAGGVPANKIVLGMPLYGRSFANTDGPGKPYNGVGQGSWENGVWDYKALPQAGATEHVLPDIMASYSYDATNKFLISYDNPQVANLKSGYIKSLGLGGAMWWDSSSDKTGSDSLITTVVNALGGTGVFEQSQNELDYPVSQYDNLRNGMQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords CHITINASE
publication title Specificity and Affinity of Natural Product Cyclopentapeptide Inhibitors Against Aspergillus Fumigatus, Human and Bacterial Chitinases
pubmed doi rcsb
source organism Aspergillus fumigatus
total genus 145
structure length 395
sequence length 395
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2004-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 1w9uA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w9uA01
3WUEA 4BF7A 1FH9A 3CTTA 5D9OA 1XYZA 2WWCA 2FGLA 5CZKA 1HJWA 3T2OA 2WC7A 4QFUA 4Z2IA 4PSPA 4U3AA 4AZ5A 2VUYA 4WSKA 4PYSA 1ESWA 1MW0A 3GXDA 3N18A 2G41A 3NUKA 1ZJBA 3O2LA 3UG5A 1DTUA 3N17A 1CGXA 3BGAA 5A6AA 3WD0A 2OLHA 4D6JA 3VX0A 2ZE0A 1JF5A 3PZNA 3FHQA 4UOZA 4DWSC 2J7EA 2BVDA 1RH9A 4D6DA 3TTSA 3T09A 1E4IA 3U5YA 2YLLA 2OWWA 1JI1A 1NWUA 1TG7A 2XVPA 2VR4A 1ECEA 1GQJA 4UCFA 4PTMA 5M17A 3L2MA 2X8RA 3ZIZA 1MFVA 2VC9A 2VJXA 2UY5A 2WCSA 2W4XA 1E6SM 1OINA 4P8WA 2MANA 5FL0A 4WF7A 1ZS2A 1UA7A 1M53A 3AMGA 3SUTA 1J0IA 4AIEA 4PSRA 4WK9A 3FY1A 1GOWA 3SCUA 4W7WA 2BY2A 3GXMA 1JNEA 4MNJA 2EPKX 1QVBA 1F4HA 3ARZA 1LF1A 4EE9A 2XGBA 4PMQA 5I0DA 1VF8A 3S2CA 2WSKA 1E1EA 1G94A 3WSUA 2J79A 3GDBA 2W67A 1OIFA 3LPGA 3VMPA 1CYGA 2VI0A 3ARUA 4BQ2A 1CWYA 2JE8A 3TP4A 5ABFA 2G3IA 3T0BA 3AIWA 1WZKA 5D9NA 2YJQA 3AIQA 3RM9A 1EIBA 3KEHA 5I23A 1I1WA 1V02A 4OOUA 2CBVA 2J7BA 2VT0A 3FNDA 3D3AA 1CLXA 1JF6A 1WCGA 3EBVA 1Q6GA 1QI5A 1WDRA 1QPKA 4CCCA 2DPEA 1H1NA 1MQRA 1CXHA 1UKSA 3EDJA 5E0CA 4B15A 3SCTA 3G6LA 5E6YA 1O6IA 3OLDA 4IISA 1TUXA 3SUVA 1NP2A 4AZCA 4MJ2A 2QPUA 1Q4NX 1JG9A 1Q6EA 1W9XA 2G3NA 1WAWA 4TUFA 1PZ2A 1UR0A 1V3HA 3VIMA 4UQBA 3BH4A 1LLOA 4U5KA 4FLSA 4AMCA 2CPUA 2VX6A 1WNOA 3L4YA 3L4UA 3SCRA 1CDGA 4FF5A 1BPLB 3WKZA 1VENA 4PTVA 4XX6A 2D3LA 3VDAA 2DSUA 1VEPA 1L8NA 1UD6A 1H0IA 3A4XA 1V6VA 1CBGA 1QNRA 4M82A 4OJYA 2PBOA 1CZ1A 4FLOA 1E55A 2BHYA 5A2AA 3AIVA 4PMDA 5AC4A 2DIJA 5D8WA 2J75A 2W61A 5M5DA 5E70A 4Z2GA 1E3ZA 4JAWA 3PZTA 3NSMA 1WE5A 2WC3A 2D1ZA 4FLRA 4UFLA 1PIGA 3GH5A 1ZBVA 1V0NA 5A6BD 4HMEA 3OZPA 1CNVA 2BY1A 4OBSA 2PC8A 3VGFA 3ARQA 3WQ6A 2BS9A 4UOQA 4NSBA 5CLTA 3AZTA 4PMYA 1VEMA 5A6MA 3GH4A 4PMUA 1N82A 1H2JA 4UFIA 3W29A 2XVGA 1E5JA 1JDCA 3CH9A 3VDCA 3SUWA 1V6XA 2BFGA 5C8BB 2WHKA 4WLCA 1E6RA 3NCOA 3VVGA 2WMGA 4P8VA 2XFRA 1G01A 1J0KA 3WH6A 5A8PA 1O7AA 1R85A 1EDTA 4CVUA 1EO7A 1H5VA 2GUYA 3SUSA 3VIIA 3ZR6A 4W8BA 2A3CA 2VNCA 3LPFA 4D6GA 1GOQA 2XWDA 4OUEA 3ARXA 1BAGA 2O9RA 4EKJA 3VMOA 4D1IA 2CKRA 1G5AA 3AYRA 2UY4A 1GVIA 1W1VA 5DT7A 1M7XA 4GI6A 2GVYA 1UA3A 2WB5A 1GNXA 3PBGA 2VR5A 3ECQA 4ZEPA 1UZ1A 5DF0A 1BG4A 2CIPA 3UESA 1OT1A 2E8ZA 4PBGA 1ZJAA 2JFEX 2YL8A 1JXKA 4B16A 2D0GA 2WCAA 3CZEA 3OGSA 2XIIA 3DYOA 4GPNA 1CXFA 1ITXA 4QAWA 3MU7A 2VRQA 3CBWA 3DHUA 3MUY1 1MVYA 1VIWA 1QNOA 3W82A 1A47A 5AY7A 5CGMA 4NRRA 3AQUA 3AXHA 3AHVA 1PX8A 3BXWA 2YDQA 5A8QA 1GQKA 1GW1A 1UR8A 1HJVA 3WENA 1CXEA 2J7HA 1IZKA 2AOSA 1NM9A 3IJ9A 4IUGA 2BXZA 2WMHA 4AD4A 1ODUA 4DM2A 4MPKA 2W63A 5A6JA 4AD5A 2ZXBA 2DSVA 4JFVA 4GQQA 2VX4A 2DSWA 2FGZA 3GXIA 2WMIB 3W4RA 4HA3A 2YDSA 4W89A 1JAEA 1HJSA 1QBBA 1GPFA 1P6WA 1B2YA 2DQXA 2GFTA 3SCQA 1J0ZA 1MQPA 1WDPA 2XVKA 3VIKA 1X6LA 4S3KA 4GZJA 1C92A 3AZRA 4AZGA 4P7OA 5BYWA 4M29A 4PMZA 5CSUA 3VM7A 1UKPA 1IT0A 4PCTA 3TONA 3GBEA 2VO5A 2EXOA 4QDMA 9CGTA 4CU8A 5A6KA 1OBAA 1CIUA 3W38A 1B3YA 1NWRA 1MYRA 4JFWA 3TTOA 5TD4A 3CUIA 2UY3A 3WQ8A 1BF2A 1OIMA 1ITCA 2WZIA 4ZXLA 4QLKA 5DFAA 1X1NA 3MV11 5D8ZA 2JF6A 5E9AA 3MMDA 2J4GA 1R8LA 4IPNB 3U5UA 1BYDA 3UCQA 3RJXA 1B31A 1HL9A 1LG1A 5D9PA 4W84A 5DMYA 3OB8A 3VD7A 3W81A 4DUVA 4AZBA 1WO2A 5D4YA 2D2OA 6TAAA 2DH2A 5IXEA 2VCBA 1EHNA 3L4TA 4D6CA 3LMYA 5ABFB 5HOSA 2VURA 4UZSA 1OGSA 1QI4A 1RPKA 1XGZA 5GPRA 2WVVA 2X0HA 1E9LA 4YPJA 4CUCA 2UY2A 4KGLA 3AISA 1G0CA 1K9DA 1V6WA 1C8XA 5BXSA 3IAPA 1NP0A 2OSWA 2FHCA 5HPCA 1XV8A 2IXVA 1FFQA 1GJUA 1DWIM 1EH9A 4AZCB 4NZCA 3PZIA 2CNCA 5JBEA 3PZGA 1V02E 2EEXA 3MANA 1QHZA 2GDVA 4J28A 3ARVA 5A95A 4UQAA 3AIEA 3L4WA 1XSKA 2E40A 2NT1A 3K46A 4HMDA 2NT0A 1I1XA 3HN3A 4TTUA 4XV0A 5IDIA 3B9AA 1V6UA 4L4OA 4TOQA 1C93A 4V27A 1H4PA 1US3A 1PAMA 4UFJA 1UKQA 1LL6A 3WFLA 1MW1A 3VIPA 1KR0A 2Y5EA 5HXMA 3JUGA 4AYSA 2OSYA 2DT0A 3KL3A 1E70M 3W6MA 2F61A 3WN6A 3SCSA 3QOKA 4B9ZA 4J3XA 4B3LA 1FH7A 3NDYA 1JYVA 2VZSA 1E0VA 1JDAA 1PX4A 3TA9A 4V28A 1B0IA 3DYMA 4KWUA 2ZICA 3L4VA 1UOKA 3AMLA 3F5LA 2DT1A 1HJXA 2AMGA 2WYSA 2RGMA 5LYRA 3WQ5A 4AEEA 1KXHA 1K6AA 3GBDA 2ZXAA 3CUHA 2OYLA 3WIJA 3O6AA 4UQCA 4LX4A 2WBGA 1C3FA 4XB3A 1W9UA 1E3XA 1UQYA 1JI2A 3LPPA 1PZ3A 3HJEA 3OGRA 4TTGA 4W5ZA 2EPLX 3M07A 1J9YA 4JCLA 2O92A 2JIWA 1GOOA 2GJRA 2VMFA 4ATDA 3SCOA 3NJ3A 1BYAA 3ZT5A 2NSXA 2Z1SA 4MB1A 3CHEA 4TXEA 2JF7A 3EYPA 4W93A 3MUZ1 5KZ6A 2G4FA 4A4AA 1B30A 4XUYA 4F8XA 1MW2A 5CXPA 3UR8A 4ZE4A 1E73M 3PZMA 3IJ7A 5EFFA 2RGLA 3VGEA 3BLPX 2YA0A 3DC0A 2X05A 2TAAA 1BVZA 3EDFA 1HP4A 3MV01 2QMKA 2WMIA 1CPUA 3WDRA 1V0MA 1WPCA 3VIFA 4QP0A 3RDKA 5CLWA 3BAXA 2D0HA 1HJUA 4GZEA 5DO8A 4W5UA 3K8KA 1XC6A 4HP5A 1E6NA 3SCPA 4BA0A 4KGJA 1QNPA 2OWXA 1KXVA 3GH7A 4U31A 1JIBA 1BSIA 5BWFA 1V08A 4JHZA 2O9TA 3N13A 4NI3A 5AYIA 1D3CA 1DWAM 2WC4A 3WDQA 1J12A 4MADA 1J10A 1W9BM 1AVAA 4OOZA 1E15A 3F5KA 3WNNA 4PMNA 1QI0A 1OWQA 3KWXA 2XFYA 1LWJA 3KL0A 4F79A 5FCZA 2WANA 4CD6A 5C71A 3RM8A 1W2VA 3AS0A 2Y4SA 3VU2A 3PTMA 1JZ7A 2D22A 3CUFA 4CCDA 2WMFA 5A8NA 1RP8A 1W91A 2BY3A 4H41A 2CHNA 1JZ2A 4X9YA 1UD3A 4JHOA 2F2HA 3O9NA 1HT6A 4AD3A 4CU6A 1NARA 3IANA 3J7HA 2YA1A 2G8ZA 4GI9A 3WMBA 3WD4A 4AD2A 2XGIA 2FHBA 5FL1A 2BNJA 2CERA 1EO5A 3VIHA 2WSPA 2CYGA 3FXYA 1W32A 5AC5A 3ARTA 6CGTA 3ZQ9A 1L0PA 4P7LA 4KRTA 2XTKA 1EGZA 2WLZA 1K9TA 4ZE5A 1J0HA 3QOMA 3VTRA 1XD1A 2YLAA 3VIOA 3WEZA 4ATWA 2Q8XA 3PTQA 1QI3A 1NWTA 1FHDA 1UR2A 3ZSTA 3WDJA 1W3KA 2VTFA 1GCYA 4AD0A 4LQ1A 1HIZA 1C7TA 1U30A 3WDPP 1CGYA 2J78A 5I24A 2WVVB 3DECA 3M7SA 3VILA 1BVNP 2PWGA 1KGUA 2ZUTA 3VGGA 1MW3A 2WBKA 5JBDA 1W3HA 1CLVA 1BYCA 4J27A 1OB0A 7A3HA 4OKDA 3AI0A 3WUBA 2BXYA 2QMJA 3F5JA 2BVTA 1UUQA 3UETA 3UG4A 1BGGA 1KR1A 2X09A 4LYPA 3AIUA 3VM5A 4CGTA 2VRJA 1WP6A 2ZOXA 1KQZA 3U57A 4Y7EA 1WDQA 4GZIA 4BS0A 1E43A 1ZBCA 2DSZA 1W9PA 5JUVA 1EQPA 5M03A 1W1YA 4DWSA 1AQ0A 3SEPA 4MAZA 1CGVA 2QPSA 1CXLA 4DUXA 4BQ3A 1EDGA 4RE4A 5DEZA 2EJ1A 5I79A 2W62A 3MUAA 2VL4A 3N9KA 2Y24A 4LYRA 2XM2A 3QHMA 3ZOAA 3T2PA 1C7SA 3WNLA 3T0AA 3RILA 1VBRA 2OSXA 2WNWA 4HOZA 1KWKA 1XHGA 4V2XA 3A6OA 2GSJA 2J47A 1EXPA 1DWHM 4Q7NA 4F9DA 2WVUA 3VD4A 2GDUA 1JYNA 1UR9A 4PEEA 3CMGA 4OIFA 1LL4A 4AD1A 2ZX7A 1G9HA 4AZ7A 2WXDM 3E1F1 2J7GA 2YL6A 1GOKA 4ZXOA 1FP8A 4LPCA 4MNLA 5E0FA 5HPOA 2J62A 1H41A 1QNQA 4R27A 5BRQA 2GJXA 3RO8A 5GNYA 1M04A 2CBUA 4P7QA 3WBEA 2X0YA 3BMVA 1C90A 1R86A 1WDSA 5BRPA 2DEPA 4EAMA 3VX1A 4PUDA 2C0HA 1OD8A 2BV9A 3GNOA 3AROA 1XH0A 1W3LA 4AIUA 5C70A 4QLJA 3BAYA 2XUCA 4BZYA 3NYDA 1HX0A 1QOXA 2CESA 3BAJA 3OBAA 3WEMA 5E6ZA 1H11A 4N0RA 2CKSA 4AEFA 2ZUMA 2WAGA 1OCQA 4FLQA 3GNPA 4ACZA 3ZJ8A 1ZU8A 4Z2KA 2D20A 5BROA 1TVPA 3I3EA 2OWCA 2VOTA 3WF1A 3WNKA 3VDBA 2WM0A 3WDHA 3POHA 4JL1A 1GOMA 4H8VA 3KZSA 1BHGA 3QHNA 4X0VA 5ABGA 3VD9A 5AYBA 3SCWA 2A3AA 1VB9A 3AYSA 3ZR5A 3VNYA 3CUJA 1IV8A 2X2YA 2B31A 5JH8A 2VZVA 1US2A 1UH4A 2UWFA 3RIKA 5FIPA 3W28A 1ZB5A 3DHPA 2ZUSA 1SR0A 1V3JA 1OGBA 2PWDA 5CGTA 1HKJA 4UTFA 3CHCA 3OZOA 2XSBA 3IAQA 4NF7A 5ECUA 2DDXA 2ZUNA 1NH6A 4HZ7A 1JFXA 3BLKA 2IXUA 1OSEA 1XD0A 5I5RA 2C8NA 4J3TA 1KXQA 1MXDA 4PCSA 3BMWA 4H2CA 5BXTA 1LQ0A 2O9PA 4CVWA 4AC1X 4BCEA 7TAAA 1XYFA 3WL1A 1ISWA 5KEZA 4NRSA 1JZ8A 1JZ4A 1MFUA 2WKLA 1VEOA 3WD2A 4CN1A 1HL8A 7CGTA 1VFUA 2CITA 4W7VA 1MQQA 1HNYA 1FOBA 4XZBA 2Y8VA 3TTQA 3NSXA 3VMNA 2G3JA 4D72A 1JL8A 4ML4A 2D3NA 1GQLA 3VINA 5JIPA 4RL3A 2V3DA 1EHAA 1UH2A 5A2CA 3VGDA 2FDMA 4QLLA 1TA3B 3ZO9A 3ZM8A 1GZJA 4L4PA 2V3GA 1LJYA 3WF0A 1WZMA 2J7FA 4HOWA 5CJ5A 1RP9A 2ZUUA 4UQEA 3ARRA 1VRXA 1CGUA 2PWEA 5A8MA 3WNOA 1K9FA 1U2YA 5CQ1A 1PIFA 3N04A 2CETA 2WHMA 4EANA 1LL7A 1CGTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1XII A;  1KA9 F;  3S1X A;  2YKK A;  1A80 A;  3VNM A;  3W25 A;  3REQ A;  4UOJ A;  4PCN A;  3PFR A;  1LYX A;  2V2H A;  3CQH A;  2RKX A;  2YOC A;  1E44 A;  4CNP A;  4B5X A;  1I75 A;  1TWW A;  3ENL A;  2VQU A;  1KW1 A;  3OJG A;  1XLF A;  3WFZ A;  4DBW A;  2TMD A;  3P5Z A;  1EJU C;  4XSM A;  3W22 A;  3LER A;  1ZSX A;  3BWW A;  2IUZ A;  5CPM A;  3NQD A;  3SSZ A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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