1TA3B

Crystal structure of xylanase (gh10) in complex with inhibitor (xip)
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
ASLNDLFVAAGKSYFGTCSDQALLQNSQNEAIVASQFGVITPENSMKWDALEPSQGNFGWSGADYLVDYATQHNKKVRGHTLVWHSQLPSWVSSIGDANTLRSVMTNHINEVVGRYKGKIMHWDVVNEIFNEDGTFRNSVFYNLLGEDFVRIAFETARAADPDAKLYINDYNLDSASYAKTQAMASYVKKWLAEGVPIDGIGSQAHYSSSHWSSTEAAGALSSLANTGVSEVAITELDIAGAASSDYLNLLNACLNEQKCVGITVWGVSDKDSWRASDSPLLFDGNYQPKDAYNAIVNALS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
molecule keywords xylanase inhibitor protein I
publication title The Dual Nature of the Wheat Xylanase Protein Inhibitor XIP-I: STRUCTURAL BASIS FOR THE INHIBITION OF FAMILY 10 AND FAMILY 11 XYLANASES.
pubmed doi rcsb
source organism Emericella nidulans
total genus 124
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2004-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ta3B00
1BGGA 3WQ4A 1CLVA 1EO7A 3W38A 4PRWA 3LPGA 4D6FA 4JIEA 5A1AA 1MQPA 5HBFA 1E70M 3UG5A 3WEMA 3OZPA 1B30A 2BHYA 3VIKA 2D1ZA 2G3MA 3QGVA 2WC4A 4NI3A 4TTUA 2WVSA 1B3XA 2VOTA 2OWXA 1C91A 8CGTA 2WBGA 4BA0A 1JG9A 4P8WA 3U57A 2F61A 2WMGA 3VMOA 1WNOA 1OSEA 1W3LA 1H49A 3VNZA 1CWYA 1E72M 3MMUA 2J75A 3LPOA 4C7FA 7A3HA 2CXGA 5ABFB 2UY2A 1V6YA 3SEPA 1GOMA 2IUZA 4IPLA 1VEMA 3VIOA 1H3GA 4AXNA 1BLIA 3CHFA 5BROA 3WDHA 2X0YA 3VX1A 1TMQA 3CIVA 2XWEA 3VUPA 1NWUA 3MUIA 2WLYA 2PC8A 3LPPA 3TTSA 3VIGA 4GO8A 2VURA 2VR5A 1XV8A 2YJQA 4D6JA 3L4TA 2WBKA 4PCTA 1FFQA 5A6BA 5AY7A 5AC5A 1JYNA 1BFNA 1TA3B 1GHSA 2FDMA 2DT3A 2DPEA 3GNOA 3WMCA 4MAZA 3AIRA 4KWUA 1TVPA 4JFSA 3UEQA 3WH6A 5EFDA 4XZWA 1N82A 2IXUA 2YKKA 1JDDA 4X0NA 1X6LA 4XX6A 1SR0A 3IAQA 4LQ1A 3VIFA 4E8DA 1HP4A 2ZUUA 2WWDA 1MXDA 4QFUA 2WCGA 4P8XA 1JGIA 4YHGA 4CU7A 3WD4A 3SCWA 1PEZA 3MV11 4GIAA 1VB9A 5JUVA 2BHZA 3CTTA 3VIMA 1PBGA 4EKJA 2ZE0A 1UR2A 2VCCA 3VU2A 4HP5A 1VEOA 3L4WA 3FN9A 4AIEA 4KGLA 2BY0A 3IJ9A 2ZXQA 3OBAA 4GKLA 3GNPA 1XH0A 4V27A 3N18A 1FH8A 1F4HA 4A3YA 1IZKA 1FHDA 4ACZB 2F8QA 3NUKA 4DWSB 3CHEA 3WDQA 4PMQA 2V3GA 5TD4A 5E0FA 3CZJA 3FNDA 3EBVA 4UQEA 3SCUA 2Y24A 1W9DM 3A4WA 2V3DA 4LX4A 5A8PA 5DFAA 3ZJ6A 2WZIA 1W1YA 3T0DA 2CHOA 3AS2A 3ZT7A 1QOXA 1TZ7A 2WC7A 2XUCA 3KWXA 5CPQA 2ZUTA 2D23A 1TG7A 3WF2A 1V3JA 3ZT5A 3U7VA 3A4AA 3BC9A 5C8BB 5A8NA 3AHYA 3AMGA 1E73M 4PMUA 1C3FA 1BG9A 1GQLA 4W7VA 4N0RA 4AZ6A 1UKQA 1FHLA 4FLRA 3PTMA 1PIFA 5IHRA 1G94A 2J8GA 4JCMA 4AC1X 4AEFA 3VGBA 4D6DA 1OT1A 4Q22A 3PZVA 3EDEA 1F4AA 4M80A 1E4MM 1QW9A 2Z1SA 3ARXA 2YLAA 3VD3A 4M24A 1YQ2A 2ZUVA 2PWDA 3UETA 1NOWA 1EDTA 4QAWA 1KWGA 4FLQA 1VBRA 1TA3A 2CESA 2YDQA 3ZMRA 1UD2A 4X0VA 3GYCA 3WQVA 2WSPA 1AMYA 1MW3A 4WSJA 3AROA 2ZWYA 5CZKA 4OOZA 1PJ9A 3BAWA 1KGWA 1NP0A 1RPKA 1TE1A 1CXHA 3ARTA 4HU8A 1LWHA 2CEQA 2VRQA 4PN2A 1G9HA 1W9UA 3PZTA 3ZSTA 1JZ6A 4X9YA 4AD0A 1JYXA 2XM1A 3RM8A 1ZB5A 3A4XA 1CXIA 1GNXA 3L4ZA 2WMKA 2UY3A 3VTRA 4ZEPA 1C7SA 1AQMA 4AZ5A 1EGZA 1Q6DA 2J4GA 1WDQA 7CGTA 2JIEA 4MADA 3MUZ1 3WY1A 4W87A 3W26A 1KQYA 4W5ZA 1BTCA 1TVNA 3VGHA 4UOJA 4CD8A 1CGYA 3SUUA 1E4LA 4KH2A 2JIWA 4IPNB 4Y7EA 4B16A 3BCFA 3W37A 3CGTA 4CD5A 4ACZA 2QMJA 5BRPA 5DT7A 3WFLA 1W9BM 2J25A 2EEXA 1CGTA 2MANA 3WF3A 4DWSA 2Q8XA 1WZLA 5LYRA 2XWDA 2BY1A 4Z2LA 3SCTA 1HJUA 1U33A 5D9PA 5A8OA 5CXPA 4GZJA 4AYSA 3ARYA 3NJ3A 4FK9A 4NF7A 3SUTA 4F9JA 3ZR6A 1C8QA 2WHJA 3N04A 4BS0A 1HN1A 2X8RA 4FF5A 3KEHA 3DYOA 1C8XA 4ZXLA 4D1JA 5BXPA 1D7FA 4UFJA 1R7OA 1OBAA 2A3AA 4B15A 2WKGA 4AIOA 1GCYA 2XFYA 5A6LA 2V38A 2EPNA 4GZIA 5EMYA 1P6WA 2DSWA 4AZCB 3SCQA 4HA3A 4CCCA 1V3KA 1E15A 1JAEA 3HMCA 4UQ9A 1CTNA 3WUBA 1NOFA 2XVLA 5FIPA 1UD4A 5HXMA 1J12A 3WNKA 3WL1A 5IXEA 3CHDA 4U5IA 3UR8A 1Q6FA 2FHCA 3DYMA 5HDRA 5I2UA 2WANA 2CNCA 2VRJA 2ZX5A 5D8ZA 5ABHA 5HPOA 3PZ9A 4HMDA 4H41A 4B9YA 4PBGA 5HPCA 2E0PA 1V6XA 3WD3A 3O6AA 3ZQ9A 3N12A 2G4FA 2X2YA 1Q6GA 4J28A 1WKYA 3ARRA 3WH7A 1BQCA 1KCKA 1JD7A 3ZOAA 4URIA 2CYGA 3VDAA 1Q6CA 1V0MA 4B3LA 2VZVA 4WF7A 2PBOA 3B8SA 2W61A 2WM0A 1OIMA 1XGZA 2VC9A 3OGSA 4TTGA 1JF5A 5AC4A 2VQUA 4J3SA 4AD2A 2WKLA 3BMVA 3M6DA 1GW1A 2PI6A 4OOUA 5ABEA 2FH6A 5HNNA 2XM2A 1GVIA 1FFRA 3WDIA 2ZXDA 3AYRA 1H0IA 4NRRA 2J7FA 4EAMA 1BAGA 1E40A 3MS8A 3WBEA 3GDBA 1AVAA 4MB3A 3VGFA 1VEPA 1XH2A 3S2CA 1CIUA 2XG9A 4ACYA 3OB8A 1B1YA 5M3WA 5FL0A 2CKRA 4U3CA 3CZEA 4GZEA 5E0CA 5FKYA 1VFFA 5F7UA 4NRSA 1H1NA 3K4AA 1TCMA 4GO9A 4IUGA 4HU0A 3DHUA 2D3NA 4HA4A 4WKHA 1UR8A 3NDYA 3EDKA 2WSKA 4MB4A 1GQIA 3RDKA 3VINA 1QI3A 1H09A 1BF2A 1J18A 4RE3A 2A3CA 2XFRA 2VZSA 4HPGA 4IISA 4PMNA 1JXKA 2VX7A 4MAVA 4W93A 2BY3A 2Y8KA 3PZGA 4CD4A 3K8MA 3SCPA 1FH7A 5EFFA 3I3EA 1KGUA 3KZSA 3GXIA 1DWGM 2BXYA 3HN3A 1WPCA 1M7XA 2E8ZA 2CBUA 4MJ2A 1J0ZA 3SUSA 4W7WA 4GQQA 2DDXA 2A3EA 1G5AA 5A6AA 4QDMA 4TXEA 4BF7A 1US3A 1JYVA 1XSKA 2VMFA 1UQYA 3AHTA 4U31A 6CGTA 5M5DA 4AZGA 1ISZA 4HOWA 4MNLA 1HJQA 1KR1A 4CD7A 1Z32X 1JZ2A 2ZXAA 1UR0A 1UKPA 1JIBA 3F5LA 5A95A 1WZMA 3N1AA 3CZKA 1H2JA 2W63A 4PSPA 1IZJA 1SMDA 1GQKA 1GZJA 5A6KA 1O6IA 2J7CA 1UWQA 3UERA 2E4TA 1CZ1A 4PMVA 1MW2A 3MSGA 4HPHA 4RE2A 5I5RA 2DGAA 1BVZA 3VKKA 3VGEA 1J11A 4AD1A 4AD3A 3WNNA 2BFGA 1HKMA 2J79A 1XSIA 1ZJAA 3VD7A 5JBEA 2XIIA 2C0HA 2YBTA 2G41A 2VTFA 3AQUA 4LYRA 4CCDA 1ODUA 1JL8A 1GOWA 1OD8A 3OA5A 2UWFA 4KGJA 2XSAA 2BV9A 4WLCA 2ZX7A 2PB1A 1OT2A 2ZOXA 2QMKA 1V03A 4PYSA 3F5KA 1ECEA 1E3ZA 4JKKA 1V0NA 3SCOA 3A47A 5E6YA 3WUFA 3VD4A 1ISXA 3AHVA 2VVNA 2VR4A 1QPKA 4W86A 1GORA 4JHZA 4GI6A 4BQ3A 3OG2A 1NQ6A 4GINA 2YA1A 1Y7VA 1K9FA 5I0DA 3PBGA 4WIWA 2QLYA 4PMXA 4CN1A 4UZSA 1HX0A 2ZX6A 1LJYA 3AXIA 4W7UA 1NM9A 3VDCA 2XIBA 1LL6A 1E43A 4AD4A 3WNLA 4GI9A 4CU8A 1ESWA 2VZOA 3RM4A 1B3WA 1W3JA 1XHGA 2DSVA 5I77A 1EHNA 4N42A 1EDGA 1B9ZA 1ZBKA 4BQ5A 2ZUWA 3ZM8A 5E70A 1IT0A 3FHAA 1LG2A 3MMWA 3CZ8A 1WAWA 3IANA 4UTFA 3VDBA 4M56A 1UD8A 2QF8A 3AIQA 4CVWA 1JZ8A 1UD5A 2WXDM 5GPRA 4UFMA 1W3KA 4UQCA 1PPIA 4TUFA 3MSDA 3WQWA 1BYDA 3DECA 4XZBA 1UD3A 3MMDA 3OLDA 1ISWA 3CUJA 1G1YA 3AZTA 3SUWA 2YDRA 2NT1A 3M46A 4AEEA 4AZ7A 4J7RA 3J7HA 1UD6A 2CHNA 2X0HA 1K9EA 2CERA 1Q6EA 1UH3A 1UG6A 4YHEA 1VJSA 1C93A 4XB3A 3GZAA 5BXRA 2PBGA 3L2LA 2V5CA 1OD0A 4LYQA 1AQHA 3QHMA 1WP6A 2VT0A 1RD6A 3CMJA 3VVGA 3WEZA 5IFTA 3SURA 3RMEA 1TFVA 2WC3A 2G3JA 2Y4SA 3VDHA 3ALFA 3I3DA 2D20A 3NSNA 3SUVA 2WVTA 4W84A 3VIPA 1E6PA 3T09A 1GQJA 2W92A 4OBSA 3W28A 2JE8A 1XSJA 3TTQA 3FHQA 2EO7A 3WH5A 4MB5A 2Z1KA 3BCDA 2O9RA 2XVNA 1YHTA 1XCXA 2XSBA 5A2AA 3A6OA 3TTYA 5BXSA 1WB0A 2XHYA 2X09A 3WDRA 4CU6A 3WF4A 3TA9A 2VL4A 1VENA 1GOIA 3G6LA 4LXFA 3TTOA 3W24A 6A3HA 3JUGA 1GJUA 1WZAA 3T0AA 4F9DA 4UZUA 3WENA 3QOKA 3PZIA 3AMKA 2XPKA 3LMYA 3WIJA 3N11A 5EBAA 1E0WA 1GONA 1CNVA 1HKJA 1PX4A 4FLOA 4QCFA 4GXPA 1CPUA 2ZIDA 1DWHM 4UOZA 3IJ7A 1ISVA 3AS0A 3WUEA 1FOBA 5A2CA 4DUVA 2DT0A 3UR7A 3W4RA 3CZLA 1E5JA 4AW7A 1CDGA 1LQ0A 3ARQA 3LPFA 5A6BD 1QI4A 1SYTA 4E8CA 1W2PA 2J74A 2OSXA 4MPKA 1QHPA 1E0VA 4QLKA 3VD5A 3ZJKA 3WNMA 1SFSA 4KMQA 4UQAA 1E1EA 4MJ4A 2VQTA 3SCVA 1ZBWA 3BAKA 4D6GA 4D6CA 5I79A 2WHKA 1J0JA 4E2OA 5BYWA 1W3HA 2QPSA 3EDJA 4EK7A 2J7DA 4MTVA 2WMJA 2J78A 2VCAA 3GXDA 1CLXA 1C7TA 3T2PA 3PTKA 5EB8A 3CMGA 5JBDA 2CIPA 2OWWA 2D0HA 1NOUA 3EDFA 4H2CA 3BAIA 5M03A 2ZXBA 1K9DA 1GUVA 4CN6A 2VCBA 4Z2GA 1J10A 2V3FA 1X6NA 3SCNA 2O9TA 3AIUA 2XJ7A 5LA2A 4F79A 2C8NA 2D22A 2EPLX 3UESA 3WEOA 4H04A 3WH8A 3AZSA 5CJ5A 2DH2A 2YIHA 2GFTA 5ABGA 3EYPA 4M82A 3ARWA 3HJEA 4YN5A 5KZ6A 2UY5A 3QOMA 2CBIA 2PWEA 2D24A 4OJYA 4P7OA 2O92A 4R5EA 1KBBA 3WKZA 4UFHA 1LL4A 1UOKA 3IAPA 4LPCA 4Q7NA 1NARA 1DWIM 4TVCA 4AIUA 5BWFA 1UWTA 1E3XA 4MDOA 4V2XA 1H4PA 2WK2A 4PTVA 1TUXA 1E6RA 1V6WA 2WHMA 2RGLA 3WD2A 3I3BA 4CVUA 1LWJA 1E71M 3ARVA 2XGIA 1QBBA 5CLWA 3W0KA 1MQRA 3CBWA 3THCA 2BVYA 4DUXA 3NSMA 4CUCA 4AZIA 2WZEA 4UFKA 2OYMA 4HZ7A 3W6LA 1KQZA 1MQQA 2WCAA 1E4IA 1KXVA 2XTKA 3MO4A 5A3HA 1JYWA 5KEZA 2E8YA 1HL8A 3AICA 2EJ1A 2QPUA 1C8YA 1CXEA 3VMPA 3W81A 5M17A 5DMYA 1E6XM 2BY2A 1IV8A 3N9KA 3ZJ8A 5D4YA 1W9PA 3PZNA 1QI5A 1ODZA 3ARUA 2VX4A 3S6TA 3PZQA 3ALGA 4ZXOA 2HISA 2FHBA 2WWCA 3OLGA 4M1RA 2DQXA 5JIWA 4Z2JA 1FA2A 3FAWA 4UQBA 3FW6A 3T0BA 4OZOA 1JF6A 5IFPA 4AISA 3IJ8A 2D3LA 5JBFA 1PAMA 2JF6A 2ZICA 1PZ2A 3AXHA 4KRUA 1EO5A 2WCSA 4DM2A 2VZUA 2EXOA 4HMCA 3B9EA 3ECQA 2GJRA 3EDDA 1W32A 3CUHA 3ARSA 4S3KA 2DT2A 5LA1A 3MU7A 3PTQA 1UWUA 5AYBA 3IK2A 3CUFA 1M53A 4D6IA 4TVUA 4D72A 1E1FA 4HOZA 3WQ5A 1OGGA 3UCQA 2E9MA 2WYSA 2WVVB 2GK1B 3VM5A 3BAJA 1QNPA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BGG A;  3WQ4 A;  1CLV A;  1EO7 A;  3W38 A;  4PRW A;  3LPG A;  4D6F A;  4JIE A;  5A1A A;  1MQP A;  5HBF A;  1E70 M;  3UG5 A;  3WEM A;  3OZP A;  1B30 A;  2BHY A;  3VIK A;  2D1Z A;  2G3M A;  3QGV A;  2WC4 A;  4NI3 A;  4TTU A;  2WVS A;  1B3X A;  2VOT A;  2OWX A;  1C91 A;  8CGT A;  2WBG A;  4BA0 A;  1JG9 A;  4P8W A;  3U57 A;  2F61 A;  2WMG A;  3VMO A;  1WNO A;  1OSE A;  1W3L A;  1H49 A;  3VNZ A;  1CWY A;  1E72 M;  3MMU A;  2J75 A;  3LPO A;  4C7F A;  7A3H A;  2CXG A;  5ABF B;  2UY2 A;  1V6Y A;  3SEP A;  1GOM A;  2IUZ A;  4IPL A;  1VEM A;  3VIO A;  1H3G A;  4AXN A;  1BLI A;  3CHF A;  5BRO A;  3WDH A;  2X0Y A;  3VX1 A;  1TMQ A;  3CIV A;  2XWE A;  3VUP A;  1NWU A;  3MUI A;  2WLY A;  2PC8 A;  3LPP A;  3TTS A;  3VIG A;  4GO8 A;  2VUR A;  2VR5 A;  1XV8 A;  2YJQ A;  4D6J A;  3L4T A;  2WBK A;  4PCT A;  1FFQ A;  5A6B A;  5AY7 A;  5AC5 A;  1JYN A;  1BFN A;  1TA3 B;  1GHS A;  2FDM A;  2DT3 A;  2DPE A;  3GNO A;  3WMC A;  4MAZ A;  3AIR A;  4KWU A;  1TVP A;  4JFS A;  3UEQ A;  3WH6 A;  5EFD A;  4XZW A;  1N82 A;  2IXU A;  2YKK A;  1JDD A;  4X0N A;  1X6L A;  4XX6 A;  1SR0 A;  3IAQ A;  4LQ1 A;  3VIF A;  4E8D A;  1HP4 A;  2ZUU A;  2WWD A;  1MXD A;  4QFU A;  2WCG A;  4P8X A;  1JGI A;  4YHG A;  4CU7 A;  3WD4 A;  3SCW A;  1PEZ A;  3MV1 1;  4GIA A;  1VB9 A;  5JUV A;  2BHZ A;  3CTT A;  3VIM A;  1PBG A;  4EKJ A;  2ZE0 A;  1UR2 A;  2VCC A;  3VU2 A;  4HP5 A;  1VEO A;  3L4W A;  3FN9 A;  4AIE A;  4KGL A;  2BY0 A;  3IJ9 A;  2ZXQ A;  3OBA A;  4GKL A;  3GNP A;  1XH0 A;  4V27 A;  3N18 A;  1FH8 A;  1F4H A;  4A3Y A;  1IZK A;  1FHD A;  4ACZ B;  2F8Q A;  3NUK A;  4DWS B;  3CHE A;  3WDQ A;  4PMQ A;  2V3G A;  5TD4 A;  5E0F A;  3CZJ A;  3FND A;  3EBV A;  4UQE A;  3SCU A;  2Y24 A;  1W9D M;  3A4W A;  2V3D A;  4LX4 A;  5A8P A;  5DFA A;  3ZJ6 A;  2WZI A;  1W1Y A;  3T0D A;  2CHO A;  3AS2 A;  3ZT7 A;  1QOX A;  1TZ7 A;  2WC7 A;  2XUC A;  3KWX A;  5CPQ A;  2ZUT A;  2D23 A;  1TG7 A;  3WF2 A;  1V3J A;  3ZT5 A;  3U7V A;  3A4A A;  3BC9 A;  5C8B B;  5A8N A;  3AHY A;  3AMG A;  1E73 M;  4PMU A;  1C3F A;  1BG9 A;  1GQL A;  4W7V A;  4N0R A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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