1UWQA

Structure of beta-glycosidase from sulfolobus solfataricus
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
489
structure length
487
Chain Sequence
MYSFPNSFRFGWSQAGFQSEMGTPGSEDPNTDWYKWVHDPENMAAGLVSGDLPENGPGYWGNYKTFHDNAQKMGLKIARLNVEWSRIFPNPLPRPQNFDESKQDVTEVEINENELKRLDEYANKDALNHYREIFKDLKSRGLYFILNMYHWPLPLWLHDPIRVRRGDFTGPSGWLSTRTVYEFARFSAYIAWKFDDLVDEYSTMNEPNVVGGLGYVGVKSGFPPGYLSFELSRRAMYNIIQAHARAYDGIKSVSKKPVGIIYANSSFQPLTDKDMEAVEMAENDNRWWFFDAIIRGEITREKIVRDDLKGRLDWIGVNYYTRTVVKRTEKGYVSLGGYGHGCERNSVSLAGLPTSDFGWEFFPEGLYDVLTKYWNRYHLYMYVTENGIADDADYQRPYYLVSHVYQVHRAINSGADVRGYLHWSLADNYEWASGFSMRFGLLKVDYNTKRLYWRPSALVYREIATNGAITDEIEHLNSVPPVKPLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords BETA-GALACTOSIDASE
publication title Structural studies of the beta-glycosidase from Sulfolobus solfataricus in complex with covalently and noncovalently bound inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 198
structure length 487
sequence length 489
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.23: Beta-galactosidase.
pdb deposition date 2004-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1uwqA00
3AYSA 3LPPA 1E0VA 1GOQA 3OLGA 4PMOA 1JG9A 4BZYA 4CVUA 4ATDA 1C7TA 1XRVA 1NARA 1J9YA 2NT1A 3WQ6A 2JFEX 3CUJA 3I3EA 2WZEA 1Q6DA 3W53A 2JIEA 3MUZ1 4M1RA 4AZ7A 1ISZA 1DWJM 1VB9A 1JGIA 1HJUA 1XGZA 1ZJBA 1E3XA 1W9BM 4WJXA 1VENA 1MWOA 2CEQA 1QPKA 5FL0A 1GJUA 1U2YA 3ARXA 3AQUA 3BMWA 2EO7A 1R85A 1OT2A 3GXMA 2QHAA 3WDRA 4D6CA 2O9TA 3AFBA 4TX6A 2VZVA 2BY2A 2C8NA 4E8DA 3GDBA 3ZJ7A 3MUY1 3GXFA 2XM2A 1JAEA 1JNDA 3FAWA 2WMJA 3GNOA 1W3KA 3GTNA 4OBSA 3KWXA 3T2QA 1R87A 4AZGA 1DP0A 4W8LA 3WQWA 1UWTA 4B15A 5A8OA 4QDMA 3WNNA 3AMLA 2GJXA 1KCKA 3ZQ9A 4M8UA 3VU2A 3MSGA 3AIWA 4CN6A 1B3XA 4PRWA 3W0KA 1XH2A 1SYTA 4RL3A 4PMUA 2W66A 4GINA 3K46A 4M82A 4PMXA 1C8XA 1K9FA 2OSWA 3AIVA 1UD4A 4ACZB 5I24A 2QLYA 4FF5A 4TUFA 3FY1A 4GZJA 5FD0A 2YDQA 1UKSA 1UWIA 1FHLA 3RJXA 1E6RA 2ZWYA 4Z2KA 2W92A 2VL4A 3AI0A 4P7QA 4AYSA 1CNVA 5AYBA 4W93A 2J25A 1V3JA 1WDRA 2G3MA 4J3VA 3U57A 3OB8A 5D9PA 1GVYA 2C7FA 2X1IA 4GO8A 2VZUA 4MB1A 3W24A 1BGGA 1EA9C 4FMVA 2HVMA 2IXVA 4YPJA 5I78A 2O9PA 4XV0A 5FIPA 2DEPA 1PEZA 3AIEA 4EKJA 1V08A 3SUSA 2X8RA 2XHYA 3M07A 2GK1B 2VI0A 1E5JA 1HP4A 3AMCA 3HN3A 3ZM8A 4U33A 1G9HA 3N17A 5IHSA 4DWSB 1ODZA 3AS1A 1J18A 3UETA 1KBBA 1RPKA 3ZJ8A 1FFQA 1PX8A 2D0FA 1TMQA 1UHVA 2JALA 1JF6A 4JL2A 3CUGA 3AZSA 3OBAA 1MW3A 2VX4A 2W62A 3ARRA 3PZNA 1UR2A 1CXHA 1JI1A 3VUPA 4NRRA 2YKKA 2TAAA 3T2OA 1WO2A 2DSZA 1X6LA 1QW8A 3ARUA 2DT0A 2YDRA 1EHAA 2D2OA 5HNNA 1R8LA 2BS9A 1QI0A 1RP8A 1WB0A 1VFFA 2G8ZA 2VQTA 1GHRA 5CZKA 5E6ZA 2YIHA 5A6AA 2J7CA 3AMGA 1KCLA 1BFNA 5E9AA 3AIUA 1FH7A 4AW7A 2WMHA 1K6AA 4BCEA 1SR0A 3NCOA 2W61A 5D4YA 2CHNA 3PZIA 1E40A 3S2CA 3ZT5A 1ITXA 3SURA 1JDAA 3GM8A 5D9MA 1LQ0A 4PMRA 4AIEA 5EFDA 2W91A 1LWHA 5IFPA 4E4PA 3WQ5A 3AOFA 4JCLA 2DDXA 2EJ1A 4X9YA 4U31A 4QLKA 1OWQA 1XYZA 4NI3A 2WC7A 3N9KA 3I3DA 4S3KA 4AZIA 4UQAA 3ZR6A 3WEZA 5HXMA 1QHPA 3GH5A 2QMJA 2WHLA 1QI4A 3THDA 1JI2A 3AMKA 5EBAA 4J28A 2VUYA 4HU0A 1QNQA 3WDPP 2EPKX 1IZJA 3B9DA 2ZUTA 2PWEA 5DT5A 2ZX8A 2VCCA 3L4XA 1DWGM 4ZE5A 1CIUA 2ZIDA 1GZJA 1Q4NX 2EEXA 2ZX6A 5KZ6A 1EIBA 3EDDA 2YA1A 3WL1A 4HA4A 1GPFA 2ZX5A 4UOQA 1VIWA 3MUIA 3CHCA 4PSRA 2FGZA 4JFVA 2BXYA 3ARVA 2WCSA 1SMDA 2JF6A 1BQCA 3NJ3A 1MQPA 2BVYA 1L8NA 2X2YA 4HTYA 2Y8KA 3AIQA 2DPEA 4U3AA 4NF7A 3VM5A 1E1FA 4M80A 1CXEA 2UY3A 3A4XA 3CH9A 1GCYA 2VNCA 1FOBA 1GONA 2XVLA 4JFSA 1U33A 2ZOXA 5I2UA 3N15A 3WNOA 2CHOA 3QR3A 2JIWA 1CENA 3PZMA 4Y7EA 5C70A 2BY3A 2JEPA 5I79A 2XVGA 1HP5A 4HP5A 2YA0A 3LPFA 4JKLA 4JKMA 4PBGA 1CPUA 4MADA 3NSMA 2A3CA 4ZE4A 2J8FA 3MV11 1OT1A 2V3GA 2VT0A 2XIIA 4UZSA 4PMVA 4IPLA 1VAHA 1UR1A 2FH6A 3W27A 1US2A 4GZEA 4AIUA 7A3HA 1H3GA 1OB0A 2QPSA 3PBGA 4TVCA 3PZ9A 4AZHA 3GNPA 4PTMA 3M7SA 1VFMA 4WKAA 3VDHA 2QF8A 3QOMA 4P7OA 1RH9A 3SUVA 1E6XM 3WNMA 1QW9A 4P7RA 5C71A 1EDTA 3F5LA 3QOKA 5DT7A 4FLOA 4P8XA 5BRPA 2WVTA 3MMDA 4TXEA 1W9PA 6A3HA 2G4FA 1Q6EA 4CU7A 1MFUA 5DF0A 3VGEA 4HZ8A 5A94A 1GQIA 4MPKA 1N82A 2VRJA 1TR1A 1EHNA 2J7DA 2G41A 2J77A 2E9BA 1C3FA 3PZOA 1XCXA 1L0PA 1OGBA 1XHGA 1KR0A 2CYGA 3WENA 5A8NA 3IAQA 4NZCA 5BYWA 4DUWA 2ZUWA 3VGFA 1WZKA 2VX5A 4EK7A 3W26A 1UKPA 1WNOA 4CD5A 4J27A 2OSXA 4MTVA 5A6BA 3RM4A 1GOKA 2XFYA 4UOZA 1W2VA 3ARSA 2CXGA 1UZ1A 1YHTA 5EMYA 4Z2GA 1UZ4A 1HN1A 3MO4A 1OM0A 2VR4A 4B3KA 1MW0A 4P8VA 3W6MA 4OOUA 4BQ3A 3KEHA 4UQEA 4AISA 1XCWA 1JYXA 2PBOA 1M7XA 1V3KA 1W91A 2WZHA 2D23A 2GJXB 1MQRA 2W4XA 4LGXA 3U7VA 3SUWA 2VVNA 4OZOA 1CGVA 2WSKA 2UY5A 1WDSA 2WK2A 2WM0A 3M46A 4J3SA 3RIKA 1QNSA 2DSWA 4EAMA 2XM1A 1GORA 4Q7NA 1RP9A 3WH9A 2ZUUA 5M17A 1DEDA 4JCMA 3SCUA 3WH5A 1GW1A 3BH4A 3N04A 5FCZA 2YA2A 5GNZA 3RDKA 3NYDA 4UFLA 4UQ9A 2OWCA 3WD4A 3CZ8A 2VURA 3WFZA 1EOKA 1IZKA 3A3HA 1V3MA 4OUEA 2CKSA 4W89A 1UUQA 2PWDA 1OD8A 5CQ1A 5M5DA 3NSNA 3N13A 1XYFA 1OIFA 3WF2A 1W9UA 3WQVA 3AZRA 1G01A 4M29A 2WHKA 1SFSA 3PZGA 1NP0A 1QOXA 4D6GA 3UG5A 1CGTA 2GVYA 3O9NA 3WF1A 3AIBA 1QNOA 1TVPA 2W63A 3WUFA 4B9YA 3T0BA 5HOSA 3U7BA 4Q22A 2GDUA 1JXJA 1JZ7A 1TA3A 2ZXAA 3WUEA 1CXIA 1BPLB 1UWUA 5I77A 2J7HA 3WUBA 4TTUA 1NOUA 2E8YA 1H09A 5A2AA 3SCNA 1ZBKA 4KRTA 1VEOA 1KXTA 3DYPA 1J01A 3VNZA 1H49A 1UR0A 2G3NA 3ZR5A 1V6UA 2GFTA 1XSJA 4PTWA 1BHGA 4TVUA 4IM4A 2UY4A 2WVVA 3ZJKA 3J7HA 1CXLA 1JNEA 3BC9A 2YBTA 4TX8A 1C7SA 1E15A 3N11A 4M81A 2OLHA 5CLTA 1NH6A 1HXJA 3A4AA 2EPLX 1GHSA 2NSXA 1FH9A 4H41A 3ARPA 3FXYA 3ZIZA 3ZSSA 2E4TA 2BXZA 1HVXA 4D6HA 1FP9A 2WMFA 2WAGA 1GUVA 3VKKA 1FH8A 1PIGA 4GZIA 1W9VA 2DT1A 4PEEA 1S46A 3WNPA 4D72A 4MJ4A 4YN5A 4EE9A 3AHYA 4UQDA 1KGWA 2ZX7A 2XSBA 3AISA 1CTNA 3OGRA 1X1NA 3MSDA 4IUGA 1UG6A 1JZ4A 3OA5A 1AQMA 1OGGA 3CHDA 1EQPA 3WD1A 4WKFA 2DSVA 1J0JA 4Z2JA 3POCA 2PWGA 4FLRA 4AZBA 4AD5A 5LYRA 4IPNB 5DO8A 1W1YA 2YL9A 2E8ZA 2CNCA 5KEZA 2D22A 3WY1A 2MANA 1ISXA 2IXUA 1V0NA 3JUGA 3TTOA 2CBIA 4QCEA 3RO8A 1WKYA 3VD7A 5ABEA 1G1YA 1V0LA 1F4AA 2WMIA 1VRXA 1PJ9A 1V0KA 2XFFA 3WUGA 4AD3A 3L4ZA 1CZ1A 2FHCA 2VQUA 1BLIA 3W29A 2WBKA 3T09A 5I0DA 3MS8A 3VTRA 4J3WA 1GQKA 3PTMA 4ML4A 3RCNA 1VF8A 2W5FA 4QLLA 2V3DA 3AHVA 3NDZA 2EPOA 5FOOA 1HKKA 4D6JA 4HMDA 1GNXA 5HDRA 2C0HA 1HF6A 3MUAA 5A6MA 1QBAA 4P8UA 2EBNA 2PWHA 4XZBA 3GBEA 1UR4A 1H0GA 4AD0A 4AEEA 3VGGA 3IANA 1W3HA 3AHZA 4JFUA 2ESCA 4AD2A 4AMCA 4PMQA 1XSIA 2WCAA 1I75A 2OWXA 1CWYA 4D1JA 2X05A 1ITCA 4AZCA 1MQQA 3G6LA 3VX0A 4KWUA 2V38A 3VD5A 3BAJA 1GJWA 2J7FA 1E70M 1KGUA 1GQJA 1E5NA 3NUKA 4RE4A 2OYMA 4V28A 3N18A 2FHFA 1Y7VA 3WNKA 1R86A 3E1F1 3ARTA 4FLQA 1QVBA 2F8QA 1E55A 3VIMA 1DHKA 2WB5A 1ZU8A 1QNRA 4AIOA 1E6NA 1W9DM 5CG0A 1BSIA 1HKJA 4PMNA 3ECQA 2XPKA 1ZB5A 1CLXA 3ALGA 1UYQA 2FH8A 4PCTA 4UQBA 4U5KA 3KL3A 1H1NA 3BAIA 6CGTA 4AZ6A 1H0IA 3HMCA 1FA2A 4UTFA 3CUHA 2VX7A 4D6IA 3BAYA 1JD9A 4M56A 1B90A 5AC4A 1PAMA 3THCA 2CITA 2NT0A 3KZSA 2VX6A 3OLDA 4W7VA 1HL9A 4H8VA 2WMKA 2EQDA 3BSHA 4UCFA 3QHNA 5A6SA 4ZFMA 1UWSA 1EDGA 3TA9A 3TP4A 4CCCA 4DM2A 3BAXA 1I1WA 4D6EA 2E0PA 2XJ7A 3L2MA 3EDJA 1ISWA 2GJPA 1PX3A 5TD4A 4UFIA 2ZWZA 4L4OA 2X09A 3CMJA 3SUUA 4W85A 5ABFB 1NWUA 3PN8A 3TONA 1QNPA 1W32A 3ZO9A 3G6MA 4J7RA 3B9EA 2OYKA 5GQBA 4CD8A 2ZXQA 3CHEA 4C7GA 1E71M 3OIHA 3ARYA 4HU8A 1V6WA 2BY1A 1BVZA 4LYQA 1LLOA 4V27A 1WAWA 1F4HA 1JAKA 1EH9A 1Q6GA 4J3TA 3BAKA 4JKKA 3CUIA 3AROA 1HL8A 1LG1A 4HPHA 1E6SM 1UWRA 4CN4A 1MXGA 3VMNA 1TVNA 3O2LA 1HVQA 2D0GA 5A8MA 4DWSD 4UFJA 4W88A 2VRKA 1XSKA 2XG9A 3RPMA 3VNYA 3VIIA 3RILA 2UY2A 4JFTA 3BAWA 5A69A 4GI9A 1CGWA 2AMGA 1M04A 1OBAA 3APGA 4GQRA 4JAWA 4R5EA 1BYBA 4MJ2A 1ESWA 2BHUA 2XWDA 3OGVA 3U5YA 4R27A 4FLSA 2J8GA 3VD3A 3WF3A 4N0RA 5CGTA 2BVDA 3CGTA 3IJ8A 3L4TA 1G0CA 2IUZA 1FHDA 3PHAA 5JIWA 1E73M 1UR8A 4Z2IA 2DIEA 4J3XA 2X0HA 2VO5A 4BS0A 3WMBA 2CCRA 2GK1A 4XB3A 3QHMA 4HZ7A 2J79A 2EPMX 3CPUA 1C91A 4A4AA 2G3JA 2A3AA 4PN2A 3ZOAA 5I6SA 1M01A 2WCGA 2CBUA 4DM1A 3WIJA 5BXRA 4CUCA 1XC6A 3W4RA 1XD1A 1KR1A 3T08A 4WKHA 3T0AA 4GQQA 2AAAA 1ODUA 4WSJA 3CLWA 3EMZA 4E2OA 2JEQA 3LPOA 5LA0A 3A47A 4QFUA 1WZMA 3BGAA 1BVNP 4WF7A 1NM9A 3VPLA 1UD8A 5A2CA 3UG3A 1GOWA 4HA3A 1UD5A 1BTCA 4YHEA 1BAGA 1V3LA 1JD7A 2PB1A 2ZUSA 4AEFA 3QHOA 1MXDA 3L2LA 1KB3A 3BCFA 3WFLA 4TVDA 3CHFA 2JF7A 3RMEA 2VZSA 4AD4A 3B8SA 2DT2A 1VJZA 2G3IA 2Q8XA 2WVSA 3S6TA 3IAPA 2O9OA 3EYPA 4BQ5A 4HMCA 1MVYA 4PUEA 2OYLA 3L4YA 5BXPA 2ZXBA 4ZXOA 2VJXA 4LYRA 5A6JA 2XIBA 2YDSA 2XWEA 4H2CA 4MB5A 1BG4A 1DTUA 5CPQA 3K4AA 2XYLA 2ZUVA 4M24A 1LL6A 1E9LA 1KQZA 1G5AA 3SUTA 3OLIA 2BV9A 1E1EA 1KXHA 1QI2A 2XTKA 3GH4A 4W87A 4WSKA 1JZ3A 5JIPA 3W6LA 1K9DA 3WBAA 2D1ZA 4ATWA 1J0KA 5FKYA 3SCWA 1V02E 1P6WA 4YHGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AYS A;  3LPP A;  1E0V A;  1GOQ A;  3OLG A;  4PMO A;  1JG9 A;  4BZY A;  4CVU A;  4ATD A;  1C7T A;  1XRV A;  1NAR A;  1J9Y A;  2NT1 A;  3WQ6 A;  2JFE X;  3CUJ A;  3I3E A;  2WZE A;  1Q6D A;  3W53 A;  2JIE A;  3MUZ 1;  4M1R A;  4AZ7 A;  1ISZ A;  1DWJ M;  1VB9 A;  1JGI A;  1HJU A;  1XGZ A;  1ZJB A;  1E3X A;  1W9B M;  4WJX A;  1VEN A;  1MWO A;  2CEQ A;  1QPK A;  5FL0 A;  1GJU A;  1U2Y A;  3ARX A;  3AQU A;  3BMW A;  2EO7 A;  1R85 A;  1OT2 A;  3GXM A;  2QHA A;  3WDR A;  4D6C A;  2O9T A;  3AFB A;  4TX6 A;  2VZV A;  2BY2 A;  2C8N A;  4E8D A;  3GDB A;  3ZJ7 A;  3MUY 1;  3GXF A;  2XM2 A;  1JAE A;  1JND A;  3FAW A;  2WMJ A;  3GNO A;  1W3K A;  3GTN A;  4OBS A;  3KWX A;  3T2Q A;  1R87 A;  4AZG A;  1DP0 A;  4W8L A;  3WQW A;  1UWT A;  4B15 A;  5A8O A;  4QDM A;  3WNN A;  3AML A;  2GJX A;  1KCK A;  3ZQ9 A;  4M8U A;  3VU2 A;  3MSG A;  3AIW A;  4CN6 A;  1B3X A;  4PRW A;  3W0K A;  1XH2 A;  1SYT A;  4RL3 A;  4PMU A;  2W66 A;  4GIN A;  3K46 A;  4M82 A;  4PMX A;  1C8X A;  1K9F A;  2OSW A;  3AIV A;  1UD4 A;  4ACZ B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2XIO A;  3GZA A;  2ZA2 A;  3LMZ A;  4W4Q A;  5T91 A;  3I3B A;  2WZI A;  3MC5 A;  4O10 A;  3P2V A;  4GVG A;  3W7O A;  4WIW A;  1PYF A;  3DES A;  1YYA A;  3W37 A;  3IJ6 A;  4KCW A;  5CC3 A;  2CZV A;  4E8C A;  4R53 A;  4O12 A;  4XVE A;  3T44 A;  3ZXW A;  4ZOC A;  5G2I A;  3VVG A;  1T96 A;  1FCQ A;  4V1X A;  4UNI A;  3G0S A;  2J62 A;  2YOC A;  3NDY A;  1C8Y A;  4U5I A;  4PUL A;  4RK8 A;  1EP1 A;  1F73 A;  3BG3 A;  4HNN A;  1WP6 A;  3B4Y A;  4UFM A;  5JVL A;  1V3H A;  4I8D A;  1FCU A;  1CBG A;  1U5H A;  2YCI X;  2ICS A;  2WVV B;  5BWF A;  2Z7K A;  1B0I A;  1V6Y A;  3T55 A;  3H23 A;  2F6X A;  2ZQ0 A;  4O19 A;  2CER A;  4Q8W A;  1IEW A;  1D3C A;  2PDM A;  2FIQ A;  1ZBV A;  3S9Z A;  4NAF B;  2CBV A;  3EXR A;  4Z08 A;  4DYE A;  1KRB C;  1JFH A;  1XWY A;  3LCI A;  4Z2L A;  3MSY A;  2NZL A;  5GNY A;  1LCO A;  3LLX A;  5DFA A;  3EOL A;  5FJJ A;  3P60 A;  4RW5 A;  2V2C A;  3WMS A;  4CVW A;  3FV9 A;  4H7V A;  3WL0 A;  3A4W A;  2Y24 A;  3TW6 A;  5A8P A;  4E38 A;  4AVN A;  1DTN A;  2WLZ A;  1LWI A;  3WD0 A; 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