1CNV | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	283
structure length	283
Chain Sequence	DISSTEIAVYWGQREDGLLRDTCKTNNYKIVFISFLDKFGCEIRKPELELEGVCGPSVGNPCSFLESQIKECQRMGVKVFLALGGPKGTYSACSADYAKDLAEYLHTYFLSERREGPLGKVALDGIHFDIQKPVDELNWDNLLEELYQIKDVYQSTFLLSAAPGCLSPDEYLDNAIQTRHFDYIFVRFYNDRSCQYSTGNIQRIRNAWLSWTKSVYPRDKNLFLELPASQATAPGGGYIPPSALIGQVLPYLPDLQTRYAGIALWNRQADKETGYSTNIIRYL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Seed protein
molecule keywords	CONCANAVALIN B
publication title	Crystal structure of concanavalin B at 1.65 A resolution. An "inactivated" chitinase from seeds of Canavalia ensiformis. pubmed doi rcsb
total genus	93
structure length	283
sequence length	283
ec nomenclature
pdb deposition date	1995-02-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1cnvA00

1DWJM 1CXEA 1B3XA 3ZMRA 3U57A 3RMEA 1EA9C 1JI1A 1C90A 1MFVA 1ZL1A 3VIKA 3WDRA 4DUWA 2E9BA 2FDMA 4D6HA 1FFRA 2CCRA 4P8XA 3WNKA 1XD0A 2YOCA 3BCFA 2VUYA 1KWKA 1OD0A 3W0KA 2CKRA 1QHPA 5I0DA 4X0VA 3WH7A 5CXPA 1XV8A 1M53A 2V5DA 5EBAA 2XG9A 3ZIZA 3N9KA 2W91A 2D3LA 2WBKA 2WYSA 1BYCA 1R85A 3IK2A 4BQ3A 2GSJA 4P8UA 3FN9A 1MW0A 3MKKA 5JBEA 1MW3A 4PSRA 5HPCA 3J7HA 2D24A 2PWGA 2OWXA 3AZRA 1H4PA 4YPJA 2UY5A 3CHDA 2J62A 4BZYA 1V0KA 3WQ5A 1GW1A 1TFVA 3JUGA 4AZIA 1J10A 3QOMA 3WMBA 4J27A 4BA0A 2CEQA 1GZJA 1J11A 3MMUA 3VM7A 4UQAA 3L2MA 1VEPA 4DM2A 4ACZA 5ECUA 1CXHA 1Q4NX 4GPNA 4J3XA 3N18A 3ALFA 1KXTA 1KB3A 5A2AA 2X8RA 1XRVA 4PTXA 4YHGA 3U7BA 2ZICA 4GZJA 1BYBA 1ITCA 4MNJA 2YBUA 3AXXA 5M17A 1KXVA 3PZOA 5ABFB 5A6MA 3L4TA 3ARRA 4WLCA 4LXFA 3DC0A 4URIA 2CETA 1HJVA 3WEMA 4NZCA 1ZJBA 4XZWA 2VZUA 1TA3A 1OM0A 2FHCA 4F8XA 1SR0A 2WVTA 4UCFA 1K9FA 3GNRA 1A3HA 3WFLA 2W61A 4M8UA 1Z32X 2VCAA 2ZX9A 4M56A 6TAAA 2Y8VA 2WHLA 1HKJA 4HOZA 3K4AA 2E9LA 1FFQA 4JFVA 4XB3A 4GZEA 2VX6A 2Q8XA 5KZ6A 5BCAA 3AMKA 4JKMA 3RILA 3RM4A 3VINA 3RJXA 1OBAA 4GI6A 1UD6A 3ARSA 5A94A 4MTVA 1GOIA 5AYBA 4H7VA 3HN3A 1OIMA 1V3HA 3II1A 3RIKA 4CN4A 1UQYA 4W88A 3VNYA 2X09A 3CPUA 1MXDA 4E4PA 3WH8A 4OUEA 3W37A 3PZQA 1QW9A 3W4RA 2VQTA 2WCSA 3LPGA 3VGDA 4ZE5A 1NP2A 4H04A 2QF8A 1WAWA 1Q6CA 3K1DA 1J0HA 4NF7A 3WQ6A 1EOMA 3OIHA 3ZM8A 2W67A 3GNOA 1RD6A 2C0HA 1JZ2A 4P7QA 3K8KA 2BHZA 2JF7A 2ZXDA 2NW0A 3DHUA 1B2YA 1JD9A 1US2A 3ZOAA 2XVNA 2G3NA 2WVUA 1E56A 1JYNA 4OBSA 4TTGA 4AW7A 1FH9A 4J3TA 1D3CA 2WXDM 3WMSA 3CZ8A 3EDFA 5I2UA 2W4XA 4QFUA 1BQCA 1R87A 4HMEA 5GNZA 1HN1A 4UFMA 1BFNA 2BY3A 2D0GA 1OGSA 4JKLA 3AHYA 4J7RA 1YQ2A 4P7OA 1H41A 3OLDA 2Y24A 9CGTA 2EPLX 4OBRA 3ZT6A 3OLEA 1KCLA 3CMJA 3NDZA 3BLKA 2D22A 1BG4A 1W9VA 1UH4A 3KL0A 1V02E 3AMGA 1UR9A 4HMDA 1PZ2A 1QI2A 3GXFA 3FY1A 1JXKA 4XV0A 2YLLA 1C93A 2VVNA 1R86A 3CH9A 4OZOA 1XSJA 4B16A 2WMKA 3PHAA 5HDRA 1JFXA 4AYSA 1MVYA 1ISWA 3WL1A 1C8XA 1PEZA 4P7LA 1B3YA 4GIAA 1NOWA 1C7SA 3VDAA 2A3HA 4WKHA 3EMCA 4FF5A 2G3IA 1B90A 2XWEA 2D3NA 3SUUA 2WCGA 1Q6FA 1VENA 1WDSA 1EDTA 1AQMA 4AIEA 1JNEA 1VEMA 4JFUA 1UG6A 5BXPA 2ZX8A 2VRKA 2VI0A 1MXGA 5A2BA 4TOQA 4U33A 2D1ZA 4AXNA 2BY2A 5IHSA 1W9UA 2VZSA 2XFRA 4ML4A 3W28A 1LG2A 3K4DA 2ZWYA 1HX0A 3WENA 1BHGA 3SCTA 3WBAA 1W9PA 4F9JA 4CD4A 3AIBA 1UKPA 3MV11 3MO4A 1NOFA 1F4HA 3RM9A 3AXIA 2QPUA 2XUCA 1ZBKA 3AYSA 1X6NA 5C71A 1ECEA 1GOOA 3THDA 2DSZA 1C8YA 2E9MA 1C3FA 3MU7A 1V0NA 2J47A 3TONA 1UA7A 5A3HA 5E09A 2DPEA 1QHZA 3G6MA 3TA9A 4AD3A 3OBAA 1H2JA 2G3JA 1CENA 2JIEA 4PRWA 4OOUA 4M1RA 1MW1A 2D23A 4JFTA 5D9OA 2VCCA 2OSYA 3IJ7A 2XVLA 4TVCA 1GNXA 1JIBA 3GDBA 4J3SA 3BAIA 3W6LA 1KQZA 1LWHA 3WDJA 2ZUWA 4EE9A 2WWDA 4PMUA 4XX6A 4AD0A 1DHKA 1B1YA 1ISYA 5ABFA 1NQ6A 3W82A 4KMQA 1UR4A 5D9PA 3GBEA 4RE2A 1WCGA 4HP5A 4GO8A 1U30A 1GQJA 4JIEA 4WSKA 2GFTA 5I79A 5GQBA 4KWUA 2OLHA 3ARPA 2AAAA 3FW6A 2C7FA 3AIEA 2VOTA 4CKQA 4E8DA 3T09A 1WE5A 2ZXAA 3AIVA 3A4AA 4Q7NA 5IFPA 4W87A 3MUZ1 3AHXA 4W7UA 1XH2A 4NSBA 3QHNA 3SCWA 3HU7A 4JKKA 3TTOA 4W8BA 1OGGA 1CGYA 3EDKA 3SCVA 4D6DA 2VT0A 3SUVA 5M03A 3PBGA 1OD8A 3WH9A 2WVVB 5CZKA 3UG5A 1Q6DA 3PZTA 3OA5A 2E3ZA 4Q22A 5A6AA 4UQCA 5DT7A 1ITXA 1ISZA 3AMDA 1XSKA 2WPGA 4J3VA 3F5JA 4FK9A 1EIBA 4UFLA 2VZVA 1CLVA 2BY1A 1QOXA 1E5JA 3VKKA 1W32A 4RE4A 1VFMA 1UWQA 5D9MA 3BLPX 2XJ7A 4CU8A 4OKDA 4HMCA 3APGA 2QPSA 4HZ6A 1UR1A 3O6AA 1JZ7A 3GTNA 4TX6A 2J75A 5LA1A 4BQ5A 1QBBA 1FHDA 1WZMA 4W85A 2WC4A 3VOCA 3AQUA 1OSEA 3U5YA 3U7VA 1W1VA 1XD1A 2YL8A 2G3MA 3QHMA 2WBGA 4IISA 1M04A 4W7VA 1LWJA 1ODUA 4EKJA 5AYIA 4RE3A 5TD4A 3N15A 1JAEA 3VIFA 2BXZA 5DO8A 2YBTA 5A2CA 2DH2A 1J0KA 4BCEA 2VVSA 4QLLA 4F79A 3W81A 3AZSA 3CUGA 4YHEA 3WD3A 5BRPA 3POHA 2GK1A 4J3WA 1FOBA 1W9BM 1HJXA 3IANA 4JL2A 3WIJA 3WUEA 2FH6A 3WD4A 3DYMA 1E6SM 4GQRA 3K8LA 2XYLA 2J8GA 1CWYA 5CQ1A 1NWRA 2WMFA 2VX4A 1KWGA 1XYZA 2Y5EA 4PMOA 3KL5A 2OYLA 3AIRA 4D1JA 2Y2WA 4WIWA 3AIUA 2WVSA 1G9HA 5AY7A 3BC9A 3NSXA 3DHPA 2ZUTA 4AD5A 4CD5A 1B0IA 3ZQ9A 5CG0A 5FIPA 1GOKA 5BWFA 3MUAA 1MQRA 3MUY1 2FGZA 3ARYA 4U2ZA 3BMWA 1KFWA 4JCMA 2X2YA 1LL6A 2AMGA 1BVZA 5I77A 3VMNA 3OZPA 4MAZA 1UUQA 2ZE0A 4UOQA 1WO2A 4D6GA 5HOSA 2YJQA 3BSGA 4PMXA 3BSHA 5JIPA 2XIIA 6A3HA 2JIWA 4HOWA 4JHOA 2PBOA 1R7AA 3VMPA 2CITA 2DSWA 4H8VA 3POCA 3ECQA 4JHZA 3E1F1 2RGLA 3WBEA 2EBNA 4XUYA 4MADA 4MNMA 5JBFA 1L0PA 1B9ZA 2XM2A 2F2HA 2WMIA 3ARXA 1VRXA 3AMCA 3CUJA 1GOWA 2XVGA 1WZKA 1WZLA 2J7CA 1JZ3A 1EHNA 2ZIDA 8CGTA 1GPFA 2DT1A 4PTMA 1EDGA 4UZSA 1OCQA 3OB8A 3NJ3A 4HZ7A 3WQ8A 4JCLA 4CU7A 4CD8A 4B15A 2HISA 1KGXA 3FAWA 5E70A 3EBVA 3NSNA 5FD0A 1E55A 1HL8A 4B9YA 5D4YA 2VX7A 2Z1SA 1E5NA 3AIWA 5D8ZA 1XHGA 3L2LA 4MAVA 4Z2KA 4R5EA 4MDOA 5IHRA 1HJSA 2J7GA 1JDAA 1BYAA 4NRSA 3AHZA 4Z2GA 3CZKA 4QCEA 3GNPA 1MFUA 1WDPA 2NSXA 4W84A 3GH4A 1CPUA 4LPCA 4UR9A 3NYDA 1HJQA 2Y4SA 4K68A 3BGAA 2WZIA 4JFWA 5IXEA 3VGBA 3PN8A 3W24A 4GI8A 2BVTA 3VDCA 3A6OA 1VJZA 1UKOA 1DWIM 1GCYA 4W5UA 3ZR6A 3UG3A 3VMOA 3L4WA 1JYWA 1M7XA 2B31A 1CGTA 2CHOA 3T2PA 4C7DA 4MB5A 2YA2A 3CUFA 1JZ5A 3WDQA 4UFHA 2WAGA 3VO0A 3NDYA 3SCRA 1HXJA 4W86A 4UOJA 3AHVA 4KGLA 3OLIA 3WSUA 1VJSA 2E8ZA 3BCDA 1CLXA 3B9AA 3VPLA 2O9PA 1VF8A 1JYXA 1RH9A 2EPMX 5LA2A 1EDQA 2G4FA 1MWOA 4V28A 4QDMA 1PIGA 4KGJA 3A4XA 4U5IA 1JNDA 1GJWA 2V38A 1I75A 1CECA 2VRQA 4PN2A 1HT6A 4M80A 4RL3A 1E0WA 1HNYA 1GJUA 4U31A 2WVVA 1EO5A 3SUTA 3VTRA 1CDGA 1H11A 1VB9A 2ZUNA 3AS0A 5JUVA 3PTKA 4Z2HA 4A4AA 3PZ9A 2BHYA 1GOQA 2VZTA 2IXUA 1B30A 4W8AA 2OYMA 1CIUA 2A3AA 4C7FA 4DUXA 2VX5A 2VRJA 4AZHA 2YLAA 4Y7EA 8A3HA 1W3HA 2J7FA 4U2YA 3THCA 1PX8A 1E43A 2CIPA 2QMKA 4HA4A 1G01A 7A3HA 4AISA 2J7DA 1UZ4A 1WDQA 3N17A 5D9NA 2OWCA 3GXIA 7TAAA 4P8WA 3BAJA 4CD6A 3SCPA 3PZIA 3MUIA 2X0HA 2WLYA 1ZBCA 2J8FA 2ZUSA 3PTMA 2ZX7A 4E8CA 2YL5A 3WDPP 3BAYA 3AOFA 4WF7A 2PB1A 4MNLA 3SCQA 4NI3A 1TR1A 3GYCA 2XTKA 1CGUA 2E0PA 3ARTA 5I23A 3QOKA 2GJPA 3A47A 3WNLA 1CGVA 2ZUVA 3WUGA 4CCDA 4M24A 1J01A 3I3DA 3BH4A 1JDCA 1LL7A 4QAWA 1CGXA 1JZ6A 2C8NA 4ZE4A 2V3GA 1AVAA 5HBFA 2VL4A 4W5ZA 1UR0A 2J78A 3CIVA 1TVNA 3RO8A 3ARZA 1QW8A 2VMFA 3CTTA 3WD0A 4HA3A 3AZTA 1XH1A 1CZ1A 1CXFA 1PJ9A 4XZBA 5HNNA 1E9LA 3IAPA 4AZBA 3KE0A 3CZGA 2W62A 1J0YA 5AC5A 3W6MA 3BXWA 1D7FA 1TG7A 1V6WA 4P7RA 1PZ3A 2QLYA 2EO7A 4B9ZA 3VD4A 2EEXA 1C92A 2V5CA 2YA1A 3OGRA 2JEPA 3F5LA 2J25A 4AD1A 1JYVA 2NT1A 1ODZA 5DEZA 2QV4A 2G41A 5CGTA 4LQ1A 3VGFA 3RM8A 1U33A 1TVPA 5ABGA 6CGTA 3SURA 1H49A 3ZSSA 5I24A 5BXRA 2VURA 1UH3A 3BMVA 3S2CA 3WF3A 3WNNA 1QBAA 1V6UA 1TE1A 4TVDA 1EQCA 1OT1A 1BLIA 1I1WA 2DT2A 4A3HA 2XGBA 3KZSA 1BVNP 4WK9A 3WEOA 2QHAA 2XGIA 4PMZA 3IAQA 4LX4A 1E3ZA 1G94A 1O7AA 3HJEA 5CPSA 5BYWA 2J74A 4C7GA 1F4AA 4UOZA 1MYRA 2CKSA 1DWGM 3N11A 3EMZA 2JF6A 3VVGA 2ZXBA 5DMYA 3RPMA 1C8QA 1KBBA 3NSMA 2PWHA 2E4TA 3QGVA 1EXPA 1KXHA 1C7TA 5CPTA 1NOUA 3TOPA 3TTSA 3ZJ7A 4HA1A 2DQXA 3KL3A 4IUGA 5CLWA 3LPPA 3VD9A 2J7EA 1BF2A 5CPQA 5FOOA 4UQBA 3SCSA 4CGTA 2CPUA 4UNIA 1Q6EA 4OJYA 2OWWA 3A3HA 3VGGA 4JZ5A 4DWSB 4H8HA 3WDIA 1V3JA 2CYGA 4PUDA 4CVUA 2O9RA 1NWSA 4FLOA 3UESA 4DUVA 3TTYA 1XC6A 3N04A 3L4UA 1JL8A 2QMJA 4DWSD 3ZR5A 3WKZA 1ZJAA 4W7WA 2CXGA 4AZ6A 2J7BA 2BNJA 1TZ7A 1J0ZA 2E8YA 4D6FA 2ZX5A 3ZO9A 3GXDA 3QHOA 1B31A 1DWHM 2XPKA 1K9TA 3AIQA 2XFFA 4AC1X 3EDJA 2XWDA 1UD4A 3LPOA 1KR0A 1BAGA 1CBGA 1JXJA 1TMQA 1GHRA 3LMYA 1W3LA 2GJXB 1VFOA 4PMQA 2ZUMA 1HKKA 4LYPA 3UR7A 4AZ5A 2WK2A 2WMJA 2W66A 1UWUA 1J18A 1V0MA 3HMCA 1HVQA 3WNOA 1X1NA 3N1AA 4AIUA 1VBUA 1W2PA 2ESCA 3CO4A 4BF7A 3W38A 3UCQA 3WF4A 1KR1A 3ZT7A 5A69A 1K6AA 3OGSA 4PCTA 1WDRA 3ZJ6A 2XM1A 1JZ8A 3FHQA 4IM4A 1D2KA 5GNYA 5A6JA 3L4YA 1O6IA 4CN6A 4GZIA 5IFTA 1VFUA 4D6EA 5IDIA 2XIBA 1E4NA 2D0FA 2CBVA 4WKFA 4AZGA 3AI0A 1HIZA 4W93A 1G5AA 4H41A 5AC4A 4X0NA 1NWUA 4NRRA 3WH6A 4U5KA 1CXLA 3B9EA 4KH2A 1BSIA 1QI0A 2ZXQA 2W63A 3SCNA 2VCBA 4CVWA 4UZUA 1QVBA 1VIWA 4BS0A 1P6WA 4DWSC 3UG4A 3VU2A 1IZKA 2D0HA 2DSVA 4HTYA 5JBDA 3ARVA 2WMGA 3CUIA 3CZEA 5A8NA 2PWFA 1IV8A 3MANA 2J77A 2DSUA 4F9DA 1QI5A 5FL1A 3M07A 3CGTA 4FLSA 1XSIA 2TAAA 1J0IA 5DF0A 4GXPA 1HP4A 3GM8A 1CGWA 3ZJ8A 1RP9A 1R7OA 5C70A 3L4VA 3WF0A 2CNCA 1V3LA 2BVDA 3LPFA 4JFSA 3VD5A 1WKYA 1CNVA 2CERA 1JGIA 3DYPA 3IJ9A 1UKSA 1AMYA 3O2LA 2WZEA 1TCMA 2IXVA 1Y7VA 1BGAA 1KCKA 2PWDA 1GVYA 2JEQA 1PBGA 1ISVA 2WHJA 3WF1A 1HJUA 1H3GA 3AROA 1JZ4A 4J3UA 3T08A 1XCXA 4M81A 3OGVA 1IZJA 2DT3A 1BGGA 2WANA 2WWCA 5EB8A 1E6RA 1JDDA 4X9YA 5A6BD 1WZAA 2CBUA 3D3AA 2GDVA 1FH8A 3UERA 4PSPA 4QLJA 2WKGA 4IPNB 1G1YA 3WNPA 2EQDA 1ZS2A 1W2VA 1UH2A 2X05A 2VZOA 3DYOA 2NT0A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4Z2L A;  1UR8 A;  2YKK A;  4MB4 A;  4M82 A;  4TX8 A;  3SCO A;  2FH8 A;  1ISX A;  1FH7 A;  2VQU A;  1M01 A;  4H2C A;  2BHU A;  2WC3 A;  1ZB5 A;  3PZM A;  3T0D A;  1G0C A;  3WF2 A;  1GUV A;  1JF5 A;  1QNS A;  3FXY A;  4ZEP A;  1LLO A;  1UZ1 A;  2X0Y A;  1KGU A;  4PBG A;  3AFB A;  1GHS A;  4UFI A;  3BAK A;  1MQP A;  2HVM A;  3CHC A;  3I3B A;  3L4Z A;  1FA2 A;  2A3C A;  1E4L A;  2J7H A;  2EPK X;  1KQY A;  2WHK A;  3WEL A;  1NAR A;  3CZL A;  4H8U A;  1EHA A;  1UWR A;  4GQQ A;  5ABH A;  2FGL A;  2JFE X;  5FCZ A;  2VJX A;  2V3E A;  3VM5 A;  2YDQ A;  4AY1 A;  5D8W A;  1UD5 A;  1E15 A;  1QI4 A;  1E6N A;  5I3D A;  4P7N A;  4AEE A;  5BXT A;  5E0F A;  1GON A;  3K46 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations