2ZTJA

Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with alpha-ketoglutarate
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
320
structure length
312
Chain Sequence
MREWKIIDSTLREGEQFEKANFSTQDKVEIAKALDEFGIEYIEVTTPVASPQSRKDAEVLASLGLKAKVVTHIQCRLDAAKVAVETGVQGIDLLFGTGRDIPRIIEEAKEVIAYIREAAPHVEVRFSAEDTFRSEEQDLLAVYEAVAPYVDRVGLADTVGVATPRQVYALVREVRRVVGPRVDIEFHGHNDTGCAIANAYEAIEAGATHVDTTILGIGERNGITPLGGFLARMYTLQPEYVRRKYKLEMLPELDRMVARMVGVEIPFNNYITGETAFSHKAGMHLKAIYINPEAYEPYPPEVFGVKRKLIIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Homocitrate synthase
publication title Mechanism of substrate recognition and insight into feedback inhibition of homocitrate synthase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 117
structure length 312
sequence length 320
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2008-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ztjA01
2E68A 3RLVA 4BWLC 1PVNA 3TH6A 4K6AA 1I45A 3H55A 5HUOA 2TRSA 3LI0A 1H50A 1LYXA 3BG3A 3GDMA 2FLIA 3UWUA 2QKFA 4TO8A 2QCLA 4FX7A 5D2VA 1AL8A 1RR2A 4LT9A 3VFLA 3Q2DA 3MP3A 2W79A 1A50A 2H90A 3NL2A 3CIWA 4X9SA 2DZVA 2R91A 2C19A 3TMLA 1WBHA 1WYIA 3LX9A 4GRSA 3PB0A 5MHBA 3NL5A 4WOZA 2C18A 3TW7A 1T8XA 3M1ZA 1A53A 2J9YA 1UBSA 3UPBA 1VGAA 3P81A 3OBKA 4MIMA 4LUJA 4UFJA 3MBFA 3QPYA 1TRIA 2QCDA 1UJPA 3CWNA 4ZQPA 4M7SA 4FX8A 1QDSA 3ZR4A 3PM6A 4AXKA 3HO8A 1LBLA 3MHGA 1BWKA 4O18A 3WJZA 2J9XA 4OT7A 2RFGA 2A7NA 1XM3A 2EF9A 3P80A 3PWAA 1L6YA 3M5VA 1TSIA 4GJ1A 2WNQA 3MP4A 4UNKA 3S6DA 3TK7A 3IEBA 3MI3A 1E51A 4A29A 5G5IA 3ZWTA 2QDHA 4HPXA 5I3KA 3F1QA 3EXSA 3I7SA 4DF0A 1GVQA 1Z44A 2A7RA 3BLEA 3O16A 1DBTA 3KOFA 4NVTA 3M16A 3MI6A 1QFEA 4ZZ9A 1T96A 1W5OA 3W87A 4JYFA 2Q3OA 1EPXA 1YDNA 1OFOA 1TIMA 5HQEA 4YWIA 3ZFHA 5G2IA 3EWUA 2WNZA 3TE9A 4S2BA 1O4UA 4UFLA 2VXNA 2TPSA 1LP6A 3HPSA 5F1UA 4UFMA 1FDZA 3KAOA 3W88A 3QC3A 1FWTA 3A5VA 1U5JA 1C8VA 1Z41A 5EMUA 3FOKA 3MHFA 3FYPA 3NGJA 3G22A 1WQ5A 5CSSA 3R13A 1B4EA 3DKLA 3UY8A 4UTLA 4DF2A 2OJPA 3C6CA 3P5ZA 4NT0A 5E0KA 2ZZ5A 2F7FA 1KM1A 2CLHA 2QF7A 2XN2A 3BV4A 3QZEA 5EL1A 3TXZA 4FIRA 4GUJA 4HSNA 4UMBA 3USBA 2ZA2A 2QAPA 3G8RA 1H7RA 1PV8A 3G1DA 4DBEA 3M0ZA 4M6QA 2X1TA 4NZFA 3QH2A 4XZ9A 5DBTA 4NXKA 1K7XA 2RHGA 4LOCA 3LRMA 4IX0A 1BKSA 5EKYA 3R2GA 1Q45A 1XBVA 3NL3A 3PBVA 3MHUA 2JGQA 4E2BA 1TQXA 1NFBA 2FJKA 4JTLA 4D2JA 5AOUA 4LC6A 4MZ1A 4EOUA 3OVPA 4I7UA 3TQ0A 5CGQA 1H1YA 4JNMA 1YPIA 1ADOA 3S1WA 4IMEA 3NPWA 3AO0A 1CX9A 5DY3A 3SECA 1KFKA 3V1PA 3W1RA 3B03A 4O54A 3W1QA 1YPFA 4MJZA 1Q6QA 1V7YA 1QR7A 4JY8A 3EX6A 4O16A 5U4NA 3RMJA 1J5TA 4IUOA 1I8JA 4A22A 3E9AA 7TIMA 5G1TA 1T0OA 1XL9A 4JTFA 2QJGA 3N19B 3BVJA 1AG1O 1HO4A 1XI3A 3WK0A 4FO4A 4WZHA 6TIMA 2ZQ0A 3A21A 3GDLA 3GDTA 1SFLA 5FF7A 4UFHA 1XFBA 1Q6OA 2ISVA 3LI1A 5AHNA 1GOXA 1OX4B 3DI1A 3P5YA 2V82A 1H51A 4NX5A 4O28A 1XBYA 3NM3A 4HNUA 3A9IA 1R30A 3KFTA 3MO7A 4O1BA 1PHQA 3TC6A 3IIXA 3CTLA 4A2RA 1SZGA 3DKJA 3DAQA 1I2PA 4O14A 4DBDA 3N73A 1RZMA 3W7MA 1D3HA 3LHUA 3G3MA 4O1CA 2QDGA 4Y8FA 1SFJA 3H53A 3NQEA 3W2JA 1O94A 1RQBA 3Q58A 4WJEA 3B0PA 1KM0A 4PL2A 2DZSA 3LCWA 1KA9F 4BR1A 5LGZA 1LTDA 4DPPA 3NO5A 4WXYA 1KBJA 5FF2A 2A85A 3I68A 3N34A 4X3ZA 1F2JA 4OBTA 3KRZA 3W3OA 3IIOA 1OABA 3L5MA 3BW3A 2Z6IA 3LV5A 3HMJG 2X2GA 3ANYA 3MMTA 4LV9A 1VYRA 4IMGA 2E6FA 1C29A 1KFCA 2J9ZA 4NJGA 3HG2A 3IVSA 4HHPA 1XUZA 2VFDA 4O11A 1KFEA 1ZJIA 4UC5A 3IGSA 2Q3RA 3GR7A 5DLCA 1TPDA 3GKFA 3GX9A 4Z1AA 3T44A 2D73A 1Z42A 1DOSA 4HNTA 4AEOA 2H8XA 5AYYA 4UFIA 3G24A 1QNVA 4O0ZA 4CNOA 1JCYA 3LV6A 5TQLA 3LHWA 2HS6A 4EF8A 4FF7A 5J5RA 3W70A 4LWWA 4YCOA 4RCXA 1OYBA 3NQCA 5CSRA 3OIXA 1GPWA 2WNNA 1TMHA 2GJLA 2Y7EA 4AHQA 1IXNA 1EP1A 3NYZA 3T40A 3HQ1A 1G4EA 4FNTA 1DORA 4UNLA 3PF3A 2ZZ4A 3NPUA 1LZOA 4LVDA 4O4VA 3WJYA 3NQ8A 4UTTC 2O7QA 4OV4A 3TXVA 1KV5A 1SW3A 1W31A 1GVRA 4OHQA 4BI7A 4FNQA 1L6WA 4NX0A 1FBAA 1IXOA 1JCNA 4MUZA 3QEZA 3STFA 3E0IA 3L0KA 4NJHA 4CCEA 4NJJA 3GKAA 2CW6A 3BK0A 1F5ZA 2RDWA 1SSGA 1H61A 4PFMA 3R89A 1X6UA 4NJKA 3DZ1A 1P0KA 4IXHA 4DO5A 4RLIA 3M44A 4BK9A 4KWVA 2ZRXA 4EIVA 3NDOA 3LB0A 5DELA 5DXYA 4QQ3A 2ZA1A 3THQA 5G4WA 3P67A 3W1AA 3RLUA 5D02A 4AWTA 1UUOA 4LTSA 3W7JA 2DORA 3FFSA 4JTUA 4XBSA 2ZZ1A 2EPHA 4N2YA 3HGOA 2FFCA 2FB2A 3VI2A 2CWNA 3IRDA 4UFKA 4H4IA 3FS2A 3I6RA 4N4PA 3W23A 4CQ9A 1KLYA 1ICPA 4K7YA 1P5BA 2NZLA 3LCGA 2VFHA 1KFLA 5LNSA 5H91A 4GE8A 2Y88A 2Y7FA 2WSYA 3B4UA 2DP3A 4GNJA 4HNNA 2YW4A 1JUKA 1HO1A 5G2WA 3DENA 3UWQA 1OX6A 1ONRA 4FHAA 8TIMA 4MZYA 4XTIA 3RK8A 3W7NA 3S5YA 1GYNA 3NQ7A 5CKSA 3H54A 3CT7A 3I7QA 2V5BA 1KLZA 4POCA 1GQNA 3I7RA 4UR7A 5K4XA 4LRSA 4JN6A 5AHMA 3PBYA 1R47A 4E2DA 2Z0IA 5AYZA 2B7PA 2Y62A 5KSWA 4LU0A 2QCEA 4LVBA 3STCA 2GVLA 1TJPA 1QPOA 5SWUA 3LLFA 1YDOA 4A21A 1HTIA 3GYEA 3OVRA 3ATYA 3IGXA 3LLDA 4MLJA 4P61A 3M43A 3HG4A 3QMSA 2YZRA 3W9ZA 1S5WA 2CZFA 5BOOA 3L65A 1PIIA 3O8AA 2BLEA 1BEUA 3N2XA 1TPVA 3FIGA 2JBMA 1ZHAA 4MFDA 1PCKA 4TIMA 2FDSA 4Y6GA 4UTHA 1GVSA 1TREA 1JJKA 2QJIA 2QEZA 4Z1BA 1OJXA 3TNOA 1TQJA 5CZ0A 2JGYA 2WOQA 2PRMA 5F2LA 4ZQMA 1ME9A 3EXRA 3IV3A 5D05A 1NEYA 2AGKA 5LNVA 3SGUA 4N6FA 3HIJA 1GVFA 1S5VA 1AL7A 4RXGA 2GQ9A 4ALDA 1WAUA 4Z1CA 4LRTA 5K4ZA 1EX5A 1VCVA 2P10A 3WFAA 2ZYFA 3C0JA 1W3IA 2O7SA 4FNRA 1G4SA 2A5HA 1LDCA 3LBCA 1F6PA 5HR6A 2CZDA 3TIMA 3S42A 6ALDA 1H62A 4AWUA 5DCDA 5FEZA 1YTDA 4YLWA 4IPJA 1JUEA 2RDTA 3TMQA 1YXYA 3LCXA 3NOEA 5FF0A 3BO9A 3EX4A 4OU1A 3C2FA 1G7VA 3W7DA 4AF0A 3KHJA 3RF9A 2LLEA 3HOJA 3UWVA 1TTIA 3T78A 4PH6A 3JRKA 2GVGA 3HPXA 2E1DA 5CZJA 3DFQA 3LHTA 1LORA 1VLWA 1FCQA 2Z2UA 3NPXA 3O63A 4FNUA 1ICQA 3THAA 1H1ZA 1F73A 1DVJA 2TYSA 3CIXA 2QCDB 5AB3A 1B3OA 2NWSA 3MYPA 4NNAA 1W1ZA 4DF1A 3G1FA 3KX6A 3W74A 1SR9A 2B7QA 1FXPA 3KRSA 4JEQA 3UYCA 1FY6A 2C6QA 3ABSA 1GT8A 1ZENA 1O5KA 2NX3A 2ABAA 1WA3A 1MXSA 3ATZA 4ZQOA 4N02A 2WKJA 3TW6A 1YXDA 2YFOA 3S0CA 3LCLA 1D3GA 1JCJA 5DXXA 4Y90A 1K7FA 3GB6A 1TV7A 4NUWA 4IPIA 4EWND 5F2MA 1FDJA 1ZAHA 5EPDA 4R34A 3TUUA 4N9EA 2GQAA 1THFD 3TU9A 4H6KA 3MWAA 3B04A 3MBDA 3P74A 4NZJA 4LVAA 5AHLA 3IVUA 4JTHA 3ZWSA 2Y7DA 4MKNA 4N9BA 3NA8A 5K2ZA 4DO4A 5AHEA 3SSJA 1GTHA 5AC6A 5C5YA 3P60A 4O19A 1MZHA 3LOTA 3TROA 3DU0A 4JIQA 4YL2A 4WX2A 3S5OA 2BX7A 2VENA 2JKPA 3MW7A 3W1NA 5F1VA 4N4QA 2NLIA 2X1RA 4OGZA 4IOTA 4FIQA 2VFEA 4LUIA 1S3HA 1W5PA 3W7IA 1VPXA 1ALDA 1LLZA 2VEKA 2FPYA 3DI0A 1NSJA 3SZ8A 3C2VA 1S5TA 2C15A 2E6AA 2OX1A 3W1PA 4Z0SA 2DJLA 4O15A 2PCQA 4UTKA 1OYCA 1XUUA 3W86A 3G0XA 1VS1A 2G5WA 1LOSA 2R8WA 4ORIA 1XDLA 3W22A 3W2LA 2XFWA 1XDMA 3IVTA 4RKAA 5I3HA 5DN1A 4ZQCA 5FF4A 3CWOX 1LBMA 1SO6A 1SO4A 4QISA 2G95A 4K8HA 4CQAA 5KITA 2DZWA 1GJPA 3FKRA 4K39A 4QJ1A 1JCXA 1RPXA 3E02A 3CHVA 2QUTA 5U7SA 4K8EA 4LVFA 3FLUA 1K8YA 3S9YA 3QYQA 3U2OA 4LC8A 4IMCA 4UTWC 3LRKA 2DU2A 4RXFA 4B5NA 1DL3A 3L5LA 3NQVA 3LXCA 4JICA 3T7VA 4YCPA 1EA0A 1GTEA 4QITA 3SFKA 2E6YA 4H3DA 3OVQA 3KXQA 1W54A 3UQNA 1XXXA 5EBUA 1M7OA 3BGGA 5F4WA 4AMAA 1QAPA 1EB3A 3C3NA 4O8RA 3P84A 3S5ZA 1TPWA 5AC8A 1O60A 1DJNA 4S2CA 4MYXA 1M7PA 1HG3A 3PSWA 4QSHA 3S1XA 5CPLA 4O12A 2ZCGA 1EUNA 2A6LA 2H6RA 4TMBA 5LZLA 2ABBA 4AHPA 4LY8A 1K03A 1WX0A 1ZY9A 3UNDA 3P7YA 5IBXA 3WJSA 1TJRA 3UXAA 1P1XA 4AB4A 3R12A 2X1UA 4DXVA 2PE4A 2BZNA 2HTMA 4IQLA 4NU7A 1TPFA 1SO5A 3DXIA 1W5MA 2E5CA 2VELA 3G1VA 3SR7A 3UZJA 3D0CA 3P8JA 3DFTA 1NVMA 4JYEA 3BPWA 2FQIA 1G6CA 4K36A 5F2IA 3NEVA 2Q8LA 1QPQA 1IXPA 2P0OA 1HL2A 1T99A 4WD0A 3TSDA 2E6DA 5AYXA 4NXSA 4WOQA 3F4NA 3QSTA 3SW6A 3VE9A 3NL6A 4ML9A 5EY5A 3N14A 3N9SA 4FX6M 2I1OA 4CCCA 4UTUA 1ZNNA 2CLFA 2ZDRA 3LCHA 4HIBA 3ABRA 2V9DA 4KFNA 4IX2A 1QO5A 3SY5A 4CNPA 4K37A 3G1AA 4O10A 5DY2A 4MJMA 1O5XA 1N8FA 2NXHA 1VHCA 5AHFA 1J4EA 3IIZA 3L67A 4I7WA 3C8FA 2X16A 1ZCOA 4GUIA 4ZL1A 4MFEA 4QIUA 3EWWA 3EX1A 3NXFA 3W6YA 2C3ZA 5LHFA 4IXXA 1VLIA 2UV8G 1AK5A 3LCIA 2X30A 2HS8A 2NV2A 3EWYA 2GVJA 3GXTA 1K02A 1FCVA 1YTKA 2NXIA 3WJWA 5CPOA 3L5AA 3LERA 4XBKA 2J88A 5HINA 2Y85A 1ML1A 3OA3A 1TO3A 1MEWA 3S5NA 5D32A 5C2XA 4YMZA 5HWNA 1OX5A 3GLCA 2QCNA 3S1UA 2R14A 4IJBA 4O52A 4ADSA 3NR0A 4IGHA 1RQHA 5ABTA 3LRLA 1EIXA 1TTJA 2E09A 3EWZA 2OT1A 4PC8A 3P82A 1R2TA 3KVMA 1PL9A 5CPMA 3M47A 5LNUA 1XKYA 2B0MA 1SZEA 3DBPA 5TIMA 4FNPA 2AQWA 1JQVA 2YXGA 3BG9A 5BW6A 3EWXA 4UTTA 3QFEA 3GVGA 3W7EA 2AAMA 3W2UA 1TPH1 1LRTA 1KBIA 3UD6A 1Z48A 2ISSA 4LNYA 4MLRA 2ZZ2A 2ZFAA 4UTJA 2ZRWA 2G96A 1ZALA 4RZ4A 4AVFA 1OFAA 1WBJA 2Z1BA 2YYTA 1CW2A 3L2IA 1H7XA 5KTLA 1SU5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1Q66 A;  3UJS A;  3P3B A;  4GZE A;  3TH6 A;  4WJ8 A;  1I45 A;  3H55 A;  4HTB A;  4RPQ A;  2TRS A;  3LI0 A;  3EOE A;  2VR2 A;  2FLI A;  3AHT A;  3GFY A;  2QKF A;  1V93 A;  4O1E A;  5D2V A;  3Q65 A;  1AL8 A;  2W79 A;  1UD5 A;  2H90 A;  3GSM A;  3NL2 A;  1EZ2 A;  3PBG A;  4X9Y A;  2XM1 A;  3TML A;  1WBH A;  1WYI A;  4XD3 A;  4BQ2 A;  1VF8 A;  5MHB A;  3DYO A;  1J5S A;  1K4H A;  1XD0 A;  4KW2 A;  1IGW A;  2XZ9 A;  4RV3 A;  1I9C B;  3UPB A;  5M3W A;  4BS0 A;  2YCK X;  2J8G A;  5IXE A;  4LUJ A;  3MBF A;  4BEQ A;  1AH3 A;  4FS9 A;  1FVP A;  4ZQP A;  4M7S A;  3ZR4 A;  5H8P A;  4AXK A;  1JDD A;  2PWF A;  2J9X A;  1AH4 A;  4B5V A;  1HJX A;  3AJ7 A;  2RFG A;  3D5H A;  1F3T A;  3AFB A;  2WHM A;  2WMJ A;  1L6Y A;  4NAF A;  5EMY A;  3RYS A;  5MKG B;  3AHZ A;  4C6D A;  4LYR A;  3TK7 A;  3XIN A;  1UZD A;  2QDH A;  4HPX A;  3I7S A;  3WLM A;  4LB4 A;  2J75 A;  1Z44 A;  3ARY A;  4IIE A;  1B1Y A;  1X39 A;  2XVN A;  1BTC A;  2PLK A;  1H5V A;  4Q6X A;  1W5O A;  1UOK A;  3WBY A;  4IP7 A;  2Q3O A;  3WH9 A;  1TIM A; 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 2ACU A;  1CXI A;  3N19 B;  2BDQ A;  1CBG A;  3W01 A;  3BVJ A;  1AG1 O;  1HO4 A;  4FO4 A;  3A21 A;  1SFL A;  1IZC A;  4U3A A;  3ZST A;  1XFB A;  3GRI A;  4FMV A;  4BCE A;  2ISV A;  3LI1 A;  4I5R A;  3DI1 A;  1DIE A;  4NX5 A;  1XBY A;  3IWP A;  4ERG A;  4HNU A;  4KCT A;  3ITL A;  1UH2 A;  1B31 A;  5XIA A;  4AST A;  3ARS A;  1I2P A;  4HA4 A;  3N73 A;  1D3H A;  3LHU A;  2GSE A;  2WQD A;  3FYY A;  1O94 A;  1RQB A;  3Q58 A;  3VNM A;  2VOT A;  5AC4 A;  1KM0 A;  3LCW A;  1S2W A;  5LGZ A;  4PSR A;  1PTD A;  3AC0 A;  4J3S A;  5LIU X;  3M0Y A;  4DPP A;  1S2U A;  3NO5 A;  2ALR A;  3A12 A;  1LQ2 A;  1GOO A;  1WDR A;  3PZ9 A;  4X3Z A;  2W9M A;  4PMJ A;  3SQL A;  4DWD A;  3M6D A;  3SQM A;  1CIU A;  3B8U A;  3TVA A;  3L5M A;  3LA4 A;  2E8Y A;  4DXX A;  2X2G A;  3ANY A;  4LV9 A;  4KT2 A;  1C29 A;  1XLK A;  4IJC A;  4QRN A;  3R0U A;  3GE7 A;  1XUZ A;  3KWS A;  2VFD A;  4CU6 A;  4JTC A;  1ZJI A;  4P8V A;  4UC5 A;  3CUJ A;  2BG5 A;  1GOM A;  2P8B A;  2QNE A;  1RVK A;  1S1R A;  1DHK A;  3UGR A;  4UFI A;  2P76 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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