3W3OA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-4-053
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-053
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w3oA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w3oA01
1TJRA 3G3DA 2DZVA 3PS7A 1GVSA 1IIGA 5CKSA 4Z1AA 1PCKA 1KM4A 2ATSA 3NQAA 3W07A 3TMQA 3DGRA 3Q2DA 2CZEA 4N9CA 1VZWA 3WK1A 1OX6A 1KTCA 2ABAA 1C29A 3S5OA 5J5DA 4YCPA 3W1TA 3UXAA 4Y96A 2C14A 5K9CA 2Y7DA 2PCQA 2QUUA 3N19B 1TV5A 4JD4A 3N14A 1VPXA 4JTTA 2ISWA 2CLHA 1FCQA 5EPDA 4ADUA 3SW6A 4LRTA 3S6DA 4CCDA 1F73A 1KM0A 2CLFA 4J9JA 1H7RA 2H6RA 3YPIA 4HNVA 5FF3A 4QM1A 5D38A 3EX2A 2OCZA 3WJXA 2C13A 2EKCA 1MO0A 1EX5A 4O1DA 3SZ8A 4DXVA 3B8DA 5HUOA 2TRSA 4IJBA 2AAMA 3W7LA 1GVOA 4OGZA 3FJLA 1P1XA 1C8VA 3R12A 3C2VA 1K7XA 1VLIA 3TAKA 4BI5A 2R94A 3DI0A 4FX6M 3R89A 3OHIA 3M5VA 5FEWA 3TQKA 4D2JA 4H3DA 5C55A 3OG3A 5AHEA 4E2BA 2YDAA 2NV1A 1GTHA 3G0SA 3LBMA 4UCGA 1AW1A 2PE4A 2ISVA 2YW3A 3TSBA 3KFTA 3W75A 1ICPA 4UIOA 1NF0A 1GYNA 1RZMA 3LB0A 2BX7A 1DQXA 3KX6A 5BNKA 3PWAA 2XN1A 3LHVA 3GDKA 3IVSA 5AOUA 1EA0A 5KINA 3NQ2A 2CLMA 3PG8A 5DELA 3LCLA 1TREA 4UTIA 3NYZA 2VC6A 4A21A 2NLIA 4IX0A 4K8HA 1OFQA 2FPYA 3EX3A 1F6PA 4B5NA 3U2OA 3OA3A 3STEA 4N02A 2CLKA 4UC5A 4YXGA 2RKXA 3LV5A 4RXGA 3FOKA 3OVQA 3DAQA 3W84A 5L9FA 4UFMA 4IQLA 1LP6A 3LHYA 1PVNA 3TUUA 2WQPA 3UWQA 1WXJA 2J9ZA 1KFCA 4QSHA 1JVNA 3CC1A 2CLIA 5K3VA 1DOSA 5KZDA 3Q94A 4N9EA 3FEMA 1H60A 1B57A 2V2HA 2I9EA 5LNUA 1EWDA 4ZQRA 2ZRWA 5AYXA 2HSAA 4QAIA 3W2KA 3UWYA 1G69A 1F5ZA 2CZFA 1FQ0A 4JXCA 4PC8A 4WUIA 2BSLA 4NX5A 1RR2A 1XC4A 2ZQ0A 3BK0A 4UTKA 5DLCA 4I7UA 5G2IA 1LOSA 4HIBA 1KBJA 3LHZA 3UNDA 1OFBA 4O18A 1QO2A 2UV8G 3NQDA 2AGKA 4O54A 4A29A 3PBWA 1KM3A 4K8EA 3HPSA 2E5CA 2OMAA 5CG7A 3MBDA 1G4TA 2ZA1A 3GDTA 1YPIA 3ZWTA 1XBVA 1SO6A 1WV2A 1U83A 1YYAA 3NGJA 1F74A 4TR9A 3BLFA 4MY9A 3MP5A 3L5AA 1EIXA 4OHQA 3M6YA 4UTMA 1XBXA 3GIYA 4S2CA 3WFAA 1LBFA 2CZDA 5SWUA 5CGQA 4NU7A 1ZALA 4XKYA 2Z0IA 3QEZA 1ICQA 1QMLA 4HSNA 2HS6A 1OFDA 7TIMA 4IX2A 3C8FA 2A5HA 3E49A 3ATYA 2FPTA 4Z0JA 3SY5A 1K8ZA 3B05A 3L66A 4NT0A 5KMYA 5AC8A 3SJ3A 2JGYA 3W22A 4JGDA 2PRLA 5HMSA 4O1BA 2DU2A 4MIMA 4NX0A 3IIPA 4O10A 3G1AA 4BF9A 2YW4A 2NX1A 4DELA 1YTEA 5I3GA 1VS1A 1WX0A 2Y70A 3NQ8A 4KFPA 1I2PA 2DZWA 1SO4A 1W1ZA 1VYRA 5K2ZA 1VYSX 3TCEA 1TPDA 1HO4A 1F7BA 3NNTA 1YDNA 4HPXA 1NVMA 4IMCA 3IGSA 4CQAA 3O15A 3B03A 3O6DA 1O4UA 1H63A 4IGHA 1G7UA 1K8XA 3RLUA 2ZZ4A 4X22A 4FIQA 1EP1A 3GB6A 4Y90A 5LNRA 1UB3A 5HNRA 3NZ1A 1H7NA 3TNOA 3LXCA 5DY2A 4ONVA 3RFAA 5FEZA 4TMBA 5E1QA 3DBPA 3KVKA 4LVGA 3NQCA 1YDVA 4RZ6A 2BTMA 4WOQA 4QITA 5DBUA 3PB2A 3MW7A 5LGXA 1U5JA 4LY8A 1KM2A 4KWWA 4YLWA 4IPJA 1MEIA 4L4MA 5HQEA 5IM51 4ML9A 1AL7A 2O7SA 4MZYA 2WOQA 3W7JA 2QJIA 1JCYA 1D9EA 3W2NA 3NL2A 4MZ1A 2QUVA 2VXNA 3JRKA 1OJXA 3HOJA 1DL3A 5TBOA 2QCEA 1OHLA 1OFAA 1ML1A 2QAFA 2JKEA 1UCWA 3OBKA 2QJHA 3A23A 3QW4B 1FUYA 4U28A 3QMRA 1TPC1 1IXPA 6TIMA 1WQ5A 2WO5A 3P67A 3A5VA 5ABTA 5FF0A 2FLIA 3T4CA 1Z48A 1SR9A 3W74A 1H50A 2DZPA 1OG0A 3MI2A 4MFDA 3M47A 1W3NA 4FNPA 3MO7A 4TO8A 1FWRA 2Z1BA 4JX5A 5D37A 4LVAA 4CCCA 4GUGA 3E0IA 2NUWA 4ZMGA 3M5ZA 3GKFA 4JTEA 3B0PA 3UWZA 4DPPA 3S1WA 2WNNA 2PRHA 1O5KA 2VOMA 1FCBA 1UBSA 3T40A 1KTNA 3CHVA 2WV8A 1ADOA 3N34A 3S5ZA 3G8RA 3NL5A 3ABQA 2QCNA 1BTMA 5AHLA 3KVLA 2ZRVA 4GNJA 3EWXA 2DP3A 1TQJA 3W7PA 3MHUA 5CPOA 2V81A 3LERA 3STGA 4XWUA 2V5BA 4WXZA 2PURA 2NWRA 1B9BA 4UFIA 5F1VA 3WJZA 1O60A 3ZS4A 3U8GA 3NQVA 5K7JA 3TDFA 1DBTA 5T26A 3UZJA 4N2YA 5CPMA 3LCFA 4M6VA 3W7DA 5DY3A 4ZL1A 3W2UA 1OABA 3NA8A 1SSGA 2G96A 2EAWA 4LRSA 3ZWSA 4ORMA 3LXBA 3N73A 3QF0A 3CEPA 3PAJA 3SI9A 3CQ0A 2E5BA 2QCHA 3NQFA 5EKYA 3U6WA 3I7SA 1G6CA 1ZAIA 3GDLA 3GNDA 1OK6A 3DKLA 5BOOA 4AB4A 5D2WA 1Q6RA 1S5VA 2X2GA 3LLFA 1K7EA 3PY2A 1JCXA 2E68A 3HPXA 3HJZA 1NF7A 4MYXA 3S5NA 1Q3NA 1LLZA 5D04C 4IUOA 4DBDA 1DV7A 3L0KA 1W37A 3HG3A 3P8JA 4PL2A 3SR7A 1OFRA 1LZOA 1AG1O 3TROA 1I2NA 2V82A 5U7SA 5HWMA 1QPQA 3W7OA 4I9AA 1QCWA 3TXVA 5BRBA 4LTSA 2HS8A 3PUDA 2NXHA 4MUZA 4O15A 3LHWA 1VJIA 4JY8A 1XBZA 3W72A 3W2MA 1F05A 2E1DA 3S1XA 2Q3OA 4NXSA 3C2OA 3QPZA 1JUKA 4R53A 4OQVA 3PBYA 4HKPA 4IMGA 2KZHA 1LLWA 3W85A 1EP2A 1XXXA 3SIZA 2I1OA 2X1SA 3P81A 5G5IA 3ZFHA 3QZEA 3FYOA 4O16A 3W1QA 4UFKA 2H3BA 1D3HA 1PV8A 1ME8A 1QWGA 1JCJA 1T99A 4RV8A 1DJNA 3TMLA 4FNRA 2YSWA 3G1VA 1KW1A 2H8XA 3W76A 2QJGA 4GUHA 1RVGA 3PC0A 3PBVA 4FNSA 4PODA 1TPWA 3PUEA 1FWNA 1UASA 1VCVA 1QAPA 3HB9A 1LRTA 1ZJIA 4Z1CA 3M7WA 4DF2A 1P4CA 2YYUA 2RDUA 5F2LA 2NXIA 3DFPA 3L2IA 3VKJA 4BK9A 3BO9A 2YCEA 1TQXA 2Y62A 5IBXA 1KTBA 1NFBA 4XTIA 5AYYA 3PBUA 4X2RA 1L9WA 4ADTA 1DQWA 4QQ3A 5E0KA 1GPWA 4R7JA 2Y63A 1JUBA 2GPTA 3HGOA 3IVUA 4BFAA 4AEOA 2Y7EA 2TMDA 4LT9A 4IOTA 2BZNA 4ZVJA 5AHNA 1KFEA 4IXXA 4K6AA 4XKYB 3O63A 3S1VA 2YFOA 4DF0A 2B4GA 3R8RA 1FCVA 4GUJA 1TV8A 2NWSA 4WY0A 4WY0F 5CZTA 3VE7A 3HGSA 2Y85A 4LOCA 1A50A 3PVFA 3L67A 4DEFA 4WX2A 1H7PA 3PSWA 3W3OA 1UUOA 4K39A 1O5XA 4BWLC 2ZRUA 2ZDRA 5HWNA 4O17A 2ZBTA 4JTLA 4MFEA 1EEPA 3PM6A 3NPVA 1ZAJA 5G4WA 4LVBA 1I45A 4DO6A 3NDOA 2H3DA 3GNNA 1XM3A 1N7KA 3TU9A 4RJEA 4MYAA 2NX3A 3LOTA 5D02A 2YGYA 1GVFA 1LCOA 4JX6A 5BW6A 2VELA 1GTEA 5AHIA 1M6JA 1SFLA 1GVRA 3UWUA 5DN1A 4AWSA 4MY1A 4JIPA 2FB2A 4X9SA 4E0CA 1TRIA 1VCGA 1CX9A 3KHJA 2Q8ZA 3LV6A 1PCWA 5LHFA 4JYDA 2HTMA 1K03A 3T44A 4HHPA 4M5PA 5F2GA 1ZCOA 3ELFA 4JR5A 5AYZA 4ZQCA 5K4XA 3VE9A 4OBTA 1M5WA 4PA8A 2B7QA 4EVZA 3E96A 2FTPA 3NPXA 1JQXA 1VGAA 4GRSA 1UUMA 1DKWA 1TTIA 4OU1A 5EL1A 3O05A 1RD5A 2ATMA 4UTHA 2JKAA 4O13A 4O19A 4C1KA 4FNTA 4Z1DA 1K7FA 3RU6A 3I6RA 3HG4A 5HR7A 4NZFA 3N3MA 4JX4A 4N9BA 4JTUA 3LX9A 3HGRA 1HTIA 1KM5A 2QEZA 5LGZA 4BR1A 1YLVA 3F1QA 4JTKA 3W7HA 1XCFA 2NXGA 2J9XA 2QCLA 3KRZA 4A2SA 2BWGA 1W5QA 3O6CA 3S0CA 1PE1A 3W23A 1SO5A 3CPRA 4NJKA 4RKAA 4XBKA 5C6MA 1XL9A 1XFBA 2X1TA 3STCA 4BI6A 3H55A 3M44A 1VCFA 1ZENA 3W1MA 5I3HA 4WXYA 5KSWA 3MUXA 5FEPA 5IBXC 3N2MA 1H7OA 1EPXA 3UWWA 2A21A 3S8HA 4JIQA 4TMCA 2CFFA 4WJEA 1AW2A 1W5PA 3IVTA 3WJWA 2YYTA 2TSYA 1W8SA 2V9DA 3W7GA 3IIOA 1LROA 3QM3A 2Z6IA 3GDRA 1TPB1 2E6DA 5CZJA 3W1PA 1ICSA 3UD6A 3MBFA 3CWNA 5HINA 3GXNA 3GYEA 1XDMA 3NOEA 5I3KA 4UFLA 4O14A 2E6AA 4NNAA 3IIXA 1LYXA 2DORA 4HT3A 4KFOA 4Q4KA 4MPQA 3UY7A 3INPA 5KZEA 3E9AA 2XN0A 1R2SA 3G0XA 4QNWA 1MEHA 1LDCA 1SW3A 4L4LA 4S1FA 3NM1A 3TE9A 4G1KA 3CWOX 4OV4A 3PR2A 3DZ1A 2JK2A 1S5TA 2F84A 5FEXA 1FWTA 2TPSA 5AC7A 1QFEA 2F7FA 5D09A 2OT1A 4IXHA 4JTIA 4BI7A 4IMFA 1B4KA 1MZHA 1R30A 5FESA 4P2VA 1M7OA 5K9DA 1YADA 2WNZA 5EY5A 2FJKA 4LV9A 2FDSA 1GYLA 1C9DA 3L0NA 3O6YX 3RK8A 3QMTA 4ZQNA 1QOPA 1FXPA 1FX6A 1HFBA 5LHEA 4AWUA 3AJXA 4JICA 4M6PA 5AFDA 3QJAA 2GVJA 3CLMA 3SSJA 1I4NA 5HR6A 3DFOA 1OF8A 3FKKA 1YTDA 1KV5A 3F4NA 5D2XA 3W7RA 2G95A 2CLOA 2WSYA 2DJLA 4XUGA 4ICNA 2G5WA 3EB2A 4OE7A 5AB3A 3SGUA 1SW0A 3MYPA 3W7CA 4LU0A 4FXSA 2QKFA 1FDJA 3TC7A 3T78A 3IGUA 5G2HA 3HIJA 4ALDA 4A22A 4UR8A 3NQ7A 1SW7A 1W56A 3FS2A 1YXDA 2EF9A 2GUUA 3NL3A 3WJYA 1Q6OA 4NJGA 3LTYA 5DXYA 4Z08A 3ABRA 4CNNA 5D05A 1GQNA 4GBUA 4Y9AA 2J9YA 1TPH1 2V2DA 5G2WA 1SZGA 3KXQA 5BMXA 3C56A 1H1YA 3RNDA 1XKYA 2CWNA 1PIIA 1JR1A 4KWVA 1BKSA 1RQHA 3VFLA 4UTLA 1Q6LA 5HULA 1KFLA 4GUIA 2WPBA 4ZQPA 4FXRA 4R33A 5CZ0A 3HO8A 3NXFA 2VFIA 1TMHA 2RFGA 3FIGA 4CCEA 1J4EA 4UTTA 1XBYA 1GJPA 3FYPA 4UNLA 1P0NA 1WOBA 4RLIA 2WKJA 3LHUA 2W0UA 1T8XA 3BVJA 2VFFA 3TA6A 4IPIA 2A7RA 2YFNA 2I14A 5G4EA 1W0MA 4MY8A 2ZZ2A 1L6SA 1OX4A 3E12A 3QPYA 2QAPA 1B3OA 3PULA 4CQ8A 1MEWA 8TIMA 4O11A 3NQEA 4PEKA 2QCFA 1I8JA 3KVJA 3EX6A 2YR1A 5C54A 5CSSA 2GJNA 3N9RA 2J24A 1W3TA 4UTUA 4NZJA 2ZRYA 4FX8A 3EKZA 3THAA 2ZZ3A 1TTPA 1QR7A 1LOQA 4JTGA 3TV8A 3TW6A 2WJZA 4O0KA 1YXYA 2B7NA 3EKLA 2B7PA 3EWZA 3Q58A 5D33A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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