2E5B | Genus

Total Genus 161

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	161
sequence length	476
structure length	466
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title	Structure and reaction mechanism of human nicotinamide phosphoribosyltransferase pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	161
structure length	466
sequence length	476
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2006-12-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2e5bA02

3UY8A 5K9CA 4GWEA 3W23A 4O8RA 4MZ8A 4NXKA 3W1MA 3ABSA 5D38A 2QUVA 2A21A 5L6UA 1ZNNA 1UJPA 4KWWA 4IWWA 1FBAA 1DKWA 1JVNA 3TFCA 3STFA 3PY2A 4H3DA 1L6WA 1WOAA 2HS6A 1FX6A 4BFAA 1J4EA 1ONRA 5AHIA 4LVFA 3NPUA 3EXSA 4M7TA 4UNKA 4JEQA 2JBMA 4JX4A 1KM5A 3UWWA 1IXQA 5GVJA 4N9DA 1ME9A 5D2VA 5HWNA 1LRQA 3LLFA 3W86A 1H50A 3BLIA 3GK0A 2VFEA 4DXVA 1H7NA 4AWTA 2JGYA 1DOSA 3G1HA 2WSQA 4ZVJA 1UUOA 1VJIA 1FDZA 4BK9A 4Y6GA 3QJAA 5AHFA 2CLOA 4JTKA 2VEKA 4WOQA 3LI0A 4YCPA 1OABA 1ICPA 3LOTA 1OFDA 2ZCGA 2GQ9A 3THAA 2ZZ5A 3PBVA 3I68A 1O95A 3RLUA 4AVFA 2QF7A 5C2XA 2BLEA 1W8SA 3DFNA 4O10A 4OGZA 4UC5A 2ABAA 4GRSA 1TPEA 1Z44A 4HPJA 5D05A 1OJXA 3W84A 4NJKA 4JYEA 1A50A 1YDVA 3TIMA 3W2UA 1X8FA 4ZQOA 1UCWA 2GPTA 4UR8A 1R2RA 4CCEA 3NQMA 1KM3A 4DO4A 2YW4A 3ABOA 3EB2A 5DCBA 3NEVA 3HPZA 1IIHA 2ZZ6A 1G67A 2JKAA 4NJIA 4IMGA 1WA3A 3F03K 4PFMA 2CLLA 5D30A 4BR1A 3GDLA 2DZPA 3WJXA 4E0CA 5HQEA 2V5BA 4IGHA 5F1UA 1LDCA 1XBVA 3MO7A 4XKYA 2I9EA 1GG1A 1B9BA 4GE8A 1GTEA 1FDYA 3UZJA 3W1QA 4MUZA 4MKNA 1OG0A 3UXDA 3B0UX 3INPA 4WY0A 3A22A 1O94A 5F2MA 3HO8A 4IXXA 2ZZ7A 3T4CA 1ME7A 2FFCA 1W0MA 2ATMA 5KITA 3SI9A 2GQ8A 1VC4A 3CC1A 4CQ8A 3EKZA 4DF2A 1OFRA 3EXRA 4X9SA 5LGZA 4UTWC 2RFGA 3CWOX 3W1TA 3BLFA 4MY1A 2WQPA 2QDGA 3E12A 3LHVA 3RK8A 1ZALA 5EKYA 3FS2A 3PBWA 3SECA 3P82A 3KFTA 1F7BA 1P1XA 2ZQ0A 4FNQA 3I7QA 3GNNA 4UTHA 1FXQA 4O1DA 3W7IA 4AEOA 1KM6A 1IXNA 4Y96A 4I7WA 3QSTA 4K36A 5LNVA 4CNOA 3CEPA 5HINA 1ICSA 1VPXA 1O4UA 1FXPA 3EWXA 3R5EA 2Z2UA 3KRZA 1XBYA 1YADA 4O4WA 2G96A 3BG5A 3R13A 3CM4A 1VRDA 4JIPA 4IPJA 1L9WA 4RZ6A 1GT8A 5SWUA 3L65A 4EF9A 3W1RA 3HG2A 4UXDA 3R89A 4AHOA 3EX1A 2V0TA 2C18A 5LZLA 4Y8FA 3C6CA 1H5YA 3QW4B 3QMSA 2V82A 5HUOA 1RR2A 4UFJA 4ORIA 1ALDA 4L4LA 1TPFA 5F1VA 1TPWA 5HWMA 3SSJA 3PWAA 2Y89A 1YYAA 3MBDA 4UCGA 3LRLA 1H7PA 1LTDA 2VFFA 1F6KA 3TR2A 2F84A 3IIPA 3O1NA 2ZRWA 2WNZA 4X2RA 2ZZ2A 3BG3A 1VLWA 3TXZA 1BEUA 3UNDA 4TX9A 2AAMA 3W7MA 5CPLA 4Q33A 1W5NA 3B4UA 4ZQRA 1F6PA 1TPVA 1VYPX 5LHEA 1THFD 2WV8A 5IBXA 1KA9F 3M9YA 3BGGA 4IJBA 5FEPA 4AWSA 3TK7A 3OBKA 3H55A 1JCNA 4XWUA 3G1AA 4XZ9A 1JQXA 2QCDB 1OYBA 4S2BA 3W76A 5CZTA 2JK2A 1GVQA 5D37A 3SZ8A 4UNLA 1JJKA 4BF9A 2ZYFA 3LDVA 3TX9A 4LS0A 4U4MA 3WK0A 1MXSA 3E49A 5HWJA 5A8GA 1VS1A 3TQ0A 5KZDA 3GIYA 4CCCA 2H3BA 2ZRZA 4DBEA 2UV8G 3S42A 4R33A 3STCA 2X1RA 4FNUA 5D32A 3O05A 3A21A 2I14A 3E96A 3GAKA 2EPHA 1AW5A 2YYTA 3GDRA 3WJYA 3GB6A 3S1UA 3W7KA 3NQ8A 3LXBA 3IGSA 2V81A 5K4ZA 2TPSA 1N55A 1JUKA 4HPXA 3IIXA 5DCEA 2VEIA 3CTLA 2JGQA 3S8HA 2GVLA 3WK1A 4AMAA 1EB3A 5E0KA 1YDNA 3GXNA 3L5LA 3DFSA 3NDOA 1F76A 1B3OA 3V1PA 1GPWA 4IMEA 1W5PA 1C8VA 5G4WA 3C3NA 1GEQA 1TJRA 2EHHA 3O07A 4U28A 4IX2A 3LTSA 1VR6A 2ZA2A 1Q6LA 3O15A 3C2FA 1TTIA 1EUAA 3T44A 3DI0A 3BPWA 2DU2A 2CU0A 4DEFA 6TIMA 4O12A 3RF9A 3TDFA 2Z0IA 2RDWA 3PR2A 5BRBA 4NZJA 3KHJA 1F05A 5K9DA 1LLWA 5D04C 3TMQA 4QQ3A 3EX3A 2J24A 4DO5A 5L9FA 3E0IA 2TYSA 3L5AA 5CPMA 3WFAA 4HIBA 2VOMA 2EKCA 3P5ZA 1S3HA 3Q58A 4OWGA 5LGXA 1EP2A 5E1QA 1W56A 3S0CA 1A5CA 5AHEA 3LXAA 3DBPA 3P67A 3LTPA 3IVUA 3PG8A 4O18A 5HJLA 1AL7A 1HO1A 1JCYA 3K30A 3O6YX 4I7VA 1NAL1 4RZ5A 3G24A 5HNRA 3W83A 2QAPA 1L6YA 4NZFA 4QIUA 3SFKA 1KTNA 3DZ1A 3L0GA 2O7QA 5EMUA 4FNSA 1VHCA 2X16A 3QEZA 1LYXA 2QCGA 1OVDA 2H3DA 5G2HA 2NX3A 3TQKA 3G22A 3MP5A 1SO6A 4OE7A 3NGJA 5FI8A 4ADSA 1S5VA 1EIXA 1FY6A 1R47A 5FEXA 3TW7A 4WOZA 5HR7A 4N4PA 4WD0A 1O60A 3P80A 2RH9A 3W2NA 4UFHA 3T40A 2QUTA 5F2IA 1XBZA 3N3MA 4R53A 4O1CA 1Q6QA 3CLMA 3LRKA 1K8XA 1K7XA 1PS9A 2E68A 3DFOA 2YPIA 2JKEA 2NX9A 3HQ1A 1OYCA 3W71A 3PG9A 3SR7A 5KMYA 1OFBA 5LNWA 3NQ7A 2Y85A 1B4EA 5C54A 2WOQA 1AW1A 1ZCOA 3I7SA 1CX9A 4JTJA 1DHPA 3LV5A 1E51A 3W2MA 4FEZA 2J6XA 3A5FA 4NX0A 3NQCA 3L9CA 3G8RA 1TTQA 2WO5A 3TJLA 2X2GA 4KFPA 1M7OA 2FLIA 2QR6A 5TQLA 2ISSA 1JRCA 4JTEA 1NSJA 1PCKA 5EA9A 4GNJA 2NLIA 4XBSA 3GR7A 2XN1A 1Q45A 3L67A 1FCUA 1Z41A 1TO3A 1CI1A 3M16A 3TSDA 4RXFA 4Z0SA 5LNUA 1H63A 2A2IA 1VZWA 3BG9A 3EKLA 4LU0A 1IF2A 2ATSA 2CLFA 2ZRUA 3DAQA 5AYYA 2B0MA 3MYOA 5K7JA 5KSWA 4O28A 1FUYA 5CSSA 5DBUA 2R94A 3NQEA 5LNSA 5G4EA 3NO5A 2QCDA 4C1KA 4WUIA 4UTLA 3MI6A 5FF0A 2RKXA 2H8ZA 3DFPA 1SU5A 2OZ0A 2OT0A 4ZL1A 3NL6A 2E6FA 1RD5A 1XXXA 4RXGA 4WXZA 1OF8A 2XN2A 1TRDA 1OX4A 1RPXA 3LB0A 1WOBA 4LC8A 4TMBA 3HGJA 1UB3A 3QSRA 3QF0A 4A2RA 2CLMA 1H60A 4MYXA 1YTEA 4FX7A 1GZGA 4LUJA 2X1SA 2TMDA 3NQ2A 4O52A 2YGYA 2CZEA 2G5WA 2E5BA 4OBTA 3VNDA 4HNUA 1RZMA 1SZGA 4JTHA 1JULA 3NM1A 4AH7A 4PC8A 1H7WA 4AF0A 4DPQA 1QAPA 1KW1A 4WQ6A 5G5IA 3C8FA 3OIXA 5IM51 3HG4A 4BI5A 3N19B 4GXMA 2ZZ3A 1KBIA 3W87A 3QZEA 3F4WA 3W7RA 3KRSA 5I3KA 1WX0A 1LOQA 1KFEA 3NR0A 3NL3A 3A23A 4O0KA 1HFBA 1XDLA 1SZNA 3MJYA 5HUPA 2DP3A 2IQTA 4O53A 4B5NA 1SR9A 2VFIA 3S9YA 2VFGA 3EX4A 3PB2A 4GBUA 1WXJA 4PL2A 3NYZA 4YWIA 2FB3A 3NZRA 3E02A 2FDSA 4OHQA 5BNKA 2QCEA 1EWEA 3NL5A 4NT0A 5G1TA 3TSBA 2OMAA 1KV8A 3T78A 1B57A 4G1KA 4NQ1A 3IVTA 5E93A 1FWSA 1I2RA 3TKFA 3CWNA 3GDKA 1XI3A 4LWWA 5FF4A 1GVFA 2EAWA 4LVDA 1DJNA 4DF1A 2OJPA 3SGZA 1SSGA 4Z1DA 2CFFA 4N9CA 1F74A 4ADUA 4RK8A 1YPFA 3SIZA 4LVGA 3HG5A 3KVKA 1RQHA 4N9EA 4FB7A 5I3HA 1GOXA 2C3ZA 2C16A 1W3TA 1SFJA 5BMWA 3S5ZA 2OCZA 4UTMA 2ZRXA 2YX0A 2F7FA 4GC4A 5T26A 1G4PA 4GUGA 1AG1O 4CCDA 4JDBA 4NJHA 3N9SA 4ZQNA 4LUIA 2NV1A 1YPIA 4HT3A 3LCFA 1A5AA 1QPNA 2FB2A 2YFOA 2E6AA 3DH7A 2NXHA 2W79A 2YSWA 3FOKA 4N02A 3ZS4A 4IMDA 1KBJA 4UMBA 1H51A 4ALDA 2R14A 3MP3A 4IXHA 3A5VA 1SFLA 3BW4A 3NM3A 1JCMP 3VE9A 4JY8A 4ONVA 1H7RA 1ZY9A 1GWJA 4OT7A 2R91A 3CEUA 2RDTA 2AQWA 3B8DA 1JCLA 3I65A 1NF7A 4O1AA 3ATYA 2XN0A 1FCBA 1LRTA 4A21A 3O8AA 1PL9A 3RNDA 3W85A 1UBSA 1Q6RA 1TJPA 1QWGA 4AWUA 2DJLA 3JRKA 3WJWA 4KWVA 5FF2A 4AB4A 4K8HA 1TCDA 2WPBA 1KFCA 4RJEA 3VE7A 4N4QA 3LHTA 2ZFAA 1VCGA 3F4NA 1HG3A 3GVGA 4FIRA 3W1AA 4CNNA 2C14A 2DZWA 1B4KA 4LV4A 3E9AA 1W31A 2A0NA 1W3IA 4QSHA 4UR7A 4MPQA 3L21A 1P4CA 4UFKA 4Q4KA 5AHLA 1WYIA 2Y6ZA 5D2WA 3SGUA 3ELFA 2W0UA 1RVGA 3IIVA 4NUWA 5CZ0A 3L68A 4LTSA 1FCVA 3IIOA 2DZVA 3QC3A 3PUOA 5LSMA 2X30A 4O13A 3LBMA 3V75A 2ZRVA 3PUEA 1MZHA 2HS8A 1L2UA 1A53A 4KKXA 4QAIA 2GJNA 4J9JA 4LVAA 2GOUA 3C2RA 3BLEA 3FYOA 4MFDA 1EP1A 3DHFA 1H7OA 2HMCA 2NWRA 2X1TA 5TIMA 4QM1A 3G1YA 1LOLA 3OVPA 5DY3A 2VEMA 3O16A 3NA8A 3NAVA 1OHLA 2VKZG 4LC6A 1G4EA 4HNNA 1M6JA 1VLIA 2FIQA 3W70A 1IIGA 2Y88A 3C0JA 5CKSA 3LHYA 1XL9A 1OK6A 4OV9A 5IBXC 4A22A 1QNVA 3H53A 3G18A 4JICA 3W7EA 3GNDA 4ZQMA 4ORMA 3B06A 5DCDA 3G3MA 5KZMA 4IMCA 2FPTA 4MLJA 4O54A 5DLCA 1P5BA 3S6DA 3QM3A 3QQ1A 3LCXA 2G97A 1VCVA 2PRHA 1XFBA 2YDAA 4EVZA 3LBCA 3S1VA 1SW0A 2C0AA 3MHUA 3HF3A 5LNRA 1OYAA 4FO4A 4WZHA 5D02A 1CW2A 5EPDA 3L0KA 2NWSA 1BWLA 1XC4A 3M5ZA 1DV7A 1K8ZA 3FJ6A 1K7EA 1NF0A 3SJ3A 2Q3OA 2NUXA 4UTIA 4CQAA 4D2JA 1VYSX 5EBUA 4FX8A 3G1SA 1MSSA 1LCOA 3ABRA 1GVOA 2EGZA 3O63A 1Z48A 3MWAA 1ZAIA 4CQ9A 3Q94A 2PRLA 2B7QA 1X7FA 2H90A 5FF7A 1O5KA 1QOPA 2QKFA 4M19A 3UPBA 3TMLA 4NJGA 3TAKA 2VFHA 2OX1A 5DBTA 3NNTA 1W5QA 3HMJG 1ADOA 4NU7A 1WBHA 3P7YA 5FEZA 5AC6A 3QPZA 1WAUA 3ANYA 1OK4A 3BW2A 3W7NA 1TIMA 4R34A 3IRDA 4O4VA 1RQBA 4JYDA 1T99A 3G3DA 2DZUA 3FFSA 5FEWA 5AC7A 3F1QA 2B4GA 4MJMA 2QAFA 3IVSA 2P1FA 1MEHA 4LV9A 1TPUA 2TSYA 2A6LA 4WY0F 3CB8A 1AL8A 3R2GA 4FXSA 1EWDA 3W7LA 1K02A 2QJIA 1LOSA 3UWYA 2NZLA 4TIMA 2PURA 3QH2A 2C19A 5CZSA 3WJSA 2V2DA 3W72A 1GJPA 3GXPA 3PSWA 2VFDA 3TE9A 3GKAA 3LERA 4K37A 2V2HA 4QNEA 3JS3A 1G6CA 4JTLA 1DQWA 1EP3A 4K8EA 5BW6A 4QISA 2QCHA 1JCXA 3W2KA 3B0VC 1FWNA 1H1ZA 3FKRA 2ISWA 3HOJA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2E5BA

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