1SW3A

Triosephosphate isomerase from gallus gallus, loop 6 mutant t175v
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
APRKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHEKLRGWLKSHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Understanding protein lids: structural analysis of active hinge mutants in triosephosphate isomerase
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 91
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1sw3A00
1R2TA 8TIMA 3CC1A 4LS2A 3L5MA 4G1KA 1I4NA 4YWIA 4BR1A 4OU1A 2DZSA 1G4PA 2VEIA 3B05A 3TH6A 2QCDB 4Y6GA 1XBXA 2JGQA 3UY8A 4OT7A 4LW7A 3TNOA 5FESA 1EUNA 3TMLA 5H2ZA 5KZDA 5CZ0A 2AGKA 2NWSA 3B04A 1SFLA 4TU1A 1FCVA 1SZGA 3A5VA 1DL3A 3W72A 3LHVA 5DELA 4JDBA 4O1CA 2R91A 4ZQMA 1R30A 1K7XA 4ZQCA 4LVFA 5FF3A 4UFMA 5HR6A 4N02A 3GIYA 5LZLA 3QMSA 3TAOA 2ATSA 4JXCA 3CM4A 3DFNA 3TMQA 1OFPA 1OYBA 1RZMA 3HF3A 5D38A 3EX6A 1RQHA 1B9BA 1L2UA 3BW4A 1FDYA 3FA5A 1VLWA 3S8HA 2ZTJA 3S5OA 2FPVA 1G69A 4UFHA 5I3HA 3W88A 1EWDA 4NJGA 4O1BA 3R2GA 3QRHA 3UY7A 5AC7A 4K39A 3TQVA 5LSMA 1ZHAA 3PVFA 3CB8A 4P61A 4P2VA 2V2DA 3NQFA 4DBEA 3DZ1A 1UBSA 2TSYA 3RFAA 1KFBA 3L68A 3BW2A 3E96A 3LI1A 2CLIA 2ZA3A 4LC6A 3MI2A 2DZWA 4KFNA 3BG5A 3T4CA 4PCFA 2NUYA 1OFBA 4WD0A 3ABSA 2WNZA 5U4NA 1VRDA 1LOSA 3RMJA 4PTNA 4DELA 1S3HA 4NU7A 3GXNA 2JKEA 1IXQA 1RR2A 1K02A 5AYXA 4DO4A 1AMKA 5D30A 4ZQNA 3EWWA 2WSRA 3DFOA 3SI9A 5J5RA 2CLKA 1EUAA 2YXGA 1DV7A 4ZQOA 4R7JA 4FX7A 4N9BA 1LZOA 4CNNA 1LROA 4EOUA 5LGXA 2PRLA 3BGJA 4DO6A 1DQXA 4HT3A 3W7CA 3IGXA 4UNLA 2A7RA 3SGZA 1OFQA 2ZZ2A 3TQ0A 3L9CA 5HNRA 3Q94A 3QW3A 4XTIA 3L5LA 3M0ZA 3GK0A 4GBUA 4Z0SA 3LXCA 4UNKA 3GNNA 5I3IA 1AL7A 4U28A 2DZTA 1A5AA 2CZDA 4NJJA 1LRNA 3C8FA 4A29A 4O28A 3MO7A 5E93A 4AHQA 4YCPA 4JTJA 3ELFA 4K8HA 3R8RA 1GVOA 4QNWA 2I9EA 1H1YA 3G1VA 3TFXA 4JY9A 2E09A 1FDJA 4GRSA 4QNEA 1SW7A 3S1XA 1W1ZA 5J5DA 5T26A 5D2TA 2FPYA 1EB3A 1W3TA 3FKRA 2VELA 5L6UA 2YPIA 4MFEA 3LRKA 1KA9F 5E1QA 3G1FA 1HG3A 1GYLA 2D73A 1XUUA 2X1UA 3VE9A 1KFJA 1VYSX 2YYTA 4LUIA 5I3GA 3UWZA 3P74A 3NQ8A 3KVKA 3O07A 2Y88A 4NX0A 1QMLA 1L6SA 3GDRA 1C9DA 1U83A 2CZ5A 3NDOA 3GKAA 1WAUA 2WOQA 5LNSA 4UTTA 3LOTA 3N3MA 3HGRA 4ORIA 3U6WA 5HWJA 3NQGA 1I45A 1TPWA 5DCEA 4UFKA 2Y63A 1IIGA 4O0ZA 3HG3A 1MEHA 1BKSA 1EA0A 3L2IA 1P4CA 1KTCA 4N9EA 3DI1A 3FJ6A 3NQ6A 4NXKA 3KRSA 3I6RA 1HFBA 1RQEA 2NZLA 4KFOA 1LYXA 2TMDA 2XN0A 5HUOA 4UTHA 4OWGA 2J9ZA 3NXFA 2A2IA 2BZNA 1MZHA 2V8ZA 1WXJA 2C19A 2CLMA 1WX0A 3DKLA 4JTHA 4GJ1A 1GQNA 3W84A 3LCHA 4OE7A 4AMAA 4POCA 3NYZA 2DORA 4JTFA 1O5XA 2O7SA 3W75A 5A8GA 4ZQPA 2NXIA 3B4UA 3UPBA 3M1ZA 3NZ1A 3BV4A 4O11A 1X6UA 2F84A 4XBKA 2FJKA 3TFCA 4O8RA 3U2OA 3DAQA 1Q6OA 4UMAA 4JICA 5LGZA 1W5PA 5BOOA 3NQDA 2RFGA 3P62A 1NF0A 1VGAA 3MW7A 4LS0A 1KM2A 5C2XA 2V2CA 2BLEA 3HG5A 3USBA 3TW7A 4NNBA 3IEBA 3LERA 4IXXA 4WOQA 1TRDA 4UTKA 3QC3A 4TIMA 4BI6A 2XN1A 3KVLA 4K38A 1EEPA 5CPLA 5EMUA 1QO5A 3LLDA 4JTKA 1JULA 2VFGA 2ZZ3A 5CPNA 1J2WA 3PC0A 1LM1A 2Y7FA 3OBKA 2GVLA 2V2HA 1F5ZA 4CQAA 2GPTA 4FXRA 1SR9A 3M5XA 1VYPX 1SSGA 3LCFA 1JCXA 1OFOA 3BLFA 3A23A 4UFLA 3B8DA 4O15A 1SW0A 4L4MA 4KKXA 3HGOA 4O14A 2RKXA 2YW3A 1DORA 2QJGA 5C5YA 1DQWA 5IBXC 2NWRA 5AHLA 2C3ZA 1T0OA 1SZEA 5D33A 2QCGA 2QDHA 1EP1A 1SUXA 4ALDA 1WQ5A 4LVGA 3E9AA 4AB4A 3QMRA 5CSRA 3HQ1A 4LTSA 3PBYA 1NFBA 2G96A 3GNDA 3R5EA 1WYIA 3HOJA 3IGSA 3LB0A 5CPMA 4JTLA 1TJRA 1TMHA 1PCKA 1GWJA 1CI1A 2PCQA 1XBYA 1HL2A 4GUIA 2VXNA 1H61A 5HMSA 3MBDA 4O13A 3TR2A 3B0VC 1G7UA 5G1TA 4UR7A 1TTIA 1YPIA 5AOUA 3IIVA 4IMGA 5TBOA 4BI7A 3N14A 3ABOA 4QISA 4JTUA 3TXVA 1DHPA 1N8FA 4JTEA 1W56A 3KXQA 4MLRA 1NVMA 2QJHA 4AHOA 1N55A 1EP2A 5F4WA 2B7NA 1KW1A 2PRHA 2OZ0A 1BWKA 3EKLA 5CG7A 2YDAA 4WXYA 2G97A 3QQ1A 3BPWA 3JS3A 2J9YA 2RDTA 4UTIA 3QEZA 3EXSA 3R89A 2E1DA 5F1VA 1TQXA 5BNKA 1KFCA 3DH7A 4N6EA 1A5CA 1VLIA 4O12A 5DBTA 4PODA 4JX4A 4JTSA 3HG2A 4DXVA 2X30A 2WO5A 4K6AA 3W85A 1K03A 1J5TA 3HIJA 4A2RA 1VYRA 4RK8A 5KINA 1JCJA 4OBTA 3NQAA 3BG9A 4JTIA 1VCGA 5CZJA 1FUYA 4DF0A 2QCFA 3L0NA 2C1HA 4AWUA 5HWMA 2GJNA 4N9DA 1W3NA 4DBDA 3WJSA 4YMZA 4JR5A 2B7OA 3LV5A 2QDGA 1RQBA 1LBLA 3QZEA 3UPWA 4E2DA 3WK0A 3ZS4A 3TAKA 3O1NA 4Y96A 1WBJA 1ME9A 3CIWA 3LRMA 5KZMA 2VFDA 2E6DA 1X8FA 4XKYA 1LDCA 3B06A 2B7PA 3A5FA 4NNCA 3G3DA 1Z44A 4ZMGA 1S5TA 4ZVJA 5LNVA 2HS8A 3PR2A 1GT8A 3C4UA 4AWTA 3DU0A 5D2YA 3E12A 1KM3A 3GKFA 3W7RA 1Q6RA 2CLHA 4HPXA 4FIRA 3W1TA 4JS3A 4S1FA 3PULA 1TREA 4C1KA 3TU9A 3LCGA 2WSQA 4R53A 1B57A 3IIZA 4MIMA 1H62A 4ADSA 2GJLA 1S5WA 4AXKA 4AWSA 3LHZA 2EHHA 5SWUA 1THFD 1TTPA 1ZJIA 4DO5A 3UWWA 1MSSA 1YDVA 4K36A 2V9DA 2OT1A 5AYYA 1XBVA 4DEFA 1TV7A 2J6XA 1GTHA 1NSJA 3M5ZA 3W83A 5GVJA 2QKFA 3PG9A 1UUMA 4FNRA 3TIMA 2R14A 4NJHA 4UFIA 3GLCA 5HR7A 1TB3A 5TIMA 3THAA 3EWUA 1F2JA 4Q4KA 1EPXA 1QR7A 3STEA 3H55A 3QPZA 1WOBA 1SQ7A 1F6KA 3LHUA 2VKZG 2E6YA 5F2LA 2DZVA 4GFSA 3CHVA 3W1LA 3PY2A 3DKJA 2B4GA 3MYOA 3UWVA 2YW4A 3DHFA 3NM1A 5C55A 2ALDA 3HPSA 2GQ9A 3QF0A 5K9XA 2OJPA 4IPIA 3NQEA 1RVGA 5FF2A 3S42A 2FB3A 3WJXA 2AQWA 3MP4A 4FNTA 2PRMA 2EAWA 3STGA 3I7QA 1HO4A 3V75A 1H50A 3HMJG 2VENA 3L65A 2ZBTA 1FCQA 3IIPA 1ME8A 2E5BA 1PV8A 5AHEA 3NQCA 3OIXA 3TXZA 1AG1O 1XBZA 4CCCA 3W6YA 2G95A 2A1YA 4UFJA 3AJXA 3MHGA 3W7DA 1UASA 3IV3A 3M7WA 2V0TA 3CQ0A 3G8EA 2I14A 1SFJA 4IPJA 3PBVA 1JR1A 2QCHA 4TR9A 2ABAA 1DJQA 3OVQA 3WK1A 3WJYA 4K7YA 3W3OA 4E0CA 3VI2A 5FF7A 4NZJA 3NEVA 3O6DA 4D2JA 4M6VA 3HO8A 5BMWA 3GAKA 3I68A 3G22A 1T96A 1H60A 3G1HA 3ZWSA 1WBHA 4M6QA 3UWYA 3MMTA 1SO6A 3NQ7A 2VEPA 2YZRA 1LOLA 1G67A 3NAVA 1PHWA 3ATYA 6TIMA 3TCEA 3M43A 2DU2A 1K8ZA 1QNVA 2NUWA 5AB3A 4WY0B 3EWBX 4BFAA 4TX9A 4NZFA 3L5AA 2HMCA 1LLWA 4IQLA 2PE4A 3DHDA 4DF2A 4BWLA 1PS9A 2IQTA 1YXCA 2NXHA 4UXDA 3RLUA 4C1LA 1TPH1 3N34A 1FQ0A 1F6PA 1PVNA 5EPDA 3O6CA 1W3IA 1FY6A 1A53A 1SW3A 2W0UA 1QPOA 1RV8A 3LTYA 1WA3A 1MXSA 2JKPA 1GG0A 3MI6A 2H3DA 3TSBA 1EWEA 1M6JA 1B4EA 3GB6A 4K8EA 1B4KA 3BO9A 1OK6A 4N9CA 4RZ6A 3S0CA 2Y62A 1PIIA 1XKYA 3TV8A 1W0MA 3BLIA 4PH6A 4UCGA 5LHEA 2J27A 3W71A 3M9YA 1I2OA 3LTPA 3VNDA 3LXBA 3UD6A 2R94A 4FIQA 4JDYA 2DP3A 2E6AA 3NQVA 4X22A 2WNNA 3DFSA 4UTLA 3T40A 2X16A 3C3NA 5KTLA 3P5ZA 1GOXA 1TSIA 3NPWA 2V81A 4ORMA 1R2SA 3NG3A 3S5YA 2A4AA 4O4VA 1G6CA 4DQWA 3W1RA 1S5VA 3WK3A 2VFFA 3P80A 3GZ3A 4AF0B 1DVJA 3TC6A 3S1VA 4RX0A 4RJEA 3FEMA 2YFNA 1OYAA 3SY5A 5FF4A 2A21A 1R47A 1FCUA 3N9RA 1YTKA 1FWWA 4QSHA 2QAPA 4MYAA 3F03K 3FFSA 5HULA 4JEQA 4HKPA 4M7TA 5L9FA 5D04C 5KSWA 3ZFHA 2VFIA 3W1MA 2E5DA 1QFEA 1H63A 5HQEA 4LS1A 1BTMA 3PF3A 1YYAA 1GVRA 4XQ6A 3W22A 5HINA 5AHMA 3OG3A 4GUFA 3PB2A 4JGDA 1F73A 4JN6A 1NF7A 4LOCA 2FTPA 5F2MA 4E2BA 1Q6LA 1XXXA 1K7FA 1W31A 3EX1A 3HG4A 4RXGA 1JJKA 1O94A 3MHUA 3NPXA 2FQIA 4OHQA 3W7KA 5G4EA 4LVAA 2TPSA 1F7BA 1Z48A 1AW2A 3N2XA 1DBTA 1GPWA 2WKJA 3BG3A 3W76A 1A5BA 1OFRA 2FDSA 3CLMA 2G5WA 5K9DA 4LVBA 2VEMA 3BK0A 4RR4A 1DOSA 4YLWA 2ZRUA 1FXQA 3PSWA 3ZWTA 5CGQA 3SIZA 1KFLA 1SO5A 4IGHA 2QUVA 4IMCA 5DCBA 3OVRA 2WQPA 2H90A 4QJ1A 4ICNA 4UTWC 1XC4A 2XN2A 3LCIA 3QSRA 4IWWA 3LCXA 1IIHA 2CWNA 4O4WA 3G24A 5CZTA 1OX5A 3LCLA 4IXHA 4ADUA 1O5KA 3W7LA 3PG8A 4R34A 4HPJA 4MUZA 4WXZA 3KHJA 3KOFA 5D2XA 3S1WA 1SSDA 1JUKA 2ZZ4A 5EL1A 4WY0F 1XCFA 3F4WA 2ZRVA 3P8IA 1IGSA 3STFA 2Z2UA 1TPEA 5DY3A 3GAYA 2DZUA 4HN4A 4TMCA 3LI0A 4MVAA 1EX5A 3RU6A 4NXSA 2ZDRA 2RDWA 2QCEA 2J24A 3N9SA 4GXMA 2C16A 2ZRZA 3N73A 1RPXA 3PSVA 1VPXA 4O50A 2EKCA 2A0NA 3KVMA 3OVPA 5EBUA 1H7NA 2OMAA 1I8JA 4Z0JA 2ZZ1A 3GX9A 4CCEA 2ISVA 3W74A 4UMCA 1R2RA 3KRZA 2GQAA 4I9AA 2GVJA 5EYWA 1OFEA 4MPQA 3IGUA 3NZRA 5AHIA 1W37A 1N7KA 3C6CA 4EVZA 3CT7A 3UQNA 1A5SA 5LKYA 1W5NA 1JCLA 2CFFA 4MKNA 3G18A 3DI0A 4K7VA 2QCCA 3BARA 2B0MA 3PUOA 2ABBA 4MJMA 4IMEA 4O17A 1YTEA 3GDKA 4MY1A 3EXTA 1VJIA 1Z42A 3SZ8A 1GJPA 4LV4A 2BXVA 3W1XA 1VQTA 3MI3A 4GNJA 2B7QA 1T99A 1GVFA 2FPTA 3DFQA 5CSSA 3W2NA 1CW2A 2QCNA 4JIQA 1PCWA 3VE7A 3MUXA 1K3UA 1W8SA 4WUIA 2YR1A 1ZY9A 3QSTA 4CQ9A 4EF8A 3NR0A 4MZ1A 1QWGA 4HNTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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