3P8JA

Y351s mutant of pentaerythritol tetranitrate reductase containing a bound acetate molecule
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
362
structure length
362
Chain Sequence
EKLFTPLKVGAVTAPNRVFMAPLTRLRSIEPGDIPTPLMGEYYRQRASAGLIISEATQISAQAKGYAGAPGLHSPEQIAAWKKITAGVHAEDGRIAVQLWHTGRISHSSIQPGGQAPVSASALNANTRTSLRDENGNAIRVDTTTPRALELDEIPGIVNDFRQAVANAREAGFDLVELHSAHGYLLHQFLSPSSNQRTDQYGGSVENRARLVLEVVDAVCNEWSADRIGIRVSPIGTFQNVDNGPNEEADALYLIEELAKRGIAYLHMSETDLAGGKPYSEAFRQKVRERFHGVIIGAGAYTAEKAEDLIGKGLIDAVAFGRDYIANPDLVARLQKKAELNPQRPESFSGGGAEGYTDYPSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Pentaerythritol tetranitrate reductase
publication title Active site modifications in pentaerythritol tetranitrate reductase can lead to improved product enantiopurity, decreased by-product formation and altered stereochemical outcome in reactions with a,b-unsaturated nitroolefins
rcsb
source organism Enterobacter cloacae
total genus 138
structure length 362
sequence length 362
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2010-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3p8jA00
1GEQA 2ABBA 3D0CA 3M7WA 4MY8A 5FI8A 4IMCA 2VFGA 2X2GA 2A85A 1FCUA 2NZLA 3GDMA 4QAIA 3L0NA 5E93A 3PS7A 2B7PA 4BI6A 4C1LA 4Q4KA 5DN1A 3LB0A 3GAYA 5CG7A 1A5BA 3TQVA 2RDWA 3QC3A 2QCNA 1QOPA 4YCPA 4IXXA 3TJLA 3W2NA 3NZRA 3M47A 3TXZA 1DV7A 3PBVA 4O54A 2OMAA 5FF2A 3GLCA 4IX0A 3PB0A 5D2YA 4JX4A 4DELA 5K4ZA 1DJQA 2RHGA 1QO5A 4GUJA 5HUPA 3C52A 4WOQA 3UWYA 3W1AA 4WQ6A 1XC4A 3MP5A 3NZ1A 1SW0A 3TXVA 3W72A 2NWSA 1LM1A 3AJXA 8TIMA 3KRSA 5DY2A 4LT9A 2QJHA 1SSGA 1HL2A 4JD4A 2Y88A 1H7WA 4MJMA 1TV7A 2WOQA 4O4VA 4K39A 2ZRWA 3IVTA 4KWVA 2ALDA 4MY9A 1FDJA 2ATMA 1DL3A 1OABA 2E68A 1I45A 3W07A 3ZFHA 3W1UA 4LRTA 3OIXA 3T55A 1H1ZA 3PM6A 2GVJA 2A1YA 1XM3A 3VKJA 3TC6A 3P67A 3O15A 1TCDA 4N9CA 1TV8A 4PTNA 3W1RA 3G1SA 2CFFA 2JGQA 5CSSA 3PWAA 1G67A 2Y7GA 5KITA 4AF0A 3C56A 4LVDA 3C2EA 3W84A 4YXGA 4K6AA 3GZ3A 3CC1A 5IBXC 4UFHA 4BWLC 1GQNA 3B05A 1JCMP 3PUOA 2FB3A 3S5OA 3L67A 4BR1A 3CPRA 4QJ1A 4MZYA 1PCWA 4PFMA 5U7SA 2ZA3A 3SIZA 3WJYA 5HWNA 2GUUA 3BW3A 2JGYA 3N9RA 5K9DA 1S5VA 3JRKA 3W70A 4DEFA 3O1NA 3UQNA 3QH2A 1OG0A 3NQAA 3W74A 3O16A 1AW1A 4Q33A 1TPWA 4LU0A 3KRZA 4R34A 5D30A 5EL1A 4JYEA 2OX1A 3ABRA 5AYYA 2BTMA 3IVUA 3M1ZA 3LHUA 3OG3A 3A22A 3A24A 2V2HA 3AO0A 4MKNA 3W1XA 3NA8A 4O0ZA 3N2MA 1Y0EA 3HPZA 1XL9A 2BWGA 4TR9A 1JCXA 1KM0A 4X3ZA 5FESA 4Y96A 5FF3A 3C6CA 4AAJA 4W9TA 5F2GA 4MZ1A 4MLJA 1EP3A 4HHPA 2QCCA 2VFHA 1KW1A 3UD6A 4CQ8A 1OYCA 4Y8FA 1H7XA 5DY3A 3C2VA 2VFDA 3W7DA 4CQ9A 2X1SA 3CM4A 4AF0B 1VJIA 1DHPA 1RV8A 1FWWA 1N55A 5TQLA 2A7RA 3LV6A 1L6SA 1F76A 1H1YA 3W2KA 3OEXA 1W54A 3RLVA 3DFTA 2C1HA 4ML9A 4PEKA 1EPXA 3RK8A 1GVRA 1OFDA 1HTIA 3TX9A 3GR8A 1UASA 4P61A 1W5PA 4RZ5A 4PCFA 2ATSA 4KFOA 1ZY9A 3UYCA 5FF0A 5AB3A 1TTPA 4E2DA 3TAOA 4XQ6A 1MSSA 4MOZA 1H7NA 4TX9A 5LNRA 1IGSA 3LLDA 1YDOA 4AHOA 4MUZA 1LLWA 5DCBA 3S9YA 1JR1A 4H4IA 1SFJA 1JCYA 4GUHA 3M5ZA 4JY8A 7TIMA 1ZJIA 4MPQA 1D9EA 2I9EA 3I7QA 3W9ZA 4K37A 5J5RA 3M0ZA 2QCLA 4GJ1A 3DI0A 3S1VA 3MP3A 2QCHA 4CNOA 2YZRA 5HULA 2YFOA 2VOMA 2A6LA 2ISWA 4DF2A 3W7CA 3GDLA 2NUWA 1ICQA 2QUVA 3W7NA 2VFFA 1EWDA 3STCA 2FLIA 3P81A 1OK4A 3MW7A 3TW6A 3TUUA 3S8HA 1W3IA 4YL2A 5HJLA 1V5XA 5FF7A 4LUJA 1TPH1 2Q8LA 4DF0A 4NXSA 3VFLA 1RPXA 2CLHA 3UNDA 1FWSA 5D33A 3USBA 4M6QA 5DELA 2FPYA 2X1RA 3FKRA 3TSDA 4LWWA 4AWTA 1DVJA 1DQXA 1LOSA 2RDUA 3QPYA 3O05A 1TTIA 2A7PA 1DBTA 4IXHA 3LCIA 3EX4A 1GZGA 3EWUA 3V75A 3QQ0A 4ZQOA 3ATYA 3QEZA 2EPHA 4LC6A 3DFOA 3L65A 2VFEA 1MEHA 1YXDA 5EKYA 2VELA 5LNUA 4FB7A 2XN1A 5I3JA 4MFDA 3HOJA 1Q6OA 3SGUA 1K03A 4K7VA 3NQ8A 4O13A 2OT0A 2GJLA 6ALDA 3QF0A 3M6YA 1PHQA 1HG3A 1K7EA 5MHBA 2W79A 5KZMA 4UR7A 4WXYA 1RD5A 1KTCA 3PUDA 4WUIA 3I7SA 4O11A 3UWUA 3BGJA 4AB4A 3F03K 5E1QA 4AWSA 1QR7A 3GR7A 4JTUA 3ZWSA 4HNTA 1JVNA 5I3FA 4NQ1A 1WXJA 3MHUA 1GG1A 1TB3A 1JUBA 3HJZA 3L9CA 4FX8A 3W1MA 2Z1BA 2J9XA 2A6NA 4Z0SA 4NNBA 3ANYA 2J9ZA 2TRSA 1I2NA 1IXNA 1W5QA 2Z0IA 3P61A 4DXVA 3DAQA 1XBYA 1SUXA 4S2CA 4OV4A 3RMJA 4UTHA 3BG3A 3MI6A 1MXSA 4X22A 2E6YA 2A4AA 2DJXA 1WQ5A 4AMAA 3GB6A 3UWZA 1G4SA 1FBAA 4EVZA 1TREA 3V1PA 1S5WA 4Z1DA 1J5TA 4UFIA 3TFCA 3W87A 5LNVA 1LLZA 4LVGA 6TIMA 3IV3A 3GYEA 1WAUA 1Q6LA 3WFAA 4DF1A 1EX5A 3EXRA 4UTKA 2H3BA 4OBTA 3QSTA 1NF0A 3MWAA 1C29A 1MZHA 4UC5A 1KM6A 2E5DA 4QISA 2V5LA 1QPNA 1G4TA 1MEIA 3EEGA 5CGQA 3WK3A 2I1OA 3IIXA 4PODA 3G22A 1YTEA 2DZXA 4G1KA 2BLEA 3Q2DA 2V5BA 2YPIA 3LERA 1FX6A 1NEYA 3A9IA 1P1XA 3NPVA 4JXCA 2YW4A 1P0KA 3LTSA 4MYAA 3G24A 5C5YA 3INPA 2KZHA 3W7OA 3BO9A 3GKAA 5TIMA 2Z2UA 3HG4A 5BOOA 3NM3A 3KAOA 4GUFA 3TE9A 5F4XA 4UTIA 4O17A 3ABSA 2QF7A 3HBLA 3CTLA 3TQ0A 1LDCA 1G4EA 1WV2A 4IMFA 2ZRVA 1ADOA 1GVQA 4ZVJA 3DBPA 3E12A 4DQWA 3TFXA 4O14A 3TDFA 2V9DA 4K8EA 3LGEA 1DJNA 4JNMA 5D2TA 3CWNA 1W8SA 3GXNA 3TAKA 1FWRA 3GDKA 1IXQA 1I4NA 2ZTKA 3NQCA 4FIRA 2V30A 1C8VA 3C0JA 4RK8A 1R2RA 3LI1A 4LS0A 3SY5A 3S1WA 3QM3A 4U4MA 1MEWA 3NPWA 1W31A 3G3MA 1JRCA 3P82A 3R8RA 1ZAIA 2B7QA 4RLIA 5EPDA 5LGXA 1TO3A 4WD0A 4UIOA 4WXZA 1WX0A 1Z44A 3DH7A 4UTMA 3O63A 1VZWA 5IBXA 3O07A 5D05A 3LXBA 4BWLA 1F74A 1IXPA 2ZZ7A 2A0NA 4JTFA 1RZMA 5SWUA 5A5WA 1I2PA 5AN7A 3EX6A 4BI7A 4O52A 2VEKA 5L9FA 3LHZA 1O95A 1XI3A 2Y61A 3MO7A 5D2WA 3PBWA 3I65A 3EX3A 1TPUA 4JGDA 3F1QA 3T44A 4O15A 4NJHA 2BXVA 1GTEA 1CW2A 5LNWA 1X8FA 4WJEA 4JIPA 3BPWA 1L6YA 2Y70A 1LYXA 3W2UA 3GXTA 2NX1A 3QW3A 1T8XA 3LTPA 3JR2A 5KINA 4YMZA 3CIWA 2GVGA 4CCCA 3HB9A 2C6QA 3DHFA 3L66A 3P60A 3LCGA 2QJIA 3PR2A 3Q58A 1UBSA 4NNAA 4X9SA 4OQVA 1KFLA 4IX2A 3QSRA 5BMXA 3DFPA 4WY0A 1VYPX 3TMLA 4RZ4A 3W1LA 1IIGA 3EKLA 5K9CA 4ZQCA 3LCXA 3WJXA 1S5TA 1TJPA 5DBUA 2NXIA 5A8GA 3WK2A 1LTDA 5HWJA 4XKYA 1B4EA 1Q6QA 2YYUA 4IQLA 1EWEA 3BLFA 1X1ZA 4O18A 3PULA 2C13A 2O7SA 4UFMA 4HNUA 1EB3A 1ICPA 1HUVA 3TSMA 4UUIA 1OFBA 3EB2A 4N6EA 4O1DA 5DLCA 2Y62A 1QPRA 4AH7A 3T7VA 4Y90A 1LOLA 1SR9A 1O5KA 2E5BA 3TK7A 3W1NA 1OX4A 3EWBX 3T78A 1JCLA 2AQWA 4PA8A 2X1UA 3CHVA 3FS2A 2DU2A 1WDWA 4U28A 1C9DA 3FFSA 3PSVA 3N14A 4Z0JA 4FIQA 3TJXA 5AYXA 1KFEA 4LV4A 1EP2A 2PRHA 3BG5A 4JTTA 3KOFA 1VHCA 2PRMA 3BW4A 1P4CA 3G1VA 2FFCA 1XBVA 5HUOA 3TQKA 4PC8A 3NL2A 1JULA 3BV4A 2JKPA 2R8WA 1G4PA 1K02A 2AGKA 1H7PA 1G7VA 3HPXA 1R47A 2PC4A 3DI1A 3GXPA 1VCFA 4WY0B 4ZZ9A 4GXMA 3GNNA 4DBEA 4DO4A 4N6FA 1QO2A 2O7QA 1JJKA 2E5CA 3C2RA 1YXYA 1SSDA 2WPBA 2YR1A 2EAWA 3C2OA 3GK0A 2QCDA 3IGUA 3TH6A 4XKYB 2CZFA 1EA0A 3KRUA 4M5PA 1OFQA 2XN0A 2CWNA 2Y6ZA 4QNWA 1F6PA 3UZJA 3NPUA 4JTJA 2X16A 4MJZA 4O4WA 3IEBA 2HMCA 3HGRA 5J5DA 1GWJA 1QAPA 1YDVA 3LCLA 4BK9A 2HTMA 3UY7A 1B3OA 3CWOX 2H8XA 5LKYA 1H62A 4HSNA 2FPTA 3QZEA 1R2SA 2P1FA 1I2QA 4UFJA 3L2IA 1OX4B 5AC7A 2Y7FA 5G2HA 1N8FA 3VE9A 3W7HA 5GVJA 1W0MA 1JQVA 2JKEA 4UMCA 5AOUA 3T4CA 1H60A 1LBLA 1TSIA 2CLLA 3WJSA 3BLEA 4Z1CA 3W6YA 1EEPA 2QCFA 1P5BA 4UMBA 1FXPA 4E2BA 1PIIA 2YW3A 3W7PA 3CB8A 3DU0A 2ZRZA 3DFQA 5HR6A 3Q37A 3P74A 2CLOA 4R53A 3HO8A 3GVGA 3FIGA 3L68A 1VRDA 1EIXA 5I3HA 1LRQA 4M7SA 3SW6A 1SZEA 4XTDA 1DQWA 4NU7A 3M5XA 3G1HA 1H61A 1F2JA 5TBOA 2RKXA 3KXQA 3I7RA 1N7KA 2B4GA 2QCDB 5G4EA 3A23A 1CI1A 1H50A 1LORA 3VE7A 3QMSA 4UTTA 4XUGA 5F4WA 1KM1A 1M5WA 3W7RA 1XFBA 4I7WA 3LTYA 1O4UA 4O19A 4RJEA 4FF7A 1QDSA 3I68A 4EF9A 3S5ZA 4IJBA 1BWLA 5F2IA 1F7BA 3G1FA 4LOCA 3RF9A 2DORA 1VQTA 2GQAA 2CLKA 1OX5A 1UJPA 1TPDA 1WBJA 5CPOA 4MYXA 3PG8A 2QCMA 4PL2A 4JTHA 2BZNA 3B0PA 5DBTA 5ABTA 3NVTA 1KM4A 4NXKA 3KFTA 5HWMA 2A2IA 1TMHA 1H7RA 3E49A 4HT3A 4JX5A 3TR2A 3HF3A 3WJWA 4Y9AA 2ZZ5A 3L0KA 1YYAA 3BK0A 2CLMA 5AC6A 2Y7EA 1VLIA 4FX6M 4IPIA 3IVSA 4LY8A 2VKZG 3HMJG 1TV5A 2Z6IA 3G3DA 3NQGA 5FEWA 1SW3A 4KKXA 1KTNA 4HKPA 2G97A 2GQ9A 1SFLA 4JTIA 3G1AA 4CCEA 5HR7A 2R94A 4RXFA 1KM3A 2ABAA 1GG0A 3NQ2A 4DBDA 5DCEA 4WZHA 4Z08A 2QEZA 4CNNA 3LX9A 4NVTA 2R14A 4FNTA 3E02A 3IRDA 1SZNA 4HPXA 4XTIA 2R91A 4GUIA 4O50A 2C16A 1Z42A 3RU6A 2QUTA 3NQ6A 3QRHA 3SSJA 1ZENA 5HINA 3WK0A 5DXYA 1ZAJA 2E09A 1F73A 1AG1O 4FNQA 4TU1A 2ZRUA 1TYGA 2CLFA 4JTKA 5F2MA 5I3IA 3EWXA 3MMTA 1XBXA 4X2RA 3DXIA 1A5AA 4JR5A 3W7MA 3F4WA 1FDZA 3UWVA 2H90A 4A2RA 5BRBA 5K9XA 3NGJA 4LUIA 1R30A 5F4SA 3CT7A 3NYZA 3G8RA 4JTGA 2Y63A 4UFKA 1UB3A 2NXHA 3G8EA 1LZOA 4MY1A 1I2OA 3C4UA 2A21A 1X1OA 4Q32A 1W56A 4Z1BA 3UWWA 1UUMA 3IIPA 4GNJA 1OVDA 3DHDA 5AHEA 4HSOA 2TPSA 2E6AA 3SZ8A 4LV9A 1ALDA 1M6JA 5CPLA 4M6PA 1YLVA 1BTMA 3S1XA 2J88A 3NOEA 3EWYA 4JN6A 2FJKA 4HNVA 4UTWC 1QWGA 4M19A 3W7JA 4QSHA 5D38A 1GVFA 1B4KA 3HQ1A 1AK5A 3KVMA 4JYFA 1GOXA 3CIXA 2ZYFA 4POCA 3B04A 3B8DA 3M5YA 4OHQA 2GOUA 1VCGA 3TC7A 4I7UA 3TA6A 1SO5A 2B0MA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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