3SCRA

Crystal structure of rice bglu1 e386s mutant
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNEPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITSNGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase 7
publication title Structural investigation of the basis for cellooligosaccharide synthesis by rice BGlu1 glycosynthases
rcsb
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 194
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2011-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3scrA00
3AIVA 1E55A 1KXHA 4ZXLA 2OSWA 4OOZA 1BTCA 3LMYA 3PZTA 3WNMA 5A2AA 3UESA 1DTUA 1UH4A 3EDKA 3VGHA 1EIBA 5E6ZA 1WB0A 1EHNA 2QMKA 4F9JA 1Q4NX 3WUGA 1HNYA 3NYDA 3T09A 1E4NA 1HP4A 1OSEA 1EA9C 3IANA 1EGZA 3FAWA 3PZQA 2JEQA 3GH5A 1UOKA 2XWDA 3PZOA 4BA0A 4D71A 2E40A 4MDOA 3GXIA 4HOWA 3VX1A 4S3JA 1XV8A 1KB3A 4CD7A 3VINA 2YKKA 2PBOA 1J18A 4D6GA 5A6LA 1E6XM 1KXVA 3MUIA 5I77A 1CGXA 3WEOA 2WVUA 2JF6A 4HU0A 3WQ6A 4GPNA 5I6SA 3CO4A 2WMGA 4AEFA 1TA3A 3HMCA 4UQAA 5FKYA 3TONA 1B1YA 5F7UA 3F5KA 3WSUA 1BAGA 4GZIA 2J79A 1W3KA 3T0AA 2W67A 4P7LA 1W9BM 3VNYA 1R7AA 4CD6A 1KWKA 1RD6A 2WW5A 1D2KA 3AS1A 5ECUA 2ZXAA 2VX7A 2PI6A 3UEQA 2XVNA 2ESCA 3NDYA 3APGA 1CXEA 2J77A 3A3HA 2YBTA 4TUFA 4GO9A 2PC8A 4PSRA 1WZMA 4LGXA 1F4AA 2VR4A 4WJXA 2YL9A 4P7RA 5CQ1A 3ARQA 4MB1A 5EB8A 5I0DA 2PWHA 2A3HA 4ZE4A 3UG5A 3SIMA 1IV8A 2WC4A 4L4OA 4KGJA 1VEOA 2EO7A 2DT1A 3AIEA 3SCOA 4TX6A 4CCCA 2D2OA 3N17A 2E9MA 3W27A 3PZ9A 1GOMA 3M7SA 4QAWA 1HJUA 1MWOA 2ZUVA 1E6SM 2WNWA 3A4AA 2NW0A 3SCNA 4DWSA 1EO7A 3VIPA 3ZM8A 4UFHA 3VIMA 3QOKA 1LWHA 4JAWA 4V27A 3SCPA 1E4MM 3OA5A 1CECA 1LF1A 5HBFA 2OSYA 3WNPA 4CCEA 1FFRA 1S46A 3VGDA 3BAIA 3L4ZA 2D22A 2GJPA 4PBGA 2EPOA 1CYGA 2VCAA 3IK2A 4J3VA 2WBKA 1FOBA 1KQZA 2WKGA 9CGTA 2J25A 3NSNA 2C7FA 1E0VA 3WF3A 2PWDA 5AC4A 4PMRA 2PWFA 2X0HA 3T2PA 3NJ3A 2YDQA 3TTQA 4MPKA 3AHTA 5ABGA 3RCNA 4EE9A 4M81A 2Q8XA 1OD8A 3M6DA 1U33A 3OIHA 3FNDA 3W81A 3AXXA 1FA2A 1CXKA 1V6WA 2VUYA 3A47A 2CCRA 2W92A 4OJYA 1AQ0A 1GUVA 1HJQA 1E6QM 2JALA 2G3JA 3VDAA 3AS0A 2VVSA 1GJUA 1HKJA 2UY4A 4PUEA 1F4HA 2HVMA 2D23A 4URIA 1JAKA 4S3KA 3HN3A 1UZ1A 4U5KA 3L4WA 2E9LA 5I5RA 4FLRA 4CGTA 2BHZA 1UA7A 4K68A 3ZSSA 1ITXA 5DMYA 2A3EA 3ALFA 2FHFA 2J47A 4AD1A 1TE1A 5FCZA 4LX4A 1G94A 1ZJAA 4B9ZA 5CXPA 3AHYA 2DGAA 4DWSD 1R87A 1W9XA 4C7DA 4A4AA 4BQ2A 2WXDM 1FH9A 4AIUA 3MKKA 4UFLA 1ISZA 4M80A 4UNIA 1YQ2A 4ZENA 3SUWA 5BRPA 2C0HA 2CITA 3NUKA 4J27A 3L4XA 3EDFA 4W5ZA 3WD2A 1XH0A 4AZGA 4M8UA 5CGTA 4UOZA 3ARPA 4W8AA 3BMWA 1K9FA 4W85A 2VRJA 1MW3A 2G41A 1J12A 1UH2A 1Q6EA 1KR0A 5LYRA 4L4PA 1UKPA 3WN6A 4WLCA 4F8XA 2D20A 3NCOA 1PBGA 1CGUA 3VMNA 2MANA 3WMCA 1QHPA 3JUGA 2XGBA 1AQHA 1O7AA 2IUZA 1JFXA 2XGIA 1GCYA 1ZBKA 2GK1B 4AZHA 5M17A 3ARYA 2XVPA 2RGMA 5A8MA 3W4RA 3HJEA 1ODUA 1V3KA 4AEEA 5AY7A 3EDJA 3UG4A 5CSYA 3WNKA 2G3NA 2ZXDA 1XYFA 1HL8A 1Q6GA 1HP5A 1V3IA 3WEZA 4XV0A 4AZCB 8A3HA 1UYQA 3CUFA 3VIOA 4OZOA 2ZX8A 3SCUA 3WMSA 4AXNA 1FFQA 3AYSA 1LWJA 2OWXA 1CGYA 4P7NA 4TVUA 2ZX7A 4BCEA 1QBAA 1EXPA 1J0IA 3WH7A 1WDQA 3RO8A 5GNYA 4WK9A 1TCMA 1B3YA 3WNNA 3VD5A 3RM8A 4CN4A 1CZ1A 1W9PA 2WLYA 3L4UA 4JCLA 2ZUTA 4UQBA 4P8WA 4MB5A 2X09A 3VX0A 1NP2A 3IJ8A 3MSGA 3AHVA 4ML4A 1QW9A 1JIBA 4W7WA 2XPKA 2QMJA 1L0PA 3MMUA 4HMCA 1K9EA 3CHEA 4RE4A 1KQYA 1W9DM 1IT0A 1SFSA 2VZUA 2WYSA 2NT1A 3MO4A 1JYXA 4UZSA 2WHMA 2W62A 4D6CA 1JNEA 1PZ2A 3FHAA 1KFWA 2BNJA 3ZJKA 1BG4A 1E6PA 3T0BA 1JD7A 1WZLA 3PN8A 1DWFM 1WAWA 5I24A 4JIEA 3J7HA 4JL2A 1BQCA 3ZJ7A 1Q6CA 1QI5A 2NSXA 1A47A 3K46A 1C92A 5A6MA 3U5YA 2J7FA 2AMGA 3ZT6A 1VFUA 3WD3A 5A69A 2WCAA 4AZCA 3F4VA 4HPHA 3MV01 3MUZ1 1UD8A 4W93A 3WNLA 3S2CA 1FHDA 1SMDA 3GDBA 3WDIA 1XH1A 4ACYA 4BF7A 1E70M 1EH9A 3VM5A 4WKHA 3VUPA 3ZR5A 2ZWZA 3WUFA 2V5DA 1PAMA 3WUBA 1JF6A 2EQDA 4IM4A 3KE0A 2Z1KA 1OD0A 1CENA 2FHBA 2Y4SA 1R86A 3CHDA 4H8UA 3EMZA 5JIPA 3HU7A 3WF4A 1OINA 2W61A 4PCTA 4D6EA 2HISA 3GBDA 2GSJA 1MW2A 3U7BA 4MNJA 1JYWA 4J7RA 2UY5A 1E73M 3AZTA 1CTNA 2OLHA 1V02E 1N82A 1UD4A 3VGEA 4W86A 3WBAA 4F79A 5IDIA 3RJXA 1M04A 2O9OA 2XHYA 4TX8A 3CUHA 3EBVA 5HPOA 3ZO9A 1AMYA 4PTWA 1GVYA 1ECEA 4TOQA 1JD9A 4QLLA 1B9ZA 1YHTA 3PZGA 2ZOXA 3L4VA 4DUWA 1J0HA 1A3HA 2QHAA 3ZR6A 3OGSA 3AZRA 6TAAA 4FLOA 1G9HA 3WF1A 1HN1A 3TA9A 4GZEA 2XFFA 5EMYA 2YL8A 1JI1A 4CD8A 5GNXA 3PTMA 3OZPA 5KZ6A 4JFWA 1GPFA 1H4PA 5FL0A 3VDCA 4UCFA 1B31A 3OLDA 4FLSA 4PMDA 4PMXA 5EFDA 1FH8A 1L8NA 2O9PA 3AMGA 4X0NA 5I78A 1XGZA 4W7UA 2XTKA 3II1A 4B3KA 4H7VA 4UR9A 2ZUUA 4TVCA 4QDMA 5CLWA 2CHOA 2X8RA 1LJYA 1UKQA 2VNCA 1V3JA 1E72M 1OGGA 4LYPA 1W3JA 2YL5A 1J0KA 4KMQA 1VENA 4GKLA 1XYZA 4BQ5A 2D0GA 4BZYA 4E4PA 2UWFA 5C8BB 3WEMA 1R8LA 3PZUA 1VF8A 2WWCA 1WCGA 1QHOA 1E1FA 1QI2A 1V6XA 2CEQA 1VJSA 4W7VA 4DUVA 1OT2A 1W3LA 3DYPA 3EMCA 2XVKA 1TVPA 2WMFA 2DH2A 1B2YA 4WSKA 2D1ZA 2YL6A 5D4YA 4AZIA 1OIFA 4IPNB 1U2YA 3VGBA 4Q7NA 4EKJA 2WMKA 1DWJM 2EPMX 4MNKA 1GHRA 4YPJA 4PTXA 4DM2A 4DWSB 1QNPA 3THDA 1VEMA 2CHNA 4U33A 1HT6A 4ZEPA 5A6SA 2G4FA 4D6JA 3WMBA 2WC7A 5HXMA 5A8NA 4D6DA 1LL7A 2E3ZA 1UR1A 3O6AA 3K8KA 3W26A 1UR4A 2AOSA 3FN9A 4NRSA 1BVZA 4ACZB 4TTGA 3ARWA 2QV4A 3ARSA 3I3EA 1PIGA 3ALGA 1WZAA 1GOKA 2PB1A 4KRUA 1R7OA 2RGLA 2WZHA 3SUVA 1E5JA 1V02A 1CLXA 3ZJ6A 2CKSA 1E6RA 1CBGA 4KWUA 2VR5A 3VO0A 1DWHM 4RE3A 5FL1A 3ZIZA 1V0MA 1FP8A 4BQ4A 3BCDA 3VILA 1EO5A 1LLOA 1JZ3A 4UFKA 1GORA 1BHGA 1GOIA 3K8LA 5JBEA 1WE5A 2DT0A 2J8FA 5IFTA 2WMHA 1B3VA 1E15A 1KGXA 5KEZA 5E0CA 1M01A 1JZ4A 2BVYA 3AMLA 1C91A 4WIWA 4AC1X 1UQZA 2VX6A 1MW1A 2WWDA 1KR1A 4NZCA 1X6NA 1HXJA 4D1IA 3PZNA 3F5LA 1HJSA 5A6KA 4V28A 4J3SA 1QOXA 2XVGA 1NOFA 3CUIA 3VGFA 3CMJA 5EBAA 4MDPA 1UKSA 2BY0A 4GINA 2E0PA 2DDXA 1E6NA 4LYRA 3OLIA 4AYSA 1OT1A 5ABEA 1H2JA 3L4TA 4PCSA 2CERA 2WMIA 2VL4A 3WD0A 4E8CA 2EEXA 3IAQA 3RMEA 3LPGA 5I79A 2V3GA 4MB3A 2VCBA 4ACZA 4H41A 4J3WA 1MXGA 1M03A 5BWFA 1JYNA 2CBVA 1SYTA 3DHUA 1W1VA 3CZGA 4OUEA 5DO8A 3WQ8A 1XRVA 1EQCA 4JZ5A 3WDJA 3T2QA 5A8PA 2JF7A 3LPOA 2WSPA 5DT7A 1H5VA 1NARA 2XFYA 4YHEA 2ZX9A 5AYBA 2CKRA 1UD5A 2VURA 3MUY1 1JG9A 3W38A 1UHVA 4PSPA 3TOPA 4IPLA 4CCDA 4GO8A 3SCWA 4J28A 4AZ5A 1VB9A 1UR9A 5A95A 2E4TA 2CETA 1ITCA 4OIFA 1OGSA 3AYRA 1CNVA 3POHA 1G01A 4H2CA 1KXTA 2VTFA 4D72A 2ZICA 4HOXA 3PTKA 4JKLA 3EDDA 3EMQA 4UOQA 1MQPA 3GH4A 2WHJA 1PX4A 1BPLB 4PEEA 5M03A 3A4XA 4PRWA 4Z2IA 2G3MA 2XYLA 3IJ9A 5D9PA 1PEZA 1XSKA 2UY3A 3KWXA 5IHSA 3OG2A 2Y2WA 4MAZA 1C7SA 1ZBWA 1C3FA 1E0WA 1FH7A 2WK2A 2WVSA 1XD1A 2YJQA 3MU7A 5E6YA 1H0GA 3B9EA 4PN2A 2WM0A 4CVWA 1V3LA 1OGBA 3AS2A 4Z2LA 3N18A 1VBUA 5BXPA 3K8MA 5I3DA 5CSUA 3ECQA 3AROA 4J3XA 5E70A 3NSMA 1W3HA 1WPCA 3WNOA 1O6IA 2CPUA 5I2UA 2J78A 3BSGA 4AD4A 4CU6A 5JUVA 3AMDA 4ZFMA 1QBBA 3TTYA 1GJWA 4F9DA 1JZ5A 1V0LA 4W88A 2BHYA 3VTRA 4WKFA 1E0XA 1E5NA 1VJZA 3VPLA 1HF6A 1OB0A 2WPGA 2ZUMA 4AWEA 3WIJA 4PMNA 4UFIA 1VAHA 4NF7A 4UFJA 4AD5A 4AZ7A 2JEPA 3VIKA 4M29A 3AS3A 3O2LA 5IHRA 3IAPA 1BGGA 2J62A 2DIJA 4JHZA 5BYWA 4DUXA 1V0KA 4HA1A 4B3LA 2VZOA 2BXYA 4AW7A 4JFVA 2A3BA 3UR8A 4PMYA 5D9OA 4CU7A 3AHZA 2FH8A 4GXPA 4JCMA 4QLJA 3M07A 4UZUA 4HU8A 3N04A 4WKAA 3CUJA 4W89A 1G0CA 4U2ZA 3GM8A 1EHAA 5A1AA 1VFOA 3W37A 2NT0A 5FOOA 1HVXA 5CG0A 2D0FA 3RJYA 3WH8A 3KEHA 4LQ1A 1W1PA 3W53A 1CLVA 3AISA 2AAAA 2VT0A 2VQUA 5HPCA 3B9AA 5D9NA 3VU2A 5D8WA 4A3HA 1J0YA 2UY2A 4U31A 3AI0A 1KBKA 4TTUA 4Z2GA 1UZ4A 5C71A 1CXFA 3WDPP 1NOUA 2JIWA 1GVIA 4LPCA 2DPEA 1DWAM 3IJ7A 2BFGA 1UWRA 3ZT5A 3CTTA 1GOOA 2OYLA 2VRQA 1MQRA 2C8NA 2WSKA 3W0KA 2VCCA 3BAKA 1VIWA 2DIEA 2OSXA 1GOWA 2WVTA 4M56A 1CPUA 3CPUA 3W25A 2J4GA 3DYOA 2EJ1A 1BFNA 3AHXA 4DWSC 4RL3A 3SCTA 4CD4A 1GQKA 4BS0A 4PMVA 2WHLA 2WZIA 5E0FA 2ZUNA 1CEOA 4W84A 1V3MA 1TVNA 4H04A 4PTMA 3QGVA 1JNDA 1UWIA 1V6YA 1GNXA 2BY3A 2WLZA 3EYPA 1C90A 4V2XA 4W5UA 2G3IA 3W6LA 3BC9A 2W5FA 4HMEA 5A6BA 3POCA 2FHCA 1I1XA 2ZX5A 5JIWA 5E09A 1QNSA 1EDTA 1H0IA 3VDBA 4PTVA 3CZKA 3N13A 1CGWA 3VVGA 1HKIA 2O9TA 1RP9A 4JHOA 2V5CA 1H49A 5D9MA 1QVBA 3BXWA 3SUSA 1H11A 4U5IA 1BVNP 2VX4A 3GXFA 3K4DA 1CGVA 4J3UA 2FGZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AIV A;  1E55 A;  1KXH A;  4ZXL A;  2OSW A;  4OOZ A;  1BTC A;  3LMY A;  3PZT A;  3WNM A;  5A2A A;  3UES A;  1DTU A;  1UH4 A;  3EDK A;  3VGH A;  1EIB A;  5E6Z A;  1WB0 A;  1EHN A;  2QMK A;  4F9J A;  1Q4N X;  3WUG A;  1HNY A;  3NYD A;  3T09 A;  1E4N A;  1HP4 A;  1OSE A;  1EA9 C;  3IAN A;  1EGZ A;  3FAW A;  3PZQ A;  2JEQ A;  3GH5 A;  1UOK A;  2XWD A;  3PZO A;  4BA0 A;  4D71 A;  2E40 A;  4MDO A;  3GXI A;  4HOW A;  3VX1 A;  4S3J A;  1XV8 A;  1KB3 A;  4CD7 A;  3VIN A;  2YKK A;  2PBO A;  1J18 A;  4D6G A;  5A6L A;  1E6X M;  1KXV A;  3MUI A;  5I77 A;  1CGX A;  3WEO A;  2WVU A;  2JF6 A;  4HU0 A;  3WQ6 A;  4GPN A;  5I6S A;  3CO4 A;  2WMG A;  4AEF A;  1TA3 A;  3HMC A;  4UQA A;  5FKY A;  3TON A;  1B1Y A;  5F7U A;  3F5K A;  3WSU A;  1BAG A;  4GZI A;  2J79 A;  1W3K A;  3T0A A;  2W67 A;  4P7L A;  1W9B M;  3VNY A;  1R7A A;  4CD6 A;  1KWK A;  1RD6 A;  2WW5 A;  1D2K A;  3AS1 A;  5ECU A;  2ZXA A;  2VX7 A;  2PI6 A;  3UEQ A;  2XVN A;  2ESC A;  3NDY A;  3APG A;  1CXE A;  2J77 A;  3A3H A;  2YBT A;  4TUF A;  4GO9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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