1PIIA

Three-dimensional structure of the bifunctional enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase: indoleglycerolphosphate synthase from escherichia coli refined at 2.0 angstroms resolution
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
452
structure length
452
Chain Sequence
MQTVLAKIVADKAIWVEARKQQQPLASFQNEVQPSTRHFYDALQGARTAFILECKKASPSKGVIRDDFDPARIAAIYKHYASAISVLTDEKYFQGSFNFLPIVSQIAPQPILCKDFIIDPYQIYLARYYQADACLLMLSVLDDDQYRQLAAVAHSLEMGVLTEVSNEEEQERAIALGAKVVGINNRDLRDLSIDLNRTRELAPKLGHNVTVISESGINTYAQVRELSHFANGFLIGSALMAHDDLHAAVRRVLLGENKVCGLTRGQDAKAAYDAGAIYGGLIFVATSPRCVNVEQAQEVMAAAPLQYVGVFRNHDIADVVDKAKVLSLAAVQLHGNEEQLYIDTLREALPAHVAIWKALSVGETLPAREFQHVDKYVLDNGQGGSGQRFDWSLLNGQSLGNVLLAGGLGADNCVEAAQTGCAGLDFNSAVESQPGIKDARLLASVFQTLRAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Bifunctional(isomerase and synthase)
molecule keywords N-(5'PHOSPHORIBOSYL)ANTHRANILATE ISOMERASE
publication title Three-dimensional structure of the bifunctional enzyme phosphoribosylanthranilate isomerase: indoleglycerolphosphate synthase from Escherichia coli refined at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 166
structure length 452
sequence length 452
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 1991-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00218 IGPS Indole-3-glycerol phosphate synthase
A PF00697 PRAI N-(5'phosphoribosyl)anthranilate (PRA) isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1piiA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1piiA02
3QPZA 2C1HA 3DFOA 1GG0A 3SJ3A 3S5OA 3NQ8A 2V2CA 2V9DA 2XFWA 4K8HA 5I3JA 3F03K 1QWGA 3M41A 3I65A 1IXNA 3RK8A 2Q3RA 3RLVA 2CLFA 3TDFA 1AW5A 4LVDA 2IQTA 2VFGA 2CZ5A 1NVMA 3LCLA 4OT7A 2OX1A 2GVGA 4DELA 1KFBA 2ZTJA 3HPZA 3W6YA 3TJLA 3INPA 5HINA 3IIZA 3LBCA 1QCWA 5F2MA 1DVJA 1FCVA 3UWUA 4GRSA 1NSJA 3TNOA 4NJHA 4JIPA 4QJ1A 3IRDA 3NXFA 1TJRA 2X2GA 5D2TA 2X16A 3EWXA 2JKEA 1HUVA 2ISVA 4MY8A 2VFDA 3QMTA 3B0PA 1TTPA 1O4UA 3BLFA 4PH6A 3TSMA 3G1HA 1Q6RA 1OFDA 3A22A 1F74A 1PV8A 1L6YA 2Z6IA 5LNVA 1Q45A 2H3BA 3TK7A 2CZEA 1G4PA 3IGSA 1YDVA 1LTDA 3Q37A 1OX5A 4LT9A 4IUOA 1R2TA 4O4VA 5F1UA 2A1YA 2VFFA 3BPWA 5EY5A 3NO5A 3CU2A 2YXGA 3P74A 4R7JA 1SW7A 4WUIA 5E93A 1TPUA 4UNKA 1TSIA 3VNDA 1QR7A 1LRNA 3A9IA 3GXPA 3SECA 3NZRA 2V82A 5DLCA 3HMJG 4X3ZA 1H7NA 2V8ZA 2VFHA 1KV8A 3LOTA 4ADTA 4BR1A 4O53A 4AF0B 1YLVA 3TA6A 2VFEA 4YMZA 5G5IA 1KBIA 4PA8A 1TPDA 4LV4A 1H7XA 2ZRWA 3GKFA 3O6CA 3C8FA 1N55A 2F84A 4UTWA 1WV2A 3W2LA 2QCHA 4BF9A 3CEUA 4DQWA 5BW6A 4JYEA 1FQ0A 1SZGA 3SW6A 1LOQA 1OFOA 2HSAA 2TYSA 3GAKA 5DCDA 4RCXA 1TV8A 3W2KA 1SU5A 3G8EA 4GXMA 3MP4A 2CWNA 1NF7A 3G18A 3QC3A 2HS8A 4FIQA 1OX6A 2XN2A 1G69A 3P5YA 5D2XA 3TMLA 1I4NA 4NT0A 3RLUA 3W7IA 5HWMA 2Y63A 1TB3A 1OYAA 4Z1AA 2NWRA 1PHWA 2FB3A 4HKPA 3CIXA 1LDCA 1TQJA 3MBFA 3GNNA 1ME7A 3LRMA 2HTMA 4ZQCA 2DZVA 4DPPA 3A24A 4M7SA 5IM51 3EXTA 2VEMA 3N3MA 4LOCA 3LXAA 5LGXA 1ME8A 3UWWA 3OBKA 4CNOA 1YTKA 4I7WA 4MJMA 1IXPA 3DH7A 3HF3A 4RJEA 1W31A 4JTLA 3W71A 1G4TA 2YCEA 4PCFA 1FY6A 3IGXA 3PBUA 2VFIA 3L0NA 4JX6A 1XM3A 1KFLA 1I2OA 3WJSA 3LI1A 1OG0A 1M5WA 4GUFA 4YLWA 4OV9A 2YYUA 5KSWA 2C18A 2ZDRA 3B05A 3L66A 4GFSA 1VCVA 1JRBA 4ALDA 1KBJA 5AC7A 1TTQA 1LM1A 4UCGA 1DJQA 4XTIA 5F4SA 1OFQA 5K4ZA 4MVAA 3O6YX 3PVFA 3FLUA 4O12A 1P1XA 2I1OA 1Z44A 3LGEA 2ZRZA 1RQHA 2VKZG 3PF3A 5FF0A 4UTUA 4NX0A 2CZFA 3F4NA 3DAQA 4P61A 5HWNA 4H4IA 3NQVA 3GXTA 5F4WA 3IIVA 4Q32A 4UFMA 3CWNA 5HUPA 3G0XA 4GUHA 1TMHA 3HPSA 5E1QA 3G22A 3W2JA 3BG9A 2OCZA 1SW3A 4JTGA 4WXYA 3TFCA 3FJLA 3W70A 4OV4A 1B9BA 3SI9A 3NEVA 3EXRA 4Z1DA 4C1LA 2J88A 4DO4A 3UD6A 4MOZA 1DQWA 1OHLA 4FX8A 5BNKA 2YFOA 4Z0JA 3H53A 1J4EA 4Q4KA 2QCCA 5FEXA 4WXZA 2YW4A 3WK2A 5I3GA 1GG1A 2QCNA 1RVGA 3W7NA 2FJKA 1YPIA 1FXQA 2QDHA 4ORIA 3PBYA 1LLWA 4BK9A 2OZ0A 1IIGA 3KVKA 1F5ZA 4PFMA 3N2MA 3W23A 2JKAA 1WOBA 3GX9A 5D32A 4ADSA 1KM1A 3GAYA 1UCWA 3WK0A 3PULA 1MEIA 5K9XA 3STEA 3H55A 1YXCA 6ALDA 3UQNA 3LTYA 3VE9A 1H51A 3FFSA 4B5NA 3C2EA 4IQLA 1RR2A 2V0TA 2QAFA 3G24A 4IMCA 2CLIA 2ABAA 2C16A 2V5BA 2VEPA 4O17A 3UZJA 3UXAA 1EB3A 2ZZ3A 2V30A 3PR2A 4Y90A 3S5YA 5FF4A 3B0VC 1SO3A 4N9CA 4MFEA 1MEWA 5DXYA 1SO6A 3W83A 4LRTA 3UWQA 5C6MA 3W1MA 3S9YA 4FEZA 3CT7A 2ZYFA 2TSYA 4MLRA 2FLIA 3IGUA 5MHBA 3DI1A 4EIVA 3B4UA 1HO4A 4O28A 4Q33A 4O0KA 4ZQOA 4XKYB 3BG3A 2ZFAA 4AVFA 4ICNA 3LHVA 3TW7A 1DQXA 2NV2A 7TIMA 3S1WA 1KM3A 1EUAA 1Z48A 3OVQA 3DFSA 1JQXA 2VXNA 1CW2A 3LCFA 5CSSA 3BARA 1KFCA 1H50A 3YPIA 4TR9A 1EUNA 5DBTA 1W1ZA 2ZBTA 1DBTA 3GZ3A 4NQ1A 1MXSA 2WNNA 2ZRYA 1I2NA 3GYEA 1GVRA 1H63A 3I7QA 5G2IA 4LVFA 2ZRXA 3HGJA 1CX9A 1V7YA 5A8GA 1FBAA 4NVTA 2C0AA 1XKYA 5CPOA 4IWWA 2P0OA 3QW4B 3T4CA 3BO9A 3HPXA 4S2CA 2BSLA 2B4GA 4LRSA 1BKSA 1RZMA 3W2MA 2I14A 1XUZA 4JS3A 3LCWA 4YCPA 2GVJA 2BTMA 5DELA 2DZUA 5FESA 1VCGA 3TUUA 4O50A 1ZENA 4NXSA 5T26A 4N9DA 1TQXA 4O16A 3GDRA 4JNMA 4KKXA 1JVNA 3KX6A 4HNTA 5CSRA 5HULA 1S5TA 1XUUA 4PEKA 4L4LA 4HNNA 1S5WA 3KXQA 2Y85A 4JICA 3W7JA 4M19A 4JYFA 3TSDA 4EF9A 5K7JA 2B7NA 1W5PA 5TIMA 1QOQA 2EHHA 3DU0A 4DXVA 4QM1A 2NUYA 2BXVA 3PB0A 5LKYA 4MYAA 1JUEA 1BEUA 5D09A 1UB3A 1W5QA 4O1CA 5TBOA 2A6NA 4HSNA 3TQVA 4N02A 1N8FA 4HIBA 4S2BA 3NQDA 4XKYA 4ML9A 3MBDA 3R8RA 4M7TA 4IXXA 1C9DA 4HN4A 4CNNA 3W7LA 3W7GA 1K7XA 4A3UA 1WX0A 3LRLA 3PBWA 4IJBA 4HHPA 4NU7A 4O57A 5CPMA 1AL8A 3G1VA 2NUXA 1SUXA 4GUGA 4IPJA 4LUJA 5I3IA 3F1QA 4EOUA 3BW2A 3R12A 3TROA 2ZQ0A 2QF7A 5D33A 3FIGA 5C55A 3R13A 4OQVA 5TQLA 1FDJA 1TPC1 1PCWA 4KWVA 3A5VA 1QPOA 1EWDA 4DBEA 4NJGA 3KFTA 1RD5A 5FEZA 2ZA3A 2DZPA 4O11A 4WD0A 1QFEA 3UYCA 4JTHA 5EPDA 4Z0SA 3W1UA 3T55A 1JCJA 3OVPA 5LSMA 2Z1BA 3TCEA 2DZTA 2RH9A 1WQ5A 3PS7A 3DENA 2WSYA 4X22A 2NX3A 1GWJA 4LS0A 1KTNA 3NPUA 5CKSA 3P82A 1PL9A 1TRDA 3QSTA 4FNTA 3SZ8A 4UTMA 3CPRA 4LNYA 1XBYA 4LWWA 3NQEA 3O07A 3NAVA 2G95A 4FXSA 1I45A 1VPXA 2I9EA 4IOTA 4K8EA 3WJXA 5J5RA 2CLLA 1S3HA 2YGYA 1OF6A 1JCMP 1PCKA 1XL9A 3W7MA 1O60A 1VCFA 1MZHA 2YPIA 3GDTA 2Z2UA 1UASA 3EWUA 5F2GA 3UXDA 1F6KA 1F7BA 1D3HA 4GC4A 3L65A 2C19A 4TO8A 5LNSA 2FPTA 3NQGA 4UTTC 4LS1A 5AHEA 2H8XA 2A7PA 5G4WA 1LROA 4I7VA 4UTJA 3HG4A 3MP3A 3E9AA 4LU0A 4NNAA 3T7VA 1ZAJA 3DHDA 1MEHA 1A5AA 1W37A 3EKZA 3MI2A 5HMSA 5AFDA 1SFJA 2A21A 3EEGA 3P84A 3GVGA 1FWSA 4DF1A 2BZNA 5CZ0A 3DBPA 3W1PA 4Y8FA 1ZAIA 3I6RA 2VC6A 2DJXA 5CPNA 3CM4A 1GYLA 2ALDA 3EX2A 2YFNA 1XBVA 4QITA 3WFAA 3S1UA 3B03A 1TJPA 4AWTA 5AOUA 3CC1A 1Q3NA 1ZALA 4RZ6A 1KW1A 1UUOA 3MO7A 3GIYA 1LRQA 3W1AA 1X7FA 2X1UA 3GDMA 5KINA 3C52A 1YPFA 3N14A 3N19B 1EA0A 1H60A 2A0NA 2GQAA 2QCMA 1TIMA 2BLEA 3BVJA 2CLKA 3ATYA 4R33A 1M7PA 4M6PA 1D9EA 3W1QA 3NOEA 4O52A 1W5MA 4UTWC 4KFOA 3UWYA 1I2QA 3PSVA 4FXRA 3L0GA 3ABSA 5ABTA 1LYXA 5LNRA 4PC8A 4S1FA 1OX4B 4MYXA 5D03A 1VQTA 1P0NA 4K6AA 5CZJA 1L2UA 1IIHA 2BX7A 3W3OA 2E5CA 4DEFA 3HIJA 1TPH1 2B7PA 3C2FA 1TPFA 3MI3A 3TIMA 2EF9A 5CG7A 3FA5A 4CNPA 1A5BA 2WSRA 4MLJA 1GOXA 3P81A 3KRSA 3GR7A 5DY2A 3LRKA 4RV8A 2PRLA 4LVBA 4HPJA 5LHFA 3M0ZA 4LS2A 2WNZA 3W7CA 3T40A 3HGSA 3W1TA 4UMAA 5H91A 1Z42A 3LHWA 3NVTA 3TXZA 3WK3A 2J9ZA 3PUOA 1SSDA 3I7SA 1G6CA 2NV1A 3L67A 3QPYA 4XZ9A 1XDMA 3C4UA 3EX4A 4TX9A 1H7PA 5G2HA 1QAPA 5I3KA 3DHFA 5D37A 2E09A 5FF3A 3DZ1A 3NA8A 4UUIA 3LCHA 3QW3A 4XBKA 1O5XA 1JJKA 2QUUA 4O13A 3NQ6A 2A7RA 3UZ5A 4ZVJA 4YWIA 4KFNA 2DJLA 2B7QA 4JGDA 3MMTA 1QOPA 1ZFJA 3LDVA 4R53A 4NNCA 3U2OA 1SO4A 1W56A 3IVUA 4HNVA 2VELA 5DXXA 2E5BA 2QJGA 2ZZ2A 2GJLA 3KVLA 4FNSA 3C2OA 2E6AA 3ZFHA 5IBXC 3GXNA 4GJ1A 3AJXA 1H7RA 3G1AA 1GEQA 3N9RA 2EKCA 1IGSA 1EPXA 1RQBA 5AYZA 3C3NA 2V81A 4NJJA 4MZYA 5HR6A 1G4EA 2R14A 2V2DA 1OJXA 1IF2A 3CHVA 3G1XA 2GPTA 4LTSA 1OX4A 4POCA 4AH7A 2QUVA 4JYDA 2Z0IA 4JDYA 1B4EA 1IXQA 5KTLA 1F73A 5HQEA 1CI1A 4FHAA 5BRBA 1TCDA 3FYOA 1OYBA 3S5NA 4CCEA 4DF0A 3W72A 4BI6A 3EX6A 3W2UA 3TXVA 3GNDA 5AHLA 1WYIA 2QCDA 3DXIA 4UMCA 2Y7FA 1F05A 2ZZ7A 3BG5A 4O1AA 1TPB1 3W9ZA 3DFTA 3BW3A 4QSHA 3S6DA 4RK8A 3NQFA 2YX0A 2WV8A 3EKLA 2WOQA 2P1FA 2H8ZA 3LXCA 4JTJA 1TRIA 1QMLA 1ICQA 2A6LA 1A5SA 4MPQA 3KVMA 1EP1A 1M6JA 3C6CA 4I9AA 3FKKA 4AMAA 4FX7A 4OGZA 1D3GA 4IPIA 3HGRA 3L68A 2W0UA 3ELFA 3W7DA 2CLMA 3M6YA 4UTIA 2QKFA 1HO1A 3V75A 3M1ZA 1OFAA 1HG3A 3DFQA 4IX2A 4M5PA 3LBMA 1GVOA 3QH2A 1VC4A 3HOJA 2J6XA 1TREA 2ZZ5A 3Q58A 3W1XA 5AYYA 2FPVA 5HUOA 2WO5A 3N9SA 8TIMA 2PURA 3QSRA 2WQPA 5CZSA 2QCLA 1OF8A 5K2ZA 3RF9A 3E0IA 1QO5A 3IEBA 4IGHA 1OFBA 4OU1A 1XI3A 3EWZA 2Y70A 4XTDA 3L9CA 5AN7A 3THAA 2GVLA 2V2HA 1GPWA 1P5BA 2FPYA 1WBHA 4OWGA 5AHIA 1ZHAA 1DKWA 1DHPA 3WK1A 5LNWA 5FI8A 2X1TA 1OVDA 3P5ZA 3RMJA 4IMEA 4BI7A 4N9BA 4K38A 2E77A 3MHUA 2TRSA 4WOQA 4BWLC 3EX3A 1QNVA 4OHQA 3PUDA 1BTMA 1ZY9A 1JCLA 4BFAA 3FKRA 3G3DA 1LBLA 4LY8A 1JULA 1Q6LA 5HNRA 2NXHA 3TSBA 1V5XA 4K7YA 5K3VA 3S42A 4WX2A 4TU1A 1K8YA 3W7EA 4JTTA 4TIMA 2FDSA 5CZTA 2GUUA 4AWSA 1WOAA 3R5EA 5DBUA 4NZJA 4O10A 1EIXA 1C8VA 2J27A 1VHCA 4CQAA 1VYPX 5K9DA 3U8GA 1EWEA 4AEOA 3STGA 2G97A 5G1YA 3W7RA 3QF0A 3FJ6A 3ABOA 2Y88A 4IMDA 3W7QA 1XBXA 4K37A 3M5YA 1OFEA 4AWUA 3TR2A 4O4WA 1I8JA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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