4QM1 | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	357
structure length	337
Chain Sequence	FQSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLVQIT

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title	Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase with an Internal Deletion of the CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with inhibitor D67 rcsb
source organism	Bacillus anthracis
total genus	94
structure length	337
sequence length	357
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2014-06-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4qm1A00

3UWQA 1W56A 5D2TA 3TK7A 2XN1A 3IVSA 4S1FA 5GVJA 3VFLA 4C1KA 1V7YA 4L4LA 3Q94A 1GVRA 1QMLA 2YYTA 1EX5A 3EXSA 3P5ZA 3MJYA 3FYOA 1PS9A 5C6MA 2ZA1A 3H53A 4UFIA 5CGQA 3G3MA 4O54A 4Z1DA 3GXTA 4O28A 3DGRA 2DZXA 4A2SA 3EWXA 2Q3RA 1ME9A 1VGAA 4LVFA 2GVLA 1FWRA 1JUBA 4IOTA 2NUYA 2XN2A 4DO4A 2QEZA 1KM2A 5D33A 2UV8G 1OX5A 1RVGA 3BVJA 4C1LA 3QF0A 2P1FA 5LSMA 4FB7A 4M6PA 2GVGA 1BWLA 4FNQA 3W1QA 1KTNA 3GNDA 2PCQA 1YDVA 1VJIA 1VQTA 1WOAA 1JJKA 4MPQA 2YW3A 3MMTA 3W23A 2HS6A 3W84A 1RD5A 2Q8LA 5K9CA 2CU0A 1C8VA 3TCEA 2FIQA 4AXKA 1H51A 3L66A 5FEZA 4WXYA 3HMJG 3WJZA 5LNUA 5DY3A 2X1UA 1I2PA 4Z1CA 4FX6M 4TO8A 3NQVA 3UWZA 2J9YA 3LCLA 1TPEA 3MYOA 3LBCA 3NPVA 2A1YA 5BOOA 2WSQA 3STCA 3PS7A 4RXGA 5HWMA 1TJPA 3EEGA 4JTHA 4Y96A 2P0OA 2E77A 4LOCA 2DZVA 4MLRA 3G1XA 2NWRA 4NJKA 2Z1BA 2C6QA 2QDHA 1OFBA 3UPWA 5DBTA 4K8EA 3HO8A 4JX4A 2NX1A 2NX3A 1AK5A 5HR7A 3L21A 1MEWA 1FX6A 2CWNA 4X9SA 3LCWA 3SY5A 1O5XA 2A7RA 1R2RA 4DF1A 1LOQA 5I3KA 3W74A 2E09A 3F1QA 3B06A 1H7PA 2VEPA 3DFNA 4NT0A 1JCNA 2FPTA 5TIMA 3TAKA 5CZTA 5LHEA 4GRSA 2FTPA 3GXPA 4JS3A 3G3DA 4ZQPA 3BARA 1JRCA 4GJ1A 1QPRA 1GTHA 4WZHA 1K8XA 4BF9A 5FF2A 2VELA 2E5BA 3TSMA 3TC7A 1TPWA 2QJIA 3STFA 3W73A 2Z0IA 1YPFA 4N02A 4MIMA 2V30A 3LHTA 4JTUA 3T7VA 4K39A 5A8GA 1DJQA 1XC4A 1MZHA 3W1LA 3W76A 3VNDA 3DBPA 1W1ZA 2A6LA 5HMSA 1FDJA 1I8JA 1KFCA 3BK0A 3M47A 1QAPA 5DCEA 2WKJA 2AGKA 4XKYB 4MJZA 4JDBA 3DI0A 4UTJA 3TIMA 4W9TA 4ALDA 4K38A 1J4EA 3KHJA 2J24A 1VYRA 1DHPA 1KM1A 2E6FA 1M7OA 4KFOA 3LERA 2AAMA 4A22A 4MLJA 3CIWA 2ZRVA 3WK2A 1TCDA 1ZNNA 5D09A 2Q3OA 4JTGA 5CZSA 1XUZA 2RFGA 4DF0A 4EIVA 5E0KA 1LCOA 4LU0A 3O06A 2FB3A 2W79A 3KX6A 4FNPA 1R47A 5CPMA 3U6WA 3MI3A 1EWDA 2ATMA 2EAWA 2TPSA 3HG4A 2EPHA 1SUXA 3W7OA 4ADSA 1WQ5A 1LDCA 3ZFHA 5D2WA 3E02A 4NUWA 2GPTA 3KVJA 5SWUA 3W7RA 4IMEA 1KM6A 2B0MA 1DORA 5AOUA 4O53A 5DCBA 1XDLA 1THFD 1P0KA 4LVGA 3PM6A 2J9ZA 2V9DA 4UTHA 3O05A 4JTJA 2R14A 1N7KA 5C54A 4OV4A 2ABAA 4YXGA 2G96A 3TH6A 1LBFA 3A23A 1W5OA 3FIGA 3NZ1A 1SO5A 1TTQA 5K3VA 2I9EA 1DQXA 1OX6A 1TTJA 1KV5A 1P4CA 1Y0EA 4IMDA 3PUDA 1H7RA 1CX9A 4K7YA 3ZR4A 3MI2A 4DELA 3I65A 2X2GA 3S42A 3PBWA 3R2GA 4MZ8A 2DU2A 1SFJA 4QJ1A 1AG1O 4DO6A 3HPZA 1NEYA 4UTTA 4JX6A 3ATYA 1KM3A 3W1UA 1JCLA 1E51A 3A21A 4CCCA 4M7TA 3E0IA 3KRZA 4UTIA 4FIRA 4LRTA 2FLIA 3TQ0A 4OGZA 4E2DA 1M7PA 4Y8FA 4GWEA 1LYXA 3TQKA 4JTLA 3HF3A 2A21A 1TMHA 4JXCA 4BR1A 1HL2A 2ZTJA 4LS1A 2E6YA 1EP3A 4O1DA 3N2MA 3GDMA 4IQLA 1TPC1 4HSOA 3JR2A 5K4XA 3LTPA 3BPWA 3I6RA 3PWAA 1ME7A 3B03A 1GZGA 7TIMA 2NX9A 4IPJA 2FFCA 1TRDA 1K8ZA 3A5VA 3PB0A 5TBOA 5HR6A 2YX0A 3T44A 3QH2A 2Y89A 3KFTA 4NJIA 4ORIA 3GKAA 3LHZA 5CPOA 4LS0A 3OVPA 1GPWA 1LLZA 2VFDA 3EX1A 3MP3A 3P62A 4JIQA 1AL7A 5LNWA 1Q45A 3AO0A 4N4QA 2YR1A 4N9CA 3KVLA 3PSWA 4AWUA 4RLIA 3P81A 2TRSA 3EX2A 1Z48A 4FEZA 3GB6A 4E38A 3ANYA 3GAYA 1OF6A 4WJEA 1I4NA 4UTKA 2OJPA 5KZMA 3P5YA 3H55A 3MBFA 1DJNA 2RHGA 4ZVJA 1W8SA 3CB8A 1G69A 3W07A 2FB2A 4EF9A 1OYAA 3FS2A 1HFBA 2YCEA 5FI8A 4JGDA 2A0NA 2NZLA 3HGSA 3VI2A 4IX2A 1L2UA 3CEUA 3ZS4A 4RZ6A 2RDWA 4AMAA 3M9YA 2I1OA 2GUUA 2QDGA 3SIZA 3BG3A 1KTCA 4CNPA 5IM51 1OFPA 3W7CA 1OX4B 1UJPA 3S1XA 5FESA 3QMTA 1WBHA 5BNKA 2YFNA 3RLUA 4LY8A 3NQDA 1SW7A 1G4PA 1IGSA 4JEQA 5ABTA 2ZZ1A 5CSSA 4CQAA 1O60A 3LGEA 3DENA 4CQ8A 4HNUA 4AEOA 4CCEA 1SO6A 2CZEA 2Y62A 2V5LA 1D3HA 1WBJA 1FCQA 3TJXA 2Y88A 1A5AA 5AYYA 3DI1A 2J6XA 1VYSX 3R12A 5L9FA 2Q8ZA 4OWGA 1KM4A 4YLWA 1VYPX 3PG8A 1ME8A 2CLFA 4JY8A 5E1QA 3Q2DA 1C9DA 1Z41A 1OFDA 4RKAA 1FCBA 1LTDA 1W5PA 2QCLA 3NO5A 5DCDA 4AVFA 2V2DA 1PL9A 2FPVA 4PH6A 4O18A 4NQ1A 4BI6A 4LNYA 4HSNA 2ZTKA 3DFOA 4AF0A 3NQ6A 2ZA3A 3EX3A 4I7VA 1JCMP 3LV5A 3B0VC 3LBMA 3LHYA 5EPDA 3UXDA 2QKFA 4A21A 2H3DA 1VR6A 3USBA 3NR0A 3IGSA 1TPVA 4UCGA 5LKYA 4Q4KA 4Y9AA 1KFLA 3W72A 3N34A 4RV8A 4Z08A 2QJGA 2OMAA 3G1AA 4TMCA 3T55A 3V75A 4FIQA 3LCIA 4QQ3A 4PCFA 3I68A 2Y7DA 2VFGA 3C2OA 3UWVA 3TR2A 4YCOA 3W7HA 1OFQA 1PIIA 2C14A 3HIJA 3TMLA 3IIPA 5U7SA 2VFFA 3DKJA 5C55A 2BWGA 4GE8A 4WY0F 3UPBA 3IVTA 4RZ4A 5D37A 5F4SA 4M19A 3O6CA 4JTTA 3STEA 4QM1A 1KFJA 3SI9A 5K4ZA 5F2GA 3NXFA 3LB0A 4JY9A 1O4UA 4NXKA 3W2UA 1M6JA 3NPXA 3L0KA 3B0UX 1GTEA 5F4WA 5F2MA 1XFBA 2C18A 1DQWA 5C2XA 4Q33A 5CPLA 5BW6A 3L68A 3LM7A 4WY0A 2JKEA 4IXHA 4NJJA 5H2ZA 1RQHA 1I45A 3M41A 3PBUA 1GOXA 4XTDA 5LHFA 1ML1A 4I7WA 3QSRA 2QCNA 4TMBA 4LC8A 4IUOA 5DN1A 1TQJA 3EWUA 4LW7A 4RXFA 3S5ZA 1LBMA 1BWKA 3MO7A 4JTKA 4LVDA 3EWZA 4LT9A 4WOZA 1RQBA 3BLIA 3BW3A 4UTTC 3PB2A 3T40A 2BLEA 1VCFA 1F2JA 3WJSA 3JS3A 4R34A 3TC6A 5LNSA 3TUUA 1SO3A 1ZALA 3W7EA 3C4UA 2ZA2A 3PAJA 1DOSA 5LZLA 2EGZA 1L6SA 3EX4A 4H4IA 3BW4A 2ZQ0A 5AC6A 4HKPA 1SW3A 3M5YA 1F6PA 5AHEA 2C3ZA 4IMFA 3IEBA 3O07A 1OABA 3QSTA 5I3JA 4IPIA 1UASA 2G95A 3IIZA 3QC3A 1EIXA 1ZFJA 3CQ0A 4UNLA 5HULA 4Z0SA 1PCWA 3THQA 2CLIA 3DAQA 3TNOA 2VXNA 5A5WA 5CKSA 1GG1A 1OFRA 1JULA 3W1PA 1L9WA 5I3FA 4O19A 4O14A 2NV1A 4X2RA 4HN4A 4UTWA 4DQWA 4O17A 4UMCA 1WXJA 5MHBA 2RKXA 4DPQA 1R30A 3LRKA 3HJZA 4CQ9A 1BEUA 1I2OA 3FYPA 1KV8A 2YDAA 2VFHA 3PBYA 2GJLA 1KFKA 1FCUA 4O0KA 3W7PA 3ABSA 2TSYA 4LC6A 4FHAA 4O52A 2QUUA 4L4MA 4KFNA 1YTEA 3C3NA 3OVRA 4X3ZA 4H3DA 1F7BA 1KBIA 1LOLA 4AWSA 3Q37A 3GIYA 3G8RA 4PODA 5KITA 1K8YA 4HNNA 1LRNA 1PHWA 1W5MA 2DZPA 3GVGA 4KKXA 5G1YA 2JKAA 3KXQA 1A5SA 1YDNA 4GFSA 4JNMA 1YTKA 3KVMA 5AHLA 1G7VA 4K36A 3D0CA 4KFPA 1H50A 3WK0A 2H90A 3NQAA 1X6UA 1GQNA 5G5IA 3QZEA 3F03K 2PC4A 1S5TA 3UWYA 3HPXA 4UMAA 3C2FA 4JDYA 4MFDA 3C2EA 1VZWA 3TW6A 5KMYA 3P84A 3S6DA 4UNKA 3N3MA 4EOUA 1F76A 3NVTA 4MOZA 4UTLA 3W1XA 5KZEA 3L9CA 4PC8A 1OJXA 1ZY9A 1XI3A 3CLMA 1W5NA 1WAUA 2B7NA 4LTSA 4NZJA 2Y70A 3GR8A 3QW4B 2W0UA 2CZDA 3QYQA 1CI1A 1O95A 5T26A 4QSHA 1Q6OA 4DBDA 2R91A 3G1DA 1S3HA 4UMBA 1WYIA 4RZ5A 5HNRA 5KINA 1XDMA 4HT3A 3QM3A 1TSIA 4UIOA 3C52A 1AL8A 3G1YA 3CWNA 1G7UA 4AHQA 2V5BA 1QWGA 5FEPA 4CCDA 1QFEA 1AW5A 4N9BA 1FUYA 1Q3NA 3NQEA 3QPYA 4IMCA 1HTIA 3BV4A 2FJKA 3OA3A 3W1MA 5EA9A 1W0MA 3G18A 3PUEA 3IV3A 3QPZA 3AJXA 2B7PA 2ALDA 3LOTA 3S1UA 3MW7A 4UFKA 2A5HA 1JQVA 2A6NA 1UUMA 4O16A 5D32A 2ZZ2A 3QMSA 3W9ZA 3FJLA 3RFAA 4IGHA 3WJYA 3DHDA 5FEXA 5DELA 3MI6A 1H1ZA 1MEHA 1K7XA 3ABQA 3LXBA 1QDSA 1W31A 2A7NA 3P60A 4CNNA 5KTLA 1GG0A 3NEVA 1JVNA 5AHMA 1EWEA 3UZ5A 3ELFA 5EYWA 5HWJA 2XN0A 1SSDA 5K9DA 3UWWA 4UFMA 5F2LA 4FNTA 1SZEA 5AYZA 1OFAA 4S2CA 1EP1A 2DZUA 4FX7A 1XM3A 5HQEA 2BXVA 1VCVA 2ZRZA 1OHLA 3W71A 3NQGA 5I3HA 2CLMA 1WOBA 3G1FA 4Y6GA 2OT1A 1FDZA 3FJ6A 3SECA 1R2SA 2YW4A 2ISWA 1ALDA 5G1TA 3TV8A 4IX0A 4MY1A 4H6KA 4O11A 1A50A 3O8AA 1NSJA 1ZAHA 2ISVA 4E0CA 3GR7A 2A4AA 1JQXA 1W5QA 1ONRA 2OZ0A 3GDKA 3WJWA 3W2KA 3N19B 4QNEA 1EPXA 2E1DA 5D03A 1YXCA 1XL9A 3PUOA 3INPA 3W1TA 4U28A 3LI0A 3HQ1A 4LV4A 1G4TA 1FBAA 1GVSA 2H6RA 2I14A 3W7DA 1ICPA 4AB4A 4UUIA 3DHFA 1NF7A 4TR9A 2FPYA 4IXXA 4R33A 4GUIA 4O15A 5IBXC 1ZENA 3I7RA 1GWJA 2WJZA 4O0ZA 3S8HA 4Z1AA 4RR4A 4HPXA 3LCGA 4WX2A 1WV2A 2QCEA 2DORA 3LCFA 1SZGA 2V82A 3IRDA 3RMJA 1ICQA 3GLCA 2YSWA 3E9AA 4JTEA 4UTWC 1NFBA 3TE9A 4B5NA 2PRHA 1OK4A 3TSBA 2V2HA 3GDLA 3OHIA 2NWSA 3NPWA 3DFTA 3HGOA 2J9XA 1SSGA 3LCHA 3FEMA 3C6CA 4RX0A 3BGJA 1P0NA 3UXAA 3U8GA 1Q6RA 3VE7A 3EX6A 1OYCA 3T78A 2ZYFA 4TIMA 3TFXA 4M6QA 3W2LA 4IWWA 3DFPA 5CZ0A 3NQ7A 2C16A 3YPIA 3FA5A 2PURA 3CTLA 4FX8A 4MYXA 3JRKA 2QCHA 3P80A 3TU9A 3NDOA 3CEPA 2J88A 1XBYA 4DXVA 1P5BA 1JUEA 3PG9A 5FF7A 3SW6A 1QCWA 2CLEA 4ADUA 3MP4A 5FF4A 3LXAA 5EKYA 4RK8A 4PTNA 3TXVA 4WQ6A 2DZWA 1GVQA 5CSRA 1VHCA 3NG3A 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1TTPA 2WNNA 4R7JA 1DV7A 4UFLA 1JCJA 4OQVA 1TPDA 3FFSA 2H3BA 3W22A 1VLIA 4GBUA 4BWLC 3MHFA 2WNQA 4NXSA 3W83A 3LV6A 3NNTA 2H8ZA 2A7PA 1XBVA 1YPIA 3P67A 2YFOA 4AHOA 3OG3A 3FKRA 1B4KA 1VPXA 3SZ8A 1TPB1 1VHNA 3W86A 2WO5A 3SSJA 5G2IA 3W75A 3QEZA 4JR5A 5FEWA 4MZ1A 3EXRA 3GDTA 4O10A 3OBKA 1EEPA 1Z44A 3NA8A 1P1XA 4U4MA 2ZZ7A 3CIXA 3A9IA 2VENA 4I9AA 4OU1A 1H7NA 1KLZA 3HGJA 4GUGA 4LV9A 1QNVA 1YADA 4AHPA 4AWTA 2YPIA 3MHUA 1OFOA 4O1AA 4A3UA 3M5XA 2PE4A 4WUIA 1H62A 3LRMA 2WQPA 4LVAA 1D9EA 5K7JA 5D2XA 5L6UA 1BKSA 1ADOA 1IIGA 3G1VA 3K30A 1T99A 3TAOA 2A85A 4GXMA 4P2VA 4NVTA 2ZZ3A 3LHWA 3M16A 3RLVA 2C15A 4ADTA 1TV7A 1W3NA 3HG5A 5FF0A 2HMCA 4N4PA 1U83A 2RDUA 5HUOA 4R53A 2AQWA 3LTYA 3GKFA 3ABOA 1N8FA 5IBXA 2C0AA 4K8HA 1JRBA 1SO4A 4JN6A 2O7SA 4XWUA 3GYEA 1LROA 3SGUA 3P7YA 2ZZ5A 3M5VA 4OT7A 1PV8A 3O6DA 3HG3A 1TTIA 4O50A 3GX9A 2YZRA 2QCMA 2PRMA 4QNWA 4O8RA 3N14A 2Y7GA 2GJNA 1G4SA 2ZBTA 3IVUA 4JTFA 1YYAA 2GOUA 1N55A 4K6AA 1K7EA 3C0JA 1O94A 4OE7A 4UFHA 1B57A 1FQ0A 3S9YA 4YMZA 5AN7A 2QF7A 2CLKA 4Z1BA 3STGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4QM1A

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