3W7J | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-040 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	106
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7jA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7jA01

3G18A 4RK8A 1B9BA 5FESA 1D3HA 1QAPA 1IXQA 4RXGA 3R13A 1KW1A 3W85A 3E02A 4CQ9A 4UTWA 4JTFA 2GOUA 4H4IA 1IXOA 5EYWA 1TRDA 4S1FA 1XDLA 2BXVA 1I2OA 1XBVA 1K8YA 3TROA 2LLEA 3O15A 2FPTA 2CLMA 1X6UA 1LYXA 2A4AA 3G1YA 2JKPA 4KWVA 4YXGA 4O13A 5CPNA 1P5BA 1TPEA 4N4PA 4IX0A 3W1MA 3ATYA 1TPB1 4HNVA 4QJ1A 1NF0A 1TTIA 3EWYA 1EIXA 2QCMA 1X8FA 1VYSX 4O19A 3NZRA 3HG4A 5EBUA 2V81A 1QWGA 2I1OA 4ZQNA 4ZQMA 3S6DA 4DF1A 4JYDA 1OK6A 3M1ZA 2YYTA 4LVFA 3MMTA 1F05A 2RDUA 3WK2A 4IXXA 2G97A 3CWNA 4MOZA 3KX6A 1THFD 1OG0A 3UD6A 3FJLA 4R34A 1OFRA 2OCZA 5D30A 3SIZA 2VKZG 1FWNA 3G8EA 4OE7A 4U4MA 1QNVA 1W31A 1LCOA 3L2IA 3W9ZA 4E0CA 2WV8A 5IBXA 3MP4A 3W84A 3LV5A 2WNNA 4HSOA 2X1UA 1GTEA 1MSSA 2JGYA 2RDWA 2ZZ1A 3FKRA 2O7SA 2P10A 1H1ZA 3GR8A 3A23A 1F2JA 4X2RA 4O1DA 3W1XA 2DZVA 1ZY9A 3INPA 2NWRA 2NX1A 3BG5A 1OFBA 4LV9A 2C14A 2A7NA 5H2ZA 1PS9A 1FWWA 1HO4A 1TIMA 5A5WA 2Y63A 3M5XA 4I7WA 2HSAA 1YPFA 3HG5A 3SSJA 4JDBA 2A6NA 2C15A 3VE9A 1TSIA 2E6DA 1Q3NA 1TPWA 5CPMA 4PTNA 1WOAA 2J9XA 3S1VA 2QJGA 4NQ1A 2ABAA 3LM7A 1O5KA 3GLCA 3N9RA 1WYIA 1OHLA 2YCEA 3U2OA 4QISA 5D02A 5J5DA 1Q45A 2V82A 4P2VA 1LP6A 3W75A 2NV1A 1OX4B 3SY5A 3I7SA 5KSWA 4CLMA 4AH7A 1SQ7A 2OT1A 3PVFA 1PE1A 1T0OA 2PURA 3PUEA 1LORA 3AO0A 2VXNA 3N3MA 1JRCA 3CEPA 1RV8A 4MFEA 4H6KA 2HMCA 3S1UA 1N8FA 4I7UA 3Q94A 4B5NA 3P67A 4MZ1A 2OZ0A 3EXSA 1TPDA 1GT8A 2RDTA 4IJBA 1YXYA 3UWQA 2DZTA 5C55A 4LC6A 1KM3A 1RD5A 2QDGA 4IMDA 4MLJA 2NUWA 3TW6A 2DZUA 2ZDRA 2Z1BA 2QCNA 3W1TA 2CLOA 4DPQA 4UTUA 1XUZA 4M7TA 4GWEA 5AHEA 3TJXA 2XN2A 1IF2A 3N2XA 4HSNA 1QOQA 3IIOA 4N6EA 4A3UA 1O4UA 4LS1A 1K03A 2QUVA 3NPUA 2NUYA 1GVFA 4KKXA 1B4KA 4QQ3A 5DCDA 1SO6A 3O63A 2OX1A 3OEXA 1F5ZA 5HUPA 5FF3A 3W7LA 2C6QA 3BO9A 3B0PA 1HUVA 2H3DA 4ZMGA 3LRLA 3IGUA 3LRMA 2YGYA 1EUNA 3I68A 3QYQA 3H55A 1DQWA 3NO5A 1VCGA 4L4LA 3STEA 1IXPA 1XBZA 3C4UA 5F2IA 5I3JA 4J9JA 4AEOA 4ZQRA 1KFKA 2BTMA 4MYXA 4K7VA 5D09A 3E49A 5LNUA 1H63A 1T8XA 3L68A 3QRHA 4IQLA 2NX3A 4JTTA 2EHHA 5TIMA 1CW2A 4UIOA 1V7YA 3ZWTA 3O1NA 3P84A 2FFCA 2QJIA 4WUIA 3LXCA 2HS8A 3GZ3A 4NT0A 4IMEA 1R2TA 3BLEA 1H51A 1SZFA 4UFKA 2GVGA 4I7VA 3C8FA 4K8HA 4AVFA 3Q2DA 5L9FA 3G1VA 1W5MA 5DXYA 3IEBA 3FYPA 2WSQA 4RKAA 1LROA 4GFSA 1TPVA 2P0OA 2Y85A 4PL2A 4TIMA 4OGZA 3KAOA 3LHUA 1XKYA 4O14A 3USBA 2VEIA 3TMQA 2ZTJA 1ALDA 3G1HA 3G0XA 1G69A 4A21A 2TRSA 4Y6GA 3UXDA 3F4WA 3S42A 3R12A 4NZJA 2TMDA 4O18A 4NX5A 3OVRA 4A2SA 4PCFA 4IUOA 1WA3A 1YXCA 2DU2A 4ICNA 3RLVA 5C5YA 3A21A 4H3DA 1TQXA 4ZQPA 3BK0A 3GDLA 3LHWA 3NAVA 3TE9A 2ZRVA 3UYCA 4OHQA 2X1RA 3QM3A 1EUAA 1HG3A 4JICA 4IMCA 3BG9A 3IIVA 5GVJA 3R8RA 3W7PA 4NXKA 1OF8A 4IMGA 1TO3A 3MP5A 1QOPA 2V0TA 1G7VA 1ME8A 3P5YA 3OBKA 2CLIA 3LTPA 1C29A 1SZNA 4E2DA 1TV8A 1RVGA 3S5ZA 5HWMA 1L2UA 4NJGA 2A7RA 1IIHA 3T44A 3QPYA 5AHFA 1XBXA 3O16A 3QFEA 1U83A 4JNMA 3KVKA 3D0CA 2J9ZA 3W88A 3QSTA 4ADSA 1MO0A 1OFEA 2WKJA 4C1KA 2NZLA 1FXPA 4NNAA 4XQ6A 2VEMA 3FIGA 4UFHA 1FQ0A 1OX4A 1D3GA 2E6AA 5CKSA 5KZEA 1DBTA 2X16A 3W7OA 2QDHA 2W6RA 2V2CA 1VHCA 3TSMA 5EY5A 1M5WA 3FEMA 1H5YA 2C18A 2QCFA 4CQAA 1GVOA 4NJIA 1DORA 3G0SA 3NZ1A 2EGZA 4YCOA 3KRSA 4XWUA 1YDVA 2ZZ3A 3TDFA 3MUXA 4LWWA 5K3VA 4JXCA 5AYYA 4AF0A 3NR0A 3G3MA 2AAMA 1I2NA 3T4CA 4ONVA 4Q33A 5K4ZA 3P82A 1FX6A 2H3BA 1VGAA 3FLUA 2JBMA 3PR2A 1J4EA 4GE8A 2KZHA 3TIMA 5KMYA 1WXJA 3NQGA 4HNTA 1KM2A 1GG1A 3DI1A 4JS3A 3MYOA 3PBVA 1XBYA 2PRLA 2A0NA 2BLEA 1GVRA 2AGKA 4JD4A 3ABSA 1IGSA 3A24A 3NQ7A 1YTKA 2GQ8A 3A5FA 4HPJA 4GC4A 4ZZ9A 3O8AA 3OVPA 4UTWC 1GPWA 3HGJA 4LUJA 2FPVA 3W7IA 4UFJA 1WBJA 2XN0A 4FHAA 4I9AA 1AL8A 1DJNA 3PUDA 4O8RA 2QJHA 4X9SA 3YPIA 4UNKA 4WY0A 1TREA 4CNNA 3W72A 1EPXA 2ZYFA 1Q6RA 1LBMA 3E9AA 4FX8A 3W3OA 2Q8ZA 4WX2A 2IQTA 4A22A 2TYSA 2ZA2A 4CNOA 1RR2A 4JGDA 3MO7A 4LW7A 4UFIA 5F2GA 3BW3A 4AAJA 3C6CA 4CCCA 1QFEA 1FXQA 1FWRA 3TR2A 3M47A 1AK5A 1FCQA 2ZFAA 1VRDA 4UTIA 1SW0A 3UPBA 1YTDA 5KINA 2F7FA 1YADA 3HJZA 4UMBA 1PCWA 3DENA 1S5WA 5E0KA 3NGJA 1JULA 2A2IA 4YLWA 5C54A 4O4VA 1ZALA 1TTQA 3BLIA 2FLIA 4LRSA 2WJZA 4UMCA 3EWZA 3FA5A 4G1KA 3PG8A 3LBMA 1TPUA 1TQJA 1JCNA 3BLFA 1OABA 1O94A 4XTDA 4RZ5A 3THAA 3W2NA 1Q6OA 2ZZ5A 3GAKA 4Z1BA 4KFPA 3N9SA 1JVNA 2ZRYA 1FDJA 3W7MA 1GYNA 1SZEA 3HOJA 3Q37A 5G2IA 1UASA 4MY1A 5FF7A 1W54A 3W7CA 1SW7A 5D2TA 4WD0A 1KM6A 1H7XA 1P0NA 1JQXA 4LVBA 4CCDA 5AHNA 3CM4A 4HNUA 1J2WA 3L5MA 3TAKA 2EKCA 5LNSA 2VENA 1EEPA 1VC4A 3DHDA 3TC7A 1LDCA 2X2GA 2Y61A 3LHZA 4HT3A 4GXMA 3MYPA 1P4CA 1TCDA 4FNTA 2YZRA 2JKAA 2FPYA 1W37A 1L6WA 3C2FA 3T40A 1P1XA 2I14A 1WDWA 1W3IA 4HHPA 4IGHA 4LOCA 4N9DA 2E1DA 1VR6A 2X30A 3CTLA 4X22A 2VFFA 3DAQA 1T99A 3LB0A 3B8DA 4Y8FA 5AOUA 1NSJA 5H91A 4MVAA 1NVMA 3C2EA 1TV5A 2NV2A 3BVJA 4DO6A 3W2MA 3CU2A 1I8JA 1KA9F 3E0IA 1Q6QA 1IIGA 4L4MA 3WK1A 4GJ1A 1NEYA 2H8ZA 3LXBA 4ZQOA 3QQ1A 3ZFHA 3W83A 5G2HA 4JN6A 1KFJA 3NPWA 1JUKA 1TV7A 3N34A 4UR8A 3RK8A 4GRSA 2A85A 5KZDA 2XFWA 3NQEA 2QUTA 4HKPA 5DY2A 2WSRA 2ZA1A 3L0KA 3LDVA 1T96A 3BGJA 3LTSA 4N2YA 1L6SA 1R46A 1OFOA 4GUJA 3DH7A 4DELA 3MBFA 4PL1A 5FI8A 2TSYA 1OYAA 4MZYA 4FNRA 3GAYA 4LNYA 3HPXA 3I7RA 4UCGA 4NJKA 4TO8A 3EX6A 3CHVA 2GPTA 2ZQ0A 2ZCGA 5TQLA 4O4WA 1JCMP 2HS6A 5BMXA 3FFSA 3TQ0A 1ZENA 5U7SA 3GDKA 5EKYA 1JQVA 1YYAA 3FYOA 5LHEA 1CI1A 4MLRA 4KFNA 4RX0A 2G95A 4RLIA 4GNJA 5FEZA 3KVLA 4QITA 1FWSA 4R53A 3LTYA 1PCKA 1F7BA 3KXQA 1TTJA 4OV9A 3GX9A 2FTPA 5I3HA 2JKEA 2R8WA 1ICPA 3SW6A 4DPPA 4MZ8A 2FIQA 3G1AA 3LI1A 1WV2A 1Z42A 3C61A 3LXAA 3UNDA 5CPLA 8TIMA 5G2WA 3W7QA 2VOMA 1K7XA 2ZRUA 1KV8A 3ZS4A 3W7HA 4NU7A 1DOSA 4Y96A 3EX1A 1ADOA 3EKZA 3FJ6A 1S3HA 1WQ5A 4BFAA 2YXGA 1RPXA 4LV4A 4M6QA 2DORA 1H7RA 3SZ8A 1OX5A 3DHFA 4QNEA 4ML9A 3W6YA 2E6YA 1R2SA 3MI3A 2YPIA 3TH6A 3B0UX 3C3NA 3CWOX 4WZHA 4FF7A 3C2OA 3OHIA 1VYPX 2NUXA 1ICSA 4WY0F 3G1SA 3DFOA 3L21A 1SZGA 1R47A 1K7EA 3GNDA 3G0UA 5K9CA 3BPWA 4AF0B 4UTJA 1EB3A 4ADTA 4O10A 2P1FA 4FX6M 3CC1A 3HF3A 4LTSA 2ZRZA 3R2GA 5K9DA 3MWAA 2ISVA 3LCHA 3P80A 5MHBA 3O6DA 3GNNA 5F1UA 1KM1A 3MHGA 2A1YA 4BI7A 1L6YA 5LNVA 1B3OA 2ZBTA 5CGQA 2FQIA 4RV8A 3ATZA 3EEGA 2RHGA 3CIWA 5D2XA 3HGSA 3NL3A 4IXHA 2QUUA 3QMTA 4Q4KA 5FF4A 4MKNA 3MHUA 3VNDA 3R89A 3W2LA 3W7GA 3CPRA 1YPIA 2OJPA 3C52A 2PRMA 5AB3A 1EX5A 1BEUA 3S0CA 3QH2A 1EP1A 1OYCA 5HQEA 3P8IA 3W87A 3QF0A 5D05A 4JTSA 2H6RA 4JTJA 4WY0B 5LHFA 3MBDA 1EA0A 1MEWA 4NUWA 4HNNA 4ALDA 2E68A 1GVQA 3LX9A 2C3ZA 1GOXA 4JX5A 3SJ3A 4GBUA 2BX7A 2JGQA 2ALDA 3MP3A 3DI0A 1CX9A 5DLCA 3RLUA 4BR1A 5G4EA 4EF8A 1G4SA 3TXVA 4ZL1A 3RNDA 4LT9A 3ZWSA 1I2QA 4IMFA 2CFFA 1QO5A 3IGXA 2R14A 2B7NA 3PF3A 5LZLA 4W9TA 3GVGA 5ABTA 3P61A 3G1DA 4XBSA 3CB8A 3EWWA 3DGRA 3W1PA 3PUOA 1A53A 1DKWA 3ZR4A 2Z6IA 1SO5A 3W7NA 1A5BA 2NXHA 5D37A 4O28A 3TA6A 2Y62A 2YFOA 3TUUA 4N6FA 2E77A 2QCCA 1O60A 4FO4A 3PB0A 3MJYA 3O07A 4DBEA 3LLDA 3KFTA 5FF2A 1C9DA 2VEPA 3P60A 4DF0A 1JCJA 2CW6A 1NFBA 3STGA 4K38A 1O95A 3QZEA 3W7RA 1QCWA 1F73A 5F4SA 3TXZA 3W1RA 4UMAA 3RFAA 3V1PA 3W7KA 5C2XA 4BWLA 4PA8A 1MEHA 2DZXA 3L65A 5D2WA 1SSGA 3NVTA 1JCXA 1AG1O 4RCXA 4DXVA 1I4NA 2CZFA 4FXRA 1H7PA 1LTDA 4UTHA 4NJHA 2YW3A 4UNLA 1K3UA 4JTHA 3GDTA 1PV8A 4E2BA 1AW1A 1RQHA 4D2JA 5AC6A 2A6LA 2C16A 3M16A 2H8XA 3PBYA 3PSWA 4NNCA 2VELA 3Q58A 4XUGA 3T78A 1XM3A 5FEWA 3EX4A 2ZZ4A 3UZ5A 2Z2UA 4K39A 4C1LA 2C0AA 2CZEA 2FJKA 4PFMA 3AJXA 2ISSA 1SO3A 2V8ZA 3W74A 5K4XA 5E1QA 2E5CA 4Z08A 3NXFA 5U4NA 1HTIA 1AW5A 1KFLA 1WBHA 2VFEA 1VZWA 1KM4A 3UPWA 4CCEA 1FWTA 1GYLA 1EP2A 3PBUA 1ME7A 3F1QA 3BARA 1ME9A 1VCVA 2F84A 4IWWA 4NZFA 2WPBA 1G4PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7JA

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Chord Diagram

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