2WHMA

Cellvibrio japonicus man26a e121a and e320g double mutant in complex with mannobiose
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
381
structure length
377
Chain Sequence
KPVTVKLVDSQATMETRSLFAFMQEQRRHSIMFGHQHETTQGLTITRTDGTQSDTFNAVGDFAAVYGWDTLSIVAPKAAGDIVAQVKKAYARGGIITVSSHFDNPKTDTQKGVWPVGTSWDQTPAVVDSLPGGAYNPVLNGYLDQVAEWANNLKDEQGRLIPVIFRLYHENTGSWFWWGDKQSTPEQYKQLFRYSVEYLRDVKGVRNFLYAYSPNNFWDVTEANYLERYPGDEWVDVLGFDTYGPVADNADWFRNVVANAALVARMAEARGKIPVISGIGIRAPDIEAGLYDNQWYRKLISGLKADPDAREIAFLLVWRNAPQGVPGQVPHYWVPANRPENINNGTLEDFQAFYADEFTAFNRDIEQVYQRPTLIVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA MANNANASE, MAN26A
publication title Understanding How Diverse -Mannanases Recognise Heterogeneous Substrates.
pubmed doi rcsb
source organism Cellvibrio japonicus
total genus 152
structure length 377
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2009-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2whmA00
2GDVA 1C3FA 4W8BA 1NWUA 1H3GA 3VD5A 2VQTA 3AS1A 5CGMA 3VGHA 3ZOAA 3WF3A 2GK1A 3AJ7A 3RM8A 4NZCA 1NWSA 3WD1A 2ZUTA 2E9MA 4CD7A 1JF6A 3ZM8A 4WJXA 3POCA 2NSXA 1DP0A 3SCNA 3BLKA 3RJYA 5A6AA 2J7FA 1H41A 1S46A 7A3HA 4F9DA 1JYXA 2PWGA 5HPOA 4HMEA 1GQLA 4KWUA 1EQCA 2X09A 2JE8A 4UOJA 1GQKA 2PF0A 4L4OA 3WFLA 1O6IA 2J25A 1EQPA 1DWFM 4DUXA 4AYSA 5LA1A 4Z2IA 2PWFA 3N17A 2XM2A 2BVTA 2JF7A 4DM1A 5I77A 1KB3A 4OOZA 5E6YA 1US3A 1MQRA 5A8MA 2BY1A 1KGUA 4HA1A 1GHRA 2CCRA 2XUCA 1XC6A 2VZTA 3PZNA 1DWHM 2CKRA 4S3JA 2VX4A 5JIWA 5I78A 3KWXA 5LA0A 3F5KA 1KFWA 1VIWA 2RGMA 3VGEA 2G3MA 1CENA 3VILA 1GCYA 2O9TA 2Z1KA 1KXTA 4PBGA 2OYMA 4HZ6A 5I79A 4KRTA 1V6WA 1B0IA 2YL8A 3WDRA 4EE9A 1VB9A 1PPIA 1TZ7A 4W93A 4AMCA 3ZT7A 1LL7A 4CUCA 4J27A 5A1AA 1UOKA 2W4XA 1K9EA 3KL5A 5DT7A 1JAKA 1OM0A 1C90A 1UH2A 2OWCA 1E6RA 2CIPA 4FLSA 3AHXA 1XCXA 2XVNA 3VGGA 2HISA 3VINA 3VD7A 4PMXA 3D3AA 3QOMA 1WZMA 5HPCA 2OSXA 1JFHA 2WCSA 5EB8A 2G3JA 1G01A 1W1TA 1ZJBA 2ZICA 1L8NA 4AIEA 2YLAA 4PMQA 4KRUA 1JZ6A 1E0VA 2WCGA 4GQRA 1XD0A 3MUIA 2BXYA 3MUZ1 2J7DA 3NSNA 1QI4A 3A6OA 1V3JA 5C71A 2X05A 2BFGA 3JUGA 1WB0A 1E40A 3ZSTA 2Y5EA 5ABFB 3SUTA 3AXIA 3KE0A 3GM8A 3A3HA 2WC3A 4Z2HA 4FK9A 1UD5A 4U5KA 1O7AA 2XVLA 1MW2A 1WDPA 3N12A 4XZBA 2ZUSA 3ARSA 4TXEA 1FH7A 3MS8A 4MB3A 5HNNA 1L0PA 2TAAA 3GNOA 2CESA 2JIEA 1C8XA 2D0HA 3AIWA 1G1YA 3WNLA 4JHZA 5A2BA 1C91A 1CDGA 3AHZA 4JL2A 1M04A 3AHTA 1V6YA 4M56A 2GFTA 3AMLA 1HL8A 3ZIZA 4H04A 1UQZA 1JZ4A 1HVQA 5CPSA 4IM4A 4A3HA 1OD8A 2ZX9A 9CGTA 4J3UA 3VIOA 1CXLA 1Q6DA 3BLPX 4W7VA 4AIUA 2D20A 1IV8A 2JEQA 3SCRA 2CBJA 2PWHA 1KGXA 2DIJA 2VO5A 1BGGA 3F4VA 3CMGA 2XSAA 4PSPA 3VD3A 5D9NA 2YKKA 1W3HA 4BA0A 4AY1A 1ISWA 1CXEA 5CSYA 1ZBWA 3CTTA 1MWOA 3VDBA 3FAXA 2IUZA 1Q4NX 1R7OA 2VMFA 1KGWA 2CPUA 1LQ0A 2C0HA 1BF2A 1BVZA 2CERA 1R85A 2VZUA 3ZMRA 4JFUA 2VX7A 4QAWA 4WLCA 3BAIA 4MDPA 4AC1X 1ZBKA 3AI0A 2QMKA 5FD0A 2VCBA 4D1JA 1W9UA 4CGTA 2A3CA 1UZ4A 3MANA 1W2VA 1R7AA 2WMJA 3L2LA 3CMJA 4AZHA 2WLYA 3UG5A 4UOZA 1UR2A 4WSJA 1SYTA 1CXIA 1XGZA 4FLOA 3GNRA 3ZO9A 1NWRA 3CZEA 4W8AA 4ACZA 2DSVA 1U33A 1BAGA 4WSKA 4TOQA 3VTRA 4AXNA 4GZEA 2WAGA 5IFTA 2NT0A 3PN8A 4PMDA 1PJ9A 2QV4A 3AS0A 3M07A 2E0PA 2WANA 3WNOA 3VD4A 2XWDA 5AC5A 1MQPA 2XYLA 5DEZA 1DEDA 3F5LA 5D8WA 3RILA 3WUBA 4E8CA 4JL1A 4GO8A 3AMCA 3T09A 4MJ4A 1VAHA 2WXDM 3K4DA 3ARYA 4Y7EA 1MFVA 1QHZA 1R87A 3TA9A 4GXPA 4PUEA 1H2JA 4CVUA 3CHFA 4PTVA 3AYRA 4CU8A 1XH1A 4U2ZA 1WO2A 2E3ZA 2XTKA 3FW6A 3TTOA 4GINA 2D0GA 2VURA 1V3LA 1X1NA 1TG7A 1GQIA 2A3EA 3NSMA 1QHPA 3G6LA 3ECQA 1IT0A 3FN9A 4W84A 2WK2A 3EMQA 2DT2A 4A4AA 2PC8A 2YA2A 1CLXA 3VDCA 5A8PA 1B3WA 2FGLA 4DWSA 1WDRA 4DM2A 1XH2A 1B90A 4HOXA 2UY4A 4TX6A 3OLDA 4OBRA 1W9PA 1SFSA 2GSJA 4OJYA 3WD4A 4IUGA 2Y24A 2WM0A 5BXRA 3ARXA 3EYPA 1JYNA 3L4WA 1VEPA 2ZUNA 3CIVA 4CD5A 4PMYA 1CPUA 1UWIA 1V0LA 2BS9A 4V28A 3TTYA 3L4XA 1ZL1A 3SUWA 1QNOA 1K9TA 1OGSA 1V0NA 3AHYA 3WUFA 2WB5A 4HPHA 4UZSA 4RL3A 3PZIA 5I2UA 4QDMA 2PWDA 4U5IA 4GPNA 1QI5A 1QPKA 1SR0A 1W9DM 2ZXAA 4PMNA 1BYDA 1VBUA 3PZGA 2ZUWA 4CD4A 4TVCA 1Q6EA 4M80A 5D4YA 2ZX7A 3N04A 4DUVA 2YLLA 1TCMA 2WVVA 4FMVA 4MPKA 1ISVA 4JAWA 2EO7A 3WUEA 1LWJA 1CNVA 3EMCA 4R5EA 5FIPA 3RIKA 3AROA 3EBVA 3ARZA 2D0FA 2PWEA 3S2CA 1ITCA 2YDRA 4R27A 3UG3A 2YBTA 4ZEPA 3OLGA 2QHAA 4MDOA 1GZJA 1UWQA 3GXFA 4ZE4A 1UR0A 1WZKA 4PEEA 1QHOA 2VX5A 3WNKA 1UQYA 1ISYA 4ML4A 2EPMX 4AZIA 2EPOA 1H5VA 1CXKA 1F4AA 5ECUA 1B30A 3WDJA 5A94A 2DGAA 3BMWA 3PBGA 1TA3B 3VIHA 1I1WA 4C7GA 1LJYA 1EIBA 1NOWA 1HJWA 3D5HA 1IZJA 1E6XM 1KXQA 4QLLA 4AZ5A 4UFHA 1E4LA 3W27A 5LA2A 4JFVA 1V0KA 3MO4A 2Y2WA 3BSGA 1E1EA 1UWUA 3OGRA 5CGTA 3WF1A 4XV0A 3BSHA 3K1DA 1CGVA 4CVWA 4GQQA 4HPGA 4P8VA 1QBAA 1W1PA 3AMKA 4D6JA 5FCZA 1XHGA 3VIIA 1VENA 1VBRA 4JCLA 1W1YA 2AMGA 2WYSA 1WAWA 1E56A 3OIHA 3WNPA 3NDYA 4V27A 1C93A 3BAKA 3M6DA 3DHUA 1TR1A 2D1ZA 3OLEA 1TE1A 1PBGA 1HJXA 2J77A 4X9YA 2VCCA 4ACYA 4NI3A 3WD2A 4UFIA 4AD4A 2FH8A 2J75A 1HXJA 4HMCA 5EFDA 3N9KA 5I0DA 5ABFA 1OSEA 4K68A 1HP4A 3RM9A 4MB1A 3WUGA 1KR0A 3IJ9A 4H2CA 1M03A 1ZB5A 2NT1A 1JYWA 3THDA 3GXMA 3T0AA 2BHUA 1J18A 1I75A 5DF0A 3W53A 3KZSA 3IK2A 2ZXQA 3PHAA 2VL4A 1JXJA 2QPSA 2IXUA 1EDTA 3L4YA 3WH6A 1ZBVA 4B15A 1BG4A 1YQ2A 1ISZA 2VZVA 3SURA 1JGIA 1CGTA 2OWXA 1GOKA 4W7UA 3T08A 2JFEX 3N1AA 3ALFA 1OT2A 5GQBA 1GOQA 4YHEA 4PMUA 4BQ3A 3ZJKA 3AMGA 1W1VA 5CLTA 1J9YA 2D24A 2HVMA 4FF5A 5DO8A 1JDAA 1ODZA 4H8UA 4XX6A 3M7SA 4D1IA 1UWSA 4U33A 3WEOA 1A47A 5DT5A 2WHKA 4LPCA 1K6AA 1BLIA 4PCTA 1V02E 2CYGA 4JFSA 5CG0A 5CQ1A 3FHQA 3SCWA 3VNZA 2J62A 4ZFMA 2WSKA 5FOOA 2O9PA 2WVVB 4D6CA 3KL0A 3UETA 1BHGA 1JD7A 2WCAA 2OWWA 1E43A 4LGXA 3II1A 1KXHA 1LG2A 4P7RA 1AQ0A 4MNLA 1FFRA 3ARVA 4BQ4A 1IZKA 4M1RA 3SIMA 1RP8A 4CKQA 1XRVA 3CUGA 5HDRA 3WBEA 3F5JA 1NWTA 6CGTA 1SMAA 2F8QA 3MU7A 1NOFA 4PCSA 1OGBA 2FHFA 2C8NA 1BYCA 4AWEA 1DWIM 3WMSA 3ZJ8A 3AXHA 3WDIA 1FA2A 1EXPA 2BY0A 4D6DA 4BZYA 5BYWA 2J7CA 3N11A 3OGSA 4HZ8A 5EFFA 4X0VA 1HN1A 5E0FA 1QW9A 1Q6CA 1GOMA 1LG1A 3O9NA 3UERA 1EOMA 2YL5A 4PMRA 2D23A 1J0HA 5JUVA 1UD8A 5IHSA 3B9DA 4U3CA 1E9LA 1H4PA 1V0MA 1C8YA 5A2AA 2GJXA 2VTFA 4JKLA 3W0KA 1WCGA 2XVKA 4UQCA 4ZENA 1M53A 4J28A 4UQDA 4D6FA 4F8XA 5BRQA 3K4AA 1LL6A 1MXDA 3DECA 4HTYA 2CBVA 1JL8A 1UR9A 4LXFA 5EMYA 3ALGA 2EEXA 1NP0A 3PZ9A 1VEOA 1FH8A 1UD2A 1VJZA 4UNIA 1B31A 2BY3A 3POHA 1VJSA 3W4RA 5A6MA 3MMUA 1CGYA 3EDDA 1HJUA 3UR8A 1XYFA 3ARWA 1LL4A 3AS3A 1UZ1A 3WQ5A 4M24A 1HJQA 4ATWA 2YIHA 1JYVA 4PSRA 4AD1A 1JDCA 1V3IA 3WSUA 1BSIA 1VFFA 1RH9A 3AXXA 1KQZA 3SCPA 5FKYA 3WH9A 4AZ6A 3HN3A 2VZOA 3UR7A 1E72M 2WVUA 4YN5A 3IAPA 2D2OA 1VRXA 4H8VA 3RMEA 2EPNA 2EJ1A 4PYSA 1WZAA 3WDQA 2WMHA 1HKJA 1H0GA 4P8UA 3K46A 2VVSA 1J01A 1V08A 1D3CA 3SCQA 2ZUMA 2XIIA 3SUUA 1W32A 1OGGA 1WE5A 5M03A 3VGBA 1HNYA 1G9HA 3VOCA 4UFMA 3WH5A 2Y4SA 3GTNA 3UG4A 4HA3A 1EHNA 3CUJA 4P7LA 2QPUA 1QOXA 1GORA 1NH6A 1EDQA 3AFBA 2VQUA 4RE4A 1E71M 1XYZA 3IAQA 3VMOA 4MNKA 2J8FA 5C8BB 1RD6A 2FHCA 2W62A 3L4ZA 1PAMA 1E55A 5IHRA 5KZ6A 1KCKA 3CH9A 4MAVA 3TP4A 1E6ZA 5TD4A 1J10A 4J3SA 4W5ZA 2WZHA 2Y8KA 4MNJA 1PX3A 4F79A 3MUY1 2XWEA 1W91A 1QBBA 1G0CA 4MB5A 3VM5A 5A6KA 1MQQA 1TA3A 4P8XA 5EBAA 1BTCA 2EQDA 1DTUA 2QF8A 2OSYA 3TONA 4HMDA 4B3KA 4DWSC 1EDGA 4F9JA 1DHKA 2G3NA 2G4FA 3SEPA 2PI6A 3WF0A 4J3VA 4WF7A 1HVXA 2E8YA 1UR4A 5I24A 2W67A 3WDHA 5A8NA 3NUKA 3AIQA 1JZ3A 4MADA 2DPEA 1YHTA 3AIRA 3KEHA 5F7UA 4H41A 5ABGA 3A4AA 1UKTA 3L2MA 2XIBA 4HU8A 2GJXB 4Q22A 2DT0A 1KQYA 5IFPA 3B8SA 4KGJA 3ARQA 4M8UA 2ZWYA 1RPKA 1UG6A 3QHMA 3VD9A 1ODUA 1KBBA 3VO0A 3I3EA 3PZVA 3NIYA 1FOBA 2EPLX 1HJSA 4U31A 2DH3A 3A47A 4JCMA 1OBAA 1CXHA 2O9OA 2V38A 2WVSA 3WL1A 3IJ8A 4IPLA 3VUPA 4AISA 3ZT5A 4P7OA 5GNZA 3VIPA 2WVTA 4GI9A 1UD6A 2YA0A 3FHAA 1E6QM 3VNYA 1TUXA 3CZKA 3PZTA 4NRRA 4AD5A 4WKFA 1E6SM 1E3ZA 3BC9A 1UKSA 4PMOA 1ZJAA 3WEMA 1VF8A 1W9XA 2ZOXA 3U57A 1C7SA 4M81A 4HP5A 3VMNA 1CGUA 1OWQA 2DEPA 1GOOA 1SMDA 3BAJA 4IISA 4A3YA 4W87A 2XFRA 3ZSSA 3GH4A 3VGDA 5A6BD 5A8OA 1F4HA 3CZJA 3AQUA 2GJRA 3WF4A 1CTNA 3BAWA 3T0DA 2CITA 2VUYA 3OGVA 2GUYA 5CJ5A 1H49A 3PZUA 2CHNA 2VR5A 2ZUUA 3MV11 5BCAA 5BWFA 1G5AA 5CSUA 2YDSA 2JEPA 3RM4A 3LPOA 1NM9A 1WKYA 3GBDA 3AIEA 5GNYA 3AS2A 2XPKA 3UEQA 1AQHA 5E9AA 2A3HA 2XFYA 4MNMA 3T0BA 3WL0A 4JHOA 4W88A 1BG9A 4WKHA 3MSGA 1H0IA 3OG2A 5CXPA 1XH0A 1FHLA 3AISA 3VX1A 4CU7A 4GIAA 2BVYA 4D6HA 1UD4A 2G3IA 4UQEA 3AZTA 3QHNA 4ATDA 1CZ1A 5A2CA 5ABEA 1R86A 1I1XA 1FP8A 3CZGA 1V02A 4URIA 1AMYA 1GW1A 4UR9A 1ZU8A 2WWCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2GDV A;  1C3F A;  4W8B A;  1NWU A;  1H3G A;  3VD5 A;  2VQT A;  3AS1 A;  5CGM A;  3VGH A;  3ZOA A;  3WF3 A;  2GK1 A;  3AJ7 A;  3RM8 A;  4NZC A;  1NWS A;  3WD1 A;  2ZUT A;  2E9M A;  4CD7 A;  1JF6 A;  3ZM8 A;  4WJX A;  3POC A;  2NSX A;  1DP0 A;  3SCN A;  3BLK A;  3RJY A;  5A6A A;  2J7F A;  1H41 A;  1S46 A;  7A3H A;  4F9D A;  1JYX A;  2PWG A;  5HPO A;  4HME A;  1GQL A;  4KWU A;  1EQC A;  2X09 A;  2JE8 A;  4UOJ A;  1GQK A;  2PF0 A;  4L4O A;  3WFL A;  1O6I A;  2J25 A;  1EQP A;  1DWF M;  4DUX A;  4AYS A;  5LA1 A;  4Z2I A;  2PWF A;  3N17 A;  2XM2 A;  2BVT A;  2JF7 A;  4DM1 A;  5I77 A;  1KB3 A;  4OOZ A;  5E6Y A;  1US3 A;  1MQR A;  5A8M A;  2BY1 A;  1KGU A;  4HA1 A;  1GHR A;  2CCR A;  2XUC A;  1XC6 A;  2VZT A;  3PZN A;  1DWH M;  2CKR A;  4S3J A;  2VX4 A;  5JIW A;  5I78 A;  3KWX A;  5LA0 A;  3F5K A;  1KFW A;  1VIW A;  2RGM A;  3VGE A;  2G3M A;  1CEN A;  3VIL A;  1GCY A;  2O9T A;  2Z1K A;  1KXT A;  4PBG A;  2OYM A;  4HZ6 A;  5I79 A;  4KRT A;  1V6W A;  1B0I A;  2YL8 A;  3WDR A;  4EE9 A;  1VB9 A;  1PPI A;  1TZ7 A;  4W93 A;  4AMC A;  3ZT7 A;  1LL7 A;  4CUC A;  4J27 A;  5A1A A;  1UOK A;  2W4X A;  1K9E A;  3KL5 A;  5DT7 A;  1JAK A;  1OM0 A;  1C90 A;  1UH2 A;  2OWC A;  1E6R A;  2CIP A;  4FLS A;  3AHX A;  1XCX A;  2XVN A;  3VGG A;  2HIS A;  3VIN A;  3VD7 A;  4PMX A;  3D3A A;  3QOM A;  1WZM A;  5HPC A;  2OSX A;  1JFH A;  2WCS A;  5EB8 A;  2G3J A;  1G01 A;  1W1T A;  1ZJB A;  2ZIC A;  1L8N A;  4AIE A;  2YLA A;  4PMQ A;  4KRU A;  1JZ6 A;  1E0V A;  2WCG A;  4GQR A;  1XD0 A;  3MUI A;  2BXY A;  3MUZ 1;  2J7D A;  3NSN A;  1QI4 A;  3A6O A;  1V3J A;  5C71 A;  2X05 A;  2BFG A;  3JUG A;  1WB0 A;  1E40 A;  3ZST A;  2Y5E A;  5ABF B;  3SUT A;  3AXI A;  3KE0 A;  3GM8 A;  3A3H A;  2WC3 A;  4Z2H A;  4FK9 A;  1UD5 A;  4U5K A;  1O7A A;  2XVL A;  1MW2 A;  1WDP A;  3N12 A;  4XZB A;  2ZUS A;  3ARS A;  4TXE A;  1FH7 A;  3MS8 A;  4MB3 A;  5HNN A;  1L0P A;  2TAA A;  3GNO A;  2CES A;  2JIE A;  1C8X A;  2D0H A;  3AIW A;  1G1Y A;  3WNL A;  4JHZ A;  5A2B A;  1C91 A;  1CDG A;  3AHZ A;  4JL2 A;  1M04 A;  3AHT A;  1V6Y A;  4M56 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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