2H8X | Genus

Total Genus 129

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	129
sequence length	358
structure length	358
Chain Sequence	ALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
molecule keywords	Xenobiotic reductase A
publication title	Xenobiotic reductase A in the degradation of quinoline by Pseudomonas putida 86: physiological function, structure and mechanism of 8-hydroxycoumarin reduction. pubmed doi rcsb
source organism	Pseudomonas putida
total genus	129
structure length	358
sequence length	358
ec nomenclature
pdb deposition date	2006-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2h8xA00

4LT9A 3IGXA 4N4QA 5AC7A 1YTKA 1EPXA 3N19B 1KTBA 4P61A 4ADTA 4HNNA 4A29A 1QR7A 4MIMA 1P4CA 3QZEA 1TPFA 2TRSA 4JY8A 1Q6RA 3S1UA 1FCUA 1B4EA 3OIXA 1RZMA 3LRLA 1K7XA 2EHHA 1EP1A 4EIVA 1W3NA 3CEPA 3W2JA 2F7FA 2A7PA 1VCVA 3P7YA 3QMTA 4QNEA 2OCZA 3W2NA 4UTIA 1JVNA 2QCDB 3RLUA 1VYPX 1MXSA 2DU2A 3HBLA 1VCGA 2CW6A 4IJBA 2R94A 3QEZA 3P82A 2V2HA 1T8XA 3FA5A 2V81A 4NNAA 1HFBA 4AB4A 5F1VA 4PL2A 4YCPA 4AMAA 4DQWA 3KAOA 5CSSA 3G1YA 3BLIA 2Y7EA 3C3NA 1LRQA 1IXNA 3ABQA 2RKXA 3S5OA 2CLOA 1G4PA 5KZEA 4JYEA 3M47A 1BWLA 2TYSA 4O17A 1MEIA 2Y70A 5I3GA 4UFJA 1PHWA 1TV7A 1TV8A 1VC4A 4HIBA 2WPBA 3M5VA 3QMRA 4OHQA 3B04A 4A2RA 3W22A 3LTSA 3NR0A 2C3ZA 3LV5A 4UTLA 1M7OA 2Y62A 3T55A 1OG0A 3GDKA 2CZ5A 3N73A 3IEBA 3P62A 3S42A 3TE9A 4UTWA 1DBTA 3NL5A 4O52A 3ATZA 1UB3A 3TK7A 2YW3A 4XBSA 3DKJA 2JGQA 1ICPA 5GVJA 5BW6A 4ZQPA 3UZ5A 4AEOA 2GQ8A 3S1XA 1G7UA 4A22A 2G5WA 2QEZA 1SU5A 2GUUA 5C5YA 4K37A 7TIMA 2ZFAA 4IPIA 1H5YA 3P84A 3SY5A 3UD6A 1K3UA 2ZTJA 4IUOA 2Y61A 2I14A 1RQEA 4O8RA 3S1WA 3KVJA 4NVTA 3LHVA 3UWUA 1I4NA 2ZRWA 2ZBTA 3LXAA 2QCGA 2WSRA 4JYDA 1T96A 5F1UA 3W7OA 1QCWA 1KTNA 3MYOA 4JTFA 3O05A 3NQEA 5D09A 1YDNA 3INPA 4N4PA 5D33A 5J5RA 1AK5A 2H8XA 3NNTA 2Q3OA 2X16A 4S1FA 3WJZA 3TH6A 4ZMGA 1OFRA 3DFOA 1ZJIA 4QJ1A 4BFAA 4RKAA 5EBUA 1LBMA 4AH7A 1O60A 4AXKA 4K7VA 1OYBA 4RXGA 4JTIA 5DCDA 4MY8A 3ANYA 3G3DA 1TQJA 5LSMA 5D05A 1IF2A 1OVDA 1DJNA 2C0AA 2ISVA 3UWWA 4O54A 1NSJA 4NXSA 1Z42A 1JUEA 3MI3A 4LUIA 3TA6A 3TXVA 5K9XA 3TDFA 1GQNA 4BI5A 5FF7A 2CWNA 1KM0A 2HS6A 5BRBA 1O94A 2NZLA 3TC7A 1TYGA 3G1DA 4NQ1A 1JQVA 3TSBA 1LBLA 1UBSA 1OX4A 1HTIA 2XN0A 3P61A 3W83A 2YDAA 4NZJA 1QO2A 4ALDA 1XCFA 1S5VA 2R14A 4UFHA 1LDCA 5F4XA 4X3ZA 3NQVA 1JCJA 5L6UA 4ZQNA 3NO5A 3O15A 4LY8A 3NXFA 4QNWA 4FX6M 1QMLA 4N9BA 2A6LA 1KFCA 2LLEA 1EX5A 4WXYA 1Q6QA 4RR4A 2VFEA 3F4WA 3GK0A 3UPBA 3R13A 3KRSA 4DF0A 3VKJA 4IX0A 2V8ZA 4K8HA 1XM3A 3GNDA 1WX0A 3UNDA 1YXYA 4WXZA 3QPYA 1W1ZA 1ZCOA 2QCEA 1IIGA 1A53A 4FXSA 1OYAA 4FX8A 2ISSA 2QUTA 1LORA 4DEFA 3WK3A 2VELA 3ATYA 3EKZA 2NUYA 3LCFA 4K7YA 4AAJA 4ADSA 4M6PA 3L21A 1RD5A 1XBZA 4WJEA 4UTHA 3GLCA 4JICA 4O1CA 2Y63A 4HSOA 4CLMA 2JK2A 4GUGA 5KZMA 1DQWA 5CPNA 2JGYA 4EF8A 1SW0A 1VH7A 2OT0A 3B0VC 1H63A 4Y8FA 3GDLA 1EUNA 5DXXA 4N9CA 4JR5A 1PHQA 3EWZA 3VCRA 3SFKA 3HPSA 4KFPA 1L9WA 2J27A 3K30A 3NQ6A 4FIRA 2Q8LA 1UUMA 4JS3A 4ZQCA 3GDMA 4RX0A 2YW4A 4GWEA 3QFEA 4CNOA 3M6YA 4CQ9A 5L9FA 2WNZA 2YGYA 1PIIA 3PBUA 5G2IA 3GDTA 4UTTA 1QOPA 4NXKA 1B4KA 2ZZ1A 3TV8A 2B7QA 2I9EA 3OEXA 1B57A 1X7FA 3EWXA 4O4VA 4POCA 1DJQA 3W2LA 4DELA 5LNSA 3M9YA 1WOBA 2A0NA 4OE7A 2VEPA 3NQ7A 1Z41A 2OJPA 1YPFA 2Y88A 1KA9F 1YDVA 3AJXA 3W7MA 3GR8A 3CM4A 3Q58A 3G0SA 4TMBA 4NJJA 5KTLA 1CI1A 1SPQA 1KM6A 3MI2A 4MYXA 3TX9A 1PCWA 3FS2A 1W5PA 3WK2A 4S2CA 3U6WA 2CZFA 5CZJA 1V5XA 2NUWA 4MJMA 4B5NA 3PB0A 4YL2A 5AHFA 4MLJA 1TIMA 3EX2A 2CFFA 3HOJA 2E6AA 2OX1A 1TRIA 5AHNA 3B0UX 4JYFA 4Z1BA 4RV8A 4QQ3A 3HGOA 3W7LA 3NQGA 1I2PA 4PL1A 4BWLA 4O0KA 2Z6JA 1TCDA 4MY9A 1VR6A 5HWNA 4JY9A 2B7OA 3PBYA 2AQWA 3TIMA 3L0KA 4IWWA 3W7RA 2O7QA 2VFHA 3KOFA 5EKYA 3GYEA 3LTYA 2D73A 2VEMA 4NX5A 3TUUA 1G4SA 3DXIA 3EXRA 4MFEA 3S1VA 1HG3A 4IMCA 2E6DA 5IM51 4LTSA 5AB3A 1KFKA 1QWGA 3GXPA 4UMBA 3GXNA 1AL8A 3LXBA 4JIQA 4AHOA 5CSRA 2BLEA 1GVRA 4GC4A 4MVAA 3M5XA 3U2OA 2FTPA 4GRSA 3F03K 2ZA2A 4K38A 1DVJA 1K7EA 1NAL1 3PVFA 4FNPA 4CNPA 3QPZA 1GPWA 1FWSA 3C61A 5E1QA 3SW6A 4DF1A 4KFNA 3F4NA 3BVJA 2WOQA 4XTDA 3TQKA 2XN2A 1NVMA 3BGGA 3HG2A 3H55A 3OVQA 4D2JA 4PCFA 1SFLA 4RK8A 3L68A 2DJLA 2CLLA 4C1LA 1LLZA 1DORA 5EYWA 1A5SA 1H7WA 5I3FA 1AG1O 1MO0A 2PURA 1R2SA 2WNNA 5G2WA 2GVGA 3W1XA 3A5FA 1GT8A 3KVLA 4FB7A 3S8HA 2DORA 4Z1AA 5DBUA 1VPXA 2WSQA 3CWNA 2QJHA 4GFSA 4TMCA 2VFIA 2DZUA 3RF9A 1ICQA 3RLVA 5LKYA 3M43A 3IVUA 1KLYA 3EX6A 4K6AA 4WY0A 1XBVA 2JKPA 3O8AA 5AHMA 2ZZ3A 5C55A 4FNTA 4UFLA 3E49A 2W0UA 3GXTA 2H3DA 5FEZA 3I7QA 3LCXA 4FNSA 3QH2A 3S9YA 4GUFA 3TSMA 3O6DA 3IIXA 3W1QA 3W7PA 5K9CA 1H61A 1OFAA 1FQ0A 4AVFA 3NA8A 5ABTA 3ZFHA 4UR8A 1ME7A 3O6YX 1XXXA 2ZCGA 4OGZA 3LBCA 5AYZA 3E96A 1E51A 3L0GA 2PE4A 3HG4A 4NJKA 4MZ8A 1F5ZA 4BF9A 4PC8A 3QF0A 5A8GA 1W5MA 3MUXA 2RH9A 3V75A 3EXSA 3DBPA 3N34A 4WQ6A 3W84A 1D3HA 1LZOA 3LCGA 3TQVA 1S3HA 1SW3A 3MBFA 4LRTA 2E1DA 4UTJA 3RU6A 1JJKA 4ORIA 4FXRA 2X1RA 3OHIA 2I1OA 2YSWA 2W79A 4JTKA 4Z1DA 4YCOA 3NDOA 4LNYA 1KM2A 1M5WA 1TRDA 3FKRA 4GXMA 3MI6A 2C6QA 1D9EA 2ZRZA 1JUKA 2IQTA 1HUVA 1N8FA 3W9ZA 4MFDA 1G7VA 2B4GA 5LHFA 1IIHA 2NV2A 3NOEA 2ZRYA 1OFDA 3UWZA 4O10A 4QM1A 3W7JA 4FEZA 4Y96A 3LGEA 5G4WA 3FEMA 3UWVA 1L6YA 3G24A 3CTLA 3NQAA 3IIPA 1I45A 3JRKA 1P1XA 2P0OA 1TB3A 4XWUA 2J9ZA 1QAPA 4O28A 4R53A 1FDJA 4OT7A 5H2ZA 2Z2UA 3EWYA 4AF0A 4M7TA 3MBDA 2G96A 4DO4A 3CIWA 3PR2A 1F74A 4JN6A 1LTDA 2YX0A 3VE9A 3FIGA 2CLHA 3DFNA 4LV9A 4N9DA 4FX7A 1KFBA 3G0UA 3PAJA 1FXQA 2E5CA 5DY3A 4QSHA 4EVZA 1FWRA 3C2OA 4O13A 3TSDA 3HO8A 1W31A 4XKYB 2PCQA 3P5YA 1SFJA 2C16A 2FLIA 3BG5A 4JDBA 3C2VA 3LXCA 2AAMA 4IMGA 4MPQA 4QIUA 4CCDA 1FCBA 4A21A 3OA3A 5I3KA 3NPXA 2X1TA 3EEGA 4PH6A 4RJEA 1A5CA 1W3IA 2G95A 1SUXA 1G6CA 1F05A 3W70A 5K9DA 1M7PA 4Y90A 2VFDA 1XUUA 5D2TA 3T78A 1H1YA 5SWUA 1O4UA 3P8IA 5CZSA 2WQPA 2CLKA 2QJGA 2VC6A 2VFGA 3JS3A 2EPHA 4NUWA 1LBFA 4R33A 3W7EA 5G1TA 3KVMA 1OK4A 1VS1A 3W1PA 1XDMA 2X1SA 3S0CA 4IXXA 3O63A 4N9EA 3P81A 2Y7DA 2ABBA 1NF7A 1YLVA 3C6CA 3IIOA 1ZALA 3CT7A 4YLWA 1UASA 4K39A 3UY7A 3M5ZA 4NJIA 2ATMA 3BLEA 1GJPA 2QCCA 5LNUA 3NM1A 3OVPA 2J9YA 5C54A 1GVQA 5AHEA 3PUOA 3LI1A 4JX5A 1IXOA 4O12A 4N6FA 3THAA 1P5BA 4HPJA 4M19A 2ZZ7A 1AW1A 3W7IA 4RZ6A 1GWJA 3W1MA 3Q2DA 1JCXA 2CZEA 1FXPA 5HUOA 3DHDA 1OABA 3MP5A 4ZL1A 4YWIA 4JTHA 1TPWA 3NQCA 4JNMA 2FFCA 3UWQA 1GZGA 4XQ6A 1SZNA 2QR6A 1SQ7A 3W71A 1LOSA 1VHCA 1SZGA 2DZPA 4M5PA 3OVRA 3I7RA 4ORMA 2P10A 3NL6A 3W7QA 3F1QA 2B7NA 1Y0EA 1YADA 1FBAA 1M6JA 4JTUA 3PSVA 3QM3A 1JUBA 1VGAA 1U83A 3W73A 1H7OA 2GQ9A 4AWTA 3EKLA 6ALDA 4JTLA 1TTPA 1OFBA 4S2BA 2NXHA 1ZY9A 3B06A 5CPMA 5BOOA 3HG3A 3W87A 2B0MA 1EA0A 3UWYA 1B9BA 1RVGA 3HG5A 3HF3A 4UNLA 1R2RA 2A7NA 5I3IA 4GUIA 4WY0F 2OZ0A 3W88A 3GKAA 1Z48A 3GKFA 4CQ8A 4E38A 1VQTA 4LS1A 5HNRA 1FCQA 5D03A 4K8EA 1THFD 1X1OA 4HT3A 3LM7A 1JCLA 3LHZA 4O1DA 4DBDA 4UTUA 5D32A 3IIZA 4BI7A 3E9AA 2ZZ4A 2BZNA 4ONVA 2C14A 1EP3A 4ZQMA 3NEVA 3DFSA 2ZZ6A 4I7UA 5EPDA 3LHTA 3M44A 1ZNNA 5DLCA 3W1RA 1C8VA 3P8JA 5HMSA 3A24A 2ZDRA 4MY1A 1Z44A 4W9TA 5IBXC 1FWNA 3ZS4A 2QCLA 1F2JA 1LM1A 2NWSA 2YZRA 4XZ9A 4TR9A 3P67A 3STCA 3W1NA 5D2XA 2CU0A 3W1AA 3CHVA 1FDZA 2YPIA 1KFJA 2A5HA 4MYAA 3QYQA 3G18A 3STEA 3PM6A 5FESA 2NUXA 3S5ZA 3SIZA 4BR1A 5KITA 4A3UA 3DGRA 3T40A 1TPDA 3SGZA 1C9DA 4UFKA 3NM3A 1VLWA 3NQFA 1NFBA 2CLIA 3UXDA 4KWVA 2BWGA 4MZ1A 1CW2A 2E6FA 2HS8A 4CCCA 4O57A 2PRMA 3MHFA 3M7WA 1WBJA 1PVNA 3MO7A 1SZFA 1ZHAA 5DN1A 2P1FA 1EP2A 4OV9A 2QCDA 2XN1A 3MP4A 4LVGA 5J5DA 1TMHA 4UUIA 4TIMA 1KM5A 3IRDA 3HMJG 1J4EA 1GYLA 8TIMA 3CU2A 4KFOA 1NF0A 2CLEA 3ABRA 5DELA 3USBA 3BO9A 4LVDA 1JCYA 4PODA 1OFQA 3LB0A 4XUGA 3MJYA 1LOLA 4JXCA 1RPXA 5FEXA 4IX2A 4TX9A 2TSYA 1KFEA 2DJXA 3TJXA 3RK8A 3CC1A 4L4LA 3WJYA 1QFEA 4UXDA 5LNRA 5HR6A 4RLIA 1TPC1 1ZFJA 3L66A 3B4UA 1ICSA 4WUIA 5A5WA 4LWWA 2QF7A 4FNUA 1F6KA 5C2XA 3W7GA 2A7RA 5D2WA 3NQ8A 1BWKA 1K8YA 3FJLA 4H4IA 4AWUA 3TAOA 3SSJA 3HGSA 1ONRA 3Q94A 1QNVA 2J88A 3FOKA 5G1YA 5HJLA 1VLIA 3MW7A 4X22A 3RFAA 2WV8A 4O14A 3G1XA 3BGJA 3TQ0A 1FY6A 2VFFA 3QQ1A 2Q3RA 3LHUA 2NV1A 6TIMA 1G67A 1DKWA 3W07A 5U4NA 1TTJA 1KV5A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2H8XA

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