1ZNNA

Structure of the synthase subunit of plp synthase
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
254
structure length
245
Chain Sequence
KGGVIMDVVNAEQAKIAEAAGAVAVMALEGGVARMADPTVIEEVMNAVSIPVMAKVRIGHYVEARVLEALGVDYIDESEVLTPADEEFHIDKRQFTVPFVCGCRDLGEAARRIAEGASMLRTKGEPGTGNIVEAVRHMRKVNAQIRKVVNMSEDELVAEAKQLGAPVEVLREIKRLGRLPVVNFAAGGVTTPADAALMMHLGADGVFVGSGIFKSENPEKYARAIVEATTHYEDYELIAHLSKGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Biosynthetic protein
molecule keywords PLP SYNTHASE
publication title A New Arrangement of (beta/alpha)8 Barrels in the Synthase Subunit of PLP Synthase.
pubmed doi rcsb
total genus 89
structure length 245
sequence length 254
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 4.3.3.6: Pyridoxal 5'-phosphate synthase (glutamine hydrolyzing).
pdb deposition date 2005-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01680 SOR_SNZ SOR/SNZ family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1znnA00
4ADUA 4A3UA 3A5VA 1BKSA 5LNVA 2JGQA 3DFNA 3KVKA 1PS9A 4K7VA 3QZEA 1Z41A 1NFBA 1OFPA 2V8ZA 3NQ6A 1MXSA 4NNBA 3PB2A 4RLIA 1UBSA 1GVFA 4O16A 4Q33A 1I2OA 1IIHA 3KAOA 1AW5A 2WNQA 3QW4B 1KM3A 1H7WA 5H2ZA 2G97A 1OFQA 1Q45A 4WD0A 2Y63A 1YYAA 3BG3A 3NQMA 4RZ4A 3SGZA 1ICQA 3W1RA 4PEKA 3PUOA 2FB3A 3INPA 5AHIA 5CZSA 3DXIA 1TTPA 3Q2DA 3T40A 2V9DA 5AC8A 3B8DA 1W8SA 1XBVA 1A5CA 5EBUA 1GYLA 1UUMA 1OJXA 4M6VA 4LV4A 5K2ZA 1QNVA 4TMBA 4PH6A 1A53A 3CT7A 3SY5A 5EY5A 3N3MA 4JY8A 4DF0A 1TRDA 3CQ0A 3HB9A 4CLMA 2I1OA 3C8FA 3E9AA 3QSRA 1E51A 1PV8A 2GOUA 2ZRWA 4JTJA 5G4WA 1OFEA 3QJAA 1ICSA 5L9FA 3NEVA 4TMCA 3CTLA 2QF7A 3G1XA 1K8YA 4O15A 4S2CA 1TIMA 3W9ZA 3QPZA 4RK8A 4LS0A 5TQLA 1KFEA 4LY8A 1JCXA 4RX0A 5LGXA 1X8FA 3F1QA 3IGXA 1FDZA 3HGRA 3ABOA 2A7PA 3FIGA 2C15A 3P74A 1YDVA 3W74A 2E5CA 2JBMA 3P62A 5AHMA 3C0JA 3S5YA 3OIXA 4YWIA 3UPBA 4BWLC 1EA0A 1JUKA 4GRSA 3C6CA 4EWND 3T78A 3HGJA 3M1ZA 1TQJA 2EKCA 3LXAA 2YW3A 2OX1A 4WXZA 2IQTA 2ISVA 4PA8A 3NDOA 1A5BA 2V30A 3NPUA 3SSJA 4O17A 1W3TA 2ZFAA 3PVFA 1TPDA 3P5ZA 2ZZ4A 4U28A 4UIOA 1LRNA 2A6LA 4JTLA 3GLCA 4LRTA 3GDKA 1RPXA 3UPWA 5CSRA 2YX0A 4BR1A 4XZ9A 4O52A 1QDSA 3GK0A 1S5TA 3C2RA 3B03A 3MP4A 2DZXA 4MUZA 4M5PA 2QJIA 2QJHA 3NPWA 3LCLA 1W1ZA 1FDYA 2GVJA 3C3NA 5G1TA 2A85A 1V5XA 3HG2A 1SR9A 3PWAA 2GQ8A 2ZDRA 4FX8A 1SPQA 4JTGA 1HO4A 1YXDA 2CLEA 1MO0A 2F84A 4NNCA 3HOJA 4O4WA 1LM1A 3C61A 1G7VA 3PBWA 5CZTA 3W1UA 4Z08A 3O1NA 2BX7A 1HO1A 2E09A 5G1YA 3PBVA 4X9SA 4HNTA 2G95A 4RKAA 4N4PA 2VENA 2XN0A 2YPIA 1JCLA 4HPXA 5LHEA 3R89A 3NM1A 3STFA 1TJRA 4E38A 4Z0SA 1NAL1 3G1DA 1LOSA 4UTIA 1OFBA 1GG1A 3TXZA 2TSYA 3GYEA 4TIMA 4PL2A 3A9IA 4O0ZA 2VFIA 4AEOA 3TMLA 1QAPA 4FHAA 1PHWA 3AJXA 3NQEA 3IGSA 4FX7A 1DJQA 1H7OA 1J2WA 3RU6A 2C16A 3LRMA 1TJPA 3JR2A 4O28A 4TO8A 5AOUA 1GWJA 3ELFA 4D2JA 4MPQA 4WOQA 3MI3A 1S5VA 3HF3A 4JDBA 4DF1A 3G1AA 2WO5A 3DHFA 4K39A 3NL5A 3PM6A 2RH9A 1LORA 4P2VA 4PTNA 2A0NA 4AMAA 3H55A 4IPIA 4XKYA 5D37A 4FB7A 4O1DA 4Y9AA 1LCOA 2BWGA 2ZQ0A 3HIJA 4UMBA 4B5NA 2FB2A 2W0UA 4ORIA 2WNZA 5CPMA 2C0AA 1EX5A 2FFCA 3DFQA 3NPVA 4UTTC 3C56A 4CNPA 3F4WA 2VELA 4MLJA 2HTMA 3KXQA 1YPIA 1Q6QA 2X1TA 4RZ5A 1SZGA 1OFAA 2C19A 5I3GA 2Q8LA 5G5IA 4EF9A 3STCA 3CB8A 4BI6A 4WX2A 4WOZA 3KFTA 1O94A 3BGGA 4H6KA 4LRSA 4UTJA 3NQCA 2A21A 3SJ3A 1Z48A 4QM1A 2YW4A 3BGJA 2OJPA 1OYBA 4XUGA 3GXNA 2QDGA 5KZMA 3MUXA 3E96A 3JRKA 1RQBA 2C14A 2WSQA 4I7WA 5F2MA 3G22A 1JCJA 3TX9A 4K6AA 4E2BA 5G2IA 1HG3A 2E1DA 1QWGA 3EWUA 3C2FA 2EF9A 4OBTA 1OF6A 4NXSA 4GUHA 3VKJA 4IWWA 4BF9A 3HQ1A 3I68A 4M19A 4DF2A 3S1UA 3UXDA 3SZ8A 4JICA 3LXCA 4FNQA 3TIMA 1OX5A 4QIUA 3KX6A 1QCWA 4ZQRA 4AF0A 1JJKA 3TQKA 3RNDA 3LI1A 3FYPA 1VHNA 2BSLA 3C2VA 1I2QA 1KTCA 5HR7A 4UMAA 1H63A 4I7UA 3MJYA 3DU0A 3EWXA 4IMGA 1FWRA 4XBKA 1TV8A 2O7SA 3NL6A 3O63A 4QAIA 4RV8A 4J9JA 1O95A 2YSWA 1XBZA 4LVBA 1RQHA 1YXYA 1VCVA 4JTFA 5LNUA 3THAA 4JTUA 3G0XA 4WUIA 1H7XA 1T99A 2OZ0A 4UTWC 1KTNA 1G69A 1WXJA 3ZS4A 2Y62A 1W31A 1DJNA 1LROA 4GXMA 1EUAA 5BRBA 3L0GA 5D09A 5HUOA 4IMDA 1TPB1 2CZFA 4GWEA 4XWUA 4BFAA 4O0KA 4JN6A 3W7NA 2BZNA 1F2JA 2AQWA 4KKXA 4C1LA 1AL8A 2WNNA 3CWNA 1P4CA 2H3BA 4BI5A 5HUPA 4JXCA 4CQAA 3LHYA 5EPDA 4UNLA 2NX1A 4O57A 4JS3A 3FJ6A 3O07A 4JTTA 1EP2A 3LCFA 3TMQA 2C18A 3W72A 3M47A 5AC6A 1JRBA 4JDYA 3HJZA 4UCGA 2ZA1A 4Z1BA 1KBIA 1WQ5A 2NZLA 2VEIA 3N14A 3KRUA 3TC6A 1L6YA 4M7SA 1B4KA 1OVDA 1SSGA 4DXVA 2X2GA 1M7PA 4NUWA 1IXPA 1JQXA 1ME8A 1PL9A 3P81A 2PCQA 4Z1AA 4LC6A 2EPHA 2CWNA 3L67A 3W75A 5BNKA 3NA8A 4OWGA 2WJZA 3QEZA 4ICNA 3QYQA 5AHFA 1ZAJA 3G3DA 4MVAA 3W86A 2P1FA 1P1XA 5FEXA 4OE7A 5CSSA 1AW1A 3W70A 2C6QA 3O15A 1RD5A 1BTMA 2Y85A 1F74A 1ZAIA 3M7WA 4ONVA 4LW7A 1TV5A 4GBUA 4QJ1A 3M6YA 4IX0A 5AHNA 5U7SA 2VFDA 1J4EA 2FPVA 5D32A 1JVNA 4QITA 5G4EA 3QM3A 1VZWA 2CW6A 3G0SA 3P61A 4ADTA 5KITA 2CLIA 3TKFA 1DORA 3S1VA 4AAJA 1N55A 1JQVA 1NF7A 3UY7A 2H8ZA 4O54A 1PVNA 1I8JA 2Y70A 3P60A 2FQIA 5D2YA 2R8WA 1VYSX 3G18A 2I14A 2PC4A 4EF8A 3ATYA 4P61A 4MFEA 3S9YA 3DBPA 3LCGA 1LOLA 5SWUA 4LVGA 4MJMA 5D38A 1WA3A 2CLHA 1DBTA 1J5TA 4FNRA 3RLVA 1OX4A 5C6MA 3QH2A 3NG3A 3BVJA 1W37A 5TIMA 1BEUA 1TPH1 2NXGA 1FDJA 2QKFA 2GQ9A 3EWWA 3PC0A 4CQ8A 2R94A 1H7PA 1H7RA 1U5JA 2XN2A 3TXVA 3W2MA 1B3OA 1IXQA 3GR8A 2J24A 1LLWA 4K8EA 3H53A 5F1VA 5AYYA 3T4CA 3GDTA 3TDFA 4N9CA 3W7OA 2CLFA 1GVOA 3BW2A 3LCXA 3UWUA 3QMRA 4L4LA 4I7VA 2J88A 3S1WA 4LVDA 3Q58A 4JR5A 4NNAA 4KWVA 1KTBA 1UASA 2PE4A 1ZENA 4BI7A 1FCQA 1H1YA 2RKXA 5IM51 5LNWA 2NUYA 3W7KA 1KM0A 3CIWA 4IMFA 3DHDA 5DELA 3MYPA 3IIVA 3PUEA 1SW7A 4CCEA 3R8RA 5F4WA 3R5EA 2QJGA 4O10A 2E6FA 2FPTA 1XUZA 2ZZ7A 3IV3A 4A29A 2ZRUA 5J5RA 3DI0A 3PG9A 3UWYA 4JYFA 1QO2A 4AWUA 1KFLA 1JR1A 1A5AA 4AHQA 1VYRA 4XKYB 4A2RA 1THFD 5BW6A 2QCGA 3QMSA 1OFRA 1QMLA 2C3ZA 4ORMA 2Y6ZA 5EMUA 4X22A 3FKRA 2RDUA 1JUEA 1FWNA 1XDMA 2ABAA 4IMEA 3PS7A 1KFJA 3E12A 2QCDA 4O1CA 2A7NA 2ZA3A 3M0ZA 1HTIA 1AG1O 2E6AA 3L65A 1G6CA 3CEPA 1IXNA 3WK0A 4DBEA 5CZ0A 2GVGA 2YZRA 3LTYA 4MJZA 4FEZA 4ZMGA 4TU1A 2PRMA 4IXXA 1F6PA 4O50A 1WBHA 1Q3NA 4EOUA 4JX6A 4DEFA 2GJLA 2Y88A 1TMHA 4JIQA 5D33A 4S2BA 4YLWA 3OBKA 1R47A 3LCHA 3WJZA 4EVZA 1FXPA 1SO4A 1SO6A 4UR8A 4XBSA 3RLUA 3GB6A 1F7BA 4JX5A 2ZTJA 1EEPA 1QR7A 1Q6LA 2X1UA 3WK3A 1SUXA 5CG7A 5LKYA 3GDMA 4IQLA 3R13A 1W5NA 1KLYA 1SO3A 2NXHA 4WZHA 4GC4A 2NX3A 3M5ZA 3MI2A 4UMCA 5K9DA 4E2DA 1XDLA 2TMDA 4NU7A 3DFSA 2GQAA 4ALDA 4FNPA 1W3IA 3W1XA 2Z2UA 2NX9A 3UWVA 1L6WA 3NR0A 2WV8A 3W6YA 5HR6A 2DJXA 4DO6A 3THQA 4UTTA 4Y6GA 3M43A 3BLIA 1G4EA 4K7YA 4NXKA 1UJPA 4AF0B 1IXOA 1YTDA 5BOOA 1FWWA 4ZQOA 5LHFA 3I7SA 2ZBTA 5DCDA 1F05A 2FPYA 1YXCA 4W9TA 3FOKA 4OGZA 3MHGA 4FXRA 3D0CA 5C54A 1VCGA 5CPNA 2FJKA 3LLDA 1VRDA 3IRDA 2YFNA 3OG3A 1N7KA 5EA9A 2CZ5A 4G1KA 3TCEA 5K4XA 1VHCA 5D02A 2Y7GA 1TPC1 3LHVA 5EYWA 2KZHA 3TSBA 3W7EA 3P8JA 4UTLA 1FY6A 1O5XA 3TH6A 1ZFJA 3W1PA 5F2IA 3L5AA 2VFGA 3EXSA 2QCMA 4A2SA 3TFCA 2J9ZA 4NVTA 3N2MA 1EB3A 3NL3A 2BTMA 1NSJA 1SQ7A 4IX2A 1LYXA 4XQ6A 1XL9A 4Z0JA 1OFDA 5D2XA 1XC4A 4XTDA 1KM2A 4E0CA 2A2IA 2B7NA 1VLWA 1W5MA 2AAMA 3UY8A 2HS8A 1WAUA 4RXGA 3ABQA 2CZDA 4MYAA 3STGA 2QCFA 3UQNA 4JX4A 1W3NA 2VFHA 1FCUA 4LWWA 1H5YA 1GG0A 4OHQA 3B04A 2DORA 3Q94A 4IXHA 1ZALA 3PY2A 2OT1A 3HO8A 3W2UA 1JCYA 2X16A 3TJXA 3WK1A 2ZZ1A 2CLMA 2DZUA 2WPBA 1FCVA 1KFCA 4IGHA 4Y90A 1NF0A 1XBXA 5FF2A 3TAKA 4UTWA 3MMTA 3T44A 4OV9A 3U6WA 1YDOA 3IVTA 5I3HA 3IIXA 1G67A 2V2CA 3T7VA 5E0KA 3DAQA 1EPXA 3P80A 3A5FA 1H61A 2WSYA 1GT8A 1FX6A 1YADA 4FX6M 5HWMA 5KMYA 1GTEA 4WXYA 4MZYA 3IVSA 2DP3A 3M5YA 3PG8A 3B0UX 2VKZG 4GE8A 4KWWA 4AVFA 2TRSA 3VE9A 1OF8A 4CNNA 1X6UA 3LXBA 3HBLA 3C2EA 3LV6A 3QSTA 4YCPA 2QDHA 3G8RA 5LSMA 3GXTA 3WK2A 3LHTA 2AGKA 3LCWA 3L0NA 2ZA2A 4IUOA 1KLZA 1KBJA 3A22A 3G1VA 3YPIA 3GDLA 4GUFA 1M5WA 2E77A 4O19A 1OX4B 4N9BA 1SW3A 1SZEA 2ZZ2A 2TYSA 4L4MA 3WFAA 3HMJG 2JKAA 4RJEA 1I2NA 3G1SA 1I2RA 2ZZ6A 3LHUA 2FLIA 5HWNA 3TUUA 4HKPA 3E49A 1A50A 2HMCA 4O18A 5IBXC 1VR6A 2NWSA 3GNNA 1EIXA 4LNYA 4JD4A 2H6RA 2X1SA 3QW3A 2DZVA 4ADSA 4HNVA 4LT9A 2J27A 3W85A 4DQWA 1RQEA 3N19B 1SZNA 3UWWA 3QFEA 3R2GA 1XUUA 2B0MA 1SSDA 2EHHA 3BARA 3DZ1A 4LS2A 3PF3A 1TREA 1MEWA 4CNOA 3JS3A 1TPWA 5KTLA 1T0OA 2NLIA 3L0KA 3HPSA 3EX2A 1QOQA 2X30A 1GTHA 4MIMA 4HSOA 3CLMA 3C2OA 3HGOA 5FEZA 2DZTA 3RFAA 3P82A 5KZEA 3A24A 4MZ1A 1F73A 3CPRA 3TW6A 1XFBA 1I4NA 4NX5A 4DO5A 2W79A 3PBYA 3EWYA 5D30A 4GUGA 5DLCA 2Z6JA 3FFSA 2G5WA 1KM1A 2QCDB 3NZ1A 4H3DA 4LUIA 1DL3A 3O06A 4LU0A 2CLKA 3MI6A 4JGDA 1FXQA 4C1KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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