2CKRA

X-ray crystal structure of the catalytic domain of thermobifida fusca endoglucanase cel5a (e5) e355q in complex with cellotetraose
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
305
structure length
305
Chain Sequence
GTPVERYGKVQVCGTQLCDEHGNPVQLRGMSTHGIQWFDHCLTDSSLDALAYDWKADIIRLSMYIQEDGYETNPRGFTDRMHQLIDMATARGLYVIVDWHILTPGDPHYNLDRAKTFFAEIAQRHASKTNVLYEIANEPNGVSWASIKSYAEEVIPVIRQRDPDSVIIVGTRGWSSLGVSEGSGPAEIAANPVNASNIMYAFHFYAASHRDNYLNALREASELFPVFVTQFGTETYTGDGANDFQMADRYIDLMAERKIGWTKWNYSDDFRSGAVFQPGTCASGGPWSGSSLKASGQWVRSKLQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOGLUCANASE E-5
publication title The Crystal Structure of the Catalytic Domain of Thermobifida Fusca Endoglucanase Cel5A in Complex with Cellotetraose
rcsb
source organism Thermobifida fusca
total genus 134
structure length 305
sequence length 305
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2006-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2ckrA00
3A3HA 4HU0A 4NSBA 3ZJ6A 1W2VA 3FN9A 1CTNA 3GTNA 1H09A 4UQ9A 1NWRA 5HOSA 2VVNA 1DHKA 4BQ5A 4V27A 4DUXA 5A6BD 1K9EA 1VFOA 2XM1A 5BROA 3VIGA 4XZWA 2TAAA 4FF5A 3AI0A 1WDSA 1QNPA 1W3KA 5TD4A 5FOOA 3L4UA 1JYNA 1C7SA 3LPFA 2J62A 5BRPA 1W9XA 2ZIDA 4JHZA 2W91A 1W9BM 3MSGA 2WMKA 1C91A 2HVMA 1CZ1A 4W5UA 2X0YA 3GXIA 4AZ5A 3SURA 1WDPA 3W27A 4ATLA 3WF0A 5FKYA 2VRJA 5AC5A 4LX4A 2BHUA 3AMKA 2IXVA 7CGTA 4P8XA 3VINA 4CU6A 2X09A 1QNRA 1JF6A 3IANA 3AICA 5HBFA 1RP8A 3OA5A 3ARPA 5A6AA 2DIJA 3ALGA 5KEZA 1CPUA 1TCMA 2V38A 3EDKA 1OWQA 5A6KA 4AYSA 2CXGA 2D0HA 1Y7VA 1HKIA 3W37A 3WQ5A 1M01A 2BY3A 1Q6DA 2ZX6A 1OM0A 2EPLX 3OGSA 2JF7A 2PBGA 3AHXA 2GK1B 5CPTA 4TVCA 3VD4A 1DWJM 2V3FA 2WC7A 2WLZA 3IK2A 2OSWA 4W86A 4OIFA 1G1YA 3I3BA 2BHZA 5CQ1A 5LYRA 3ZT5A 1PIFA 2AOSA 1HJQA 2DT2A 5D8WA 1U33A 3RM4A 2YBUA 2YA2A 3WQWA 5A2BA 4YHGA 1TFVA 4J3XA 1V0KA 4PTWA 2F8QA 2QPUA 1JZ8A 1TVNA 2VURA 2CCRA 2WHJA 3VNZA 4QLJA 4PMXA 3MMDA 3CZLA 2Y2WA 3BSHA 1BG9A 3NSNA 1W2PA 4D6DA 2VNCA 3WF4A 5I79A 3M6DA 1QNSA 4IM4A 1EHNA 4ACYA 1JNEA 4L4OA 4J7RA 4WF7A 2Y4SA 1TUXA 2WM0A 3IJ9A 3LPOA 2CKRA 1CDGA 2J75A 4AZ7A 3L4TA 1NOFA 1WPCA 3SUVA 4AIOA 5CGMA 3F5LA 2CBJA 5A8NA 3L4VA 1MW1A 4XV0A 2VZSA 4MNMA 1M04A 2GK1A 1ITCA 4H2CA 5AY7A 3T0AA 1UH3A 3CHCA 1LJYA 1B3ZA 6CGTA 2XGIA 2E9LA 3U7VA 5M03A 3EMCA 2JF6A 1DWFM 1HL8A 2OWXA 3GXFA 2X1IA 1WP6A 4PUEA 3CLWA 1M53A 1XC6A 1ZJBA 1C93A 4BCEA 2VR4A 4HOZA 1CXKA 1QI0A 2WMFA 2YA0A 1V08A 1E6QM 1PZ2A 3VMOA 1W9DM 3EMQA 4JL2A 4F9JA 9CGTA 1EGZA 3UG3A 1SR0A 4U5IA 2DEPA 4MJ4A 1US2A 3QHMA 1UWUA 3PZNA 1J0JA 5E6ZA 4MB3A 3O2LA 3T09A 1ZBKA 3W81A 1RPKA 1IZKA 4D6GA 2GJPA 1V3MA 1H5VA 2PWGA 4Z2IA 1VFFA 2VJXA 1OCQA 3WH6A 2WZIA 1FHDA 4F8XA 3II1A 4HPHA 5I23A 1E6XM 3AIWA 2WC3A 4ACZB 5AYBA 3VX1A 5IDIA 2O9TA 4GXPA 2OWCA 3AXXA 1W1VA 3QGVA 2XSBA 1K9FA 4XB3A 2PI6A 5ABGA 2ESCA 1GZJA 1Z32X 4HZ7A 4ZE5A 1HX0A 1C8YA 1PEZA 1B3XA 1KCKA 4J3TA 1QI5A 3CO4A 3ZT7A 3W26A 1CXIA 1E6RA 2G3JA 3KL5A 4HTYA 3W25A 2Y24A 2XVPA 2VCCA 2J8GA 1JDAA 1CGVA 3WQ4A 2YDQA 4RL3A 3RCNA 1C7TA 1S46A 3F5KA 4UFLA 2EPMX 1LLOA 2FHFA 1W9PA 3VM5A 4B3KA 3IAQA 1R86A 3EDJA 4PRWA 1ISZA 1W1YA 5EB8A 3AYSA 2D0FA 4FLRA 3QOMA 1JXKA 3W6MA 1E1FA 2DSWA 1NWUA 3T0DA 1AMYA 3ARWA 1ZU8A 4M29A 1UA3A 1V6XA 3FY1A 3DYMA 3A4WA 5JUVA 5IHRA 1EQPA 3WKZA 5GNZA 1HXJA 2A3BA 3AFBA 4KWUA 3GBEA 4ACZA 4W84A 3SUTA 3WH5A 1EA9C 1TA3B 1HNYA 4W5ZA 3NDYA 3VPLA 4RE2A 1OINA 3BAXA 1OGGA 2DGAA 2ZX5A 3GYCA 2J7FA 4PSPA 2ZE0A 1JZ4A 3OB8A 3VIPA 2HISA 2FDMA 3TTSA 3WDHA 4W88A 1GOKA 3VIIA 4Z2JA 3WQVA 4N42A 4W7VA 2Y8KA 1BFNA 3N1AA 3RIKA 1J9YA 1MQRA 1GOWA 2Y5EA 2XGBA 2JIWA 3CZKA 2A3CA 2WWCA 2V3DA 4AEEA 2ZX8A 1W9UA 1UR1A 1ZBWA 3QOKA 4WIWA 4P8UA 3O6AA 3VM7A 4LYQA 1CENA 2WHKA 5LA2A 4ATDA 3W6LA 1O6IA 1E4LA 3PHAA 1OT1A 4BF7A 3MO4A 3FAWA 3PN8A 3HN3A 4W85A 1CYGA 3N15A 3VMNA 1GJUA 5JIPA 4MPKA 1UD4A 4XX6A 1WKYA 3RPMA 2GUYA 5A1AA 3AHYA 5IXEA 3K1DA 2UY3A 4UR9A 3WFLA 1UKQA 3L4WA 1PIGA 1JG9A 1TA3A 1AVAA 2EPKX 3SCTA 3UETA 4PSRA 3L2LA 1FP8A 3VDHA 2E40A 4AD4A 1GW1A 3ARUA 1GPFA 2WKGA 1JGIA 1VEPA 4C7GA 3I3EA 3N17A 3G6LA 3UCQA 3WQ6A 2XFRA 3AIVA 2XTKA 1FH7A 4M80A 3AQUA 3KWXA 1CGUA 3HMCA 1TMQA 3LPPA 2ZWYA 4UOZA 4CVWA 1B3VA 1BTCA 1UKPA 5CPQA 2FH8A 3FHQA 5IFTA 4P7LA 1UR8A 5A3HA 1MQPA 2XFFA 3TTYA 3AMLA 3VD9A 4ZXOA 2J7CA 3PZ9A 5CJ5A 4KMQA 1QI4A 1HP4A 2IXUA 4E8DA 2A3HA 2WSPA 1MQQA 2NW0A 1HVXA 3FAXA 2G4FA 3VO0A 3LPGA 1FFRA 1US3A 1UZ4A 2G8ZA 3EDFA 3VGEA 3WDIA 3W28A 4QP0A 4JFTA 4JAWA 1UD8A 4HU8A 3F4VA 4JZ5A 4UFIA 2ZX7A 3VD7A 1KQYA 4D6EA 4B9YA 3J7HA 4QCFA 1NM9A 4N0RA 2OYKA 4D6JA 4HA1A 3K8LA 2DH2A 2GJRA 1JZ5A 1VENA 4AIUA 4ZE4A 4AZBA 3SEPA 4JFSA 1HJUA 3MV01 4PMRA 1LF1A 3A4AA 4EKJA 3VKKA 1LG2A 4UQAA 1HF6A 5A8PA 3IJ7A 2VZTA 1XSKA 3QR3A 5D8ZA 4D1JA 1E6SM 4UNIA 2WHLA 1MXGA 2ZWZA 3OLEA 4GZEA 2NT1A 4H8HA 3ARVA 4GINA 3VIFA 1JYWA 4OUEA 3SIMA 3VIJA 1J10A 5CLWA 1B3WA 3GH7A 2QF8A 1C3FA 1YHTA 1JFXA 4TVUA 1QPKA 4Y7EA 5A95A 1VJSA 3CUFA 3ZQ9A 1OD0A 5M17A 1G94A 1HJVA 1WO2A 1H11A 3MSDA 1HJSA 1LL4A 2GVYA 4B9ZA 3PZTA 5GNXA 2XJ7A 4MB5A 1VEMA 4U2YA 2C0HA 2VRQA 2BVYA 3E1F1 4HA4A 3CZ8A 5A6SA 3GNOA 1L8NA 4UOQA 4LPCA 3O9NA 3F5JA 4JCMA 3ZOAA 1QOXA 3ZM8A 5HXMA 1TG7A 2XPKA 1MWOA 3NSXA 1BLIA 3U57A 4D6IA 4MAZA 2GDVA 4Z2HA 2UY4A 1BYDA 3BC9A 2PF0A 2CKSA 1W91A 1E40A 2CBUA 5A6MA 2XM2A 1UH4A 2ZUVA 4CCDA 1UD2A 3BAWA 4MADA 1E4MM 3RDKA 2PWHA 2ZXQA 2NSXA 1SFSA 3DYPA 4EAMA 3VMPA 1I75A 1DEDA 1MYRA 4WSJA 1D2KA 1BVZA 2DT1A 3FHAA 4UFKA 2EPNA 2Q8XA 2D20A 2GDUA 1K6AA 2YJQA 2PWFA 5GQBA 2DSUA 2VX6A 5I6SA 2WMIB 2BHYA 3WMBA 1JAKA 3RM9A 1NP2A 3PZUA 4S3JA 1E0VA 4CVUA 3VU2A 1V0MA 3U5UA 4QAWA 4B3LA 1CXEA 1X6LA 4GO9A 1VFMA 1V3KA 1VFUA 2BY0A 1E3XA 1OIFA 4P7QA 2CEQA 2EO7A 1JYVA 1UQZA 1B30A 2VX4A 3APGA 3GXDA 3T2PA 1SMDA 4NZCA 2G41A 3WFZA 1XV8A 3CUJA 1D7FA 5HNNA 3IJ8A 1UR2A 2EPOA 3CHDA 1PPIA 1UWRA 3UERA 4HZ6A 3PTMA 1JL8A 1JD7A 2WLYA 4J27A 1NARA 1GUVA 4JIEA 3BXWA 2F61A 1J0YA 3QHOA 2JEQA 2V5DA 5IHSA 2XWEA 4HMDA 5A8QA 1UWTA 2FH6A 3VNYA 2WSKA 7A3HA 4DUWA 2E9BA 4H8VA 3AIQA 2WW5A 1BG4A 1B31A 1GCYA 8A3HA 6TAAA 1EO7A 2WMIA 3AIRA 4EANA 2B31A 1BGGA 5FIPA 4CGTA 2YDRA 2VRKA 3PZQA 1B2YA 1FHLA 4A4AA 2YOCA 1ISVA 5JIWA 1PZ3A 4J3SA 5D9OA 1BYCA 2D2OA 1MVYA 2EBNA 2RGMA 3D5HA 5DMYA 1ISXA 1MFVA 1H1NA 2WK2A 1IV8A 4GIAA 1KR0A 1E4NA 2YLAA 1E73M 2ZUTA 3WD1A 5HPOA 4E4PA 1ZB5A 2CYGA 1UWIA 1W3LA 2X2YA 1WDRA 3GDBA 3WUFA 1CGXA 2XVKA 2XHYA 1OT2A 2ZXAA 2J79A 1EDGA 5EFFA 5D9MA 3AHTA 4KGJA 2BNJA 2VO5A 1M7XA 1XD1A 3EYPA 4FLOA 2ZICA 1ZS2A 1TZ7A 3OG2A 4V2XA 5EBAA 3VGDA 3ZR6A 4UQDA 1HVQA 2G3IA 1R85A 3SUSA 3WNKA 3RJXA 2WVVB 2DQXA 3ZSSA 4D72A 5ABHA 5BXRA 1Q6GA 2ZOXA 4HP5A 4AD2A 1TE1A 1WCGA 4JKMA 4BQ4A 1LG1A 3TP4A 3TTQA 1CGYA 1UYQA 2CITA 2XVLA 2WHMA 5DFAA 3WIJA 4JHOA 1V02E 2WYSA 2VC9A 4GI6A 1V6YA 1J0KA 1OIMA 2UY2A 3CH9A 5D9PA 4MTVA 3PZIA 2WZHA 1B3YA 2EXOA 1QW8A 1ZBVA 3W53A 4FMVA 4HOXA 2WANA 5FCZA 3KL3A 4OOUA 1G0CA 3AXIA 3AMDA 1KQZA 4AZHA 2DSKA 4AD1A 1JXJA 2V3GA 3K46A 1ITXA 1CEOA 1W3JA 3AISA 1UD3A 1QHZA 3WF2A 5ABFB 2WVVA 2BVDA 2WWDA 4BZYA 5BXTA 1EIBA 1W1TA 1PX3A 4MDPA 1V6VA 3MS8A 1JAEA 1XCWA 4UFHA 3WELA 4AC1X 1JNDA 1OD8A 3EDDA 4U5KA 2XWDA 1KGXA 2CETA 3AZRA 1UA7A 5BCAA 2WMGA 4U33A 5A69A 3OLIA 5JBFA 1AQHA 1EOMA 1HJXA 5E70A 1KCLA 3T2QA 2W5FA 4TVDA 4H8UA 3VGGA 4M24A 1DP0A 4QCEA 4FLSA 3PZMA 1UKTA 4CD7A 3FW6A 3MMUA 3BGAA 2CESA 1LL7A 3CMJA 2YL8A 3RM8A 3W82A 4Z2LA 3K4AA 1JZ3A 2VCAA 3M07A 5M5DA 2YBTA 3VIHA 1HKJA 2V5CA 3WN6A 3OGVA 2EQDA 1RD6A 5ABFA 3SCWA 3MU7A 4H04A 1JYXA 3N11A 3VOCA 3SUWA 4AEFA 2E3ZA 2WB5A 5A8MA 1E4IA 3BMWA 1LWJA 4M81A 5I24A 1CWYA 2FGLA 4IPNB 4MNLA 4RE4A 1PX4A 3AHZA 5A6JA 2VUYA 1JZ2A 1XH0A 1VBUA 2Z1KA 1HJWA 5JBEA 1MW3A 1NWTA 3B9AA 4BQ2A 1KGUA 5CGTA 1C90A 3W29A 1NOWA 3KL0A 4CD4A 3WL1A 2W63A 2A3AA 1QBBA 3FXYA 3SCQA 3ARYA 4WK9A 3WNLA 2V3EA 3BAKA 3NDZA 2OWWA 1WDQA 3ARQA 2DDXA 3WD4A 1DWGM 2CHOA 2G3NA 3WEMA 1MW0A 2VZUA 3WDJA 4M1RA 3M46A 1B9ZA 4J28A 3POCA 1QBAA 2WBKA 2VR5A 4C7DA 2XG9A 4PTXA 3K8MA 2WCGA 5CSUA 1QW9A 1V03A 3N13A 5HDRA 3TONA 3BMVA 1NQ6A 4UFMA 2FHCA 4LYRA 4J3WA 3VGHA 3ALFA 1GNXA 3WSUA 4HMCA 1FA2A 1E6ZA 3N12A 4LGXA 4PMZA 1F4AA 4CN4A 3ZSTA 3I3DA 1JF5A 1KBBA 1JD9A 3ZJ7A 3A4XA 2VQTA 2VOTA 4NRRA 3UESA 1V6UA 3BSGA 4PMYA 1BF2A 2J7GA 2D3LA 4LXFA 5E09A 1K9DA 3WD0A 1XYZA 1WZAA 4CD5A 3SCNA 5I77A 3ZJKA 1UQYA 3KZSA 1EDTA 1E56A 1TR1A 1I1WA 1IT0A 3AS3A 4AZ6A 4PTMA 3W0KA 3U7BA 4R5EA 3WMSA 4PMNA 1Q4NX 4P7OA 1LWHA 2OLHA 1VF8A 4CU7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A3H A;  4HU0 A;  4NSB A;  3ZJ6 A;  1W2V A;  3FN9 A;  1CTN A;  3GTN A;  1H09 A;  4UQ9 A;  1NWR A;  5HOS A;  2VVN A;  1DHK A;  4BQ5 A;  4V27 A;  4DUX A;  5A6B D;  1K9E A;  1VFO A;  2XM1 A;  5BRO A;  3VIG A;  4XZW A;  2TAA A;  4FF5 A;  3AI0 A;  1WDS A;  1QNP A;  1W3K A;  5TD4 A;  5FOO A;  3L4U A;  1JYN A;  1C7S A;  3LPF A;  2J62 A;  5BRP A;  1W9X A;  2ZID A;  4JHZ A;  2W91 A;  1W9B M;  3MSG A;  2WMK A;  1C91 A;  2HVM A;  1CZ1 A;  4W5U A;  2X0Y A;  3GXI A;  4AZ5 A;  3SUR A;  1WDP A;  3W27 A;  4ATL A;  3WF0 A;  5FKY A;  2VRJ A;  5AC5 A;  4LX4 A;  2BHU A;  3AMK A;  2IXV A;  7CGT A;  4P8X A;  3VIN A;  4CU6 A;  2X09 A;  1QNR A;  1JF6 A;  3IAN A;  3AIC A;  5HBF A;  1RP8 A;  3OA5 A;  3ARP A;  5A6A A;  2DIJ A;  3ALG A;  5KEZ A;  1CPU A;  1TCM A;  2V38 A;  3EDK A;  1OWQ A;  5A6K A;  4AYS A;  2CXG A;  2D0H A;  1Y7V A;  1HKI A;  3W37 A;  3WQ5 A;  1M01 A;  2BY3 A;  1Q6D A;  2ZX6 A;  1OM0 A;  2EPL X;  3OGS A;  2JF7 A;  2PBG A;  3AHX A;  2GK1 B;  5CPT A;  4TVC A;  3VD4 A;  1DWJ M;  2V3F A;  2WC7 A;  2WLZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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