4MY1A

Crystal structure of the inosine 5'-monophosphate dehydrogenase, with a internal deletion of cbs domain from bacillus anthracis str. ames complexed with p68
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
362
structure length
349
Chain Sequence
SNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKLVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLESHPHHVQITKEAPNYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
publication title Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase, with a Internal Deletion of CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with P68
rcsb
source organism Bacillus anthracis
total genus 102
structure length 349
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4my1A00
5U7SA 1ICQA 5BRBA 3PUOA 4ZQCA 3THQA 1DKWA 3EB2A 3UXAA 3HGSA 1TV7A 1R2RA 4ML9A 3S0CA 4XBKA 3C4UA 2FB2A 4K39A 4FIRA 1VYPX 3WK0A 4JTJA 3A9IA 4O50A 4BR1A 4IX0A 2NXGA 3GDLA 1Z48A 2VEMA 2ZQ0A 1SFLA 1SO3A 3DHDA 3TNOA 4JTUA 3O16A 1JUEA 3P81A 3QPZA 4FXRA 3QM3A 3WJYA 2I1OA 3BK0A 4UIOA 1KLYA 2E6FA 3L0GA 3NZ1A 2ZTKA 1F6PA 3Q2DA 4MZYA 1TCDA 2QJGA 4RK8A 2GJLA 3E0IA 3W7IA 1YTKA 4JX6A 2ZA1A 1QOPA 4JD4A 1KBIA 2YFOA 1SW7A 5BMWA 1R47A 3DI1A 3UWUA 1EA0A 2C1HA 2ZZ1A 3TU9A 1LOLA 4WX2A 4OV4A 4A2RA 1X6UA 2E68A 4OQVA 5TIMA 1H50A 1TMHA 3KVKA 1JUKA 4W9TA 2GJNA 1KM0A 1K8XA 3KRZA 3GDKA 4UMBA 5G1TA 3I6RA 1C9DA 4N9BA 2X30A 4IMCA 1H63A 1VYRA 3GXTA 1QOQA 3M5ZA 1H7PA 3QC3A 2FQIA 1AL7A 4M7TA 3S5OA 3JR2A 5E93A 5FF3A 1ZHAA 2QJIA 1TPB1 4DF0A 4DBDA 3C6CA 4HT3A 5HINA 3NPWA 1XL9A 5KZEA 3G1YA 1BEUA 2B7NA 1DOSA 1NF0A 2TRSA 2CW6A 5TBOA 1M7PA 1XXXA 4DF2A 1R46A 1O5KA 3BLIA 4FX8A 5LNSA 2DJLA 1WDWA 2QCLA 3W3OA 2WSQA 1W5OA 1ADOA 5K7JA 1OFDA 1JRBA 1LBLA 4JYFA 5C2XA 3FS2A 1GYLA 2WNNA 3G1FA 2RDUA 3OVRA 2C0AA 4FNPA 1KM5A 5DLCA 1H5YA 4JDYA 2YX0A 1UJPA 2C16A 3GXPA 1WXJA 1GZGA 3NL3A 1PCKA 5IBXA 1OF6A 3ABQA 3HO8A 3TQVA 1FX6A 1H61A 2FDSA 4UTMA 1FCUA 3UPBA 1P5BA 3P62A 1SPQA 1W0MA 4IMEA 1I2NA 1OYAA 3JS3A 4E2BA 3USBA 1PS9A 3UXDA 1Q6RA 5AHLA 5HR6A 2TMDA 1B4EA 1XBVA 2LLEA 4UTLA 2DZXA 1TPEA 5T26A 3C2VA 5C54A 2V2DA 1XBZA 2J6XA 3IIZA 5DCDA 2ZZ5A 1UB3A 2R94A 4MZ8A 4MYAA 3S42A 5KINA 5K9CA 1SR9A 1JVNA 1WOAA 3A23A 4WXYA 3GR8A 5BMXA 2Y7EA 1MO0A 2W79A 5D37A 3NL5A 1P0KA 2ZFAA 2Y7FA 1C8VA 3HPXA 3LCHA 4DPPA 2R8WA 1W3NA 5BNKA 1AK5A 1SZGA 2YGYA 4O54A 2XFWA 1ML1A 5J5DA 3IRDA 3HIJA 4N9DA 3NEVA 3B8DA 1K03A 3PBUA 1B57A 2NWSA 2OT1A 3M5YA 1JCLA 3M41A 3QZEA 5D04C 3MI6A 4FB7A 1LOQA 3TK7A 5KZDA 5G2HA 1S5VA 2VFFA 4Z1AA 4IOTA 1QDSA 1TPDA 3W1UA 3S9YA 3W7RA 4LNYA 1VC4A 3HMJG 4Y90A 2RDWA 3TCEA 1EP2A 1KM6A 3Q94A 3M0ZA 4N2YA 2B7OA 3LCFA 4IPJA 3UZ5A 4O1DA 4HNNA 3TH6A 3WFAA 4FNRA 4EIVA 1BKSA 4O57A 4MIMA 3PC0A 1X1OA 1TPUA 1EUAA 3GAKA 5AHFA 3TDFA 2FB3A 3EWWA 1LOSA 3CM4A 3TV8A 4HSOA 1Z44A 4GUHA 5G5IA 4EF9A 4JTHA 4JTLA 2VKZG 1TPFA 3W73A 2JKEA 5D02A 4UR8A 2VFGA 2JGQA 1OYBA 1KFBA 3I68A 5D30A 3OBKA 5DXXA 5L9FA 4IMDA 4UTHA 3H55A 2W0UA 1I2RA 5LZLA 4UTJA 1JQVA 2CZEA 4HIBA 3EEGA 5EA9A 1TJRA 3W7GA 2XN0A 3MMTA 3I7QA 4Z1DA 3RLUA 3HB9A 1RR2A 2ZA2A 4MY1A 3TC6A 1WBJA 5HUPA 2TSYA 4JTTA 4LWWA 2X2GA 1KLZA 4CNNA 1B9BA 4JNMA 3QMTA 4BI6A 5DN1A 5EL1A 3A22A 1GT8A 2VOMA 1IXOA 3RF9A 1PHWA 1YTDA 3PY2A 3NQ2A 3GNNA 3SIZA 1F7BA 3FA5A 3CQ0A 3LTYA 1KV8A 2B7PA 3DZ1A 5HWMA 3W2NA 1A5AA 1F5ZA 2I14A 5CPMA 3PM6A 4JTGA 1WQ5A 3EWZA 1JJKA 2NWRA 3PSWA 2PRMA 3UWYA 4POCA 4GFSA 5L6UA 3PSVA 3L65A 2DZPA 4UTTA 4AHQA 3ZS4A 5AC6A 1RQHA 4P61A 3NM3A 3L0KA 4O17A 1FXQA 1GJPA 3STFA 2QCMA 1VPXA 5HJLA 2NUWA 2WNZA 1YDOA 5AYYA 1SZNA 1KM1A 3OHIA 5H91A 1VCVA 3KVJA 1DJNA 4CCCA 4QITA 1WA3A 2E6AA 1PE1A 3SSJA 1YPFA 4H3DA 3IIOA 4WY0F 3NXFA 1M6JA 3FYOA 1A5BA 2VEPA 1DORA 3U8GA 1YXCA 1GTHA 2WSYA 2QCFA 1KM3A 1PVNA 4D2JA 1TO3A 3BG5A 1TPVA 3EWUA 1Z42A 4MUZA 2ZRUA 2DJXA 4LU0A 4LTSA 3C56A 3T4CA 5FF4A 4FNUA 1TQJA 2B7QA 1TIMA 2ZA3A 4ZQOA 1SU5A 3TQ0A 2AAMA 2J9ZA 3QYQA 3M5VA 1UASA 4MJMA 3CIWA 1O95A 1L6YA 3NL2A 2J27A 4LRSA 3CTLA 4R7JA 2H90A 1ZAJA 4LV9A 3QEZA 4O1CA 3NQEA 3M44A 1FQ0A 2C13A 5CGQA 5GVJA 1QMLA 2QUUA 4DPQA 2E6YA 4QQ3A 4ORMA 5D09A 3W1MA 4CLMA 4O4VA 1LYXA 3W07A 3G1HA 2A7RA 3FFSA 3MHUA 1QNVA 4WQ6A 3STEA 1FWWA 4JX5A 1OYCA 1VRDA 2ISVA 1PHQA 3HF3A 5F1UA 1UBSA 3RNDA 5DY3A 3LV5A 4RR4A 4LVDA 4NJGA 3W76A 4NQ1A 1OABA 3W74A 3NQ7A 4X9SA 4DEFA 4A29A 2VFDA 4HSNA 3LLFA 4O18A 4GNJA 3LI1A 4UTTC 5K3VA 4GUIA 3W2LA 2O7SA 4MYXA 3O05A 4ZQNA 3RMJA 3EX4A 5HWNA 2C15A 4I9AA 3C2RA 1Q6LA 3L66A 4FNSA 2V8ZA 3QQ1A 1G7VA 3NYZA 4BWLC 2C19A 2H8ZA 3TQKA 1B3OA 3M1ZA 4AH7A 1DQXA 2YSWA 2KZHA 2ZZ3A 3CT7A 5LHFA 5C6MA 4ICNA 1ME8A 1IXQA 2PE4A 3R2GA 3G0UA 4DXVA 2JGYA 1W54A 3E02A 3BLEA 3PUDA 5HULA 2ZZ6A 4MVAA 5D32A 3ZWSA 1X1ZA 2V81A 5H2ZA 3GNDA 4O11A 2A21A 2Y63A 2NX1A 1EB3A 4UTKA 4OGZA 1DQWA 2BXVA 1D9EA 2FPTA 1K8YA 1OFRA 2EGZA 1K7XA 5E0KA 2QCEA 2E6DA 3GZ3A 1THFD 1AW5A 2P0OA 1SFJA 4MPQA 3MYPA 4AWTA 4CQAA 3LV6A 3MW7A 1GWJA 4N6FA 2CZDA 3TC7A 4IJBA 3T44A 1H7NA 3R89A 2X16A 3UQNA 1LORA 1TV5A 4XZ9A 1Q6QA 1ZNNA 3VNDA 2NV1A 1OX5A 5G4EA 1A5CA 2YXGA 4O52A 4GWEA 3GXNA 1GG1A 3QH2A 1K8ZA 4UFJA 3W70A 1H60A 2CZ5A 2H6RA 1G67A 3GLCA 2ZDRA 3DXIA 3EWXA 3CWNA 2ZRYA 2FTPA 2A6NA 3BVJA 4A2SA 4QM1A 3LXBA 3ELFA 5SWUA 1GVQA 4I7UA 3P67A 3QRHA 4LRTA 2X1SA 1OK4A 3FOKA 3T78A 3MI3A 2FPVA 4N6EA 5DXYA 4ZZ9A 4WZHA 3S5NA 3HBLA 3DHFA 1XM3A 3GYEA 1OHLA 1KFCA 1VZWA 3QSTA 4ZQPA 1QPOA 5CSRA 1JCYA 3AJXA 2EKCA 3NM1A 3W84A 1W56A 2VFIA 2HS8A 5LHEA 1A53A 2R14A 1MEHA 5I3GA 4Y6GA 5HR7A 3W7KA 5HMSA 3YPIA 2Z2UA 4ALDA 4QJ1A 2DZWA 1ICSA 4QAIA 1S5TA 3NQ6A 5K2ZA 1OFBA 1L6WA 2QAPA 3KOFA 4MFDA 4PODA 2FFCA 5D2XA 1X7FA 2G5WA 3TUUA 4GBUA 4WUIA 2QUTA 4RCXA 3WJSA 1HL2A 3T7VA 1O60A 2UV8G 3LX9A 3UWZA 1LRQA 3GVGA 3OA3A 1FBAA 1L2UA 2AGKA 5AC8A 2YPIA 1M5WA 2OJPA 3HGOA 1DHPA 2DZTA 4UFHA 1OX4B 3TAOA 1DV7A 1VLWA 3IGUA 2YFNA 1K7FA 3L21A 2RDTA 2V2HA 1QPNA 1NFBA 2QCDB 1A5SA 1GEQA 3N2XA 4TX9A 1FDJA 2A2IA 2YW4A 4DO5A 1EUNA 3E9AA 3S1UA 4RZ4A 4PL1A 1OK6A 2CLLA 4B5NA 3G0SA 2W6RA 4WY0B 3DAQA 3C0JA 1BWLA 5LNVA 2GQ8A 3BW2A 2FLIA 2WJZA 2GQ9A 1Y0EA 3L5LA 4JTEA 3SGUA 4NXSA 1I2OA 2TPSA 1GVOA 4PL2A 3L9CA 3TAKA 1VCFA 5F2MA 4UFIA 3UZJA 3BLFA 3M43A 3NQVA 2CU0A 1NSJA 3W2KA 1W31A 3NVTA 5AB3A 4JIQA 3O6CA 1HG3A 3G24A 3EWYA 4WJEA 1FUYA 2Q8LA 5D33A 1EP3A 4Q4KA 1PL9A 3CB8A 2OMAA 4JN6A 2CLHA 5LNRA 3KRUA 4GUFA 3L68A 2DP3A 3LRKA 3IIXA 2QCGA 2Q3RA 1YDVA 1KFKA 4Z08A 3O07A 2E5DA 1EWEA 3SY5A 1HFBA 5FESA 4AWUA 1LRTA 3M7WA 1QFEA 3IEBA 3P61A 2CLFA 3VI2A 3PF3A 1G4EA 3QPYA 2CLKA 1DVJA 1IGSA 3R13A 1TTJA 5AYXA 1VHNA 3W2JA 1YXYA 4K36A 1CX9A 4YXGA 5FEWA 1P1XA 2CLIA 4O16A 4JXCA 4O28A 3B06A 5AOUA 3A21A 5I3IA 5EY5A 3B0UX 1S3HA 2A5HA 5K9DA 2PRLA 5I3KA 1I8JA 5A5WA 1SW0A 5K9XA 3NQGA 1B4KA 1FXPA 3TA6A 4RZ6A 3W1RA 5AHEA 3IGSA 3R12A 2WQPA 1XUUA 2OT0A 1KBJA 3GDRA 4S2CA 4NT0A 1DJQA 4YWIA 2Q8ZA 1OFOA 3BGJA 4LVAA 2QR6A 2NX3A 3G18A 1EEPA 4LS2A 2D73A 3DFQA 3ZWTA 1XC4A 3M47A 5DCBA 3MUXA 3E12A 2ISSA 4OT7A 2X1TA 3IVUA 3W1QA 4FO4A 1W3IA 1W5PA 4LC8A 4JICA 1KA9F 1VH7A 1VQTA 5DBUA 4U28A 2ZCGA 2QCCA 4BK9A 2DZUA 3SFKA 1N7KA 1TREA 3FJLA 3GDTA 4WXZA 3I7SA 4UTUA 3DENA 4XTIA 4DELA 3W2MA 5F2LA 2NX9A 3BO9A 2VEIA 1MEIA 1CW2A 3MP3A 5LNUA 3PVFA 4BI7A 3W83A 5G4WA 4IX2A 3PAJA 3BW3A 3LRLA 3OVQA 3P84A 4K8HA 3S1WA 1LLWA 3FEMA 2G95A 1JUBA 3B05A 4XWUA 2CLOA 3GKFA 3F4NA 4P2VA 3BG9A 2X1RA 3MO7A 2V82A 3PBVA 1SSGA 1KTBA 4UTIA 3PS7A 5EPDA 3LB0A 1HO1A 4AF0B 3Q37A 3NR0A 4UCGA 1TQXA 5K4XA 3NDOA 5CPLA 2C6QA 3G1SA 2BWGA 2YR1A 4MFEA 1QCWA 2GOUA 2V5LA 4JX4A 3EX2A 3W85A 4JTKA 1ICPA 3G1DA 5HWJA 3NAVA 5AHMA 3IVTA 2QCHA 7TIMA 3W1NA 4QNWA 1JCXA 4IPIA 3EWBX 3W7NA 4K7VA 3SR7A 3LDVA 3MP5A 1KFJA 4IUOA 4O12A 4AHPA 3HQ1A 5KTLA 5D2VA 4C1LA 2EF9A 3TFXA 3EXRA 3P5YA 5C55A 1HTIA 3E49A 4MY9A 1JR1A 1W5MA 3U6WA 3B0PA 3O1NA 3QMRA 3G8RA 2WPBA 3TSDA 1VHCA 1TRIA 4K38A 2Z1BA 5D03A 1P4CA 3W23A 3F4WA 5E1QA 3WJXA 2Y88A 3EX3A 3I7RA 2X1UA 3BARA 2QDHA 4A3UA 1LTDA 5EBUA 2VFEA 4M6QA 3FKRA 4OE7A 3NQFA 1UCWA 3HG3A 4O4WA 5G2IA 1EIXA 3MYOA 3G3MA 1G69A 2EAWA 4AHOA 4RXFA 1I4NA 5D2WA 3EXSA 3N73A 3LCIA 1KFEA 4BF9A 4BWLA 2C18A 4OWGA 3P60A 3S6DA 4O1AA 2HSAA 3VCRA 2E5BA 3TKFA 5J5RA 1J2WA 4ADTA 1W3TA 3ATYA 5FF0A 3S1VA 5ABTA 1PCWA 3EKLA 1J5TA 4G1KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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