5D32A

Directed evolutionary changes in kemp eliminase ke07 - crystal 11 round 6
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
LAKRIDAALIVKDGRVVEGSNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELSFWDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVEINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVYIAAKRVDGEFMVFTYSGTKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEIVLGSIDRLGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIAHRGAGKMEHFLEAFLAGADAAKADSVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags De novo protein, lyase
molecule keywords De novo kemp eliminase KE07 round 6
publication title Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 11 round 6
rcsb
source organism Synthetic construct
total genus 94
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.3.-:
pdb deposition date 2015-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5d32A00
1W1ZA 3NQFA 1SR9A 1UBSA 3MBFA 4AHQA 4NX0A 1TO3A 2WQPA 3M7WA 1NEYA 4NT0A 1PHQA 3W7EA 3AJXA 1TPWA 4K36A 3TCEA 3NL3A 4XTIA 2QJHA 3LDVA 3CLMA 5AHLA 3EXSA 5KITA 1KFLA 3EX3A 4TX9A 3EKLA 1P0KA 2P1FA 4QJ1A 2YR1A 3NR0A 3DENA 1PCWA 3R8RA 4HN4A 5D2XA 4NNBA 2TPSA 1VQTA 2DZUA 2V30A 3M6YA 3EWUA 3PF3A 2QUTA 2NUYA 4JEQA 2B0MA 3OHIA 3L9CA 4DO4A 4XBSA 3RF9A 5A8GA 3EX1A 3NYZA 5TBOA 2EAWA 4JX4A 3FS2A 5G2WA 4K7YA 3S5YA 1OK6A 1WAUA 3F4NA 2GJLA 3U8GA 5CSRA 2DZSA 4DEFA 1OHLA 5LZLA 2EHHA 1QO2A 2ZRXA 4NNAA 1XXXA 1TSIA 2ZRZA 1JRCA 1B57A 1JCLA 3G1AA 2OCZA 1OFPA 4CLMA 2VFGA 4WY0F 3DKJA 3LX9A 3H53A 2R8WA 4PFMA 2ISVA 5J5DA 2A5HA 4IOTA 3SY5A 2V5BA 4ZQPA 3TQ0A 3E02A 2E6YA 4M5PA 2V81A 1XBXA 3ELFA 3IGUA 1H7OA 1KV5A 1SW7A 3NQAA 1T99A 1H7RA 2JKEA 3O05A 3NM1A 4AHOA 4NU7A 4MIMA 1VYSX 5F2MA 4IPJA 3WK3A 5EYWA 4R34A 3G3MA 3M43A 4ZVJA 3SIZA 5CPLA 2V2CA 2Y7GA 4O54A 3TR2A 5D2WA 5AC8A 4QISA 1UUMA 3OG3A 5D2YA 4BF9A 1AW5A 2GVJA 3KVJA 1HO1A 1F76A 3S8HA 2KZHA 1EUAA 4YCPA 4NJJA 3BO9A 3I6RA 5E93A 4E38A 5KTLA 1S5WA 4M7TA 3W87A 4NJIA 4GBUA 4LS2A 1LRQA 2DZVA 2ATMA 1FUYA 3S1XA 3L2IA 3ABOA 2ZRVA 4N9BA 3DHDA 3NQVA 4HNTA 3P74A 3P81A 3WK1A 3NPVA 1TCDA 4UTTA 3GAYA 1LOLA 3Q2DA 3M5VA 3GIYA 2GUUA 1YDNA 4NXKA 5DCEA 3LHUA 2ABBA 2E09A 4Z0SA 3L67A 2NWRA 5DCBA 1VHCA 5C5YA 2VFHA 1W8SA 2FPTA 3FEMA 1JCYA 4AHPA 3EWZA 4P61A 1F05A 4IMCA 4PEKA 3CTLA 2C3ZA 3UQNA 2E5BA 3A21A 4GWEA 3DFOA 1I2NA 1VYRA 3O15A 2RDWA 5CZSA 1YADA 3NPXA 1SSDA 1BWKA 3PUDA 5G4EA 2ISSA 4FF7A 1BWLA 3BGGA 1TIMA 3QF0A 1DHPA 2FQIA 3TJXA 1JUKA 4RR4A 3MW7A 1J4EA 4C1KA 4JY8A 2CLOA 5KINA 2VFEA 2X30A 5AFDA 1BTMA 3GX9A 3NAVA 3ZS4A 1RD5A 3O06A 3OVRA 3TC7A 1WX0A 3IVUA 4TU1A 1YTKA 1YXCA 4A2RA 3G1HA 1OFAA 4OT7A 3QEZA 3BG3A 2VC6A 4LV9A 4O53A 1WA3A 5D02A 2PCQA 3TW6A 1VCGA 3P8IA 3W7IA 1GVFA 3C2EA 2YFNA 2IQTA 5IBXA 3S6DA 3SGUA 2Z0IA 3HG3A 4LC6A 3FOKA 3WJSA 3IEBA 1ZAJA 1N8FA 3B0PA 5CPOA 4NXSA 1FY6A 3IIVA 3K30A 4EF9A 1JCNA 2J88A 3M5XA 1R47A 3UYCA 4X2RA 3JRKA 1P0NA 2E5DA 2QAPA 3RLVA 4FXSA 1H60A 4LTSA 4MYXA 3L0GA 3SECA 1MEWA 3EXTA 4LRTA 5BOOA 3MP5A 5FEXA 1OF8A 1QPQA 4Y9AA 3L5LA 1F74A 2B7QA 4L4MA 3QMTA 5LNWA 3UWZA 4U28A 1ICQA 1YDOA 3EX2A 3EB2A 2W6RA 1WBHA 3W2LA 5F4XA 3I7SA 1HUVA 2YW3A 2V0TA 1ICSA 2Y70A 3W70A 4OGZA 1SO6A 3LHTA 4WXYA 1X1OA 3BW4A 3P5ZA 4UFIA 3QFEA 4CNNA 4GUFA 4YWIA 3E12A 4LS1A 3ABRA 4O0ZA 4RCXA 1GT8A 3PC0A 3STCA 3MI2A 1F6KA 1F6PA 1THFD 4ZQRA 1EP1A 4BFAA 1EPXA 2BWGA 4UTKA 3R5EA 3LHZA 4MY8A 1GEQA 5C6MA 3UXDA 3TW7A 2JKPA 1KM1A 5EY5A 2CLEA 4UIOA 3M5YA 1WDWA 2YZRA 3GXPA 1ZJIA 1X8FA 3N9SA 5DCDA 2CU0A 5E1QA 4PC8A 4HPXA 4LY8A 1DBTA 1QDSA 1TYGA 4RV8A 1G7VA 3LLFA 2E6AA 1B4EA 1VR6A 5DXYA 1O4UA 2C6QA 4AMAA 4CCDA 4BWLC 2ZZ7A 3NZ1A 4ICNA 3HMJG 2HMCA 3NQCA 1SO3A 3DFSA 3NL6A 3GLCA 4MZ1A 2O7SA 4RJEA 3R12A 1WOBA 4JD4A 4RLIA 4TMCA 3LI0A 1QPOA 2Y63A 3TDFA 2E68A 4IMGA 4WXZA 4JGDA 5AHFA 1JRBA 1LRNA 2WSYA 3BW2A 3LXCA 1GJPA 2WSRA 3JR2A 2F84A 1XL9A 1YYAA 1X7FA 2V8ZA 2A21A 1D3GA 1QWGA 3HQ1A 1GTEA 2QJIA 5BMWA 1FWTA 4I7UA 4UTLA 2Q3RA 4LNYA 2Y85A 4MZ8A 4MY1A 3LCGA 5H2ZA 4FO4A 4RXFA 1XBVA 1W5QA 5LGZA 1TV5A 2GJNA 4O4VA 3DFQA 3GYEA 2A6LA 2FFCA 3CPRA 4OHQA 1R46A 1YXYA 3G1SA 1YPFA 1LM1A 1IXPA 1VCFA 1OG0A 3M44A 2QAFA 4QSHA 5BNKA 3DXIA 1SFLA 5G2IA 4M6QA 4QNEA 2LLEA 1SU5A 1W37A 4JYDA 3RU6A 4ZQCA 1S5TA 3TAKA 3W7CA 1KW1A 4HHPA 5HINA 3W88A 1DQXA 5CZTA 4N4PA 1RPXA 4YLWA 3NQDA 2WJZA 4LUIA 4FB7A 2XN2A 3LRMA 4OV4A 3TC6A 1Q6OA 2R14A 3PM6A 2TYSA 4PL1A 4FNUA 2BXVA 4O50A 5AHIA 4ALDA 5DBTA 3FFSA 4LOCA 3I7RA 3W7JA 5LNUA 1TTQA 3G24A 4N6FA 1R2TA 4K8EA 5K2ZA 1VJIA 2QCNA 3PB2A 3PSVA 1K03A 1Q3NA 4MZYA 3MMTA 2BZNA 3EXRA 4S2CA 1ME8A 4NJGA 5E0KA 1L6YA 1RZMA 3T44A 1Z42A 4MJMA 4UTTC 2H8XA 5DY2A 2E6FA 5LNRA 2QCLA 1W5NA 4WOZA 1H1ZA 1KM4A 3N3MA 5I3HA 3DFTA 2XN0A 2X1RA 2Y62A 3W1RA 4LS0A 1WV2A 1YDVA 4I7WA 4YL2A 5EMUA 1O95A 3LB0A 1EP2A 3LCXA 3NL5A 3LHYA 4IQLA 5CG7A 2YCEA 4Y96A 1G67A 1TPH1 1OFOA 1KLYA 1V7YA 3B8DA 3CM4A 4P2VA 5DBUA 4JTSA 3NQ7A 1ML1A 5I3GA 5AC7A 4GUGA 1J2WA 3SR7A 1K7EA 1ONRA 1LLZA 1A5AA 1AL7A 2GVLA 2VOMA 3VCRA 3G1VA 3BPWA 4IXHA 3DZ1A 5FF4A 3SI9A 2CLMA 2H6RA 4DELA 3W83A 4LVBA 3L68A 3NQEA 3TXVA 3PSWA 3I65A 3A5VA 3LI1A 1W5PA 3S1VA 5KZDA 3NOEA 4IJBA 2ZA3A 2ALDA 3G0XA 3KVMA 3KAOA 1PV8A 3HG4A 3IIOA 1B3OA 1IXOA 2PC4A 5HWJA 1XI3A 2ZCGA 3TUUA 1VRDA 5BMXA 3R2GA 5CPMA 1UJPA 4Y8FA 5G2HA 3QSRA 4BI6A 1KTCA 4MYAA 4O15A 4UMCA 2YYTA 3LCFA 3F1QA 3CQ0A 3L0KA 1VHNA 1SW0A 3Q37A 1SSGA 1LLWA 3FA5A 4UNKA 1Z44A 1PCKA 1L9WA 1EIXA 3M16A 4KFNA 3W1QA 1UB3A 1S3HA 1OVDA 3GNNA 2OT0A 3HGJA 4O1BA 3M9YA 2DJXA 3WK0A 5LGXA 5HWMA 1EP3A 4H3DA 3G1FA 4A21A 1DL3A 3G1DA 5K7JA 4M6PA 2ATSA 4H4IA 3W7OA 1FDZA 2NXGA 1W54A 4LU0A 3PBVA 3PBWA 4HNUA 3LXBA 5F1VA 3S5ZA 2VFIA 1KLZA 2ZZ2A 3EWWA 2QCHA 2I1OA 1F5ZA 4JICA 5C55A 1RR2A 2CFFA 4EF8A 2FIQA 3PUOA 4K38A 1LOQA 1SZNA 7TIMA 1MZHA 3DBPA 4LT9A 1QFEA 4JTTA 3V1PA 1RQEA 1EX5A 3NGJA 2CZEA 4RX0A 3UD6A 4DO6A 4GUJA 1GQNA 2ZZ4A 2VEPA 1MSSA 3UPBA 4NJKA 2G5WA 3ZWSA 5LHFA 2H8ZA 1TPFA 3SZ8A 3PBUA 2GPTA 1VPXA 3LCWA 2CZ5A 1W31A 2RKXA 2XFWA 4KFOA 1O5KA 1WBJA 2HTMA 3IGXA 3KRUA 5D33A 1WYIA 5FESA 3CT7A 3W1PA 1OFBA 1RVGA 4JXCA 4QQ3A 5BRBA 5TQLA 4Z1CA 1D9EA 3W1UA 2V2HA 2VENA 1JCXA 5G1TA 1ZALA 1DV7A 2EGZA 4DPQA 2QDHA 3CIXA 5KZMA 2RHGA 4N9CA 4UUIA 3PG8A 3UWYA 1JULA 1IIHA 4M19A 3M41A 4WOQA 3UY8A 2HS8A 2ZRWA 2FLIA 4UTWA 3G18A 4K39A 3W7KA 2YX0A 2CLFA 3MYOA 1A5SA 3C52A 5U4NA 1LOSA 5HNRA 4L4LA 4X9SA 4A3UA 4IMDA 2G97A 5AHEA 4H6KA 3E96A 4UTJA 1LRTA 1AG1O 1GVQA 3C2RA 4WUIA 3LCLA 4IMEA 4TIMA 5F2GA 4W9TA 3SSJA 3W23A 4CQ8A 4NQ1A 1TPB1 5LNSA 1IXQA 4UNLA 3UPWA 1NAL1 1VYPX 3TIMA 2ABAA 3FJLA 3NNTA 4CNPA 3UWQA 4LV4A 4PL2A 4JDYA 5AN7A 3B06A 2JGQA 4JS3A 4KFPA 3DU0A 3TFXA 3STGA 1GPWA 3G1XA 2A1YA 1VLWA 1RQBA 4JTHA 1N55A 1FXPA 5CPNA 3W1MA 5FI8A 3TK7A 5EPDA 3M0ZA 1XC4A 4NX5A 4HT3A 3INPA 1PVNA 1FWNA 1SFJA 2VKZG 3W1LA 1A53A 2QDGA 1SO5A 2A6NA 2C14A 1OFRA 4XTDA 2Q3OA 5K9DA 2DP3A 3LRKA 4Q33A 2J9XA 1KTNA 4R33A 1R2RA 2E5CA 3FYPA 3G8EA 4LVAA 1TPDA 2QCMA 1W5OA 2NXIA 3MI6A 3W73A 1RQHA 4Q4KA 2DZTA 2ZZ5A 1WQ5A 2B7PA 4HKPA 1SQ7A 3HB9A 1W56A 3VE7A 4JTUA 1I8JA 4LW7A 1TRDA 3P60A 2Y6ZA 3WJXA 1KTBA 5AHNA 5LSMA 2QCCA 3O1NA 4UR8A 4DO5A 1F2JA 3BV4A 3R13A 4O12A 3O6DA 1NFBA 3H54A 3E0IA 1R30A 5HQEA 4Y6GA 1TQJA 3GKFA 3PY2A 5GVJA 1ALDA 1I4NA 3A5FA 3W76A 4RXGA 3I7QA 4K7VA 3FIGA 3C61A 4N4QA 5CZ0A 4WX2A 3DH7A 1AW1A 1GYLA 1TPC1 3PBYA 2CLKA 2BTMA 3EWYA 4MPQA 2OJPA 4O4WA 4N02A 4BR1A 2WNQA 2ZQ0A 5MHBA 1XDMA 4CQ9A 1XBZA 5D38A 3TSDA 5D09A 4FX6M 2J27A 4N6EA 3DFNA 1YLVA 2Y7FA 3W7GA 1FBAA 4XZ9A 1VH7A 3G0SA 3HF3A 1OJXA 4N9EA 4UMAA 5EL1A 3TNOA 2Q8ZA 1TMHA 2GQ9A 1WOAA 1JQVA 4RZ4A 2FPYA 1FCQA 3S5NA 3TU9A 1KFBA 1UCWA 2DZPA 3VKJA 4XKYA 2Z6IA 4AH7A 2JK2A 3B05A 2WSQA 1KA9F 2YW4A 3VI2A 1H1YA 1XCFA 3MJYA 5AB3A 3STEA 1Y0EA 5AC6A 1I2QA 3OVQA 5F1UA 2ISWA 4LWWA 1FDJA 5AHMA 5CSSA 1DORA 3PAJA 3ZWTA 2ZZ1A 3FLUA 1I2RA 3TV8A 2VEMA 2RFGA 3U6WA 4C1LA 2X1TA 3SGZA 1G6CA 4S2BA 3W7NA 4E2DA 3TROA 3W9ZA 4UMBA 1JUBA 1FCVA 2E1DA 1HTIA 1VLIA 1PHWA 3T78A 1KM6A 3HGRA 5K4ZA 3BK0A 1JCMP 3P80A 3LM7A 1W3TA 4EWND 4Z08A 4JIQA 2A0NA 3N73A 4O17A 5HMSA 2ZYFA 5FF7A 3T4CA 1NF0A 1VZWA 1EA0A 4X3ZA 1FDYA 1TTPA 3GNDA 1M5WA 3N2MA 1IGSA 2ZBTA 3UWUA 1GG0A 2CW6A 2ZZ3A 2TMDA 3KOFA 1FWWA 5DLCA 1NVMA 3W1XA 3C4UA 4AAJA 1IF2A 2WPBA 3F4WA 3NXFA 5D32A 2J9YA 2VXNA 3G1YA 1TRIA 1J5TA 4JTJA 2FDSA 3ATZA 2ZZ6A 3MP3A 5D04C 2HS6A 3C2VA 2WKJA 4WQ6A 2QUVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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