5AHM | Genus

Total Genus 112

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	112
sequence length	378
structure length	354
Chain Sequence	MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHETAKAKTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGEIELFQGRSYKSYRGMGSLVPEGIEGRVPYKGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGAGMAESHVHDVQITKEAPNYR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
publication title	Crystallographic Studies of Two Variants of Pseudomonas Aeruginosa Impdh with Impaired Allosteric Regulation pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus	112
structure length	354
sequence length	378
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2015-02-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5ahmA00

3W7EA 4D2JA 3STGA 3OA3A 4GUJA 4XKYA 3UZJA 2FB2A 4CQ8A 4K36A 4LOCA 2J27A 3TMLA 5AFDA 3LCHA 3FEMA 4GUHA 1YADA 4RZ4A 3UWUA 1TQXA 3MHFA 1YPIA 4LUJA 3DFPA 3WJXA 4AHQA 2CLHA 1YXYA 3KVKA 3M47A 1GYLA 5DY2A 3B0VC 5H2ZA 1GPWA 1HG3A 4RV8A 1FWNA 3PUOA 1GTHA 2V82A 3P80A 3FKKA 4NNBA 4R7JA 1SW7A 5D30A 1Y0EA 3UQNA 4JTEA 3GXNA 1W31A 1HTIA 2C3ZA 1YDOA 3R2GA 4MJMA 3W3OA 4ZQRA 5F1UA 4O17A 3LLFA 1LZOA 3B8DA 5F2GA 3NG3A 1TJPA 1JUKA 1WYIA 2QCDB 1SSGA 3G22A 3EX3A 5D02A 3A21A 1A50A 3GKFA 1EP1A 2WSYA 1ZAJA 3LTSA 1WBHA 4JDYA 3B4UA 5EL1A 4O57A 4LRSA 4UFJA 1F6KA 2HSAA 2NX1A 4UTTC 2FQIA 5F2MA 3B06A 3LLDA 1PIIA 1EUNA 4UMCA 2E6YA 3I7QA 1NFBA 3BLFA 1YTDA 3P8JA 2HTMA 4ZQCA 1EUAA 4TO8A 4TU1A 3I6RA 3S5ZA 4LVFA 3G1XA 1KA9F 1V7YA 4N9DA 1G67A 4LTSA 2E6FA 1XC4A 4C1KA 2WPBA 1M5WA 3A24A 4IMFA 4LW7A 3B04A 4UNKA 4WOZA 3SJ3A 2OJPA 1QO2A 3G1VA 3MWAA 3TR2A 1G4EA 4MKNA 3LX9A 2ZTKA 4IMEA 3STCA 1RQEA 3NPVA 5E93A 1CW2A 1E51A 4QITA 1TPDA 1H50A 3DKJA 2QCDA 5BOOA 3C2EA 1B4EA 1LOSA 3UWYA 2WJZA 3UY7A 2Y70A 2V5BA 1OX5A 3PS7A 1G7VA 3W1TA 4A21A 2TMDA 1LBLA 4EIVA 4UFHA 2EPHA 1TYGA 2RH9A 5CZ0A 5J5RA 1G4PA 2CZEA 2QCEA 3QMRA 3MBDA 4Q32A 3DFSA 1SO3A 2WNZA 4MYXA 4LU0A 4XUGA 1SUXA 3W7CA 1SZFA 4NJIA 2Q3RA 3QW4B 4XTDA 1MO0A 4AB4A 3PG9A 1RV8A 3I68A 1BTMA 1H7XA 1H62A 3A22A 4IXXA 3NL2A 5H91A 1H7NA 1F2JA 3M41A 4DXVA 3PB0A 1J4EA 3TKFA 3BK0A 3UXAA 2Z6JA 3S1VA 1J2WA 3W1RA 4WQ6A 2AQWA 3DHDA 3WK3A 3FYPA 3HPXA 1W5PA 4IX0A 1UASA 1PS9A 2E6AA 4EF8A 2VEIA 1EX5A 3M0ZA 2OX1A 2VFEA 1PHQA 2OZ0A 1Q6LA 4UTWC 1H1ZA 4HPJA 4IMCA 2NLIA 3NL6A 2G97A 5KTLA 2JKPA 1KFEA 5D2VA 3W2NA 3BGJA 2ZRVA 1KM5A 3QJAA 3A9IA 5E0KA 3W87A 2ZZ7A 4E38A 2VFHA 1KM6A 4O28A 3HB9A 4DELA 4CCCA 2UV8G 4U4MA 1H60A 3N73A 1W8SA 3LHUA 5LNWA 5C54A 4AHPA 1X8FA 3MYPA 3W9ZA 3T78A 1QPRA 3FYOA 1SQ7A 5AYZA 4HNTA 4JTHA 1XFBA 4JN6A 3MHUA 1XL9A 4FX7A 4FNQA 3NR0A 4P2VA 4JX6A 1RVGA 4MY1A 5K9XA 3BG3A 2NXHA 3SFKA 4AF0B 2TYSA 3W7GA 2XN1A 4RX0A 3THAA 2TSYA 3UWVA 2AGKA 2RFGA 3QMSA 2VKZG 4LVBA 3OIXA 3BO9A 4GBUA 4O4WA 5G4EA 2GQ9A 2TRSA 5K4ZA 3NPWA 4N6FA 3KXQA 4JTSA 6TIMA 1VCFA 3ZR4A 3H53A 1W5QA 4W9TA 2J9ZA 5LHFA 3NZRA 1KBIA 5AHIA 3EXTA 1WDWA 1YPFA 2TPSA 3L9CA 1D9EA 3U2OA 3WJWA 1W37A 1LRTA 1XCFA 1S5WA 3E02A 4ZMGA 1IF2A 2WO5A 1O94A 2C14A 1LRQA 1MEWA 4OV9A 1I4NA 2PC4A 3W88A 5F2LA 3S1XA 4TIMA 1K8YA 3BV4A 1TPB1 3KHJA 3TIMA 3IIZA 2D73A 2J9YA 1LDCA 3EX2A 1DJNA 2ATSA 1TMHA 1PHWA 5CZTA 3KX6A 3C2FA 2QCCA 3N2MA 1KFKA 3HG3A 1W3NA 3OVQA 2ZBTA 4UTKA 4JYDA 3M5ZA 4QQ3A 1VR6A 2NX3A 4DEFA 3NQVA 4QJ1A 5DY3A 1H7RA 5LNVA 3YPIA 1T0OA 1UB3A 3ZFHA 5L9FA 2CFFA 4CLMA 3P60A 3LI0A 3S9YA 1JCMP 3L21A 3WJSA 4Z1AA 1ZY9A 5HJLA 3BGGA 3SGZA 4RR4A 1TRIA 3JRKA 3R5EA 3HIJA 2J24A 2Z2UA 3MMTA 1SO4A 3BW2A 3IGSA 2GPTA 3GX9A 2ZDRA 2NWRA 3W2UA 3BG9A 3CWOX 4FNUA 2YX0A 4GC4A 1OF8A 2VFGA 2QAFA 4BWLA 4HPXA 4QISA 5AN7A 5D03A 1JCJA 4CQAA 4QNWA 1XBVA 5AHFA 3W83A 4JTLA 2J9XA 5LSMA 4M6PA 3L0KA 3LERA 2OMAA 3UWZA 3TUUA 2YYUA 3NQMA 3O6CA 2DZWA 5D09A 3GDTA 3RU6A 1O5KA 1EWEA 3EKZA 4A22A 1I45A 3IIPA 4X2RA 4HSOA 3B0PA 1L2UA 3W70A 1JULA 1ZAIA 1R46A 3GXPA 4JEQA 2Y61A 1JRBA 3FKRA 5A5WA 3THQA 2YXGA 1YDVA 3P74A 4BI7A 2A7PA 1F76A 3P8IA 2A6NA 1B9BA 3PUDA 3W7LA 5HWJA 3L65A 4HSNA 3WK2A 4XWUA 5DXXA 3S1UA 2WSRA 3ABQA 4POCA 1TIMA 3HG4A 3OHIA 1RD5A 4E0CA 1K02A 3SI9A 2ABBA 3N3MA 1KLZA 2NZLA 2ZA3A 2QEZA 4BF9A 1OJXA 3W1XA 3GR8A 1C9DA 3R8RA 3N34A 3MJYA 5AHLA 2A4AA 3M5YA 5HMSA 2B7NA 4K7VA 1X7FA 4O10A 3B05A 1FUYA 4MY8A 2ZRZA 3UNDA 2NX9A 4O8RA 2V2HA 1F6PA 4O18A 2CLLA 3VNDA 1WOAA 2YZRA 1QOPA 3FFSA 4S2BA 2ISSA 3CT7A 4JGDA 1T96A 3W1PA 4O1AA 2JGQA 2C18A 2CZFA 2FDSA 3W07A 4CNNA 1G6CA 3LCWA 4RJEA 2EGZA 5FEWA 1GT8A 3BARA 1EWDA 4IQLA 1GTEA 5D05A 3FJLA 4WY0F 1OYBA 4CCEA 3EX6A 3LRMA 3HGJA 3DI1A 1KW1A 4N02A 1J5TA 3GDLA 1HL2A 5ABTA 3IVTA 1NVMA 2FPTA 1LYXA 3FOKA 5AOUA 3MP3A 1OF6A 2Y85A 5D38A 2DP3A 1SR9A 4NZFA 1F5ZA 2Y7GA 1DVJA 3EEGA 1GJPA 3IGXA 3LHWA 3W7DA 2WNQA 3W7RA 3S5NA 3W1AA 4UIOA 3TC7A 2CLFA 4FNSA 1OX6A 3W85A 1T99A 4OWGA 4PL1A 1W5NA 1F74A 5F4XA 4NU7A 4JS3A 1JUEA 4DBEA 4ONVA 3CIXA 1AW1A 3TXZA 1X1OA 3E0IA 3G0XA 2J6XA 2QJHA 4MY9A 4P61A 1TREA 4Q33A 3SY5A 3NQCA 3M1ZA 1R2TA 1KV5A 3KRZA 3G0SA 1B4KA 1G4SA 4WXZA 2DZSA 4ZZ9A 3N9SA 5D2WA 4CNOA 3TSMA 3CLMA 5IBXA 5G1YA 1A5AA 3TU9A 1OFAA 4QIUA 4ALDA 4A2RA 1OFQA 4A3UA 3O16A 1VLWA 2CLKA 1AL7A 3W84A 1ADOA 3W7OA 2Y7EA 1FWTA 2E6DA 4EF9A 2X1RA 4S2CA 5KZDA 1DKWA 3LOTA 1W3IA 2ZA1A 3GVGA 1KLYA 3CWNA 1QDSA 1EPXA 1KTCA 3G1FA 3L2IA 4QNEA 2V0TA 3LXCA 4ZQPA 1XKYA 3G18A 1U83A 2CZDA 3TAKA 1GEQA 3TROA 4NXKA 4RZ6A 3OBKA 4HN4A 3G1AA 1YYAA 3VE7A 5G1TA 4ZQNA 3LCIA 3TW6A 3PAJA 4AAJA 4NJHA 3KOFA 2ZA2A 3QMTA 1HO4A 5EMUA 1BKSA 1UUOA 4K8EA 3NDOA 3NQFA 2NUYA 2CZ5A 3HPSA 3DFNA 5KMYA 4NXSA 5CSRA 3P61A 5FF4A 1H51A 4EWND 4O54A 2QKFA 4JTJA 2Y63A 3O15A 1H63A 3W86A 3HF3A 5HULA 2FIQA 5D33A 3W1QA 3WFAA 3W1NA 2W79A 4N4QA 1FCVA 5KINA 3M5XA 3M6YA 2XN0A 3NQGA 4O15A 4FX8A 1WX0A 5FI8A 3PR2A 2JKEA 1TPWA 2PRMA 2DORA 2DJLA 3F03K 4BR1A 3VFLA 1GVSA 5EKYA 2EF9A 1N55A 3RF9A 3NM1A 5KZMA 3IRDA 1VC4A 3NYZA 3CC1A 3M5VA 3P82A 3DAQA 3LRLA 3A5FA 1AW2A 4OV4A 4Y8FA 1SZEA 3CB8A 2B4GA 2P1FA 4TR9A 4LVGA 4LUIA 1SW3A 4GUIA 4JD4A 4O4VA 4UMBA 3U6WA 3HQ1A 3HJZA 1W56A 1C8VA 2BX7A 3TA6A 3DXIA 4WZHA 3G8RA 3SW6A 1FBAA 5DBTA 2CW6A 3I7RA 1D3HA 3M43A 4TMBA 4LV9A 3CU2A 4Y9AA 4AXKA 1R2SA 3L67A 3SSJA 3C0JA 4MUZA 2CLIA 3S6DA 2H8XA 4UMAA 5K7JA 4ZQMA 4LT9A 2Q8ZA 2AAMA 4UR8A 3TNOA 1TTQA 3MUXA 2A7NA 4R53A 4AH7A 2YFNA 1TTJA 5G2IA 5IM51 3S0CA 3IGUA 4ORMA 5G2HA 4KFPA 1FXQA 5AC6A 2XFWA 1KM0A 3JS3A 1PCWA 1LROA 2ABAA 3UPWA 3DENA 1QPQA 3LCFA 3GAYA 5D37A 1SSDA 1GVQA 2ZFAA 1VH7A 1P4CA 3MO7A 3Q37A 1NSJA 1TB3A 3NL5A 2J88A 2WQPA 1FDJA 2A21A 3S5OA 2YPIA 2NUWA 3O6DA 3NQEA 1PV8A 3V75A 1FQ0A 4HNNA 4PL2A 3K30A 3WJZA 4JNMA 3N9RA 3NPXA 5CPLA 1QMLA 4NX0A 4WOQA 3SIZA 3ATYA 3PG8A 1A5BA 4DPPA 5AC8A 1RQHA 3MHGA 1JCLA 2DU2A 4UXDA 2CWNA 1KV8A 5CPNA 4XZ9A 3LDVA 1ML1A 1RR2A 1TPC1 2NV1A 4IGHA 1XDMA 4UFMA 3LM7A 1MXSA 1SZGA 8TIMA 5K3VA 1TPVA 3W76A 5HNRA 4RCXA 4WXYA 3WK0A 4MYAA 4PC8A 2QCLA 2X1TA 1WV2A 3L5LA 3W7PA 1DHPA 2ZRUA 1YTEA 1RPXA 4FNPA 5D32A 3BVJA 3LV6A 2QUTA 4JIPA 4BWLC 1BWKA 1M7OA 1FDYA 3INPA 1L6YA 1OK4A 3EWYA 4ADUA 1A5SA 1FCUA 3W74A 3DH7A 3LHVA 2BXVA 3GNDA 4NT0A 3E9AA 4YMZA 4PTNA 2C19A 4X9SA 4Z1CA 4J9JA 3ANYA 5E1QA 5BRBA 3N14A 3B0UX 1F05A 4IXHA 4WX2A 1KM4A 1Z44A 1VHCA 4OT7A 3ZWSA 3HO8A 1I8JA 5EA9A 3LCXA 2A2IA 3LCLA 1JCXA 1OVDA 1VYRA 4MLJA 1FDZA 1N7KA 1YXDA 1EEPA 5FF2A 3LB0A 5G2WA 2QDGA 3HPZA 4AHOA 3FS2A 1GVRA 4FIRA 4FX6M 2F7FA 2WV8A 4DF1A 5LNSA 1LLZA 3W23A 4Z0SA 2GJLA 4Z08A 4LC8A 2QUVA 4IUOA 3F4WA 1KFLA 3BW3A 5KZEA 4EVZA 2ZRXA 3TCEA 3CM4A 4YCPA 2GJNA 4CQ9A 2A85A 4WD0A 3CEUA 4UC5A 3TXVA 1LOLA 2ZZ6A 2Y7FA 5BW6A 5CGQA 1XBXA 2CLEA 2RHGA 5EPDA 4O50A 5U4NA 3T55A 4IMDA 3TV8A 1JJKA 5SWUA 2GQ8A 3DFOA 2VOMA 3E49A 3GLCA 1Q3NA 1FWRA 4I7WA 3TFCA 2F84A 4AF0A 1O95A 5FF7A 1LBFA 1EP3A 3P62A 3RLUA 4O0ZA 3P81A 3G1YA 2VELA 3GDMA 2I1OA 4K6AA 2ZRWA 3O6YX 1H1YA 1TJRA 1R30A 1YLVA 4AEOA 3IVUA 2B0MA 2X30A 1RQBA 2PURA 1UCWA 2ZYFA 1DJQA 2GUUA 1I2NA 3HGOA 5HQEA 4IPIA 3NM3A 4DF0A 5BNKA 4PEKA 2ZTJA 1S5VA 3O8AA 3ABSA 4JXCA 4JIQA 1X1ZA 2VFFA 4K38A 4GXMA 1A53A 1FY6A 3W2MA 4DPQA 2R94A 1CI1A 3HOJA 3PBUA 3KVJA 2BSLA 4K37A 4Y96A 5HWMA 1MSSA 1M7PA 1VRDA 1SZNA 3GDKA 3C3NA 4HNVA 1P0KA 4BI6A 1OFDA 2RDTA 3M44A 1Z41A 5D04C 3JR2A 4HKPA 3KAOA 2VEKA 4Q4KA 1O4UA 3W7KA 1QPOA 1PL9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5AHMA

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Chord Diagram

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