4ATL | Genus

Total Genus 183

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	183
sequence length	501
structure length	470
Chain Sequence	NDATRISRSDFPADFIMGTGSSAYQIEGGARDGGRGPSIWDTFTHRRPDMIRGGTNGDVAVDSYHLYKEDVNILKNLGLDAYRFSISWSRVLPGGRLSGGVNKEGINYYNNLIDGLLANGIKPFVTLFHWDVPQALEDEYGGFLSPRIVDDFCEYAELCFWEFGDRVKHWMTLNEPWTFSVHGYATGLYAPGRGRSTGNPGTEPYWVTHHLLLAHAAAVELYKNKFQRGQEGQIGISHATQWMEPWDENSASDVEAAARALDFMLGWFMEPITSGDYPKSMKKFVGSRLPKFSPEQSKMLKGSYDFVGLNYYTASYVTNASNFSYNTDIHVTYETDRNGVPIGPQSGSDWLLIYPEGIRKILVYTKKTYNVPLIYVTENGVDDVKNTNLTLSEARKDSMRLKYLQDHIFNVRQAMNDGVNVKGYFAWSLLDNFEWGEGYGVRFGIIHIDYNDNFARYPKDSAVWLMNSFH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	RAUCAFFRICINE-O-BETA-D-GLUCOSIDASE
publication title	High Speed X-Ray Analysis of Plant Enzymes at Room Temperature pubmed doi rcsb
source organism	Rauvolfia serpentina
total genus	183
structure length	470
sequence length	501
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.1.219: Vomilenine glucosyltransferase.
pdb deposition date	2012-05-08

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4atlA00

1WZLA 1W3JA 3QGVA 4W86A 2EPMX 3BAYA 1UR9A 2D23A 1UR8A 2BY3A 2VQTA 3TTQA 4AZBA 2ZUVA 4RE4A 4PRWA 1I75A 1UD2A 1XH1A 1E71M 3DYMA 4P8WA 2VX5A 1UZ4A 2QPUA 4MB4A 2VRJA 3W82A 1PX8A 4YPJA 4HTYA 3WQ8A 1FFQA 1K9DA 4JFVA 3A4XA 4ZFMA 3RM9A 4PCSA 3ZSTA 3VIIA 2PI6A 1R85A 3OIHA 3OGVA 3ARPA 1GQLA 2EPLX 2VJXA 3U57A 3APGA 3VM7A 1HT6A 3NJ3A 3NIYA 3GXDA 4YN5A 3SUVA 5I77A 3L4TA 4TOQA 1ITXA 3CZJA 4P8UA 3PZMA 3TTSA 1L0PA 3GM8A 4MADA 1YQ2A 5JBFA 2J47A 3MSGA 3WF0A 3WDHA 3WF1A 3CPUA 1D3CA 1E6XM 2Y8VA 4KRTA 1E6NA 5IHRA 3NDYA 2YL9A 2WC7A 3PZQA 1PEZA 5JUVA 1KWKA 1WNOA 4AD2A 2O9RA 5A8OA 4AZIA 1C93A 1NH6A 2XVGA 3MKKA 4HZ7A 1HJVA 4UTFA 1MW1A 3CHDA 1JD7A 4UQEA 3AFBA 1ZJBA 3AHTA 4PSRA 4AWEA 2VX4A 4GIAA 1HP5A 4WKFA 3L2LA 2FH8A 1MWOA 1K9FA 5HPCA 1UA3A 1MXGA 5DEZA 1WP6A 3T08A 3MSDA 1CIUA 4P7QA 4CU8A 4PUDA 1H2JA 1LF1A 3PBGA 3EBVA 5EFDA 1CZ1A 1HNYA 1O6IA 3KE0A 2X0HA 3RM8A 1VBUA 3L4WA 4EAMA 5CLWA 1OB0A 1PZ3A 1EOKA 4LYQA 2J7DA 3IAQA 1R87A 3B8SA 2DT1A 3FNDA 2DT0A 1KBKA 1ZBKA 3CHEA 1ZBWA 3VNYA 2D20A 5D8ZA 2BVDA 4AY1A 3OG2A 4KGLA 1QI4A 3WD1A 1EO5A 3QHMA 5BCAA 2ZUNA 1KQZA 2IXUA 1OBAA 5AYIA 1EIBA 1W9UA 2ZUSA 3CUJA 1JAEA 2J74A 4CN4A 1J10A 2E4TA 1BHGA 4CN6A 1WZAA 3CUIA 3S6TA 3WEMA 5A94A 3GBDA 4HU8A 4N0RA 2DSZA 4JCMA 4MPKA 1ESWA 2WSKA 1GUVA 4HU0A 4J3TA 1AQ0A 1HP4A 2WVUA 1VFOA 4W88A 4UZUA 1W91A 4XB3A 1G5AA 3VDHA 4AD0A 1H5VA 3MV01 4H04A 1V3JA 4X0NA 4BQ3A 2WB5A 4OIFA 4HPHA 1HX0A 4CVWA 2Q8XA 3ZQ9A 2BY1A 4R27A 5A6BD 3GH5A 3CUGA 2JEPA 2FHCA 1US3A 2ZIDA 4DUVA 1CNVA 5A6KA 5E6YA 3WEOA 2BY0A 1OSEA 3SCRA 4UOJA 3UERA 1VEPA 4TTGA 2GJPA 1MYRA 5C70A 1DWGM 4C7DA 5KZ6A 2ZWYA 1E5JA 3FY1A 3OZPA 1KBBA 2ZICA 3OGRA 1C90A 5D9MA 2CIPA 3DHPA 4AIEA 1PX4A 3AXXA 1D7FA 1QVBA 3WD0A 2GK1B 2XVKA 5A6SA 1JGIA 3UR7A 3KL3A 4K68A 4QP0A 4H8VA 3VIGA 4PMUA 3BMVA 1CGUA 1TR1A 3HJEA 3N17A 2CPUA 5M3WA 2A3BA 3GYCA 2V3GA 3M07A 5A6LA 1W1PA 3AIVA 4D6JA 2EPOA 4YHEA 1JYWA 2DH3A 2W62A 4F79A 2J8GA 2EQDA 1JDDA 5DFAA 1VFUA 1ISZA 4HA1A 3AMDA 2WK2A 1QNPA 1KR1A 5A8MA 3KWXA 4P7RA 4OJYA 2W61A 3OA5A 5A8PA 1W9VA 3PZOA 1UYQA 1UKQA 4UR9A 2WMIA 1C91A 2D22A 4TVCA 4AD4A 1QBBA 3VIMA 5CJ5A 4OOZA 1LLOA 3U5UA 4AZ6A 8CGTA 1QHZA 1AQMA 4NRSA 1UWIA 1GZJA 1PBGA 3WELA 3O9NA 2JIWA 3N04A 2F8QA 2A3HA 2CETA 3FAWA 1PAMA 1XC6A 5A2AA 4BZYA 4UOQA 1TVPA 1UD8A 3ZT6A 2VC9A 2ZUTA 5DT5A 3NYDA 3RO8A 1B3XA 3AIRA 3BAXA 4E4PA 4V28A 4F9DA 4AW7A 1UD4A 4D6FA 3VD9A 5A6BA 4PTVA 1QPKA 4IPNB 2WCGA 2MANA 1OGBA 2DPEA 4W5UA 1OWQA 4JHZA 4AZGA 2BS9A 1CTNA 3VOCA 4UFJA 3GNRA 1GPFA 1HVXA 4WLCA 5CLTA 4CD5A 1KGWA 2RGLA 4EANA 1HKMA 3W0KA 4EK7A 2ZUUA 1CDGA 1UR1A 2DGAA 1RH9A 4H8HA 3A4AA 3E1F1 4PSPA 4AMCA 4R5EA 4WKHA 3GXMA 4KRUA 4AEEA 3T0AA 5DMYA 5E6ZA 1UH4A 3PTKA 2J75A 3BGAA 3CMJA 2WMJA 2V3EA 4GPNA 4Z2GA 2CCRA 1CXIA 2WKLA 5A6JA 2WHMA 2QHAA 1UOKA 4U2YA 1C7TA 3CZLA 3VMNA 1UR0A 1QI3A 4W87A 2BY2A 2WZEA 2TAAA 3UG3A 3BSGA 3BMWA 1W3KA 1BYBA 3SUWA 3T2OA 1GW1A 3WQ5A 1UKPA 3CHFA 4J3SA 2PWEA 2G3IA 5ABGA 5IFPA 1M7XA 3EMCA 3AS1A 3OGSA 4TVDA 1C92A 2D3NA 3VGGA 2O9PA 4UFLA 2VRKA 5CXPA 3AROA 4MJ4A 1Q6GA 3TTYA 2O9TA 1RP9A 3AI0A 1XSJA 4H2CA 3VX0A 4GQRA 1UZ1A 4DWSD 2ZWZA 3M7SA 3B9AA 2D0FA 1E6ZA 4CGTA 4BF7A 1E3XA 1V3HA 3LMYA 5FOOA 2J79A 2E40A 3IJ8A 5IXEA 1V6YA 3VKKA 5A2CA 2VURA 4ZE4A 2CHOA 4AZHA 2YA0A 2CYGA 2JEQA 1DWIM 3TA9A 2FHBA 3ARQA 1SYTA 1EDGA 4PMYA 1HKKA 1BFNA 3N1AA 3NSNA 5LA0A 1LWHA 3POCA 2A3AA 1XYFA 3SCVA 2NW0A 2WYSA 4B15A 4LQ1A 3ZR5A 1UWRA 1BYDA 2E3ZA 1WZKA 2XGBA 2D0GA 2CBIA 3B9EA 4W7UA 1NWRA 1GORA 1W32A 4HPGA 4HZ8A 1E4LA 3AS2A 2XM2A 1WB0A 1JL8A 3WDJA 4BQ5A 5BXRA 2WKGA 2OSYA 1UG6A 3UG4A 2WMFA 1L8NA 2GK1A 3G6MA 4AISA 5EFFA 1X1NA 3VD7A 1E1EA 3SCPA 4TUFA 4B3KA 1H41A 1XGZA 1UA7A 1XH0A 1E4NA 3L4YA 4KH2A 4JKLA 2XWDA 4M29A 5E0FA 1FH8A 2D1ZA 3EDKA 3FW6A 1IV8A 2UY5A 3KL5A 4DM2A 3MUZ1 1GCYA 3AS3A 3WBAA 4JKKA 4MTVA 3WDPP 4LXFA 2XWEA 3WSUA 2ZUMA 3TP4A 8A3HA 3AZRA 5A1AA 1BGAA 1GOWA 1DWHM 1UWSA 3MMWA 4XX6A 2DIEA 1JYNA 4B9YA 5ECUA 4DUXA 2J7CA 4FF5A 2VOTA 1OIMA 2CHNA 1HJXA 3AIUA 2FGLA 4BS0A 2PWHA 2W91A 1EO7A 3WENA 1J0JA 3AIBA 1DHKA 5I23A 2AMGA 3MUIA 4J3XA 1B0IA 1HKIA 3W29A 3THDA 1ODZA 2EBNA 2XTKA 4TX6A 4UCFA 1UUQA 2OSWA 3T2QA 1E1FA 4MDOA 3IAPA 1NWSA 2IXVA 4GQQA 2QF8A 4MNMA 5CGMA 2BHYA 4YHGA 2WMIB 1JF6A 2D3LA 1PPIA 2WVTA 3CTTA 1C7SA 3UEQA 4D6DA 3WD2A 2QMKA 2BNJA 4RL3A 4P8XA 4D72A 4ZXOA 1DP0A 4UFMA 3WQ6A 1UKTA 1KGXA 4U5KA 4XZBA 2D24A 1NOWA 2BV9A 3K4AA 3VDCA 1WO2A 3VPLA 1JF5A 2CKRA 2BXYA 4A3HA 1SMAA 4QCFA 1J0YA 1GJWA 1ODUA 3VD3A 4GI9A 5M5DA 4HMCA 2GJXB 3WNKA 5I24A 4S3JA 4IUGA 1JFHA 3WDRA 1IT0A 2WC3A 1VRXA 4W7WA 1CGVA 1AVAA 2WHLA 3BH4A 3W38A 1V3LA 3K8KA 4GZJA 5CPQA 3ZJ6A 3D3AA 3W6MA 1O7AA 5F7UA 4CCCA 2GUYA 3POHA 2E0PA 1I1WA 2VO5A 4ZENA 1OT2A 4MB5A 4HP5A 2WXDM 2D0HA 4OOUA 3ZJKA 3AHVA 3SCQA 4W8LA 5CPTA 2ZXQA 4D71A 4JFUA 4FLQA 3UG5A 3AXIA 3CO4A 1OIFA 5E9AA 3VUPA 2UY4A 2J77A 2PF0A 2VUYA 2YJQA 1KGUA 1E43A 2ZXBA 2J7BA 2XJ7A 4F9JA 3OLEA 4M1RA 2VVSA 5DT7A 5AC5A 3JUGA 2V5DA 2OYMA 4ATDA 2WMGA 1WZMA 2WVVB 4LGXA 4H8UA 1ITCA 4Q22A 3WQWA 5HBFA 1BF2A 3RPMA 1W9PA 4AIOA 1JXKA 1TUXA 3AHXA 3SCSA 3N9KA 3K8MA 5CSYA 3DYOA 5HDRA 2DSVA 3CZGA 3DYPA 1HJUA 4GO9A 5BROA 2BXZA 1HL8A 3AZSA 1GONA 3BAJA 1NP2A 3PZNA 3RILA 4E8CA 1GOQA 3SUUA 2J25A 3GXIA 3WKZA 4ATLA 1E9LA 1MQRA 3VGBA 2JF7A 5GQBA 1B30A 4J3VA 2CBVA 2DDXA 3BAWA 3AMGA 1UD3A 1E56A 4PMQA 1MXDA 4IM4A 1E6QM 1UWTA 2VX7A 1PZ2A 2JE8A 4HMEA 1V08A 3KL0A 5A95A 4M81A 1E72M 1DEDA 1UR2A 1PX3A 3BCFA 1GQKA 1A3HA 5FCZA 5IHSA 1LJYA 3F5LA 3IJ7A 3M46A 4PYSA 3TOPA 2VX6A 5HNNA 3MMUA 4L4PA 3WBEA 1K9TA 3TONA 3QHOA 1MQPA 1CXEA 1EHNA 1LL7A 4E2OA 1OCQA 3MUAA 2E9BA 2CKSA 2XYLA 4PMXA 1JZ7A 1RPKA 2UY3A 3HN3A 4B3LA 1ZJAA 3RM4A 2PWGA 2J4GA 1Y7VA 2FGZA 2GVYA 1A47A 3CBWA 3WUBA 2DQXA 3AJ7A 4OKDA 3ARSA 3RDKA 5A6AA 3B9DA 1K6AA 3GXFA 2OSXA 4CD4A 3AQUA 5GPRA 4L4OA 5E09A 1RD6A 3NSMA 4OUEA 5LYRA 1US2A 5IFTA 1B3ZA 4P7OA 3PHAA 2DSUA 2XM1A 1QI5A 4LYRA 4AIUA 4BA0A 1QNQA 4PTMA 1NP0A 1KXHA 3W6LA 1V02E 1Q4NX 2Y24A 2C0HA 1JZ2A 1SMDA 4AZCB 1V0MA 4MNKA 1V3MA 1B1YA 4GO8A 5BRQA 1M01A 1IZKA 3AISA 4TVUA 6CGTA 2YLAA 1Q6DA 3VINA 3W24A 2CESA 4JHOA 2WWDA 1ECEA 4W8AA 1H0IA 4Q7NA 2XFFA 4PTXA 2JFEX 2VQUA 1UR4A 1CECA 3L4ZA 3U7BA 2E8YA 6TAAA 1P6WA 1LQ0A 3UCQA 4DWSB 5FD0A 4U33A 1W1VA 4JIEA 2CITA 1VJSA 3EDJA 3VIJA 2WHKA 5GNYA 1WDRA 2QV4A 2XG9A 5A2BA 4AEFA 1JXJA 1UH3A 4UZSA 1PIGA 1AMYA 4X9YA 3K1DA 3A6OA 1B3VA 5D9PA 2YBUA 2PBGA 4DM1A 1EDQA 4QLJA 5M17A 2GJXA 5AC4A 2XVLA 1H0GA 1UKOA 1UD5A 3PN8A 1GQIA 2IUZA 2X09A 3PZGA 1B31A 3BLKA 3VTRA 4TTUA 3AHZA 3CZEA 1HJWA 1UQYA 4D6EA 1E6SM 1E3ZA 5BWFA 3VIKA 1EDTA 2W63A 2RGMA 3DHUA 4XV0A 1EXPA 1G0CA 3VGDA 1J18A 1KXQA 3ARVA 1H49A 1R7OA 2V5CA 1OM0A 1CYGA 3WD3A 1WDSA 2V38A 1B3YA 1E0WA 3WDQA 3I3DA 2DH2A 1RP8A 3WF4A 1ZU8A 4BCEA 1GJUA 4J3WA 4CD8A 3T0BA 1H1NA 3W4RA 4GKLA 3WF3A 4B9ZA 2F61A 2C8NA 4ML4A 1BPLB 7TAAA 1PIFA 1V3KA 4KMQA 3AIEA 1M53A 1W3HA 2BFGA 5D8WA 2V3FA 1QW8A 4HA4A 2E8ZA 4FLRA 1XD0A 2WVVA 3O2LA 2FDMA 2HVMA 3GH7A 1W3LA 2GFTA 3ARXA 1UH2A 3EMZA 4W5ZA 3CZKA 3CHCA 1XH2A 1Q6EA 3BCDA 1HVQA 1UWQA 1JZ8A 1UQZA 1NARA 1VFFA 3IK2A 4JFWA 1J0IA 1EOMA 4ATWA 1KFWA 1VJZA 1GOMA 1BYCA 1U30A 4JZ5A 4F66A 2YKKA 3TTOA 2CERA 4JFSA 3K4DA 2ZUWA 3BAKA 1LL4A 3L2MA 5ABEA 1EGZA 1X6NA 1F4AA 5A69A 2BHUA 2XIIA 2WCSA 5A8QA 1E0VA 1XRVA 4J7RA 1J11A 1V0LA 3HU7A 1CGXA 4AD3A 3WMBA 4W84A 4UNIA 1C3FA 1KR0A 1XCWA 5C71A 3O6AA 2YIHA 1J01A 1FH9A 5GNXA 1R7AA 4AZ7A 4D6CA 3MO4A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4ATLA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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