2ZZ6A

Covalent complex of orotidine monophosphate decarboxylase from m. thermoautotrophicum with 6-azido-ump
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Structural characterization of the molecular events during a slow substrate-product transition in orotidine 5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 83
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2009-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zz6A00
1TO3A 3EX3A 1S5WA 3MHFA 4JDBA 3QMSA 4LS0A 3HG5A 1J4EA 2QCEA 4N9BA 3GB6A 4JN6A 3GNDA 1JJKA 2OJPA 3BG5A 5AHFA 1A5BA 3EX6A 3G8RA 4RZ6A 1FWTA 1FWNA 4FF7A 1K8XA 3WK1A 3F4WA 2XN2A 3VCRA 4JTFA 3L66A 5A5WA 1TJPA 3R12A 1L9WA 5LZLA 5U4NA 2DZUA 1DL3A 3IIOA 3O07A 4GUFA 3EWBX 2PURA 4AVFA 3KVJA 4GJ1A 3F4NA 2I14A 1W54A 3C2OA 1SUXA 1KFKA 3PC0A 1VHNA 4O17A 5CZJA 1SFLA 3LX9A 3Q94A 3MI2A 3KRZA 3C2EA 1QMLA 5HUOA 2GVLA 4Y90A 1BWLA 1ZNNA 4Z0JA 3R13A 2EHHA 1LOLA 1TTJA 3HBLA 2CU0A 2C13A 5ABTA 1FWSA 3TQKA 3S9YA 5AC6A 2VFEA 5H91A 1OYCA 1WXJA 3QEZA 1M7OA 3W9ZA 4MPQA 2JK2A 2YGYA 2Z2UA 3FJLA 1JCXA 3UWYA 4JTLA 3C3NA 3CHVA 2DZWA 3GYEA 3VE9A 5LGXA 3HGSA 1WBJA 5G4WA 1KM4A 5D2XA 3ZR4A 4ZZ9A 1GYLA 3DFTA 2ZTKA 4LV4A 5AHMA 3MP4A 4N6EA 3W88A 1P0NA 1H60A 2Y70A 3NVTA 4QISA 5LNRA 4HNNA 3NQFA 2NX1A 2VEIA 1SW7A 1TPWA 2QUTA 4IMCA 4DPPA 2C3ZA 3SSJA 5L6UA 1K7FA 3W7IA 1ZHAA 3W1NA 2W6RA 2R14A 2WSQA 3L5AA 3HG4A 5DXYA 2JGYA 4PA8A 3EEGA 3DI1A 4RJEA 4GUHA 2EKCA 4RKAA 4O1AA 1EUAA 3UXDA 5AHLA 3V1PA 5D04C 2YFNA 4E2DA 4HT3A 4JXCA 1MSSA 1C8VA 2RKXA 3E96A 1J2WA 1H7OA 3I6RA 1SO3A 1TPC1 4POCA 4EIVA 3OBKA 2HTMA 3STEA 4DELA 1SU5A 4NJGA 2AQWA 2GQ8A 5KZMA 1HO4A 3BO9A 4C1KA 4QSHA 2XFWA 2ZRXA 4K6AA 2TSYA 3JS3A 4AHQA 1XKYA 4JTHA 2I1OA 4NQ1A 3CQ0A 4KFOA 4MZ1A 1RD5A 2FJKA 4HSOA 5F4XA 5I3JA 3KHJA 3NQMA 4QM1A 4AHPA 5KSWA 3NQEA 2V82A 4UC5A 4EVZA 4E0CA 1BEUA 3GXPA 3TJXA 5D37A 1I2PA 4RXFA 1KBIA 2F84A 1OFOA 1YTEA 3CM4A 4TMBA 1B9BA 3N19B 2TYSA 1KM2A 3GX9A 5AYYA 1QAPA 2A2IA 4R34A 1T99A 5D03A 2OT1A 4IX2A 5BMWA 4CCDA 5FEZA 3E9AA 3BGJA 5AYZA 2E5CA 4NZFA 1L6WA 5BMXA 2E6FA 5EL1A 4CNOA 1TPVA 3LCLA 3PF3A 1ZENA 4N9DA 4RZ4A 2QCHA 1F7BA 1SPQA 3EX2A 5KINA 3HB9A 3V75A 4OV4A 4FEZA 1YXDA 1GVQA 4O0KA 4NXSA 2ZQ0A 1JCJA 1I2OA 1UB3A 4AB4A 4P61A 1QO2A 5U7SA 3R89A 1Q6OA 3W1QA 1Q6QA 1H61A 3TV8A 4OGZA 3W7DA 4XBSA 3PAJA 4WXZA 2DZVA 2Y63A 4PL1A 1QWGA 3GDLA 1XM3A 4MYAA 2XN1A 4HNUA 3G1AA 2Y7GA 3TAOA 1FDYA 1JRCA 1FQ0A 2FPTA 2ZZ4A 5GVJA 3KOFA 3TKFA 3SY5A 3LTSA 3EWXA 1TV7A 3L5MA 4JNMA 1PCWA 3QPZA 5HR6A 4JYEA 2EF9A 3I7QA 2WO5A 3BK0A 3CEPA 3PBUA 3PBVA 3OA3A 2W79A 3FFSA 5FF4A 4ADUA 1HG3A 1KFLA 4PTNA 4LOCA 4MY1A 1MZHA 2Q3OA 4FX6M 5LGZA 5I3GA 1D3GA 4RLIA 3LTYA 1R2TA 3EKZA 3NG3A 3N73A 3W1LA 3GIYA 2YYTA 2R94A 2J6XA 1UUMA 1QR7A 3NQ2A 1HO1A 2OT0A 4UTTC 3OHIA 1VRDA 3WJSA 4TMCA 3GDKA 3P60A 3W7PA 5F2LA 3B04A 5H2ZA 3G0SA 3NQCA 3G24A 1SQ7A 3G8EA 4OQVA 1SO5A 4XBKA 2Y7FA 3F1QA 1JUBA 3TJLA 4UTMA 3IIZA 4PC8A 3LBMA 2BTMA 1FDZA 2Y89A 4IMDA 3TDFA 2H6RA 3JRKA 1V7YA 1VS1A 1KV5A 2TRSA 1GT8A 3IIPA 3HG3A 2UV8G 3TSMA 4I9AA 1TPDA 3BLFA 2CFFA 1AG1O 3BPWA 2ZFAA 5CPMA 2TPSA 4OV9A 3W7QA 3S1UA 5HWNA 4JIPA 3MJYA 5AHIA 4DBEA 4FX7A 3S1WA 3INPA 1ZAHA 1H1YA 3GAKA 3W7MA 1FXPA 4BI7A 1TV5A 3P8JA 2ABBA 3OIXA 2ZTJA 1S3HA 1JCLA 3QMRA 3B03A 1LCOA 2ZDRA 4GFSA 4Z1CA 4DBDA 5TQLA 4LVBA 4BWLA 3G3MA 3IVUA 5FF7A 3RMJA 1RZMA 5FEWA 3OVRA 2FTPA 3O1NA 1FX6A 3NQ7A 4CQAA 4NJHA 1XI3A 1B4EA 1IXNA 4UFJA 2G96A 2JKPA 3NPUA 2GVJA 5DXXA 1HUVA 1V5XA 2J88A 3GKFA 2ZZ7A 5K4XA 4LRTA 4JTJA 4R53A 2NUWA 3Q58A 1TB3A 1QDSA 4LVAA 1G7UA 3KRSA 5KMYA 2QAFA 5FEXA 1QPQA 4A29A 1Y0EA 2RH9A 5EPDA 2C19A 5KZDA 1M6JA 2QCMA 2X1RA 1UJPA 5BRBA 3FKKA 4PL2A 4RCXA 4A22A 5A8GA 1KA9F 4MOZA 3KVMA 3NPXA 2B7OA 2J9YA 3EWZA 3L0GA 3NQAA 1ME9A 2E5BA 1XFBA 1LRTA 4UTLA 1ZJIA 3W87A 3TXVA 3W73A 1W5PA 2FB3A 3QRHA 2V30A 3CC1A 6TIMA 3W2JA 3P81A 1NEYA 3B0UX 5G5IA 5I3KA 3S5OA 1HL2A 2ZRUA 3IGXA 3M0ZA 4LUJA 4N9EA 5HULA 3HO8A 3MMTA 4FIQA 2B7QA 2KZHA 1KFBA 3G0UA 2HMCA 2QCFA 3PUOA 4UTJA 5G2HA 1K03A 3MW7A 5TBOA 1GPWA 1XCFA 4AF0B 1EP1A 1YPFA 4O4VA 3EWYA 1G4SA 4LC6A 1UCWA 4O53A 3NOEA 1VJIA 1OX5A 3STFA 3TFCA 1VQTA 1H1ZA 3MP3A 3LRLA 1WBHA 2BXVA 4NNAA 4EWND 3FA5A 3NO5A 5HQEA 3B8DA 2XN0A 2VFDA 2E5DA 4N4PA 2PRLA 4PCFA 3PULA 2VELA 3DU0A 2H3BA 2WJZA 3DBPA 3DHFA 2CZEA 3C4UA 4WZHA 3L0NA 3TMLA 1EEPA 3IVTA 3RFAA 1X6UA 5BOOA 1W5MA 2Q8ZA 1TYGA 4GUIA 3MBFA 4M6VA 3S1VA 2Z6IA 5I3IA 3S5NA 1N8FA 1F73A 2E68A 1G4EA 1THFD 5F2IA 2ISSA 3DGRA 3NM3A 2YR1A 3M5VA 1IF2A 4UMAA 5BNKA 2A21A 1K3UA 3ABRA 2Y7EA 1BWKA 1AW1A 4ONVA 4Q32A 5KITA 1KW1A 2E09A 3LHYA 3W74A 1KM0A 4WOQA 5HUPA 1YPIA 3KVKA 4Z1AA 4ORIA 3N2XA 3KX6A 4XWUA 3P8IA 4O19A 1VCFA 2OCZA 4IXXA 4MZYA 2VXNA 3VI2A 2ZA2A 3M41A 2VEMA 2OMAA 3LLFA 4UNLA 3Q37A 3WJZA 2Z6JA 5EYWA 4NUWA 1YTKA 3NQGA 3C2VA 4JIQA 3T44A 2ISVA 4ZQPA 3PG8A 1C29A 1GVSA 1GTHA 4UFMA 2NUXA 3LRMA 1W8SA 3UWZA 3G1FA 1N7KA 1P4CA 2R91A 1TMHA 4IMFA 4K37A 2E77A 2GJNA 4LU0A 4NZJA 4HSNA 3M43A 2CLIA 1WOBA 2QAPA 4GUGA 1FY6A 1GQNA 1M7PA 1K8ZA 1LLWA 1X1OA 3VE7A 3IRDA 3SI9A 1AL7A 3FYPA 3F03K 4MUZA 3TCEA 2E1DA 1Q45A 3KAOA 3Q2DA 2B4GA 4TIMA 5LNSA 4R33A 3W1RA 4DO5A 3E49A 3G3DA 4ADSA 3OG3A 5D05A 2VENA 3M5YA 5F4SA 2NX9A 4KFPA 5IBXA 3NAVA 4N02A 5MHBA 1O94A 4FXSA 1OX4B 3SIZA 3E12A 3OVQA 1IXQA 2QJIA 3L68A 4IOTA 3ZWTA 1I2RA 4XTIA 2E6YA 2J9XA 1RPXA 1FWRA 1ONRA 2ZRYA 5C6MA 2QDHA 1LBLA 4N6FA 1RQHA 1VHCA 4WOZA 1XL9A 5I3FA 1SW0A 3N14A 2JBMA 4A2SA 3W1PA 4Y96A 2CLHA 2FPVA 3G18A 4UTWA 2GJLA 1P5BA 4FIRA 5DCDA 3M5ZA 2V2DA 3LHTA 3FKRA 1PL9A 2Q8LA 3NL5A 1H7XA 3DKLA 1G69A 4I7VA 3PBWA 2BX7A 4BWLC 1T0OA 3OVPA 2C1HA 3DHDA 1GVFA 2JKEA 1TQXA 5F1UA 2FIQA 3NQVA 4Z08A 3C52A 1RQBA 4X3ZA 1OG0A 3IIVA 3PG9A 3LHVA 1XXXA 3DZ1A 3TW7A 1XBXA 3O6DA 2ZYFA 4ALDA 3BGGA 1MEHA 4NX0A 5EKYA 3I7SA 1H5YA 3CWOX 3NYZA 3T78A 3O05A 6ALDA 3W72A 3MYOA 4R7JA 3W2MA 3P5YA 2RDTA 3NQDA 2EAWA 3G1XA 2CZFA 3RNDA 2Q3RA 4UR8A 4RV8A 2ZCGA 4LVGA 3DFNA 5D2VA 1PE1A 1FXQA 3GR7A 4YCOA 4JY9A 4JX4A 4FNRA 4AEOA 4BI5A 1OF8A 1KM6A 4UFIA 4CCEA 3P62A 4Y6GA 1LDCA 4ZQMA 1LBMA 4S1FA 4K38A 5HWJA 3UD6A 4JEQA 3LGEA 5CZTA 3L65A 3W70A 2W0UA 1B3OA 3PVFA 4RX0A 2QEZA 2A0NA 3S0CA 3TFXA 4MY8A 5AHNA 3K30A 2G95A 1NVMA 5F2GA 2Y61A 5DCEA 3UY8A 4KWWA 1SO6A 5I3HA 2NXHA 2OZ0A 3U8GA 2V8ZA 3W1XA 4JTKA 4IJBA 1D3HA 2BZNA 3PM6A 4UCGA 1VGAA 4A3UA 1ALDA 4O1CA 1B57A 5FI8A 3MI3A 1JCMP 1JQXA 1WOAA 2NV2A 1O95A 3SJ3A 3M1ZA 3I65A 1RVGA 4O14A 8TIMA 2A7PA 1CX9A 2H8XA 5G1TA 5E1QA 3W1TA 5F1VA 4LW7A 2NUYA 4ORMA 3KFTA 4QITA 1GYNA 1HFBA 3S6DA 1U83A 4Y9AA 4AH7A 1IXPA 4FXRA 5LNVA 3A22A 3LBCA 3LCIA 3LHZA 3LERA 3FEMA 4DF0A 3O63A 4GUJA 4U4MA 5D2TA 1M5WA 4RZ5A 4FHAA 1YTDA 1DBTA 4MKNA 2JKAA 4UIOA 3QJAA 1F6KA 4ZQNA 1O60A 2QCCA 5K9XA 1W3IA 1TRIA 2ZZ6A 4CNNA 1OF6A 1A5CA 4BF9A 1F2JA 3LI0A 2ZRZA 1YYAA 4EOUA 1FUYA 4LUIA 4HNTA 3A24A 1DVJA 3LRKA 4OT7A 3O8AA 3MO7A 1PHWA 1NAL1 3E0IA 1MXSA 3KVLA 2H90A 3W2UA 2YCEA 5HNRA 1TTIA 2HS8A 1JR1A 3ATZA 1TSIA 1LORA 1TREA 4QNWA 4YXGA 1H7RA 3DAQA 3LXCA 4O57A 2LLEA 4HIBA 1TPEA 1EA0A 4JDYA 3U2OA 3GDTA 1JQVA 3YPIA 1VZWA 3BLIA 2FPYA 4UXDA 2A85A 3FS2A 3W7KA 3ELFA 4S2BA 4O0ZA 1A53A 3M16A 3H55A 3BVJA 1PV8A 3IVSA 2X2GA 1LROA 1AW5A 1XUUA 3TW6A 2C15A 3G22A 1XC4A 3R5EA 5KTLA 5G1YA 1H7WA 4AWTA 3O6YX 2QKFA 3P61A 3LTPA 3M9YA 4O28A 2HS6A 2ZRVA 4E38A 4K7YA 1TPUA 4Y8FA 1C9DA 3QW4B 2B7PA 3FYOA 3ZWSA 3N2MA 5CSSA 5D32A 4NJKA 1LYXA 4LS2A 3THAA 5L9FA 1VLWA 4UNKA 1SFJA 3M7WA 1DOSA 2TMDA 2CLMA 3W1UA 3STCA 3CEUA 3QSTA 4YMZA 1QPNA 3PBYA 1KLYA 1QOPA 1PVNA 3S5ZA 1W3NA 5LNWA 5C5YA 3QMTA 2DP3A 2WPBA 1Q6LA 4AWSA 1G6CA 3E02A 5IBXC 2X1UA 2YW3A 3CLMA 1CI1A 1ICSA 4WX2A 4DO4A 4FNTA 1RQEA 3DI0A 4QNEA 3I7RA 5HJLA 3IIXA 3UWVA 2X30A 2QCDA 4RK8A 2QCDB 1KLZA 1LLZA 2CLOA 2RFGA 5LSMA 4JTGA 4ZMGA 5E0KA 4JD4A 5AC8A 1XDLA 3QW3A 3TX9A 5LHFA 3GXTA 3W7OA 1W3TA 3T7VA 3TSBA 2ATMA 3LOTA 2PCQA 4O13A 1WX0A 3JR2A 4UTWC 1FCUA 1A50A 5LKYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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