2WNQA

Structure of the e192n mutant of e. coli n-acetylneuraminic acid lyase in space group p21
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
299
structure length
299
Chain Sequence
HHHATNLRGVMAALLTPFDQQQALDKASLRRLVQFNIQQGIDGLYVGGSTGEAFVQSLSEREQVLEIVAEEAKGKIKLIAHVGCVSTAESQQLAASAKRYGFDAVSAVTPFYYPFSFEEHCDHYRAIIDSADGLPMVVYNIPALSGVKLTLDQINTLVTLPGVGALKQTSGDLYQMEQIRREHPDLVLYNGYDNIFASGLLAGADGGIGSTYNIMGWRYQGIVKALKEGDIQTAQKLQTECNKVIDLLIKTGVFRGLKTVLHYMDVVSVPLCRKPFGPVDEKYLPELKALAQQLMQERG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
publication title Structural Insights Into Substrate Specificity in Variants of N-Acetylneuraminic Acid Lyase Produced by Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 113
structure length 299
sequence length 299
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2009-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2wnqA00
3M5XA 2NZLA 3UY8A 3EWUA 4PEKA 3JS3A 4UFJA 2V8ZA 5FF2A 3M5ZA 3W1MA 3L5AA 4IOTA 4JYDA 4ADSA 3B04A 1DJNA 3RFAA 4DPQA 3QMSA 3CWOX 1A53A 2NV1A 2C19A 2BTMA 4H4IA 4N02A 2BWGA 3HO8A 3BVJA 3CIXA 4UFIA 1JCJA 2NX1A 1SW0A 4WX2A 1X8FA 2DZSA 1H60A 5HWMA 1H5YA 3T4CA 3OVQA 2Q8ZA 4PFMA 4TO8A 2P10A 4E2BA 1V5XA 3TJLA 1D3GA 1VYRA 1Z48A 2PRLA 3C2RA 2JGYA 3QZEA 4IGHA 5AYZA 4O10A 1KLYA 3WK1A 1RVGA 3BARA 4UFMA 5D2WA 4U4MA 1G4TA 1SR9A 2XFWA 4K7YA 2CLOA 3NL3A 4OHQA 5D37A 3TUUA 1OYAA 3IVSA 4RZ5A 4JICA 1IIGA 1JRBA 1THFD 2J6XA 2VXNA 4ZQNA 5D04C 2ZDRA 3DFQA 4HSOA 2NLIA 2NUYA 4U28A 4RK8A 5FEXA 2JBMA 2O7QA 4CCCA 1AW5A 4UTHA 1C9DA 4UR8A 1R46A 4WD0A 3WJSA 1H51A 3DAQA 4XKYA 4LVFA 1VCVA 4FHAA 3C2FA 4RZ6A 4A2RA 4N2YA 1O60A 2ZZ1A 1GZGA 3C6CA 2W0UA 3O6CA 4CNPA 5FEPA 4JNMA 3PULA 4AHPA 2QCEA 2WOQA 1DOSA 4KWWA 1R47A 1SSGA 1VPXA 5D03A 3HIJA 3PWAA 3E96A 1LZOA 2B7PA 2X2GA 2VEPA 4XBKA 5DBTA 2V82A 3CEPA 3W1UA 4M7SA 4ADUA 2QAPA 1QPOA 5CG7A 2WPBA 1W5QA 3DFPA 3VFLA 1C8VA 1H7RA 2WNQA 1LYXA 3DGRA 3W7LA 1M7PA 3WJYA 1WBJA 3HPXA 2Z6IA 1JUKA 3V75A 1B57A 3TR2A 3PUOA 3TC6A 2B7QA 1RD5A 5AOUA 2QUUA 3P62A 1O94A 4YCOA 3M1ZA 3UPBA 2HSAA 5IM51 4ZQOA 2YFNA 1LOSA 1H63A 2WV8A 3STCA 4IQLA 1TPFA 1H1ZA 2ATSA 4UTLA 3A5VA 3CM4A 1EWDA 2QCFA 2R14A 2VFFA 4X2RA 2Z0IA 4PCFA 5CZSA 4O57A 5F2LA 3KVKA 1ME7A 1VS1A 3VI2A 3B0VC 4UTWC 3G24A 4UXDA 4N9BA 1G6CA 4ZVJA 2H3BA 4LV9A 4TIMA 3QC3A 3NPXA 4O12A 1W1ZA 3CT7A 1F73A 3M0ZA 4QJ1A 1BTMA 1H62A 4N9CA 2WSQA 5C54A 1P5BA 3B06A 4HSNA 4O52A 3R13A 1X6UA 3ZR4A 4PL1A 3NG3A 1F5ZA 3GDMA 2WNZA 3NO5A 4N6FA 1KM4A 2ISWA 3EWBX 4N6EA 3B4UA 3HGSA 1PV8A 5LGZA 5AYXA 2A7NA 1JR1A 1LTDA 4IPIA 1QO5A 3EKLA 3NQVA 1TSIA 3AO0A 1W3TA 4O4VA 1KTNA 7TIMA 1FWNA 1S5VA 3SIZA 4AAJA 4RJEA 1KM1A 4LVGA 1VYSX 4O1CA 4NUWA 1Z41A 4GUHA 1X1ZA 3STEA 2ZZ3A 4WXYA 3MYOA 2C15A 1EUNA 1JVNA 3ZWTA 5U7SA 3W72A 3TNOA 4BK9A 4HIBA 2PRMA 3DHDA 5TBOA 1DL3A 1RV8A 1YTKA 5H2ZA 3GNNA 3ZWSA 1OJXA 3DU0A 1W3IA 3IIVA 3BW3A 4AMAA 3S1XA 4GE8A 5KZMA 1FDJA 4XKYB 1GVQA 5F1UA 3TMQA 2Y85A 4ORMA 1N8FA 2Q3RA 1C29A 2X16A 2V5LA 1VR6A 2DJLA 1P0KA 2QJGA 2DZXA 3LCWA 3N14A 3UZ5A 1ZALA 4DPPA 1GWJA 1SZEA 3W23A 4R53A 2H6RA 1UJPA 3EXRA 3RK8A 1MZHA 2CLKA 2Z1BA 4WY0F 2ZBTA 3SGZA 2JKPA 4OT7A 4AVFA 5D33A 1GVFA 3E9AA 2VEIA 3NEVA 4TU1A 8TIMA 1ZFJA 4WJEA 3G1FA 3W84A 1NF0A 3LTSA 1B9BA 3IGXA 2GJLA 1OHLA 1TTJA 4FX6M 1LCOA 5AC7A 1OK6A 3NQMA 3LCHA 3R8RA 3Q94A 5EY5A 1AG1O 3MP3A 2GPTA 3EWXA 2CWNA 5L9FA 1F76A 2YFOA 5AN7A 4JY8A 1OFQA 4P2VA 3W7KA 3NQCA 4AB4A 4L4MA 4GC4A 3NM3A 2QCHA 3TH6A 1XBZA 1OF6A 3W1XA 5LHFA 3U6WA 3UXDA 2YCEA 4XQ6A 1QDSA 2WO5A 3ABRA 5D02A 3WJZA 3DFOA 2BSLA 4RR4A 3B0PA 2VFDA 5LHEA 1RQBA 3E02A 4NZJA 1QPQA 4PA8A 1FUYA 4GWEA 3T55A 2JK2A 3PSVA 3SI9A 4NXSA 3DXIA 1AL8A 2VELA 1HO4A 3PG8A 4CNNA 4M6VA 1JCYA 3MYPA 3W1NA 4K8EA 3OIXA 2QDHA 5LNWA 1QMLA 4AF0A 3L65A 2OJPA 4GRSA 1Y0EA 3S5ZA 3I65A 4FNRA 3LDVA 3P84A 3GB6A 2YSWA 3P80A 2YYTA 5DXYA 3R89A 4WXZA 1EB3A 1LRTA 2Y7DA 1HTIA 3EWWA 3GDKA 1WV2A 3HG2A 4UCGA 4FF7A 1KM5A 5L6UA 5EL1A 2DP3A 3W3OA 4Y90A 1M5WA 3M41A 4LC6A 5EPDA 2NX9A 4UTWA 3INPA 3TE9A 3NNTA 3IRDA 4HNTA 1TIMA 3L0GA 5LNRA 2E5CA 3TIMA 1EP2A 4EF9A 2J27A 1AMKA 5DCDA 3QM3A 1OF8A 4UTMA 1I8JA 2A0NA 2AAMA 3LHZA 3TKFA 4IWWA 1T8XA 3C3NA 3P8IA 1EEPA 2DZVA 2E5BA 1O5XA 4S2CA 4IX0A 4RZ4A 2ZTJA 2I1OA 4N4PA 4AHQA 4I7VA 1TQXA 1JRCA 1YYAA 3GZ3A 2LLEA 2A6LA 5A8GA 1OVDA 2NV2A 4OV4A 4FIRA 4LUIA 5G2IA 2I14A 5HINA 4Q33A 3ABQA 3ATYA 1NSJA 3W2MA 4K8HA 1UBSA 4AH7A 1GT8A 3DFSA 1F74A 5IBXC 3W71A 4O8RA 1F05A 1W56A 1U83A 3EX4A 5E0KA 1KM3A 4QM1A 4MZYA 5HUPA 4NQ1A 5HULA 3VNDA 4IMEA 3OHIA 1I2NA 4YCPA 2RDUA 2I9EA 4UTTC 3R5EA 4MYAA 4DBDA 3MBFA 3QSTA 2FIQA 2ZZ2A 3LCXA 5C2XA 1TRDA 3FEMA 1Z44A 3LHVA 3IGSA 4JIPA 4PTNA 5SWUA 3M9YA 4WY0A 4O1DA 3P74A 4GJ1A 3HQ1A 2E6AA 1ICSA 1K3UA 3JRKA 1B3OA 1M7OA 4JTTA 3VKJA 3TSMA 5HWNA 5G4WA 4O13A 4AXKA 2OT0A 1SO5A 4BFAA 3BW4A 3FKKA 3ABOA 4NNBA 1DBTA 1D9EA 4K38A 4KFOA 3TFCA 3E12A 2ZA3A 1LOQA 1ME9A 1W37A 1VC4A 4GUIA 4NT0A 5HJLA 1UUMA 5AHFA 1ALDA 1FDZA 3FOKA 3G0XA 3S1VA 4EF8A 3M7WA 4Y8FA 1SUXA 3GLCA 1U5JA 5FF4A 4X22A 3NPWA 1ZCOA 1AK5A 2A7RA 4A29A 1PCKA 3LRMA 1YTEA 1IF2A 3W1RA 1XCFA 4O16A 3MP5A 4IMDA 3MI6A 3UWQA 3G8RA 2IQTA 3A9IA 2QKFA 1SO4A 3W7DA 3FJLA 1SO3A 4JTKA 3B8DA 4HPXA 1IGSA 4AF0B 2NWRA 5KTLA 4ICNA 4YL2A 4Q4KA 3LTYA 4MY8A 2QJHA 2VFEA 3PBYA 2CZFA 3TXZA 1TPB1 1ZNNA 3GVGA 2Y7EA 5BNKA 2H90A 4LT9A 4WOZA 5K7JA 2DZUA 3BV4A 2XN1A 5CSSA 5A5WA 2DZPA 4MFDA 2AGKA 1GJPA 1LORA 3I6RA 1TV5A 4YXGA 4NNCA 3PG9A 2FQIA 2QF7A 3CHVA 3QMRA 4HNUA 3O6YX 4O28A 1FWWA 1XI3A 4JTFA 1DVJA 5K4ZA 4O14A 4R34A 3UZJA 3I7QA 3KVMA 1TYGA 2CLMA 1ZAJA 1KBJA 3BLIA 3ATZA 4FNSA 2QEZA 3HMJG 1GTEA 2FPYA 1EA0A 4DEFA 3LBMA 4LS0A 4IMFA 3Q2DA 5LNUA 1VCGA 4H3DA 4UMCA 4KFPA 1GVRA 2Y89A 3MMTA 3TAKA 4PC8A 3CU2A 1TJPA 3LLDA 2TRSA 1QWGA 1L6YA 1D3HA 4BF9A 2QUVA 1QAPA 3L5MA 4WQ6A 3BPWA 3DI0A 1H7OA 3G1VA 3W7JA 4FXRA 4LUJA 4MPQA 3MUXA 3NL2A 1KV8A 3WK2A 2KZHA 3W7NA 5EA9A 3GAYA 1RPXA 1FQ0A 3LV6A 4XTIA 3LM7A 3O07A 3B05A 1EPXA 2VKZG 2CZEA 2X1SA 1JQXA 3G1HA 3MI2A 4LOCA 3O05A 3L2IA 3RLVA 1H7WA 3W22A 4WY0B 1SO6A 3LCFA 3G3MA 3LXAA 4M19A 4RX0A 2ABBA 3L21A 3LI1A 1A5CA 2CZ5A 3L0NA 1PVNA 1H50A 3HPSA 4XUGA 3W6YA 4NXKA 2NXHA 1WBHA 1KFLA 2ZYFA 1BEUA 2YX0A 2A5HA 2YGYA 4MLRA 3IV3A 1QR7A 3MP4A 2ZCGA 2AQWA 3SR7A 4LTSA 1ICQA 5CPLA 1GYLA 5D38A 1SFJA 2VENA 3W07A 4UTTA 2ALDA 2Y61A 3G8EA 1MXSA 2V30A 4FXSA 3DBPA 4HPJA 4JTUA 5I3FA 2WQPA 3HG5A 4E38A 2DJXA 3E49A 4JYEA 4DXVA 5HR7A 2DZWA 4QIUA 3G1SA 3B0UX 1XUZA 2JKAA 3MBDA 1BKSA 2JGQA 5DCBA 3O63A 4J9JA 4O0KA 2FTPA 2CLEA 2V81A 3NL6A 2YW4A 2FB2A 3PY2A 4ORIA 3HG3A 5K9XA 4ALDA 1A5SA 5CKSA 3W7QA 3HF3A 4MJMA 3SW6A 4FIQA 2TYSA 1MO0A 3STGA 1WYIA 1SW3A 3R12A 1A5AA 4PH6A 3KOFA 2OCZA 1ICPA 1Q6LA 1KV5A 1G67A 3UWWA 1OFBA 3S5YA 1VHNA 1WX0A 1XBXA 2ZFAA 2H3DA 1KLZA 1AW1A 3O16A 2B4GA 4DELA 4UR7A 3HGRA 2CLLA 4JTLA 3A5FA 3W2JA 2JKEA 3U8GA 3CLMA 1NEYA 4L4LA 3LCIA 1PHQA 5F2GA 4GXMA 1W5PA 1XC4A 3FLUA 1P4CA 2E77A 3H54A 1GEQA 5G4EA 1DQXA 3A24A 4A21A 2GQ9A 3VE9A 5D32A 5EKYA 4AEOA 1P1XA 2A21A 3TSBA 2NUWA 4WUIA 1YXCA 2FLIA 4MVAA 1BWLA 3G0UA 4JTJA 1R2SA 5CPNA 1XDLA 3WJWA 2HMCA 4Y9AA 3MW7A 4NJHA 1TTIA 3W87A 3N34A 1SPQA 4Z1CA 3F4NA 4LVAA 4QNEA 3LCGA 1EX5A 4FNPA 2BX7A 4FX8A 1X1OA 3T44A 4DO6A 5AHNA 3TW7A 5LGXA 1H7PA 3TDFA 2VFHA 1ML1A 1T96A 5DELA 4FX7A 3GK0A 3GYEA 1HUVA 3RNDA 1OX4A 5TQLA 4CNOA 5BMXA 4UC5A 2V9DA 4OGZA 2Z2UA 3LB0A 1HL2A 1OFDA 4UMAA 1JQVA 3NQGA 6ALDA 5F2MA 3SY5A 4LS2A 2EKCA 3MJYA 2E09A 3M5VA 2PRHA 4H6KA 3OEXA 2X1UA 1Q3NA 1W5NA 1GOXA 2ATMA 3W7MA 2YZRA 5K3VA 1DORA 2OT1A 5HR6A 2Y63A 1VYPX 1O95A 3PUEA 3TSDA 5MHBA 1JCMP 2PE4A 1JCLA 4BWLC 3LHTA 1W8SA 4DF1A 1J4EA 3T7VA 1XUUA 3QJAA 4RXFA 1N55A 5FEWA 2V2CA 2O7SA 3KAOA 3SSJA 1YTDA 2Y7FA 4DF2A 4DO5A 1YPFA 4S2BA 3W83A 2WSRA 4UNLA 4MOZA 4N9EA 3W9ZA 1TRIA 3BG9A 5BOOA 3MO7A 3LBCA 5HWJA 3W7IA 2CLFA 3NQ7A 1QNVA 3QYQA 4HNVA 3KX6A 3N19B 2OMAA 5TIMA 2C1HA 1K8XA 4Z0JA 1TTQA 2QAFA 3GIYA 4JGDA 4KFNA 3MHFA 2B7OA 2TPSA 4GNJA 1FWRA 1QFEA 2V2HA 4MUZA 1VCFA 3G22A 2E6YA 4IMGA 2J9YA 4OQVA 1ADOA 1TREA 3VE7A 3CPRA 3UWZA 1W5OA 1GVOA 4O15A 5K9DA 5CGQA 3L0KA 1SW7A 1YXDA 1MEWA 4JYFA 4NVTA 2G95A 4B5NA 3W88A 3W7RA 2EPHA 4LNYA 5LNVA 3GDRA 3CC1A 3LRLA 4MIMA 3FKRA 2ZA1A 3W1PA 3C2VA 4NNAA 4IUOA 4E0CA 4RV8A 2Y62A 2H8XA 3PM6A 5KZEA 3FYOA 2QJIA 1SZNA 3N2XA 3DKLA 3R2GA 5I3HA 4EIVA 4JX5A 5CZ0A 3EEGA 1G4PA 4JDBA 2F84A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M0V A;  3UY8 A;  2NLY A;  1VEP A;  3EWU A;  1XLA A;  2V5C A;  4JYD A;  4J3U A;  4ADS A;  2J74 A;  3PTK A;  4UQD A;  2CLP A;  1HGY A;  5AYB A;  2NV1 A;  2C19 A;  2BTM A;  4KES A;  4H4I A;  1ITC A;  1V03 A;  2FH6 A;  2QJN A;  4HGX A;  4IPP A;  1GOO A;  3A64 A;  4UFI A;  4NI3 A;  1NDV A;  3MV0 1;  1PSC A;  2HDJ A;  2OVL A;  1SW0 A;  2ODO A;  4GIS A;  2ZX5 A;  1X8F A;  1KR0 A;  1OGG A;  4BEQ A;  4AST A;  3BE7 A;  3SRF A;  1YX1 A;  1EJ7 L;  1QT1 A;  1BG4 A;  1R3W A;  3WK1 A;  2VP8 A;  2GOK A;  1SR9 A;  1XS2 A;  1Y8B A;  5D37 A;  3TUU A;  3GTF A;  3IVS A;  4ATD A;  3WD0 A;  1IIG A;  2J6V A;  3JVA A;  1ZJB A;  2VXN A;  3THC A;  4ZQN A;  5D04 C;  1F4A A;  2NUY A;  1ELS A;  4PEE A;  1POK A;  1AW5 A;  3AUO A;  1DWI M;  2GSH A;  4X0N A;  3WJS A;  3U9I A;  1VCV A;  4FHA A;  1M7J A;  4RZ6 A;  3VOC A;  4K3Z A;  4I5R A;  1UZH A;  5C7V A;  1DWA M;  4L9Y A;  1Y5W A;  2PD9 A;  1GZG A;  1UR0 A;  1QHP A;  3O6C A;  4KH2 A;  4QEH A;  4AHP A;  4AIB A;  5I7G A;  1PKL A;  1NDW A;  4JTD A;  3HIJ A;  4E4F A;  3E5P A; 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 1IEV A;  4KCU A;  3EWD A;  5U7S A;  3ONB A;  3GO2 A;  3VNL A;  3BCJ A;  3N6J A;  1S2V A;  3DHD A;  4AEF A;  3NWR A;  3GNN A;  3ZWS A;  1BFN A;  1W3I A;  1UKQ A;  4TVD A;  4XKY B;  1GVQ A;  2NQJ A;  4MKS A;  1VJZ A;  2PWG A;  2X16 A;  3ZJ6 A;  3N14 A;  1ZAL A;  1GWJ A;  4F66 A;  1SZE A;  3W23 A;  1FWH C;  2PBO A;  4XKM A;  4C1N A;  2H6R A;  1UJP A;  2CLK A;  3ABX A;  4A6G A;  1C8Q A;  2JKP A;  4DZI A;  2Z2A A;  3HUR A;  2VEI A;  4NAE B;  3GVR A;  3WNK A;  1ZFJ A;  3MA8 A;  2G3N A;  3WBW A;  3G1F A;  4JTA A;  1KXT A;  3IGX A;  2A79 A;  2DSV A;  4GI8 A;  4HCL A;  5EY5 A;  5EFD A;  3N04 A;  2PDW A;  1W3L A;  2GPT A;  3MMU A;  2CWN A;  2BGQ A;  3EA3 A;  1F76 A;  2QII A;  1BGG A;  2O92 A;  1AQM A;  1T8Q A;  3NQC A;  1ITQ A;  4M81 A;  2HVM A;  3SEP A;  1XBZ A;  2OO0 A;  5HNU A;  1DJW A;  3QPE A;  3W1X A;  1S5M A;  1HJW A;  3QBU A;  1UKT A;  4Q7I A;  1VBU A;  2BSL A;  4RR4 A;  3CAK A;  4W86 A;  2AKM A;  2DUZ A;  1LL7 A;  4XZM X;  3CUX A;  4GWE A;  5HOS A;  1RBL A;  1WB0 A;  3NGF A;  4MWA A;  1UUQ A; 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