2HS6A

Crystal structure of the e291k mutant of 12-oxophytodienoate reductase 3 (opr3) from tomato
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
376
structure length
362
Chain Sequence
NPLFSPYKMGKFNLSHRVVLAPMTRCRALNNIPQAALGEYYEQRATAGGFLITEGTMISPTSAGFPHVPGIFTKEQVREWKKIVDVVHAKGAVIFCQLWHVGRASHEVYQPAGAAPISSTEKPISNRWRILMPDGTHGIYPKPRAIGTYEISQVVEDYRRSALNAIEAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDEYGGSLANRCKFITQVVQAVVSAIGADRVGVRVSPAIDHLDAMDSNPLSLGLAVVERLNKIQLHSGSKLAYLHVTQPREEEEARLMRTLRNAYQGTFICSGGYTRELGIEAVAQGDADLVSYGRLFISNPDLVMRIKLNAPLNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 12-oxophytodienoate reductase 3
publication title Crystal structure of 12-oxophytodienoate reductase 3 from tomato: Self-inhibition by dimerization.
pubmed doi rcsb
source organism Solanum lycopersicum
total genus 137
structure length 362
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date 2006-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2hs6A00
1HO1A 4AWUA 1TSIA 4B5NA 5F1VA 2DZUA 5FEZA 4TMBA 4FHAA 1D9EA 3HBLA 1GYLA 3FKRA 3EWWA 5KSWA 4JTJA 5HWNA 1VS1A 1RD5A 4FXSA 4MZYA 3MHGA 2PRHA 2BX7A 3QEZA 1KM1A 2XN2A 1VGAA 4CNOA 3TSDA 3M6YA 4ZVJA 4MFEA 3LHUA 4FNSA 4UTIA 4YL2A 3LTSA 2YYTA 3NM1A 1FCUA 3P5YA 4LY8A 2Z6JA 5E0KA 1H7WA 3LM7A 4O50A 3H53A 4U28A 3LHYA 2X1RA 5IBXC 3E96A 1KM3A 3DFNA 4O12A 2OT1A 2Y7GA 4EVZA 1ZNNA 3L9CA 1FBAA 1I45A 1SO6A 3G1DA 2Y88A 5AHMA 4O53A 3O1NA 3SSJA 2I14A 1HG3A 3R13A 3PBUA 1C29A 2YGYA 3Q58A 2YX0A 4MFDA 2TRSA 2C0AA 3KRZA 1N7KA 1L6YA 4QNWA 1OFAA 4NT0A 2J27A 2OJPA 3KX6A 3TQKA 2TSYA 4IMCA 2QCEA 5AC8A 4GRSA 1K02A 3GX9A 1OJXA 3SZ8A 3HG2A 1GWJA 4GUHA 2YR1A 3MBDA 3JS3A 1V5XA 2B0MA 2Y63A 3UXAA 3R89A 1FWTA 3S0CA 3GNDA 4O57A 1K03A 3GXTA 1A53A 1F73A 1UUOA 1P0NA 2RDTA 3ZWSA 4EWND 1XFBA 2I9EA 1WXJA 4MLRA 1XXXA 3ABRA 1G7VA 1IGSA 3AO0A 3HPSA 3LLFA 1KM6A 4OWGA 1LDCA 1F6PA 4AHQA 5CPMA 4WXZA 1MEHA 2ZZ7A 1T96A 4WQ6A 3W2MA 3BO9A 3I65A 1SZFA 5G2IA 4FX6M 1GG1A 2X1SA 2X1UA 3HPZA 1KFKA 3SGUA 3G0XA 3IEBA 3NQ6A 3HF3A 1Q6LA 4O14A 3W7NA 5D38A 3NO5A 2A7RA 1ICPA 4WY0B 3G22A 4IMFA 1Y0EA 3GAYA 4C1LA 3QZEA 1WOBA 2FPYA 4NJJA 3LHWA 1W56A 2Y7EA 3L5MA 3MI3A 2V9DA 4Q33A 1AW5A 1U83A 2B4GA 1MXSA 1N8FA 3P67A 3UWVA 1LOQA 1SW3A 2H6RA 3BLFA 3VI2A 2VFFA 3I7RA 2DORA 3A22A 3BK0A 3M41A 4AMAA 5KTLA 1IXNA 4UTTC 5DBUA 1RR2A 1FXQA 4DELA 1M7OA 2ZRUA 1IIHA 2G97A 3TQ0A 4RZ6A 4MYAA 1TJPA 3L5AA 1AG1O 3P84A 5CPOA 4HN4A 1HTIA 3QW4B 2PRLA 4FNTA 1L6SA 5HQEA 3EKLA 2VEKA 1KBJA 4MY9A 3W7DA 1FWSA 3PG8A 3SGZA 2XN0A 1ZHAA 2A0NA 4DEFA 4N2YA 5D2WA 4FIRA 4M7TA 3QYQA 1G67A 1A5CA 4JTLA 2A6LA 2CW6A 2DJLA 5F2MA 1K8XA 1OFEA 2E6FA 4GXMA 2V81A 4IQLA 1Z42A 3KXQA 2JGQA 2NXIA 5CZTA 1TPC1 3W23A 2C19A 1YPFA 3VCRA 1DQWA 3ZS4A 1QNVA 3LCXA 3W70A 3TSBA 4GWEA 4YLWA 3M5ZA 4LS0A 4ZQNA 3WJZA 3QPYA 2OMAA 4O15A 4TIMA 2H8ZA 3O07A 4NXSA 1XBXA 3QSRA 1R47A 5FF4A 5CKSA 4UR8A 1SPQA 1YXCA 1PCKA 4HIBA 2ZRVA 4GUFA 1WOAA 1ONRA 2E77A 1XBZA 3IV3A 4ZL1A 3G1XA 5FF3A 2GPTA 1ZALA 1H1ZA 4DO5A 3UD6A 3BG9A 3NGJA 3Q94A 4JY9A 3LTYA 1OK4A 3S5OA 1NF0A 3P81A 1HFBA 1OF8A 3TROA 1I2RA 3W07A 3YPIA 5BMXA 2VELA 3WK2A 1HUVA 1OYCA 3P8IA 3MP5A 2J6XA 1YTDA 3NL2A 4L4LA 1H50A 4G1KA 4JIPA 1XM3A 4MLJA 2V82A 4DPPA 3O16A 2A85A 2CU0A 3BV4A 4PA8A 2CLIA 3VE9A 3EXRA 3QJAA 4IWWA 3NM3A 5HR7A 2J9XA 3M43A 3W7GA 1OFOA 2GQ8A 5AC6A 1ME9A 1G7UA 1TTIA 2X2GA 2NZLA 3FA5A 4K37A 2ISVA 1MZHA 3B06A 4RX0A 2PRMA 3C8FA 3S6DA 3P60A 4RR4A 3SR7A 3NL6A 4O0KA 3W2NA 4YCOA 4MZ8A 3PR2A 3IIOA 1MSSA 3W2LA 1OFBA 1G6CA 4PC8A 3W1LA 3MHUA 3BLIA 3NOEA 1KLYA 2E6YA 2YYUA 3MP4A 2RFGA 5DCDA 1B57A 1KLZA 2E6DA 3EWYA 3HQ1A 3WK1A 4QITA 3O15A 2Q8LA 5KITA 3MBFA 1H1YA 1UJPA 1F05A 3O8AA 1F76A 2DZVA 1OABA 4Z1DA 4MJZA 4LTSA 2QJIA 1SO5A 3IIPA 2WSYA 5LNRA 1KTCA 1H7PA 3DI1A 3GK0A 1NAL1 3USBA 3DU0A 4NNAA 3B0UX 3O6CA 4EIVA 1FCVA 5G4WA 3GKAA 1HO4A 3AJXA 4UCGA 1B4EA 5C55A 4AAJA 3N9RA 1QPOA 3A5VA 1DVJA 2ZRWA 2E5CA 3GLCA 3W7KA 1QMLA 3CU2A 4A3UA 2FPTA 3UWQA 2H8XA 3M1ZA 1UCWA 5HUOA 2QCFA 1VRDA 3P82A 4CCCA 3W7LA 2F7FA 3G1YA 4N4PA 1LBLA 4YXGA 1P4CA 3TV8A 3G1AA 2FFCA 2DU2A 1G4EA 1XUUA 2NXGA 1TV8A 4ZQMA 1XBVA 2V2HA 3E02A 3GNNA 3DKLA 4FB7A 3LRLA 4N9DA 2ZZ3A 4O52A 5KZMA 3GXPA 2JKPA 4O1AA 7TIMA 1W5QA 1MO0A 3P5ZA 5G2HA 4O4WA 1LTDA 1N55A 2UV8G 2CLOA 3L67A 1KV5A 1F74A 4OHQA 2VFIA 4OE7A 4XUGA 5AOUA 2Y7FA 4DF1A 5EA9A 1EP1A 1ZJIA 3E12A 2QUUA 4HHPA 5A8GA 1KA9F 2ZRXA 1M5WA 3W7JA 3NEVA 1S5TA 1WAUA 1PVNA 4RKAA 1FDYA 3EX4A 4CLMA 1FX6A 1XUZA 1TPFA 5F1UA 5HJLA 4QAIA 1VJIA 1B9BA 1MEWA 4IXXA 2ZA2A 3FJLA 1ME7A 3HMJG 1LRNA 1W5OA 5EMUA 1GVOA 3IIXA 1LLWA 3TXVA 1VHNA 5U7SA 1TPB1 3A24A 4IUOA 5MHBA 2JKEA 3PBVA 3W7PA 1GTHA 2NUWA 1G69A 1TREA 3ATYA 2VEIA 3DAQA 4JTKA 1VC4A 4BI6A 8TIMA 2QCDB 1EP2A 1FUYA 4MIMA 2Z2UA 3EX3A 4H4IA 2GVJA 3N19B 2OT0A 5E93A 3W74A 1WV2A 3FJ6A 3CLMA 1JRCA 1RPXA 3H54A 4K38A 3LLDA 1GT8A 3TA6A 3NZRA 4O28A 4GC4A 1LLZA 4HNVA 3TH6A 1QWGA 3UWZA 1OX6A 4FNQA 1B3OA 3NQEA 1YTKA 1QO5A 4JTIA 1OFDA 5CSRA 4UNLA 1FWWA 3M0ZA 4RK8A 4O0ZA 1KM5A 3EX1A 2X16A 2I1OA 1DV7A 1BEUA 3L68A 5A5WA 4XKYB 4XBSA 3G3DA 4N02A 4MYXA 1R30A 4ORMA 3W7RA 3GXNA 1A5SA 3B05A 3CIXA 4DF2A 5FEWA 3HO8A 4QIUA 1NFBA 1TPDA 2YFNA 2ZCGA 3C2VA 1OFPA 1JUEA 3HGSA 4MJMA 3LOTA 4GE8A 5FF0A 1LRQA 4E2BA 3FEMA 3LERA 3KRSA 3W9ZA 3QRHA 3CM4A 2C15A 1X6UA 5CZJA 4FF7A 4M19A 3C0JA 3KVKA 3MMTA 1H62A 2ZBTA 4WZHA 3P80A 5SWUA 1WQ5A 1U5JA 5ABTA 1D3GA 1W3IA 2AGKA 3NDOA 5AYXA 4JN6A 3S1VA 3EX2A 1H63A 3OVPA 5DN1A 3W1RA 3CHVA 3DH7A 3W1XA 1TQXA 3F03K 2DZPA 3FOKA 1GTEA 3RK8A 4EF8A 1S3HA 5D32A 2YDAA 3DFTA 3HJZA 3G3MA 3EB2A 3MYOA 3TQVA 3DFPA 3UYCA 4HKPA 3NPVA 3LCFA 3NL5A 3GVGA 2V2DA 4UMBA 3N14A 4ML9A 4NX0A 3DFSA 4TO8A 4IGHA 1JUBA 1WBHA 2BZNA 4WD0A 1ML1A 3GZ3A 4QSHA 1ZFJA 3EXTA 4OU1A 3UXDA 1NF7A 1TRDA 4XKYA 1SO3A 4TU1A 2A5HA 4GUGA 3ATZA 1W54A 3ZFHA 3BARA 1P5BA 1DORA 3F4WA 3SI9A 4X22A 4Y9AA 5K3VA 3IVUA 3B8DA 5I3FA 3S1UA 5K9DA 1M7PA 3TMLA 5I3KA 4GJ1A 5K4XA 2Y6ZA 2VXNA 3IIVA 3MO7A 3LXAA 4PL2A 3DHDA 4UFIA 4LV4A 3B0PA 3TX9A 1GZGA 5TBOA 5T26A 2WPBA 4AXKA 5C2XA 2IQTA 3LDVA 4HSOA 5EPDA 1PE1A 4H3DA 3SIZA 3WJWA 5AHEA 5L9FA 2Q3RA 3M44A 2E5BA 1QPRA 2R94A 3TR2A 1IXPA 3EXSA 3C2EA 4Y90A 3H55A 3LX9A 4Q32A 2RHGA 1FDJA 2ZYFA 3NPXA 5D09A 3RFAA 4HNNA 1SW0A 5AFDA 4QJ1A 5D2VA 3EWZA 3W88A 2HTMA 2NX1A 3W7EA 3LGEA 4E2DA 2JKAA 2ZZ6A 3EWXA 3CIWA 2QCNA 5EBUA 4BI7A 3WJSA 3W7HA 4FEZA 2Q3OA 4AHOA 2QUVA 3G0UA 1I2NA 3T55A 4L4MA 1FQ0A 4ZZ9A 2Y85A 4UUIA 3DFQA 4NXKA 3I7QA 3G8RA 5F2IA 2JBMA 5G5IA 4DF0A 1YXYA 2ISWA 4N9CA 3N9SA 3LB0A 4GUIA 4RV8A 3QQ1A 3W7IA 1W3TA 2CZFA 2WV8A 4CQ9A 3W1UA 4NZJA 3U8GA 1K7XA 4JS3A 2CLMA 3W1NA 4CNPA 3GDLA 4Y96A 3GB6A 3RLVA 3W7QA 5LKYA 1F6KA 1FWRA 3WJXA 4FO4A 1NVMA 2EPHA 2A7NA 1RVGA 2V2CA 1EEPA 3TAKA 3W1AA 4PCFA 1TMHA 1ZCOA 3OVRA 5H2ZA 4BF9A 2R8WA 3A23A 4RJEA 3W83A 3PB2A 3FS2A 3SW6A 3C6CA 3G0SA 3M5YA 2A6NA 1KW1A 1CX9A 3LRMA 3PF3A 3NR0A 3UZ5A 2O7SA 5J5RA 4K39A 3FYPA 1X1ZA 3B4UA 3L0NA 3BLEA 3EEGA 2FQIA 1L2UA 4NU7A 3VFLA 4UTUA 5KZDA 3PM6A 5AHIA 1FY6A 2FLIA 5D33A 3WK3A 3PSVA 3B03A 2C13A 3LBMA 2WSRA 1QR7A 4QM1A 1AW2A 3Q2DA 1KFBA 2V0TA 3O05A 4R33A 3TFCA 4P61A 1FDZA 3E9AA 5I3JA 1J5TA 3T7VA 5F4XA 1Q6RA 1H7NA 3NL3A 3C61A 3PAJA 2BTMA 6ALDA 3WK0A 2Z0IA 3W3OA 4NZFA 3W1MA 2PC4A 3M7WA 1I2OA 4ICNA 2QKFA 2CZEA 4Q4KA 4NNBA 4AB4A 1GEQA 3CPRA 5DXXA 1JULA 5EKYA 4I7VA 5G4EA 2GVLA 5EYWA 5DY3A 1TB3A 2NXHA 4FIQA 2BLEA 1TV5A 3FIGA 4LC6A 4N6FA 2ZRZA 2DZWA 3C2FA 4O54A 5K7JA 1EX5A 4A29A 1ZENA 2WNZA 4O10A 2HS8A 1KFLA 4E0CA 2V5BA 4DBEA 3TSMA 4JTUA 3TJLA 3L5LA 1PL9A 2ZZ4A 3OG3A 1MEIA 3GYEA 2EKCA 1F7BA 2ALDA 2B7NA 2GOUA 1VH7A 3OEXA 2FJKA 4RZ4A 1YYAA 1HL2A 3IRDA 2QEZA 3HG4A 3W2JA 3E49A 4Y8FA 1ICSA 2H3DA 4CCEA 4YCPA 5LNWA 4LNYA 1DHPA 4K7YA 1Z44A 3P8JA 1GG0A 4Z1BA 3MHFA 3SJ3A 3UZJA 1GVRA 4LVDA 3STCA 4O17A 3MI2A 1TTPA 3W76A 4OV4A 2B7QA 4LC8A 3T44A 4AHPA 1LYXA 3HGOA 1DJNA 1YDNA 1DKWA 1KM4A 3V1PA 1LBFA 1LROA 3D0CA 3I68A 2FTPA 4TR9A 3QMRA 4YMZA 1TQJA 3M5XA 2BSLA 2YW4A 4DO4A 3HPXA 5AHNA 5K2ZA 2WNNA 3R8RA 2NX9A 2W0UA 4A21A 4HNUA 1YPIA 4ADTA 5K9XA 5EL1A 2R91A 2GJNA 4Y6GA 2AQWA 4O13A 3M5VA 1SZEA 1GVFA 2YSWA 3S8HA 3HGJA 1M6JA 1ME8A 4RCXA 4UTKA 2C16A 2ZRYA 2BXVA 2ABBA 1UUMA 4I9AA 1XBYA 3MJYA 3PC0A 1R2TA 1RQEA 2AAMA 1X7FA 1SR9A 3CWNA 3UY7A 3HG5A 4CQ8A 1TPWA 2KZHA 1OX4B 4WY0F 3TJXA 3JR2A 2ZZ5A 4JDYA 3TCEA 1TCDA 3IVTA 4OV9A 3LCLA 4WOZA 1QFEA 3NA8A 4QNEA 1XC4A 1JR1A 1ZAHA 3KVLA 1T8XA 2VFDA 2Y89A 1SUXA 2NUYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WEO A;  1TSI A;  1XYF A;  1Y5X A;  1DWI M;  5FEZ A;  2DH3 A;  3H2N A;  3JZE A;  1E55 A;  3HBL A;  3EWW A;  2W4X A;  4PMD A;  1OD8 A;  4E3V A;  1DJG A;  1GGO A;  4GCX A;  5XIM A;  1RD5 A;  3WQ4 A;  3H23 A;  3Q67 A;  2PRH A;  1W9B M;  2CEQ A;  3QEZ A;  3DN5 A;  2QPU A;  1N2V A;  1IQ8 A;  1D3C A;  1J96 A;  4ZVJ A;  4DM1 A;  1YBQ B;  1Q6D A;  4YL2 A;  3LTS A;  4S38 A;  3T1G A;  3LM7 A;  3H53 A;  3LHY A;  5IBX C;  2RGM A;  3THD A;  3DFN A;  3S6T A;  2E8Y A;  3L9C A;  1FBA A;  3A64 A;  2VVN A;  4IIH A;  1US3 A;  5CCZ A;  2Y88 A;  1A4L A;  2D2H A;  2I14 A;  3R13 A;  4H7C A;  3PBU A;  2WHL A;  4PMV A;  2TRS A;  2C0A A;  4DX3 A;  1L6Y A;  1GOW A;  1KFW A;  4I9J A;  3KX6 A;  4IP4 A;  4HK7 A;  1OIF A;  1W1T A;  7CGT A;  3ZJK A;  3S4T A;  3EBV A;  3ONB A;  4EP8 C;  2YL6 A;  1F6Y A;  2B0M A;  2C79 A;  4QE4 A;  1JD7 A;  2Y63 A;  3SCU A;  5DQP A;  2FYM A;  3GG1 A;  1BXC A;  4O57 A;  1K03 A;  5FAC A;  3HTW A;  1ISV A;  3GG8 A;  2QLY A;  3ZWS A;  2A3E A;  2ZDS A;  2I16 A;  2PCE A;  2BBF A;  2QZR A;  4TTG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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