2VVSA

Btgh84 structure in complex with pugnac
Total Genus 236
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
236
sequence length
588
structure length
580
Chain Sequence
LQPPPQQLIVQNKTIDLPAVYQLNGGEEANPHAVKVLKELLGMLISIGEKGDKSVRKYSRQIPDHKEGYYLSVNEKEIVLAGNDERGTYYALQTFAQLLKDGKLPEVEIKDYPSVRYRGVVEGFYGTPWSHQARLSQLKFYGKNKMNTYIYGPKDDPYHSAPNWRLPYPDKEAAQLQELVAVANENEVDFVWAIHPGQDIKWNKEDRDLLLAKFEKMYQLGVRSFAVFFDDISGEGTNPQKQAELLNYIDEKFAQVKPDINQLVMCPTEYNKSWSNPNGNYLTTLGDKLNPSIQIMWTGDRVISDITRDGISWINERIKRPAYIWWNFPVSDYVRDHLLLGPVYGNDTTIAKEMSGFVTNPMEHAESSKIAIYSVASYAWNPAKYDTWQTWKDAIRTILPSAAEELECFAMHNSDLGPNGHGYRREESMDIQPAAERFLKAFKEGKNYDKADFETLQYTFERMKESADILLMNTENKPLIVEITPWVHQFKLTAEMGEEVLKMVEGRNESYFLRKYNHVKALQQQMFYIDQTSNQNPYQPGVKTATRVIKPLIDRTFATVVKFFNQKFNAHLDATTDYMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords O-GLCNACASE BT_4395
publication title Elevation of Global O-Glcnac Levels in 3T3-L1 Adipocytes by Selective Inhibition of O-Glcnacase Does not Induce Insulin Resistance
pubmed doi rcsb
source organism Bacteroides thetaiotaomicron vpi-5482
total genus 236
structure length 580
sequence length 588
ec nomenclature ec 3.2.1.169: Protein O-GlcNAcase.
pdb deposition date 2008-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
A PF07555 NAGidase beta-N-acetylglucosaminidase
A PF18344 CBM32 Carbohydrate binding module family 32
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.58.460 Mainly Alpha Up-down Bundle Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1 Hyaluronidase post-catalytic domain-like 2vvsA03
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2vvsA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 2vvsA01
2OWWA 4AZCB 4W89A 4W7VA 3PN8A 5A6SA 3ZJ8A 4X0NA 1UQYA 3VNZA 2WZIA 1LG1A 3F5JA 2WVVA 4YHEA 4DWSA 5IFTA 5E0FA 3LPPA 2EQDA 2VX5A 2WVVB 5JBFA 5CPTA 2G4FA 3MKKA 4ZENA 1US3A 1KBBA 4PUDA 3CZKA 3MO4A 4XUYA 3WEZA 1V0MA 4Z2HA 2WWDA 1JZ8A 1A3HA 4WSJA 4PMRA 1QBAA 2UY4A 5CJ5A 3AICA 3K8LA 3VGEA 1TMQA 3T2PA 5A8MA 3AMDA 2VX6A 4HZ6A 1XSIA 3AXIA 4WF7A 2JEQA 3WUEA 3IAQA 1V0NA 2W91A 1J10A 2ZICA 2TAAA 3W82A 3VGBA 1CTNA 3U5UA 1H49A 2EPMX 5E6YA 2F61A 3EDKA 2DT2A 1J0HA 3AIVA 4WKHA 5A6JA 1LF1A 1KGUA 1XD1A 3ZO9A 1W9XA 2VTFA 1JYNA 4AD2A 1J12A 4JFUA 1R87A 5GQBA 1GOWA 3OA5A 3OZPA 1C8XA 4HPHA 2ZOXA 3GH5A 1HJQA 5A8OA 2WNWA 4ATLA 4DUVA 7TAAA 2GJRA 5KEZA 4AZ6A 5HPCA 3THCA 4E8CA 4C7DA 4UFMA 4HA1A 1UHVA 2X1IA 1JZ6A 5I2UA 3WNKA 1C7TA 4D6IA 1UD5A 4ATDA 2CETA 2BNJA 4FF5A 5GNYA 1U33A 1ZB5A 2WMFA 3OLIA 5AYBA 2BS9A 4M29A 2WHKA 3GH4A 4UFHA 4CGTA 4GI9A 1WO2A 5A6AA 4C91A 4MNMA 3BAWA 4CD7A 5HOSA 1ESWA 4AD0A 4AXNA 1B2YA 1UR0A 3WKZA 2J7HA 1E3XA 3WIJA 4CVUA 1AQMA 1SFSA 2WVTA 1I1XA 1WDRA 1QPKA 2ZE0A 1QNRA 4UFIA 3WUBA 2UY2A 1N82A 3IJ9A 1RD6A 3MMDA 3A47A 3WH7A 1E6XM 5EMYA 3AIRA 1ISVA 1K9EA 1EOMA 4HU8A 4U2YA 2ZXBA 1F4AA 4FLSA 2JE8A 1UKQA 4UQBA 3WNNA 4AIEA 1FH8A 1WNOA 3EDEA 3VGGA 4U3CA 2WVUA 4FLQA 5KZ6A 2VVSA 5DF0A 1V03A 1CGXA 3HN3A 3BH4A 3AIUA 5ABGA 3CHDA 4W8LA 2ZX9A 4MADA 4KRTA 4J3UA 4BZYA 4MNLA 3F5KA 3LPFA 4DUXA 4XZBA 1K6AA 3QHMA 1HJXA 1B1YA 3I3DA 4B3KA 4JL1A 1XYZA 1W1YA 3EMZA 5LYRA 1HNYA 4H41A 4F79A 1DWAM 1W9PA 1MYRA 2XVGA 4J3SA 2YL8A 2Y24A 3AIQA 2CEQA 4W8BA 1JYWA 1I1WA 4ZEPA 4TUFA 5EBAA 5E0CA 2G8ZA 3WQ6A 4AZ5A 2E8YA 1Q6FA 2E9MA 3WF4A 4H8VA 1CECA 1LL6A 2Y4SA 4S3JA 4W85A 1R7AA 1V3JA 1UWSA 2XSAA 1OT1A 2YLAA 4PMVA 2VQTA 3F5LA 3CH9A 1US2A 1CWYA 4W87A 2D0FA 1UD6A 3SCNA 5CLTA 2IXUA 3UG5A 4QP0A 2YOCA 1QHPA 4JFTA 3ZT5A 2E0PA 1KBKA 4KRUA 3GYCA 4IUGA 2VRJA 5FOOA 4PCSA 1X1NA 2W62A 1BLIA 4HMEA 1LWJA 2QMKA 2X0YA 4GXPA 3BAJA 1C8YA 3K8MA 3VM7A 2B31A 2NT1A 1XC6A 1FH9A 1UH3A 2ZX5A 4JFSA 4PEEA 4CN1A 3VMOA 1V3KA 4XZWA 1UD8A 3A4XA 1XGZA 4AD3A 1V6UA 4Z2LA 1MWOA 4R27A 4WIWA 1E0XA 3VD4A 4DUWA 1VFUA 3GXDA 3KL3A 1TE1A 4URIA 1HT6A 2PWHA 1RH9A 4KWUA 2RGLA 2YBTA 3JUGA 2G3NA 3GXMA 1LWHA 3VUPA 3W4RA 3SIMA 1E56A 1E0WA 1Y7VA 2E8ZA 4F66A 1QVBA 1OGBA 1KGWA 3ARUA 4JHZA 5CG0A 1JDCA 3A6OA 1OWQA 1ZL1A 1TVNA 2OYLA 5BWFA 3TTQA 2YL5A 3CZ8A 4QLKA 3ARXA 4JKMA 4AD5A 4HPGA 4JHOA 3APGA 2DSKA 4JZ5A 1AVAA 4CN4A 1NQ6A 4KMQA 1GNXA 2WMKA 4OBRA 1CDGA 1HVXA 1GQIA 1PBGA 2XG9A 4KH2A 1G01A 2CIPA 2GFTA 1DWFM 1UZ1A 1OM0A 2D0HA 3VD3A 3WSUA 2EJ1A 1XHGA 1DHKA 5EFDA 5A1AA 2ZX8A 2W61A 2E3ZA 3ZT7A 4IPLA 3L4UA 5BCAA 2XFYA 2AOSA 1BVNP 4AY1A 3DC0A 1JZ5A 2VZUA 5ABHA 5HNNA 3S2CA 5I5RA 4JL2A 1E1EA 2RGMA 4NRRA 1XH2A 3PTQA 1V3MA 3VMPA 1B3VA 4CD4A 3VIMA 2VCBA 4QLLA 2OSXA 1LLOA 1XCWA 4PTXA 1V02E 3CZEA 3CGTA 3N17A 1NWSA 4LYRA 5JBDA 3O9NA 2WHJA 4CKQA 9CGTA 4LYQA 1V6VA 1WZKA 4ZXOA 1J01A 1JI1A 1R85A 3W38A 3PZQA 3WQ8A 5M3WA 4H8UA 4CCDA 4CCEA 3MUZ1 1C92A 5I78A 4V28A 1LQ0A 2YL9A 4LQ1A 2PBOA 1M03A 5A8QA 2J62A 3CIVA 4AZ7A 3UCQA 2ZUMA 2WHLA 2QMJA 2VCAA 4V27A 1NARA 3AZSA 4EK7A 2VZVA 3SUSA 2CBIA 5D8ZA 1W9BM 2JF6A 1JI2A 1W3KA 1VFFA 2VT0A 1O6IA 3W24A 3HU7A 3ZR6A 2JIEA 5FD0A 2X0HA 3HJEA 1GVIA 1AMYA 2C8NA 4GINA 1BGGA 2Q8XA 4HZ7A 4EE9A 2ZIDA 3OB8A 4CU6A 4HZ8A 1UWQA 3DHUA 4D6CA 5A6BD 3OIHA 3G6LA 1G0CA 3VIGA 3BLPX 1C7SA 5D4YA 1V3IA 5LA0A 2FDMA 3WMBA 1MXDA 2ZX6A 2PC8A 1UR2A 1W91A 4QLJA 5BXRA 4UOZA 3PTMA 5FCZA 1UKPA 3B8SA 4D6EA 4CUCA 1B90A 2YKKA 2IUZA 1H3GA 1RPKA 1PJ9A 2BY2A 1W9DM 3CHFA 3MUAA 2ZXQA 4CVWA 1DWJM 1FH7A 1KWGA 3L4ZA 1ZBKA 3GH7A 4AZBA 3ZT6A 4W93A 5A6LA 1K9DA 2A3CA 3LMYA 2DSUA 2VI0A 1QI0A 2XJ7A 1NOFA 1VFOA 1C90A 3AJ7A 2XIBA 2V5CA 3AXXA 2DH2A 3OLGA 3SUWA 1OCQA 4BS0A 1HIZA 3WD3A 2VMFA 3KEHA 2J79A 3RIKA 2VX7A 2X8RA 1HP4A 1ZBVA 1IV8A 1NH6A 4LGXA 3FW6A 4F9JA 1DWIM 2O9RA 2CNCA 1SMDA 1WAWA 3FXYA 1CZ1A 1E5JA 1ISWA 2WB5A 3LPOA 3L4WA 1EO5A 4WLCA 2VZSA 1L0PA 4NSBA 2DIJA 1WDQA 2D0GA 1MW2A 1XRVA 3AMGA 4CCCA 4GO9A 3WL0A 1V0KA 7A3HA 3T09A 3WQ5A 3UESA 5CPQA 5A69A 4JAWA 3UG4A 2A3HA 4M82A 1PZ2A 2OSWA 4H2CA 1UZ4A 2BV9A 2E9LA 3UEQA 5CSYA 1E73M 4LYPA 3AXHA 2XVKA 1B3ZA 3N13A 3ZJ6A 4JKLA 1CPUA 4B9ZA 4GQQA 1H1NA 3CUJA 3CZLA 3ZM8A 3CUFA 4MAVA 1V6YA 3NSXA 2BY0A 1UD3A 3BAXA 2QPSA 4J3XA 4W84A 2Z1SA 3M6DA 1Q6EA 4NRSA 3ARQA 1BQCA 5BXPA 5HXMA 3ARTA 2BFGA 4FLRA 1E4IA 1WB0A 1NOWA 4UQDA 3K8KA 2WSKA 2D1ZA 2QLYA 1FA2A 1HJSA 4H8HA 4JKKA 1GPFA 4Z2IA 1H11A 3WBAA 1MW3A 1PPIA 1TVPA 2DSVA 4LX4A 4MNJA 1ZU8A 3AI0A 1D3CA 4UOQA 4ACYA 4YHGA 4DWSB 1E40A 3U57A 4YPJA 1HL8A 5GPRA 4PTWA 3BSHA 5I6SA 3GNPA 4BQ3A 2XFRA 3K1DA 5JBEA 1ZBCA 1ISXA 4GZIA 2YA0A 4ZE4A 2FGZA 2ZX7A 2XM1A 3VIJA 2O9TA 3T0DA 4IM4A 4W8AA 1UWTA 3M07A 4UR9A 3SCUA 4Z2JA 3AOFA 1JXKA 1NWRA 3POHA 3IK2A 1TFVA 4A4AA 4EKJA 4GQRA 1O7AA 5A6KA 3CMGA 1QI3A 2CERA 1U30A 1EOKA 5C70A 3K4DA 4A3YA 5EFFA 1WCGA 3AYRA 1BFNA 3W6MA 3NCOA 3NIYA 1JD9A 4MAZA 3BGAA 2FH8A 2XM2A 2JEPA 3WMSA 2FHBA 2V5DA 1M53A 4N42A 3J7HA 3CUIA 3VDBA 5A2BA 4HP5A 2D20A 1QW8A 3VVGA 1ZBWA 2XGBA 3WF0A 3CZJA 1UWRA 2O9OA 2BXZA 1UWUA 5HPOA 1YQ2A 3SCQA 3VIKA 1H4PA 4MB3A 4PCTA 5CZKA 2J74A 2EBNA 4S3KA 4OBSA 3VGFA 4QDMA 1JG9A 4WK9A 3ARZA 4MB4A 1UUQA 1UOKA 5ABEA 2F8QA 2G3IA 4WKAA 4H7VA 4U3AA 5DT5A 4W88A 3N1AA 2BVTA 1GOMA 2W63A 2D23A 3AYSA 2CBUA 1DWHM 1JFXA 2WZEA 2ZUVA 3KE0A 4BCEA 1VENA 2WKLA 2NSXA 4C7GA 3E1F1 5AC5A 3WFZA 1CGVA 5DMYA 2J8GA 2GDVA 1HKIA 1BYAA 3VD9A 2QHAA 4RE3A 4CU8A 3VOCA 4PN2A 4PUEA 3CTTA 5CPSA 2ZWYA 1GVYA 3VU2A 6CGTA 1UR9A 2JFEX 2DDXA 1W32A 2WK2A 3VDHA 2ZXDA 1GQLA 1E6PA 4D6GA 3SEPA 1CYGA 1JF5A 5I79A 1WPCA 1UA3A 2XVPA 3MMUA 3NSMA 2EO7A 1GCYA 1EIBA 2DIEA 3D3AA 4H04A 1KGXA 1KCKA 2DSWA 3BAKA 1PX4A 3ZIZA 3VIIA 2XYLA 3QHNA 1OD8A 4PMDA 2J7EA 2IXVA 1BG9A 4A3HA 1QI4A 2WM0A 5D9OA 3WDQA 1B30A 3WL1A 2J25A 1J18A 1M7XA 2OLHA 3W27A 1KR1A 3W28A 3W81A 3GTNA 4UCFA 4CN6A 1ECEA 4K68A 3KL0A 4OJYA 4AC1X 4CD8A 3ALFA 3AISA 1UKSA 3CUHA 1KXHA 4OZOA 1ISYA 3ARVA 4PSRA 5IDIA 1G9HA 4U31A 4WKFA 4RL3A 4KGJA 1B3YA 1E70M 2WMIA 4UNIA 1E55A 3DYMA 4X0VA 3AMCA 4Y7EA 1WKYA 5D9PA 1KCLA 3ARYA 2CBVA 3MSGA 4P7OA 2OWXA 3VX0A 3AROA 3QHOA 3VGHA 5TD4A 2FGLA 4GPNA 3WH6A 4F8XA 3RILA 1JAKA 1RP9A 3TP4A 1FP8A 1TCMA 1UR8A 2J78A 2VR5A 5CXPA 3PBGA 3IAPA 4UQEA 1LG2A 2J7CA 4U5KA 2NW0A 3ZSTA 2YLLA 2ZUTA 2VCCA 3TTOA 3VKKA 5ABFA 4P7RA 2XVNA 1UA7A 1ZS2A 2E9BA 2D2OA 5ABFB 2WCGA 1E43A 2ZUSA 4B9YA 1PZ3A 1KXTA 1AQHA 4BF7A 5IHSA 1XV8A 3GZAA 1S46A 3FN9A 1V3HA 3VIHA 2VO5A 1H0IA 4HOXA 1V0LA 2BXYA 1CXEA 4HTYA 4J3WA 5JIWA 1JFHA 4MB1A 2J7DA 1KQYA 3WENA 1ZJBA 1UWIA 5A3HA 4MDOA 1W2PA 4ZE5A 3WH5A 4HOWA 4BQ5A 2W66A 3N12A 4HA4A 1NM9A 4MPKA 4ZXLA 3N15A 4FMVA 2EXOA 4JCMA 2YIHA 2WSPA 5D8WA 1XSKA 3VM5A 1C3FA 1OT2A 1J0ZA 3ZOAA 2OWCA 2AMGA 2D24A 3PTKA 4IISA 5M17A 3PHAA 1W1TA 3BXWA 3WDRA 3A4AA 1PIGA 4P8XA 5C8BB 1UQZA 3BCFA 1JYXA 4L4PA 4GKLA 2ZWZA 1VEOA 1GORA 1TA3A 4XV0A 3L4XA 2WPGA 4DM1A 1OGGA 1LJYA 1U2YA 2ZUNA 1TA3B 3POCA 4AMCA 3AQUA 3U5YA 4AD4A 2C0HA 2WVSA 2GVYA 3CMJA 4M24A 1A47A 4HOZA 3CHEA 1J11A 1EA9C 1G5AA 2OYKA 4MJ4A 5FL1A 5DFAA 1KQZA 3WNPA 4DWSC 4FK9A 4GIAA 1VBUA 1E6ZA 2E4TA 1BPLB 1XH1A 1XSJA 2NT0A 1CENA 2WC3A 1H2JA 1E6NA 1MFVA 1PEZA 4UQCA 5DT7A 1HVQA 4TVDA 5FIPA 5LA2A 3OLDA 2WAGA 3AHVA 4YN5A 3VIPA 3MV01 1E5NA 3WF3A 4TX6A 4DWSD 2VL4A 5FKYA 5E6ZA 3BCDA 1QNQA 1CGTA 3N18A 2CPUA 3K46A 3QGVA 3GBEA 3S6TA 1V3LA 1EDQA 2DPEA 1BYCA 2BVYA 4OOUA 4V2XA 3VINA 3AZRA 1GJWA 1GHSA 1ZJAA 5M03A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2OWW A;  4AZC B;  4W89 A;  4W7V A;  3PN8 A;  5A6S A;  3ZJ8 A;  4X0N A;  1UQY A;  3VNZ A;  2WZI A;  1LG1 A;  3F5J A;  2WVV A;  4YHE A;  4DWS A;  5IFT A;  5E0F A;  3LPP A;  2EQD A;  2VX5 A;  2WVV B;  5JBF A;  5CPT A;  2G4F A;  3MKK A;  4ZEN A;  1US3 A;  1KBB A;  4PUD A;  3CZK A;  3MO4 A;  4XUY A;  3WEZ A;  1V0M A;  4Z2H A;  2WWD A;  1JZ8 A;  1A3H A;  4WSJ A;  4PMR A;  1QBA A;  2UY4 A;  5CJ5 A;  3AIC A;  3K8L A;  3VGE A;  1TMQ A;  3T2P A;  5A8M A;  3AMD A;  2VX6 A;  4HZ6 A;  1XSI A;  3AXI A;  4WF7 A;  2JEQ A;  3WUE A;  3IAQ A;  1V0N A;  2W91 A;  1J10 A;  2ZIC A;  2TAA A;  3W82 A;  3VGB A;  1CTN A;  3U5U A;  1H49 A;  2EPM X;  5E6Y A;  2F61 A;  3EDK A;  2DT2 A;  1J0H A;  3AIV A;  4WKH A;  5A6J A;  1LF1 A;  1KGU A;  1XD1 A;  3ZO9 A;  1W9X A;  2VTF A;  1JYN A;  4AD2 A;  1J12 A;  4JFU A;  1R87 A;  5GQB A;  1GOW A;  3OA5 A;  3OZP A;  1C8X A;  4HPH A;  2ZOX A;  3GH5 A;  1HJQ A;  5A8O A;  2WNW A;  4ATL A;  4DUV A;  7TAA A;  2GJR A;  5KEZ A;  4AZ6 A;  5HPC A;  3THC A;  4E8C A;  4C7D A;  4UFM A;  4HA1 A; 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