2ZCGA

Structure and inhibition of orotidine 5'-phosphate decarboxylase from plasmodium falciparum
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
320
structure length
318
Chain Sequence
GFKVKLEKRRNAINTCLCIGLDPDEKDIENFMKNEKENNYNNIKKNLKEKYINNVSIKKDILLKAPDNIIRKSEEFFYFFNHFCFYIINETNKYALTFKMNFAFYIPYGSVGIDVLKNVFDYLYELNIPTILDMKINDIGNTVKNYRKFIFEYLKSDSCTVNIYMGTNMLKDICYDEEKNKYYSAFVLVKTTNPDSAIFQKNLSLDNKQAYVIMAQEALNMSSYLNLEQNNEFIGFVVGANSYDEMNYIRTYFPNCYILSPGIGAQNGDLHKTLTNGYHKSYEKILINIGRAITKNPYPQKAAQMYYDQINAILKQNM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Structure and Inhibition of Orotidine 5'-Monophosphate Decarboxylase from Plasmodium falciparum
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 119
structure length 318
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2007-11-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2zcgA00
4BF9A 1TPVA 3M1ZA 1FUYA 1HL2A 1OYBA 1RQBA 1A5BA 4FIRA 3TIMA 2YX0A 1G6CA 1DBTA 2VFHA 1DV7A 1LLZA 1K8ZA 1H1YA 1SUXA 4ADTA 2VXNA 1MXSA 1B4EA 2YZRA 3W72A 3L0GA 1QR7A 2DZPA 3IV3A 3LTYA 1B3OA 1ZALA 2R94A 4GUHA 5L6UA 4RJEA 4CQ8A 4O0KA 4PTNA 4IMDA 2CLHA 4LS0A 1I2RA 4O13A 1W3NA 3EWUA 2GVJA 2DZUA 1H7XA 4KFPA 4WY0F 4MOZA 4JDYA 5BMXA 3PM6A 3FJLA 1LOSA 3W1RA 3CB8A 4PL2A 1SU5A 5CZSA 4JTKA 1AMKA 4UMAA 1WAUA 2ZBTA 5D37A 4JN6A 3NG3A 3NQGA 5FF7A 2C0AA 4JEQA 3TR2A 4ORIA 1ME9A 3O8AA 1A5AA 2ISWA 3AJXA 1CX9A 4X3ZA 1TQJA 4UTLA 4MYXA 3EWXA 1RR2A 1YDOA 3LERA 4UTIA 1VYRA 2Q3OA 5E93A 3C56A 5LSMA 2P10A 3NQAA 2WNQA 2JKEA 1W37A 5LHEA 4K39A 1SZGA 2PRMA 1BTMA 2FJKA 3TV8A 5LGZA 2A21A 3C2VA 4MLRA 4NVTA 2YSWA 3BLEA 1MEHA 2YYTA 5F2MA 2ZRVA 5LNVA 1FBAA 2CZ5A 4IPJA 1XXXA 5I3GA 3NQMA 3OVQA 4CCEA 1BWLA 2GOUA 4LTSA 4U28A 1VCVA 4I9AA 3SY5A 4FNTA 5ABTA 1T99A 1O94A 1ICPA 3OHIA 1W3TA 6ALDA 3W6YA 2FB3A 2DZXA 4GUIA 3LCLA 4HPJA 2CLKA 1JCNA 1K7EA 4PL1A 3W75A 1TJPA 3SGUA 5CSSA 3SSJA 4AEOA 1YYAA 1IF2A 3W1NA 2CLMA 2QJIA 4WXYA 3W1LA 2C16A 4UR8A 1ZAJA 1O4UA 2QUUA 3DKJA 3CPRA 4S1FA 3P80A 4HSOA 5D03A 3UWUA 3DBPA 2RFGA 5T26A 4RX0A 3W71A 3NDOA 3H55A 3IGUA 5TQLA 2J24A 3HG3A 4UXDA 4O1CA 3RNDA 1QWGA 2J27A 3LDVA 4HNTA 1HTIA 2X2GA 5HULA 1SW0A 3TC6A 3E0IA 1NVMA 4ZQRA 1OK6A 3NQVA 1VLWA 3HG2A 1B57A 3A23A 4GUFA 2EGZA 3HBLA 1R30A 3I68A 3DFOA 2RDTA 1EWDA 3NQ7A 4JNMA 3EKZA 4EVZA 1LROA 3W1UA 2Z1BA 4JYEA 3TKFA 1DJNA 1QNVA 2G95A 4UTTC 2YFNA 3TQ0A 1PS9A 3BK0A 1XI3A 4TMCA 1PIIA 4ZQOA 3C52A 1YTKA 5IBXC 2HSAA 3L66A 1GEQA 1OX4B 1T0OA 3DFQA 4DXVA 1SSDA 3QQ0A 3C8FA 1EP3A 2ZRYA 5DELA 1S5VA 4K8HA 1KM5A 3P60A 3W7IA 4KWWA 3G1VA 3VFLA 3PWAA 2C18A 1V5XA 2VELA 4XKYA 2ABBA 1DJQA 3IIPA 2QCLA 5BNKA 2QKFA 3SFKA 1D3HA 3R89A 4XBKA 5FF0A 3WK3A 4NX5A 1TV7A 3TA6A 2YGYA 1ZCOA 1JCXA 3LXCA 3PG9A 3NO5A 1GVOA 3OVRA 3KVKA 4O52A 3LRKA 4JGDA 1W3IA 3P8IA 4Q33A 3C6CA 1JRCA 1YDVA 1W5QA 3W2NA 5C55A 3E9AA 4FXSA 1E51A 1WDWA 5HWMA 1W8SA 3HIJA 4NJIA 3ZWTA 2ZZ3A 1ZFJA 3G0XA 2NV2A 2ZA3A 1KV5A 1EPXA 1H7WA 1H7NA 4M19A 4WZHA 3GDTA 3LHWA 4JDBA 3NPUA 4AWSA 3PULA 1OFOA 4KKXA 3NM3A 3FOKA 2ZFAA 3W74A 2WO5A 3OBKA 1AG1O 4AVFA 1QPOA 3V75A 4JTJA 2ZZ7A 3MYPA 4O4VA 3HG5A 4JD4A 3N9SA 3TXZA 2BX7A 4IX0A 4EIVA 4H3DA 4CLMA 3M0ZA 1LM1A 4UTHA 4WX2A 2PRLA 3GXTA 2YR1A 1FXPA 1X8FA 5LKYA 4DPQA 5AHNA 3NQEA 3G0SA 3C3NA 1X6UA 1K02A 3UZJA 4DBDA 4ZMGA 3G1AA 1JUEA 1JQXA 1OX5A 2A2IA 4X2RA 3FLUA 4BWLC 5F2IA 2KZHA 2WNZA 3N2XA 1M6JA 3G1FA 4U4MA 4FXRA 4GE8A 1GVSA 2QCFA 3CM4A 5KZDA 4AH7A 4N9EA 4K7VA 3LV6A 3GDMA 1WBHA 3G0UA 3B0UX 3L21A 4E38A 3PR2A 2J9YA 4CNNA 1BEUA 2NWRA 4Z1BA 3F4WA 2OX1A 4X22A 3CIWA 3M5ZA 1LOQA 5FEWA 4E2BA 3EWYA 1WOBA 3ZR4A 4EOUA 4AHOA 3VCRA 2ZRWA 4PH6A 3NQDA 2YW3A 1XDMA 4A29A 4DF0A 4TR9A 1K8XA 3NPVA 2VFEA 5U7SA 4J9JA 5I3KA 1Z42A 4UC5A 5SWUA 4N6EA 2AGKA 3STFA 2X1UA 2ZA2A 3TFXA 4WY0B 5AC7A 4GUGA 3GZ3A 3NVTA 3W7MA 4JTSA 4M7TA 4RV8A 3UWWA 4UTWC 3W3OA 4DO4A 1P0KA 1W54A 3AO0A 1ZENA 3QF0A 4N9DA 5DBTA 1OFQA 2QAPA 4XQ6A 5FF4A 4YL2A 1P4CA 3KRSA 5H2ZA 7TIMA 2CZFA 4I7UA 3LBCA 1WXJA 1T96A 3RFAA 1FDZA 3EX6A 4JTHA 3TROA 5A8GA 1W0MA 2GJLA 2ZZ5A 1PE1A 1OF8A 3L0NA 1EX5A 4M7SA 1DL3A 4JXCA 3QSRA 3ABRA 1H7RA 2A7RA 3BW3A 5F4SA 4NNBA 1F6PA 2X1TA 4UNLA 1RZMA 3O63A 3T44A 4I7VA 2JBMA 1P5BA 4CCDA 4RZ4A 2WSYA 3P5ZA 3ATZA 3S42A 4K37A 3UZ5A 3PVFA 3W1XA 3TNOA 4DPPA 5I3IA 4R34A 4GJ1A 3I7SA 2WSRA 4WD0A 3S1VA 3KRZA 3DU0A 1OVDA 3W1QA 3C4UA 1MO0A 3TQKA 5TIMA 1XFBA 3GK0A 5FEZA 4GUJA 1VC4A 4C1KA 1K7XA 1L6WA 5LNUA 1RV8A 5AB3A 4A3UA 4LT9A 4AB4A 1KBIA 3MP3A 3U2OA 3VKJA 4MIMA 4KWVA 2R14A 1H50A 4TMBA 1SO3A 3S5ZA 4UIOA 3NQFA 1VYPX 3BVJA 3WJWA 3TK7A 2NUWA 3R2GA 3LXAA 1FXQA 1HO4A 3W76A 4LVFA 2VENA 3N34A 3TJLA 1LBFA 1JVNA 4JTEA 1Y0EA 4O0ZA 4LWWA 1XKYA 4JS3A 4JY9A 4O28A 3Q58A 4QSHA 1I2PA 3BV4A 4PCFA 5CG7A 4WOZA 3RK8A 3O6CA 2Y62A 5AHMA 3W1PA 2C6QA 3M7WA 1VCFA 3O1NA 4LC8A 2JK2A 4GWEA 2A0NA 1G69A 4AWTA 1KA9F 1L2UA 2V81A 1TV5A 5BRBA 4UMBA 3SR7A 3LLFA 4OBTA 3DHDA 1UJPA 4ONVA 3N73A 3NOEA 3C2RA 4LRSA 3DI1A 3LI0A 2D73A 4LVAA 2NXHA 4ML9A 3NQ8A 2A1YA 1VPXA 3KHJA 4WUIA 2ZRXA 3PAJA 4LV4A 4JTTA 4IUOA 3UWYA 3TUUA 1OFBA 2C3ZA 5DXXA 3RMJA 2WSQA 4YCPA 5F4XA 4CQAA 4DBEA 3MO7A 4CNPA 2ISVA 3B04A 3FKKA 1QOPA 2QCHA 2TPSA 1GWJA 1PCKA 1DQXA 3QH2A 4PA8A 1OFEA 3DGRA 1Q3NA 5D2VA 2FDSA 3G3MA 3S0CA 4A21A 2ZYFA 4OV9A 3BLIA 3S9YA 4NT0A 3EX4A 1YDNA 3W2JA 3QPZA 3ZFHA 4UNKA 3M43A 2B7NA 5AHFA 2DU2A 1K3UA 3NQ2A 5HR7A 2E09A 1VRDA 2V8ZA 5DY2A 3PG8A 1AW2A 3STGA 1TPWA 2TYSA 1QMLA 5EY5A 3QMRA 3KFTA 3P61A 4MJMA 1MEWA 3JS3A 4TO8A 4BI6A 5D09A 3TSDA 4MUZA 2AQWA 3THQA 1FCBA 1B4KA 4FX8A 4BK9A 2E77A 1G4EA 1EP1A 3HPZA 1ZAHA 1RPXA 2OCZA 4QNWA 5CZJA 5DLCA 1CW2A 4IMCA 2GVGA 3INPA 1FCQA 1J5TA 3O6YX 3OA3A 4NUWA 2TMDA 3WK2A 1XBZA 4M6QA 2RDUA 1H63A 1YXYA 4XKYB 1TJRA 4UFMA 2VEIA 3S8HA 5IM51 3STCA 4JTIA 1XL9A 3T7VA 3G8RA 3EXTA 1FDYA 4JIPA 4IGHA 2I1OA 3QEZA 1Q6LA 3T40A 4GRSA 4FNUA 4LVBA 1H7PA 5IBXA 2Y85A 3S6DA 1RQEA 3LTSA 1L9WA 2ABAA 1P0NA 3NPXA 1AL8A 5BMWA 2XN2A 5F1VA 4O15A 1GYLA 4XWUA 2NWSA 4QJ1A 3K30A 2V2CA 3DHFA 3GX9A 1GTEA 5D38A 4O12A 2V82A 1M7OA 3PF3A 1TTJA 3LCFA 3FJ6A 1H60A 3UD6A 3NZRA 2DP3A 3E96A 4MKNA 1SSGA 3KVLA 4YWIA 2QJGA 1QO2A 3A22A 2Q3RA 3HF3A 3S5OA 5GVJA 1KM4A 3W7CA 3PUEA 2ZTJA 3O07A 1GG0A 2NXGA 3IIXA 4RLIA 4RXGA 5DBUA 5G4EA 2G5WA 3I6RA 1L6YA 3UY7A 1ME8A 2WKJA 3O06A 2CWNA 4MYAA 2VEPA 3PB2A 4AHPA 3C2FA 3GDRA 3Q2DA 1KFCA 4M5PA 3QZEA 1FWNA 1M7PA 3CT7A 2Y7FA 2Y7DA 4GBUA 2NX9A 4QM1A 3PS7A 5G2WA 2X30A 1FWRA 4IMFA 4O17A 2DZTA 4MJZA 5K2ZA 4K38A 4HHPA 3F1QA 1WQ5A 1I8JA 4CCCA 1JULA 3EWWA 1U5JA 2YDAA 1F76A 4Z1DA 2BWGA 3BW4A 5U4NA 1LDCA 2QAFA 3P74A 3WK1A 3NA8A 3QMTA 1GJPA 1VHCA 2GQAA 2IQTA 4O57A 4UTJA 4DELA 3LLDA 3D0CA 1TREA 1VR6A 4QAIA 2GVLA 4XZ9A 4XBSA 3LHYA 1UUMA 3U6WA 3EB2A 5DXYA 2Q8ZA 3NR0A 6TIMA 4BI7A 3P84A 3TXVA 1IXNA 3NYZA 3UXDA 1H62A 2Y61A 3QYQA 1UB3A 4LVDA 1EIXA 3QW4B 1U83A 3HGRA 3M5XA 1HO1A 3OIXA 2C15A 1TTPA 4DEFA 2QCMA 3CIXA 3LHTA 1TO3A 4NJKA 5I3HA 4YXGA 4M6VA 1ML1A 3PSWA 3EEGA 2AAMA 5BOOA 3WK0A 1H51A 3B06A 1LOLA 2B7QA 5F2LA 3GIYA 1TRIA 3MI2A 3S5NA 2RH9A 5C5YA 1KM6A 4AF0A 1PCWA 3FYPA 3ABSA 2ALDA 1OABA 3UNDA 4A22A 1KFBA 3MUXA 3TU9A 3STEA 2XFWA 4NZFA 3N2MA 3W7EA 4YMZA 3UWVA 5D04C 1ZNNA 3F4NA 2FPTA 5CKSA 3UPBA 1C8VA 2EHHA 5DCEA 3DFPA 4AMAA 3L5AA 3M5YA 3W9ZA 2HS8A 1C9DA 4H6KA 3GYEA 2B7OA 4JIQA 1B9BA 3LCHA 4P2VA 3SIZA 3CLMA 4NJHA 3W2LA 3IRDA 4MFDA 1GZGA 2H3BA 1SPQA 1I45A 1I2OA 5HWJA 3T4CA 1VS1A 2V5BA 4RKAA 2ZTKA 2NUXA 3CEUA 4A2SA 3I65A 4UTWA 2I9EA 1VZWA 1DOSA 3L0KA 5C54A 1XBVA 3W7QA 5C6MA 4JX6A 3CEPA 5K3VA 1SW3A 3W7JA 1TIMA 1NSJA 3MHUA 5LZLA 3PUDA 3W7GA 2OT1A 4E2DA 1KM3A 1SFLA 4HNVA 3QJAA 1KTCA 3CWNA 1OHLA 4N02A 3W7DA 1R47A 3W1AA 2DJXA 4EF8A 5J5RA 4ZQNA 3KRUA 2E6AA 2C13A 5KITA 1RQHA 3C2EA 2FLIA 2EPHA 2C1HA 2DZSA 1I2QA 1YLVA 3N3MA 3ZWSA 2E1DA 1EEPA 3PC0A 4PEKA 3ATYA 1ICSA 3HOJA 3W2MA 4IJBA 1ZJIA 2Y88A 2CLOA 3B0PA 4IPIA 3TH6A 4RZ5A 4DF1A 2ZZ6A 1A53A 1D3GA 1S5TA 4UFIA 5AYZA 2R8WA 2P1FA 5A5WA 5D02A 1WX0A 1O60A 2A6NA 3MWAA 4AAJA 4N6FA 3DENA 3FYOA 1TPEA 3JRKA 2R91A 2E5DA 1ZHAA 4MY1A 3JR2A 3MYOA 1N7KA 1KBJA 3LCWA 1IXPA 2OJPA 2V2HA 2YW4A 3GVGA 4JTFA 4OQVA 1K7FA 3B8DA 5KSWA 1EWEA 3F03K 4KFNA 5D30A 2QDGA 2GQ8A 3LGEA 4EF9A 3P82A 4Z08A 4FNSA 1IXQA 3GNDA 4N2YA 4O1DA 5I3JA 3P5YA 3PY2A 4CQ9A 1TPC1 4P61A 3B0VC 1NF7A 3EWZA 4N9CA 3TDFA 1LBMA 1UCWA 4EWND 1MEIA 3M5VA 1JRBA 2ZZ2A 1LCOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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