4ZFMA

Structure of gan1d-e170q in complex with cellobiose-6-phosphate
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
474
structure length
459
Chain Sequence
HLKPFPPEFLWGAASAAYQVEGAWNEDGKGLSVWDVFAKQPGRTFKGTNGDVAVDHYHRYQEDVALMAEMGLKAYRFSVSWSRVFPDGNGAVNEKGLDFYDRLIEELRNHGIEPIVTLYHWDVPQALMDAYGAWESRRIIDDFDRYAVTLFQRFGDRVKYWVTLNQQNIFISFGYRLGLHPPGVKDMKRYEANHIANLANAKVIQSFRHYVPDGKIGPSFAYSPMYPYDSRPENVLAFENAEEFQNHWWMDVYAWGMYPQAAWNYLESQGLEPTVAPGDWELLQAAKPDFMGVNYYQTTTVEHNPPDGVGTSSGIPGLFKTVRNPHVDTTNWDWAIDPVGLRIGLRRIANRYQLPILITENGLGEFDTLEPGDIVNDDYRIDYLRRHVQEIQRAITDGVDVLGYCAWSFTDLLWLNGYQKRYGFVYVNRDDESEKDLRRIKKKSFYWYQRVIETNGAEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Putative 6-phospho-beta-galactobiosidase
publication title To be published
rcsb
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 184
structure length 459
sequence length 474
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.85: 6-phospho-beta-galactosidase.
pdb deposition date 2015-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4zfmA00
1FH7A 3B9DA 4YN5A 1KFWA 1W91A 1V6YA 3NCOA 1M04A 1UZ1A 4FLQA 4UQEA 3HN3A 2XTKA 4BZYA 2VL4A 1DWAM 2G4FA 2Y8VA 3AZRA 1XH2A 5A69A 3GXIA 3T08A 1ZBCA 2YL8A 4UOQA 3JUGA 1KR0A 4DWSA 3A4WA 1AVAA 1H49A 1HKIA 3ARRA 3WMCA 8CGTA 4FMVA 1XSIA 2A3AA 5I77A 3FAXA 4C7GA 1B3WA 1K9DA 4LXFA 4E8CA 4P7OA 3WUEA 4DM2A 1PX3A 4CN4A 5EFDA 4PSPA 1M01A 5IDIA 3WH9A 1QW9A 3VGHA 2WAGA 3PTQA 1GORA 4B9ZA 2CKRA 3T0BA 4UFKA 4PMRA 4LYPA 3GBDA 1C3FA 4IM4A 4A3YA 3SCNA 2DPEA 1UKQA 4AZBA 3OLDA 2JIWA 3OA5A 1C8QA 5A6MA 1XCWA 4RE3A 1DHKA 4D1IA 5A8QA 5I5RA 2EO7A 1GVIA 3BH4A 3RPMA 3WDPP 1CBGA 2CEQA 2DSUA 3BCDA 1EHNA 2BS9A 3BCFA 4DUVA 1KXVA 1WZAA 4J3XA 1NOFA 4AWEA 2D2OA 4W8BA 3MKKA 3PZIA 2J7DA 4MJ4A 3AIQA 2J75A 4CCEA 1PX4A 4HOWA 1JXKA 1MXGA 4AYSA 4D6DA 2ESCA 1W32A 2IXUA 5JBDA 3K8MA 3VIPA 3BSGA 4WKHA 1E4MM 2HVMA 4U3AA 2A3BA 5C71A 1KQYA 4GQQA 5F7UA 2YA1A 3OLGA 4V2XA 4P8VA 2YA2A 3QHMA 3AS1A 3WNKA 4LYRA 1E0VA 1W9BM 1QOXA 2A3CA 3QOMA 3SCUA 4QCEA 2V5DA 2CHNA 2WVVB 1BGAA 6A3HA 1B3ZA 3L4VA 2D0FA 3MU7A 1NWUA 3VNYA 1HKKA 2WMKA 2WMIB 3VU2A 3VGEA 2ZXAA 4UFIA 3SCTA 1X6NA 3WF3A 1ESWA 1MQPA 3PTKA 2YBUA 4JKLA 5CZKA 1NH6A 3ARWA 5BRPA 3BSHA 3WQ8A 1BPLB 5C70A 3WQVA 3CZEA 2O9OA 3VIFA 3O2LA 3VPLA 4H8VA 3TTSA 5DFAA 2GJRA 4PMYA 3NSXA 1HL8A 2EPNA 3ZSSA 1WDSA 1JFXA 3ZOAA 4KWUA 4NI3A 1QHOA 1HJXA 4HU0A 3MUY1 2XSBA 2WVVA 3AMCA 1JXJA 1NWTA 3U57A 3RIKA 3WQ5A 1UKTA 2WMIA 2ZE0A 2ZIDA 1WO2A 4UNIA 1W3LA 2DT3A 4NRSA 3W82A 2EJ1A 1JAKA 1E3XA 1H2JA 3CBWA 4WJXA 3AJ7A 3PZOA 2VX5A 3QGVA 2D24A 3CZGA 2TAAA 5E0CA 1DWJM 3D5HA 3M7SA 4AD5A 1CXEA 2BY0A 4J27A 1AMYA 1J0KA 1UOKA 4NZCA 1CGXA 2OWCA 3TP4A 1QBBA 3BXWA 3G6LA 4GPNA 2CBVA 3DYOA 3S2CA 4D6GA 1D2KA 2VJXA 5CQ1A 1IZKA 2XG9A 2Y2WA 3VIMA 5D9PA 4PTMA 2Y24A 2BY3A 3ZT6A 1OWQA 4JHOA 1DTUA 1V3LA 4HU8A 4ATLA 1OGSA 2BFGA 3K4DA 3VUPA 1MFUA 3W6MA 1TMQA 1E6QM 5A6BD 1IT0A 2XVNA 1GOIA 4LX4A 4HMDA 1W1YA 1JZ2A 3WH8A 4XZBA 5D8ZA 3VD3A 3K1DA 4EE9A 4W84A 2WZEA 2UY5A 1E55A 2VRJA 3WNNA 3ARYA 4RE2A 1UH2A 4WSJA 4OIFA 5M3WA 5D9OA 4AD4A 4W5ZA 5D9MA 5A8PA 3B9AA 1ECEA 1R86A 5CPTA 3PHAA 5M03A 3PZQA 4JFVA 1EH9A 3WNLA 1OM0A 1C7TA 4AEEA 3LPGA 1BYDA 3VIHA 4A4AA 5FIPA 3AMLA 1QNQA 3WDRA 1W1PA 1UR8A 4MPKA 3ARZA 1HJSA 1W2VA 3SEPA 3CGTA 1EDQA 3N13A 4FLRA 4P7LA 2J7CA 3RCNA 3MSDA 1MQQA 2DH3A 4MB1A 4P8XA 3UG3A 3F4VA 4M8UA 3AIEA 3WQ6A 3PTMA 1J0IA 2WZHA 2YDRA 4J28A 5AC5A 2XIBA 2GJPA 3AISA 1BG9A 1M03A 2ZUTA 2WHJA 3AIRA 3T0AA 1WP6A 3CHDA 4F9JA 1Q6FA 1E1FA 1OIMA 1GQLA 4KRTA 1VF8A 4F9DA 2G3JA 1UG6A 2F2HA 2BXYA 5I78A 3OZPA 1A47A 4P8UA 4OOZA 5HPCA 3OLEA 1VBUA 1GQJA 4M24A 3VIOA 2FH6A 4HOZA 5CSYA 1BVNP 4AIUA 4D72A 1QNRA 1K6AA 5BROA 4PMOA 2BHZA 1PIGA 5A6JA 1MQRA 1OCQA 1VJSA 1JDDA 3T2QA 3WUGA 4OOUA 3PZ9A 1W9UA 3WMSA 5M17A 3VTRA 4U2ZA 4BQ3A 3HMCA 4OBSA 3WL0A 3WQ4A 1ZL1A 1WZMA 4QAWA 2PWFA 3S6TA 3WD3A 3L4UA 3VIIA 3ALFA 2OYMA 2UY4A 2DEPA 2QPUA 4TXEA 2VX4A 4ML4A 2DQXA 1BG4A 6CGTA 1GNXA 3U5YA 4W8LA 4BS0A 3WD0A 3NUKA 4FK9A 3CUGA 4UFLA 1RH9A 4WKFA 1CGYA 9CGTA 4HA3A 2WPGA 2RGLA 1I1WA 5E6ZA 3ZR5A 3AZTA 2GVYA 1VRXA 1UD8A 5A2CA 4BA0A 2OYLA 1HJVA 1A3HA 1BGGA 1XD1A 1TZ7A 1B9ZA 2WCAA 5HPOA 3AHVA 2DT1A 3UG5A 4Z2JA 2B31A 3TTYA 4DWSC 2BXZA 1E4NA 1VBRA 1W2PA 2W4XA 5CPQA 3T2OA 1H3GA 5EMYA 2YDQA 1EO7A 3SUUA 1OB0A 3T0DA 3CH9A 4J3SA 4U5KA 3BAKA 4MNKA 2CIPA 4MNLA 1UKOA 1V3MA 3I3EA 3GH4A 4JKKA 4UZSA 1R7OA 1C91A 4UFHA 2YOCA 1JZ3A 4MB3A 2JF7A 1K9EA 1Q6EA 1E0WA 3PZTA 4L4PA 4GINA 4W8AA 3AHYA 3WDQA 1GOQA 3WDJA 1RD6A 5EFFA 1UQZA 3WNPA 2WW5A 4JHZA 1VJZA 3I3DA 2WNWA 4UOJA 3OG2A 3KWXA 1UH4A 4U2YA 5CG0A 2WVSA 4HTYA 1JDCA 5A8NA 1J0JA 3AS2A 1V3KA 1TA3B 2FHFA 2VRKA 3AHXA 5BXSA 1LLOA 3ZT5A 4JIEA 4AZHA 1GHRA 1JI2A 4FLOA 2EXOA 3VGBA 3NDYA 3N12A 1U30A 3WENA 1CECA 1LWHA 3IJ8A 4AY1A 2X09A 4HA1A 4RL3A 2GDVA 2G3IA 3SUSA 1QNOA 1CXIA 4XV0A 3IAPA 4AD0A 1UUQA 2DT0A 1KXTA 2VZUA 3ARPA 5E0FA 5FOOA 1UR4A 2D3LA 5I24A 1CGTA 1KBKA 3GNOA 2X8RA 5I23A 3UR8A 1W9DM 1HL9A 3FXYA 3CZJA 1H1NA 4BCEA 1B31A 3NSNA 1TA3A 4D1JA 3RO8A 4QDMA 2VUYA 2IXVA 1ZJAA 4TTUA 5E09A 1CLVA 2OYKA 4YHEA 1XH1A 2WC4A 2YL9A 4KMQA 1X6LA 3OGVA 1E71M 3WEOA 3DECA 1JD7A 1CZ1A 1W3HA 3BMVA 2OLHA 4ZFMA 1JZ6A 4S3KA 4JFWA 2WCGA 3VVGA 1NM9A 3BC9A 1UWUA 2J62A 1EDTA 4MAVA 1QVBA 4QLLA 2DSZA 3QHOA 2WLZA 1Q6CA 3FHQA 1TCMA 1PAMA 4QFUA 1XYZA 4Z2HA 1OGGA 4PMUA 3TOPA 3AXHA 3AHTA 1KWGA 5HDRA 5TD4A 4JFSA 2J8GA 1HP5A 3LPFA 2CHOA 4GO8A 1VEOA 1PPIA 4ZEPA 4GQRA 1CPUA 1JYWA 3VO0A 3W29A 2DGAA 1J01A 3GTNA 1B3YA 2CESA 4AZCB 1CWYA 2RGMA 4V28A 3L2LA 2NSXA 4CN1A 5CLWA 1E73M 2BHYA 1LG2A 4Q7NA 4Z2GA 2CBUA 1TFVA 4GI9A 2WSPA 2YL6A 1ZS2A 2Z1KA 1CDGA 4OKDA 4W7VA 2PBOA 3VDCA 1E1EA 3WF1A 2BVTA 1V6XA 1QI2A 5D4YA 1Q4NX 1E56A 2PWDA 2VX6A 3WH5A 5FL1A 3BGAA 3UERA 1AQHA 4PUEA 2DSWA 1VB9A 3EDEA 3M6DA 5GNXA 2J7HA 3FNDA 4IUGA 4AW7A 4UCFA 2XUCA 3EBVA 1UKSA 2G3MA 1PEZA 1P6WA 2ZX9A 1G9HA 3OB8A 3WFLA 3W24A 5C8BB 1LL4A 1VFOA 1W3KA 1J9YA 5BYWA 3QR3A 3MUAA 3B9EA 4UTFA 3AXIA 3ZJKA 2GUYA 2D22A 1U2YA 1WB0A 2GFTA 1ISVA 4KRUA 2FH8A 1CEOA 2O9PA 1QHPA 4U5IA 5DEZA 1VFUA 2VT0A 4CGTA 2X05A 4PEEA 3WDIA 5CSUA 4P7RA 4AXNA 4H7VA 2E8ZA 2WMGA 1MW1A 1ZBKA 3WD4A 4HMEA 2CERA 2PBGA 2DDXA 5HXMA 4CVUA 2OSWA 2EPOA 4PSRA 1W3JA 1V03A 4U31A 5I6SA 2D20A 1ITCA 2DT2A 4D71A 2Q8XA 4PTXA 4C7FA 4CKQA 2XVGA 2EQDA 4D6HA 5LA0A 1PBGA 2W92A 1UA3A 1G94A 3N15A 1V6UA 3AFBA 1XV8A 5BXPA 4UQ9A 1E9LA 1JF5A 2OSXA 3SCPA 3WUFA 3UEQA 1HP4A 3BAWA 4HZ7A 4D6EA 3UETA 1GJUA 3CZ8A 1EA9C 4X0NA 3BLKA 2W5FA 4BQ2A 3MUZ1 2BY2A 2NT0A 2ZUSA 1D7FA 4CCCA 3WDHA 4YPJA 3A4XA 3O6AA 4QLKA 1H4PA 3CZKA 3U7VA 2ZX7A 2J25A 4PYSA 2WHMA 4DUXA 3BAXA 1LF1A 2XM1A 1ODZA 2ZXBA 1OBAA 4CD7A 1SYTA 4WKAA 3WEMA 1CXLA 3WEZA 3PZNA 3UG4A 3EMCA 4PCTA 5ABFB 2ZUVA 1K9FA 3SURA 1VENA 4EANA 4TOQA 2DIEA 3VOCA 4MDPA 3AICA 4U33A 3ARUA 4EKJA 1DWGM 4QLJA 2JE8A 1GPFA 1JL8A 1NOUA 2FHBA 1TG7A 3GH5A 4WLCA 3THCA 5D9NA 8A3HA 1MYRA 2VC9A 2VI0A 3KZSA 1JI1A 5CJ5A 2E9MA 3WNOA 1BTCA 5JIWA 2YA0A 3WF4A 4UOZA 4HPHA 1G0CA 2WWCA 1EQPA 2OSYA 5D8WA 1E6SM 2UY3A 3MMDA 3SCWA 5GQBA 5DF0A 3DYPA 4M81A 3W38A 4P7NA 1CGVA 2WVTA 1KCKA 1BSIA 3HU7A 4PMZA 3UCQA 1XGZA 5KZ6A 4ZE4A 1EIBA 3B8SA 2VR5A 1C8XA 3OGRA 5HNNA 4FF5A 1V3JA 2V3GA 2C0HA 4IPLA 3QHNA 1H0IA 3WD2A 1ISYA 1BAGA 1O6IA 1Y7VA 4P8WA 1QNPA 1IZJA 1SMDA 2WC7A 4W5UA 2EBNA 5HOSA 4AD2A 2ZXDA 2VMFA 7TAAA 4GXPA 3WL1A 3RDKA 3CZLA 2VZSA 4Q22A 3GM8A 5CXPA 3ZQ9A 3A47A 4TUFA 2CBIA 4UZUA 4W7WA 2AMGA 1HKMA 1EQCA 1B0IA 1AQMA 2YDSA 4JFUA 3RM8A 1EDGA 3U5UA 4ACZB 5GNZA 1UD3A 3N1AA 4TTGA 2ZX6A 5GPRA 1Q6GA 3VX0A 1TR1A 3KEHA 4QCFA 1HJWA 4M1RA 7A3HA 4J3TA 1E6ZA 1DWHM 3VD4A 3PZGA 1EXPA 1WPCA 3GNRA 3MMUA 3SUWA 4GI6A 3NYDA 4MJ2A 3MANA 4R27A 3KL0A 4ZE5A 3VMOA 1S46A 1VAHA 1W9XA 3W28A 1UWSA 4PTWA 3CTTA 1ISXA 3LPOA 1XYFA 3F5LA 1E15A 2XVLA 3IJ7A 1ISZA 1FFQA 1J0ZA 1WAWA 1JDAA 3WKZA 4J3WA 2VCCA 1YHTA 4YHGA 2JF6A 1WDRA 4N42A 4OZOA 1KGUA 4OBRA 1GOKA 3MV01 5FD0A 3AMDA 3D3AA 3G6MA 5BCAA 1TUXA 3EDDA 3GDBA 3NJ3A 5A6AA 2VZOA 2XWEA 3FY1A 3WH7A 2ZUNA 3CUIA 3WN6A 4MB4A 3EDKA 3VDAA 1PJ9A 3DHPA 1HIZA 2XPKA 2OWWA 3BMWA 3PZVA 5E6YA 1MXDA 4RE4A 1V3HA 2VVNA 3RM9A 1BYAA 1X1NA 1MVYA 3TA9A 2DSVA 3WBAA 3WY1A 3K8LA 1UH3A 1J18A 4H8HA 1V6WA 3KE0A 2AOSA 3K8KA 3ZSTA 2XGIA 4J7RA 3WH6A 3UR7A 5LYRA 4MADA 1V0KA 1UQYA 3RJXA 3BAJA 4PN2A 3CHEA 1UR0A 1UD5A 3K46A 2E8YA 1RP8A 3OBAA 3VDBA 3EYPA 4AC1X 3W26A 4AEFA 1UD2A 2DH2A 1GHSA 1MWOA 1HJQA 2QF8A 2BY1A 1E70M 1VEPA 3ZO9A 4URIA 1NQ6A 2WLYA 2WXDM 3VM5A 4U3CA 2XHYA 1HX0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FH7 A;  3B9D A;  4YN5 A;  1KFW A;  1W91 A;  1V6Y A;  3NCO A;  1M04 A;  1UZ1 A;  4FLQ A;  4UQE A;  3HN3 A;  2XTK A;  4BZY A;  2VL4 A;  1DWA M;  2G4F A;  2Y8V A;  3AZR A;  1XH2 A;  5A69 A;  3GXI A;  3T08 A;  1ZBC A;  2YL8 A;  4UOQ A;  3JUG A;  1KR0 A;  4DWS A;  3A4W A;  1AVA A;  1H49 A;  1HKI A;  3ARR A;  3WMC A;  8CGT A;  4FMV A;  1XSI A;  2A3A A;  5I77 A;  3FAX A;  4C7G A;  1B3W A;  1K9D A;  4LXF A;  4E8C A;  4P7O A;  3WUE A;  4DM2 A;  1PX3 A;  4CN4 A;  5EFD A;  4PSP A;  1M01 A;  5IDI A;  3WH9 A;  1QW9 A;  3VGH A;  2WAG A;  3PTQ A;  1GOR A;  4B9Z A;  2CKR A;  3T0B A;  4UFK A;  4PMR A;  4LYP A;  3GBD A;  1C3F A;  4IM4 A;  4A3Y A;  3SCN A;  2DPE A;  1UKQ A;  4AZB A;  3OLD A;  2JIW A;  3OA5 A;  1C8Q A;  5A6M A;  1XCW A;  4RE3 A;  1DHK A;  4D1I A;  5A8Q A;  5I5R A;  2EO7 A;  1GVI A;  3BH4 A;  3RPM A;  3WDP P;  1CBG A;  2CEQ A;  2DSU A;  3BCD A;  1EHN A;  2BS9 A;  3BCF A;  4DUV A;  1KXV A;  1WZA A;  4J3X A;  1NOF A;  4AWE A;  2D2O A;  4W8B A;  3MKK A;  3PZI A;  2J7D A;  4MJ4 A;  3AIQ A;  2J75 A; 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 2DT3 A;  4NRS A;  3W82 A;  2EJ1 A;  1JAK A;  1E3X A;  1H2J A;  3CBW A;  4WJX A;  3AJ7 A;  3PZO A;  2VX5 A;  3QGV A;  2D24 A;  3CZG A;  2TAA A;  5E0C A;  1DWJ M;  3D5H A;  3M7S A;  4AD5 A;  1CXE A;  2BY0 A;  4J27 A;  1AMY A;  1J0K A;  1UOK A;  4NZC A;  1CGX A;  2OWC A;  3TP4 A;  1QBB A;  3BXW A;  3G6L A;  4GPN A;  2CBV A;  3DYO A;  3S2C A;  4D6G A;  1D2K A;  2VJX A;  5CQ1 A;  1IZK A;  2XG9 A;  2Y2W A;  3VIM A;  5D9P A;  4PTM A;  2Y24 A;  2BY3 A;  3ZT6 A;  1OWQ A;  4JHO A;  1DTU A;  1V3L A;  4HU8 A;  4ATL A;  1OGS A;  2BFG A;  3K4D A;  3VUP A;  1MFU A;  3W6M A;  1TMQ A;  1E6Q M;  5A6B D;  1IT0 A;  2XVN A;  1GOI A;  4LX4 A;  4HMD A;  1W1Y A;  1JZ2 A;  3WH8 A;  4XZB A;  5D8Z A;  3VD3 A;  3K1D A;  4EE9 A;  4W84 A;  2WZE A;  2UY5 A;  1E55 A;  2VRJ A;  3WNN A;  3ARY A;  4RE2 A;  1UH2 A;  4WSJ A;  4OIF A;  5M3W A;  5D9O A;  4AD4 A;  4W5Z A;  5D9M A;  5A8P A;  3B9A A;  1ECE A;  1R86 A;  5CPT A;  3PHA A;  5M03 A;  3PZQ A;  4JFV A;  1EH9 A;  3WNL A;  1OM0 A;  1C7T A;  4AEE A;  3LPG A;  1BYD A;  3VIH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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