3R5EA

Transaldolase from corynebacterium glutamicum
Total Genus 151
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
360
structure length
360
Chain Sequence
MSHIDDLAQLGTSTWLDDLSRERITSGNLSQVIEEKSVVGVTTNPAIFAAAMSKGDSYDAQIAELKAAGASVDQAVYAMSIDDVRNACDLFTGIFESSNGYDGRVSIEVDPRISADRDATLAQAKELWAKVDRPNVMIKIPATPGSLPAITDALAEGISVNVTLIFSVARYREVIAAFIEGIKQAAANGHDVSKIHSVASFFVSRVDVEIDKRLEAIGSDEALALRGKAGVANAQRAYAVYKELFDAAELPEGANTQRPLWASTGVKNPAYAATLYVSELAGPNTVNTMPEGTIDAVLEQGNLHGDTLSNSAAEADAVFSQLEALGVDLADVFQVLETEGVDKFVASWSELLESMEARLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Transaldolase
publication title Conservation of structure and mechanism within the transaldolase enzyme family.
pubmed doi rcsb
source organism Corynebacterium glutamicum
total genus 151
structure length 360
sequence length 360
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-03-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3r5eA00
1CI1A 2J27A 5AC6A 2CLMA 1ZCOA 3W73A 4K38A 1FCBA 3IRDA 3PWAA 3FLUA 1W3TA 1QPNA 3CWOX 5LNVA 1GVSA 1JCYA 3IIPA 1J4EA 2V81A 3DGRA 5DY3A 4BR1A 3CT7A 3W1TA 3USBA 2V9DA 3UNDA 4MJMA 2FTPA 1B9BA 4ONVA 5EYWA 1K7XA 5T26A 2GPTA 4NJJA 3W2JA 3CPRA 1SO6A 1SUXA 1S5VA 4MY8A 1D3HA 4GJ1A 3TSMA 3KRZA 3MW7A 3GYEA 4XTDA 1FDZA 3DFSA 4AF0B 3N9SA 2ZZ7A 1RZMA 1FCUA 4UC5A 2NZLA 5G4EA 5CPMA 4E0CA 4Y6GA 1W56A 3PS7A 1WXJA 4RK8A 4UFKA 1AW5A 3DKJA 4LUJA 1ONRA 2QJIA 3EWXA 4H4IA 2OT0A 3RLUA 4UNKA 3TH6A 4EF9A 4LW7A 4DO6A 2Y62A 4UFLA 2TMDA 2X1SA 3LHVA 4Z0SA 3NOEA 1KTCA 2XN0A 2WJZA 2Q3RA 2QCLA 2V5BA 3S8HA 1DBTA 3W3OA 1ICPA 5K9DA 3CB8A 3B04A 3ZWTA 1H51A 3ABQA 3H54A 1FCQA 1GYNA 4IMEA 1VYPX 3P81A 2RHGA 4CLMA 4A2SA 2DZVA 4IMFA 1HG3A 3NO5A 5LHFA 2OX1A 4XTIA 3HPSA 4HN4A 3UPWA 1UB3A 1YXCA 2NXIA 1X8FA 2Z6IA 4OV4A 2A5HA 2QCFA 1WOBA 1QNVA 3TKFA 1OYCA 3R12A 2H6RA 3WFAA 4NZFA 2CZDA 5H2ZA 2QCCA 3EKLA 2QUTA 4UMAA 2O7QA 4PH6A 1KBJA 1X1ZA 3FEMA 2ZZ1A 4O50A 2DORA 3P61A 3HG3A 2X1RA 2NX9A 2G5WA 2BTMA 4JYDA 2ZZ4A 1JJKA 1XBZA 1TREA 3C2EA 2X16A 1MEWA 2VELA 3NPVA 4ADTA 2ZCGA 3I65A 4AAJA 2BWGA 3OHIA 5AB3A 4LUIA 3RNDA 2A7PA 3M5VA 1ME8A 1VGAA 4M7TA 1DQWA 2EF9A 4UFJA 4AEOA 4IWWA 4LVFA 1TTJA 3HGSA 4CQAA 2OJPA 1DJQA 4UTHA 1GQNA 2CLHA 4K39A 2XN2A 2O7SA 4RV8A 3ZS4A 3TSDA 4GE8A 5D30A 3DFNA 3T7VA 4AHOA 1H61A 3NZRA 3W23A 1SPQA 4CNPA 4LNYA 4JDYA 3TUUA 2NV2A 3L2IA 5U7SA 1SW7A 1GZGA 1ME9A 3JRKA 2QCNA 3Q37A 2YW4A 3DFQA 1Z42A 3IEBA 4ZQMA 3R8RA 3PUEA 2CWNA 3E0IA 3P5ZA 2QCGA 3NQ2A 3DENA 2QCMA 1QOQA 2OMAA 4XWUA 2V5LA 3W7OA 2CLKA 3OVQA 4FEZA 1KFBA 1PS9A 4PFMA 2VC6A 2NWSA 3G0SA 3L9CA 4HIBA 5HWNA 1KM0A 5KZDA 1SW3A 2V30A 3PULA 3EWYA 1N8FA 3R13A 5F1VA 1OJXA 3LOTA 1HL2A 3IIOA 3PY2A 3TFCA 3EXRA 2QDGA 4RZ4A 2C16A 5AHEA 3NL6A 4PA8A 3DXIA 3THQA 3ZFHA 3WJXA 2E5CA 3P62A 2ZZ5A 5CZJA 4BWLC 3BPWA 3DI1A 2A7RA 1W5MA 3KRUA 4GXMA 4HT3A 4JTGA 3LTYA 1SZFA 3GK0A 1GVOA 4WY0B 3KVLA 4MZYA 4CCDA 2DJLA 5K2ZA 3UZ5A 1H7RA 5FEPA 4RR4A 4I7UA 2QJHA 5KZMA 3CQ0A 2F84A 4N4PA 1FXPA 3GIYA 3JS3A 1AG1O 3QEZA 3QM3A 2EKCA 4FXSA 2W0UA 4XZ9A 4L4MA 4NJIA 4GBUA 1TMHA 2WOQA 3GAKA 4GUJA 3T55A 3B8DA 1B3OA 3S1VA 5EY5A 2PRLA 2V8ZA 1KV5A 4JGDA 5I3FA 2KZHA 4LVGA 3Q2DA 3W1PA 1P0KA 5FF0A 3P8JA 2DZPA 4DPQA 5I3JA 3PBUA 1LYXA 2Z2UA 2VFDA 3QH2A 1YLVA 1TPH1 2FFCA 5CPNA 1TPB1 4UXDA 4TU1A 1TJPA 3MI6A 4FNQA 1FX6A 3C4UA 2Y6ZA 1I2RA 5BRBA 2ZA2A 4Q33A 4LVAA 2B7OA 2RH9A 4A29A 1SQ7A 2WKJA 4OWGA 3BARA 3DHDA 3W1UA 3NQ7A 5AC7A 4NUWA 4O16A 1TV7A 4MLJA 1G7UA 3N34A 2GQAA 4FIQA 3LI1A 3MMTA 1DQXA 1GPWA 1OABA 4JX4A 4MFDA 3M9YA 1G4PA 4QITA 3V1PA 5F1UA 2EAWA 3ABSA 4JTHA 1K7FA 2JKAA 3EX2A 1S3HA 5F4WA 1SZEA 1U5JA 4O0KA 4IMCA 1FXQA 1O60A 5DBUA 3VCRA 3EEGA 2J6XA 3HGOA 3HJZA 3W7RA 4M5PA 1IF2A 2QJGA 2PCQA 3DAQA 4LS1A 4YCOA 1VCGA 3O05A 4MYXA 2TYSA 3LXAA 1XKYA 1X1OA 3C61A 4I7VA 2AAMA 2BZNA 4EOUA 5F2GA 1P4CA 1M7PA 2Y7FA 1V5XA 2B0MA 5FI8A 1J2WA 3W7CA 3FJLA 4O53A 1O5XA 1AK5A 5F2IA 4JIQA 1K02A 4DF0A 2R14A 2YSWA 4DBEA 4WXYA 1XUZA 1VH7A 2VFFA 3W87A 3LCHA 1HUVA 1LBLA 1LZOA 3P80A 3NR0A 1JCXA 2ZTJA 1TIMA 4O28A 1RR2A 4O4WA 4LTSA 3ABOA 4IMDA 1YTEA 2CLLA 4WD0A 3W86A 3PSWA 3NPXA 2G95A 1GJPA 3C52A 4MFEA 1AW1A 4FNTA 1ZAJA 2ISVA 1B57A 3IV3A 4C1LA 1LLWA 3KRSA 2NX1A 3KVJA 3M1ZA 3W2NA 3LERA 3A22A 4HSOA 4NJGA 2A2IA 2WQPA 1XDLA 3NQ6A 4KFPA 4QIUA 3M16A 4R34A 2C14A 1TPVA 4XQ6A 5CPOA 3TSBA 1GWJA 1KFJA 3GAYA 3TK7A 3UWVA 3O6CA 4NX0A 2P10A 2NUXA 1KFCA 4DEFA 3C2FA 3G1VA 2CZ5A 1DKWA 3NDOA 4WJEA 2FPTA 1WAUA 4ZQPA 1TQXA 3PR2A 1EX5A 3HG4A 4AWUA 3CEUA 4NNAA 3QPZA 4FNUA 1PHWA 1QFEA 1W8SA 2ZTKA 3W9ZA 4IQLA 3DFPA 3BW4A 2ZA3A 2J9YA 3DBPA 1G4SA 1LBFA 3LRLA 5D32A 3UXDA 1A5SA 4Q4KA 5D2TA 5AYYA 3GDLA 1TPDA 1WOAA 1O4UA 5EA9A 4O52A 3SIZA 3TCEA 3UXAA 1NVMA 1XBVA 1VYSX 3W2UA 4N6EA 3NVTA 3GVGA 5TQLA 2VFGA 3BG3A 3W1LA 4NZJA 4RCXA 3V75A 3VI2A 3NYZA 1TTPA 1I2OA 3FKKA 2FPYA 4YLWA 1QPOA 2A21A 2PRHA 3C0JA 2BLEA 7TIMA 1WA3A 1O5KA 3TQVA 1ZY9A 3NXFA 2FDSA 4AWTA 2FJKA 4LT9A 1EUAA 5EL1A 3NL2A 1Y0EA 2WO5A 2C6QA 1KM3A 4Q32A 1OFQA 5LKYA 3W7HA 2Y61A 3STCA 1KTNA 4JTIA 5BMWA 3L67A 2C15A 3N2XA 3G1YA 4M7SA 1OK4A 2A7NA 1JUKA 1KLYA 3CWNA 1KTBA 2I14A 2PRMA 3S1WA 3W7IA 1TSIA 2J9XA 2OT1A 3GDRA 3NQDA 1XM3A 1Z44A 4YCPA 2R8WA 1F74A 3IGSA 4Y90A 3SZ8A 1VCVA 2CW6A 4QM1A 3LCFA 1MEHA 3KAOA 3M7WA 3BO9A 2X1TA 1ML1A 2RDTA 3CTLA 3HBLA 1OFRA 1FDYA 4DF1A 4DPPA 3NEVA 4IXHA 4JTFA 2WNZA 2E68A 3IVSA 1AL7A 1QAPA 5I3HA 1LRTA 3EXTA 1VJIA 3AO0A 1XDMA 2GVLA 2QCHA 3L0KA 3HG5A 3QMSA 2E77A 2ZBTA 3L68A 2PURA 3TX9A 1L6WA 3O1NA 1LOLA 3L0GA 4FO4A 1EEPA 1XCFA 4E2DA 3N3MA 4JTUA 5DXXA 3ZR4A 4O11A 2BX7A 2Y7DA 1H1YA 2EPHA 1ZAIA 1EIXA 1SZNA 2GVGA 3QMRA 3W74A 4NU7A 5DY2A 3LM7A 4UIOA 2DJXA 3QPYA 3B0UX 2BSLA 5FEXA 3MHGA 4ALDA 3RMJA 4DXVA 3W2LA 3DH7A 1XI3A 1VHNA 3UZJA 3I7SA 2H3BA 1H1ZA 3WK2A 2JK2A 5AHLA 4QISA 1W3NA 5BOOA 4JDBA 3O16A 3G18A 5D2WA 1KM4A 1LP6A 1XC4A 2J24A 2QF7A 2NLIA 4DO4A 3M5YA 1YDVA 4UR8A 3TXVA 5CZSA 3TMLA 1BWKA 3W7LA 4OT7A 4FB7A 2F7FA 4WY0F 1FWWA 2H90A 1F73A 1H63A 4GUFA 1DL3A 2A1YA 2ZDRA 3MI3A 5AHFA 5HULA 1VCFA 4RXGA 4JX5A 3R2GA 4RJEA 4R33A 3C56A 1Q6LA 5C6MA 1F05A 4PEKA 4CQ8A 3GXNA 3NG3A 1EP2A 1AW2A 1W31A 4O10A 1IIGA 4JX6A 2HS6A 1J5TA 1F6KA 2Y7GA 1OG0A 1Q6QA 5BNKA 4O1AA 1H7OA 1R2SA 1GYLA 4R7JA 4IUOA 3FYPA 5HQEA 1UUMA 3TMQA 3W83A 4N4QA 5G4WA 1YPIA 3L5MA 5DCDA 4O54A 4RXFA 4MZ1A 1SR9A 5I3IA 2GQ8A 4K7VA 4ML9A 1GVQA 3LV5A 3S42A 3QYQA 1VRDA 3T4CA 3TFXA 1H7XA 4ZQOA 3NL3A 4LVBA 3P74A 3HF3A 1EWEA 4NVTA 1TB3A 3S5YA 2QCEA 2C3ZA 3OEXA 1NSJA 4UFHA 1RPXA 1U83A 4HPJA 1OK6A 3WJYA 5TIMA 1ZFJA 5HJLA 2FB2A 4AHPA 1H50A 2QEZA 5HR6A 4JR5A 2NXHA 3QJAA 1Q6OA 1QDSA 4JTLA 3RLVA 2ABBA 1PCKA 3C2OA 2JKPA 2GJNA 3G24A 4GUHA 4AVFA 3W2KA 4EF8A 3R89A 1RQHA 3NM3A 3HPZA 1YXDA 4O57A 1B4KA 3INPA 3EWBX 4QQ3A 1ZALA 1EP3A 3MWAA 3SJ3A 1JCMP 5C2XA 4CNOA 2V2DA 5A5WA 3IGUA 4NT0A 4GFSA 1P1XA 1LROA 3W71A 2GJLA 1MEIA 2G97A 4PL1A 1Q3NA 1O94A 4FX7A 2YGYA 3W7NA 3NPUA 3NNTA 2YX0A 3N73A 5KSWA 1YPFA 4UTJA 3LBMA 4ORIA 3O6YX 3TQKA 3BV4A 3KFTA 2YCEA 3W7PA 4ZMGA 1KM6A 3HIJA 3G8EA 1I2QA 5D38A 3G0UA 3LX9A 3G3MA 4UFMA 5IBXA 4HHPA 4P61A 2CLIA 3TJXA 1RQBA 4UTWA 4LV9A 4S2CA 4CQ9A 2ATMA 2Y85A 5K4ZA 3W1XA 8TIMA 3W7QA 3GNNA 1XXXA 2A0NA 4N9CA 3TC7A 1SZGA 5BW6A 4ZVJA 2CLEA 4OBTA 2DZXA 5DBTA 2AGKA 5LNSA 2GQ9A 3N2MA 2Y70A 2ZRUA 3IVTA 3GDMA 3LB0A 1WBJA 1K03A 3LV6A 4TX9A 1PL9A 3UY8A 1I2NA 3BK0A 3M41A 2X2GA 2YYUA 3NQGA 1XUUA 4NX5A 2DU2A 2UV8G 4JTKA 1JRBA 1ZHAA 1THFD 1OVDA 4MY9A 2YFNA 5L9FA 4FHAA 2YYTA 1OFEA 2YFOA 3P5YA 4TIMA 3A21A 4D2JA 3O07A 2R94A 3LDVA 4XKYA 5D09A 3MHUA 1QOPA 1UBSA 5LHEA 4JICA 5K4XA 3WK3A 3EWUA 4H6KA 2R91A 1R47A 1HO1A 3E02A 3UPBA 4FF7A 2NUWA 2ISWA 4MVAA 3W76A 3PBWA 1GTHA 2FB3A 2FIQA 4RLIA 1QMLA 3O8AA 3STGA 1H62A 2XN1A 1OX4B 1QO2A 1M5WA 4OHQA 3CEPA 4J9JA 3TROA 3KHJA 3W70A 4DO5A 3W1NA 1LORA 1G4EA 1TPUA 3LLDA 3LHUA 3F03K 1RD5A 4ADUA 4UCGA 4B5NA 1IXPA 3UYCA 2QAFA 1QPQA 3E49A 5AFDA 1JRCA 1K8ZA 4U28A 3PB2A 2DZTA 2Y88A 3PAJA 1TPFA 4IPIA 1LRNA 3W07A 3QW3A 2V2CA 4FX8A 4IJBA 1BEUA 4O1BA 1OF6A 2G96A 1KM1A 4QJ1A 1S5WA 1JCJA 1LOQA 2E1DA 1R2RA 1WBHA 2E6DA 4S1FA 1ME7A 4TR9A 2JKEA 2H8XA 4IGHA 1KM5A 2ZZ6A 1YYAA 1F76A 1MZHA 3EXSA 1NF0A 1NEYA 3L5AA 3W85A 1OFPA 4WXZA 5D2YA 5DN1A 3N14A 1VQTA 3QZEA 2WNNA 1LBMA 1TTIA 1W1ZA 3EB2A 2NX3A 5CZ0A 2ZYFA 3GKAA 4UTKA 3FJ6A 3G0XA 4FIRA 4QSHA 5L6UA 3BG5A 1FWSA 4CNNA 3OG3A 3DI0A 5CPLA 5KITA 1XL9A 2ZFAA 1L6SA 2E6YA 1WV2A 3PBVA 3NGJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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