2OJPA

The crystal structure of a dimeric mutant of dihydrodipicolinate synthase from e.coli- dhdps-l197y
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
292
structure length
290
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGTTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSRTGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIEATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQYGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINERLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title Evolution of quaternary structure in a homotetrameric enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 103
structure length 290
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2007-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ojpA00
5F4WA 5AHFA 3BG9A 5F4XA 3MYOA 1WOAA 1AW2A 3HGJA 4X2RA 4FX6M 1GQNA 3OVRA 5G5IA 1QWGA 4JICA 5KSWA 3L2IA 1L6SA 3S1XA 3KOFA 2BX7A 3LGEA 8TIMA 3ABSA 3QEZA 4K8HA 4UNKA 2Z1BA 1K8ZA 3C2RA 3IIZA 3Q2DA 4N6EA 1Q6RA 1ZJIA 2P1FA 3NGJA 3C2OA 1XBZA 1LROA 3GR8A 3C61A 4PEKA 4UTUA 3LLDA 1IIGA 4AAJA 3NG3A 4E2DA 4W9TA 4KFOA 4QITA 2V9DA 3L66A 4O14A 3IIXA 1VH7A 1PCKA 2WPBA 3W75A 1VYPX 4UMBA 2OX1A 4Y9AA 1H7XA 3UYCA 3OG3A 2GUUA 2VFHA 5DBTA 3TAKA 3H54A 2E77A 5FEXA 4WXYA 1TPWA 1KV5A 2XN2A 2Y62A 4LS2A 5I3JA 3N9SA 4JX6A 3TX9A 2ZZ4A 4DF2A 4LVFA 4LNYA 1TV8A 3W70A 3W7OA 3W7IA 4UFLA 3FLUA 1F6KA 3EKZA 1WX0A 4XBKA 2FDSA 3W23A 5FF7A 1U83A 1R2SA 4QNWA 4WOQA 4QNEA 4GUJA 4JTJA 4NXSA 3CM4A 3FKKA 1GZGA 3GB6A 4DF1A 2B7QA 3W7GA 4FIQA 1K3UA 4DPPA 2NWRA 5AYXA 1GG0A 2PRHA 3NPWA 5HJLA 1W8SA 3ABRA 3PC0A 1G4EA 4UTLA 1EIXA 3W7DA 1EWEA 4IPIA 4DXVA 4TIMA 3TW6A 1IXPA 1NEYA 3FYPA 3NNTA 3S42A 1KFJA 1MEHA 1XL9A 3W2MA 4IMCA 1L6YA 4CNPA 4MZ1A 4JY8A 2OT0A 1HUVA 1FDZA 3W71A 3LHZA 1YPFA 5D2TA 3HPZA 5EKYA 1UUMA 4OV4A 1VYRA 3BO9A 4UTIA 4M7SA 1BEUA 1QAPA 4DO5A 1K8XA 4EWND 4AWUA 1W5NA 4ALDA 1OFQA 1OYBA 2BWGA 3EEGA 4AVFA 2DP3A 3D0CA 3GDLA 2YR1A 3HJZA 1T8XA 3R89A 4QJ1A 4P61A 1TMHA 3O8AA 2FFCA 2QR6A 2X1TA 3LHTA 1JCLA 2VEKA 4I7UA 3BLEA 4JY9A 2VOMA 3N73A 4MFDA 4PH6A 3EWWA 3UZJA 1NF0A 2FPYA 4N4QA 2A7NA 3KHJA 1HO4A 4Z0SA 2G5WA 3FOKA 4IUOA 2I9EA 4AHPA 4X3ZA 2V5LA 1GVOA 4LS0A 1VJIA 2QCDB 5FEWA 5AYZA 1TJPA 3M47A 3UWZA 1K7XA 3IVUA 2TPSA 3HGOA 3MP4A 5KTLA 3VCRA 5BMWA 5GVJA 2Z6JA 4MYXA 5K4ZA 1DQXA 5HUOA 1BWKA 1CW2A 3NYZA 1SUXA 2YX0A 3BPWA 1JR1A 1Q6LA 4K39A 3C2VA 2C15A 1FCBA 2I1OA 3S1VA 3FJ6A 4IMEA 1OFAA 3G1DA 3TIMA 2Y85A 2Y61A 4MZYA 4GFSA 3C4UA 4O1CA 1BWLA 5AC8A 3UPWA 1ICSA 3TJXA 3STGA 1D9EA 4NJHA 3FYOA 4XKYB 4QAIA 3P5YA 3P62A 4M5PA 3W6YA 1OFOA 4JTGA 2PRMA 3UPBA 3LI0A 4LT9A 1AL7A 4TO8A 1VGAA 4GC4A 3S1WA 3BARA 5L6UA 3N14A 1FDJA 1W0MA 5G2HA 2ISVA 3P7YA 5K4XA 2UV8G 2BSLA 2VELA 3DHFA 1S5WA 3DHDA 5D33A 1TRDA 1QPQA 4JNMA 3S5NA 3G24A 2V81A 4TR9A 5EY5A 3DBPA 4L4LA 3U2OA 4HNNA 3LTYA 3DFPA 3FS2A 4POCA 1JCXA 1ME7A 3W87A 1XBYA 5D03A 2VFIA 2WNNA 2A2IA 3NO5A 3LCLA 3LCIA 3W74A 1TTPA 1XI3A 3DFTA 1LBLA 3CWNA 1JULA 5I3FA 3A22A 2XN1A 3LLFA 3DH7A 3IGUA 3KVKA 1SFJA 3R13A 1W3IA 2E68A 1FX6A 1H63A 1GOXA 3DXIA 2Z0IA 3BVJA 4NU7A 1Y0EA 2ZRWA 3I7QA 5F1UA 3G1AA 1OF8A 3MO7A 4DBEA 3PAJA 1F74A 1SZNA 1J4EA 3SIZA 1OFEA 2QF7A 1H5YA 1KM6A 3TCEA 4XTIA 1P5BA 1SW3A 2VFGA 3L65A 1SO5A 3QMRA 3RK8A 5KZDA 4AHOA 1SSGA 4M6VA 1OX6A 1G67A 4WY0F 1OF6A 2YDAA 4N2YA 1N55A 1BKSA 2FJKA 3PY2A 3DKJA 1KM2A 2C0AA 3DENA 7TIMA 5HWMA 4IJBA 3LXAA 1C8VA 1G69A 4QSHA 1P0NA 4JTKA 3GAKA 4S2CA 1I2OA 3W07A 3W1PA 4A3UA 1X6UA 1ZAIA 1DVJA 4Y8FA 5C2XA 4EVZA 4E2BA 4FXRA 3IVSA 2CU0A 2J24A 3DAQA 3O63A 2WSYA 4MY9A 1U5JA 4WY0A 1OFPA 1SSDA 1E51A 2W6RA 4ICNA 1D3HA 4UFHA 5E1QA 5D05A 2C3ZA 5G1TA 5AHMA 1QO5A 1UJPA 2TSYA 4N6FA 4O52A 1C29A 5F2IA 3MW7A 5CSSA 5D2VA 2V5BA 2EAWA 3TNOA 3VE7A 1TPH1 3NEVA 3NQ2A 3KVLA 2A85A 2B7OA 4BR1A 3B0UX 2H3BA 4O18A 4JTEA 2VXNA 3C0JA 4ORIA 2FTPA 3TH6A 4HNTA 3LHYA 4LRTA 4RXGA 3G8RA 4GNJA 1FWWA 4OWGA 1TQJA 2VFDA 3LCGA 5TQLA 1ZCOA 4U28A 4JIQA 2YSWA 2DZXA 4HPJA 4JYFA 3WJSA 4IXXA 4O16A 4O4VA 3NPUA 1TTIA 4OU1A 4RZ5A 1RR2A 3GDKA 3TR2A 5CZSA 1S5TA 4Z0JA 1SZEA 5AHEA 1WDWA 3E02A 2QCEA 2JBMA 5FF2A 1H61A 2QDHA 5D38A 5F2MA 4AF0B 3V1PA 2DZUA 1GTEA 4UTHA 5CPLA 3GXTA 3W7EA 3F1QA 4JD4A 3LV6A 3BGJA 3NM3A 4AXKA 4LRSA 3RLUA 4NZFA 3BGGA 3S0CA 1O60A 2V82A 1TPC1 4LUIA 5EMUA 4IWWA 4DBDA 3L5MA 2A6LA 4IX2A 1DV7A 1H7OA 4R53A 2FLIA 3OVPA 4MJMA 3GXNA 2HMCA 3P61A 4XQ6A 5AOUA 1EA0A 4JX5A 3N3MA 5LGZA 3U8GA 2NWSA 3ZR4A 3HQ1A 5CPOA 3ZWTA 1YDNA 5D32A 3WJZA 4YL2A 3GR7A 4Y6GA 4NX5A 1Z48A 3BW3A 5AN7A 1XFBA 3TFXA 4K7YA 1DOSA 1WQ5A 5CKSA 3PSWA 2VEMA 4OT7A 4FNUA 2A7PA 4BF9A 1RV8A 3R12A 3G1FA 3T4CA 4HHPA 2ZZ1A 1N7KA 3GDMA 4IXHA 5DY3A 4CCEA 2PCQA 2GVJA 1P1XA 4K6AA 5HULA 3SGUA 5AB3A 4Q4KA 2YYTA 2DZSA 4A22A 1WV2A 1DBTA 1QOPA 1TIMA 3F4NA 3EWXA 2G95A 3UD6A 3HG3A 3GAYA 3WJWA 4K37A 3QQ0A 1QDSA 4O57A 4WJEA 3N34A 1SFLA 1SPQA 2ABBA 2X16A 3NOEA 5CSRA 5J5RA 4ZMGA 2DJLA 4KWWA 3IIOA 4FX7A 2ZZ5A 4HPXA 4UCGA 3NDOA 3O6YX 3MI6A 2WSRA 3PSVA 3QMSA 5D09A 3I7SA 1LLZA 4TX9A 3QZEA 3EX1A 3HOJA 2E5DA 4NZJA 3W1LA 1JJKA 1LCOA 1LYXA 1N8FA 3NQMA 4AMAA 3IEBA 3EX3A 1IIHA 3M5ZA 1WBHA 2ATSA 5DY2A 4MPQA 3TSMA 5L9FA 1OX4A 4DO6A 4XUGA 4UR7A 1S5VA 3UZ5A 4L4MA 3NPXA 2YXGA 2Y7GA 2ZZ7A 3TMLA 5K9CA 1W5MA 1SU5A 2GQ9A 2VEPA 3CLMA 1QNVA 2GVGA 3T40A 5BRBA 1W54A 3A21A 2A21A 3RNDA 1CX9A 4YMZA 3T78A 5DCDA 3T44A 1RQBA 2QDGA 4UTKA 1HL2A 4Y96A 5HWNA 1ZHAA 1QMLA 1LRTA 3LHUA 4NUWA 2ISWA 1I2NA 4PC8A 1O4UA 4PA8A 1KFEA 3HG2A 4LUJA 1JCNA 3VE9A 3G3MA 3KRUA 1FXPA 2OZ0A 3W1UA 2OCZA 4FEZA 4O4WA 3NQGA 1FBAA 2EHHA 3VKJA 1A53A 1T96A 3L0NA 1FCQA 4ZVJA 4FXSA 3LBMA 2NX1A 1LRNA 4Z08A 2E1DA 4M7TA 4AH7A 3KVMA 4XBSA 5CPMA 3C8FA 3NQEA 4NT0A 3MWAA 3TROA 1R2RA 3M0ZA 2NLIA 1Q6QA 1G4PA 1MO0A 4YLWA 3W1TA 4GRSA 2Q3OA 1H60A 2X1UA 3RU6A 1KFLA 3LDVA 5AHLA 2H3DA 4A21A 4C1LA 1H50A 1VQTA 3IVTA 3KAOA 3ATYA 1OK6A 4N4PA 4DPQA 3NQCA 3CPRA 5LKYA 3T55A 1AK5A 1YLVA 3T7VA 3LI1A 1AW5A 4I7VA 5DN1A 2QKFA 1I2RA 1ADOA 3PULA 3SW6A 3A24A 4TU1A 1XDLA 2NUXA 1Q6OA 5BNKA 2ZRXA 1KBIA 5BW6A 3OA3A 4CQ9A 4OHQA 2E6YA 4RZ4A 5FESA 1OHLA 4FNSA 5LHFA 1MEIA 1I4NA 3TMQA 2QAFA 3GKAA 1T0OA 4O1AA 2PE4A 4WD0A 4OQVA 2E6FA 5K2ZA 3TXVA 3MP3A 4UTTA 3WK3A 1EPXA 4EF9A 1FWSA 3VI2A 1RZMA 3R2GA 1TPDA 1FDYA 4JTUA 1XC4A 3W7LA 3W84A 4GUFA 5LNSA 2J9ZA 3B05A 3F03K 1KTNA 1HFBA 6ALDA 5D2WA 1K8YA 4Q33A 3IGSA 4N9BA 3SZ8A 1FY6A 4H4IA 3EXSA 3HGRA 1THFD 5I3HA 2ZZ2A 3OBKA 3DFOA 2ZA3A 4O0ZA 5F1VA 1PV8A 4FNQA 2YYUA 5F2GA 3W83A 3STFA 3PBUA 1VYSX 3QJAA 3GKFA 2J88A 3LCWA 5EBUA 3W3OA 1JRBA 5BOOA 4DEFA 2EF9A 3QW3A 3MBFA 2GJNA 1PL9A 1ICQA 1XBXA 3GVGA 3L21A 3P5ZA 2ZTKA 4Z1DA 1YDVA 3THAA 2C19A 1FCUA 4CQ8A 1OYCA 5D37A 1B4KA 2RDWA 1X8FA 4OE7A 1RQEA 2H6RA 4IPJA 2YPIA 5TBOA 1OVDA 1VR6A 1PIIA 1L6WA 3NM1A 3NA8A 4XZ9A 4QM1A 4DQWA 3GDTA 2NV2A 1LTDA 4O28A 1VZWA 3Q94A 4AHQA 4UTMA 2Z2UA 3NL6A 3QQ1A 5KINA 3HB9A 3PB2A 4AWTA 1NSJA 4A2RA 1EB3A 3EXRA 3LOTA 3JS3A 2WNZA 5LSMA 3H53A 4YCOA 1ZFJA 3IRDA 3BW2A 3L68A 1TSIA 3LTPA 4B5NA 4N9EA 1RVGA 1AMKA 4O54A 3UXAA 4RV8A 2EGZA 4IQLA 2YGYA 3W7RA 4ORMA 2OJPA 1ME9A 5DLCA 3EX6A 4AWSA 1QCWA 1D3GA 4IX0A 1KM3A 4H6KA 1GEQA 3TC6A 2FIQA 1OFBA 2Y70A 3L67A 4HSOA 4GJ1A 3LCHA 4U4MA 3JR2A 1GVFA 1AL8A 2WV8A 1YPIA 4FX8A 2VENA 3LRLA 3STEA 3DGRA 4NNAA 4CNNA 5D2YA 4E38A 4NNBA 3W2UA 4FB7A 2P10A 2E6AA 2RKXA 1GPWA 4Y90A 4ZQPA 1K02A 5D02A 2WSQA 2JKEA 4AB4A 3W1AA 1WBJA 5SWUA 3CWOX 5K9XA 3FFSA 4WZHA 5EL1A 3CU2A 5I3GA 4WY0B 3B0PA 3MP5A 3NXFA 4J9JA 3I68A 2ATMA 4FIRA 2G96A 3DI0A 2NX9A 3B06A 3SFKA 1S3HA 5KZMA 4GUIA 3CC1A 3ZFHA 1YDOA 4A2SA 5E93A 2HS8A 1W37A 5KZEA 5MHBA 3KRSA 2TMDA 3QSRA 3IGXA 4M6QA 1LOLA 3HPSA 3W2NA 2WQPA 1OFRA 3E0IA 1IXOA 4JDYA 2Q3RA 2CZ5A 3FEMA 3MHGA 3M43A 2HS6A 2FB2A 3G1VA 4NNCA 3M7WA 2C14A 2ZRVA 4MLRA 1JCYA 4K38A 2QCCA 3LCXA 3QW4B 1OFDA 3N2MA 2QCLA 3ELFA 3PB0A 3Q58A 2VFFA 3QRHA 2P0OA 5F4SA 1KFBA 2ZQ0A 4MJZA 1GG1A 3VNDA 4ZQCA 2TRSA 3QFEA 3TC7A 2FQIA 1FQ0A 2RHGA 5DELA 4MY1A 5D30A 4JYDA 5G2IA 1H7WA 1K03A 2A7RA 4MUZA 3WFAA 3O6CA 3BG3A 1WOBA 3M9YA 3O16A 4O19A 1O5XA 3U6WA 1HO1A 4GBUA 4Q32A 4RJEA 5FF3A 5KMYA 4K36A 3M5YA 1NAL1 1O94A 2CLHA 3CEPA 2JGQA 3TUUA 3W22A 2CLIA 3MMTA 3DFQA 1PS9A 1YXCA 4ZQMA 3WK0A 2NXHA 3G1YA 4PCFA 1W31A 3ZS4A 2V2HA 4FNTA 5IBXC 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BFN A;  4RDV A;  5AHF A;  4JBR A;  1HF6 A;  1B90 A;  3TA9 A;  3F5J A;  1WOA A;  3RHG A;  1Z6K A;  1ZBV A;  4H8V A;  4FX6 M;  1FH7 A;  3IGH X;  2XZ7 A;  5G5I A;  1R0M A;  4GYP C;  5KSW A;  3L2I A;  2WZT A;  3ABS A;  1FTX A;  3C2R A;  3Q2D A;  4AC7 C;  4DNM A;  4QTG A;  1K9D A;  1LJY A;  3N2C A;  2ACS A;  4IH3 A;  4UTU A;  1H3G A;  1Q6F A;  4XVE A;  3LLD A;  2ODO A;  1AH4 A;  3QV6 A;  4QIT A;  3NSM A;  7REQ B;  4FMV A;  2V9D A;  1R5Y A;  1D3C A;  4O14 A;  2ZUV A;  4HU4 A;  1VYP X;  4PUU A;  4UMB A;  1BVN P;  2KAU C;  2OX1 A;  4Y9A A;  1H7X A;  3U2C A;  3OG3 A;  4AG0 A;  3TAK A;  5FEX A;  2E77 A;  4WXY A;  4AWE A;  4K1W A;  1Q4N X;  4LS2 A;  1CZ1 A;  1VAH A;  2ZZ4 A;  4DF2 A;  2WMH A;  1XCX A;  1TV8 A;  4URI A;  4ZO7 A;  3EOO A;  4GC3 A;  1SJD A;  4XBK A;  3JUG A;  2YB4 A;  4JTJ A;  2PWD A;  1GZG A;  3GB6 A;  2J6V A;  4HVX A;  2QGH A;  5AYX A;  1MW3 A;  1W8S A;  2D24 A;  2PWE A;  4B5U A;  4IGN A;  4UTL A;  3U5Y A;  3W7D A;  4PSP A;  3L4V A;  2J25 A;  1BSI A;  1E72 M;  1UOK A;  3ERP A;  3NNT A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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