3W1MA

Crystal structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-bromoorotate
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with 5-bromoorotate
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 107
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1mA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1mA01
3TA6A 3KRZA 1DKWA 2BXVA 4DELA 3TU9A 1Z42A 4EIVA 2ZRVA 4DPPA 1XBVA 4RXFA 4WXZA 3PF3A 1F73A 2CZEA 3ATZA 4ZZ9A 5F1VA 1SZFA 5FF4A 2ISVA 3W7OA 1W5OA 2Y62A 4Q32A 3O6DA 2DZVA 4O0ZA 4AVFA 3PY2A 3G1HA 4IUOA 1VLIA 6ALDA 4CQ8A 2DZWA 4DPQA 3W7HA 4U28A 2B7OA 1QNVA 4JIPA 2H3BA 4OQVA 4NX5A 3R8RA 4O50A 1R2SA 3G1VA 2O7QA 3UWZA 1B4EA 1LORA 2ZA2A 4MJMA 4JTTA 2Y7FA 3HB9A 1PVNA 5DCBA 1I2NA 4UNKA 3EWYA 4AH7A 2HS6A 3W23A 1K7EA 1M5WA 1OFBA 3L68A 1YTKA 2DORA 4MKNA 4KFNA 3ABRA 2A4AA 3O1NA 1ZAHA 3M5XA 2Q3OA 3S1UA 3PC0A 3KRUA 1I8JA 3FKRA 3NQGA 4X9SA 5DLCA 1KM3A 5FEZA 1M6JA 1VH7A 1KW1A 4WY0F 4IJBA 3DFQA 3QQ0A 1DVJA 4JYDA 1FDYA 3PBVA 2VC6A 1AG1O 2A7RA 5KSWA 2Z2UA 3TQKA 2NUWA 4WJEA 1K03A 3PBUA 4NX0A 1I45A 3OIXA 3DBPA 4LS1A 1OVDA 3DH7A 4LRSA 1AW5A 4XKYA 5F2MA 3O63A 2H8ZA 1W3TA 5LGZA 3OHIA 4N9DA 4OE7A 3UD6A 3EX3A 3M5YA 1N8FA 3W7CA 3W2MA 1TQXA 4RXGA 4N9BA 4JD4A 2NX9A 6TIMA 1P5BA 1GVSA 3N14A 1F05A 5DBTA 3W88A 3EWUA 1LROA 1R46A 2DZTA 4A2RA 1F7BA 3S42A 3DFPA 2TYSA 3W7DA 1OFAA 1TRDA 3SI9A 1W3IA 3LERA 4FNUA 1LDCA 4MIMA 1Q6LA 2Z6JA 3MHFA 4DXVA 3K30A 4MYAA 4RR4A 4KWVA 4W9TA 4N9EA 2ISSA 3KVLA 3NQVA 2OZ0A 3MP5A 1KM0A 4BI7A 1RQBA 3L0NA 2CLMA 2NWSA 4CLMA 4WOZA 2ZZ1A 1X1ZA 3H53A 4FF7A 1FCQA 3OVPA 3QPZA 3TE9A 5CGQA 3W22A 3MYPA 4HNNA 8TIMA 4M7SA 4E2DA 3TUUA 1EX5A 3TFCA 3F4NA 2R14A 3LTSA 1YXCA 4UFHA 3B06A 4BR1A 2QCEA 5DN1A 3CEPA 3C2VA 3EEGA 4JTLA 1H61A 1TTPA 1PHWA 3BGGA 2W0UA 2G97A 4LNYA 3NZRA 2P0OA 3U8GA 3TFXA 4HKPA 3UWUA 3C6CA 1XKYA 1YXDA 3PBWA 1FWWA 3IIPA 4MZ8A 4N6FA 1EP1A 1MZHA 3HOJA 4MUZA 5A5WA 3G1FA 3KAOA 3QJAA 3L2IA 4A2SA 3EXSA 5AHFA 4DO4A 1K7XA 3WK1A 1EB3A 1VYPX 4GXMA 3G24A 4IGHA 5C55A 4FXSA 1W0MA 2XN1A 4JICA 3NQ8A 4BI6A 2WOQA 3PUEA 3PBYA 3S8HA 3FA5A 1PHQA 5CG7A 4FX7A 5BMWA 3O6CA 5I3FA 1FCVA 3NQ2A 3GDRA 5EBUA 3ATYA 3W7EA 1WXJA 2H90A 3W7GA 3QMSA 3F03K 4JX4A 4M6PA 3M6YA 1TMHA 2B0MA 3UPBA 1GVFA 2RFGA 2TPSA 1TJPA 3NPWA 3LRMA 3DHFA 3TR2A 4FX8A 1H60A 4QNWA 1KTCA 1R2TA 2H8XA 4NXKA 1LRNA 2Y61A 4E0CA 1BEUA 3G1AA 1J2WA 2C13A 4GE8A 4KKXA 1K7FA 1Z48A 3M1ZA 3O05A 3SR7A 2X1RA 4TMBA 3S6DA 4Y8FA 4GUFA 1JRCA 2TSYA 1OX5A 1L2UA 4O19A 2G96A 5LZLA 2VXNA 3UWQA 3VI2A 2WJZA 1WYIA 4WX2A 1QOPA 4O54A 3ZS4A 2J24A 3NEVA 3QZEA 2WPBA 1J5TA 2QJGA 4MY1A 1N7KA 1LLWA 4HPJA 4C1KA 3TJXA 3QEZA 3MJYA 3UXDA 4HIBA 2ZRWA 3W1AA 4XWUA 3THAA 3O06A 2VFIA 4UTHA 4UTWA 2QCMA 3NM3A 3BO9A 3FS2A 3G8EA 4HSOA 5LNWA 3EKLA 4RZ6A 2JKPA 1W1ZA 4N4QA 3FIGA 3BPWA 2B7PA 2NV1A 1EWDA 1EUNA 3W1MA 2EAWA 3BGJA 4XQ6A 1I2RA 4LOCA 1H7WA 3UWYA 5EYWA 3O6YX 1TPDA 1JR1A 5D38A 3GAYA 2V0TA 4O17A 2PC4A 4N6EA 3G1XA 3W9ZA 4M19A 5D2VA 2TMDA 1TV5A 2V81A 3RMJA 4GUGA 3TX9A 1NF7A 1QO5A 3IIOA 3W1NA 1OABA 1RZMA 1JQXA 3DZ1A 4ZQNA 1TO3A 5G1YA 5E93A 1SFJA 1FCUA 2CU0A 3UY8A 3GNDA 3P84A 4GUHA 1SR9A 1ML1A 2Y6ZA 4NJJA 3BW2A 4ADUA 4B5NA 2H3DA 4OBTA 4MLJA 5D04C 3Q58A 1OFOA 3P81A 5SWUA 1G67A 2DZSA 3L0GA 3W6YA 4JYFA 5CSRA 1ZAIA 2BLEA 2G95A 3IIZA 3MBFA 5I3GA 5HNRA 2X2GA 3D0CA 3P8IA 3T55A 2TRSA 5AC6A 2ZYFA 1W31A 1ZJIA 2QUTA 4NNAA 3TSDA 7TIMA 2RDUA 2YFNA 4K37A 4K7YA 4X22A 3SGUA 4UFLA 2OT0A 1OK6A 4E2BA 2J9YA 4K36A 3H54A 4DQWA 1F76A 1UCWA 4IPIA 4LRTA 3W7QA 4O8RA 2Q8LA 4UUIA 2YXGA 5D32A 1RPXA 4QM1A 1VYRA 1KFJA 2QCDB 1OX6A 4PTNA 1WX0A 3OA3A 2Y89A 3W7RA 1YPIA 3STCA 5F2LA 1OYAA 1SO3A 1RQEA 3M47A 1K02A 3DXIA 3G18A 1IIHA 4IMDA 1KFBA 3CHVA 4ZQOA 2PURA 3LCWA 4WY0A 3TV8A 2EF9A 3KRSA 1QPRA 3LRKA 3IGUA 1K3UA 1ZHAA 4K7VA 4LVDA 4MY8A 4WZHA 4UFIA 1F74A 3M43A 3CLMA 2ABBA 4RZ5A 3GKAA 1A5AA 3DKLA 3DFNA 2DJXA 2DU2A 1KLZA 4ADTA 1VS1A 3M16A 3NAVA 3E12A 2FB3A 5HUOA 3N2MA 3V75A 2GVGA 3MI3A 2V5LA 5C54A 2QDGA 4EOUA 4MJZA 2C15A 3C61A 3RFAA 3P74A 3A24A 3VNDA 1KBIA 3W7IA 1VHNA 2J9ZA 2NXGA 3A22A 1I2PA 2Y7GA 2JKAA 3TC7A 4ZL1A 3WJZA 3UNDA 5C2XA 4BWLC 1DL3A 1HL2A 1S5WA 1KA9F 1N55A 3C8FA 4FHAA 4Y96A 1G4SA 2VFGA 4LVAA 5G1TA 3P80A 1H51A 2WNNA 3THQA 2E68A 4O11A 1WBJA 3T4CA 5IM51 3P67A 5DXXA 1DV7A 5DELA 5AOUA 2JKEA 1JUBA 5HWMA 3NQCA 4LTSA 3BW4A 4Y9AA 1LRTA 2VEMA 1H1ZA 1OHLA 4X3ZA 5FEWA 1QFEA 2WV8A 3NYZA 1WQ5A 1ZALA 3HBLA 1KM4A 1LTDA 1S5TA 3JR2A 4GUIA 4UC5A 4ZMGA 4GBUA 5F4XA 1WAUA 3NQDA 4YXGA 2E6YA 2B7QA 2CLHA 1GQNA 3BG5A 2QCNA 3PB0A 1X6UA 5HMSA 3TIMA 1W8SA 2YW4A 3PR2A 5AYZA 1OFDA 1YDNA 3FOKA 3PS7A 3Q94A 3FEMA 1XXXA 1WBHA 3LHTA 4IX2A 5MHBA 3DI1A 3O16A 3P60A 4DBDA 4RCXA 2WKJA 4UTMA 4TIMA 1BWKA 4ZQPA 1QO2A 4O12A 3G3MA 3QSTA 5LNUA 4ONVA 3B8DA 2E09A 3DENA 1KLYA 1WOAA 4O18A 4XBSA 1TPUA 3C2EA 3PWAA 1GG1A 3L5MA 1OJXA 5D2WA 2V30A 2VKZG 3P5YA 4UR7A 3PG8A 1GVQA 4IXHA 5GVJA 4H3DA 1A5CA 1GOXA 3LXCA 1H50A 3O07A 2C0AA 3E96A 3IIXA 5D2YA 5DCEA 2YZRA 3LM7A 1SW0A 1C9DA 4R53A 1PE1A 2V5BA 2XN2A 5CPMA 1NAL1 1R2RA 3MBDA 3TW7A 1GG0A 4IPJA 1KFEA 4K6AA 5U4NA 3NZ1A 3UPWA 3C3NA 2EKCA 1YADA 5I3JA 1SO5A 3R2GA 1B57A 2AQWA 3ZFHA 3DFSA 1IXPA 3LXBA 4JTFA 3SSJA 4JEQA 2V9DA 3G0XA 1TPB1 4QNEA 5C5YA 1LM1A 2QCFA 4LC8A 5AYXA 4RZ4A 2Y63A 4Y90A 4IMCA 1OG0A 1Q3NA 2EGZA 3KVJA 3W2UA 3OVQA 4OWGA 1L6YA 1VRDA 1AW2A 4AB4A 4BFAA 3IVTA 1X1OA 1OX4A 1Z44A 4O10A 1B3OA 3LHVA 3I7SA 2WNQA 4JTEA 3TNOA 1ICQA 2QUUA 4DF1A 1FXPA 1IXOA 3WK0A 1GEQA 5K9DA 3NVTA 3QC3A 1H1YA 5AYYA 4O4WA 1EUAA 2ZRXA 4O4VA 1QPOA 2FDSA 4O1DA 1KM6A 1ME8A 1TB3A 3TROA 2Z6IA 4D2JA 3A5FA 2E1DA 2GOUA 1XDLA 3BARA 3KHJA 3DAQA 5DBUA 2FPTA 2JK2A 2FIQA 3HG4A 5E1QA 4RX0A 4RKAA 2FJKA 3LV6A 4Y6GA 1W5MA 1G4EA 1UBSA 3W2NA 4JX5A 3W84A 5K9CA 5FESA 3LTYA 1U83A 1A5SA 1NEYA 1YYAA 4YMZA 5G4WA 4CNPA 1GYNA 4Z0JA 2A7PA 1LBFA 5LSMA 1X8FA 3TAOA 3M5ZA 2R8WA 4EWND 4ML9A 5K9XA 2GUUA 3GDLA 2DJLA 3KOFA 4JTHA 3S1XA 4HNTA 3SZ8A 1V5XA 5K3VA 4ZVJA 3IGSA 1O4UA 3TXVA 1OFPA 1IXNA 4HNVA 1ZY9A 4OV4A 3NGJA 2JBMA 3LBMA 4FXRA 2YFOA 4QSHA 4UXDA 1EP2A 5BW6A 2GJLA 4NUWA 3W1TA 1TPWA 1OFEA 5D30A 2OJPA 3IGXA 3LLFA 5KINA 1XBZA 3T78A 5LGXA 3W1XA 2I14A 1PS9A 1ME7A 3B4UA 1VCGA 2ZA1A 5FI8A 2HS8A 4JYEA 3UZJA 1QAPA 3MO7A 4AHQA 3QW4B 4GC4A 4M6VA 1SW7A 5EY5A 2QAPA 1F5ZA 2CLFA 3SW6A 4LV9A 3BV4A 3WJSA 3CEUA 3NPXA 4HPXA 4Q4KA 1FDZA 3NNTA 2RHGA 3NQAA 2CZFA 3G1DA 1JULA 1TJRA 1VPXA 4MVAA 2A85A 2QCCA 2XFWA 2D73A 3ABSA 2NUYA 3FFSA 1GZGA 2A0NA 4YCPA 2VEPA 1V7YA 1GWJA 1T8XA 2FB2A 2HTMA 2QF7A 4U4MA 4WUIA 1XL9A 5F2GA 4LWWA 2A1YA 4O28A 4QISA 1R47A 4MZYA 3W71A 2CZ5A 1SO6A 1HO4A 3DI0A 5G2WA 2QEZA 1K8YA 3W1PA 4JTIA 1LRQA 2JGQA 2X16A 3PAJA 4MY9A 4JY9A 3W86A 2X1UA 1ONRA 1GPWA 4ICNA 5CZSA 1BKSA 3QYQA 2HSAA 3GYEA 1BTMA 2P10A 1TTJA 1W3NA 2J9XA 2CWNA 3W87A 4PCFA 3NXFA 5HWJA 3MHUA 2V8ZA 5AHNA 4S2BA 2P1FA 3BVJA 3DU0A 1MEIA 3T7VA 1L6WA 2VELA 2J88A 3DFTA 4OGZA 5FEXA 5HWNA 1TCDA 5EPDA 4N2YA 1H7XA 2E5BA 3ZR4A 1A5BA 3S0CA 3W3OA 3GXPA 2X30A 2GVJA 2QKFA 1XCFA 1ZCOA 5CPLA 1KFKA 3W7MA 5CPNA 3IRDA 4NNBA 1UJPA 4WOQA 3W1LA 4CCCA 2H6RA 3LHWA 4N02A 5D33A 2BWGA 3OVRA 3LCFA 2FPYA 4CQAA 3CIXA 1I2QA 1EIXA 3QF0A 1UUMA 3BLEA 4DEFA 2OMAA 1K8ZA 1JJKA 3RU6A 5HINA 1XFBA 2FLIA 4IMGA 3W7LA 2WSRA 1VJIA 3TJLA 4PC8A 2C3ZA 2Z1BA 1YPFA 2EPHA 3S5YA 3L0KA 4LUJA 3W7NA 3HGJA 2ZTKA 4UNLA 1F6KA 3YPIA 2X1SA 1O94A 3O8AA 5LHEA 1TPFA 2FPVA 3LCIA 4RLIA 3W70A 2OCZA 1WA3A 2ZRUA 5G2IA 2DZXA 1RQHA 2NV2A 1LLZA 2J27A 1GVOA 3TSMA 1SZEA 3GVGA 2ZZ7A 4CNNA 3F1QA 1U5JA 3E0IA 4Z08A 3GR7A 1GVRA 3PG9A 3L5LA 3L65A 5TIMA 3PVFA 3VE9A 4CQ9A 3FKKA 1SZGA 3R5EA 3W2LA 3IIVA 4UR8A 5EL1A 4AHOA 4QIUA 4IOTA 3MI2A 4DO6A 1VYSX 3W7JA 5K7JA 2KZHA 3W1UA 3ANYA 4AF0B 3NQ7A 2VEKA 4ORMA 1AW1A 5IBXA 5K4XA 3W7KA 1M7OA 4H6KA 2UV8G 4LVBA 4Q33A 5AHEA 3LHYA 2BX7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TA6 A;  1XKJ A;  2HWG A;  3KRZ A;  1DYS A;  4DEL A;  3WY1 A;  1UPP A;  1Z42 A;  1XBV A;  3URA A;  2BY0 A;  2J7B A;  3CMJ A;  4WXZ A;  3PF3 A;  1F73 A;  3ATZ A;  1R9Y A;  2PLJ A;  5F1V A;  1CGV A;  1DWI M;  3UCQ A;  3THD A;  4KMQ A;  3PY2 A;  4EAM A;  2DW7 A;  2JQX A;  1VLI A;  2DZW A;  4DPQ A;  4U28 A;  2B7O A;  4OZO A;  5CXP A;  3RR4 A;  1C8X A;  4QDW A;  1R2S A;  3G1V A;  2O7Q A;  3WQF A;  4PCN A;  3S2L A;  2ZA2 A;  4H8H A;  4HZ7 A;  1M7X A;  1C90 A;  1I2N A;  2G4J A;  3FA4 A;  1PIG A;  1K7E A;  3L68 A;  2DOR A;  4S38 A;  5AZ1 A;  4KFN A;  3O1N A;  2VX6 A;  3M5X A;  5C9Z A;  4KEV A;  3KRU A;  5BCA A;  1I8J A;  3CS2 A;  2ZWY A;  4YJ5 A;  4X9S A;  4L9Z A;  3L23 A;  5DLC A;  1KM3 A;  3OOQ A;  3S83 A;  5FEZ A;  1VH7 A;  5LYR A;  4IJB A;  3FVD A;  3QQ0 A;  3POH A;  1DVJ A;  1UQZ A;  4JYD A;  1FDY A;  3PBV A;  2VC6 A;  4YHG A;  4D6C A;  2ONE A;  2P0I A;  9RUB A;  2EG8 A;  3DG7 A;  1BYA A;  3ZT5 A;  3WFZ A;  3DBP A;  1YX1 A;  4LRS A;  3O63 A;  3SRK A;  4PSR A;  4DAF A;  1NP0 A;  1W6T A;  3EX3 A; 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