2EXOA

Crystal structure of the catalytic domain of the beta-1,4-glycanase cex from cellulomonas fimi
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords EXO-1,4-BETA-D-GLYCANASE
publication title Crystal structure of the catalytic domain of the beta-1,4-glycanase cex from Cellulomonas fimi.
pubmed doi rcsb
source organism Cellulomonas fimi
total genus 129
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1994-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2exoA00
2XYLA 2G3IA 4D6DA 5C8BB 5E9AA 4NRRA 2EPMX 3U57A 2QLYA 3T2OA 1VIWA 1PZ3A 4XUYA 3VO0A 3WH6A 3NJ3A 4TTGA 2YDRA 1KGXA 2W61A 3HU7A 2J62A 3LPFA 4W89A 1E15A 5FIPA 2WMJA 2WW5A 4J3TA 4UFLA 3VU2A 1EO5A 3GXFA 1JAKA 1CWYA 1FH8A 4AZ6A 1Q6GA 1GOOA 1CGVA 4BCEA 1OGSA 4EAMA 3W24A 1QW9A 3W6MA 3VMPA 3K4AA 3F5LA 2YL6A 3AICA 3EDKA 4AXNA 3IJ7A 3AFBA 4MNJA 1KGUA 4M80A 1OGGA 3ECQA 3WDRA 3W37A 1AMYA 1PPIA 1Q6DA 1E4MM 2WVTA 1UWRA 2FHFA 1B0IA 1E4NA 3EMQA 3WNLA 2D20A 2FHCA 1AVAA 2WVVB 4QAWA 1FOBA 4HZ8A 1N82A 1JXJA 3IJ8A 1W3JA 1VF8A 1J12A 2O9OA 3ZJ6A 3A6OA 2V3DA 1UUQA 1TUXA 2C0HA 4DWSB 1V6YA 1VAHA 1V3HA 4J28A 4X0VA 1JF6A 3IAPA 3QHNA 4GI8A 3UG5A 2YL8A 4XB3A 1QOXA 2QF8A 3ZJKA 5D8WA 4Z2KA 1WPCA 4CCCA 2EJ1A 4TVCA 1VEOA 4PN2A 5CGMA 1GPFA 3G6LA 2BHUA 1CEOA 1SMDA 2E8YA 4LQ1A 3PZVA 3FAWA 3TONA 4ZENA 1GNXA 1PJ9A 1H1NA 3BAKA 3WF2A 5BXRA 4UQEA 1FP8A 1HX0A 3AS1A 3OBAA 4LX4A 3VIMA 3WIJA 2ZWZA 4CU8A 2VX4A 1NARA 4AISA 1V3JA 1BHGA 4AD2A 2XM2A 1G01A 3NSMA 1GZJA 2AOSA 3OLIA 1UR1A 1LG2A 4RE4A 4V28A 3RO8A 2VVNA 4QP0A 1KXQA 4CU7A 4Z2IA 3PZNA 2WMHA 2PWHA 4OZOA 2D3LA 1EHNA 4QFUA 1W1VA 5DFAA 1E3XA 4Y7EA 5BXSA 5I5RA 5I77A 5FKYA 1UD8A 2BY1A 1LL7A 3WQ6A 2CIPA 2WHLA 2CNCA 2JFEX 2VRQA 2B31A 2WNWA 3AHYA 1M01A 1XSJA 4D6IA 1XSIA 3VIJA 3OA5A 1ZB5A 3VD7A 3NSNA 2X0HA 1E73M 3AHXA 3BLKA 2E3ZA 3ZQ9A 4UOJA 3ZT7A 3UR8A 4CD8A 2ZWYA 3BH4A 2J8FA 1A3HA 3CBWA 1JNDA 3CTTA 4JZ5A 1TCMA 1W9UA 5I6SA 4UFMA 1HXJA 4AD5A 5JIPA 1ODUA 4UZSA 4FF5A 1W32A 5A95A 1IT0A 2X09A 2YBUA 1LG1A 4MJ4A 3MSGA 4QCFA 2E40A 3ARYA 3W27A 4GZJA 5BXTA 4JFTA 4AZ5A 2DH2A 4GINA 3SUSA 3IK2A 2PWDA 5I23A 1MVYA 2QMJA 3D5HA 4M1RA 2DSVA 1HKIA 2ZUUA 3AZRA 5EBAA 7CGTA 1E71M 3PZUA 1WZAA 3BAIA 5DO8A 4GO8A 3PTQA 2CHOA 1GORA 3OGSA 1JYVA 1UYQA 4PMOA 2ZIDA 1MQRA 4EKJA 1W3KA 5E0FA 3VIPA 1QPKA 1UD2A 3VDHA 4JFVA 2EBNA 4LGXA 4M8UA 2D24A 1G5AA 1L0PA 1DWHM 2TAAA 4A3YA 3AS3A 2DT3A 1ITXA 2UY4A 2YLLA 4MPKA 1ISZA 2XIIA 4UQDA 3CUGA 3N12A 3OG2A 4H7VA 3N11A 4B15A 3WFZA 2FDMA 3VIIA 1WNOA 3B8SA 4P7OA 4RL3A 1W3HA 3UETA 3ARPA 2VUYA 4IPNB 1J9YA 1QNRA 1E72M 2J7GA 3WDPP 5CLTA 4EANA 3AXXA 4P7LA 1XYZA 1QNOA 3B9EA 2YL5A 3RDKA 2BY2A 4AEFA 1B3ZA 4C7GA 2YJQA 3M46A 1HJSA 3NYDA 3WF0A 3ZJ7A 4W93A 3VMNA 1H4PA 3WKZA 2Y8VA 3F5KA 3W81A 1GOKA 3W38A 3WY1A 2JEQA 4FMVA 1IZKA 4AZGA 5HXMA 2VC9A 1E6NA 4MAZA 2WHKA 4UFJA 1DHKA 3PTKA 3VM7A 3WDJA 1HJWA 1TFVA 5BYWA 4Z2LA 4TX6A 2XVGA 1XRVA 2WAGA 2XFYA 2BHZA 3SEPA 3MUAA 2XSBA 3ALFA 3PN8A 1UQYA 5CGTA 4W8AA 1J0YA 4M82A 1W1PA 1WDSA 3OZOA 3RPMA 1MQPA 4ATWA 4U3AA 4HOZA 2DQXA 3CZGA 2J7EA 3GH7A 4PSRA 1J0HA 4D6FA 3N15A 3WMBA 3N18A 4UCFA 2WSKA 4CD5A 5A8NA 1V08A 2CXGA 2EPNA 2XG9A 5GQBA 5CPQA 3N13A 5I79A 5IXEA 5D9PA 3BXWA 3RIKA 2VOTA 4L4OA 4C7FA 2VR4A 2MANA 1C90A 2D3NA 3OGRA 4KGLA 1O7AA 4DWSC 4J3WA 4H8VA 3LPOA 4F9JA 4AYSA 3CZEA 4LYPA 2WSPA 2J7CA 3VGGA 3WNKA 3AYRA 3K46A 1I1XA 3WQ5A 3DECA 3GM8A 5BRPA 3SCTA 1C7TA 3T0BA 3ZOAA 1QI2A 3UEQA 2XVKA 2O9RA 1NWSA 3MANA 4ACZA 1V0NA 2G3MA 4HZ7A 4OOUA 3D3AA 1OIFA 2XGBA 3DYOA 4X0NA 1E9LA 2J7BA 2A3BA 5DEZA 1BVZA 4UQCA 3CMJA 5EB8A 4KRTA 1H2JA 1RP9A 4P7QA 3CHDA 4Z2HA 1SFSA 4J3SA 3T09A 1FFQA 2G3NA 4D6HA 3PZTA 3VIFA 4HU0A 4URIA 5A3HA 1H49A 2BNJA 3AMKA 1QNSA 2OYMA 2YLAA 1CDGA 3BMVA 1VEMA 5LA2A 1HL9A 1UD5A 1LWHA 2JEPA 3J7HA 3AMCA 2ZXDA 1MWOA 1R86A 3SCSA 2YA2A 4AZCA 2J78A 1HVXA 1UR4A 4J7RA 1HNYA 4H8HA 2WMIA 2VRJA 4W84A 1R87A 1B3YA 5JUVA 1BTCA 4MB3A 1FFRA 2GDVA 1KWGA 2UWFA 5E0CA 1W1YA 3WBAA 5A2CA 3A47A 4M56A 1ISXA 1HIZA 2VNCA 1UKSA 2XWDA 3WDIA 3CPUA 1OD0A 4IUGA 1E6ZA 1UR2A 1EGZA 3VD9A 1OGBA 4RE3A 4JCMA 1EHAA 1EOMA 1EDQA 4AC1X 1TVPA 3AS2A 1C8QA 3GZAA 1UR9A 1UD3A 3WQ8A 4KRUA 1E6SM 1EOKA 3BMWA 1GUVA 3AQUA 3AS0A 5F7UA 4W86A 3W28A 1GQJA 1TMQA 1EQCA 2J25A 2EPKX 1V0LA 1BYBA 1UD6A 1J11A 2ZX6A 2FH8A 5GNZA 1V6UA 2WMIB 4WSKA 2CYGA 2XWEA 3OGVA 1CLVA 5CZKA 3SCOA 1XYFA 5TD4A 1VJZA 1OT1A 1J10A 3L4XA 3CUJA 5E6YA 5A6JA 3TTQA 2XM1A 2BFGA 3WFLA 1K9TA 5HPOA 2J74A 4P8UA 4UQ9A 4LXFA 1G0CA 1YQ2A 3PZIA 4PMQA 2WVVA 4JHOA 1QI4A 1BGAA 3AHZA 1QHPA 1E5JA 4LYQA 4GKLA 4DUWA 5AYIA 2XIBA 4OJYA 2XTKA 3DYPA 3WH8A 4DWSA 2E9BA 1AQHA 1EA9C 1XGZA 5A94A 3RCNA 3FY1A 1E6XM 3DHUA 4F79A 1W91A 1D2KA 2E8ZA 4CU6A 3W25A 2VX6A 3ZMRA 3AIWA 3I3EA 4CD7A 4AIEA 1E56A 4CGTA 3MV01 1JDAA 4MNKA 5A6LA 1K6AA 3CUHA 2ZUWA 4B9YA 1JZ8A 2W4XA 1W2PA 1P6WA 4W88A 1UKPA 4BQ5A 4F66A 1BG9A 1C92A 4NI3A 5JBEA 1GJWA 4LPCA 1ODZA 4UTFA 1GW1A 1DTUA 3AZSA 1KXTA 4R27A 4GQQA 2WCSA 3CLWA 4B9ZA 4HU8A 4JFWA 1V3IA 4FLSA 1E6QM 2IXVA 3PZOA 2ZUSA 4U33A 4BF7A 4QLLA 2DH3A 3VM5A 1MW3A 3AZTA 3K8MA 3O2LA 2PC8A 4JFSA 4Q7NA 4UFIA 4V2XA 2BXYA 1AQ0A 3WF3A 1BFNA 3L4WA 3AJ7A 4WKFA 2OSWA 5AYBA 1VBRA 4JKKA 1ECEA 1DEDA 4NRSA 4HA4A 4QCEA 1R7OA 4OUEA 1PX4A 2CBUA 1CXFA 2WZEA 1M03A 3VIKA 2QPUA 3CZLA 1DWFM 4JHZA 3AXIA 3MU7A 1JDDA 4S3KA 1VEPA 3VVGA 1VBUA 5JBFA 1GOQA 4J3UA 1H41A 2PWEA 2ZXQA 1JAEA 4AW7A 3ZJ8A 4GPNA 4CCEA 4KMQA 1LWJA 2JIEA 3RILA 5AY7A 3KL5A 1CIUA 2OWXA 1M7XA 1V6XA 3W6LA 3EDJA 5A6MA 4XX6A 4Z2JA 4A3HA 3K4DA 3L4VA 3FHAA 3M7SA 1CGTA 3T08A 1FH9A 3N04A 1K9DA 3QR3A 5IHRA 4WKAA 3MKKA 3SCRA 1LLOA 4YHGA 2QHAA 3TA9A 5CXPA 2ZUMA 2EO7A 3F4VA 6A3HA 2D0FA 2Y2WA 1LF1A 1BF2A 2BY3A 1NP0A 4DWSD 3K8KA 3L4ZA 1OWQA 1DP0A 2X1IA 3W29A 1KQZA 1QBAA 2ZXAA 2OWCA 1HJVA 2O9TA 4R5EA 1UH2A 9CGTA 4V27A 1JYWA 2HVMA 1VFOA 2DSZA 2ZX5A 2VQTA 1U2YA 3WD4A 1UWIA 1D3CA 5GNXA 2V5CA 2PBGA 3ARXA 1ISVA 4MB4A 1E6RA 2VZVA 5M03A 2FGLA 5I78A 2O92A 3EDFA 4JIEA 2WVSA 2VL4A 3ZM8A 1I1WA 4TTUA 1CXHA 1TVNA 1AQMA 2O9PA 1CECA 4BQ2A 2YL9A 5IDIA 1JIBA 4WIWA 4E2OA 1JFHA 4E8CA 2J7FA 5ABHA 1MXDA 3L4YA 2XHYA 5EMYA 2DEPA 4MDPA 4PSPA 1PBGA 2DT2A 1DWAM 2F2HA 3BAXA 2V3EA 1XCWA 1QHOA 1JD9A 2VCAA 4HZ6A 3T0AA 5LA1A 1XSKA 1JZ7A 4UQBA 4D1JA 4XZBA 4AEEA 3WF4A 4MDOA 3WL1A 2E9LA 1DWIM 2A3HA 4W8LA 2G41A 4HP5A 3VDAA 1UKTA 3E1F1 4NZCA 2YKKA 3IAQA 1C8XA 1EXPA 1XV8A 3QHMA 1J0KA 1NOWA 1KQYA 4AD0A 3TTOA 1PX3A 1HVQA 6CGTA 4LYRA 1QNPA 4M81A 3EDDA 1U30A 3VGEA 4DUXA 5AC4A 2DT0A 2WC3A 5CLWA 1UZ4A 1U33A 4N0RA 5IFPA 1HP5A 1UR0A 1CTNA 2F61A 3LPPA 4ZXLA 1DWJM 3WD0A 3WQVA 4TUFA 2WZIA 3WUEA 3MMWA 1WCGA 3LMYA 3QOKA 5CJ5A 3GNRA 2J8GA 3PHAA 3KL3A 2PWFA 4MB1A 1BG4A 3ZIZA 2BS9A 1V6VA 4XZWA 3GBEA 3WH5A 1Q6EA 7TAAA 1E0VA 3A4AA 3UESA 4U31A 1M04A 2JALA 1OSEA 2DSKA 1VFMA 2WMFA 4PMUA 3VIGA 3NCOA 1HKKA 1JXKA 4UQAA 3I3DA 3VMOA 2VO5A 5A8QA 4N42A 2GJXB 4PMRA 4Q22A 3MV11 4HPHA 3WD2A 1NOUA 1C8YA 3MSDA 4DUVA 2NT0A 3RJYA 2OSXA 1WZMA 1CXIA 2GK1B 1MQQA 2J7DA 1LQ0A 3S6TA 2VJXA 3PZMA 5IFTA 3ZR6A 1W9DM 1IV8A 4MB5A 3WDHA 2E4TA 1B3WA 2DIJA 3O6AA 1NWUA 5I2UA 3UG4A 3GH4A 1M53A 2CEQA 2XPKA 2CBVA 5A6SA 4HTYA 4PMVA 8CGTA 3FXYA 1W9PA 1NH6A 3VGBA 1GHSA 2WKLA 1Q6FA 2V3GA 3AIRA 1UOKA 2JIWA 3NUKA 3CUFA 4FK9A 4KWUA 3MUY1 1ZBKA 1WDPA 1B3XA 1C93A 3VX0A 3DHPA 2X05A 2E9MA 2X8RA 2XGIA 2W66A 5DT5A 1F4AA 1E1EA 4H41A 4PUDA 3WNPA 2WB5A 2GDUA 2YIHA 3POCA 3AIQA 2YOCA 1Y7VA 2J7HA 1E3ZA 2WXDM 4JKMA 3VGFA 1HJUA 2CERA 1H0GA 1SR0A 2D1ZA 2CBIA 3GDBA 1HJQA 1VRXA 3GBDA 4U2YA 4J3VA 2WLYA 2Q8XA 1UWTA 5EFDA 1KR1A 1JL8A 2VCCA 1EQPA 2G3JA 3VUPA 4H04A 2ZX9A 3AIEA 1RD6A 1QI5A 2WVUA 2XVLA 4AD4A 4W7UA 3VD3A 1BPLB 4PMXA 1B30A 1XD0A 3AMDA 1XD1A 4CKQA 2IXUA 3AXHA 3PZGA 4AD1A 3VGDA 1ISYA 3GTNA 4PEEA 2CITA 1NWRA 3AYSA 3W26A 1VJSA 5E6ZA 4MJ2A 2FHBA 5ABFB 2ZX8A 1DWGM 2Y24A 1H3GA 3MMUA 4FLRA 1QHZA 2OYLA 4YHEA 3BAJA 1WAWA 2VI0A 3KZSA 3HN3A 1JI1A 1UA7A 3VD4A 2ZUNA 1TR1A 3QGVA 1JZ4A 2EPOA 1VFUA 3CIVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XYL A;  2G3I A;  4D6D A;  5C8B B;  5E9A A;  4NRR A;  2EPM X;  3U57 A;  2QLY A;  3T2O A;  1VIW A;  1PZ3 A;  4XUY A;  3VO0 A;  3WH6 A;  3NJ3 A;  4TTG A;  2YDR A;  1KGX A;  2W61 A;  3HU7 A;  2J62 A;  3LPF A;  4W89 A;  1E15 A;  5FIP A;  2WMJ A;  2WW5 A;  4J3T A;  4UFL A;  3VU2 A;  1EO5 A;  3GXF A;  1JAK A;  1CWY A;  1FH8 A;  4AZ6 A;  1Q6G A;  1GOO A;  1CGV A;  4BCE A;  1OGS A;  4EAM A;  3W24 A;  1QW9 A;  3W6M A;  3VMP A;  3K4A A;  3F5L A;  2YL6 A;  3AIC A;  3EDK A;  4AXN A;  3IJ7 A;  3AFB A;  4MNJ A;  1KGU A;  4M80 A;  1OGG A;  3ECQ A;  3WDR A;  3W37 A;  1AMY A;  1PPI A;  1Q6D A;  1E4M M;  2WVT A;  1UWR A;  2FHF A;  1B0I A;  1E4N A;  3EMQ A;  3WNL A;  2D20 A;  2FHC A;  1AVA A;  2WVV B;  4QAW A;  1FOB A;  4HZ8 A;  1N82 A;  1JXJ A;  3IJ8 A;  1W3J A;  1VF8 A;  1J12 A;  2O9O A;  3ZJ6 A;  3A6O A;  2V3D A;  1UUQ A;  1TUX A;  2C0H A;  4DWS B;  1V6Y A;  1VAH A;  1V3H A;  4J28 A;  4X0V A;  1JF6 A;  3IAP A;  3QHN A;  4GI8 A;  3UG5 A;  2YL8 A;  4XB3 A;  1QOX A;  2QF8 A;  3ZJK A;  5D8W A;  4Z2K A;  1WPC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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