1OF6A

Crystal structure of the tyrosine-regulated 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate-7-phosphate synthase from saccharomyces cerevisiae complexed with tyrosine and manganese
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
351
structure length
350
Chain Sequence
GAEEDVRILGYDPLASPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDELKGDLSIIMRAYLEKPRTVGWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAIGARTTESQLHRELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMGVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTNYDAKSVAEAKAQLPAGSNGLMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGIPAEGKAGLKYGVSITDACIGWETTEDVLRKLAAAVRQRREVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords PHOSPHO-2-DEHYDRO-3-DEOXYHEPTONATE ALDOLASE, TYROSINE-INHIBI
publication title Crystal Structure of the Double Complex of the Tyrosine Sensitive Dahp Synthase from Yeast
rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 138
structure length 350
sequence length 351
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2003-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1of6A00
4JTTA 5K3VA 1PE1A 3GR7A 4EVZA 3OIXA 3N73A 3BARA 1R2SA 1H7OA 1K02A 1L9WA 4GFSA 3A24A 3OA3A 1LRTA 1FDJA 2FPVA 3KFTA 3HMJG 1NFBA 5G1TA 2FLIA 1H1ZA 4DF2A 2JK2A 4IQLA 4NQ1A 4O0KA 2Y89A 3F1QA 5D04C 3DU0A 2H3BA 4CNPA 3LCWA 4HNVA 1TV8A 1FDYA 3BG5A 4JY8A 4JICA 3W72A 3K30A 4FIRA 4MVAA 3NQCA 1AL8A 4UTHA 3O8AA 1GJPA 1QMLA 3VKJA 2G5WA 3EXTA 3HPXA 3W84A 2E77A 1LOSA 1I2RA 5KITA 3ZFHA 3IIVA 4N4PA 3B03A 1H7NA 2EPHA 3QMTA 2VC6A 4OT7A 5AHMA 3G1HA 3RF9A 3KRUA 2GPTA 3NQ6A 4IPIA 1YLVA 5F1VA 3EKZA 5FEWA 3HG4A 3FKRA 4R33A 4WY0F 1OFBA 3QFEA 4FF7A 3W1MA 1K7FA 4GRSA 2E5CA 3O6YX 4DXVA 1ZJIA 4N6EA 2BLEA 3LHZA 1EIXA 4QNEA 4E38A 1EP2A 2GVJA 4QITA 1TPEA 2A4AA 1XBYA 1GVRA 4Z08A 2DZSA 5AN7A 4QISA 4ADTA 1GPWA 4LS2A 3UWWA 3C3NA 1QDSA 2ISVA 1IXNA 1FCUA 4JTFA 2NUWA 4CCEA 3C61A 3LB0A 3KVKA 5E0KA 4A2RA 4DO5A 1TTQA 4O28A 1JCMP 3L5LA 2PRLA 4DPPA 2H6RA 3DGRA 1ZCOA 4MY8A 1KBJA 2RDWA 2A5HA 5LGZA 4HPJA 4P61A 5BMXA 3ELFA 4NX5A 1KM2A 1SQ7A 3DHFA 4CQ9A 1L6WA 3W1QA 1I2NA 5DY2A 3SR7A 3SSJA 3STCA 4CNOA 3NL2A 2Z0IA 4OU1A 2J24A 3TC6A 5DLCA 4I7VA 3QPYA 1BTMA 2TYSA 4PL1A 1D3HA 2YW3A 1XKYA 4WQ6A 2XFWA 2QUTA 3U6WA 4FNRA 4UFKA 5HUOA 1C8VA 3VNDA 1TPUA 1W3NA 1W5OA 2Y7DA 3N2XA 4KFNA 2GJNA 3KVJA 3PSVA 3P7YA 4S2CA 2F7FA 3S42A 3CIXA 3M43A 3OG3A 4BF9A 3NYZA 5EMUA 4NNCA 3HPZA 4JIQA 1IIGA 4O4VA 3Q94A 5GVJA 5FEZA 1OK4A 3SW6A 2HTMA 3TUUA 4RK8A 3WFAA 3CEUA 2VEKA 4GE8A 4UFLA 3EX4A 3PG8A 3NDOA 4I9AA 1NAL1 2RH9A 1L6SA 2A7NA 5I3KA 2ABBA 3C2RA 2G95A 1SR9A 3CC1A 3S1VA 3NXFA 3DFTA 3TFXA 1TB3A 2RKXA 4JX6A 4IXHA 1I2OA 2NV2A 3UD6A 1H7XA 2Y62A 1FWWA 2HS6A 1YDOA 1KFJA 5G5IA 1PVNA 3UPBA 4E0CA 3IIZA 1TPFA 4JY9A 2J6XA 3V75A 1HL2A 3HF3A 5FF4A 2QJIA 3QQ0A 5K7JA 2CLFA 2R91A 3KAOA 5AB3A 1BWKA 1GEQA 3GDRA 5AHIA 4N9DA 3TA6A 3W7NA 4ADUA 4AHPA 2CU0A 3GDKA 1LRQA 3MUXA 3WK2A 4Z1AA 1VPXA 4FNUA 4ZMGA 2FTPA 3W7DA 3N34A 1C29A 3IIPA 4PA8A 4WOZA 4EF9A 2V2CA 4CNNA 1NF7A 1W56A 3G1AA 2DZUA 1F73A 2CLOA 1TQJA 2FDSA 3R12A 5HWNA 4UTLA 4MZ8A 4NZFA 5FESA 5AHNA 4GNJA 2P0OA 3NQDA 4FNPA 2Y7EA 3SFKA 4AF0B 3LHTA 4JTKA 1JQXA 1OFDA 4O1AA 3W2MA 3D0CA 1LM1A 4DF1A 1LROA 2YCEA 3M47A 2B7QA 1NSJA 2DZWA 3I65A 3G1XA 1N8FA 4LRTA 4PCFA 3UWQA 3PR2A 4MUZA 5AC8A 1RV8A 3E49A 1GTEA 2VFGA 3FEMA 1GTHA 1OF6A 5F4XA 5I3IA 1BWLA 1FUYA 4NZJA 1EX5A 3W85A 1TCDA 5G1YA 1P4CA 5C2XA 3THQA 3NQVA 2A1YA 3A22A 2WNNA 2ATSA 2V0TA 4X2RA 3L65A 1W1ZA 2CWNA 1QCWA 3TFCA 5AC6A 4MPQA 1M7PA 1OF8A 4TIMA 5AC7A 3W2UA 3LTSA 3W7GA 3GAYA 3LXAA 1A5CA 2UV8G 3M0ZA 3IGSA 2CLIA 4GBUA 2DZXA 1OFRA 3WK3A 2QJHA 3HGRA 1ME8A 4FNSA 3BVJA 1GWJA 5C6MA 4HNTA 1LLWA 3GKAA 5TQLA 2DJLA 2E6FA 2R8WA 4MOZA 5I3JA 3P61A 1KFCA 4NNAA 3N2MA 1RD5A 2E1DA 3A21A 3EWUA 3PB2A 1PL9A 5G2HA 4LUIA 4ORMA 3FYOA 4POCA 1ZAIA 4A3UA 1R30A 1LOLA 1W8SA 3B0UX 4DO4A 2D73A 1WAUA 2O7QA 4M6VA 4ZL1A 1YXDA 3W1AA 1W0MA 2R14A 2WO5A 2E09A 3H53A 4HN4A 2NX1A 2VEPA 4XKYB 4JGDA 2ATMA 1M5WA 4Y6GA 4HIBA 3TXVA 2ZA1A 4X3ZA 5FEPA 4NXSA 1VCVA 3G1YA 3UPWA 4ZQCA 3MYOA 1H7RA 5BMWA 2HSAA 1UBSA 3L2IA 3N3MA 3MP3A 3GAKA 4HHPA 1LLZA 5DXYA 3MHUA 4QQ3A 1OYAA 1G69A 3PBWA 1TV5A 3JR2A 1UB3A 3EB2A 3QSRA 5ABTA 3NPVA 1EPXA 1W3TA 2Y88A 4UFJA 4UTMA 3TW7A 4AWTA 3RLUA 2ZZ6A 1TJPA 5HJLA 4N6FA 3R8RA 2NX3A 3IRDA 4NXKA 3HBLA 2JGQA 2QKFA 4JIPA 3G1FA 2X1UA 3EWBX 4UC5A 1LORA 4BFAA 2QCCA 2VFEA 1QPRA 3FOKA 5LHEA 3BLEA 3NAVA 1VCGA 3P74A 1W54A 3L9CA 2ZRXA 3KRZA 3B0PA 2QF7A 5BNKA 4MYXA 1TPC1 4ML9A 3TJLA 4TO8A 2ZRYA 4O52A 3UWUA 5DXXA 1W3IA 1OK6A 4RXFA 3Q2DA 4O57A 3W6YA 1YDVA 4UXDA 1ZY9A 3STGA 4I7WA 2ZRWA 1R46A 4UTIA 3EWZA 3EX3A 1F6KA 1JULA 2OMAA 4OHQA 3T4CA 4X9SA 1WBHA 1SO5A 2QDGA 3NO5A 4GJ1A 1YXYA 3B04A 3C0JA 2BXVA 1OHLA 1IXPA 3W7KA 3AO0A 1WOBA 4PFMA 2QCNA 3DI0A 2ZCGA 1SSGA 1SZEA 5F1UA 3W7QA 3LXBA 3OBKA 2GOUA 5LHFA 2VFHA 2CFFA 4LVAA 3SI9A 6TIMA 4U28A 5DCBA 4UNLA 3IIXA 3LHUA 1ZFJA 2E68A 3OVRA 2J9ZA 1KFEA 1JCYA 5CPLA 2VEMA 4Z0JA 2DORA 3ZS4A 3W1NA 3LTYA 5G4WA 3QRHA 4CQ8A 3LCIA 1K8ZA 3G3MA 1THFD 2ISSA 3M5YA 4K7YA 3RK8A 4LT9A 4JN6A 3CQ0A 3DAQA 1HO1A 1TMHA 4Z1CA 1FWRA 1PCKA 3W2JA 3HOJA 4RR4A 4X22A 3W86A 1LCOA 1F2JA 5A8GA 3DFNA 4UMAA 4MIMA 5KINA 1U83A 1FCQA 4PL2A 3HG3A 3PUEA 3QM3A 5L9FA 4OWGA 3OVQA 1QPQA 4O14A 3S8HA 2DZPA 3HGOA 3CB8A 2GQ9A 4O16A 3E02A 3L67A 4GUFA 3H55A 2ZZ2A 5EYWA 1QNVA 4MZYA 3NQFA 5KMYA 1V7YA 2WSQA 2ISWA 3NR0A 3W7MA 5CPNA 2I1OA 2ZRUA 4Y96A 1W5PA 4JTJA 1F05A 4NU7A 2JKAA 3IVTA 3N14A 2Q8LA 1T8XA 3GXNA 4UUIA 2V5BA 3IV3A 3LLFA 5KZDA 5K4ZA 3NZRA 3NPWA 4RLIA 1JUBA 4A2SA 1F5ZA 3YPIA 1H61A 3B4UA 4BWLA 5KZMA 3DBPA 5EY5A 1EWDA 3UY8A 4JXCA 4GXMA 5CPOA 3PF3A 3SZ8A 1FX6A 1S5WA 2YYUA 5H91A 3R13A 2OZ0A 3MI2A 4R53A 3QF0A 1MSSA 3W1TA 1YADA 3QMSA 4HT3A 4HPXA 2J9XA 4NJIA 1ADOA 2WV8A 3G1VA 1ICQA 3I7QA 1QOPA 3GX9A 1TPWA 1ZAJA 3HO8A 3MMTA 3NG3A 2YFNA 5LKYA 3OHIA 2QCDB 4AHOA 5L6UA 1VHCA 2KZHA 3RMJA 1L2UA 1RR2A 4FX6M 1VH7A 4LY8A 3UXDA 4PH6A 4DQWA 3VFLA 5KSWA 4DF0A 3KOFA 2ZTKA 3OEXA 4LV9A 2YGYA 5F2IA 4ZZ9A 4S2BA 4LVGA 4O13A 1GZGA 3HG2A 1J4EA 4JR5A 2WJZA 5FI8A 3KHJA 1FWSA 3MWAA 2RDTA 2O7SA 3UZ5A 1XI3A 2X2GA 4MY1A 4BI7A 3FIGA 4HSOA 2YPIA 1VYRA 3HPSA 4YMZA 1A5AA 4UTKA 4JYEA 1KM0A 4CCDA 4N4QA 1H7WA 4ALDA 3BLIA 5I3HA 1K03A 4M6PA 3JRKA 3RNDA 1V5XA 3SECA 4JDBA 2J88A 1I2PA 1ICSA 5FF3A 3QW4B 4K37A 3E12A 3QH2A 1FXQA 4QAIA 2Q3OA 1VC4A 5C5YA 2DZTA 3M6YA 3M44A 1ZNNA 4N02A 2JBMA 4JTSA 2ZZ1A 3SY5A 1OG0A 4HSNA 5DELA 2Y70A 5HQEA 4QNWA 4EIVA 4K6AA 2AQWA 3DHDA 4UTWC 3DZ1A 3C52A 4N9EA 2FB2A 3EWXA 4JDYA 1FCVA 4E2DA 4LTSA 3V1PA 3M5VA 1Q6LA 4RZ6A 4UTTA 5EL1A 2YXGA 2R94A 4PODA 3BK0A 5F2LA 4JTUA 1GVQA 1VR6A 2NWSA 1E51A 4K8EA 3GXPA 4NJKA 3ATYA 5DN1A 1IXOA 2C6QA 3QQ1A 2Q8ZA 2EAWA 2W6RA 1RVGA 2B7NA 1K7XA 3HJZA 4OV9A 1QR7A 3QJAA 4AHQA 3KX6A 1WBJA 4YXGA 2A7RA 3B0VC 3P82A 3W07A 1JUEA 1Q3NA 2OJPA 3MBDA 3P62A 3ABQA 3TV8A 4XWUA 3C2VA 5KTLA 1ZENA 1OYBA 2A6LA 2V30A 3TMQA 5FF7A 1B4KA 1LP6A 3G1DA 3LCLA 4ZQRA 5G2WA 5G2IA 3TKFA 3VI2A 3W7RA 2ZZ7A 3A23A 1A53A 2C19A 2WSRA 4MFDA 2WNQA 1ZHAA 3ABSA 4IGHA 4B5NA 1S3HA 3R5EA 4IPJA 2Y7FA 1Z48A 2WKJA 5HR6A 3LLDA 4K36A 4RX0A 1G4EA 1K7EA 3O6CA 5K9XA 1SU5A 1LZOA 5AFDA 3S5OA 1DQWA 3LV6A 4JTGA 1TRDA 1F74A 1QOQA 5HULA 2X16A 1PV8A 5D09A 3DI1A 4RXGA 2B4GA 1RQBA 2V8ZA 3O05A 3TC7A 2GQ8A 3P8JA 3QW3A 4O8RA 3TH6A 5CG7A 3G0XA 2V9DA 1IF2A 1KLZA 3HGSA 3IIOA 5HMSA 1U5JA 1XFBA 1G67A 4O53A 4I7UA 3LRKA 4AF0A 3H54A 4K8HA 1FWTA 3M5ZA 3S9YA 5FF0A 3CWOX 1FQ0A 4O10A 1F7BA 4AH7A 3B05A 5EPDA 1WYIA 1GG0A 3SJ3A 3GKFA 4IOTA 3USBA 4EOUA 1LTDA 1DQXA 2F84A 3THAA 2XN0A 1SSDA 2P10A 4JEQA 2TRSA 2QCEA 2W79A 4MZ1A 1PCWA 3TSMA 4FNQA 1QWGA 2RHGA 1XUZA 3M5XA 4O15A 1ML1A 3MW7A 3ANYA 3L66A 5C54A 3F03K 4WJEA 5MHBA 1TREA 1CX9A 2H8XA 1KM3A 3L0KA 1SFLA 4XZ9A 2TMDA 1GYLA 5TBOA 4ZVJA 3P81A 2VKZG 5HR7A 1YPFA 1YDNA 4R7JA 2NX9A 4OBTA 1SFJA 2QAFA 3PUOA 3PB0A 2H3DA 3E96A 3WJYA 4JX5A 5TIMA 2E6YA 3I68A 2IQTA 1Z42A 1H5YA 3BW4A 1FDZA 3P60A 4UMBA 5DCEA 5HWMA 4H6KA 1DV7A 5SWUA 4XBKA 3W1RA 3DFPA 3TDFA 1VGAA 2GVGA 3W1UA 1K8XA 1Z44A 1WXJA 3W3OA 1WX0A 1CI1A 3F4WA 2A21A 1LBLA 1SPQA 1VRDA 4RJEA 3NQGA 3PUDA 4FEZA 1ME7A 2VELA 1HO4A 3TNOA 2V2DA 3S5ZA 2GVLA 4L4LA 5HWJA 1W5MA 2VFIA 3MHGA 5D03A 2I9EA 4DELA 3EEGA 4AEOA 4YCPA 4JTIA 3UQNA 1X6UA 3QPZA 2AAMA 3DKJA 2VXNA 3FA5A 2H90A 3CT7A 4LWWA 3G18A 5F4WA 3PULA 4LW7A 1DOSA 5J5DA 1A5SA 1Y0EA 1P1XA 2C0AA 2E5DA 1QO2A 2TSYA 3GLCA 2ZFAA 4JD4A 3CWNA 1P0NA 5DBUA 2YW4A 3TR2A 4MYAA 1KV5A 2A0NA 3R89A 4ADSA 4FX7A 4FO4A 3DFOA 4JYFA 3O15A 4UFHA 1XBZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4UWM A;  5CBB A;  3OJG A;  4HYR A;  1K02 A;  1HVQ A;  4GFS A;  4L7Z A;  3ZLF A;  3E0V A;  3QGK C;  5G1T A;  2FLI A;  4IQL A;  3TTQ A;  1VIZ A;  2CPU A;  2J78 A;  4DI8 A;  3UWE A;  4HNV A;  1TV3 A;  4H41 A;  4JIC A;  2XVP A;  4LFY A;  3W72 A;  3CQK A;  3O8A A;  3R10 A;  3VKJ A;  3EXT A;  1DQU A;  2E77 A;  4AFY A;  1I2R A;  5KIT A;  4A3R A;  4RDY A;  1KXQ A;  2VC7 A;  2VGF A;  2XU2 A;  2BBF A;  4OT7 A;  4Q3M A;  4UOJ A;  3G1H A;  3AZS A;  4IIB A;  3H2A A;  2GPT A;  5FJJ A;  3ICJ A;  1KCZ A;  3GDB A;  1YLV A;  5F1V A;  3HG4 A;  3FKR A;  3L4Z A;  4YTT A;  5CAH A;  1CB7 B;  1GJU A;  1A3W A;  1GVY A;  3H8A A;  3SUS A;  1RY8 A;  4LQ1 A;  3UA4 A;  1MW2 A;  5CGT A;  4Z08 A;  1J0H A;  4ADT A;  2INE A;  4K1G A;  4LS2 A;  3C3N A;  5BCA A;  1F6Y A;  5JXQ A;  1FCU A;  4JTF A;  1XLD A;  1YKW A;  5E0K A;  4A2R A;  1NU5 A;  1TTQ A;  1SR0 A;  2R24 A;  2Y0F A;  2YCL A;  1RLD A;  5IDZ A;  2H6R A;  2Z1X A;  1EXP A;  2C79 A;  2RDW A;  1W2V A;  3VKC A;  1QNO A;  5BMX A;  3K5X A;  4JTD A;  4NX5 A;  4KF1 A;  1AUS L; 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