1E4MM

Myrosinase from sinapis alba
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords MYROSINASE MA1
publication title High Resolution X-Ray Crystallography Shows that Ascorbate is a Cofactor for Myrosinase and Substitutes for the Function of the Catalytic Base
pubmed doi rcsb
total genus 198
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2000-07-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e4mM00
3I3DA 4TVDA 4OOZA 2QF8A 1W9BM 1M03A 1CBGA 3AMGA 3CUFA 5FCZA 5DO8A 1O6IA 4AMCA 3OGRA 4WK9A 1QI5A 1FHDA 2Y5EA 5A8MA 3AHTA 3ARTA 3AQUA 2ZX5A 2Z1SA 2G4FA 4V28A 2J75A 3VGDA 1QW9A 3DECA 1UKTA 4DWSD 2OLHA 5D4YA 4GQRA 2W63A 3FHQA 2ZXDA 3A4XA 2JALA 4LYPA 1DWJM 5A6KA 2J8FA 1CYGA 2DQXA 4JIEA 4OUEA 5DEZA 1VEOA 3WMBA 4CCDA 3G6MA 3WFLA 3ZT7A 9CGTA 2XHYA 2WPGA 4UCFA 1KGXA 2W62A 4AZCB 1SMAA 4RE3A 4QFUA 3MS8A 1K9FA 2VC9A 1V3MA 3CIVA 4LX4A 4JAWA 3RILA 5CG0A 1JI2A 3PZNA 4PRWA 5I0DA 4W8AA 3EDJA 3THDA 1VFMA 4H04A 3KL5A 1CGXA 2XVLA 3E1F1 1VENA 3FNDA 1XH2A 3FY1A 5CPTA 1GQLA 4NRRA 4AD5A 1BYAA 2CNCA 3VIGA 2DH3A 5BWFA 1ISZA 1HJXA 1XSIA 4HZ7A 2GJXB 2W61A 3CBWA 5FKYA 4QDMA 5EFDA 2VMFA 3OZOA 4CCCA 2OWXA 2CPUA 1E4LA 2PBGA 3PZ9A 3EDDA 4JCLA 1E5NA 4UFLA 2B31A 2X09A 3NDZA 3QHNA 3EYPA 2WVTA 4Q22A 3WD0A 1ZU8A 5LA0A 3AZTA 1BGAA 1ISVA 3VINA 5A8OA 3MUAA 3VIIA 1OGGA 2Z1KA 3BMVA 1XCXA 2WM0A 4CN1A 1BSIA 5CSUA 5JUVA 5A6SA 3W4RA 4B9ZA 1JG9A 3SUSA 5C71A 4PCTA 3AIVA 1H2JA 4W88A 2VI0A 2OYKA 1NOFA 2GUYA 2WC3A 5BXTA 2WMIB 1EIBA 3TTOA 1RPKA 2X8RA 1KXHA 2NT1A 4AYSA 3SCPA 2W66A 3ZOAA 5CGTA 4QAWA 4JFWA 4HPHA 4W93A 4DWSA 3LPOA 1G0CA 2WCGA 4HPGA 2WZIA 1KXVA 1JGIA 2GSJA 4Z2JA 1XD1A 1H41A 4LXFA 1V03A 2QMKA 2BY1A 2X05A 3K8MA 3WEOA 2F8QA 4UFHA 3MMWA 5A69A 1G1YA 4WKFA 1W3JA 3AIEA 2WHKA 3BH4A 1JDCA 1H09A 3M7SA 2OYLA 4A3YA 1V3IA 1UKSA 1GCYA 1C3FA 4H2CA 1FA2A 3GM8A 4OZOA 4L4OA 5AYIA 4R5EA 1JNDA 1E73M 1ZBWA 2F61A 2EO7A 3GNRA 3OLGA 3WQWA 2V3DA 1TR1A 2D0HA 2CBVA 3W24A 3WNKA 1K9TA 2G3IA 1KCLA 2DPEA 1I75A 4QLLA 4J27A 3AXXA 1BQCA 4PCSA 4D6DA 2O9RA 5F7UA 4KRUA 2GJRA 3NIYA 3TTSA 4D72A 4Q7NA 3G6LA 5E09A 3VGGA 1A3HA 2JE8A 3NSXA 3VKKA 2V3FA 1UQYA 2EJ1A 3BLKA 4F8XA 4QLJA 3WD2A 3AS1A 4AD4A 4RE4A 1V0MA 3W28A 3W26A 2EBNA 2A3BA 1GW1A 3AZSA 2VL4A 4EK7A 4KRTA 4YHEA 4AZBA 5AC5A 1V0NA 3OLIA 1ISWA 2EPMX 4PMZA 1EDGA 2VQTA 4J3XA 4TVUA 2ESCA 4DUVA 4CU6A 1XH0A 3GDBA 2VNCA 5D9NA 2WB5A 3WL1A 1PBGA 3CTTA 4H8HA 1UD8A 1PX3A 3L4YA 1VBUA 1Q6GA 1MVYA 3F4VA 2J25A 2DDXA 1LL4A 3KZSA 1JDDA 5I23A 3VMOA 4CN4A 4W8LA 1FP8A 2VR5A 1JZ8A 1GHSA 3L4ZA 1I1WA 4AZ5A 2JF6A 1XRVA 3IANA 5D8ZA 1E9LA 1QNSA 1AMYA 1VFFA 1C7TA 4ATWA 4HOZA 4MJ4A 7A3HA 5IHSA 1NH6A 4ZE5A 1UA3A 1WAWA 2X2YA 2D20A 4JKMA 2CERA 4BF7A 3HJEA 3VPLA 5CSYA 2WBKA 2CCRA 3WDRA 3CHFA 2O9TA 2FDMA 3EDFA 1KXTA 5FL0A 1B3YA 3WY1A 4JFSA 1B1YA 1YQ2A 2E3ZA 5HOSA 1J0HA 1KBBA 5DT5A 3S2CA 4HTYA 1WE5A 4Z2HA 1QW8A 1J01A 2D1ZA 4AZGA 1OCQA 4PMRA 3F5JA 4J3WA 4AZIA 3WQ6A 3PTQA 1UD5A 2WNWA 1W3KA 2XIIA 2XYLA 1CXFA 2F2HA 4NZCA 4UFKA 1D7FA 4W84A 3AHXA 3PZGA 2EPKX 3II1A 5C8BB 4XZBA 1WDRA 3L4TA 1UR1A 3TONA 3SURA 4D6CA 1ZBVA 1GOMA 1CGYA 4YHGA 3VTRA 3ZT6A 1NP2A 3OGSA 1OGSA 4AIEA 1OIMA 1E6NA 3BCDA 2D3NA 2RGLA 3RMEA 1GOKA 1UZ4A 5A8QA 5BXPA 1KWGA 3WUBA 1TA3A 1MXDA 2YL8A 5ABHA 2WC4A 1TFVA 4X0NA 1SR0A 5CZKA 3VGHA 3BAIA 1B31A 3CHDA 4D71A 4A3HA 1G9HA 1G01A 2YKKA 3FAXA 3WF3A 5D9PA 3N15A 2J74A 2XIBA 1TVPA 3L4UA 1E40A 4PTVA 1JDAA 1WZAA 1BLIA 3CPUA 1EHNA 2DSKA 2VRJA 3APGA 1XD0A 3AICA 3VILA 3U5UA 2O9OA 8A3HA 4UQEA 3A6OA 4JFUA 1FH8A 3GH5A 4HA4A 3CUGA 1M53A 2WMJA 5TD4A 4DUXA 4PMNA 4JZ5A 3ZJ8A 2YJQA 1E3XA 1W1YA 4LGXA 2D0GA 2PBOA 1S46A 3A47A 2W91A 3CUIA 3BSHA 3T0AA 3AMKA 1XH1A 3SCUA 3T09A 1R85A 5BRPA 3L2LA 4RL3A 4X0VA 4C7GA 3B9EA 2VVSA 2TAAA 3AIWA 1CWYA 4FF5A 1HT6A 3ARVA 3W82A 1CIUA 1BAGA 2UY2A 2XVKA 2G41A 1BVNP 4TX8A 3WUGA 2VTFA 1Q6DA 3D5HA 1TG7A 4CD6A 1BGGA 4MJ2A 1UKQA 2WVUA 2G3JA 1ZBKA 2J7EA 4M80A 1QVBA 2OWWA 3W6LA 2VRQA 1GOOA 1HVQA 3CZGA 5GNYA 4AW7A 4CVUA 1W32A 4DM2A 2FHFA 3AIRA 2DSZA 4ATDA 4QLKA 4M29A 4MDPA 1AQ0A 2XM1A 4E2OA 1UR9A 3CMJA 1GQIA 4S3KA 1W1PA 4TOQA 5JBFA 1XHGA 5I3DA 2CETA 3OLDA 2J79A 3CMGA 1EQPA 1DWGM 5KZ6A 3RIKA 3UETA 4FLQA 2UY3A 5D9OA 4WSJA 1LLOA 1NWRA 4D6FA 1RD6A 1ZBCA 3WD1A 3BGAA 3D3AA 4WF7A 2BHZA 4IISA 4CCEA 4ZE4A 2HVMA 3NSMA 1JXJA 3AXIA 2DIEA 4JHZA 1HKMA 1D2KA 2BNJA 2JFEX 2QPUA 4WSKA 5ABFB 3W38A 1KXQA 1TUXA 1B3ZA 1E6SM 4CKQA 3VO0A 4ZFMA 3DHUA 5KEZA 4OBSA 4D6EA 3AIUA 4MDOA 3MV11 2BHUA 3CHCA 3OLEA 1SMDA 1M01A 2VJXA 1CLXA 2WK2A 3VDAA 1UWTA 4H8VA 1OT1A 1J0JA 1WP6A 4WKHA 1L0PA 3K4DA 4P7LA 4PTXA 4AD0A 1TE1A 3NJ3A 4JKLA 1US3A 4W7VA 2PWGA 4MNJA 1HJWA 2ZX9A 3O9NA 3TA9A 4KGJA 1QI4A 2WAGA 4LYRA 2BS9A 5DMYA 1CGVA 1EHAA 2WKLA 1WNOA 1CXEA 1E5JA 3BLPX 3W81A 1FP9A 4P8VA 1UWRA 3N13A 3FN9A 1VIWA 4D6IA 4MPKA 5AYBA 1KQYA 2PC8A 2WCAA 1CTNA 4V27A 4F79A 4HOWA 1E4IA 3WNMA 1TZ7A 4HMCA 4UOQA 3WNPA 3OGVA 1AQMA 2JEPA 4BQ3A 3T0DA 3MUY1 3RDKA 1GNXA 1EDTA 1B0IA 3RPMA 3MANA 3IJ7A 2XFFA 2YBTA 3JUGA 3WENA 1VRXA 2IXUA 2XUCA 3U7VA 4AEFA 4CU8A 4AWEA 3HN3A 5CQ1A 3L4XA 1NWSA 2DT0A 2X0HA 4PMXA 1H11A 3ZJKA 3WEZA 3PBGA 1V6UA 3A4WA 4GO8A 3RO8A 4HOXA 4P7NA 3CLWA 1RP9A 1Q4NX 5E70A 3OG2A 1HP4A 3AS2A 1QBBA 1XGZA 1NOUA 1K6AA 1MQRA 1HKJA 5BCAA 3AYSA 5IFPA 5A6AA 2VX4A 2WLZA 4HMDA 3ZSSA 2VZSA 1E6XM 4AY1A 5FL1A 1OBAA 4L4PA 4W5UA 1V0LA 4IM4A 3UESA 1J0KA 1X6NA 3T0BA 1C7SA 2WC7A 4BS0A 5I79A 1C91A 4CGTA 5HDRA 4E8DA 1X6LA 4MB3A 3MU7A 3AS0A 1TCMA 1KBKA 1R86A 2E40A 4GO9A 2Y8VA 1F4AA 3POHA 5CLWA 4KWUA 2WYSA 1GOWA 1J0YA 1GPFA 3GXDA 1DP0A 4PMVA 2X0YA 1HL8A 2XTKA 6TAAA 3DC0A 2G3MA 4DWSC 1BVZA 4F66A 3VU2A 3ZMRA 2WWDA 2QPSA 3HMCA 2ZUUA 1FFQA 3PZIA 1GJWA 2ZUWA 4UQAA 4UR9A 4M24A 1HP5A 4HU8A 1LF1A 2WLYA 3VNYA 5A8NA 1VFOA 3QHOA 1UZ1A 3THCA 5HPOA 1GJUA 1V08A 5I24A 4CD8A 1JF5A 2BVYA 3NUKA 2CKSA 2AAAA 1OSEA 2ZWZA 1BFNA 2E9BA 2HISA 2YDQA 3BXWA 1H0IA 1F4HA 2YA0A 3AMCA 1OD0A 1V3LA 4GZEA 3WQ5A 4CD5A 1W9VA 3IAPA 4U33A 3KEHA 1C90A 3K1DA 3EMCA 3CZ8A 5EMYA 3WUEA 1UYQA 4BQ2A 2XWDA 2CEQA 2CBUA 1MW1A 1PZ3A 3W0KA 1UD3A 1WKYA 1E1FA 2NW0A 2YLAA 4F9DA 1B9ZA 1JZ3A 4GINA 4GXPA 5CJ5A 2ZX8A 3K8LA 1N82A 2BHYA 1W91A 4UOZA 5M3WA 1WZMA 2PI6A 1B3WA 3VUPA 5DFAA 1NP0A 3DYOA 1WO2A 2PWDA 4KH2A 4NRSA 1UH2A 2PWFA 1GORA 3SCRA 1ITXA 3QOMA 3MMDA 2ZX7A 4P8WA 1V6YA 3NCOA 3WFZA 3RJXA 4MNKA 3GYCA 4Y7EA 3VD5A 3WH6A 4KGLA 5GQBA 2Y2WA 2WMHA 3WH5A 1WB0A 1GQJA 2J7DA 2ZUVA 1ODZA 5A2CA 3AXHA 1H5VA 5IHRA 2W5FA 3VOCA 4BQ5A 1E70M 1GVYA 4YPJA 3VD3A 4GI9A 2FH8A 1TMQA 5FIPA 1CPUA 4DUWA 1PZ2A 4W87A 4JL2A 3RCNA 1E71M 5FOOA 3LPPA 3PZUA 1ZL1A 1JYVA 3U7BA 3RM4A 2J47A 1K9EA 3FXYA 1CLVA 4M82A 4B16A 4NSBA 3RJYA 5BYWA 2ZUSA 3WN6A 1UR0A 1JI1A 1NARA 1V02A 5CLTA 3WH9A 3PZOA 2CITA 2CKRA 4UZUA 5D8WA 3TP4A 1E43A 3OBAA 4LPCA 1LJYA 1DWAM 4JL1A 4D6GA 2GK1A 4X9YA 1EA9C 4MB4A 1J0ZA 3NDYA 2FH6A 1DTUA 1Y7VA 2PB1A 2WZEA 4JHOA 4F9JA 2O9PA 2DEPA 5LA2A 1QHZA 2ZIDA 2BVDA 4MAZA 1EXPA 1RP8A 1BYDA 4GKLA 4UFJA 1GONA 3AJ7A 3VMNA 1BYBA 1O7AA 3K8KA 4UQCA 2YL9A 3NYDA 3CHEA 2J77A 2JIEA 5I2UA 3MV01 5LA1A 4YN5A 3ZQ9A 3KE0A 4XB3A 1XV8A 1XYFA 1MW0A 2XFRA 1CZ1A 5DT7A 4NI3A 4ACZA 1H1NA 2VT0A 2WSPA 2ZUTA 1W1TA 4HA1A 3M46A 3WF4A 5JBDA 4W89A 4J3SA 1WPCA 4U5KA 3L4WA 1DHKA 1MFVA 1M04A 2J7CA 3CZEA 3VIKA 3B9DA 3WDIA 1ODUA 4C7DA 2A3EA 4CN6A 1R87A 5A6MA 1EOKA 1US2A 2J8GA 4U31A 4M8UA 2IUZA 2VUYA 3W37A 1U33A 4IPNB 3BAYA 5E6YA 5M17A 3N1AA 1UR4A 1NWTA 2EQDA 5BRQA 1UQZA 1NQ6A 1KR1A 1W2VA 2DSUA 3GNPA 1H49A 5AY7A 3GXIA 1E6ZA 3ZR5A 3WEMA 4PMYA 4QCFA 1V6XA 1VF8A 2CBIA 3WF1A 3WKZA 1PPIA 2XG9A 8CGTA 3RM8A 4AC1X 3SCQA 4N42A 1E4NA 1WDPA 3ARPA 1B3XA 1EH9A 4MB1A 3ECQA 4BCEA 3AOFA 2XVNA 2D3LA 2YA2A 3N11A 3PHAA 3ARQA 1Q6CA 3SUVA 1IV8A 1UKOA 1BG4A 2ZWYA 4TUFA 1J9YA 4BA0A 5A6JA 1EQCA 3VDHA 1EGZA 2D23A 1MWOA 4BZYA 2DT3A 2NSXA 1UH4A 4B15A 2WVVA 3WMSA 2QMJA 4TTGA 1H4PA 4UZSA 3SEPA 1TA3B 1UWIA 1XCWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3I3D A;  4TVD A;  4OOZ A;  2QF8 A;  1W9B M;  1M03 A;  1CBG A;  3AMG A;  3CUF A;  5FCZ A;  5DO8 A;  1O6I A;  4AMC A;  3OGR A;  4WK9 A;  1QI5 A;  1FHD A;  2Y5E A;  5A8M A;  3AHT A;  3ART A;  3AQU A;  2ZX5 A;  2Z1S A;  2G4F A;  4V28 A;  2J75 A;  3VGD A;  1QW9 A;  3DEC A;  1UKT A;  4DWS D;  2OLH A;  5D4Y A;  4GQR A;  2W63 A;  3FHQ A;  2ZXD A;  3A4X A;  2JAL A;  4LYP A;  1DWJ M;  5A6K A;  2J8F A;  1CYG A;  2DQX A;  4JIE A;  4OUE A;  5DEZ A;  1VEO A;  3WMB A;  4CCD A;  3G6M A;  3WFL A;  3ZT7 A;  9CGT A;  2XHY A;  2WPG A;  4UCF A;  1KGX A;  2W62 A;  4AZC B;  1SMA A;  4RE3 A;  4QFU A;  3MS8 A;  1K9F A;  2VC9 A;  1V3M A;  3CIV A;  4LX4 A;  4JAW A;  3RIL A;  5CG0 A;  1JI2 A;  3PZN A;  4PRW A;  5I0D A;  4W8A A;  3EDJ A;  3THD A;  1VFM A;  4H04 A;  3KL5 A;  1CGX A;  2XVL A;  3E1F 1;  1VEN A;  3FND A;  1XH2 A;  3FY1 A;  5CPT A;  1GQL A;  4NRR A;  4AD5 A;  1BYA A;  2CNC A;  3VIG A;  2DH3 A;  5BWF A;  1ISZ A;  1HJX A;  1XSI A;  4HZ7 A;  2GJX B;  2W61 A;  3CBW A;  5FKY A;  4QDM A;  5EFD A;  2VMF A;  3OZO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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