5CZ0A

Neisseria meningitidis 3 dexy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase glu98ala variant
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
334
structure length
334
Chain Sequence
KELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFAKPRTTVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLSVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase
publication title NmeDAH7PS E98A variant at 2.5 Angstroms resolution
rcsb
source organism Neisseria meningitidis serogroup b (strain mc58)
total genus 122
structure length 334
sequence length 334
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2015-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5cz0A00
2ZTJA 4GFSA 2QCMA 2FLIA 2FFCA 4JICA 3QMTA 1HO4A 3JS3A 3GDLA 3EWYA 1M7PA 1XBVA 1TSIA 4JX5A 4XKYA 1DKWA 2YSWA 1LDCA 1XCFA 3GDKA 4AB4A 1GVRA 3TV8A 4CCCA 4HT3A 3QMSA 4GBUA 4QQ3A 5K2ZA 2FPVA 4N4PA 4MIMA 2B7QA 2R91A 3KXQA 4Y8FA 2ZRUA 2R94A 3A23A 4XBKA 5D2TA 1O5XA 3QRHA 2E6AA 4WXYA 1H61A 3MP4A 3BW4A 2VFDA 3H54A 1G4TA 1XUZA 3S9YA 1TTJA 3BK0A 3KRUA 3LV5A 3NOEA 4IX2A 1G7UA 3LB0A 4O0KA 2A1YA 2G95A 2YZRA 3L0NA 1DJQA 4AXKA 2NUWA 2DZWA 1WX0A 2WJZA 3PBVA 4EOUA 1H7OA 3KVKA 4XKYB 2QJHA 3AO0A 1P4CA 2C13A 4M7TA 4EF8A 1I4NA 4FNUA 4TIMA 3E0IA 3BGJA 4IPIA 1IXNA 2GQAA 2ABAA 1B9BA 3NXFA 4NNCA 3G1DA 3B0UX 3GNDA 2V30A 3C6CA 3F4WA 1TV8A 4DF2A 1TQXA 1CX9A 1TPWA 4BR1A 2DZSA 4UFHA 2Y70A 1DV7A 3M5VA 4PTNA 1KA9F 5FEZA 1VPXA 4IXHA 4JYFA 4AWSA 1FXQA 1PL9A 4FNRA 4LUJA 1R30A 3NPVA 1MZHA 5H91A 3C56A 5G4WA 5DXYA 3ZWSA 3SSJA 2Q8ZA 1W8SA 4MYAA 5CPLA 4QNEA 4UIOA 2JKEA 3WK3A 1TV7A 3TQ0A 1GTHA 1EUAA 1OFRA 1KFLA 4LOCA 4NZJA 4JIPA 1G67A 5F2LA 5I3JA 1OFQA 1VCFA 3W2NA 3R12A 5FI8A 2FB2A 2J27A 1F5ZA 1M7OA 1O94A 3DFQA 5BOOA 3TH6A 1TPH1 1N7KA 2FTPA 3M0ZA 4Z1CA 4HN4A 1K7EA 6ALDA 4MJZA 4MUZA 4IGHA 4NJKA 3G24A 2ZA3A 3L68A 1ZAJA 3DKLA 4NXKA 1LOSA 2QCFA 3P5ZA 2ZA1A 3QC3A 3EXRA 4O12A 3W72A 2KZHA 4K8EA 4Z1AA 1ZY9A 3GKFA 4UNLA 3LHVA 4OU1A 3A21A 2ZYFA 2QCGA 1XXXA 2ZRZA 5D2WA 2EGZA 4DO6A 3NL5A 4UC5A 2Y63A 3M7WA 3W2JA 1AK5A 3NQMA 3N9SA 1VGAA 5CPMA 1FCQA 1KFKA 3E49A 4MY1A 2QUTA 2C16A 3ZS4A 4QM1A 4PH6A 1JCLA 4D2JA 2YFOA 3K30A 3B4UA 1FXPA 2Y88A 3EX4A 4WOZA 2QDHA 3O6CA 3W7NA 3PY2A 2YPIA 3GVGA 1AW2A 1DJNA 2WPBA 2BZNA 1UB3A 4LVFA 3OEXA 3M44A 1D9EA 4J9JA 5DY3A 4X22A 3EB2A 3BO9A 4POCA 4RLIA 5HR6A 5FEPA 2NXHA 1LYXA 2V81A 4RZ5A 2E68A 3PM6A 4Z1DA 2GUUA 4Q33A 4O50A 4GXMA 4CQ8A 4XZ9A 1LCOA 3GLCA 2DJXA 4Z0SA 2V8ZA 3W1TA 4EF9A 4UFLA 4Q4KA 4ZVJA 3TA6A 3W3OA 4JTSA 3GZ3A 2BX7A 4PEKA 3TXZA 4QSHA 3L65A 1Y0EA 2NUYA 3Q2DA 3W1UA 1LBLA 3W1AA 5K4XA 3WFAA 1TPUA 5GVJA 3V1PA 5HUOA 4O15A 5F4SA 3STFA 2RKXA 1AG1O 5TBOA 4NVTA 2DZXA 1THFD 2V9DA 4C1LA 2FQIA 1OVDA 2GVLA 4MZ8A 3DKJA 3B03A 2FB3A 2CLKA 4K7YA 2EF9A 2Z6IA 5I3GA 2QCCA 4DBEA 1XDMA 1W31A 1Z48A 3BPWA 3PBUA 1E51A 1OF8A 3L67A 1J4EA 5AC7A 4O19A 1OK4A 4TMBA 1I2RA 3S5YA 3DFPA 3GXTA 2ZCGA 2YYUA 3L2IA 3TU9A 4ML9A 4UTHA 4P2VA 3EKLA 3H55A 3FJLA 3NQ7A 1UJPA 3G8EA 3P8IA 4Y90A 3KOFA 3NQ2A 1VCGA 3FOKA 4BWLC 1FCUA 2ZRWA 3NNTA 2QKFA 3LLFA 4AMAA 3DHDA 3TR2A 2E6FA 2YW4A 2P0OA 1B57A 2D73A 2O7QA 2VC6A 3HG3A 1FWWA 3PUEA 1KLYA 1RV8A 5TQLA 5L6UA 2CLIA 1SW7A 1ZFJA 2A85A 5D09A 1F74A 2DP3A 3UWVA 3I7QA 2YX0A 1VH7A 1JRBA 2VXNA 1KTNA 1EP2A 4DF1A 4HNVA 2NX3A 3GB6A 1S5TA 1RQHA 2DJLA 4WZHA 4PODA 4I7WA 2QJGA 3W1LA 3N14A 3P62A 1SW3A 3FIGA 4A21A 1TCDA 3W7KA 1FWTA 1P1XA 1HL2A 2A7RA 3M5ZA 3P80A 1LBMA 3C0JA 5C54A 3IGXA 2ISWA 1GG0A 2QCNA 2QCDB 2CLOA 1H7WA 1JVNA 4O52A 1GVFA 3N19B 5LGZA 4O28A 3MHUA 4ZQCA 2Q3RA 5J5RA 2VEPA 3W1XA 1KM6A 3MJYA 4WXZA 4UMBA 1AW1A 3UD6A 3RMJA 3M5XA 3C4UA 2X30A 4O1BA 3HB9A 3GXPA 4TR9A 1C8VA 3P7YA 3QMRA 4NZFA 1QMLA 3WJWA 1L2UA 2B4GA 4DO5A 2XN2A 4UTUA 4XTDA 3BVJA 3N2MA 1TMHA 3O05A 4JXCA 3HF3A 4WUIA 2CZ5A 1XM3A 1GJPA 3EX1A 4LNYA 4WD0A 1LBFA 1ZALA 2X1SA 4O13A 3W87A 1F6PA 4DF0A 1PHWA 1I2NA 1T0OA 3N3MA 1MSSA 3T55A 4FX8A 1KFEA 1JUKA 5E93A 5AHFA 4UTWC 5DLCA 1YTEA 2C18A 3W85A 4JTJA 1S3HA 1D3GA 5BNKA 3LM7A 1MEHA 1SFLA 1SO4A 1OJXA 2PE4A 4JDBA 3HJZA 3FYOA 5AHLA 4N9DA 3IVUA 3E12A 3FKKA 3BV4A 5FF4A 1NSJA 3QW3A 3S6DA 3P8JA 2WSRA 4RR4A 1V5XA 3R2GA 3W7DA 4JX6A 1G7VA 1GYLA 1PCWA 5L9FA 4LVBA 3LXCA 1R2RA 2VEKA 3AJXA 4H6KA 2X1TA 1OX4A 1SUXA 3LRKA 1JRCA 3VI2A 4IQLA 1WYIA 1WA3A 3NG3A 3TC6A 1KLZA 1YDOA 1ME8A 4ZL1A 3GNNA 4UXDA 3W7JA 4RX0A 5G4EA 2VFFA 2H90A 3TFCA 5I3FA 1HG3A 1TJPA 3M5YA 1ICQA 5AB3A 3W73A 5DXXA 1VR6A 1KM5A 4IMGA 4X9SA 3HG5A 1H7PA 3T4CA 4OE7A 2VFIA 3MBFA 4MFEA 3GDTA 5K9DA 1W5QA 3QFEA 2GVGA 1F6KA 4GUJA 5IM51 2DZTA 4ZQOA 4LUIA 4KFNA 1ADOA 4FEZA 5DBUA 5CPOA 1EPXA 1OX4B 3M47A 4O53A 4UMCA 1RQEA 3GAKA 4UTLA 1UUOA 1GVSA 3ABSA 4LRTA 4O16A 4Z08A 4JX4A 4GUHA 4LY8A 2RDUA 2WOQA 5LNUA 4JY8A 1F05A 3G0XA 2PRHA 4N6FA 1TRIA 4ZQMA 1R47A 2BLEA 3MUXA 1LORA 4CQAA 1W54A 1QOQA 4N2YA 1A5SA 2NXGA 5D04C 5AFDA 1KTCA 2Y7FA 3L0GA 2VOMA 4A22A 3G1FA 3VFLA 3M41A 3DFOA 2H8XA 3OG3A 3Q37A 4UFIA 3MP5A 3UXAA 3A9IA 3C61A 1QO5A 1BEUA 1T8XA 5LNWA 3VCRA 4O4WA 4YXGA 3PB0A 4JTIA 3IIOA 3W7LA 4FHAA 1VS1A 2A21A 1K7XA 3GR8A 5KITA 2OMAA 2ZQ0A 3ABRA 4IMEA 1EEPA 1GVOA 4XQ6A 1Q6RA 4X2RA 3MO7A 4KWVA 4O1CA 3IGSA 4WJEA 1O5KA 3W70A 3TQVA 3PUDA 1SFJA 1H62A 2ZZ7A 2YXGA 3SZ8A 2A6LA 4AAJA 4FB7A 3L5MA 3F4NA 3VE7A 3DXIA 1V7YA 3W7RA 2PC4A 1J2WA 2ZTKA 4FIRA 5G5IA 1CI1A 1NF0A 2OT0A 3P84A 4AWUA 5K7JA 2ATMA 1B4KA 3WK1A 4M6PA 4NJHA 5H2ZA 1GG1A 1LTDA 3OVRA 3UY8A 1QPNA 1O4UA 3CLMA 1HFBA 1M6JA 2WO5A 1H5YA 1TB3A 1C9DA 3NDOA 4LS1A 2BXVA 3CTLA 1NF7A 2UV8G 4O54A 3A22A 3NZRA 1KBIA 1JCMP 1I8JA 3BG3A 3FYPA 4NQ1A 1X7FA 3TKFA 2V2CA 4OGZA 1PE1A 5D37A 1QO2A 4ZQNA 1F7BA 4WY0F 1OYCA 1X6UA 3MI3A 3SR7A 4PL2A 3CM4A 1OFEA 4IMFA 1YTDA 3UZ5A 1OX5A 3HMJG 2ZZ1A 1SZEA 1VYPX 5D03A 3HGOA 4LVGA 3E96A 1NAL1 3G1AA 3V75A 2ZA2A 3BGGA 1B3OA 1IXPA 1IF2A 1GZGA 3RLUA 2E77A 3E02A 5BMWA 3TJXA 3L0KA 2ZBTA 3PG9A 2WNZA 1QR7A 3VNDA 3S1XA 3NPWA 1T99A 3NPXA 3OVQA 3LCXA 2NX1A 2ZRYA 1VLWA 3CHVA 5FEWA 1OYAA 2OJPA 3LI1A 2QAPA 4K6AA 4JD4A 1I45A 2QCLA 2YFNA 3DI1A 5EYWA 3TSBA 1W3TA 3LTPA 3PSWA 3PC0A 1G4PA 4IPJA 1S5WA 4HSNA 2H6RA 5EPDA 1SPQA 3EX6A 5KZDA 3W7GA 4RCXA 2NLIA 3QEZA 3M43A 4A3UA 4MY8A 5D05A 5HQEA 3QQ1A 3MHFA 4PCFA 5AOUA 4OV4A 1RVGA 3GYEA 3IGUA 1K03A 3O8AA 3LX9A 1DOSA 3DH7A 2FIQA 3HQ1A 3W2UA 3NAVA 1TPC1 3S1VA 3SGZA 1GOXA 4JS3A 4Y6GA 1YLVA 3S8HA 5KZEA 3DZ1A 1XDLA 4LV4A 3S5ZA 4XWUA 3N9RA 1Q45A 2YGYA 3C2VA 5J5DA 2OT1A 4UMAA 2I1OA 3G1YA 1FY6A 4MOZA 2OCZA 3H53A 3PSVA 3LCIA 1L6YA 3TX9A 1SZNA 3C2FA 1AL7A 5HR7A 2C6QA 3THAA 2ZRXA 1GT8A 3LRLA 3MP3A 3USBA 2WKJA 5F2MA 1W1ZA 4K37A 3C2RA 2AQWA 3L9CA 4XTIA 4N4QA 3R89A 3SI9A 3TCEA 4FIQA 3MW7A 4DPQA 3HG4A 4K8HA 1QAPA 5AC6A 1VZWA 1FDYA 1YTKA 4KFOA 2E6DA 4Y9AA 4ALDA 3VE9A 2FJKA 4NJJA 3S1UA 2CLFA 2CLEA 2LLEA 5F1VA 6TIMA 4L4LA 3KHJA 4LS0A 3QQ0A 3TAKA 3W74A 3GXNA 3WJYA 2V5BA 4FNSA 2QUVA 2VFGA 1QWGA 4ADTA 1QDSA 1JQXA 1LZOA 3IIXA 4UR7A 1H7XA 2O7SA 3OIXA 2B0MA 1R46A 5K9XA 3O16A 3SECA 2X1RA 3W1NA 4K36A 4TX9A 5DY2A 3G8RA 3Q58A 1KM1A 3EKZA 1X1ZA 3UWUA 5KMYA 2DZVA 3LBCA 4LTSA 4NJGA 1YYAA 3LV6A 4AWTA 4FX7A 4E2DA 1JUBA 4BI6A 3P60A 5G1TA 5LNVA 4MKNA 5CZ0A 3LHZA 2AAMA 1BWLA 2FPTA 3DGRA 1KV8A 1VHNA 4FXSA 1GPWA 4MFDA 1KFBA 4S1FA 1AMKA 5G2HA 4O0ZA 3UYCA 3ATYA 3S1WA 3CB8A 2J9XA 5K3VA 1KM4A 2ZZ6A 3FA5A 3T44A 1YXYA 3O07A 4U4MA 2YYTA 4IMDA 1FQ0A 3TJLA 2QCEA 1FWRA 2HMCA 1OFPA 3G1SA 4UTMA 1JR1A 5LHFA 3BLIA 2NXIA 3NL2A 3PUOA 4MZYA 2PCQA 3BG9A 1FDZA 1K8ZA 2ZFAA 4RK8A 4GUIA 1IXQA 1U83A 4LC8A 2Y85A 1UUMA 1N55A 3HBLA 5AN7A 8TIMA 1A5CA 7TIMA 3LCGA 5BRBA 4M7SA 3RNDA 1JULA 1Q3NA 3DFNA 2H8ZA 1SO5A 1SZGA 2ZDRA 3I6RA 1W5OA 3W75A 4LVDA 5LSMA 4N9BA 4LW7A 5BMXA 1H50A 5I3IA 1F2JA 3VKJA 5LKYA 3LOTA 3ABOA 4RJEA 3BLEA 4LC6A 5LNSA 4HSOA 4XBSA 2Y7EA 4HNTA 5G2IA 2JGQA 1K02A 3O06A 3GR7A 3W7HA 5D30A 1KBJA 1MEIA 2J9YA 3A24A 2J24A 3FEMA 3CPRA 1SW0A 3ABQA 1KW1A 2E6YA 5FF2A 5F1UA 3TDFA 3NPUA 3S0CA 1L6WA 2X1UA 2ZRVA 3F03K 4JIQA 3TUUA 3U6WA 4RXFA 4E2BA 3NA8A 3PBWA 3EXSA 1IIHA 4KWWA 3TK7A 3P67A 3PVFA 4BWLA 2WSQA 5U7SA 2NV2A 5D33A 3LBMA 4FNTA 4NT0A 2CZFA 3OBKA 3L21A 3G1XA 5HULA 4QAIA 3BARA 1OFBA 3T40A 3MWAA 4N6EA 2EHHA 4DBDA 2AGKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GW3 A;  5A6L A;  3LBO A;  2FFC A;  2AL1 A;  1JF5 A;  2DVX A;  4DXX A;  1TSI A;  2VR4 A;  2A3H A;  1S1P A;  1GQK A;  3GDK A;  4MJ2 A;  4CCC A;  4REQ B;  2F6X A;  4QQ3 A;  4M24 A;  5K2Z A;  1VFH A;  4MIM A;  2B7Q A;  2R91 A;  3I3D A;  4Y8F A;  1E3Z A;  2J7D A;  1T5A A;  1H61 A;  1HVX A;  3BW4 A;  2VFD A;  1E43 A;  4K68 A;  2GGJ A;  3KRU A;  3LV5 A;  4QEH A;  4KWO A;  1G7U A;  3IPW A;  1DJQ A;  3BAY A;  4AXK A;  4XAP A;  2NUW A;  4AZC B;  2DZW A;  1B90 A;  1H7O A;  4XKY B;  3AO0 A;  5CGM A;  5REQ A;  2PDW A;  4EF8 A;  5HQM A;  1I4N A;  1OCN A;  2J75 A;  3BGJ A;  4QX4 A;  1B9B A;  4NNC A;  2JF7 A;  5LIY X;  2OQH A;  3GND A;  1GGO A;  3OB8 A;  3F4W A;  1ISZ A;  5CZK A;  1P6B A;  4R88 A;  3WFZ A;  4BR1 A;  4UFH A;  2X7W A;  3VAB A;  4PMO A;  1DV7 A;  4MB3 A;  3BUR A;  1RH9 A;  3GVV A;  4F0L A;  1PL9 A;  1R30 A;  3NPV A;  3B9O A;  3WBW A;  3LY0 A;  3WQE A;  1S2T A;  2Q8Z A;  1W8S A;  1Q7M A;  2A3L A;  1C7T A;  4UIO A;  1TV7 A;  1TG7 A;  1BSI A;  3MSG A;  2PBG A;  2XIS A;  1MUM A;  4JIP A;  2OWW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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