1BSLA

Structure of alkanal monooxygenase beta chain
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
MKFGLFFLNFMNSKRSSDQVIEEMLDTAHYVDQLKFDTLAVYENHFSNNGVVGAPLTVAGFLLGMTKNAKVASLNHVITTHHPVRVAEEACLLDQMSEGRFAFGFSDCEKSADMRFFNRPTDSQFQLFSECHKIINDAFTTGYCHPNNDFYSFPKISVNPHAFTEGGPAQFVNATSKEVVEWAAKLGLPLVFRWDDSNAQRKEYAGLYHEVAQAHGVDVSQVRHKLTLLVNQNVDGEAARAEARVYLEEFVRESYSNTDFEQKMGELLSENAIGTYEESTQAARVAIECCGAADLLMSFESMEDKAQQRAVIDVVNANIVKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Flavoprotein
molecule keywords BACTERIAL LUCIFERASE
publication title Structure of the beta 2 homodimer of bacterial luciferase from Vibrio harveyi: X-ray analysis of a kinetic protein folding trap.
pubmed rcsb
source organism Vibrio harveyi
total genus 123
structure length 323
sequence length 323
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.14.3: Bacterial luciferase.
pdb deposition date 1996-10-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 1bslA00
5AECA 2B81A 2I7GA 1Z69A 4J2PA 4US5D 1NQKA 1LUCB 3RAOA 3SDOA 3FGCB 1BRLB 4US5A 1LUCA 5LXEA 4UWMA 1F07A 1NFPA 3FGCA 1RHCA 1BRLA 1M41A 5DQPA 1EZWA 1XKJA 1TVLA 1BSLA 3B4YA 3B9OA 3C8NA 1FVPA 3B9NA 1YW1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1V02A 3CUXA 4WY0A 4GQGA 5TNVA 3MU7A 4G6CA 5B80A 4QEEA 3K4WA 1XPGA 4AUBA 4US5A 3TTYA 1S1PA 3STFA 1TR9A 3V35A 1KTCA 1EJWC 1WKFA 3FV9A 1J18A 2ADAA 2KZHA 2YFOA 2Y7GA 4GQBA 3TW9A 2DH3A 3EMZA 3EWXA 2X0HA 1LQAA 4MNJA 4JIEA 1E6XM 2X30A 4C1KA 1F8IA 1JNEA 2ZVIA 3UEQA 3OLIA 2NT0A 4LNYA 4IXXA 3H7VA 4ZQNA 4QG8A 4PMNA 4NYYA 3TNBA 4H83A 3W7QA 2E9LA 3NQEA 4ZO9A 3TSDA 2BY1A 5AN7A 3HJEA 4TIMA 1W1VA 1FCQA 4H9UA 2WJDA 5XIMA 2FZ9A 3PTKA 3VD9A 5ABFA 1B3ZA 4ICNA 3BJSA 1Q2RA 4IMDA 5FSEC 1JYXA 4G56A 3GVRA 4BJHA 4BEQA 1CXHA 2F84A 1IXQA 3ZLFA 3GB6A 3WD1A 3MTWA 1MI3A 2PDQA 3SCSA 3AOFA 4AWTA 3S1GA 4TOQA 4XVEA 1A5KC 2XGZA 2AKMA 4IFRA 3OO2A 1AD4A 3BXWA 4DNMA 2PDFA 3HG3A 5HMFA 2GGIA 3Q67A 2WCAA 3T0CA 1EYWA 3BCDA 1MNZA 3W73A 2GUUA 1EGMA 1WKEA 3IJ7A 2FDSA 4RE0A 3CZGA 4CEXC 4I9MA 5E9AA 4I9AA 5CPTA 1SW3A 2C1IA 3UU0A 4BY3A 4CUCA 3PZ9A 4RW3A 2XIBA 2EPKX 1H0IA 1RBLA 1FWEC 4JD4A 3P8IA 1TZ7A 1TX2A 1SQ7A 1MQQA 2YXXA 4JCLA 4O1CA 1TELA 1FP9A 4GFIA 1EZ2A 1DWAM 1AW1A 3AICA 2O0TA 3TW7A 2WZTA 3K8KA 3D6NA 3B0YA 4JN7A 4LOCA 1Q65A 2DGAA 2IQTA 1Q6LA 1GJPA 5E0KA 3ITXA 2PDCA 5G1MA 3QBUA 3ABZA 1DIEA 2VGBA 5DBUA 1YRRA 2ESCA 4YVVA 2O9PA 2PF8A 1REQB 3WBAA 1Q6EA 4MOZA 2MANA 2BOGX 3UXIA 3GDTA 4I9TA 4NY2A 3B4YA 4N7QA 1HJQA 4M19A 4NU7A 4D6IA 2PD5A 4JZ5A 3R25A 3V16A 1QASA 5BXTA 3WSUA 4GACA 6REQA 1A4MA 3DBPA 3S1XA 1K03A 2Z27A 1NDWA 1OC6A 4R33A 3SR7A 1IGWA 3IK4A 3VCRA 3A13A 4K8GA 4PUEA 1IT7A 1VGAA 4GISA 1GOXA 2HQAA 3OZMA 3DECA 4XK2A 3ZWSA 4N6EA 4HNUA 1E6RA 1FX6A 4S3DA 3DGRA 1SSGA 4H6EA 2Y85A 4ROPA 3TWAA 5LSMA 1PSCA 3PPCA 1EOKA 2D3LA 1Q13A 4GYFA 3W1RA 1W5MA 4WJXA 1DXEA 2E5BA 3W1LA 5HXMA 1Q66A 1TTJA 5LNWA 2C8NA 2PWEA 4LVDA 5HWNA 1XLJA 3LX9A 1LYXA 4MZ1A 3W7OA 3K4AA 5BOFA 3F2DA 2E5DA 1XP3A 1CEOA 2NSOA 5GJPA 3UJFA 1LUCB 2J7BA 2BP1A 4WJEA 3CZKA 4RZBA 3FN9A 4AHPA 1JCTA 3P67A 2C6QA 3B9NA 2J79A 1Q85A 1XQLA 3MBFA 4GUIA 3ZO9A 2XINA 1SZNA 2PDMA 3C0QA 3WJWA 3KDNA 2DIEA 1GZGA 4EXQA 1J96A 3EDEA 1KGWA 5A6LA 2F6UA 2WWCA 4HYWA 4WGXA 4F0SA 1JFXA 2OO0A 1JXJA 2NUXA 1R9XA 3VGHA 5A8GA 3M43A 3W7NA 1T8QA 4Z2KA 2POZA 3W29A 3TA6A 2W61A 1MUMA 1Q5MA 2ZUWA 3NDYA 1XS2A 4XD6A 4P8WA 4OECA 1S2WA 2VEMA 1I2NA 5F1UA 1TWWA 1NVMA 3CH0A 1K8YA 1ZALA 2Y1HA 1P7TB 1WXZA 4H9XA 1DJZA 2XU2A 1U1JA 2ZX6A 3IJ9A 1HKIA 1O94A 2DT1A 4E3TA 3KL3A 3N2MA 4ZVJA 2W91A 4ATWA 1UB3A 1TCDA 1C92A 3LCFA 4EAMA 4KMQA 1WCGA 5FJJA 1BKSA 1XH0A 4IFOA 4L6DA 3U5YA 2D24A 4WXYA 4GO9A 1EQPA 2OX1A 2DZBA 1IWAA 3DEQA 2VGFA 2OWCA 5AHIA 1LOLA 1SFLA 3W9ZA 3L7RA 4H6KA 2QIIA 2PLCA 4ALDA 1GVEA 1CXLA 4GIRA 4A3YA 2ODOA 3B0XA 3LNPA 3LMYA 2OSWA 1JAKA 1GYMA 3GK0A 5A8QA 3CO4A 4KIEA 4XBKA 3K1GA 3QC3A 4ZEPA 2EKCA 3WO8A 2GSHA 2PBGA 2V38A 1DP0A 3W82A 1RY0A 3TQ0A 1OC7A 4PTVA 5A6SA 1GT8A 1BVNP 3QR1A 2NQHA 4AZ5A 1VRXA 1Z6KA 3T6CA 1AQMA 2V30A 4F9JA 1M7XA 3AUJA 3GH5A 1EHAA 2PLMA 5CC6A 3HQNA 4ACZB 1XFCA 4CQDA 3DHPA 2AMXA 1I2OA 2ZX5A 1J93A 4LYQA 2WZHA 5E6ZA 3R89A 3PTQA 2WLYA 3MMUA 4C6LA 3E3HA 3ARYA 4PCSA 1ISZA 3CQHA 3CV1A 3N9RA 2VVNA 3RXZA 4JTLA 1JGIA 5EMKA 5I77A 2EPOA 1V03A 3VILA 2AL2B 3HGRA 3TLLA 3W7LA 4E5TA 3QYQA 1EJXC 1WZAA 3SUSA 2RJGA 3GTNA 4GZIA 4RDZA 4UTLA 4LFYA 3AZSA 3O6DA 4X2RA 1ZL1A 5I03A 3QOKA 4C6CA 1PXGA 5LIKX 2Q01A 4GYKA 2E4TA 3E02A 3R43A 1GKPA 4M1BA 3TTSA 4UTMA 2OKOA 3PBGA 3P3BA 3QTGA 3BLLA 3GTIA 4F40A 3RYSA 2VR2A 4IIBA 1GVYA 1Q6RA 1XRTA 4DBEA 1TYGA 1CXIA 1M41A 4PBFA 1RP9A 1TPVA 1BXNA 1IT8A 4S39A 3TXZA 4LGXA 1C29A 1C8YA 1KA9F 2EQDA 3C86A 1A80A 2ATSA 1KBJA 4OV9A 4FR1A 3DFTA 2I16A 3AMGA 4N9BA 1H7NA 1O5XA 3FYOA 3USBA 2C79A 5IBXC 1R3WA 2WXDM 3DAQA 1UR1A 2Z28A 2D2OA 1O60A 3QMRA 2XWEA 4XO6A 1UWSA 1VF8A 1UPMB 1M68A 4PE8A 3O05A 3WF2A 3A23A 3ATZA 2C16A 5LIXX 4L4PA 3EA1A 4ZE4A 3Q37A 3QVQA 4XSMA 4JQAA 1LBMA 1PIIA 2B31A 5CPLA 1RP8A 2G5WA 1LLOA 5CZJA 5CGMA 1C7SA 4QFUA 1OWQA 1O5QA 4R7WA 2EF9A 4LXFA 1WOBA 1R3SA 3NTYA 1E73M 2EJAA 3W2LA 1UKSA 3TFCA 1G5AA 1YLVA 4S3EA 2Z1WA 2ZE0A 3I65A 4PBEA 4JHZA 3BQ6A 2VELA 2CZFA 4RX0A 1IXNA 1DQWA 3GG0A 4PMYA 4CQCA 1HO4A 2E67A 4H04A 4G7EA 4AC1X 4PMXA 3B4UA 1KXHA 3ZXWA 1EHNA 1W3JA 3BJFA 1TFVA 4M51A 1J0KA 4Q8MA 4A21A 4ZA0A 4Z0SA 3VK5A 3FW6A 4DRSA 1OZMA 2P53A 2KX9A 4FR6A 1LRQA 2XIJA 3AHYA 1HGYA 4BI6A 2Y6ZA 3NZRA 2FVMA 3RR4A 1WDWA 1ZP4A 1MNSA 4BA0A 3WQWA 3WNKA 3P84A 1GTHA 4MB5A 4LCRA 2WMIB 1BD0A 3I7RA 3N12A 1A3WA 3R8RA 5FF7A 3IJDA 2AGKA 3H4GA 1KXQA 4AB4A 5ABHA 2BVTA 4MGGA 1UD8A 1LG1A 5BOEA 1RPXA 4FNRA 1RQBA 1JZ2A 2O4QA 4HHHA 1V8EA 3GH4A 1EKOA 4B3LA 2XSBA 2ZRVA 3ABSA 1KQZA 1CX9A 3ID7A 4UC5A 4DHGA 3W76A 3MWAA 3W2UA 3WQDA 3NM3A 4CNPA 3WLHA 2X1UA 2PDJA 3N4EA 1QT1A 2V5CA 1XM3A 3O1NA 1XLFA 1GZ1A 3J7HA 3EXRA 3MZ2A 3L65A 2Y5SA 1W1YA 5CKSA 4B92A 4NZJA 1MXDA 4XAYA 1CGVA 1Y5XA 1UR4A 4AHOA 3QH2A 1HT6A 2Q02A 4DJEA 3MMDA 3ES7A 2OCZA 2YGYA 2PWHA 3MSRA 4FI4A 4G5DA 3C2RA 1H4PA 2OODA 4RE4A 1TX0A 4PFMA 2PUZA 1CB7B 1H49A 5DMMA 2C3ZA 1RVKA 2PGFA 5FI8A 1QXLA 3ITGA 4H4IA 1OEPA 2HROA 5E09A 1US0A 3ZJ8A 3G1HA 3NZPA 1I1WA 3DYPA 3WQ6A 3B04A 4JFVA 3WH6A 2Q71A 2UWFA 1XYLA 3R13A 4GE8A 2CPUA 3WMBA 3R4IA 2CLHA 3QY6A 4F4RA 4YXGA 3TYDA 1S5NA 3GXDA 4Y96A 4LF2A 1FA2A 1J6PA 3UWWA 2FQIA 1SYTA 2W3ZA 1Y5VA 3GU9A 3OGVA 4PMQA 1QJWA 5A69A 5ECVA 1EC7A 3TKFA 3O0KA 4NYUA 1XC4A 1E6SM 2ZX7A 4B5SA 4JTCA 4B3ZA 4MWAA 1H7XA 4AIUA 5CC5A 3KCLA 3MO7A 2OU4A 4BHYA 2AQWA 4H9TA 4BS0A 2QDEA 4OVXA 3G77A 4PSPA 4DBWA 2NUYA 3DFSA 1CW2A 3BAKA 2VWSA 3UJ2A 3W25A 3EB4A 2E6AA 1S5TA 4G9PA 1H5YA 4JFUA 3G0UA 3VDGA 4DJDD 4FEZA 4PTXA 4TV5A 4XKYB 3PZMA 3V5CA 1KGUA 1XIEA 3P61A 1J10A 4AY1A 1WAWA 4O57A 2Y8VA 2ZA2A 1L8NA 1CXFA 1EWEA 5K4XA 2B0MA 2X0YA 3G1XA 3SCTA 1RUSA 3NQ8A 3VGBA 3AMLA 4RR4A 1QBBA 2WQDA 3WIJA 1NTHA 3GXPA 5A2CA 2DZTA 3H2FA 2DJLA 1A5BA 4FIRA 5HNUA 5DT7A 3EPNA 4GQ0A 5AZ0A 3FVMA 1D3CA 3GC5A 3PULA 5DF0A 4FLQA 4FPSA 4AEEA 2J62A 4C1NB 3W84A 2DVTA 1EYEA 2VFFA 2Y0FA 1PZ1A 2ZIDA 3BJTA 3GUGA 3NSMA 3GRIA 4GXWA 3TMLA 1AH4A 3L4UA 1R8LA 4GGHA 4UTWA 5D2WA 3NFUA 4QITA 1Z9AA 5H1WA 4RJEA 3IVSA 1BVWA 3K13A 4NF7A 1OCNA 4OFCA 5RUBA 3FCPA 1R3YA 3EXTA 5FL1A 4HZMA 3VKKA 3UWVA 4JCMA 4PB5A 3EX6A 2BZNA 1T7LA 2ICSA 2ZC8A 3KOYA 3NNTA 3LU2A 1Z44A 4CN6A 3LV5A 3TU9A 2UY2A 3VGFA 1GVFA 1E1CA 3OLDA 4AWUA 3R12A 1UD2A 1W3IA 3FEMA 4IOTA 3ZM8A 3NXFA 2RDWA 1S1RA 2I5IA 1XJBA 3JS3A 1E6ZA 3LM7A 2GGGA 1QWGA 3W1AA 3PBWA 4CNTA 3MI6A 3RM4A 2VC7A 2QUNA 3EDKA 2IUZA 4LNCA 5IOBA 4C6FA 2PODA 3SSJA 4J3SA 4Z1YA 2Z2UA 4X3ZA 1H51A 4C6MA 3SADA 3FX4A 3TONA 2PGEA 3PBUA 4M0XA 1F6KA 2F9RA 3EDFA 1EGVA 3WY1A 1ZS2A 1MW1A 1L8PA 1YDNA 2QJJA 3BCJA 4AZGA 4UTUA 1OGGA 5GJMA 5A6JA 4MTVA 1V93A 2ZRUA 1PDZA 3LTPA 1M3UA 2W5FA 3S2CA 4XV0A 2BODX 5JIWA 4FXSA 4ZFMA 1F2JA 2WHJA 1P48A 1CLXA 3FDKA 3MS8A 1CZ1A 3OIHA 1V6UA 4GK8A 5HPCA 3T44A 3AFBA 1SO3A 4REQB 2DP3A 4LF1A 3CZJA 3V18A 1TPDA 5JU6A 2FTYA 4DYKA 1W9UA 4F9DA 1X8CA 2OPJA 1EP3A 3KTCA 5C5YA 1GQNA 1EIBA 4C7GA 3S2MA 4I7VA 4AW7A 3L68A 4GVFA 2NV1A 3AIRA 3C5QA 3EWCA 4J7RA 3W28A 3N25A 1BSLA 4JNZA 3GZ3A 3IVUA 1IXPA 5BMWA 1ICPA 5LXXA 3W7EA 1LQ2A 3NA8A 4LU0A 1FHLA 1FWWA 3QJAA 3AIUA 3NO1A 1XH2A 2VZVA 3QW3A 1P4CA 3C6CA 3FNDA 2QPUA 1TA3B 2FZDA 4OT7A 3B9OA 2QR6A 4UR7A 4E4PA 4OUIA 4LYRA 3FLUA 1R2SA 4HZ8A 4WDUA 3UWYA 3R0DA 8TIMA 4JTAA 3W7JA 3PANA 1I4NA 1JPDX 3KBWA 4PMZA 2Y8KA 4S38A 4LVAA 3U2EA 4K37A 4V1XA 3BV7A 2CLMA 4EWJA 4H01A 4LT9A 3WH9A 4B3KA 3TR2A 2V68A 2TSYA 4AF0A 3OEXA 4WKFA 1TREA 2F2HA 2VT0A 1TPC1 2QZRA 1YPIA 7ODCA 3OA5A 4Q7BA 3ABQA 4IQJA 4J35A 1JDFA 5MKGA 3N13A 3R2GA 3IGSA 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