2LLEA

Computational design of an eight-stranded (beta/alpha)-barrel from fragments of different folds
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
234
structure length
234
Chain Sequence
MGKIVLIVDDATNGREAVEKYKELKPDIVTMDITMPEMNGIDAIKEIMKIDPNAKIIVCSAMGQQAMVIEAIKAGAKGFIVNTAAVENPSLITQLAQTFGSQAVVVAIDAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRDGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADAAAAASVFHFREIDGRELKEYLKKHGVNLEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Chemotaxis protein CheY, Imidazole glycerol phosphate syntha
publication title Potential of fragment recombination for rational design of proteins.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 70
structure length 234
sequence length 234
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2011-11-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2lleA00
1SUXA 3DH7A 1XUZA 2JKAA 3QYQA 3EXSA 3W2KA 1OYCA 3FYPA 1DV7A 3UWQA 2BLEA 1OX6A 3EEGA 1ZFJA 3LDVA 4M7TA 4QNWA 2TPSA 1KLYA 2E6YA 4AXKA 5D32A 1PIIA 1BWKA 1R47A 1KM5A 4MZ8A 3MP5A 3W1RA 3L66A 2D73A 2ZZ4A 3M5VA 2OT1A 1JR1A 3T55A 4I7VA 1OX5A 1B9BA 5LKYA 4YMZA 2R14A 3PR2A 1QOQA 4PC8A 3O1NA 1MEIA 1NAL1 1LM1A 5F2GA 4HN4A 3BW3A 1GVFA 4ML9A 4AH7A 4IPIA 3QRHA 4AEOA 3ELFA 5KZDA 1OX4B 3TXZA 3QMSA 5F2MA 3WJYA 2VXNA 1NF0A 2CZEA 2YZRA 5BMWA 3W1QA 1ZALA 3EX3A 3S9YA 2H3BA 2AGKA 5CPNA 1A50A 4KFNA 2QCGA 3SIZA 4UMBA 5LSMA 2A21A 1Z42A 1S5TA 3RFAA 1TV7A 1R2SA 1W5PA 2WKJA 4ZQMA 4P2VA 3UXAA 1KTBA 3QW3A 4RKAA 3C52A 4O50A 5KINA 3VCRA 3HJZA 4LRSA 3BV4A 4OQVA 4K38A 1ADOA 4JDYA 3NQ2A 3N34A 5TIMA 3EWWA 1UBSA 3N9SA 3GDLA 3G1AA 4BI6A 1ZY9A 3E12A 1TJPA 4DELA 4I7WA 5EMUA 4MIMA 3F1QA 1SSGA 1C29A 3PWAA 4N02A 1C9DA 2ISWA 1T96A 5EL1A 3TW6A 1TCDA 3WK3A 4DBEA 5HMSA 3DHDA 3W3OA 5AC8A 4JTTA 1DVJA 1H1ZA 1W54A 2H8XA 3LRKA 4PA8A 2VENA 4Q33A 4JNMA 2NLIA 1ZAHA 3GR7A 1DORA 1HO1A 4M6QA 5DXXA 1VGAA 2ABBA 4BWLC 3TAOA 3DFTA 1VYSX 3SJ3A 3IIOA 2YSWA 3NPXA 1L6SA 1SO6A 1OFEA 4O57A 3ABQA 2VEKA 3A9IA 1DJQA 4JYFA 3SGUA 1QO2A 2B7OA 2E5CA 1XM3A 1K02A 4EOUA 1YXDA 2WPBA 4LS2A 1K3UA 1RQBA 2B7NA 2ZA2A 1WAUA 3GKAA 5G4WA 2E77A 1JRBA 3B4UA 5CG7A 2ZQ0A 1XCFA 2Z0IA 3W7JA 4O8RA 1QOPA 3I65A 4CQ9A 4LVAA 1K8ZA 4RZ5A 1JCLA 2VFFA 1OABA 4Q32A 3KHJA 3O05A 3D0CA 4XUGA 1FUYA 3SI9A 3ABSA 1X1OA 1OFOA 5FF7A 1M6JA 8TIMA 3NQ6A 3MYPA 1ZCOA 2QCHA 1QWGA 3DI0A 3NPWA 1FXPA 3ABRA 5G2WA 3W2UA 2O7SA 1GYLA 2QKFA 1SO3A 2J6XA 4DQWA 1SQ7A 4MKNA 5EA9A 4POCA 2Q8ZA 3IVUA 3WJXA 4M6PA 3B0VC 4U28A 1OVDA 2RDTA 4JTEA 3IIXA 1C8VA 3LHYA 5FEWA 1H7WA 1K8YA 4UR8A 4HPXA 4NXKA 5U7SA 3RLUA 1K7XA 2J9XA 5D05A 3UPBA 4ZQNA 5I3FA 5F4SA 3UQNA 3SSJA 3MO7A 1GPWA 4LUJA 3TSBA 4OE7A 3GDMA 1LBMA 2YFOA 1XDLA 4UFMA 4I9AA 1W8SA 2HTMA 3DBPA 2OZ0A 4K36A 5F1VA 1F6KA 4WUIA 4Z0SA 3SZ8A 3QQ1A 1TPEA 3QEZA 1D9EA 1JUEA 2CLFA 4FNPA 3O63A 4MYXA 3MWAA 2NXHA 2CZFA 3G8EA 3W7HA 1VCVA 2EF9A 3CEUA 3UY7A 4IWWA 1GJPA 1VHCA 5AHNA 3A24A 2C15A 1KFCA 4MLRA 2ZYFA 2J9ZA 2C6QA 1PV8A 5D2TA 4MZYA 2WSYA 3TIMA 3C2VA 2A6LA 3MHUA 2NV1A 1OFBA 3QFEA 1D3GA 1GTEA 3LHZA 4R53A 5CSSA 1TPUA 2X1SA 3DHFA 3E96A 3S5ZA 3KVKA 1W31A 1K03A 3TX9A 3AJXA 3S1UA 3UD6A 5T26A 3NQDA 1T8XA 2ABAA 2NXGA 1QO5A 1XBXA 3QM3A 3FJLA 5E93A 3STCA 1LBFA 1UB3A 3SFKA 4O54A 4O53A 1TQXA 3LCGA 3NPUA 1KA9F 3CTLA 3M6YA 4S2BA 3HGRA 1Q6RA 5J5DA 4TMCA 5D04C 4UIOA 3MHFA 3GLCA 2XFWA 3N2MA 3W9ZA 4LV9A 1EEPA 3BK0A 2YPIA 1FWRA 3T7VA 1XBZA 5AYXA 1VPXA 1Q6QA 3KVJA 3FYOA 1AL7A 5G1TA 5I3JA 5MHBA 3N19B 2QUTA 2FB2A 4E0CA 3IVTA 3LI0A 1KFBA 4GWEA 2NUYA 2QJHA 5HINA 3QPZA 1CW2A 3LBMA 4NU7A 2QR6A 3GB6A 2VFHA 2NX3A 1W5MA 4JXCA 3L5AA 4C1LA 2X1UA 3LHWA 2JGQA 3QSTA 2HS8A 1H7OA 3NL2A 4EWND 4ADSA 5FEXA 5CKSA 3M5XA 4WJEA 4UTHA 3OBKA 2QUUA 5SWUA 1X6UA 3HIJA 4E38A 3UPWA 4UFHA 3HG4A 1O4UA 4AMAA 1AW5A 2QDGA 4OHQA 3WJZA 4O4VA 1UUMA 4HNUA 1I8JA 3FIGA 3KVLA 4Y9AA 1EUAA 4FO4A 4UNKA 1OFQA 1WA3A 5AFDA 2NUXA 3G3MA 1YLVA 3NQGA 4KWVA 3VKJA 4UTTA 2OT0A 4HNTA 5K4XA 1TTPA 3C2FA 5L6UA 5LNSA 3GXPA 1S5VA 3B04A 2C0AA 1B4KA 1QPOA 4B5NA 1W1ZA 1JCYA 1FDYA 4JDBA 3F03K 3M43A 3TFXA 5F2LA 3Q58A 3H53A 2P0OA 2J27A 3P61A 4GUFA 4ORMA 1ZENA 4IXXA 1IXPA 1GG0A 5FEZA 1F5ZA 3DFQA 3I68A 1F76A 5D33A 3DGRA 2XN0A 2AQWA 1H61A 2R91A 1L2UA 1LTDA 4BI5A 4FNRA 3G8RA 3GX9A 3LBCA 1RR2A 3E49A 4UMCA 4JTUA 3TSMA 3WK2A 3BLFA 3MUXA 3KAOA 3IIZA 3W7NA 2TRSA 1NFBA 4E2BA 3I6RA 3W1XA 4LW7A 6ALDA 2EPHA 4ZMGA 1UCWA 1SR9A 3S5NA 3GDKA 4MY9A 2DZXA 2BXVA 1IXNA 5LNUA 4HSNA 2H6RA 3UWVA 3THQA 3LLDA 1F2JA 1JULA 1LDCA 2GQ9A 1A5SA 4BF9A 3SY5A 1LOQA 1XUUA 4ZVJA 3LM7A 3PUEA 3STFA 5E0KA 2PURA 5AHIA 2KZHA 3O16A 1LP6A 1XI3A 3QC3A 1DOSA 2V2CA 2PC4A 3QW4B 4FNSA 1L6YA 3EWYA 1WBHA 2YFNA 5AC6A 1OF6A 2G96A 1N55A 3BLEA 5LNVA 2FFCA 4RV8A 4Y90A 2H8ZA 3VFLA 3W22A 3DZ1A 4JTIA 3HQ1A 4YCPA 2FJKA 3LCLA 1GT8A 3LTPA 3L2IA 2Q3RA 3G1HA 3B05A 3VNDA 4BK9A 3W7KA 1RQEA 4IMFA 4NUWA 3UY8A 3T4CA 4LY8A 1W0MA 3W7LA 4S2CA 3C6CA 1BWLA 3LOTA 3ZR4A 4FXSA 3QQ0A 3FFSA 4OT7A 2OMAA 5G2IA 4L4LA 3P67A 4UR7A 2V2HA 3HPSA 2DJXA 4O28A 3NZRA 1NEYA 2VFEA 1WX0A 3GVGA 4ZQCA 3EWZA 1SW7A 3QMRA 1Z44A 1HG3A 1K8XA 3DKLA 3MMTA 4RZ4A 1JCMP 3F4NA 2Y89A 1TO3A 4XZ9A 1TPWA 3LB0A 2VFIA 1V7YA 2JK2A 4O15A 2FTPA 3EX4A 2LLEA 3BGJA 2JKEA 3Q2DA 1KM1A 3NQMA 4JTJA 1H1YA 4J9JA 2YXGA 2QF7A 3EX6A 3TROA 2QCLA 3TR2A 1VYRA 3PSVA 2QAFA 5DCDA 4O4WA 1TPFA 1E51A 4DF1A 3W1TA 3W7OA 1O5KA 1F05A 4P61A 3KXQA 4A2RA 3PUOA 4HKPA 1PL9A 4GUHA 4NJJA 4EF8A 2VFDA 4MYAA 3GXTA 2YYTA 4NNAA 2F84A 4LVDA 4ADTA 4JTGA 3T78A 1H50A 4AHOA 4MY8A 3LRLA 3UWYA 5K9CA 2PRHA 3DKJA 1PS9A 3PBVA 4WY0B 3W1LA 1KLZA 1KFJA 1LROA 1ZNNA 2A7NA 1S3HA 4XTDA 1QMLA 1MZHA 1NSJA 3FLUA 4WOZA 3FS2A 4FX8A 2QCDB 3GR8A 4CNOA 1ZJIA 3QH2A 4QAIA 3P60A 5LZLA 2YW3A 4GUJA 4QISA 4CCCA 4HIBA 3BGGA 1J4EA 4XBSA 4AWTA 5KZMA 3QMTA 5D09A 2ZRZA 4N6FA 3IEBA 2A6NA 2NUWA 3M41A 3NL6A 3W75A 3L5LA 1IF2A 1RVGA 3LGEA 1G6CA 2JBMA 4TO8A 1M7OA 1XFBA 3HF3A 2CLLA 4O18A 1FCQA 1KTNA 2V2DA 1XXXA 3LXBA 5I3HA 4NVTA 1RD5A 1H7XA 1EWDA 3HGOA 4UMAA 3W2LA 3VI2A 3M16A 4QM1A 3MYOA 4AF0B 4HPJA 3PY2A 1M5WA 3W1UA 4MFEA 4ORIA 2GUUA 2QCMA 1YXCA 1SO4A 3FA5A 5C54A 1IXQA 2CWNA 3P5YA 4JICA 4HNVA 3UZJA 3ZWTA 2GVGA 3L0NA 2Y63A 4MPQA 4N4QA 1FWSA 3B03A 1LZOA 4JX5A 3S5OA 2EGZA 1I45A 4O1BA 3E02A 2Y6ZA 1YTKA 2NV2A 4NNCA 4XKYA 1I2QA 2ZZ2A 2X16A 1G67A 3N2XA 4O17A 4RJEA 2ZZ1A 2A7RA 4WXYA 1LLZA 4L4MA 1RQHA 3UYCA 4TIMA 3PC0A 3W6YA 2B7QA 3LXAA 1QPRA 2FQIA 1FX6A 3QF0A 1SU5A 1WYIA 3B8DA 4JIQA 3NG3A 4UFKA 4UTJA 5EY5A 3HG5A 4QNEA 1ONRA 1DL3A 3W74A 4Y8FA 4UFIA 1NF7A 1OHLA 5F2IA 4AVFA 1J5TA 2WV8A 3EX2A 5D2YA 2QDHA 3LV5A 7TIMA 1ME8A 4JTLA 4LTSA 5KSWA 2Y7FA 2VKZG 1SFJA 3Q94A 2ZCGA 3IGSA 2V82A 3LCHA 1MEWA 1G69A 1MEHA 3P74A 3RLVA 1WV2A 3CEPA 4NQ1A 3W76A 2GVJA 3ATYA 3H55A 3NQAA 3L9CA 3W84A 3G24A 1PHWA 2Y85A 5EBUA 1WBJA 4LS0A 4WXZA 2C16A 4QIUA 1KV5A 3TMQA 4LV4A 3HB9A 2NWRA 3N14A 1EP3A 4JS3A 4MVAA 2GOUA 2Z2UA 3KVMA 1GEQA 3C61A 5LGZA 3MP3A 1HUVA 1OK6A 3N73A 1GVSA 2CLOA 3IRDA 3VE7A 4AHPA 4OU1A 2DZSA 2ZTJA 1XL9A 2DJLA 3R89A 2B0MA 4O16A 5G1YA 3LTYA 2DZVA 1RV8A 2R8WA 2X1TA 2QJGA 4WOQA 2QCEA 1OFAA 4G1KA 4IX0A 5DELA 2VEMA 1P1XA 4A2SA 1DHPA 4HHPA 3W07A 3LRMA 3NM3A 3GDTA 4DPQA 1AL8A 1FCVA 4NX0A 4JX4A 4HNNA 4AAJA 4JYEA 3IIVA 3R2GA 3CWOX 4DEFA 2Y62A 4IPJA 3PAJA 1TSIA 4O11A 3TK7A 4FHAA 5CGQA 3W23A 1Z41A 3GNNA 3TFCA 1VJIA 1G4SA 4Z1AA 2YX0A 1FXQA 3A22A 4UTIA 4YLWA 2X2GA 3FOKA 4ZZ9A 3M5ZA 3EX1A 4YXGA 1OFPA 2WSQA 2ZRWA 3LCXA 2CLKA 1LCOA 3EXTA 2Y88A 3S1VA 4D2JA 4WY0F 3CU2A 1HFBA 2VC6A 5K4ZA 2VEIA 4A29A 5I3KA 3PB0A 3HBLA 2A0NA 2E6AA 4RLIA 3G22A 3NM1A 3KRSA 3NQ8A 1S5WA 3NXFA 5D30A 4U4MA 2EAWA 5AYYA 4UXDA 4NJGA 3RK8A 1W3IA 4UTWA 1GWJA 4WX2A 1TTQA 3FJ6A 5IBXA 3JS3A 2CLMA 1TMHA 1JCNA 3G3DA 5D03A 5C55A 1SW3A 1SZEA 2ZZ3A 1TRDA 4GFSA 2O7QA 4CNNA 3NQCA 1IIHA 3W72A 3FKKA 1YYAA 4UC5A 1YDOA 2BTMA 2W79A 3BLIA 4JN6A 3BARA 5U4NA 2Y7DA 1VCGA 2WOQA 4ONVA 5KMYA 3UZ5A 4MOZA 3GZ3A 1WOAA 1ZHAA 2B4GA 2CZDA 3A21A 3CPRA 5D2XA 1YPIA 2RDUA 3O6YX 5FF0A 2ZDRA 2A4AA 4GUGA 3O15A 3PG9A 1VLIA 4UUIA 1XDMA 1KFEA 3L65A 1KM3A 3PG8A 1TPH1 3W85A 4JY8A 5C5YA 2HSAA 4QQ3A 3G1VA 3NOEA 1KTCA 1MO0A 5H91A 4S1FA 5BRBA 1TIMA 2CZ5A 5D02A 3RNDA 1B3OA 4Q4KA 5DXYA 1KBJA 3OG3A 1FWTA 2E5DA 1ME7A 2WSRA 5EYWA 3LHTA 4JIPA 3GYEA 4E2DA 3C2OA 1XKYA 1JUBA 1THFD 3LV6A 4MZ1A 5AOUA 1VLWA 4MLJA 1W5OA 4FNQA 4CQAA 1KFLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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