1KA9 | Genus

Total Genus 83

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	83
sequence length	251
structure length	251
Chain Sequence	SLAKRIVPCLDVHAGRVVKGVNFVNLRDAGDPVEAARAYDEAGADELVFLDISATHEERAILLDVVARVAERVFIPLTVGGGVRSLEDARKLLLSGADKVSVNSAAVRRPELIRELADHFGAQAVVLAIDARWRGDFPEVHVAGGRVPTGLHAVEWAVKGVELGAGEILLTSMDRDGTKEGYDLRLTRMVAEAVGVPVIASGGAGRMEHFLEAFQAGAEAALAASVFHFGEIPIPKLKRYLAEKGVHVRLD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	imidazole glycerol phosphate synthase
publication title	Structure of Imidazole Glycerol Phosphate Synthase from Thermus thermophilus HB8: Open-Closed Conformational Change and Ammonia Tunneling pubmed rcsb
source organism	Thermus thermophilus
total genus	83
structure length	251
sequence length	251
ec nomenclature	ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2001-11-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
F	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1ka9F00

3EX4A 5HUPA 5KTLA 3W1AA 1W37A 4O4WA 1K03A 4LW7A 2QAFA 5BNKA 1Z41A 1WXJA 5D2XA 3UWUA 4HHPA 1Q6OA 2ZFAA 1BWKA 1SZNA 4UTTA 3DZ1A 3E96A 3QFEA 1WOAA 5K2ZA 3ABQA 3DU0A 4NNAA 4BK9A 5G5IA 3TAKA 4CQ8A 4CCCA 3IIVA 3W2MA 5AHLA 1VZWA 2WSQA 3BVJA 4I7UA 3SGUA 3LHUA 3QPZA 3GZ3A 4E2BA 1TPUA 2FIQA 2H3DA 4HN4A 1UASA 3W84A 5D33A 5AHEA 3KX6A 1OYBA 3M47A 4RCXA 3NQ8A 3SJ3A 3NQ2A 3HPZA 4E0CA 2QCLA 1JCJA 4Z0SA 2X1SA 1KFJA 5C5YA 3W1XA 3QJAA 4UTTC 3DKJA 3USBA 5CKSA 3T55A 1SZGA 1XUZA 2R94A 2X16A 3LTSA 3VI2A 1TPVA 3QYQA 1XBZA 3S42A 1W5NA 1Z44A 5F2IA 1RQEA 3LCIA 3TW6A 3TSMA 3G22A 2CLHA 4UFMA 5D2VA 1R2SA 3LRKA 1TTQA 4K39A 4RZ5A 3GVGA 2EAWA 3TJLA 4ZQPA 4MLRA 3W2JA 4GBUA 4MZYA 1P0KA 3VKJA 3G1XA 3L9CA 3RU6A 2Y70A 4JTIA 5FF4A 5HNRA 3W7DA 4RX0A 3W1PA 2J9ZA 4OT7A 4R33A 3CWNA 4N6EA 4JEQA 2QJIA 3BPWA 4Q33A 2NUXA 2B7OA 1WAUA 3GDMA 3KRUA 3OEXA 4W9TA 5I3GA 3RLUA 2QDGA 4AH7A 1EEPA 3W76A 1B57A 3A23A 4YXGA 5J5RA 3G1YA 3WK1A 2WKJA 2WNNA 4FNPA 3NNTA 3F1QA 2FFCA 3GKAA 5F1VA 4O15A 1SSDA 3IIZA 2OX1A 3PULA 5F4WA 1KFEA 2I14A 1EB3A 2EHHA 5TIMA 1JCNA 4XWUA 5C55A 4IQLA 1HO4A 4PEKA 4LS0A 2ZZ5A 1LDCA 2ZA3A 3P67A 3C2RA 5AYZA 1R30A 1XFBA 2CWNA 1OHLA 5CSRA 2DORA 4JTLA 5DELA 3W75A 4O52A 1GQNA 4UTMA 2VOMA 5D03A 1DKWA 3PF3A 4RZ4A 1FWTA 1SFLA 1VC4A 3G1VA 3O1NA 2V5LA 4ZZ9A 5J5DA 5LNRA 3W7JA 4C1KA 4G1KA 1LORA 2RKXA 3N19B 3S5ZA 4J9JA 2DP3A 3LV5A 3N3MA 4QNEA 2NV1A 3MMTA 1G4TA 1TPH1 5FEPA 4N4QA 2QCEA 3N2XA 2FPTA 4DBEA 3W88A 2Z2UA 5BMWA 2C18A 3UQNA 2GQAA 1Z42A 2QCHA 1N8FA 3NL6A 3TKFA 5DLCA 4UFIA 3BO9A 4K7VA 4GUFA 3OG3A 1KV8A 2OT1A 2CZEA 3WJWA 1VQTA 4XZ9A 3W7NA 6TIMA 4UCGA 2V30A 1G4PA 4LS2A 3R12A 1I8JA 3M6YA 4K8EA 2J6XA 1KM4A 2V82A 2BXVA 1WQ5A 1W54A 1XKYA 2XN0A 3MP5A 3TR2A 1TO3A 1LOQA 1G7VA 2NXHA 1K8ZA 2ZRWA 2PRMA 3DHDA 1G6CA 1GVFA 3Q37A 3EXRA 2WQPA 2VFGA 1BKSA 3UWZA 4JTUA 1ZY9A 3FJLA 1OFQA 1KM3A 2VELA 3SW6A 5DCBA 5IM51 4EWND 1I2QA 1F2JA 1GG1A 3S5OA 3A5FA 1BTMA 2J24A 2WJZA 1MXSA 1XBVA 4Z0JA 5HINA 3DFPA 1KTBA 2WPBA 4UMBA 4ADSA 3U8GA 3ZFHA 4AVFA 3GAKA 4ALDA 4O12A 1B4EA 1GVQA 1TJRA 2A21A 2NXIA 3L0NA 4UFJA 4N4PA 3T4CA 5AHIA 4FIQA 2FPVA 3NM1A 5G1YA 5F1UA 4LRSA 1VCVA 1JVNA 5LNVA 5FF0A 3YPIA 3LTYA 3QSTA 2ISWA 3NPWA 3MWAA 2ZZ2A 2BTMA 4NNCA 3W7HA 1ML1A 1QPNA 1ZENA 1GEQA 3QZEA 3OA3A 2YSWA 3DKLA 1OG0A 1THFD 4M6VA 4WY0F 5CZ0A 3PG8A 1C9DA 1R46A 3H55A 1NF0A 2WSYA 5L6UA 1YDVA 2A6LA 3LCXA 5AC7A 4UFKA 3W7MA 2Y7GA 3O06A 1PCWA 3B06A 3KVKA 4OV9A 4WD0A 3LX9A 4CNPA 4GUGA 1M7OA 2TYSA 2YZRA 4P61A 1QFEA 4JIQA 3ABSA 1QCWA 4N2YA 2EKCA 1ZAIA 1YTEA 3W7IA 2GPTA 2H6RA 3LCFA 1JUEA 4MOZA 2CLEA 5HULA 3P80A 4FX8A 1QNVA 1HTIA 3HG4A 5G4EA 4UTUA 5DBUA 1PV8A 2JGQA 3TROA 1IF2A 1XM3A 4MZ8A 1EUNA 3NL2A 1P0NA 2FPYA 2B0MA 3UZJA 4WY0B 2GVLA 5G2IA 2YFNA 4NVTA 2OZ0A 5BRBA 3EX2A 3NO5A 3LRLA 5AC8A 6ALDA 3EWYA 2E6YA 2BSLA 3NVTA 5CSSA 1YPIA 4Y96A 3E02A 1O4UA 4A22A 1K7FA 1RD5A 4Y8FA 1K7XA 2A4AA 5D09A 2ZZ1A 2PC4A 2C0AA 5TBOA 3O6YX 1ZAHA 3N9SA 4O17A 4LY8A 3I7SA 1JCYA 1ADOA 5FESA 4JTJA 1VHCA 1OX6A 4N9CA 3UY7A 1GT8A 3MW7A 3BV4A 4UUIA 2QUVA 2YPIA 3LRMA 1TYGA 1S5VA 4WQ6A 1EWDA 3DH7A 3UWQA 2HTMA 1L9WA 1JULA 2VFIA 1OABA 4IOTA 5K9XA 1ZCOA 3PUEA 1BWLA 4NZJA 3P7YA 2X2GA 4D2JA 3TC6A 4GUHA 1KM1A 5EMUA 1GVOA 4JTKA 3GR8A 1QMLA 2F7FA 5H2ZA 4GXMA 1TB3A 3MI6A 2ZDRA 4KKXA 1GJPA 3UPWA 3NM3A 2YR1A 1H51A 1L6WA 4LUJA 3PY2A 3BARA 1TPB1 3W86A 5DXXA 2VENA 2NUYA 1QOQA 3QEZA 1KTNA 4O4VA 3C6CA 1KBIA 1KM5A 3RLVA 1FCBA 1WX0A 1ZFJA 2ZA2A 3R89A 4QQ3A 3TFXA 1N55A 3G1AA 1QPOA 2QCMA 4PCFA 3DFQA 4A2RA 2OT0A 4U28A 4PODA 4YWIA 3E12A 2G96A 1F6KA 2FTPA 3N34A 4KWVA 5EBUA 1U83A 2Q8LA 3L65A 1JUKA 2A5HA 1W3TA 4JTGA 2E77A 1RPXA 2YGYA 4M7TA 5FEZA 3B0UX 5D37A 2EF9A 1GVSA 3FYPA 4MZ1A 3MYPA 5AYXA 1GYNA 2LLEA 1LTDA 1TRIA 5EYWA 2DZPA 5FF2A 2QUTA 4GE8A 4WXZA 4O1CA 3L0KA 4ZQRA 4UTIA 4AWSA 3M5YA 3G0XA 4O54A 3CHVA 3E9AA 1DOSA 3LLFA 1FX6A 4MFDA 3EB2A 1O5XA 1P5BA 2GVJA 1ME9A 4NJKA 3F4NA 1ZJIA 3A24A 3PSWA 2A85A 1SZEA 3LBMA 3QMRA 2B7QA 2E09A 4NZFA 1OF6A 1ICPA 3C61A 3HO8A 4NT0A 5I3KA 4FXRA 4WJEA 5MHBA 3GAYA 4LT9A 3W7CA 2QF7A 1LROA 3NG3A 3NZ1A 4UNLA 4CQ9A 1CX9A 3G1SA 3LI0A 3NQEA 1XUUA 2RH9A 3DXIA 3MO7A 5SWUA 4CNNA 4I7VA 3M43A 3O6DA 1X6UA 2KZHA 3TSDA 1OFEA 3W07A 5KZMA 2W6RA 3O07A 4PFMA 4FNUA 3MI2A 1DL3A 1PE1A 2NXGA 3NEVA 4MUZA 1ZNNA 5CPNA 2PRLA 1A5SA 4PL1A 5K9CA 3HPSA 3GNDA 1KFCA 2ZRYA 1D3HA 4LVDA 3LBCA 5D32A 2Z0IA 1TRDA 4RLIA 2G95A 1D9EA 3LXAA 4O0KA 1W8SA 4KFNA 5LNSA 2I1OA 3CT7A 2ZRXA 3H53A 4JY9A 4O19A 1SFJA 3SR7A 2FB3A 4NX5A 5AN7A 2VFDA 3DI1A 3LLDA 5K4XA 4IMGA 1J2WA 3S1XA 3NA8A 2A2IA 3TX9A 3U6WA 1SO5A 3ZWSA 1FBAA 3M16A 4YCOA 3GLCA 4IUOA 4AHPA 5DXYA 4NJGA 4HSNA 1R47A 1P4CA 4UR7A 2NZLA 3PBWA 3TJXA 1JRBA 1MSSA 2A6NA 4DPQA 3LGEA 3FIGA 4EIVA 5G1TA 2YDAA 5TQLA 3SGZA 3STFA 1OFRA 2QCDB 3ATYA 1PS9A 1GYLA 3RK8A 4WZHA 3LB0A 1B4KA 2C14A 4MY8A 4K6AA 4LVFA 3MHFA 2RDUA 2ZA1A 4FO4A 3THQA 4L4MA 1W5QA 4O57A 5KMYA 2O7QA 3W23A 3W7OA 2E6FA 3GX9A 1JJKA 3MP4A 1YTDA 5DCEA 2ZRZA 5AC6A 1L2UA 1RQBA 3WJYA 1TQJA 1UBSA 2XN1A 1I2NA 2NUWA 4MY1A 4O0ZA 4KFOA 1XBXA 4YMZA 4GUIA 4LV9A 1H5YA 3IEBA 1TV7A 1I4NA 4Z1AA 4WX2A 2YW4A 1UUMA 2Z6JA 5U7SA 4NXKA 4JX4A 3QC3A 4O50A 1FCUA 1LCOA 4TX9A 5CGQA 1EWEA 2Z6IA 2AAMA 5KINA 3L5AA 4UR8A 2P0OA 4JX6A 3BLFA 4PTNA 3WFAA 3DENA 1TPEA 3SZ8A 2FLIA 2NLIA 3C0JA 4PH6A 1TIMA 2TPSA 2ZBTA 1F05A 4JIPA 5HWMA 3NXFA 5FI8A 4A29A 1GPWA 2C6QA 1JR1A 3B4UA 3NQ6A 2OJPA 3GK0A 3O05A 4RK8A 3IVSA 4GWEA 1F6PA 4RXGA 2R8WA 1OX4B 4O1AA 1LRQA 1AW1A 4GRSA 3W7GA 3JS3A 4IX0A 4YLWA 2QCCA 4A21A 1DJNA 3KVMA 3FKRA 4GC4A 3QSRA 2C15A 1OFAA 3HQ1A 3NR0A 2J27A 2CZFA 3NQVA 1FCQA 4UTHA 1DJQA 4JYFA 2TRSA 1OK6A 3CWOX 1HL2A 3LTPA 4JD4A 5D05A 4UNKA 3IGXA 3FS2A 4ZQCA 1H63A 4XTDA 1EP1A 1KM6A 3W1NA 3GXPA 2YXGA 1W56A 5I3JA 3P74A 2OCZA 3MBDA 5LNUA 3G24A 1KM2A 2ISSA 4HKPA 4HIBA 1FWWA 3S8HA 5AHMA 3CTLA 1M5WA 4L4LA 4NX0A 4N9EA 3OBKA 1TV8A 4EF9A 2YYTA 4IPIA 2ZCGA 3EX6A 3MI3A 1PIIA 1A5CA 1TPFA 3KRZA 4UFLA 1F73A 4XTIA 2JKPA 1I45A 3B0VC 3HIJA 1NSJA 1W3IA 5D04C 1IXPA 2DZTA 1JCMP 1GVRA 3BG3A 1SW0A 2CZDA 1UCWA 4RZ6A 1TMHA 1GG0A 1X1OA 3V75A 4OV4A 5A5WA 2V8ZA 4I7WA 1MZHA 3LM7A 4UIOA 5CZJA 4EF8A 4ADTA 2X30A 4Q32A 2GQ9A 4LC8A 3WJSA 5DBTA 4IMCA 1EX5A 4R34A 4AHQA 2QCDA 5AFDA 2Y62A 3STCA 3M41A 3HGJA 1OX5A 2VKZG 3W7RA 3SY5A 3M7WA 3C2OA 4E38A 4O11A 4HNUA 1HUVA 1SW3A 4AEOA 5K4ZA 2I9EA 3AO0A 2F84A 1XCFA 5I3IA 2Y63A 5F2LA 4LWWA 4JGDA 3N2MA 3UD6A 2NWRA 1KLYA 1S3HA 4QM1A 3W1LA 1I2RA 3S6DA 1AL8A 3A9IA 3ANYA 1YYAA 3W1RA 4JDBA 3HGRA 1WDWA 4DXVA 2ZZ7A 3IVTA 1KM0A 2Y85A 1AW2A 1SO6A 5FEXA 5LKYA 3W3OA 1L6YA 3HB9A 2DJXA 3DFNA 3S5NA 1QR7A 3EWBX 4CLMA 3BLIA 2PURA 1JCLA 3UNDA 4H6KA 4AF0B 1LZOA 3CU2A 1LBFA 2EGZA 3PB2A 5C2XA 4KWWA 1OFPA 2ATMA 3CIXA 1EUAA 4MYAA 4XQ6A 2PCQA 2Z1BA 1SR9A 1TTJA 2G97A 3A21A 3W1QA 3PUOA 2C1HA 2QR6A 2DZXA 1PCKA 4WUIA 3CB8A 3GYEA 3P61A 2H3BA 1H7NA 3H54A 1AMKA 3QQ0A 3LHVA 4M19A 3TFCA 1YLVA 1H7OA 3O8AA 1I2PA 2RHGA 3C8FA 3EWZA 4QAIA 1OX4A 2D73A 3NQCA 1IIGA 2P1FA 1XL9A 2CU0A 4HNVA 3BLEA 3HG3A 1W5OA 4AMAA 5FF3A 5AOUA 2V0TA 3UWVA 5HWJA 1DQXA 1FDJA 1AK5A 2GUUA 3B04A 1FXQA 3UXDA 2Y89A 4LUIA 5DY3A 4LVGA 1OFDA 1JRCA 3KVJA 1LOLA 3FFSA 1EP3A 1QO2A 1RQHA 1U5JA 3G1DA 2ZZ6A 1VCGA 3GNNA 2VEIA 3THAA 2QJGA 3DFOA 3DBPA 5E0KA 1R2RA 4N02A 1FDYA 3FYOA 4MYXA 4Y90A 1FWSA 1K7EA 3NDOA 1LOSA 1OYCA 5LHFA 3BG9A 3BW2A 1QWGA 4UFHA 1SO3A 2DZSA 3W74A 1VH7A 3C52A 1DV7A 5G2WA 3LHZA 3W1TA 3INPA 1FDZA 4LTSA 3TCEA 2GJNA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1KA9F

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